5DT6A

Crystal structure of the drosophila glur1a ligand binding domain complex with glutamate
Total Genus 88

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
GSYDRNHTYIVSSLLEEPYLSLKQYTYGESLVGNDRFEGYCKDLADMLAAQLGIKYEIRLVQDGNYGAENQYAPGGWDGMVGELIRKEADIAISAMTITAERERVIDFSKPFMTLGISIMIKKGTPIKTPEDLTMQTDVNYGTLLYGSTWEFFRRSQIGLHNKMWEYMNANQHHSVHTYDEGIRRVRQSKGKYALLVESPKNEYVNARPPCDTMKVGRNIDTKGFGVATPIGSPLRKRLNEAVLTLKENGELLRIRNKWWFDKTEC

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (8-13)TIV1 (4-7)EMPTYS4 (55-60)TVIII2 (87-90)TI1 (61-64)TIV2 (17-20)TVIa1 (16-19)S2 (21-22)S3 (37-38)3H1 (33-36)AH1 (40-52)AH2 (80-86)S6 (77-79)AH3 (100-104)S5 (67-69)TII2 (73-76)S16 (228-230)S7 (91-92)S8 (97-98)AH5 (148-155)S13 (193-198)S15 (223-225)S9 (106-108)AH9 (235-249)TIV3 (111-114)AH8 (199-207)S11 (117-122)TII3 (122-125)TVIa2 (208-211)O2 (211-266)O1 (125-127)TI'2 (189-192)S12 (140-142)TVIII3 (176-179)TII4 (144-147)3H2 (172-174)AH6 (159-170)AH7 (179-188)S14 (213-216)TII5 (230-233)AH10 (251-261)TI2 (70-73)AH4 (130-134)TI3 (261-264)S10 (113-115)Updating...
connected with : NaN
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Glutamate receptor 1
total genus 88
structure length 266
sequence length 266
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A02
1USYH 1B0HA 3K1PA 2Y7WA 1GGGA 1II5A 1QKBA 4R9GA 1B5JA 2YJPA 4RPNA 2O7IA 3M8UA 2X26A 2I49A 3UP9A 1LGBC 1TT1A 3IOVA 3IOWA 3DP4A 3RN8A 1B3LA 2THIA 5KCJB 2P1SA 1US5A 4XKQA 3T93B 3VVDA 4H6DA 1FQDA 3MZBA 5H8FA 1A99A 3TUSA 4LQ5A 4H8IA 4IGTA 3RQTA 1LB8A 4ZE8A 2CZLA 4F2OA 4U23A 1TFAA 2DS9A 1MY4A 4ZZEA 1PBQA 3L6GA 1UIUA 1MM6A 1SBPA 2XD3A 4HW8A 3OMBA 2ZMBA 3S2VA 2O1LA 4O3AA 4EQ7A 2XXXA 2F97A 4NF8A 4NF6B 1M5BA 4F3PA 4R73A 1H44A 