5BUUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-321 at 2.07 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Synthesis and Pharmacology of Mono-, Di-, and Trialkyl-Substituted 7-Chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides Combined with X-ray Structure Analysis to Understand the Unexpected Structure-Activity Relationship at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA02
3K6UA 2V25A 4GXSB 3SETA 4LP2B 1ZTYA 1FQDA 1B3GA 1MQHA 3TQLA 2YJPA 3C4MA 2F35A 1XOCA 1YCJA 3LUYA 2E0SA 4BDOA 4OQOA 2CMOA 4NF5A 2H4IA 1MH4A 3VDFA 4QFOA 4EUOA 2VOZA 1B7ZA 4DCYA 5K2XA 1MS7A 5A5XB 5AA2A 4IO4A 5J1DA 1JEUA 1ELJA 2FNCA 1TFDA 1Y3NA 2O7IA 3D4GA 3KOTA 5H8QA 4AB5A 5I56B 2OZZA 4MLVA 3FVGA 1KWHA 3TCHA 1A8EA 4OEVA 1BIYA 4R6KA 3TDJA 3B7DA 2V84A 2X7PA 5KCJA 2HEUA 3IOVA 3CSBA 1MQDA 4BDLA 2I3WA 4F22A 3PV0E 4NF4A 3I6VA 4M4GA 5CMBA 1DPPA 3KN7A 2NUVA 4Q8RA 2F6GA 1DOTA 2F97A 3RTFB 3E4RA 3FJMA 2XXWA 3G3KA 4NWCA 2F6PA 4JDFA 3PUWE 3OSQA 4GXAA 4DCXA 3IJOB 3EHSA 1MPBA 1FTKA 1Y1ZA 4GWOA 4LZ5A 1DSNA 4FECA 2ZXTA 1US5A 4C0RA 1ZKBA 4MH5A 1B0HA 1EZ9A 3U72A 3VXCA 1B58A 1LAHE 2V3UA 2F5XA 3CRBA 5HM4B 3RQTA 2XX7A 4GOTA 4F18A 5KZTA 4XKQA 3U93A 3QUJA 3BKIB 3FGSA 3PUZE 4MFIA 1S50A 2NVUB 3R6UA 4OTEA 1UTHB 3IB1A 4LONB 1R9LA 2QS1A 3ZKLA 3FJGA 1GGGA 3S2VA 1XT8A 4IO3A 3VVEA 1LFHA 1JW5A 2HZKA 1B40A 1LB9A 2M8CA 4ZE8A 1I69A 2H98A 4F31B 4PFYA 1R9QA 3K4UA 3T9VA 3IJXB 2HZLA 1QKBA 2PT2A 1B7HA 3FATA 3GXAA 1JVYA 3IR1A 4RNSA 3K1MA 3K1PA 3G3GA 3UGWA 1B3LA 1R6ZA 1P1WA 3CFZA 1LGBC 1SBPA 2NOOA 5CBRA 2I49A 4YB6A 4ZECA 1AIVA 4RJZA 1H44A 4X48A 1P1QA 4DXBA 2HQ0A 1B5IA 5KDTA 4OEUA 3N26A 2HAVA 1LAGE 4JSOA 3OO8A 4GF8A 5IKBA 3QUFA 4G68B 4IO7A 1Z7NE 3G3IA 1LLSA 