5DYHA

Ti(iv) bound human serum transferrin
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
677
structure length
677
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
publication title Unusual Synergism of Transferrin and Citrate in the Regulation of Ti(IV) Speciation, Transport, and Toxicity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
total genus 188
structure length 677
sequence length 677
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dyhA03
5ELVA 3CSBA 1MXUA 3FV1A 3HPIA 2REJA 3KEIA 1B4ZA 4YKPA 3JYRA 4R2FA 1YCJA 3IO6A 1MRPA 5ICQA 3K02A 3QUFA 2XHDA 3JZJA 2B3BA 2PT1A 1SW1A 2RKMA 3KOTA 4RK2A 3P7IA 1OLCA 1LFGA 3LSLA 3CI8A 2FYIA 2XX8A 2H98A 3LSXA 3SEVA 2W7YA 3E9XA 3T96B 1LB8A 4OESA 3A09A 4YKJA 1D4NA 3FV2A 3E4RA 1URSA 4H1XA 4MLQA 2D5WA 5JEIA 3CFZA 3FJGA 1B40A 4H67A 5B7DA 5TPAB 4WEDA 1ELJA 3OD7A 3HN0A 4G4PA 3OO7A 2F7BA 4H65A 4R6YA 2ALUA 3SETA 3K6UA 1MQHA 2ONSA 1SYIA 5KCJA 1B3HA 2X7PA 2G29A 4AQ4A 1NFTA 3KSJA 1EZPA 1PC3A 1N84A 2VGQA 3CFLA 5ITOA 4F19A 3VVDA 2QS3A 1IZ1A 2DS9A 2ZXTA 3MQ9A 3G3HA 1KWHA 2UVIA 4XXUA 4IO7A 3I6VA 2O7UA 4M1VA 3TFLA 4X1BA 1B9JA 3EPEA 2PVUA 2R71A 2I0CA 4G77A 1DTGA 3TTKA 3BKIB 1GVCA 3C34A 3C33A 1YPNA 3VV5A 1MXWA 1WVJA 1SW5A 3VVFA 2V3TA 3CG1A 2I4CA 2V93A 4FAJA 3K6WA 1RKMA 4QRZA 3GBAA 2X7QA 1O7TA 4U22A 2QPQA 4R73A 2P0SA 3KN8A 4I9DA 3PUXE 1I6AA 3C4MA 4NWDA 3L6GA 4TLMB 3PU5A 1Y3PA 2H99A 3O6GA 4Q30B 1SI0A 5H8QA 1ATGA 3G3IA 4WEPA 2F35A 3CVGA 1IXGA 2V3QA 4PE5B 1FQBA 1B1HA 2P2AA 4PQJA 3H03A 4LATA 1CB6A 4GL8A 1HSLA 4OHNA 3V83A 3RGYA 2ONKE 4PETA 1JETA 1N0TA 1UTBB 4H6DA 5DT6A 1B1XA 5CBRA 5KCJB 1EU8A 4XKQA 1D9VA 1M5BA 3PD9A 4Z7EA 4P0GA 4DLDA 1OQHA 1B0HA 4JB7A 2ANJA 2Z22A 5I56A 2XD2A 3TAJA 1FTKA 2YJPA 4F3PA 4TQUQ 4YKIA 3DP6A 3LC8A 2Q88A 4O3AA 5JK4A 3O6IA 3E3KA 4EXLA 3R6UA 3OO9A 3FVGA 3IORA 3PGFA 1UIVA 3OO8A 3K01A 3MZ1A 3FJ7A 2RCAA 5AA2D 1AH5A 1SDXA 3T66A 3UN6A 5M2VA 4AB5A 1B05A 1MQIA 3OSQA 1VR5A 4EF1A 2RF1A 