5CBRA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(3,4-dichloro-5-(5-hydroxypyridin-3-yl)phenyl)propanoic acid at 2.0a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA02
3PMWA 2UVHA 1B3EA 1A7LA 1XHYA 1N84A 4AB6A 2DVCA 2GHAA 4RK2A 3LSLA 1GGGA 3PUVE 2H25A 2F7CA 5H8FA 3D4CA 3PPPA 3E3KA 2OJTA 2Z8EA 4LZ7A 3ZKKA 1B46A 3VXBA 1B5JA 1WVJA 5AA2D 2UYFA 1MM6A 2DQVA 3M8UA 3IK6B 4BDOA 3H7MA 3UIFA 2P2AA 5KDTB 1MM7A 1B7HA 1NH7A 3FUZA 3OELA 2OLBA 1Y4CA 1OMPA 3MC2A 1LAFE 1M5EA 3SEWA 3O66A 1IEJA 1B7ZA 3QUJA 5I56B 2DYXA 3RLFE 2DWAA 4DCXA 1M5DA 2GHBA 3MVWA 4EDPA 1EU8A 4I1DA 3OO7A 4OETA 2R71A 1MRPA 4NWDA 1ZIUA 1OQGA 2OWTA 1H43A 4Q0CA 1QUKA 4FJPA 1O64A 4XXUA 4MF3A 3KEIA 1HSEA 1Y1ZA 5K2YA 2XXIA 2PVUA 4FECA 5I2NA 3PPOA 4OFJA 1F9BA 4R75A 2Q2AA 4ZEBA 3S9NC 3RPWA 1IUDA 1UIUA 4N13A 3PPQA 1IZ1A 2RC7A 2O7UA 1B3GA 2DXYA 4E0WA 3N6TA 1M5CA 5AA2A 2QS1A 2QS3A 4YICA 2RCAA 3RTFB 3T93B 2F36A 3RNNA 3N5LA 4QFPA 2DOJA 4E0XA 4TQUQ 3UA8A 5CMMA 2O51A 4OTEA 3H4ZA 3K00A 3TQLA 1RYXA 1FQBA 3S9MC 4PETA 4GWOA 2RC8A 1TFAA 1MXZA 1SW2A 3OO9A 3PD8A 3PGFA 4YB6A 3U93A 1PBQA 3TTMA 1A99A 1POY1 2NUVA 2XX8A 2XXHA 3B6TA 1DPEA 3FVNA 5DEXB 2H98A 4AQ4A 2Z8DA 4NF4A 4U22A 4ZECA 1USYH 3PPRA 2A5TB 3Q26A 5EHMA 3UORA 4RJZA 1QUIA 5I57A 1PB8A 1MH3A 4X9TA 3HPIA 5CC2A 3O9PA 4ESXA 4O3CA 3IB1A 1Y9UA 4WXJA 2Y7IA 5A5XA 2ONSA 4C1UA 3MVXA 4WEDA 5KZTA 1D4NA 3M3FA 3RT8A 1TWYA 3FXQA 1NKXA 3FVOA 3T9XB 1M5BA 1FQEA 1HSLA 1A55A 3CVGA 1I6AA 3VVEA 4MLQA 4R9FA 3K01A 3KFMA 2Z23A 3R6UA 4Q30B 3PPNA 2DE2A 4EQ9A 5DTBA 2I4CA 3SKPA 2O7IA 3DP4A 1AMFA 2AL4A 3H03A 3LSXA 3VXCA 5TP9B 4F1VA 2VP1A 4YKPA 3CG1A 1LAGE 2AIXA 3HCQA 4MH5A 4EXKA 4YAHX 1MS7A 2HEUA 4PQJA 4F1UA 3W9WA 3ZS6A 1PEBA 4PFYA 1MH4A 4IO2A 4XKNA 1BKAA 2QMWA 4DDDA 3KGCA 4RPNA 3MPLA 4KYSA 2Z22A 3SEVA 2I0CA 1PBPA 4FEBA 2I49A 3H06B 4ZEDA 3K1PA 1GR2A 3G3JA 1PB7A 5H8SA 2F7BA 3EQ1A 2Q9TA 3V83A 3A3CA 1P99A 4MBPA 4KFQA 3FATA 5DVJA 4EF1A 3MZ9A 5L8DA 2I0BA 3CSBA 1MXWA 3QYTA 2DXRA 2DS9A 4KYDA 5I56A 1HSJA 4BDQA 5I58B 5CRYA 3IOTA 3U92A 4FAJA 4H8IA 3MPKA 1SQYA 2F5XA 4F22A 3K4UA 4OERA 3EHUA 4FE8A 1XS5A 