5CBRA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(3,4-dichloro-5-(5-hydroxypyridin-3-yl)phenyl)propanoic acid at 2.0a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA02
2H99A 3K6WA 3HV1A 1H76A 5H8NA 2F8DA 1MY0A 1LGBC 4F18A 3EN3A 4QSEA 3HPIA 2ZYKA 4OEVA 4TLLB 1D9YA 2XXWA 3PV0E 1QW0A 4IO6A 1POY1 2FNCA 2I49A 4LATA 2F6GA 5I59B 4UACA 3LUYA 1SW5A 4XXUA 3F11A 1S50A 1MY3A 3RLFE 2UYEA 1PB9A 4RJZA 4DLDA 2DP8A 4F39A 4F3GA 1B7HA 2VHAA 1B46A 1QKBA 2GRVA 2KLFA 1IQ7A 1N7XA 2O6AA 1B0HA 1IEJA 2GHBA 5L9OA 2E0SA 1MXUA 3MBPA 3FJ7A 3CRBA 1MPDA 2DSFA 5F1QA 1DOTA 4IO7A 4GQOA 1A8FA 1IXIA 4RYAA 3TUSA 2OLBA 2O1LA 1IXGA 4GXAA 3IO4A 1B7ZA 4KYSA 2DWIA 2H98A 1R6ZA 3PGFA 4GLIA 2I4BA 4DXUA 4PFWA 3U1OA 2O1MA 3A3CA 3DLNA 2ANJA 1UTHB 4FE8A 5L8DA 1CE2A 3CFZA 3K00A 2DWHA 2ABHA 1SQYA 3FVGA 4MH5A 4QHQA 2DOJA 1VE4A 1Y3PA 4RNSA 3IOUA 3PD9A 4ONYA 5I2KA 3N26A 3OEMA 3PUVE 4ZS9A 2R9JA 1P1OA 4FEBA 2D5WA 3VXBA 2I3VA 5FTIA 2YJPA 3E9XA 5JTYB 4YB5A 2Y7WA 3RUMA 5I56B 2OWSA 4YZZA 1MXVA 2XXVA 4FAJA 3PMXA 2B3FA 1N04A 1O7TA 1TXFA 5H8FA 2AIXA 3FJGA 2XXRA 4GL8A 3TTMA 2XD2A 1VSOA 3M3LA 2XXPA 3RNNA 4JWOA 1WODA 4YMBA 4H5GA 1P99A 1DTGA 5DVFA 3IOTA 2D21A 2PYYA 1YTVA 4U1OA 3HO7A 4IY6A 3I3VA 1T0KA 2F6PA 5KDTB 4JWYA 3OXNA 3N94A 1JNFA 4F1UA 3IB1A 3JYRA 4ZDMA 1S7YA 4JXIA 4OETA 4WEPA 3G3JA 5K2YA 4BLAA 1PBPA 1R9QA 1YCJA 3FV2A 3VFJA 1POTA 1DPEA 4ZZEA 3UP9A 4MF3A 3IOVA 3DP6A 4F22A 5FTHA 2LAOA 2I48A 4IY5A 1M5FA 3OMBA 5CBRA 1MDP1 3TFLA 3TPAA 4O3BA 3CVGA 3SEYA 4NF6A 3DP4A 3RT6B 1Y9UA 3S9EA 3MPKA 4YKPA 4LVQA 1NMUA 2NUVA 2AYSA 5JEIA 1SYIA 2F7AA 1NFTA 3IB0A 3GBBA 4XKNA 2GFEA 3BFUA 5ICTA 1N3WA 1MPCA 1RKMA 3VVFA 1AIVA 2B65A 4F1YA 3H06B 3LSFB 4THIA 5CMMA 4NF8B 3S9MC 5L9SA 5TPAB 5H8QB 1DPPA 1TT1A 4AB6A 4GVOA 3TQLA 3SERA 4K3FA 1N76A 5BUUA 3GZGA 3G7WA 4R72A 3VLWA 1B05A 3OO8A 2V3QA 4FORA 1FTJA 1LAFE 3OEKA 1LAXA 1B5HA 1B52A 2B3BA 3KN7A 5ISUA 4PFTA 5ICQA 1EZPA 3VVDA 1FTOA 1PB8A 5H8HA 2D3IA 4ZEFA 4R74A 2AL4A 2V93A 4ZEBA 4BDOA 4U1ZA 3K6UA 2H9BA 1B40A 3VLVA 4XIGQ 3FD3A 2I0BA 2RC9A 5B70A 1TWYA 1LB9A 4U2RA 2PMSA 1FTLA 5F7VA 1OMPA 5CBSA 