2PMSA 3OO6A 4XKPA 1EZOA 3CRBA 1MXVA 3S9MC 3S4UA 1NH7A 2RC8A 4NEDA 1Q1KA 2NXOA 1BKAA 5I2NA 3T93B 1BP5A 1WODA 3LUYA 5F7VA 3MBPA 2QMWA 2D3IA 2ZNTA 1ZIUA 5TP9B 2FNCA 5H8QB 3O97A 4QHQA 2Z8DA 2O84X 4ISUA 4M4GA 1M5CA 2NOOA 1B3EA 5A5XA 3MP1A 4YICA 5DVJA 1P1NA 3T9VA 5ICTA 3G3FA 4KD5A 1UTHA 3FJMA 4H5GA 1LSTA 4F31B 1BTJA 4RJZA 1A8EA 3M3LA 4R2BA 1AL3A 1LBBA 4N6PA 3VE1B 3V8XB 3HSTA 3BBRA 1JVYA 5I56B 2OLBA 4PFTA 3PUYE 2I3VA 2Z8EA 4JWXA 1XHYA 2O1MA 1NNPA 4BDRA 3TQLA 5I57A 4TLLB 2DP8A 1JEUA 1IEJA 3MC2A 3OOAA 1PBPA 2DE2A 4EQ9A 3MZ9A 2OBGA 3MP6A 3C9HA 1B52A 5EHSA 4ELQA 1MDQA 1UQWA 4RYAA 2O51A 1LAFE 3RQTA 1NKXA 3O2AA 4UA8A 4LZ7A 1H43A 2O1LA 5B70A 1Y20A 3SKPA 1D9YA 1B5JA 4R75A 2I6EA 2REGA 2PYYA 4KPTA 4LA9A 4XKNA 1R6ZA 4QFOA 4GIZA 3PPPA 1XS5A 4G68C 4NF4B 1ZLQA 1FTLA 3M3FA 5H8HA 2Q2AA 3IO4A 4OWDA 2IA4A 2DOJA 1R1NA 4IGRA 3KOSA 4PP0A 1MY2A 3HV1A 4X48A 1UTHB 2AL4A 5KDTB 3ZKLA 1URDA 3TZAA 4ELOA 2VD2A 3BFUA 1PDAA 5EYFA 4NF8A 3O6HA 3K1PA 2OCUA 4YAHX 2YPNA 2QS1A 5DEXB 3QXMA 3U72A 5CMKA 4JXIA 3UGWA 4JWOA 3KN7A 2F7CA 3PPOA 3MJNA 1B51A 3C36A 2F97A 4U4XA 4FEBA 3MW0A 3IAZA 4YZZA 5H8NA 2B3FA 1LGBC 2Q2CA 4U4SA 1MY4A 3ONMA 2XX9A 4GXSB 5IAIA 5I59B 4G68A 2VD3A 3IB2A 1LCFA 4OMBA 2XXPA 3GLBA 4KCDA 1QULA 4O3BA 3TTRA 3W9WA 2XXHA 5FTHA 3CG3A 4RPNA 3IB1A 3U94A 4NTLA 3RY3A 1MXXA 3H4ZA 3R7XA 4G8MA 2ABHA 3ILUB 1GR2A 4YU0A 4KR5A 4KI0E 2AYSA 3OEKA 4YB7A 4THIA 4QFKA 4NF5A 4F39A 4TOZA 2HAUA 3IOWA 1FQEA 5FHNA 2M8CA 3CSGA 1JW4A 2HZLA 1FQDA 2V25A 4EUOA 3N6UA 3SDFA 5CMCA 1A8FA 4YKKA 3UA8A 4I8CA 4ZS9A 3LBSA 3IR1A 4OFJA 3H6WA 3RT8A 5HPQA 1PB8A 2I0BA 2GHAA 4ELRA 2H25A 3HHFA 4NF6A 1WDNA 2ZYOA 3THIA 3FVNA 4NE4A 3AXFA 1N04A 4NF8B 2DXYA 4EXKA 1O64A 4N13A 1OLAA 4I62A 3H6UA 1OVTA 2FA7A 3UK4A 1CE2A 2F8DA 1FCKA 4X1DA 1LAHE 5BUUA 5FHMA 4JWYA 5CMBA 5H8NB 4MF3A 2Y7WA 1LAGE 1MXZA 1LLSA 1A54A 5JTYA 1B46A 3Q27A 2UYFA 4OFOA 2Z8FA 5I84A 4R9GA 1YAEA 2D21A 4XKRA 3OSRA 4G68B 3FIRA 4KHZE 3ZS6A 2F6PA 3MVZA 