5AA3A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in the presence of tetrasaccharide and tetrapeptide
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
molecule tags Sugar binding protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 138
structure length 417
sequence length 417
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa3A02
3N6UA 2H25A 1Z7ME 1QUKA 1R9QA 2H98A 4ZEDA 4JXIA 3R7XA 3ILTB 1CB6A 4OFOA 4G68C 1US4A 5KZTA 4GIZA 3KN8A 1IXHA 3PU5A 3EPEA 2P0SA 1MH4A 2Z22A 5AA4B 3SEVA 4QF9A 1PBQA 2DVCA 2Q2AA 2Y84A 1IIWA 1LCFA 2D3IA 3TDJA 2QS1A 3T9UA 4QFLA 3D4GA 3MP1A 3UORA 3SEYA 2ZYNA 1PB8A 3BFTA 1QKBA 3LSWA 3FZVA 2ZNSA 2DWJA 3KJTA 5I2KA 3UGWA 1XC1A 1POTA 4H6DA 3LSFB 2OCUA 4LATA 2F36A 5DT6A 3P7IA 1QUJA 4DXCA 1SBPA 5H8NA 4ZZEA 1Y3QA 4X9TA 3UIFA 1QULA 4MLQA 2OJTA 1H43A 3S9MC 4KHZE 3PGFA 2FNCA 1CE2A 3M8UA 3E4RA 3KEIA 1MDQA 1MQJA 4OEVA 5I84A 2X26A 4PE5B 5IAIA 3H3GA 2QMWA 4NF8B 3K6WA 1O7TA 2HZKA 3T66A 2NOOA 2X7QA 1A40A 4GFRA 4BDMA 3W9WA 5CRYA 3ILUB 4IO6A 1AL3A 5I2NB 5JK4A 4QSDA 2OLBA 5CC2A 3FXQA 3PUWE 1PEBA 2RC7A 2XXRA 4FIMA 1FQBA 3RGYA 3H7MA 3MP8A 1LB8A 5FHNA 4OFLA 2QJEA 1OVTA 5ISUA 3RY3A 3FXUA 2DWAA 2FYIA 4JBZA 2Q88A 3V89B 3Q29A 3MVYA 4P11A 4QFPA 1Y20A 3Q27A 1FTMA 4PFUA 2HZLA 2QPQA 1HSJA 5AA1A 4H5GA 3TQLA 4YKKA 1XVXA 4KFQA 2QSXA 2F35A 2P2AA 3C32A 1TFDA 2QS3A 5KDTB 2V3TA 3K6XA 2YJPA 4PFTA 1OQHA 4KYSA 1I6BA 2QMXA 3MZ9A 1B4HA 3MJNA 3T22A 4WXJA 4LVQA 1B51A 1B05A 3E3KA 1B9JA 3IL1B 1DPEA 4GL8A 4LQ2A 3H06B 4C1TA 3LC8A 4U22A 3GLBA 1FCKA 4TLMB 2RINA 3QUJA 3K0VA 3KJ7A 4JSOA 1D3KA 1YAEA 3MAMA 1JQFA 2QRYA 1OIBA 1VE4A 2Z23A 5FTHA 2AYSA 3G3GA 2Z8FA 1FTOA 3KBRA 2THIA 4R75A 2QL3A 3VLUA 3MW0A 3MVWA 3GBAA 1N3WA 5J1DA 4G68B 1IITA 4GQOA 3F11A 4NF6B 2DS9A 2GFEA 2XHDA 1AIVA 2DXRA 1TFAA 4F22A 2F7BA 4G8MA 3C4MA 1UTHA 3S9NC 3A3UA 5F7VA 3R26A 2ABHA 3M3LA 2B3FA 3PUXE 3OMBA 1XOCA 1US5A 5AA3A 2ZYMA 1IQ7A 3OOAA 2XXYA 2ONSA 1M5BA 