1ZBMA 2HZLA 1LB8A 3LSXA 4NF5A 1Y20A 3PPNA 4OZ9A 1OLAA 1UTBB 1P1UA 3E4RA 3L6HA 3IX1A 5HM4B 4H67A 4YB7A 4ZE8A 4UA8A 2QL3A 2DE2A 3QIMA 3TAJA 2CZLA 2HAVA 1ZU0A 3EHTA 5ITOA 3PUWE 3FATA 4ZEKA 3LR1A 2HQ0A 1ZIUA 4LZ5A 3KSJA 1M5DA 1FTMA 2Y7RA 3O9PA 3FXQA 1URDA 5I57A 3B6QA 3RT8A 2A5TB 4GL0A 3EF7A 4EQ7A 3DELB 3UK4A 3S4UA 4I8CA 1MXZA 3SETA 1HSLA 1H3DA 1MDQA 4X9TA 1J1NA 4QFOA 2I0CA 4G68B 4IGTA 4ELQA 1PEBA 3O28A 4LZ7A 3G3FA 2H4IA 3EHSA 4NF4A 4YKKA 1A7LA 2VD3A 4QSDA 3SEVA 2HAUA 1XT8A 4Q0CA 1NL5A 4F19A 4IB2A 4Q5TA 1RYXA 4GIZA 3T66A 4G8HA 4RXLA 2QS4A 3FVKA 2UVGA 1QKAA 4YKJA 1IUDA 2DWAA 3L6GA 2UYFA 3CFLA 3FVOA 2QS3A 1IITA 4QFKA 3H3GA 2F35A 5AA2A 4ND9A 5CMBA 1TFAA 3FASA 3JZJA 1LBBA 4OYVA 3KG2A 4JB7A 2NXOA 1NNFA 1GTKA 4JDFA 1QULA 2RC8A 3UA8A 1B7UA 1Y1MA 2VOZA 3KJTA 3SDFA 2NWJA 3S9LC 1NKXA 4Q30B 2O69A 3KZGA 4DXCA 4G8NA 2OJTA 2HCAA 2VGQA 4HS7A 3FJMA 1BKAA 3P7IA 2VP1A 2ZXTA 1FQBA 2V3TA 4XTCQ 2Q89A 1SI0A 1D4NA 3K2DA 5I59A 3IJXB 1FQCA 2Z23A 3PMVA 4H5FA 4QFNA 3EPEA 3RTFB 1MH4A 4RK9A 3SESA 5H8SA 4YKIA 3K1MA 5IKBA 3IORA 2A5SA 2ONKE 4KYDA 1M5BA 5DT6A 1USYH 4PE5B 1B1HA 4KCDA 1ATGA 2HFBA 2HEUA 4IO2A 4NWCA 4KYEA 4G2ZA 3RY3A 4C1UA 1LCTA 5HBCA 1MY4A 2P1SA 3TKDA 3H6TA 5EHSA 3OO9A 3B7DA 1MY1A 1L5TA 2XX8A 1UTHA 4OWDA 1B3HA 1B1XA 3V8XB 3TTNA 4DIGA 1SBPA 1D3KA 4OERA 1JW4A 1IZ1A 3PU5A 3MAMA 4GF8A 1MPBA 1P1WA 3LC8A 3CSGA 1SI1A 4G77A 3M8UA 4WEDA 2V25A 4XKQA 5AA3A 1USYE 5KZTA 3WAEA 4JSOA 5I56A 2O7IA 4O3CA 1B9JA 3ECRA 4EXLA 3TMGA 1A99A 3SEXA 4LZ8A 3CG3A 5CC2A 1IXHA 1Y3NA 3D4CA 2OCUA 5FHNA 2DQVA 1SW4A 1B5JA 3GXAA 3ILTB 3V89B 3KSXA 2I58A 3KN8A 4YB6A 3RTWB 2Y84A 1VFDA 1VFEA 3USDA 5AA4B 3MW0A 5A5XB 1A40A 5AE4A 1H45A 2Z22A 3C9HA 3RQTA 1AOVA 3EHUA 3H6WA 3PUXE 1URSA 4F2OA 1EZ9A 3C4MA 3MWBA 1SW1A 3C34A 5KDTA 3O6IA 2RCAA 2ALUA 2PT2A 4GRKA 1B0LA 3PMWA 3DP8A 4ESXA 3VE1B 2Z8DA 3OELA 1XOCA 1MQJA 2OBGA 4HTGA 3LBSA 4KD5A 4ELOA 1UIUA 4G8MA 4OESA 1TFDA 1AL3A 1FW0A 4EQBA 3M3KA 2RC7A 3QK6A 2NOOA 4H1XA 2F36A 1VR5A 1B4HA 1JVXA 3H4ZA 1SD3A 2V3UA 1NNKA 3KN3A 1FQAA 3R6UA 4FJPA 1M5CA 5DVJA 2IEEA 3TCHA 3MJNA 3O97A 5I58A 5DYHA 