2B3BA 4GXAA 1B52A 4ELRA 2QPQA 3VVEA 5AA4A 4P0GA 3OXNA 3K00A 4YB7A 1MXUA 2PMSA 2NVUB 1LAFE 3GBBA 1RKMA 1GTKA 4U1ZA 4JXIA 5CMMA 3O6GA 4F22A 3O66A 3MUQA 2UVGA 3TQWA 2Z8FA 2A5SA 1B9JA 1S7YA 2I58A 3KEIA 3DM0A 3CR9A 3VFJA 5AA2D 3SEYA 1AL3A 1DPEA 2P2AA 2HXWA 1NFTA 5KDTB 5H8QA 1B0LA 2F78A 5CBRA 5I58A 5AA3A 1IITA 5AE4A 2O51A 3EN3A 3U92A 3PPOA 1MQJA 4PFUA 2IEEA 2O7UA 5I84A 4I1DA 3I5OA 4TLMB 3B6WA 3K1NA 1ZU0A 4EDPA 1N7WA 5EYFA 4ZDMA 3UIFA 4IO4A 3SESA 1BLFA 2ZYKA 4GWOA 1I6QA 1MM7A 1XVXA 2VOZA 3T22A 1MPDA 2F7AA 5I2NA 1FQAA 4WEPA 2XX8A 3T96B 1OVBA 2OBGA 4ISUA 1B3FA 2RC7A 4IY5A 4GOTA 1PEBA 1PC3A 3SEUA 5AA2A 3FZVA 2GHBA 3SERA 1JVYA 3TTRA 3VDFA 2DVZA 5I57A 5ELVA 3I3VA 1XOCA 1Y3QA 4KCCA 3OEKA 1FTKA 4U4XA 4AQ4A 2UYFA 1M5DA 4QFKA 1URGA 2RC8A 1I6AA 4O3BA 4ZEDA 2XXTA 5CMKA 1NNKA 2A5TB 5A5XB 1OVTA 1Q1KA 1M5CA 1Y4TA 3UGWA 5M2VA 3D4GA 3RGYA 2ABHA 4ELPA 1DSNA 5IAIA 3EHSA 3RLFE 3LR1A 1B4HA 5LOMA 1MXYA 4MLVA 3Q26A 1MDP1 5CI5A 4YAHX 4BLAA 1EU8A 3RTFB 1LBCA 1FTLA 5KCJA 1Y1MA 1SVXB 2OZZA 4LZ7A 1NNPA 4TQUQ 1QUJA 2AYSA 4EQ9A 1QUKA 4M4GA 2VP1A 2YPNA 4X1BA 3CRBA 1N3XA 4ELQA 2QS3A 2H25A 3CFLA 1B51A 4LZ8A 2V3UA 3LSLA 4H1XA 4HS7A 1JW4A 3LUYA 5FHMA 1S50A 2NWJA 4G4PA 1B7HA 4NF6A 1JEVA 1LAXA 4QSEA 3T9VA 1MH3A 4F39A 3IB1A 4LP2B 2XX9A 4AB5A 1B7UA 3TTMA 2PVUA 3PUVE 2XXHA 3S9LC 4YKKA 2OWSA 4QFLA 3PMWA 3I6VA 2VD3A 2R71A 1ZLQA 3OO9A 1P1NA 3O6HA 4XIGQ 1LAHE 3OO6A 3N6UA 2UXAA 4BDOA 3MVZA 5HPQA 4G8MA 4NWCA 4OFLA 3CIJA 4DXBA 5FTIA 2RCAA 3B6TA 2KLFA 1IQ7A 4XXUA 3TEPA 3UN6A 4YKJA 1XHYA 1EZPA 1NL5A 4QFPA 3KN7A 2QRYA 4I9DA 2F5XA 3Q25A 3GXAA 1SW1A 3B7DA 4NWDA 2ANJA 2V25A 3IX1A 3KZGA 2Y7KA 5L8DA 1FQCA 4F1UA 2ZNSA 5H8HB 1VFDA 3B6QA 4KI0E 1USYE 4PFTA 1P1WA 3RPWA 1ANFA 3ECRA 3Q28A 3PUYE 4YKIA 3ILUB 4ZECA 5FTHA 1A8EA 