4U4XA 5JTYB 3TTNA 2DWIA 4F39A 4OTEA 2HAUA 1IXCA 4AB6A 4ZZAA 4Z0IA 4OMBA 4GWOA 3FGSA 1MQGA 1FQCA 3G3JA 4DCYA 4OXVA 2F34A 3GXAA 2DWHA 4K3FA 4LQ5A 4NEDA 3G3KA 1O63A 4JWYA 3PPQA 3CSGA 4F1VA 3TYHA 1POY1 1SW2A 1FW0A 4IGRA 4KCCA 3EHSA 5HBCA 3C33A 3O6HA 3L6HA 2I4BA 3VDFA 3SEWA 4FEBA 1R9LA 3HPIA 3FV1A 1AH5A 4OETA 3TCFA 2PBWA 3TQWA 5DVIA 3T9VA 4BDNA 1SI1A 1MY2A 2F6PA 5IKBA 4N07A 1LBBA 4NTLA 2ZXTA 5FTIA 5I57B 4OEUA 2I48A 1N0TA 4OESA 5CBRA 5EHSA 4EDPA 3G3FA 2O6AA 2XXXA 4F3PA 2HCAA 4YKIA 1B1HA 2ALUA 5AA4A 2XXVA 3K1NA 3O29A 4U2RA 2OK2A 1B5HA 3UA8A 3B6WA 3T93B 2V25A 3KSXA 1LAGE 3FJMA 2PYYA 2X7PA 2V93A 1A8EA 1LLSA 1NNPA 2HQ0A 3QUFA 1MM7A 1DPPA 2IA4A 3WAEA 4G2ZA 3CFZA 1B46A 3PPPA 3FASA 1MQHA 3RQTA 1JW4A 2RF1A 3B7DA 3IAZA 1Y4TA 1B3FA 1FTJA 1HSEA 1M5FA 1B32A 4ZEFA 3PMXA 2E0SA 5CMCA 2R9JA 3IORA 4NF8A 3I6VA 2XX7A 3TAJA 4EF1A 4IB2A 1MXVA 2YPNA 3LSLA 5I2NA 1EZPA 4PFWA 2D5WA 4RJZA 4YB5A 1ANFA 4ZE9A 1P1WA 4X1BA 1A54A 1MS7A 3U8QA 3SKPA 2UVHA 4IY5A 2Q9TA 2Y7IA 4FJPA 1GGGA 1NKXA 4DE8A 3FVGA 1SDXA 3Q25A 4WEPA 3FVNA 5KCJB 3K6UA 4GRKA 3CIJA 5LOMA 4X48A 4R6KA 2HAVA 3JZJA 4U1OA 5KDTA 3HHGA 1WODA 3LR1A 1M5DA 3VXBA 2XD3A 3MPKA 5BUUA 2Y7PA 4I8CA 3C31A 3CFLA 4IGTA 1MM6A 1J1NA 4Q0CA 3QIMA 1YPNA 4QFNA 4KPTA 4YICA 4O3AA 3OD7A 3OO6A 3PPRA 1DTGA 1AMFA 5I59B 3CI8A 3ZKKA 1QKAA 1NH8A 1BKAA 3VFJA 1XS5A 1SYHA 2VHAA 4DLDA 3AXFA 3H6TA 4KQPA 4U23A 4LZ5A 3K2DA 3TFLA 2DP8A 2I3VA 1MH3A 1MY3A 3DP4A 1RYOA 2ZMBA 5ELVA 3QSLA 1GR2A 4GOTA 3L6GA 3Q28A 2O84X 1MXXA 4G68A 1Y9UA 1KWHA 3PD8A 4F1UA 1R1NA 4NF6A 2AL5A 3VLVA 1EU8A 3BBRA 1ZLQA 3BFUA 4DZ1A 3WAFA 4H67A 4LA9A 3C36A 3O66A 3O97A 1H76A 2DOJA 1BIYA 2ZYKA 4UACA 2UVJA 4AQ4A 3HV1A 1A55A 2O1LA 1R6ZA 5AA2B 3S9LC 5JTYA 3KSJA 4XKQA 2O51A 1LB9A 2QS4A 4NF4B 2DYXA 4BDOA 1FQDA 4UA8A 3OXNA 4C0RA 5A5XB 1I69A 2XD2A 3QXMA 1JNFA 1XT8A 1LFIA 1JETA 1EZ9A 2O7IA 4GVOA 1EH3A 4HCWA 3PUYE 5DVJA 4RK2A 1GTKA 4NWCA 3MQ9A 4JWXA 2GHAA 3OSQA 