3CG1A 3K01A 4LA9A 3R7XA 3Q27A 3GLBA 4F2QA 4IGRA 4ELRA 3CFXA 1DTZA 4I62A 4ZEIA 1OQHA 2Y7IA 1SVXB 4KQPA 5AA1A 2O51A 3ZSFA 1KWHA 3SKPA 4HCYA 5TPAA 4EF2A 5H8QA 3GBAA 5AA2D 1FQFA 3M3FA 1EH3A 5FHMA 3FXRA 2RF1A 3U93A 3EQ1A 1O63A 1D9VA 3K1PA 2ZYMA 4EXKA 2ESNA 2M8CA 4GFRA 5DEXB 4PETA 3QAXA 2OK2A 1MQDA 2F5XA 1WVJA 2I6EA 3T9VA 1ELJA 3QXMA 5ITPA 3S9NC 3V5AA 3SEWA 5I84A 2WKYA 3TODA 1B58A 3HHFA 3MPLA 4MBPA 2VD2A 3TZAA 4TQUQ 3PD8A 5KCJB 1DSNA 1LFGA 4R9GA 2Z8EA 1QVSA 1XC1A 2QS2A 3ILUB 3O2AA 5CM6A 4LQ2A 3HCQA 3ODBA 1I6BA 1B3EA 4KR5A 2F78A 5TP9B 1FCKA 4H8IA 1LBCA 4POXA 3TCGA 3ZKKA 3QSLA 4JBZA 3PPRA 1AH5A 1MY2A 4N6PA 3CI8A 3I5OA 1UTBA 3TQWA 2X7QA 4EQ9A 3MP6A 1M5EA 4Z7EA 5CMKA 2Q8JA 1N7WA 3MUQA 1R9LA 4JSDA 1N84A 1BP5A 2FYIA 2ZNUA 4LONB 3OSQA 3CSBA 4M1VA 3IL1B 5EYFA 4FATA 2REJA 2DVZA 3MZ9A 1JW1A 2QS1A 1GVCA 3E3KA 2A5TA 3MZBA 5J1DA 4OFLA 3H7MA 1NNTA 4MLVA 2G29A 4G68A 2QPQA 1Y3QA 3Q29A 2RKMA 2XXXA 4NTLA 2XXUA 5B7DA 3A09A 1H43A 2Q88A 4BDLA 2AL5A 2CMOA 3C36A 4R2FA 5BWJA 3W9WA 2ZNTA 1OVTA 3K1NA 1QUKA 3K0VA 3VXCA 5EHMA 4U22A 4L17A 3CR9A 1XS5A 4F3SA 3OOAA 3PPOA 1QUIA 4O3AA 3VLUA 4ELPA 4DXBA 4N13A 4U23A 2ZMBA 3OO7A 2GH9A 3RPWA 2YLNA 3IJOB 4NF4B 2DE4A 2QSXA 1RYOA 3IK6B 3MVZA 4NMYA 2XXYA 4ZZAA 5I2NB 1JETA 3FV1A 4H65A 4LUBA 4QFPA 4F1VA 3H6UA 1B6HA 3G3KA 3MQ9A 4F29A 3TDJA 3O29A 4X48A 2O84X 2Z8FA 5TU0A 3RN8A 2QMXA 4QRZA 4RA1A 1PC3A 2HZKA 3KFMA 4U4XA 5H8NB 2ONSA 1O64A 3MVWA 3ZKLA 1LAHE 2XD3A 1B5IA 3MVXA 4H0WA 3N6TA 4POWA 2V84A 2XXTA 3BFTA 3QYTA 1LCFA 3TTKA 4H8JA 3IOWA 3HHGA 3MVYA 4IO5A 3U72A 2Q2CA 3OD7A 3UORA 4AB5A 3FGSA 1YPNA 1HSEA 4NEDA 1GR2A 1S9TA 4PP0A 3KEIA 3TELA 2F7CA 3K02A 4LP2B 4YAHX 2P2AA 2PVUA 4GXSB 1BLFA 4OTEA 1B4ZA 4AQ4A 2PT1A 4F31B 1A55A 1JQFA 1GGGA 2G93A 4E0XA 1R1NA 1MM7A 4E0WA 3IAZA 4LQ5A 3N6UA 4JWXA 5LOMA 3O6GA 1LAGE 4QFLA 1DMBA 4RY1A 2DXYA 4QSCA 1SW2A 5JTYA 2Q9TA 4KCCA 3ZS6A 1FTKA 5K2XA 3C31A 4PFUA 1LFHA 4OMBA 3AXFA 4RK2A 4OHNA 1EZOA 5JK4A 3KJ7A 4U4SA 3KGCA 3KOSA 3D4GA 5I2KB 2OZZA 1IXCA 4N07A 3H6VA 3C35A 1LFIA 5FHOA 4R6HA 5AA4A 3B6WA 5A5XA 2ZYNA 1ZJLA 3BKIB 4DCXA 4G68C 3C32A 4F3BA 