4OTEA 3RT8A 4PE5B 1ZTYA 2FA7A 2OWTA 2I6EA 2PT2A 1YCJA 2AL4A 2XXRA 3CI8A 4P11A 4E0XA 1WDNA 3A3CA 3H4ZA 1VE4A 4OHNA 1XC1A 3FUZA 4Z7EA 1RYOA 4EF1A 2V93A 4ESWA 2AL5A 1OLAA 1HSLA 1JNFA 3MP6A 3FJGA 2A5TA 5A5XA 2V3TA 3HO7A 4F3BA 1P99A 4JWOA 2Q9TA 1FTJA 3MAMA 3C34A 4F2QA 4R74A 4FATA 2QS1A 4XKRA 1AMFA 3E13X 4OETA 3H6UA 1MXZA 3RY3A 4IO2A 4PFWA 3QK6A 2UVIA 5FHOA 1XS5A 2DOJA 3PU5A 1SD3A 2F36A 3KGCA 4EF2A 4EXKA 3VV5A 1ZMGA 1UTHA 3C9HA 4KFQA 3SETA 1R9LA 1B5HA 1F9BA 2B3FA 4DE8A 2QJEA 1NKXA 3T9HB 3PUXE 2E0SA 2RKMA 2XXVA 2REJA 4R2BA 4O3CA 4QSDA 4WXJA 1FQBA 1JVXA 3PPPA 4H8JA 3IOTA 4H0WA 3MP1A 2I48A 1MY2A 3MVYA 4YB5A 1LLSA 4FECA 3KN3A 2ZXTA 1KWHA 4GRKA 3FD3A 3KJ7A 2ONRA 2PT1A 4G68C 3M3LA 4OENA 4KYDA 3FJ7A 2O84X 3PPNA 2R9JA 4F1YA 3KBRA 1TFDA 4ZEIA 2FYIA 5CM6A 4I62A 4IO5A 5DTBA 2Z23A 2RCBA 5EHSA 4R72A 4FAJA 1HSEA 2E1SA 2HZLA 4PP0A 2DWAA 3WAFA 4QFNA 1MQGA 1N0TA 3FVNA 2ZYNA 4NTLA 2RC9A 3O28A 3V83A 4LQ2A 1JETA 5HBCA 4RK2A 3PMXA 4YB6A 4OESA 3TTNA 4LVQA 1AIVA 1UIVA 3OSQA 4OVJA 4OEUA 4TOZA 3M3FA 3JZJA 5IKBA 3QSLA 1NNFA 5I2KB 3MW0A 1VFEA 2ZNUA 5JTYB 4LATA 2HAVA 3K01A 1FQFA 3IL1B 5H8HA 3G3GA 4RNSA 2H98A 4ZEBA 3O97A 1QVSA 4DXCA 3K6VA 4QFOA 4BDQA 4EQBA 3MPKA 4GFRA 1NH7A 5DVJA 4ECFA 5DVIA 3O9PA 4EUOA 1SI1A 3PGFA 1N84A 3VXBA 1Y1ZA 1PB8A 2Q89A 4YMAA 5H8SA 3EQ1A 4C1TA 5DEXB 1B46A 2V3QA 3ZS6A 1BIYA 3MPLA 2IA4A 3RUMA 3TCGA 3KOSA 4E0WA 4U21A 2QS4A 5ITPA 1MPCA 4OMBA 2GFEA 3KOTA 3PPRA 4FEDA 3ONMA 2GRVA 2ONKE 4QHQA 3C36A 4BDMA 2DXRA 2W7YA 2M8CA 3MP8A 5BWJA 5ICQA 3GBAA 4RA1A 2DWJA 1LBBA 3TFLA 2XXPA 2DXYA 3V5AA 3FXRA 4LUBA 1BTJA 4F19A 3UA8A 4UA8A 1MQDA 4MF3A 1M5FA 4N13A 4QRZA 1B6HA 4OQOA 3DLNA 4BDLA 2OCUA 1MXVA 3G7WA 1Z7ME 4L17A 4IB2A 4OYVA 1B1HA 1DTZA 4KYEA 3A3UA 2P0SA 1B2HA 4IO7A 3W15C 3HPIA 3EPEA 