5CMCA

Mnemiopsis leidyi ml032222a iglur lbd e423s mutant glycine complex
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
LIGRHLRLGSVESQPFMFFATEGCEGNDCWSGMVNDMVVKLSEDLGFTYEYIQPDDRKFGALNKTTNEWNGMIRDLLDDKTDMIAIDLSTNSARKSAIDYSFPFMDAGIKAVVKGEGTTLNQVLELLDQDKYKWGVIGSRHPETLLKTHRDSRYSRLVDEGVELKDLNHAIETLRGGLFVFIDEGPVLAHNLISDCDVFSVGEEFQSFEYAFGLPKDSPYKSLIDSHLLKFREEGFIDILWEKWSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular lock regulates binding of glycine to a primitive NMDA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ML032222a iGluR
molecule tags Membrane protein
source organism Mnemiopsis leidyi
total genus 79
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cmcA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cmcA02
2DOJA 4RK9A 5I56B 3K01A 3EHTA 1MY2A 3EF7A 4IY5A 4YAHX 3SDFA 3PUYE 4FJPA 1B3HA 2DS9A 4H5FA 3U8QA 4ZECA 3LC8A 2DVCA 4OYVA 4OFJA 4F29A 1B7UA 4G68A 3W9VA 3S9MC 3JZJA 3O2AA 4MF3A 4GD5A 1LLSA 3O6IA 3QYTA 2I3VA 4QRZA 2PX1A 4M4GA 2RINA 1UTHA 1B2HA 2M8CA 4ELOA 1BLFA 1SW4A 3MBPA 1OQGA 1IXCA 3N6UA 4RNSA 3CSGA 3FGSA 1MY3A 3MP1A 3KJ7A 5I57A 1Z7ME 5L9OA 4YMAA 4THIA 2I6EA 1S7YA 2X7QA 5I59A 3USDA 5DT6A 4FORA 4OEUA 2GHBA 5CRYA 5KDTA 4I62A 2FNCA 4EXKA 1Y4TA 4N6PA 4QSDA 3TDJA 3LSFB 5I84A 4FIMA 4F1VA 1NFTA 1D9VA 4Z0IA 3RN8A 4WXJA 4ELPA 3E9XA 4EQ9A 2ONRA 4RK2A 1MPDA 1R9QA 4DDDA 1SVXB 3LBSA 3TAJA 2YLNA 4NF5B 4C1UA 4XKNA 1AMFA 3HN0A 3K00A 2AIXA 3HSTA 3HPIA 1FTMA 4GXSB 1HSLA 2ZYNA 4WEPA 2YPNA 3VDFA 3VXCA 1DSNA 4JWYA 3RGYA 5FHNA 3QSLA 2UVGA 4DZ1A 1UTBB 2QRYA 4PFWA 4X9TA 4P0GA 1FTKA 3T9UA 4OESA 1XVYA 4OWDA 2XXVA 4LZ7A 4QFOA 4RPNA 3UA8A 2HEUA 2ZYMA 1QW0A 4HS7A 1B1XA 3V89B 3T96B 1MXVA 2THIA 5CC2A 3OEMA 3TODA 5H8NB 1VE4A 1ZIUA 1AL3A 4POWA 1MY1A 1BIYA 4NWCA 3TPAA 1A40A 1H45A 5I58B 4ISUA 4ZEFA 3LSLA 4R74A 3TTKA 3K1NA 5JEIA 2R71A 1N3WA 3H3GA 1MXUA 2XXRA 1N7WA 4GL0A 3HO7A 4MFIA 4I8CA 3QUFA 1JW1A 3IOVA 2CZLA 3IJOB 3KN8A 4FEBA 1NNKA 2ZNSA 1IXHA 1B32A 4H8JA 5ICQA 3OO7A 4YKKA 2OJTA 2OBGA 