5EHMA

Crystal structure of the drosophila cg3822 kair1d ligand binding domain complex with nmda
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANLKNKTLVVTTILSNPYCMRKESAIPLSGNDQFEGYAVDLIHEISKSLGFNYKIQLVPDGSYGSLNKLTGEWNGMIRELLEQRADLAIADLTITFEREQAVDFTTPFMNLGVSILYRKGTPIESAEDLAKQTRIKYGALKGGSTAAFFRDSKISTYQRMWSFMESARPSVFTASNGEGVERVAKGKGSYAFLMESTSIEYVTERNCELTQVGGMLDTKSYGIATPPNSPYRTAINSVILKLQEEGKLHILKTKWWKEKRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RE06730p,CG3822
molecule tags Membrane protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA02
2RC9A 4WXJA 4AB6A 2E1SA 4O3BA 4FJPA 3OO8A 4P0IA 1MY2A 4YKIA 1WODA 3JV9A 4YAHX 3CFZA 1QW0A 2Y7KA 3G3HA 1GGGA 1UIUA 2RCAA 4ZEIA 3KOSA 3O6HA 3K2DA 2B65A 5AA3A 2AIXA 3RTFB 1NNFA 2R6GE 5K2YA 3MQ9A 2THIA 1MG1A 1M5FA 1NFTA 3VLWA 4BDNA 1B40A 3MVZA 2OK2A 1TXFA 1HSLA 4F1YA 1LSTA 3BKIB 5L8DA 4HW8A 3SEYA 1Y3PA 3GBAA 4FAJA 5H8HB 2VGQA 3S9MC 4JWOA 2XXYA 1MQJA 1DTZA 1B46A 2V25A 3MVWA 4X9TA 1XS5A 2GHBA 1SQYA 2DSFA 2NOOA 2ZYNA 4RNSA 2OBGA 3ILTB 4GOTA 4DCYA 3FIRA 2DXYA 3TPAA 2F7CA 4OXVA 2G29A 4XKPA 2AYSA 1LB8A 3TFLA 4KYDA 2ZYOA 4N6PA 3CG3A 3IOUA 4DIGA 4K3FA 1USYE 4XIGQ 2Y7RA 2XXUA 1MQDA 1PDAA 1EZPA 4GL0A 4OFJA 3C34A 3OO7A 2QL3A 5L9SA 4ESXA 4DDDA 3FUZA 1B1HA 1POTA 1SD3A 2HQ0A 2O51A 2V3TA 2XX8A 3CIJA 3CVGA 1Y4CA 2DVCA 3SERA 2PT1A 3IX1A 3QSLA 4H67A 4P11A 1USYH 2F34A 4KPTA 5AA4B 2Z22A 1YCJA 1B3FA 4ESWA 3RUMA 3O97A 2O7UA 1LFIA 1MY4A 3N6TA 4Q0CA 2XXRA 1B4HA 1A40A 3WAEA 4GWOA 1LFGA 4R75A 2VP1A 2F78A 2P1SA 3L6HA 3RLFE 3SETA 5JTYB 1SW4A 2I0BA 5H8NA 3R7XA 3RTWB 5ITPA 2GRVA 3RN8A 1DOTA 3ZKLA 4G77A 4H8JA 2DP8A 1S9TA 1EH3A 3FV1A 2ZNUA 3SKPA 2BJJX 3DP8A 2Z8EA 4F1UA 4H5GA 4FIMA 3FVKA 2Q89A 4F2OA 1M5CA 3KSJA 1VSOA 1MY0A 2D21A 4QHQA 1UQWA 2RCBA 3FXUA 4R6KA 3OMBA 1P1OA 4GD5A 3MAMA 2V3QA 3MP6A 2PT2A 3CSBA 3G3KA 3PUZE 3T96B 4E0XA 1MPDA 5J1DA 2GFEA 3FD3A 4F19A 1MDQA 4G68C 2H5YA 1N7XA 2QPQA 3Q26A 2RC7A 1IITA 1IEJA 4QF9A 4KHZE 4NWDA 3TTMA 