2F35A 3K0VA 3QUFA 4POXA 1B32A 4MLQA 5DYHA 1Y3NA 3K02A 2OK2A 3O6IA 4G77A 3IORA 2XXWA 4FJPA 3S9EA 2XD2A 1UTBB 3PPQA 4FORA 4LZ5A 4DCXA 3MWBA 3KFMA 1N3WA 3EHTA 4G8NA 4HTGA 5ISUA 4ND9A 4DCYA 3KG2A 5FHNA 3R6UA 3VE1B 4QF9A 5CRYA 1B1XA 2F8DA 3G3JA 5KZTA 3TPAA 5I2KA 1MQHA 2VGQA 3O29A 4NMYA 4POWA 1N7XA 5JTYA 3VLUA 4OFOA 1QKAA 2ZYMA 1PB7A 1J1NA 3H6VA 1B3HA 1LFGA 3CVGA 1IXIA 2I4CA 4U4SA 3D4CA 3S4UA 4JBZA 3R26A 2OJTA 2Z22A 2RINA 5KDTA 5TPAB 2WKYA 1B3EA 4R6KA 3G3IA 1D4NA 3IK6B 3K6UA 5JK4A 2Q88A 3T9XB 5CMCA 4RJZA 4GLIA 4YZZA 1EH3A 3R7XA 5L9MA 4ZS9A 3W9WA 1SQYA 1TXFA 4AB6A 1O64A 2PX1A 4F3GA 4ZEFA 3MC2A 4WKMA 4JB7A 1SDXA 3E9XA 4ZZAA 3KJTA 5DEXA 1N76A 4XKPA 4FIMA 1IXCA 1XVYA 2GH9A 2Y7PA 2GHAA 4HCWA 2HQ0A 3HV1A 5J1DA 2F6GA 3OENA 4ZEKA 3FJMA 4UACA 5I59B 4JSOA 5ITOA 1BKAA 4Q30B 2H99A 2UVJA 2ZYOA 2XXYA 5AA1A 1MXXA 1ZIUA 3MZ1A 3ZKKA 4R2FA 3V89B 4C0RA 1Y9UA 3LSFB 3LSWA 1P1QA 1WVJA 3FV1A 1R1NA 3FXUA 3E3KA 3AXFA 3PD8A 2DSFA 1MG1A 2I3WA 4JSDA 1Y3PA 1D3KA 3CSBA 3OELA 1MY0A 2Y7IA 1QJMA 2NOOA 2OLBA 4NEDA 4G68B 4U2RA 1SYIA 4IO6A 3N6TA 4F3SA 5CMBA 1LCFA 2D21A 1NH8A 4IGRA 3LBSA 1GR2A 1LFIA 1H43A 1LCTA 3G3FA 1LB9A 5H8NB 1FTOA 4RPOA 1ZBMA 3ZKLA 1P1UA 4DZ1A 4NF5B 4ZE9A 3LC8A 3Q29A 3UK4A 3MVXA 3O2AA 3CG3A 2D5WA 3BBRA 1SI0A 3SEWA 3OSRA 1OQGA 3EF7A 3TCFA 4KCDA 3H3GA 2I3VA 4PETA 2DE3A 2DE2A 3IJOB 1UTBA 4DDDA 1JW5A 2Y7RA 3OO7A 3TDJA 3SEXA 1JQFA 1M5EA 4F29A 2UYEA 3L6HA 1L5TA 3C35A 3TZAA 4OERA 4MH5A 1OIBA 2F34A 4KD5A 2O1MA 4FE8A 3E4RA 4RK9A 1JW1A 5EHMA 2Q8JA 4XKNA 2BJJX 3U93A 1LAGE 2DVCA 2I0CA 2ZNTA 3FVKA 3SEVA 3QAXA 2XXIA 1FW0A 3SKPA 5I56B 2LAOA 3MVWA 1BP5A 4OWDA 5TU0A 4OXVA 3ILTB 1OLCA 3QIMA 2PBWA 3VLWA 4THIA 4ELOA 3TTLA 4R6HA 1B4ZA 1D9VA 1PDAA 1R6ZA 1R9QA 4NF4B 1SW4A 1P1OA 5TPAA 3DP6A 1Z7NE 3OD7A 