4DDDA 3O2AA 2ANJA 3UK4A 4AB6A 1B32A 3TELA 1YPNA 4IY6A 1QUJA 3KBRA 3S9NC 2Z8DA 3SKPA 5A5XA 5HBCA 3U94A 2DP8A 5EHSA 2ZNUA 1IXCA 4P0GA 5H8NB 4I1DA 3JYRA 4OESA 5I56A 2XX9A 1D3KA 1JVXA 1IQ7A 4N6PA 1NNPA 3U8QA 3PMWA 1DTGA 2UVIA 1II5A 3TKDA 1EZPA 3ZSFA 4RYAA 4PQJA 2B3FA 4NF8A 4G77A 4GRKA 3ECRA 2DQVA 4O3CA 4XKRA 3O6GA 3W9WA 1IXHA 1MDQA 2HFBA 3MVWA 3PGFA 3PMVA 1TXFA 4GL8A 3QIMA 2F8DA 2ESNA 3OMBA 4G8NA 4YB7A 3VE1B 1OVBA 4PFWA 1QW0A 3CI8A 3BBRA 3N94A 5AA4A 4YMAA 3FV2A 1I6BA 4HTGA 4YZZA 3IK6B 4KPTA 1SW4A 1A7LA 3N6UA 5DYHA 1QJMA 3QSLA 4QFKA 4LUBA 1VFEA 2F34A 4ESWA 2Q89A 4ZS9A 1ATGA 2VD2A 1Y3QA 4DIGA 1IZ1A 1Y4TA 5I2KB 5H8FA 4Q5TA 4U21A 1PB7A 4IY5A 1QUIA 1O7TA 5BWJA 2I3VA 1JNFA 4H6DA 1O64A 3THIA 3MBPA 4KHZE 3KG2A 2DE3A 3HO7A 4ND9A 4YKPA 2GHBA 4P11A 4LATA 4ELOA 4LZ7A 5I57B 1MQGA 1A55A 4RK2A 4LZ8A 4OZ9A 1F9BA 4PE5B 4OHNA 4F1VA 3N5LA 1B7UA 3LC8A 3I5OA 3RUMA 3HPIA 3TEPA 1MQIA 4PETA 1GV8A 5EHMA 3IB2A 3VLVA 2Y7RA 4ECFA 1ZU0A 1NMUA 1I6AA 1VE4A 5ICTA 4IO6A 5CRYA 3KSXA 4EXKA 2HCAA 3TCFA 1XVXA 4F3SA 2Z8FA 4OVJA 2XX8A 4RY1A 3SESA 3M8UA 4LVQA 2QJEA 1SVXB 2DS9A 2OWSA 5I58B 3MPLA 4RA1A 4Z0IA 4U4SA 4G8HA 1FQBA 3KJTA 1LFGA 4I9DA 4FAJA 1ZIUA 2FA7A 3IAZA 5ISUA 5TU0A 4MF3A 3RLFE 3OD7A 3RGYA 2I48A 3IO6A 1S7YA 4QFLA 3EHTA 4R9GA 1R1NA 2D3IA 2XXPA 1LSTA 4NWDA 1LAXA 1BTJA 4WEDA 1O63A 2Z8EA 2FYIA 2Q2CA 4Z7EA 3CR9A 2V3TA 3FASA 4JB7A 5TPAB 2ZMBA 1M5EA 3H7MA 3H6TA 4F39A 4F29A 1DTZA 1OQHA 2KLFA 2DWHA 3DP6A 3TTMA 1B5HA 1POTA 2QRYA 3UIFA 1LBBA 1MG1A 3RN8A 4FE8A 5I2KA 3RT8A 1XS5A 1NNKA 5CMMA 5FHNA 2RF1A 3LSXA 3USDA 4L17A 4YKJA 4M1VA 5FTIA 2ONKE 3H4ZA 4RPNA 2QPQA 1GVCA 3H3GA 4ESXA 3LSLA 5I57A 1D9YA 3K01A 4O3AA 3CSGA 4E0XA 4GD5A 2ONRA 2CZLA 2DE4A 2DXYA 5B7DA 5JTYB 