2GH9A 4DZ1A 1TFAA 4Q8RA 3RPWA 3PD8A 4WKMA 3TQWA 4EF2A 1QKBA 4GQOA 4U23A 4IO5A 1N7XA 4HCYA 4OETA 4DXCA 1IXIA 4ZDMA 4U21A 3FVKA 4ZEDA 3U93A 4G8HA 3BFTA 2OK2A 5H8SA 3OELA 3FGSA 2PBWA 1LAXA 3DLNA 4RXLA 2BJJX 4IY6A 3U92A 2DVCA 1QUJA 3PPQA 1B3GA 3M8UA 1US4A 1OVBA 4RNSA 3M3KA 4IO2A 1I6BA 2F36A 1MQJA 2UXAA 3RNNA 2HZKA 2QL3A 5HM4B 5CBSA 1MM6A 3GXAA 1DOTA 2Y7RA 1N76A 3ODBA 2ZYKA 4C0RA 3N6TA 3FD3A 2Y84A 4PFWA 5AA4A 3DM0A 5AA2A 1S7YA 4U1OA 3K6XA 4I1DA 4JSDA 4LVQA 3VLUA 5H8FA 2R9JA 4LZ8A 1SI1A 3TCHA 1SVXB 2X26A 3G3GA 2I3WA 2IEEA 1MM7A 4Q0CA 1MY0A 3MWBA 3O29A 2LAOA 3IL1B 4YB5A 4OXVA 3C31A 1QVSA 1TFDA 3FATA 1BIYA 2DWAA 3VVEA 4YB6A 4LONB 4JSOA 2RINA 4MFIA 3LSFB 2DWJA 4BLAA 2H4IA 4E0XA 2ZMBA 2H9BA 1LFHA 1RYOA 3H6VA 3N26A 4OERA 4FJPA 4QSDA 1SYHA 1XT8A 5CRYA 1OQGA 1M5FA 1GTKA 3MAMA 2B65A 1XVYA 4ZZEA 4ZE8A 3B6WA 1II5A 4R6HA 2GFEA 4U2RA 2G93A 3JV9A 3T9XB 1AMFA 3QUJA 2OWSA 1ANFA 4PFUA 1SBPA 2QJEA 4EDPA 4GD5A 4KYDA 1B5IA 3B6QA 3FXQA 3ZKKA 4C1UA 2VHAA 2ONRA 4K3FA 4LQ5A 3ECRA 1M5EA 2VOZA 3UORA 4N07A 2NUVA 4G2ZA 4F3SA 3Q25A 3MZBA 5K2XA 3RT6B 4FECA 4ND9A 1AIVA 3FXRA 1OMPA 3WAEA 2QRYA 4F3BA 3T9UA 3GBBA 5CI5A 3VXBA 4ONYA 3USDA 3KBRA 3K4UA 3I3VA 1VFDA 2PX1A 1IUDA 5AA4B 1B6HA 3PMXA 1EH3A 1FQCA 2QSXA 1AOVA 2RC7A 5H8FB 4GXAA 4O3CA 4FE8A 2XXXA 2NWJA 1USYH 5LOMA 2HQ0A 4G8NA 1N3XA 3EQ1A 3IOUA 1M5DA 3PV0E 4IO3A 3H6TA 1MH4A 4GF8A 3ILTB 3QSLA 5FHOA 2CZLA 4H0WA 4RA1A 2XXYA 4F22A 1URGA 3K00A 4GRKA 3H3GA 4FATA 4ZEIA 2Y7PA 4GL0A 3IJXB 3PMVA 4RPOA 5I2NB 1Y4CA 1MY3A 2OJTA 5L9OA 4QF9A 3ZSFA 1JEVA 1TWYA 3PUZE 4LZ5A 1Y1MA 1FTOA 4F2OA 5TPAA 1PB7A 5CC2A 3O9PA 1JW5A 3QK6A 2XXTA 1O63A 3C35A 2A5TA 3RUMA 4HS7A 5A5XB 4E0WA 3O28A 3TEPA 3RTFB 4F29A 1B3FA 4R9FA 2QS4A 2O69A 1I6QA 2PT2A 5IKBA 3TODA 1MXYA 4IO6A 4KYSA 3KSXA 1Q35A 1EZ9A 2ESNA 3EHTA 2XXRA 5ISUA 2WKYA 2Y7KA 1YTVA 3MPLA 4F2QA 3EHUA 2O7IA 4F1YA 1B5HA 5DTBA 1B4HA 4GLIA 4QFNA 1RYXA 3TELA 3FVOA 3UIFA 1DPEA 3S9NC 1MS7A 3MP8A 3N94A 1H45A 