1LCTA 3KSXA 4F3SA 3S9EA 2I4CA 2Y7PA 2GH9A 3O28A 1DTGA 2ZYKA 3FJGA 2ZNSA 1UTHA 3QUJA 2H9BA 1POY1 3W9WA 2W7YA 3TTNA 2RC8A 3PPNA 1BP5A 3MBPA 4LZ8A 4OQOA 3B6WA 1B3GA 1SVXB 4MF3A 1FTLA 2D5WA 4X1DA 4DZ1A 2NWJA 2I49A 4UA8A 1D9VA 3T9HB 4KI0E 3RT6B 2FYIA 3LSLA 4DXCA 3MZBA 1B5IA 3KFMA 2QS4A 3U94A 1XVXA 4PETA 4THIA 1EZ9A 1MM7A 4NF8A 1NNTA 1JW1A 4POWA 3KN7A 1JVYA 1L5TA 4BDLA 3SEUA 2H99A 3P7IA 3KJ7A 5I57A 1Y20A 2QS3A 4LATA 1O7TA 4R9GA 2P2AA 4PE5B 2DWIA 4WEPA 3I6VA 1OLCA 5TPAA 3VE1B 5HBCA 3B7DA 3K0VA 4G8MA 4LVQA 3IB0A 3O66A 1A8FA 1URGA 1WDNA 3K6UA 3HHFA 4RPNA 4QFOA 4OYVA 1H45A 1D3KA 1B3HA 1TFDA 2O1MA 4TLLB 2DWJA 2V84A 4U4SA 3LC8A 3PUWE 4RYAA 3THIA 4F2QA 3ONMA 3W15C 1MXXA 2ALUA 3C9HA 3CFLA 3PD9A 4IO4A 4YICA 3C35A 3MWBA 1KWHA 3FJ7A 4RPOA 5FTHA 3KN8A 3MPLA 4Q30B 5AA2B 4RJZA 1SI0A 3I3VA 4NEDA 1NNPA 4RY1A 3BFUA 4OERA 1ZIUA 1IUDA 1MY1A 2O1LA 1MXZA 4ELRA 5FHNA 4IO5A 1N76A 5TU0A 4HS7A 3C36A 4OESA 1FTKA 1UIVA 1URSA 3K4UA 3CG1A 2ZYMA 4GL8A 2XD2A 3USDA 5F7VA 4IO6A 4G4PA 1IQ7A 3MC2A 1QUKA 3KN3A 2YLNA 3LBSA 3QUFA 3VXBA 1MM6A 1NL5A 1JW4A 2OZZA 5L9MA 4ZZAA 1JEUA 4R73A 2M8CA 4R2BA 3E13X 3VXCA 3UP9A 1Y1ZA 5TP9B 3L6GA 2OWTA 1M5BA 1CB6A 2D3IA 2F35A 4OVJA 2A5SA 1H43A 3PMXA 3KG2A 3IORA 4NF4A 3ZSFA 4ZE8A 1LLSA 3ODBA 5F1QA 2F7AA 3GBBA 4MFIA 2R71A 3A3UA 4I8CA 3MP8A 4N13A 4OWDA 3PGFA 4OFOA 1BTJA 3W9VA 5ICTA 3IO4A 1R9LA 3C33A 4XKNA 2YPNA 3EQ1A 3TODA 5I2KB 5I58A 4WKMA 2HZLA 3S9NC 5ITOA 1VFDA 4RXLA 3HO7A 4DXUA 3VDFA 5H8QB 1VE4A 3K01A 5TP9A 1B5JA 4JWXA 1B6HA 1JETA 4ZS9A 1BLFA 5AA1A 4U23A 2XX7A 3OEKA 1I69A 3CRBA 1LFHA 2ZNTA 1B9JA 1LBCA 2WKYA 3UN6A 3FZVA 3OSQA 4QFLA 2I3WA 2P0SA 3FGSA 4OEUA 2I58A 2CZLA 2A5TA 2ONRA 1SBPA 1N0TA 4YMAA 4LZ5A 5I2KA 1SDXA 5BUUA 3TMGA 3LSFB 4BDQA 4R6YA 4U1ZA 1Z7NE 3OD7A 3R6UA 4KFQA 5H8QA 4FATA 1B4ZA 1YAEA 1ZTYA 3DP4A 2F7BA 3UK4A 4F31B 1RYXA 2HXWA 3U1OA 5CRYA 3T9XB 1MH3A 3VVFA 3TCFA 3CR9A 2PX1A 4GFRA 2XXQA 5H8NB 1B0HA 3FVNA 3LSXA 3M3KA 5M2VA 4NTLA 4ZEBA 1ATGA 1VR5A 