4LQ2A 1IIWA 2P1SA 2H5YA 3PPPA 3KFMA 1M5CA 5CMKA 4FJPA 2XD2A 1FTOA 4EQ9A 3MP8A 5I59B 1SW5A 2WKYA 2UYEA 4YICA 2O7UA 3K0VA 4EQBA 2HXWA 3ONMA 4BDNA 3C9HA 1FTMA 3IOWA 3O97A 3TQWA 3TMGA 3LBSA 4JXIA 3FIRA 2VGQA 5F1QA 1N7XA 1A40A 4ONYA 2OJTA 1OLCA 2I0BA 3FXRA 3V5AA 1HSJA 4FEDA 3FZVA 1FCKA 4G8MA 1LCFA 3RPWA 4NF6A 4N13A 1UIVA 4MLQA 3K02A 2YPNA 3E13X 1P99A 3K6XA 1QUKA 1MXUA 3T66A 5ITPA 4WXJA 2QL3A 4JWYA 2A5TA 3FVKA 4R2BA 4IO5A 4X1DA 2QSXA 2Y7IA 1A8FA 4GVOA 1TWYA 3TFLA 4YB5A 3S4UA 3RT6B 3QK6A 1NNTA 1MY2A 1LBCA 3PPRA 4G68C 4H8JA 5ICQA 1VR5A 4ELPA 1N3WA 1DMBA 4H5FA 3GBBA 3C36A 3AXFA 4XXUA 1UIUA 4LQ5A 4U2RA 4XKPA 3MZ9A 3W15C 3OSRA 1SW2A 1BP5A 1PBQA 3KGCA 2GHAA 1MY0A 2F7BA 3R7XA 1MXZA 3MP6A 1WDNA 3TTRA 1Y20A 4G4PA 4O3BA 3D4CA 3OEMA 4OERA 1JW1A 4IGTA 2DWIA 4R6YA 5I84A 4POWA 4KCCA 1FQAA 4OXVA 3OO9A 3P7IA 4H67A 3G7WA 3PMXA 3U92A 3O6HA 3T22A 3H03A 4NTLA 1QULA 1URDA 1A99A 4I62A 2O51A 2DVZA 3DELB 5JTYA 3CG3A 4R73A 5ITOA 4TQUQ 2B3BA 4R2FA 3SDFA 1B3HA 3TTNA 3PPQA 1A54A 3IX1A 3PD8A 4U1OA 2F36A 1IXGA 3FJ7A 4DE8A 3MVYA 1B4ZA 2XD3A 3O28A 5DEXB 3HN0A 1MXYA 4R74A 2A5SA 2OWTA 2D5WA 3PD9A 4QSCA 3IOUA 2V93A 3T9HB 5TP9B 3KN8A 4F1UA 2RC9A 2R71A 1AL3A 2XXXA 1N76A 4HCYA 2OCUA 2OBGA 3KJ7A 3FV1A 3Q27A 2ABHA 2VD3A 2H9BA 1UTHA 2RKMA 1MM6A 4NMYA 1VFDA 3VV5A 3Q29A 1JQFA 4OWDA 5B70A 2I6EA 5L9OA 4QSEA 3I3VA 2DXRA 3V89B 1HSEA 2UVHA 1N84A 2P0SA 4NF5B 4GQOA 1MXWA 3TYHA 3CVGA 4F2OA 2Y7PA 1PBPA 2AL5A 5AA2B 5AA3A 3MP1A 1B2HA 1FQCA 3VFJA 3H6UA 1NH7A 3C34A 4XIGQ 5H8QB 2Y84A 1MY4A 3DM0A 4H1XA 1MRPA 1PB9A 2QMWA 1UQWA 3CFLA 1FW0A 4KFQA 5FTHA 1B1HA 4F3GA 5KCJB 5AA2D 2QS4A 2ZNTA 3HV1A 3TPAA 4ZE9A 4NF4B 2AIXA 4RXLA 1JETA 1NH8A 4I8CA 1LAFE 2BJJX 2Y7KA 5AE4A 4G68A 5L9MA 