3ODBA 3VLWA 1B0LA 3HSTA 3MUQA 2F97A 4QFKA 2RINA 4DE8A 4ZEIA 4XKPA 2QMXA 3DLNA 4R9GA 1N7WA 4DXCA 1LFGA 3H6TA 4JXIA 4LZ8A 4G68C 2Y84A 3KZGA 1LLSA 1FTLA 1FQCA 5EYFA 1NNKA 2DSFA 4NTLA 1BTJA 2ZNTA 1DSNA 3E9XA 1S9TA 3T9VA 4DIGA 3T96B 4ISUA 3OXNA 3G3KA 4NF4B 5FTHA 1SI0A 2HAUA 1QULA 3GBAA 5I57B 4KQPA 1B32A 3CR9A 3MJNA 4H5FA 3W15C 2REGA 2P1SA 3JZJA 1B3LA 3TDJA 4G77A 2NVUB 3KN8A 1I6BA 2Y7PA 4ELOA 1AIVA 4HW8A 3VV5A 3S4UA 5DEXA 1FW0A 1B3HA 1ZKBA 4F31B 1BLFA 1B5IA 3SEUA 1II5A 3MP6A 1Y1MA 4HTGA 4AB5A 4BDRA 4QSCA 1N3WA 1DTZA 4QRZA 4GF8A 1FTOA 4G68B 1TFDA 3BFTA 4ZZAA 4OFOA 2QL3A 3MZBA 1JETA 4ZEFA 3SESA 1B5HA 3K6UA 2XD3A 4R72A 3U94A 4ND9A 1FQFA 4OESA 5JEIA 5CI5A 1Y3QA 3TEPA 4LQ5A 2V25A 3P7IA 2F8DA 4DXBA 1H45A 2X7PA 3ZKLA 1XVYA 4IO7A 3TUSA 1GVCA 4OFLA 5TPAB 1ATGA 4BDLA 1MG1A 2DE3A 3FXRA 4G8NA 2VGQA 1P1WA 5M2VA 1JW1A 3OO6A 4ESWA 3MWBA 3LR1A 5TP9A 3O6HA 3OEKA 2B3FA 1SW5A 1YCJA 3C35A 4DXUA 3Q28A 1Y4TA 4U21A 4UA8A 3PUZE 2ZNUA 2KLFA 1I69A 3H6WA 3RQTA 4POXA 3CG3A 3K1NA 3BKIB 2ZYMA 3VVDA 3TTKA 1SD3A 3OD7A 1SDXA 1B6HA 3OO8A 3KBRA 2HZKA 4YKKA 1XC1A 1SVXB 4BDNA 2XXYA 3FJGA 3GBBA 4F1YA 4XKQA 5FHMA 4R6KA 3HHGA 4BLAA 5FHOA 3VFJA 4ONYA 1DMBA 1FQAA 3PMVA 4OQOA 2GH9A 3CIJA 2CMOA 3K0VA 2HQ0A 1B52A 4Q8RA 4M1VA 3W9VA 4F3PA 3B7DA 2PT2A 1MY2A 1MY0A 5EHSA 1R9QA 2OWSA 5I58A 1NNFA 3I3VA 1US4A 5H8QB 2Q89A 1MDP1 1QVSA 4N07A 4NF8B 3BFUA 4U1ZA 5CMCA 3KOTA 3KN3A 2QJEA 2QS2A 3IORA 2VD2A 3OMBA 1YTVA 2B65A 1NNTA 5LOMA 2OBGA 1H76A 3S9EA 5AA1A 5AA4B 2I3VA 2XHDA 1N0TA 4N6PA 3O6GA 2G29A 1O7TA 4QFNA 4RPOA 3MQ9A 2VD3A 4U4XA 2UYEA 1MXXA 4OZ9A 1JW5A 4F2QA 3FGSA 4GL8A 4G8MA 3MW0A 3GLBA 1EZ9A 1ELJA 3FJMA 3QSLA 2O68A 2V3QA 1M5FA 3K2DA 4P0IA 4ZDMA 3H6UA 4R74A 3DP6A 1CB6A 3QAXA 3O97A 4JB7A 1B0HA 3OSQA 3UK4A 3VVFA 3TPAA 2Q88A 3VLVA 5L9MA 3MZ1A 3QUFA 3I6VA 5ICTA 1SW1A 1B51A 2NXOA 4ZZEA 1MPBA 4PP0A 1B1HA 4GVOA 4YU0A 2HXWA 1LAHE 3K6WA 5K2XA 3ILTB 2D3IA 3MP1A 3S9LC 2R9JA 4H5GA 1H44A 3TTLA 4U2RA 4G68A 1IQ7A 1P1NA 3O2AA 2YPNA 2AL5A 4Z0IA 1Y20A 3T9UA 1XOCA 2YJPA 3K6XA 2RF1A 2Q2CA 5JK4A 3GXAA 3S2VA 2QPQA 3MP8A 3CSGA 2I4BA 4FIMA 