4HTGA 3MW0A 1R9QA 4OHNA 4R74A 3TTRA 1MXYA 1B3LA 2G93A 5CC2A 1N3WA 2DE4A 5CMKA 1MPBA 1PB8A 1NH7A 5IAIA 5KDTB 5BWJA 3QXMA 4ZECA 5DEXA 1ANFA 3IOTA 1GV8A 3T93B 2DWHA 4FEBA 3OO9A 3ZKKA 4PFYA 4EDPA 2DE2A 5DTBA 3IAZA 4F3PA 1Y3NA 2V3UA 3HHGA 3O6IA 4OZ9A 4JXIA 2UVIA 5I59A 1N84A 3R26A 1UTHB 3TTKA 1LBBA 1OIBA 2H4IA 4E0WA 3UIFA 5DVFA 1NNKA 4R72A 1QJMA 2YJPA 4ZEKA 5LOMA 5I84A 1JQFA 1P1WA 2CMOA 3QK6A 5KDTA 2DWAA 1SW5A 5H8FA 2VOZA 1OVBA 1AIVA 3V89B 2NUVA 4QRZA 1B3EA 3KOTA 4EQ7A 1SW1A 3EHUA 4MLQA 4XTCQ 3T9UA 3TDJA 3TELA 3FATA 3PV0E 3IJXB 3S9LC 4RA1A 4NF8B 1LAFE 4YKKA 4N07A 1I6QA 2I48A 2QJEA 1FQEA 5I2NB 1URDA 4GXAA 5H8SA 1FCKA 1JEVA 5I57B 2XXVA 1DMBA 3MZ1A 3QIMA 4G8HA 1MY3A 5ICQA 4NF6A 1PB9A 3T66A 4QFPA 3K6XA 3Q25A 2ESNA 3LR1A 4IY5A 5TPAB 3SEXA 3JZJA 2Z23A 4U4XA 1N7WA 3VVEA 4BDRA 3EPEA 3N26A 1LAXA 4YKPA 3GLBA 3G7WA 1SYHA 4Z0IA 3AXFA 4ZZEA 3K02A 5I2NA 3E3KA 4TQUQ 1AH5A 1Q35A 2QMXA 3H6UA 3FVGA 3V8XB 1PC3A 3MP1A 3PPQA 3KBRA 3MZ9A 2QS1A 4BDOA 5A5XA 3CFXA 2ZXTA 4H8IA 3C31A 4ZEFA 1MS7A 4G2ZA 1RYOA 4R9FA 4KR5A 1B0LA 4PP0A 5EYFA 3IO6A 4KQPA 4GVOA 4KYEA 3K1MA 1WVJA 4FE8A 3FVOA 2Y7IA 4ZEDA 5ELVA 2Q88A 1Y3QA 4LQ2A 3U93A 3TCHA 3H4ZA 3OOAA 4UACA 2I6EA 2Q8JA 5DYHA 1N3XA 1JVXA 2UVHA 2XXPA 1A54A 4EXLA 5CBSA 1MXVA 1O63A 2R9JA 3D4GA 4F3BA 4RK2A 3FXRA 1LGBC 3IL1B 4TLMB 1BKAA 5DT6A 1S7YA 4FECA 1EZOA 3SEVA 3TAJA 3UORA 4PFWA 4NF5A 4F22A 1QKBA 4IO2A 3IOVA 4DE8A 4H65A 4HCYA 4C1TA 4U2RA 4BDMA 4F39A 1ELJA 5DVIA 3HV1A 1D4NA 3TCGA 3LUYA 3B6QA 3DLNA 1IZ1A 3TTLA 2DVZA 2Q9TA 3DELB 1FW0A 4EF1A 2V93A 2Z8DA 5CM6A 3BFTA 4OETA 4KCDA 1S50A 1AMFA 5EHSA 4G68A 1P1UA 1NKXA 2F36A 1M5DA 4NWCA 1N04A 1HSEA 4JSOA 4NF4B 2DYXA 4I9DA 4ELPA 2QS2A 3K1PA 1R1NA 3H3GA 2F5XA 1T0KA 2OWSA 3OEMA 3MJNA 3H06B 2AL4A 3G3JA 2X7PA 2B3BA 3M8UA 2O7IA 2RF1A 5EHMA 3ECRA 1OMPA 1A7LA 2XX9A 3GXAA 3O29A 4QFNA 2NXOA 3S2VA 1B7UA 1FTOA 1FQCA 3ILUB 5KZTA 5I58B 2DS9A 1QUJA 3RNNA 2HAUA 3EF7A 1PB7A 2XHDA 2B3FA 2I0CA 4POXA 1GR2A 2HZKA 1YPNA 4H0WA 