3K4UA 3LBSA 4IO2A 1BTJA 4XKPA 4OZ9A 4IO7A 3KZGA 2ANJA 3CVGA 3TTKA 5CI5A 1M5EA 1P99A 4E0WA 1ELJA 3TELA 1N7XA 3T96B 2Q89A 2XXIA 1SI0A 3FUZA 3MUQA 1TWYA 4E0XA 3TKDA 4GF8A 4BDRA 2PVUA 1JW5A 4BDQA 4KR5A 5I57A 2F6GA 4HTGA 1MPDA 1MXYA 1OVBA 2UVIA 2LAOA 1D9VA 1GVCA 3IO6A 2H4IA 5JEIA 2W7YA 3OO7A 3PV0E 4P0GA 5H8HB 3H4ZA 3B6TA 4PQJA 2DE3A 1P1UA 3HSTA 2XXHA 1EZOA 4F3SA 4F2OA 3OELA 3EHUA 1URSA 3U92A 1Y1MA 2GH9A 2F5XA 4RK9A 5ITOA 2H5YA 1LBCA 3O28A 4MH5A 1A99A 4RY1A 2F7CA 2REJA 2XXUA 2H9BA 3B6QA 3RPWA 2WKYA 3FD3A 3IOVA 1B7HA 4G4PA 4EQ7A 4EQ9A 5TP9B 4KD5A 3MBPA 3A3CA 1S9TA 2O7UA 2I6EA 2OWSA 3UP9A 3C9HA 4MFIA 1DOTA 3U72A 2RCBA 1QJMA 3K1MA 3TZAA 1D4NA 4THIA 1URGA 4F29A 1S50A 1XHYA 1YTVA 4GXSB 1L5TA 1B58A 1B3GA 4U4SA 3VV5A 3N6TA 4ZEBA 2O1MA 5H8FB 4U1ZA 4I1DA 2VD3A 4TOZA 2ZNTA 3M3KA 3RTFB 1VR5A 4QHQA 5I56B 1IEJA 4G8NA 4NF5B 3SESA 1FQFA 2AL4A 3IOWA 2I4CA 3T9HB 1B40A 4DDDA 4NMYA 5KCJA 3VVFA 1IUDA 4F18A 2Q2CA 1B7ZA 1A7LA 4MLVA 4OVJA 4EQBA 2H99A 4U21A 1NNTA 3K01A 3JYRA 4ISUA 3USDA 3HN0A 4LZ7A 1ZMGA 4EUOA 2R71A 2Z8DA 2NUVA 2XX9A 4RA1A 3FJ7A 4MF3A 4RYAA 4WEDA 1ZU0A 4POWA 3UK4A 1P1OA 1B0HA 5FHMA 1LGBC 2VD2A 4XIGQ 5L9SA 4FORA 1LCTA 3RLFE 2Y7KA 4JB7A 4GL0A 3KGCA 3CRBA 1N76A 2Y7RA 2F8DA 2XXWA 1H45A 1B5IA 4GLIA 5I59A 4G8HA 4JDFA 1NH7A 3MVZA 3KFMA 4IO5A 5I58B 1ZBMA 4R6HA 3OSRA 4YB7A 3PD9A 3K02A 1FQAA 3ODBA 4Q5TA 4KCDA 4R9GA 3ZS6A 1IXIA 5TU0A 4RPOA 4OFJA 1MRPA 2PX1A 3S9EA 1AOVA 1WVJA 2HFBA 5B70A 2VP1A 4R9FA 3N5LA 1JVXA 1N84A 2V3QA 4ZS9A 2DQVA 4R74A 2PT2A 3UN6A 3DLNA 3SETA 1N04A 4H5FA 4ELPA 1UQWA 1VSOA 3MZBA 4KYEA 1URDA 3IR1A 5F1QA 3Q26A 4H8JA 3T9XB 2CMOA 3EF7A 4EXKA 5AA2A 4YZZA 1PC3A 1YCJA 1ZKBA 5BWJA 4NE4A 4LONB 2F78A 4NF4A 1FTKA 4MBPA 4YB6A 1NFTA 4JSDA 4RPNA 4FATA 1FTLA 1MXZA 4RNSA 2NXOA 2GHBA 2RC8A 3ONMA 1B52A 3D4CA 5A5XA 1MY4A 2OWTA 3PUZE 4ZECA 4DCXA 1PB7A 3GBBA 2G29A 3IOUA 5K2XA 1MXWA 1MPCA 2M8CA 4OENA 1Z7NE 3PPNA 2Q8JA 3SEUA 3G7WA 2G93A 