4EUOA 4C0RA 4POWA 3TTRA 1JNFA 1MQDA 3KN7A 3LSWA 4P11A 5TPAA 4BDMA 2IA4A 1MPCA 1MXYA 1I6QA 5CM6A 2ONRA 1IXGA 3KSJA 3FJ7A 1FTJA 3H6VA 1NNPA 5ITOA 2XXXA 1OLAA 3M3KA 4WEPA 4YMAA 1R9LA 1TXFA 1CE2A 3USDA 5F7VA 3G3HA 4IY6A 3EHSA 1Z7ME 3R7XA 2X26A 4QFOA 1B1XA 1Y3NA 2V93A 4MFIA 4THIA 4KHZE 2LAOA 2HCAA 3IOUA 4F3BA 1MQJA 1Z7NE 1VSOA 4MLVA 3QXMA 5FTIA 1KWHA 2F7AA 1UQWA 3RUMA 3RTWB 1QJMA 5L9SA 2XXPA 2V3UA 3Q27A 3QIMA 2I58A 1B05A 1EZOA 1Q1KA 1VFEA 2IEEA 1URDA 3FVGA 2G93A 3Q29A 4M4GA 1URSA 3SDFA 4NF6A 1S50A 4LP2B 4RY1A 2YLNA 3KJ7A 2GFEA 4OEVA 4I8CA 2X7QA 1FTKA 4IGTA 3PUXE 3U1OA 2OCUA 1IXCA 1AOVA 4X48A 3ZSFA 1LFIA 2PX1A 5H8QA 1DOTA 2ANJA 4RXLA 4K3FA 4NF8A 3D4GA 1OVBA 4QF9A 3FIRA 1JQFA 4PFTA 3CI8A 4H0WA 4ZE8A 5I84A 4JSOA 4RK9A 1LGBC 4JWYA 5CBRA 4ELQA 4OWDA 4QSDA 3Q25A 3EPEA 3N26A 1BP5A 4IO6A 3PMXA 5DYHA 2I3WA 1JVXA 3C34A 4I9DA 5AA4A 3IJXB 3OENA 4TLMB 3VLUA 3OSRA 1P1UA 1B3FA 4YB5A 3MVZA 3SEXA 1FTMA 2XD2A 2RKMA 1OVTA 1MQIA 1N7XA 3I5OA 1AH5A 2Z8FA 1LSTA 4ZS9A 3IB0A 4H65A 5KCJA 4YKJA 4R73A 1A8FA 4LA9A 3R26A 3CFLA 1Y3PA 3H3GA 5AE4A 3V89B 4DCYA 2A5SA 3CRBA 3G7WA 3OOAA 2F6PA 2XX7A 2XXUA 4IY5A 4PFUA 2I48A 5ITPA 5DT6A 4F18A 3ONMA 1P1OA 1MQGA 3LBSA 1GV8A 4RA1A 3LSFB 5HPQA 4KCDA 1N3XA 4FORA 2CZLA 3IL1B 3TMGA 2DWJA 4GIZA 2P0SA 5CBSA 3TCGA 2FNCA 3TAJA 5J1DA 3C33A 2RCBA 5F1QA 4GQOA 1P1QA 1NMUA 5DVFA 4TLLB 1B40A 1PDAA 3FD3A 3IR1A 1WODA 5H8HB 4JDFA 3UN6A 3TELA 5HM4B 2DVZA 1IXHA 2XXQA 1N04A 1VFDA 4H6DA 2ZYNA 2XXRA 3C31A 4R2BA 2OZZA 1H3DA 4F3SA 3IAZA 3TCFA 1SBPA 1MXVA 1MQHA 1LCFA 4HS7A 3GZGA 1UTBA 1QUJA 1IIWA 2B3BA 2F35A 1MDQA 1XT8A 2V3TA 3M3LA 4YKIA 2VOZA 4XKRA 3KOSA 4H67A 3O28A 1JVYA 1PB9A 4OHNA 2AYSA 2WKYA 2O84X 4LONB 1SYHA 4NF6B 1YAEA 5DVIA 3E4RA 1IXIA 1EH3A 4O3AA 4OENA 2ESNA 3U8QA 3LC8A 3KJTA 3LUYA 3FV2A 4RNSA 3C32A 2H99A 4JBZA 1QKBA 4KCCA 4NF5A 2DE4A 4HCYA 2UXAA 4U23A 1S7YA 4FEDA 3SEYA 1UTHA 2F34A 4P0GA 4Q5TA 5H8NA 5I59B 4EXLA 1BIYA 4IGRA 3HHFA 3IJOB 2E1SA 4XIGQ 3TKDA 2BJJX 3ECRA 3QK6A 2H4IA 4XTCQ 5CMKA 3JYRA 4JSDA 5JTYB 1ZBMA 1JW4A 2PT1A 3AXFA 1LFHA 3TODA 4GLIA 1LB8A 4KD5A 4FATA 3V8XB 4KI0E 