2HCAA 3U8QA 2XXWA 1FTMA 1VFEA 2HEUA 3JYRA 5AA2D 3OXNA 3H6VA 4U21A 1ZJLA 1B05A 1OQGA 1MH4A 3PUYE 3VLVA 4GIZA 1US4A 2QSXA 3SDFA 2X7QA 2KLFA 4EQBA 2UVGA 3D4CA 1HSJA 2Y7WA 3DM0A 4Z7EA 3TKDA 1B5HA 2A5TB 1R6ZA 1SI1A 1OVTA 1P99A 4U22A 4JDFA 3IR1A 3TZAA 2XXHA 3EHTA 4MLVA 4ELQA 3HSTA 4LP2B 3QYTA 5ISUA 2Q2CA 4ELOA 1MXUA 1ZU0A 2I3VA 3PMWA 1P1QA 1ZLQA 3K00A 3G3FA 4LZ7A 2PBWA 1US5A 3LSWA 3FJMA 5KCJA 1FQDA 1PBQA 5CI5A 4NMYA 1FQAA 3MVYA 3EHSA 3KGCA 3RT8A 2F6GA 1XVYA 3G3GA 3HPIA 1QKAA 1B1XA 3N5LA 5K2XA 3TEPA 3H6TA 3PMVA 1M5EA 4IGRA 3V5AA 4IY6A 4M4GA 1TT1A 1MXWA 1MDP1 3WAFA 2XXIA 3PPRA 2DE3A 4IO3A 1TWYA 5DEXB 4X48A 3U92A 1AL3A 2H25A 1GTKA 1P1NA 3O6GA 4L17A 4RK9A 3MPKA 3A3CA 4I1DA 4OEVA 4ND9A 3C4MA 1MQIA 4LA9A 3C32A 1EU8A 2VD2A 5H8HA 5I59B 1UTBB 4LQ5A 2LAOA 3OELA 1LAGE 4PFUA 3FXQA 4GQOA 2IEEA 4EUOA 4OMBA 5I56B 1D9YA 1IXIA 3T22A 2ONKE 3MUQA 1LAHE 2Y84A 4YB7A 3IB1A 3TYHA 3KJTA 3TUSA 5H8FB 4I62A 2PMSA 4NE4A 2OJTA 1JNFA 4F29A 2FNCA 1XOCA 3DP6A 4C1UA 2F8DA 2I4BA 4Q5TA 4MH5A 4TOZA 2REGA 5HM4B 1GVCA 1LB9A 4EF2A 1Y1MA 3H03A 1OLAA 4Q8RA 3H7MA 3QAXA 5CMBA 1UTBA 1XC1A 4GLIA 3IJOB 4M1VA 4GF8A 1A99A 4PFTA 1J1NA 4AQ4A 3PD8A 5I56A 1B58A 1AOVA 1B52A 3SEWA 1NH8A 1LCFA 2X26A 2DXRA 3Q28A 5HPQA 3F11A 3PUVE 2DOJA 1QULA 2PYYA 3KEIA 4F3GA 5AA4A 3VFJA 4NF6B 1MQGA 3RY3A 3I5OA 4QFKA 3TQLA 3VVDA 3ZS6A 1QUIA 3EN3A 4KD5A 3M3LA 3FV2A 1PEBA 5FTIA 3N94A 5JTYA 1O64A 1H44A 2UXAA 5JEIA 1IXCA 4R2FA 4ZE9A 4YB6A 4HCWA 4GRKA 3M3FA 2REJA 4YKJA 4JWYA 5B70A 2Q2AA 4LONB 2F6PA 5A5XB 1FQBA 3PUXE 4GXSB 1I6BA 3FASA 4OTEA 2H98A 2ANJA 3O2AA 4F1VA 3O9PA 4IB2A 1MPCA 3KZGA 4YB5A 2QMWA 1SW2A 3G3IA 4R6HA 3E4RA 4IGTA 3S4UA 1ZKBA 4IO7A 4QSEA 1IXGA 4DXBA 4C0RA 4O3CA 1II5A 1JW5A 3TQWA 1ZBMA 5IKBA 3K6WA 4YMBA 2AL5A 1H3DA 5CMMA 2UYFA 2UVJA 3MVXA 1FTJA 3IK6B 4NF5B 2OLBA 1XHYA 3GZGA 4G8NA 4XXUA 4OENA 4EXKA 2UYEA 2ONSA 2DQVA 1IXHA 4OFLA 3RQTA 2Z8FA 4U1OA 3UGWA 3OO6A 3PPOA 3BBRA 3IOWA 2XXTA 3V83A 2GHAA 4FORA 4LUBA 2O68A 1A55A 