3V8XB 1PBPA 3LSXA 4GXSB 1RYXA 4F1VA 4IY6A 4P0IA 5K2XA 3WAEA 3K1MA 2RF1A 1LFHA 3IB0A 2R6GE 1QUIA 2NXOA 5F7VA 1EZ9A 1MQIA 4RY1A 4GQOA 1Y4CA 3HCQA 1MXWA 1YTVA 2HAUA 2YLNA 3PMVA 2F7BA 5BUUA 4U22A 3QUJA 2I4BA 3G3HA 4M1VA 3JV9A 1SYHA 1NNTA 1DOTA 1LSTA 5I59A 2Q2CA 2Y84A 2H5YA 3BKIB 2UVHA 1ATGA 1PB9A 3T9UA 3FV2A 2I0BA 1H76A 2DYXA 4FEBA 2Q2AA 2DQVA 3DP8A 3FGSA 4ESXA 2DE4A 1ELJA 3N94A 5TP9B 3A09A 1Q35A 2XX7A 1US4A 2G29A 3RTWB 1A55A 4RXLA 2PYYA 3ZSFA 4G68A 2H9BA 4DLDA 2X7PA 1SW5A 2QS2A 3OEMA 3M3KA 1SW2A 3W9VA 5ICTA 2QMWA 3H06B 1MY3A 1AOVA 1MRPA 4H67A 3ODBA 3HHGA 3FASA 3U94A 2Z8DA 4BDRA 5DVFA 2QMXA 4KQPA 3K6XA 5H8NA 1POY1 3KSJA 1S9TA 4OFJA 4NF5A 4Q5TA 4KHZE 3T66A 1YPNA 4H65A 3U8QA 1FTMA 2XXQA 3P7IA 3GLBA 1GV8A 2DWHA 1O7TA 3SDFA 4MBPA 3U1OA 1MPBA 2V84A 3KSXA 4C1UA 1IXGA 1B05A 2CMOA 1URDA 3PD9A 2DWIA 1OMPA 3QYTA 1O63A 4QSCA 1NMUA 1A54A 1MS7A 4OEVA 3TQLA 5L9OA 2FNCA 4KPTA 2X7QA 4BDNA 1UTHB 1A40A 4JWYA 3G3KA 1POTA 1I6BA 4G2ZA 3C4MA 4GD5A 5I56A 1QULA 1AH5A 4R6YA 3TKDA 3F11A 4IO3A 3UORA 2O6AA 3S9MC 3C33A 4YICA 1H45A 2XXUA 1A8FA 4NF4A 3C32A 1TWYA 1IIWA 3TYHA 3TTKA 1VSOA 4NE4A 1IZ1A 5L9SA 4YMBA 3TMGA 4F18A 2O68A 3IOUA 3IAZA 2AIXA 1Y20A 1MY1A 3FXQA 1B58A 4YKPA 3VXCA 4Z0IA 1MH4A 3K6WA 1URSA 2ESNA 5H8FB 3PUWE 4RYAA 2ONSA 1XT8A 4H5FA 4ONYA 3TODA 3IO4A 3FATA 3BFTA 2F6PA 5HM4B 1ZKBA 1A7LA 2O69A 3FVOA 1CE2A 4LA9A 4KYSA 2Z8EA 3TCHA 2DP8A 2XHDA 2VHAA 1DMBA 3IJXB 4KR5A 1HSJA 4NF8B 3HHFA 1D9YA 1DPPA 1DTGA 3KN8A 4I8CA 1IXHA 3H6TA 3OO8A 3CFXA 3CSGA 3VLVA 5AA4B 5JEIA 2HZKA 1EZOA 5TP9A 4LONB 4JWXA 4GL0A 3MQ9A 3N5LA 2QSXA 4X9TA 4GVOA 4WEDA 1YAEA 2H4IA 2HEUA 3H7MA 4EXLA 4DXUA 1FQEA 3RT6B 1IEJA 2NUVA 3MBPA 1ZJLA 3C31A 1VR5A 4K3FA 2D3IA 3MJNA 2VD2A 3DELB 4YU0A 3QXMA 3PUZE 3H03A 3TELA 3PV0E 