3H6VA 3T66A 3EQ1A 3PUZE 1A8FA 5HBCA 4OHNA 5DVJA 1OIBA 3VXBA 5K2XA 4OFLA 5A5XB 4DCXA 3KOSA 2P0SA 2V93A 1B6HA 1LAGE 5H8HA 4ELQA 1URGA 4WEDA 4R75A 3L6GA 4XXUA 3PPQA 4GLIA 5M2VA 1PDAA 2D3IA 1S9TA 4TLMB 4H1XA 2DP8A 1GV8A 4KI0E 2QL3A 3HCQA 3IOUA 1RKMA 2ZXTA 3K02A 3TFLA 3RTWB 1UIVA 3QIMA 4GXAA 2QS4A 3IO4A 1Y4CA 1ZBMA 1AH5A 4G2ZA 3OO8A 4LZ8A 4G68C 1B9JA 1QJMA 5I2NA 1YPNA 3CI8A 4RPOA 3VLUA 3B6WA 4HTGA 1B4HA 3N26A 2UXAA 3OEKA 3IO6A 1SBPA 2V3UA 4C1TA 5B70A 4KCDA 2QPQA 3T22A 4PFUA 2UVJA 4MLVA 3FXUA 2HZKA 5JTYA 2RCAA 4E0XA 3Q26A 3K1MA 5FHOA 1MXWA 1TXFA 2OK2A 3AXFA 3VVFA 5CI5A 2E0SA 4LZ5A 3GLBA 4MH5A 1QVSA 4UA8A 4EQBA 1A99A 2NVUB 3IOTA 2P2AA 3EHSA 3MPLA 3B7DA 1PB9A 1MQGA 5H8QA 5FHMA 1Y1ZA 3VVDA 4NE4A 4Q0CA 1N7XA 3TQWA 3ILUB 2ZYKA 3CFZA 2Y7PA 4BDLA 1N76A 1TWYA 5EHMA 3FVKA 1DTGA 2I3WA 5H8FB 5KCJB 3CG3A 2QS3A 1MM7A 2GRVA 4EUOA 2Q2AA 3E4RA 4U2RA 4XKPA 3KN7A 4FEDA 1MH4A 3H6WA 4PFYA 3Q29A 2REJA 1B52A 1R9LA 3GBAA 2F7AA 1MRPA 4ZE8A 3PGFA 3PPRA 4K3FA 5BWJA 1MS7A 2Z22A 1NH8A 4KQPA 1NNPA 1EZOA 3KG2A 2F35A 1WDNA 1GR2A 1P1WA 2A5SA 1M5DA 4X48A 3UP9A 2RCBA 3PMWA 2F7BA 2R6GE 4EF2A 2IA4A 1A8EA 5AE4A 1SYIA 4IGRA 3MVZA 2AYSA 4U1OA 4IY6A 2DE2A 3ZKLA 1MG1A 4TOZA 4AB6A 3O97A 1XHYA 1LAFE 4OENA 1SYHA 2DXYA 1D4NA 1B1HA 2O7UA 1GTKA 5FTHA 1FQFA 1L5TA 1IUDA 2XXUA 1F9BA 2QSXA 2BJJX 1B4ZA 3G3IA 4LUBA 2VOZA 2OWTA 3BFTA 2VD3A 1MY0A 3DELB 1MH3A 4EDPA 1A54A 3ECRA 4H0WA 2A5TB 3CVGA 4F19A 2F6GA 2XXYA 2Y7KA 4OTEA 3VV5A 3JV9A 1Q1KA 3IOWA 3TCGA 3PU5A 1QULA 2OWSA 2F78A 4DLDA 4R6YA 1POY1 1FQDA 5DVIA 1URSA 3TTNA 3MUQA 4NF4B 3LSXA 4JB7A 1SI0A 1FQAA 2UVIA 4RY1A 3FVGA 1LB9A 3PMXA 2F6PA 1B05A 3I5OA 3F11A 4LATA 3RPWA 2VHAA 3ZKKA 4AQ4A 4DIGA 2F97A 2V84A 3GZGA 1OLCA 3KGCA 4I9DA 2CMOA 1PB8A 5I58A 3OO9A 1LGBC 4NWDA 4IB2A 1MQHA 1M5CA 1MPBA 2B3FA 3C32A 3OD7A 5L9SA 3S4UA 4TLLB 3C36A 2DWAA 1VSOA 2NOOA 3N94A 1I69A 2XXPA 4OZ9A 1BKAA 2O51A 3FV2A 4F31B 2PVUA 4R6HA 3OXNA 2ZYOA 3PUVE 4OERA 5CMKA 2RC9A 1OVBA 1ZJLA 3MWBA 3MJNA 3SEWA 3LR1A 5A5XA 4F3GA 3SEXA 