1MQHA 2O69A 4H5FA 1NMUA 4F18A 3OENA 1Z7ME 1OQHA 2RINA 5B7DA 4G68B 3T9VA 2RKMA 2O6AA 1SYIA 2ABHA 3HCQA 2O84X 1H76A 1B2HA 3IB2A 1IIWA 4FEDA 3A09A 5CMCA 5DVJA 3Q27A 2E0SA 4BLAA 5FHMA 1ZMGA 4XKQA 1B7ZA 1I6AA 2VD3A 3E9XA 2F97A 4JBZA 2VHAA 2XXXA 4H1XA 2HAVA 5JK4A 3PU5A 3K1NA 3SESA 3B6TA 5FHOA 1F9BA 4JB7A 2FA7A 4P0GA 1PBPA 3CSGA 3RPWA 3U72A 3VV5A 1Q1KA 4AB5A 3H6WA 3CI8A 3N6UA 3OSRA 3K6VA 1B7HA 4ISUA 1DPPA 4KCCA 1TFAA 2XD3A 1A8EA 1RKMA 1Y9UA 1QVSA 1MRPA 4EQ9A 2PVUA 1DPEA 3HN0A 2HFBA 2NVUB 1DSNA 4DCXA 4YU0A 4KYSA 4DLDA 1BIYA 1XT8A 2ZMBA 3VLUA 2QRYA 5AA2A 1Y4TA 5AE4A 5L9OA 4QSCA 4WEDA 1B32A 1YTVA 4YZZA 2IA4A 4X1BA 4ECFA 4JSDA 2OCUA 1FQFA 3RGYA 1B51A 4H6DA 3PPPA 5CBRA 4QSDA 4XKRA 1CE2A 4ONYA 4PQJA 4ZDMA 4MBPA 5KCJB 4O3AA 3UA8A 3Q29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2P3VA 3O97A 2O7UA 1LFIA 1MY4A 3N6TA 4Q0CA 2XXRA 1B4HA 1A40A 1CNQA 3WAEA 4GWOA 1LFGA 5EYGA 4R75A 2VP1A 1IMCA 2F78A 2P1SA 3L6HA 3RLFE 3SETA 2CZHA 5JTYB 1SW4A 2I0BA 5H8NA 3R7XA 2PCRA 3RTWB 5ITPA 4PCDA 2GRVA 3RN8A 1DOTA 3ZKLA 4G77A 4H8JA 2DP8A 1S9TA 4PFRA 1EH3A 3FV1A 2ZNUA 3SKPA 2BJJX 2V4CA 3DP8A 2Z8EA 4F1UA 4H5GA 4DI4B 4FIMA 2Y5KA 3FVKA 2Q89A 4F2OA 2Q8MA 1M5CA 3KSJA 4OVTA 1VSOA 1MY0A 2D21A 4QHQA 4PBQA 1UQWA 2RCBA 4R6KA 3FXUA 3OMBA 1P1OA 4GD5A 4HE0A 2WBDA 3MAMA 2V3QA 3MP6A 2PT2A 3CSBA 3G3KA 3PUZE 3T96B 4E0XA 1MPDA 5J1DA 2GFEA 3FD3A 3E78A 4F19A 1MDQA 4G68C 2H5YA 1N7XA 2QPQA 3Q26A 2RC7A 1IITA 1IEJA 1VDWA 1NUYA 4QF9A 4KHZE 2PFZA 4NWDA 3TTMA 1LCTA 1FPGA 3KSXA 4PDDA 4F3SA 3S9EA 2I4CA 2Y7PA 4XFEA 2GH9A 3O28A 1DTGA 2ZYKA 4N6DA 3FJGA 1INPA 2ZNSA 1UTHA 3QUJA 2H9BA 1POY1 3W9WA 1FBFA 2W7YA 3TTNA 2RC8A 3PPNA 1QGXA 1BP5A 3MBPA 4LZ8A 4OQOA 3B6WA 1B3GA 1SVXB 4MF3A 1FTLA 2D5WA 4X1DA 4DZ1A 2NWJA 2I49A 4UA8A 1Q9DA 1D9VA 3T9HB 4KI0E 1DK4A 3RT6B 4GWUA 2JJKA 2FYIA 3LSLA 4DXCA 3MZBA 1B5IA 3KFMA 2QS4A 3U94A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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