3C9HA 1GTKA 1LBCA 2DWHA 5IAIA 3L6GA 1ZLQA 4U4SA 4ELPA 3K6VA 2HFBA 4ECFA 1J1NA 2ONKE 1NFTA 1MXUA 5KCJB 3F11A 3G3IA 5HBCA 2UVIA 1OLCA 3UGWA 4EF2A 4F39A 1N76A 1O63A 1ZJLA 4GXAA 2VHAA 3O29A 1MPDA 2UVGA 1JEVA 3K02A 3RY3A 2D5WA 5B7DA 1JEUA 3L6HA 2REJA 3PV0E 1SYIA 2R6GE 2Y7RA 4NEDA 1B9JA 3FASA 4JWOA 3N6UA 1ANFA 2Q8JA 3IO4A 3OEMA 2ABHA 2PBWA 2PYYA 2Y7WA 1B4HA 4LZ5A 2ZXTA 3IO6A 3HO7A 1US5A 4X1BA 4L17A 3T9HB 3DP8A 5I2KB 4IO5A 3FXUA 1LBBA 4ZEKA 5L9OA 1A8EA 1ZTYA 3K1MA 3A3UA 3C4MA 1B58A 4R2FA 2GRVA 1FQDA 2PMSA 3TZAA 2E0SA 2H5YA 4GD5A 4OVJA 4X1DA 3CFXA 2THIA 4NWCA 2O1MA 2ZMBA 2ZNSA 4G2ZA 3EHTA 5H8FB 3T66A 1ZU0A 3FV1A 5ELVA 3IB2A 1IITA 1VE4A 3PUWE 1DPPA 4H8JA 4G4PA 1UTBB 1USYE 1MY4A 1Q35A 4GL0A 4GFRA 4ELRA 1B7UA 5ISUA 3IOVA 3SETA 5H8HA 3B6WA 2HZLA 1D9VA 5FHNA 4OYVA 2QS4A 3EF7A 1L5TA 4IO4A 3B6QA 4LQ2A 4PE5B 3IX1A 4JWXA 4QHQA 4DLDA 1MY3A 1NH8A 3CFZA 3IOWA 1OQHA 1WDNA 4F2OA 3N94A 3C36A 1LCTA 3PUYE 3G3FA 5B70A 2UVJA 2QRYA 5KDTA 1AL3A 1QKAA 2Y7KA 4NF5B 2OK2A 3EN3A 1UTHB 5I2NB 3V5AA 5H8NB 1ZMGA 2ZYKA 2F78A 4ZE9A 4IB2A 5ICQA 2FYIA 3RGYA 3WAEA 1EZPA 1LAXA 3TCHA 4GXSB 5BUUA 1TT1A 5AA2B 4F29A 3E13X 5CMBA 1VR5A 2W7YA 3WAFA 3FVKA 4OXVA 3BBRA 1T0KA 3UP9A 3PU5A 3VE1B 1POTA 2QSXA 1QW0A 4EQ7A 2XX9A 3HV1A 4WKMA 5I59A 4F19A 3A09A 4QSEA 1DTGA 4OMBA 1LB9A 5BWJA 3SERA 5AA3A 2DP8A 3T22A 4YMBA 1XVXA 4GOTA 1SI1A 3THIA 4O3BA 4RYAA 2XXWA 5IKBA 4LATA 4UACA 4I62A 5JTYA 2FA7A 4PFWA 4R6YA 3JV9A 3G3GA 4R6HA 3MBPA 1B2HA 3PD9A 4KPTA 4GRKA 2V84A 3TTNA 3MAMA 3TYHA 3VDFA 1SW4A 2M8CA 3FZVA 4TOZA 3KSXA 1A40A 4EQBA 1D3KA 4LUBA 2RC9A 1FCKA 1MY1A 1UIVA 3ILUB 5A5XB 2NWJA 5TU0A 3TQWA 1YPNA 4KYEA 3DM0A 4KR5A 2A5TA 4NMYA 2I6EA 4C1TA 3DELB 4HCWA 2NOOA 3O6IA 1RKMA 2XXTA 3RN8A 4YB7A 4DZ1A 4NE4A 4H1XA 3RT6B 3U72A 1B4ZA 2O6AA 4Z7EA 4OEUA 2D21A 2HAVA 3KG2A 4U1OA 1NL5A 2O69A 1R6ZA 1RYOA 1R1NA 2F6GA 4F3GA 4G8HA 2H9BA 5I2KA 2ALUA 4LVQA 1D9YA 3HN0A 2DWIA 2O1LA 1PC3A 2XXVA 1OIBA 4IO3A 4YZZA 1URGA 2ZYOA 3MVYA 1A54A 4QFLA 3TFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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