5H8QB 4JDFA 1N04A 4N6PA 4Q0CA 4PQJA 5I58B 4R75A 5B7DA 3BFUA 3TAJA 3GZGA 2F7CA 1OQHA 4G8HA 2B65A 4TLLB 3FIRA 4MFIA 1T0KA 3HN0A 4X1DA 3MZ9A 3Q27A 1WODA 1B3GA 4N07A 5K2YA 1H3DA 4U1OA 4R9FA 1GVCA 3JYRA 5F1QA 5I2NB 3OOAA 1UQWA 3EHUA 4OZ9A 3RNNA 2REGA 2QL3A 4Q8RA 3K2DA 3IB2A 4F31B 5AA2B 1MDQA 3CG1A 4X48A 1B5IA 5I57B 1FCKA 5B70A 4H5GA 4HCYA 1I69A 3THIA 4GIZA 2G93A 5DT6A 4GL8A 1CB6A 4XTCQ 1IUDA 5CC2A 3N26A 3VVFA 1B40A 2HFBA 4PFYA 1QW0A 3IO6A 2ALUA 3U72A 3CFZA 5CBSA 3HSTA 3K4UA 3IR1A 3H6WA 1B7ZA 2HCAA 3USDA 4GF8A 3FVGA 4DIGA 1JEUA 3S9NC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1USYH 1B0HA 1EYIA 3K1PA 2Y7WA 1GGGA 1II5A 1QKBA 4R9GA 1RDXA 1B5JA 2YJPA 4RPNA 2O7IA 3M8UA 1FPEA 2X26A 2I49A 2GQ1A 3UP9A 2Q8MA 1LGBC 1TT1A 1FBFA 3IOVA 3IOWA 3DP4A 3RN8A 1B3LA 2THIA 5KCJB 2P1SA 1US5A 4XKQA 3T93B 3VVDA 4H6DA 1FQDA 3MZBA 5H8FA 1A99A 4XEQA 3TUSA 4LQ5A 4H8IA 4IGTA 3RQTA 1LB8A 4ZE8A 2CZLA 1KA0A 4F2OA 4U23A 1TFAA 2DS9A 1MY4A 4ZZEA 1PBQA 3L6GA 1UIUA 1MM6A 1SBPA 4NG7A 2XD3A 4I3EA 4HW8A 3OMBA 2ZMBA 1FTAA 5EYGA 3S2VA 2O1LA 4O3AA 4EQ7A 1FBDA 2XXXA 2F97A 4NF8A 4NF6B 1M5BA 4F3PA 4R73A 1H44A 2B3BA 3LV0A 4GXAA 1B52A 4ELRA 2QPQA 3VVEA 5AA4A 4P0GA 3OXNA 3K00A 4YB7A 1MXUA 4OVSA 2PMSA 2NVUB 1LAFE 3GBBA 1RKMA 1GTKA 4U1ZA 4JXIA 5CMMA 3O6GA 4F22A 3O66A 3MUQA 2UVGA 3TQWA 2Z8FA 2A5SA 4PFIA 1SPIA 1B9JA 5EQ7A 1S7YA 2I58A 3KEIA 3DM0A 4O94A 3CR9A 3VFJA 5AA2D 3SEYA 1AL3A 1DPEA 2P2AA 2HXWA 3KC0A 1NV7A 1NFTA 5KDTB 4MNPA 5H8QA 1B0LA 2F78A 5CBRA 5I58A 5AA3A 1IITA 5AE4A 2O51A 3EN3A 3U92A 3PPOA 4P1EA 1MQJA 4PFUA 2IEEA 2O7UA 5I84A 4I1DA 3RYDA 3I5OA 3CHGA 4TLMB 3B6WA 3K1NA 1ZU0A 4EDPA 1N7WA 5EYFA 4ZDMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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