1LFHA 1Y3NA 1IZ1A 5HPQA 4HS7A 4ONYA 2E1SA 3V83A 1MY1A 1B5JA 4M4GA 3RTWB 5AA2D 3RT6B 1ZJLA 3MP6A 3M3FA 3VVEA 4O3BA 4ELQA 1RYXA 2Y7WA 3MVXA 3V5AA 3QK6A 1UIVA 2UYEA 1XVYA 1RKMA 1NMUA 3DM0A 4H8IA 1QUIA 4YMBA 4H0WA 3FVOA 1UTBB 1I6AA 2I49A 2QS2A 1DMBA 2BJJX 1OLCA 3RUMA 1T0KA 2FA7A 3A09A 2A5TB 3DELB 2B65A 1H3DA 3ZSFA 4ND9A 1NL5A 4EXLA 5L9MA 1P1QA 1H44A 4QFKA 5H8HA 4F3BA 5H8QB 3QAXA 5DEXB 4KYDA 1OMPA 4TQUQ 4DIGA 1SYIA 4Q8RA 5TPAB 1HSLA 2O68A 1OLAA 4YU0A 4IY6A 3KOSA 3O2AA 3VVDA 5CBSA 3IO4A 3EQ1A 4IO4A 2UYFA 3H6UA 1TXFA 4HCYA 1OQGA 4X1DA 1VFDA 4I9DA 1B7UA 1N3XA 4BDLA 3MPLA 5EHMA 3E9XA 3IX1A 4HW8A 5TP9A 3IB0A 2DSFA 2O69A 3OENA 4R73A 3U1OA 4L17A 2ONRA 4EF2A 3W9VA 4XTCQ 1MY0A 2XXTA 4F31B 3TCGA 4OHNA 4YMAA 1MQDA 1S7YA 5FHOA 4H1XA 4YKJA 3U93A 1B0LA 4I62A 2NWJA 1II5A 5H8FA 1SW4A 2PMSA 2XXPA 1B3HA 4LZ8A 5CMMA 1B4ZA 5I56A 3KN3A 2VOZA 4NF5A 3S2VA 3BKIB 3I3VA 3K6VA 4Z7EA 4DXBA 1LFGA 2RCAA 4QSCA 3R6UA 3IB2A 3TTMA 1USYH 5DTBA 2ONKE 4ZDMA 3IJOB 1B3EA 2RC9A 4GD5A 3PUVE 4ESXA 1Y4CA 3VE1B 2F97A 4PFYA 2UXAA 1Y3PA 5I2KB 4OERA 1D9YA 1JW1A 3ECRA 3IJXB 5DVFA 2V3UA 1SQYA 2ZYOA 4FAJA 1BP5A 4R2FA 3LUYA 1ZTYA 5H8NB 1M5CA 4F19A 3KG2A 3C34A 3S4UA 3RN8A 3H03A 3TTLA 3G3HA 1SVXB 3H6WA 3CR9A 3EHTA 1A8FA 1QVSA 1PB9A 2OBGA 4ELRA 3PMVA 3JV9A 2DE4A 2GRVA 4FE8A 3U94A 5I58A 2P1SA 2REGA 4YAHX 4O3CA 1ATGA 3TUSA 1JVYA 4XKNA 2ESNA 3IK6B 4LP2B 4XXUA 3G3IA 3I5OA 1BLFA 4R6YA 2Z8EA 4XKRA 5ICQA 3C35A 3PMWA 3TTRA 3O6IA 1B2HA 2DXYA 3THIA 5B7DA 1B3LA 1MDP1 4OWDA 1JEUA 5HM4B 3ZKLA 4NWDA 4BLAA 3MC2A 3HCQA 3TMGA 4QRZA 3V8XB 3CSBA 2I0CA 1PBPA 2R6GE 2KLFA 1MG1A 2V84A 1TT1A 4R72A 4GXAA 3IOTA 2XXQA 4FECA 4M1VA 4POXA 3FV2A 2D21A 1ZIUA 3FIRA 3FATA 1Q1KA 2IEEA 5AE4A 3OO8A 1B6HA 4JWOA 3GZGA 1MQIA 1Y1ZA 1MPBA 3CFXA 4QSEA 1NNFA 3KN7A 4H65A 5M2VA 4AB5A 1O64A 3K1PA 5CMBA 2HEUA 3EN3A 5ITPA 4Q30B 4YKPA 2PT1A 3TEPA 1SW5A 3SDFA 5DYHA 5H8SA 4ESWA 2ZNUA 1LAHE 4ZEIA 1USYE 2VGQA 3MZ1A 