3PPOA 1TT1A 1MXVA 3UP9A 3FVNA 4OFLA 1D4NA 3B6WA 5DVIA 5H8NA 1P1OA 3G3HA 3U1OA 4WKMA 4ZEDA 1ZBMA 4THIA 4YAHX 1B9JA 1USYH 3M3KA 3OO7A 4GFRA 3QYTA 1QKAA 5I2NB 3QXMA 4Q30B 4QFNA 4KR5A 1XHYA 1OQGA 5H8HB 3WAFA 2AL4A 3S9EA 3MZ1A 2PYYA 4ZEIA 5DVFA 4E0WA 2XXRA 1LFIA 1M5DA 3K6VA 3Q28A 2DWJA 3Q26A 1P1NA 4F2QA 1TFAA 5ELVA 1Q35A 4X1BA 1GTKA 3GBAA 4PP0A 3RNNA 2F78A 4YKKA 2X7QA 3SEUA 4FEBA 2QS2A 1BLFA 2V3QA 4BLAA 3BFTA 4ELRA 5DTBA 3K1NA 4R72A 1HSLA 5IAIA 2X26A 1RYOA 4KI0E 4QSDA 2RCAA 1N04A 1XC1A 1CE2A 1POY1 5KDTB 1FTLA 4TLMB 3CIJA 2DWAA 1USYE 3IB0A 1N0TA 3K2DA 2RC7A 2REGA 4H0WA 3TTLA 1Z7ME 3IOTA 3IL1B 3WAEA 3QAXA 2B65A 3ZS6A 3UN6A 2XXUA 1UTBB 3H6WA 1WODA 4ZEBA 4GLIA 2XXHA 3FUZA 4FATA 3TODA 1IEJA 1OIBA 2R9JA 5LOMA 3L6GA 3PPNA 1Y3PA 3TUSA 3BFUA 3TAJA 3EQ1A 1B51A 4NF8B 3W9VA 4BDMA 3C35A 3T93B 3HHFA 4U4XA 1OVTA 3ILTB 4ZZAA 1Q1KA 1D9VA 4RPOA 3EF7A 3SERA 4ZZEA 3V8XB 1Y4CA 4F3BA 2VHAA 1EZOA 1RYXA 3C33A 2GFEA 4EQ7A 1QVSA 3A09A 4QF9A 3M3LA 3F11A 3VLWA 2DSFA 3EN3A 4GL0A 4IGRA 2ZYMA 5I58A 5AA4B 1WVJA 3SEVA 1B1XA 4U23A 1I6QA 3VLUA 2Y7WA 3V83A 1H45A 4ZDMA 5L8DA 5F7VA 3HSTA 3K00A 3CG1A 1Y9UA 2PBWA 3K6WA 4OENA 5HPQA 1ZJLA 3KOSA 4HCWA 4LA9A 2ZYNA 1DPEA 2D21A 3LSFB 2PT1A 3ILUB 1OMPA 5I2NA 2XXQA 5DT6A 2DVCA 4IO2A 5H8HA 2XHDA 2OLBA 1LB8A 3MJNA 3SEWA 3HCQA 2XXTA 1XVYA 5FHMA 3H6VA 1B46A 5H8FB 3VVDA 5BUUA 1SDXA 2F7AA 3O9PA 3MWBA 3T9XB 3RTWB 5JEIA 3OXNA 3G3FA 3IO4A 5TPAA 4QRZA 2RC8A 2YLNA 1Y1MA 1MY1A 2I4CA 1B3FA 4XTCQ 2G29A 3T9UA 1IUDA 3MW0A 4BDRA 3KN3A 4QFPA 4ELQA 2Q8JA 1MH3A 2I0CA 3SEXA 4OFOA 3RY3A 3HHGA 4QHQA 3VVFA 1AH5A 1YAEA 4C1UA 4KYEA 1OLAA 2W7YA 4ZEFA 3M3FA 3OENA 3MPKA 2GH9A 1JEVA 3FXQA 4G2ZA 1SI1A 1VSOA 3KEIA 1SYHA 4EXLA 3PUYE 4Q0CA 3FVOA 1SI0A 