1ZU0A 4LQ5A 2Q88A 3RY3A 4JBZA 2REGA 5K2YA 1FTLA 2I58A 4IO4A 2FYIA 4XTCQ 3BFUA 4JXIA 3CG1A 2DSFA 5DEXB 3Q25A 1Y3PA 1LAXA 3TQLA 4R6KA 1CE2A 2DE4A 1ATGA 1Y3QA 4HCWA 2PT2A 4N13A 1SD3A 4BDNA 1D9YA 4YKIA 2LAOA 2QMXA 3P7IA 4H5GA 1B3FA 2XXQA 5I2KA 2I4CA 1FTJA 2Y84A 4GL8A 1MDQA 2QS1A 3U72A 2Y7IA 1EZ9A 1VFDA 3KBRA 2HQ0A 2KLFA 2ZMBA 3TZAA 3H6UA 5CMBA 4BDMA 3Q27A 3U94A 3FUZA 3ZS6A 2G29A 3S9NC 4YKJA 1H3DA 1JVXA 1QKAA 2ONSA 3MZ9A 2XXIA 4ELRA 3CSBA 4U22A 2NXOA 1UQWA 1YTVA 2DWJA 1Z7NE 4QFKA 5ITPA 2H5YA 1UTHB 4G4PA 3L6HA 5AA4B 4ND9A 3FIRA 1SQYA 2ABHA 3WAFA 4M1VA 3QK6A 3MVXA 3GBBA 2Z8FA 1NH7A 1N0TA 3PMVA 3B6QA 4PE5B 2V3TA 5TPAA 4IO2A 5KCJA 3IJXB 3B6TA 1NNFA 3R7XA 1D3KA 4YZZA 4ESXA 1ZKBA 1LBBA 5CMMA 3HV1A 4NEDA 1FQBA 4ZZEA 5KDTB 1WVJA 1QUJA 5F7VA 3D4GA 4X1DA 1I6QA 1JETA 3HHFA 5DYHA 1Q35A 3MAMA 4G8MA 4KHZE 1NL5A 1MQIA 1YAEA 5BUUA 4WKMA 4ZEBA 3OO6A 4FECA 3RT8A 4OMBA 3V5AA 4RYAA 2ZNUA 1B0HA 4R9FA 3G7WA 1N04A 4QSCA 1ZLQA 2XXWA 3DM0A 4QF9A 1YCJA 1B5HA 1IEJA 4U4SA 3SETA 1FW0A 4O3BA 3U93A 1B5IA 4U4XA 2XXXA 1PB7A 3IR1A 1P99A 3K6UA 3T9HB 3T9VA 2YJPA 4LONB 1USYH 1N84A 4GRKA 3TKDA 1NNTA 4MLQA 3SEYA 1RYXA 2UYEA 1RYOA 3IK6B 1NKXA 1SW2A 2XX8A 3DP4A 3QAXA 3R6UA 1EH3A 4QFNA 5DTBA 1PBQA 4GOTA 3FJ7A 1SI1A 3IB1A 2Q8JA 1Y20A 1DPEA 1R6ZA 5ITOA 4QHQA 2XXTA 1JW4A 5I56A 2H25A 3UN6A 1JEVA 3M3KA 3FJMA 5B7DA 2XHDA 3TCHA 4GIZA 2OLBA 2H98A 3K6XA 4NF4A 1H44A 2RC8A 3RNNA 4I1DA 3TCFA 2VGQA 3GXAA 3H7MA 4PETA 4RJZA 2DVZA 1ZTYA 3T9XB 1MPCA 2ANJA 2FA7A 3VE1B 3DP6A 1Y3NA 4ZEDA 4MBPA 2Z23A 3E13X 1JQFA 5FTIA 1JNFA 3C33A 3K1PA 3IB2A 3KFMA 2PBWA 5AA2D 4PQJA 5EYFA 5IAIA 2ESNA 4F2OA 3IL1B 5L8DA 1XOCA 4OVJA 2DWHA 4XKRA 3SERA 3MP6A 5KZTA 2PT1A 5TP9B 2ZNTA 4POXA 2QS2A 5HPQA 4ZE9A 1JEUA 4Q30B 2B65A 3KSJA 1MQJA 1MXYA 4OFOA 4RA1A 3R26A 3JYRA 1XT8A 1EU8A 3CFLA 3WAEA 1H76A 3C34A 3EPEA 3A3CA 5L9MA 3FXQA 1USYE 2X7PA 3CRBA 2F8DA 2VP1A 4DE8A 2RF1A 4R9GA 1MY4A 5I2NB 3TYHA 1LFIA 4NF5A 1LFGA 1CB6A 4NF8B 4L17A 2DYXA 4BDQA 2H9BA 3KZGA 4FAJA 4XIGQ 3RT6B 4IO5A 4XKQA 