5I57B 4ECFA 4KCCA 3I5OA 2O6AA 4C1TA 4BDNA 3W15C 1N7WA 1UIUA 3MPKA 4ZE9A 1MPCA 1ZMGA 1QUIA 1XOCA 3VDFA 3SEUA 2XXWA 1US5A 5F1QA 4F3GA 4OVJA 1A40A 3IX1A 3DP4A 3TKDA 4IB2A 1FQAA 4ZEKA 4JBZA 4EQ7A 2XXQA 5AE4A 1P1OA 3MVYA 1H76A 3OEMA 5AA3A 2Y7IA 1NL5A 5CMMA 4DDDA 4NWCA 4ZECA 1MDP1 3TTMA 2VP1A 2QS2A 4ZEBA 5DVIA 2F5XA 4IY5A 3PPNA 3Q29A 4QSCA 2GHBA 2I49A 1VSOA 4OYVA 1SQYA 4QFPA 1QUKA 1PBQA 3G7WA 4OZ9A 4GVOA 5H8HB 4DXBA 2HFBA 2XXUA 2A5TB 1UTBA 3UP9A 3KG2A 1MQDA 1B7ZA 2I48A 3VXCA 2UYEA 1Z7ME 1Y3NA 4MBPA 2UVJA 5AA1A 3DELB 1VE4A 2I4BA 1Z7NE 3MVWA 1B0LA 2V84A 2I58A 4KYEA 1H44A 1MG1A 1TT1A 3EN3A 1QW0A 2AL5A 1F9BA 2A5SA 4GWOA 4DIGA 5L9MA 1S9TA 2KLFA 1POY1 1GV8A 3G3KA 3GZGA 3O66A 3G3JA 3HCQA 3C32A 3KZGA 3IOVA 3CIJA 2XX7A 4RY1A 3U1OA 4P0IA 3B7DA 2DE3A 3OENA 1ZKBA 3K2DA 3MVXA 3K1MA 2HXWA 5BWJA 1OIBA 2DWIA 3QAXA 2YLNA 1A7LA 4HW8A 3PPRA 3EHSA 4LQ2A 2XXVA 1N3WA 3Q26A 3DP8A 1B32A 4ELPA 1B2HA 3V89B 3Q28A 4FIMA 3WAFA 1JQFA 4FEDA 3FZVA 4FORA 1L5TA 3TPAA 1SW2A 4R74A 4QSEA 1XVXA 3SESA 5TP9A 3TUSA 1DPPA 1B7HA 3TYHA 1PEBA 2HAVA 4ESXA 4NMYA 2ZNSA 2DE4A 4POXA 5L8DA 3LSWA 1PB9A 3T9HB 1POTA 4NF5B 3KJTA 4Z0IA 4DCYA 3K1NA 3K0VA 3IJOB 4HCWA 3OXNA 1NNKA 4MLVA 3K6VA 4LP2B 3MUQA 1DMBA 4WXJA 1T0KA 3RTWB 4OENA 4ZEFA 3LR1A 1H3DA 1R9LA 1P99A 4F1UA 4OFLA 4P11A 2DWHA 2UVHA 3R26A 4BDOA 1DSNA 4NF6B 1ZJLA 3SEYA 2ZYNA 4RK9A 4OEUA 2RCBA 3FUZA 3TTNA 3PMWA 4OTEA 3QIMA 5K2YA 5J1DA 4ZZAA 3EF7A 5I58A 1IXHA 4UACA 3U8QA 4KQPA 2V3UA 3D4CA 3B6TA 5FTIA 1Y1ZA 3TDJA 1IIWA 4R6KA 1I69A 2THIA 5I2KA 3FXUA 3TCFA 4DXUA 5JTYB 2F34A 4OQOA 4XTCQ 3OMBA 4F18A 4ESWA 1J1NA 4BDMA 2R6GE 2H5YA 2E1SA 1SD3A 1HSJA 5CM6A 3VLWA 1BLFA 1SW4A 2DVZA 3S2VA 1LB9A 1Y3QA 2Q8JA 2QMXA 3SERA 3HO7A 3V5AA 4Q5TA 3IB0A 3FASA 1IITA 4NF4A 5HBCA 3H06B 3TCGA 4R72A 4U1ZA 4HTGA 1JNFA 1ZBMA 1P1WA 4AB6A 4IGTA 3S9LC 2XD3A 2CMOA 5DYHA 1LBCA 2F7AA 1ZU0A 2F6GA 4YMAA 2HCAA 3QYTA 2P1SA 5KDTA 2O68A 3SEWA 2Q9TA 3T22A 5ITPA 1B7UA 2HEUA 5DVFA 