1ANFA 3MVZA 4AQ4A 1B0LA 5H8SA 2IA4A 4F3PA 2O1MA 3EHUA 2DOJA 2THIA 3TCGA 2OK2A 1FTJA 1UTBA 4DLDA 4EF1A 1MM7A 1SQYA 4K3FA 1MPDA 4JWXA 3MC2A 2RINA 1EH3A 3IORA 2ZNSA 1B3EA 3EPEA 1NKXA 2UVJA 3PU5A 4U1ZA 2G93A 2XXIA 4IB2A 3MQ9A 2RCBA 3N6TA 2QS3A 4JSDA 2Q2AA 3L6HA 2ZYKA 2NXOA 4UACA 4KD5A 4X9TA 3LR1A 1CB6A 5I59A 4JWOA 4MBPA 1URGA 5FHOA 5CBSA 3Q25A 3JZJA 4DZ1A 2Q9TA 4R6HA 4RK9A 2NWJA 2R6GE 4HW8A 2O68A 4TOZA 5EYFA 3E3KA 4DXCA 3C31A 4R9FA 2I58A 5CC2A 1SW1A 1LCTA 2Z23A 1NNFA 3B6QA 2XXVA 4PFTA 1BKAA 1ZMGA 1AMFA 1URSA 2F7CA 4YMBA 2HAUA 3CFXA 2AYSA 4F19A 1PEBA 1US4A 4H65A 3A3UA 4YKIA 4F1YA 1L5TA 1GR2A 1N7WA 4FIMA 5AA1A 4N07A 3MVXA 1MDP1 2PMSA 5K2YA 3FD3A 2VP1A 3OO6A 4ISUA 3ODBA 1JW4A 3FXUA 4GIZA 2O6AA 1B52A 3GZGA 1EU8A 4WEPA 4JBZA 2I4BA 3ZKKA 3C32A 3DP4A 5M2VA 2E1SA 5L9SA 2UVGA 2GRVA 3E9XA 4YU0A 1M5FA 4ZEKA 2LAOA 4OFJA 3G3JA 3VXBA 2Q88A 4KQPA 4EF2A 4PFUA 4TLLB 2PVUA 3OOAA 3SEYA 3JV9A 1AOVA 1N3XA 1MY3A 2ALUA 4HS7A 2UYFA 3S9LC 1FQEA 2ONSA 3UA8A 1T0KA 3LSWA 3O29A 2REJA 3O66A 4KCDA 3PUVE 2PX1A 2O69A 3B6TA 2H25A 1H76A 1RKMA 3UORA 1S9TA 4H5GA 5DVJA 4OETA 1IITA 2ZYOA 2QMXA 4XKNA 1MPCA 1J1NA 1B4HA 4OMBA 3TTKA 1FQFA 2H99A 1NFTA 1B05A 5JK4A 2Z22A 3PUXE 4H8IA 4P0IA 3TZAA 2O1LA 1H3DA 1PB8A 3OEKA 4NF6B 3T96B 4C1TA 4BDQA 1B6HA 4KYSA 1MXXA 3KSJA 1P1UA 3A3CA 2IEEA 3H06B 1IXIA 2DYXA 3GLBA 1YTVA 2XXYA 1SD3A 2UXAA 3DP8A 3O6IA 2A5TB 1B5JA 5DEXA 3OELA 4POXA 5CM6A 1PDAA 1ZLQA 4UA8A 2DE2A 2P2AA 3MZBA 4NE4A 3DLNA 3MUQA 4NEDA 5CI5A 4FORA 4DXUA 5TP9A 3S9MC 3R26A 4OYVA 1M5BA 4R75A 1NL5A 1H43A 3KZGA 1SYIA 1MQJA 1PC3A 4KYDA 4EDPA 2O84X 4U22A 5CMCA 3MAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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