4OETA 5DEXA 1M5EA 4H8IA 4JSOA 1AOVA 4LQ2A 5JTYB 4LA9A 3G3FA 4X1BA 3DP8A 1AIVA 3KJTA 3KN3A 3PPNA 1XC1A 3IX1A 1I6BA 1UTBA 2RKMA 4F1YA 2PYYA 2PMSA 4JSDA 2AL5A 4F3PA 1LFHA 4DXCA 2F34A 3IAZA 1MDP1 1B51A 1B0LA 3FXRA 1OLAA 5AA3A 1BTJA 1US4A 2I48A 5H8QB 3A3UA 3UGWA 3O6HA 1IZ1A 2ALUA 1XVXA 1B7ZA 3RUMA 3MVWA 4YB7A 4HW8A 3O29A 5ISUA 3EN3A 3O6GA 2B3BA 5H8NA 3FV1A 4R72A 3ZSFA 4ZEKA 3SEUA 3M3FA 1H43A 2V25A 4KYDA 4G77A 4U23A 3PPOA 4ECFA 3MQ9A 3BKIB 2XXHA 4UACA 2D21A 2F5XA 1TFDA 3SESA 1O63A 5AA2B 2O1MA 1EZPA 4GF8A 1FQEA 5AA4A 1FCKA 1J1NA 5HM4B 3CFXA 4F39A 3VLVA 2I49A 3FATA 3FJGA 5CM6A 1II5A 2G93A 2O69A 4NF6B 1MQDA 3MP8A 3RTFB 1LAHE 1LB8A 2NWJA 5IKBA 3G3GA 3CR9A 4ZZAA 3U92A 2H4IA 1IIWA 4F1UA 4Z7EA 2Y7RA 2WKYA 4FE8A 2GHAA 2V3QA 3SKPA 1DTZA 1LCTA 3PD8A 4QFPA 4R2BA 4JWOA 2OCUA 4H6DA 1P1NA 4NMYA 2O6AA 4P11A 4C0RA 3VVEA 3A09A 2I0BA 3CIJA 1XS5A 3O9PA 4LVQA 3G3HA 1P1OA 2HZLA 3PUXE 1HSJA 1A7LA 1PEBA 5CBSA 5J1DA 1B7HA 2UVHA 4BDOA 1M5BA 3K6WA 3N5LA 4F2QA 3BBRA 3UK4A 3E3KA 3I6VA 2GH9A 2Z8DA 1Y9UA 3H6TA 3IORA 3MPKA 1N3XA 1LSTA 3C9HA 1JW5A 2UYFA 4OQOA 4YKPA 4O3CA 3KSXA 3UORA 4JWXA 1OVTA 4F3SA 1M5FA 1P1UA 4R2FA 1MM6A 4KYEA 3K0VA 4ZDMA 1B3EA 4P0IA 4PFTA 1R1NA 2HAVA 1MXZA 1TT1A 1Y1MA 2DXRA 2F7CA 1WODA 4Q8RA 5ICTA 4YICA 2W7YA 4G68B 1FTOA 1SW1A 3K2DA 5ELVA 4KFQA 1O7TA 2QJEA 2OZZA 1OQHA 1T0KA 3TTRA 4IO3A 1DOTA 2HCAA 4R73A 2Z8EA 2XD2A 1IXGA 2R9JA 3UIFA 5I57B 1BP5A 1ELJA 4ONYA 4N07A 3RLFE 4F3BA 5H8FA 1VFEA 4JDFA 3S2VA 5I59B 4Q5TA 4NTLA 3KEIA 2AL4A 4FATA 1P1QA 2VD2A 3KOTA 4DXUA 1MXXA 3FVNA 2XX7A 3RQTA 2D5WA 3O66A 3OENA 5F1QA 1PBPA 3ODBA 3TUSA 1B5JA 1TFAA 3MZBA 2O68A 1B3GA 3ILTB 5TP9A 4ZEIA 4G8NA 3FASA 3ONMA 3W15C 4HCYA 4LP2B 4E0WA 2F36A 1I6AA 4F18A 3U1OA 1FQCA 4U1ZA 3MZ1A 4IO7A 4EXLA 2X26A 2P1SA 4YMBA 3I3VA 1SW5A 3LSWA 5AA1A 3V83A 2I0CA 1VR5A 4YB6A 3G3JA 5I2KB 3OMBA 3QXMA 1IITA 4NF8A 1KWHA 1GGGA 2DWIA 2A5TA 4GFRA 2GFEA 4QFLA 5TU0A 1B3LA 4O3AA 1LBCA 2NUVA 1HSEA 4U21A 3S9LC 4DCYA 3SEVA 2HAUA 2HFBA 1ANFA 2I4BA 1OMPA 2XD3A 2O84X 