4WKMA 1OLCA 3K4UA 4R6YA 1LSTA 2RCBA 3TTRA 1MQHA 3QUJA 1Z7NE 1MXWA 4XKRA 1HSJA 3FZVA 2F97A 4G4PA 4YICA 1FQEA 1II5A 2YPNA 2PBWA 3G3HA 1Y1ZA 3Q26A 5H8FB 4PFYA 3Q25A 3VVEA 2I3WA 2XHDA 3B6TA 3IB2A 2IA4A 1ZTYA 1MS7A 3TYHA 1CB6A 2REGA 5DVIA 2F7BA 2X7PA 3BBRA 1SYHA 2ZNSA 3IO6A 1JW5A 3O6HA 2X26A 3K6XA 1PBQA 4F3PA 4NWDA 4WXJA 1P1QA 2Q2AA 4EF1A 4IO4A 1XVYA 1F9BA 2DVCA 1XHYA 2THIA 1P1NA 1MXXA 2ZYOA 2HXWA 3T9UA 3T9HB 4PQJA 3ONMA 1ZLQA 3T22A 4OVJA 2DXRA 1I6AA 1JEVA 4DCYA 4P11A 4R75A 3HN0A 3U94A 4M4GA 4FEDA 4X1BA 1H44A 3HSTA 1NH8A 4OXVA 1US5A 4C0RA 4YMAA 1JEUA 4NE4A 3E13X 3N5LA 1MG1A 4ISUA 1B2HA 3A3UA 4NF8A 4NF6B 1EU8A 2R71A 2RINA 4TOZA 3KBRA 5I58B 4FIMA 4KPTA 4OFJA 5DEXA 3UGWA 2Y7PA 3MZ1A 4MFIA 3RGYA 4BDNA 4P0IA 3PUYE 2H25A 3LSLA 1UIVA 3QUFA 3G3GA 4GD5A 1FQDA 4BDRA 4XKPA 5KCJA 1A54A 3IR1A 4GOTA 3Q28A 2UXAA 2QJEA 2P0SA 5IAIA 3O66A 4QF9A 1SDXA 2DE3A 2QMWA 3VV5A 1I6QA 3C33A 4RPOA 4OENA 4ZEDA 4MLQA 1NNPA 5TP9A 3DM0A 3FXUA 4R6KA 1MM6A 1BTJA 3MP1A 4C1TA 4ZE9A 4TLMB 5H8HB 1N0TA 4FECA 1MXYA 4R73A 1B3LA 1US4A 4OQOA 4Q8RA 1ANFA 1B3GA 3W15C 1Q35A 3H03A 4YU0A 4I9DA 2O7UA 5M2VA 3KOTA 1NH7A 1Z7ME 3G3IA 1UQWA 3PPQA 2XXIA 1GV8A 1LLSA 1URGA 2Y7KA 1I69A 3U92A 4DDDA 2ONRA 3FIRA 3WAFA 3MC2A 1ZKBA 4BDMA 5CMCA 4NF5B 3FVNA 4ESWA 4R2BA 3OSRA 1MQGA 1XVXA 3MP8A 3UN6A 5ELVA 1B51A 1YAEA 2XXHA 3OO6A 1PB7A 3R26A 2DS9A 3THIA 3TTLA 4KFQA 1PDAA 3T9XB 4DE8A 3K6VA 2GHAA 1Y4CA 4R9FA 4RPNA 4IO3A 1OVBA 4GWOA 3PPPA 5L9MA 5CRYA 1A8EA 4P0GA 2XXQA 3FUZA 4HW8A 3OENA 2FA7A 2BJJX 1Y4TA 1WDNA 2DYXA 5I57B 3JV9A 2NVUB 3V83A 1OQGA 4Z0IA 5CI5A 1JVYA 3CIJA 2E1SA 1N3XA 4BDQA 4OEUA 4EUOA 3SEUA 1B32A 2UVJA 5HPQA 2H5YA 3TEPA 2QRYA 2F34A 4HCWA 2OWTA 2R6GE 5DTBA 2XX7A 2I4CA 3S2VA 4H6DA 2UVIA 1MH3A 2O68A 3PUZE 4DZ1A 3UIFA 4KHZE 1IIWA 1OIBA 3I6VA 4ECFA 1B3FA 3W9VA 3LSWA 5I2NA 4I1DA 2W7YA 3T96B 3T93B 3U8QA 4X1DA 4U21A 2UVHA 1Q1KA 4EDPA 4KI0E 2DWJA 1ZMGA 1MQIA 1BIYA 3VDFA 1QJMA 1MRPA 3TCFA 1QUJA 5AA2B 4OFOA 2XX9A 1AMFA 4ZECA 2PX1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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