4N6PA 3TODA 4ECFA 5K2YA 2F7AA 2AIXA 3TCHA 1NNKA 3KOTA 4OQOA 2I3WA 4PETA 1I6QA 3CG1A 2HXWA 1B1XA 1LSTA 2XX8A 3OEKA 1UTHB 2RKMA 3HHFA 4ZE8A 3LSXA 1UTBA 3O9PA 4KI0E 3H6VA 1UIUA 5ICTA 1IXGA 1JEVA 5L8DA 2A5TA 4F2QA 1LAXA 4IO3A 3SERA 2CZLA 4R2BA 1Q35A 3K00A 5L9OA 3N94A 1MXUA 3DP6A 3IB1A 5H8QA 4F1YA 1QW0A 3N26A 2I58A 3OEMA 3HO7A 4QFOA 1F9BA 3SEXA 1N7WA 5DEXA 3PPOA 1FQEA 4N13A 2I0BA 4OYVA 4P0IA 3OO9A 3DP8A 3FJGA 5TPAA 2NVUB 3RNNA 5EYFA 3VLWA 5CM6A 3W15C 1DTZA 2OZZA 3TPAA 2DVZA 3RT8A 4DXUA 4ELOA 3QYTA 4WKMA 4RXLA 1WDNA 1P1NA 2DE2A 2YLNA 3O6GA 3VXCA 1GV8A 3MWBA 5CMKA 4G77A 3CG3A 1SD3A 1SW1A 2B3BA 1VFEA 1PDAA 3FXRA 4ZEKA 4C1UA 2UVGA 1LAFE 3FVKA 3E13X 4TLLB 4F3GA 2A5SA 1DSNA 4FEDA 4LUBA 4PP0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3N6UA 2H25A 1Z7ME 1QUKA 1R9QA 2H98A 4ZEDA 4JXIA 3R7XA 3ILTB 1CB6A 4OFOA 4UABA 4G68C 1FBEA 1US4A 4PF8A 2XWKA 4XEQA 5KZTA 4GIZA 3KN8A 1IXHA 3PU5A 3EPEA 2P0SA 1MH4A 2Z22A 5AA4B 4PE3A 3SEVA 1NV5A 4QF9A 1PBQA 2DVCA 2Q2AA 2Y84A 1IIWA 1LCFA 2D3IA 4MX6A 3TDJA 4AS4A 2QS1A 3T9UA 4QFLA 3D4GA 3MP1A 4HE2A 3SEYA 3UORA 2ZYNA 1PB8A 3BFTA 1QKBA 3LSWA 3FZVA 2ZNSA 4N4UA 2DWJA 3KJTA 5I2KA 3UGWA 1XC1A 1POTA 4H6DA 3LSFB 2OCUA 4LATA 2F36A 5DT6A 3P7IA 1QUJA 4DXCA 1SBPA 5H8NA 4ZZEA 1Y3QA 4I3EA 4X9TA 3UIFA 1QULA 4MLQA 2OJTA 4MNPA 1H43A 3S9MC 4KHZE 3PGFA 2FNCA 1CE2A 3M8UA 2DDKA 3E4RA 5EQ8A 3KEIA 4P1LA 1MDQA 4P1EA 1MQJA 4OEVA 5I84A 2X26A 4PE5B 5IAIA 3H3GA 2QMWA 4NF8B 3K6WA 1O7TA 2HZKA 1NUZA 1FPJA 3T66A 2NOOA 2WBBA 2X7QA 1A40A 4GFRA 4MEVA 4BDMA 3W9WA 5CRYA 3ILUB 4KXPA 4IO6A 1AL3A 5I2NB 5JK4A 4QSDA 2OLBA 5CC2A 3FXQA 3PUWE 1PEBA 5I5PA 2RC7A 2XXRA 4FIMA 1FQBA 3RGYA 3H7MA 3MP8A 1LB8A 5FHNA 4OFLA 2QJEA 1OVTA 5ISUA 1RDZA 3RY3A 3FXUA 4AS5A 2DWAA 2FYIA 4JBZA 2Q88A 3V89B 3Q29A 3MVYA 2WYPA 4P11A 4QFPA 1Y20A 3Q27A 1FTMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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