2IEEA 4IGTA 1IXIA 3K6VA 1S50A 2O1LA 3TTLA 4H65A 4AB5A 2Q89A 4PP0A 3PPPA 4KD5A 1GVCA 4DXBA 4F22A 3H03A 4TQUQ 4OEVA 1DPPA 3OSRA 3H06B 4EQ7A 3M8UA 1DMBA 3DLNA 3MVYA 3C31A 1A55A 3H4ZA 5TPAB 1B46A 5H8SA 2Q2CA 3PV0E 1LCFA 5AA2A 3PD9A 3TEPA 3EHUA 5H8HB 2Y7WA 2E1SA 4IO6A 4G8HA 3LUYA 3OELA 3TELA 3IB0A 2DQVA 4KPTA 1O64A 3O28A 4BDRA 3C4MA 4NF6A 1ZMGA 1B58A 3Q28A 4GQOA 3OOAA 2ONKE 4YU0A 1NMUA 3THIA 3S9EA 3VFJA 1US5A 4KYSA 5DVFA 2DE3A 3HHGA 3N6TA 4ZS9A 1QKBA 3MW0A 4OXVA 3G3KA 5CBRA 3FZVA 3QUJA 1JVYA 3OSQA 3V8XB 5JK4A 3MC2A 1SDXA 3VLWA 5EHSA 4QSEA 3W9WA 3D4CA 2QMWA 4GWOA 1QUKA 3K4UA 4EF1A 1B40A 2Q9TA 3TTMA 3TMGA 4BLAA 1IQ7A 4H67A 5CMCA 2XX9A 3C35A 2O7IA 1PC3A 2RC7A 5LOMA 1UIUA 1URDA 3T93B 1POTA 4GVOA 4ESWA 4KR5A 3FD3A 1QUIA 3M3LA 2H99A 4KCCA 3PUWE 4RXLA 2HXWA 4YB5A 3FVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4OANA 1XVYA 4OWDA 3RPLA 2XXVA 1VDWA 4LZ7A 4QFOA 3ISPA 4RPNA 3UA8A 2HEUA 2ZYMA 1QW0A 4HS7A 1B1XA 3V89B 3T96B 5ET7A 1MXVA 2OWZA 2THIA 1FSAA 5CC2A 3OEMA 3TODA 2ZZWA 5H8NB 5EQ8A 1VE4A 1NUYA 1ZIUA 1AL3A 4POWA 1MY1A 3KBZA 1BIYA 4JVIA 4NWCA 3TPAA 1A40A 1H45A 5I58B 4ISUA 4ZEFA 3LSLA 4R74A 3TTKA 1FBGA 3K1NA 5JEIA 2R71A 1N3WA 3H3GA 1MXUA 2XXRA 1N7WA 4GL0A 4PDDA 1FPDA 5A5LA 3HO7A 4MFIA 4I8CA 3QUFA 1JW1A 3IOVA 2CZLA 3IJOB 3KN8A 4FEBA 1NNKA 2ZNSA 1IXHA 1B32A 4H8JA 4XFEA 2OX3A 5ICQA 3OO7A 4YKKA 4O7IA 2OJTA 2OBGA 3H6VA 3T66A 3EQ1A 3PUZE 1A8FA 4X8RA 5HBCA 1SPIA 4OHNA 5DVJA 1OIBA 3VXBA 5K2XA 4OFLA 5A5XB 4DCXA 3KOSA 2P0SA 2V93A 1B6HA 1LAGE 5H8HA 4ELQA 1URGA 4WEDA 4PC9A 4R75A 3L6GA 4XXUA 3PPQA 4GLIA 5M2VA 4PCDA 1PDAA 2D3IA 1S9TA 4TLMB 4H1XA 2DP8A 1GV8A 4KI0E 2QL3A 3HCQA 3IOUA 1RKMA 2ZXTA 3K02A 3TFLA 3RTWB 1NI9A 4P47A 1UIVA 1NV5A 3QIMA 4GXAA 2QS4A 3IO4A 1Y4CA 1ZBMA 1AH5A 4G2ZA 3OO8A 4H45A 4LZ8A 4G68C 1B9JA 1QJMA 5I2NA 1YPNA 3CI8A 4RPOA 3VLUA 3B6WA 4HTGA 1B4HA 3N26A 2UXAA 3OEKA 3IO6A 1SBPA 2V3UA 4C1TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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