1IXCA 5KZTA 4KFQA 1ZTYA 1JVXA 1NNTA 1B3LA 3D4GA 1P1QA 1VFEA 5AA2B 4XIGQ 1MPBA 4OEVA 1S50A 5DEXA 3CR9A 3CFXA 1FTJA 1GGGA 2F78A 3VFJA 1Y4TA 4MH5A 3A3UA 1P1UA 1NNFA 4IO4A 3KJ7A 2DQVA 5I58B 3N5LA 1QJMA 1MPDA 1FQFA 4H8IA 4EQBA 1QKAA 4QFLA 1LFIA 4BDLA 4DE8A 3H7MA 1LCTA 2DSFA 4YMBA 5I59A 1A55A 5I2KB 2E0SA 2GRVA 3PUWE 1TXFA 3F11A 2RC9A 2NVUB 1R9QA 1FTMA 1JW1A 2XXIA 1IQ7A 2OWTA 4X9TA 3S9EA 4H8JA 4GOTA 3A3CA 3HHGA 4GFRA 2AIXA 3SEXA 3IK6B 3KN3A 3W9VA 3PUVE 1USYE 4JDFA 1D3KA 2DXRA 2Q89A 3VLVA 3L6HA 1MH3A 3IOTA 3TTLA 4POWA 1XC1A 4F1VA 5TU0A 3RN8A 4BDQA 1DTZA 2DYXA 3KFMA 4H5FA 1NMUA 4PFYA 1Y9UA 1FW0A 4L17A 1HSEA 3TMGA 2ZNUA 1B58A 4DCXA 5EHMA 3KGCA 2ZYMA 1MY1A 1MQGA 1NH8A 2Z23A 1A99A 3E13X 5L9SA 4LUBA 2OZZA 2UVGA 3RLFE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ELVA 3BIHA 3CSBA 1MXUA 3FV1A 3HPIA 2REJA 3KEIA 1B4ZA 4YKPA 3JYRA 4R2FA 1YCJA 3IO6A 5T3JA 1MRPA 5ICQA 3K02A 3QUFA 2XHDA 3JZJA 2B3BA 2PT1A 1SW1A 2RKMA 3KOTA 2XA5A 4KXPA 4RK2A 3P7IA 1OLCA 1LFGA 4P56A 3LSLA 3CI8A 1NV0A 2FYIA 2XX8A 2H98A 3LSXA 3SEVA 2WYPA 2W7YA 3E9XA 3T96B 1LB8A 4OESA 3A09A 4YKJA 2QVVA 4PFBA 1D4NA 3FV2A 3E4RA 4MX6A 1URSA 4H1XA 2OWZA 4MLQA 2D5WA 5JEIA 3CFZA 3FJGA 1B40A 4H67A 1FPFA 5B7DA 5TPAB 4WEDA 1ELJA 3OD7A 3HN0A 4G4PA 3OO7A 2F7BA 4H65A 4R6YA 2ALUA 2Y5LA 3SETA 3K6UA 1MQHA 2ONSA 2QVRA 1SYIA 1NI9A 5KCJA 1B3HA 2X7PA 3MSTA 2G29A 4AQ4A 1NFTA 4P1EA 3KSJA 4N8YA 1EZPA 1PC3A 1N84A 2VGQA 3CFLA 5ITOA 4F19A 3VVDA 2QS3A 1IZ1A 2DS9A 2ZXTA 3MQ9A 4LN5A 3G3HA 1KWHA 2UVIA 4XXUA 4IO7A 3I6VA 3A29A 2O7UA 4M1VA 3TFLA 4X1BA 4HE0A 1B9JA 3EPEA 2PVUA 2R71A 2I0CA 4G77A 1DTGA 3TTKA 4NAPA 3BKIB 1GVCA 3C34A 3C33A 1YPNA 3VV5A 1MXWA 2XWVA 4PDDA 1WVJA 1SW5A 3VVFA 2V3TA 3CG1A 4OVRA 2I4CA 4UABA 2V93A 4FAJA 3K6WA 4MEVA 1RKMA 4QRZA 3GBAA 2X7QA 1O7TA 4U22A 2QPQA 1D9QA 1QGXA 4R73A 2P0SA 3KN8A 4I9DA 2OX3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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