5EYFA

Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
EDILERSKSTNEIIWGVKYDTRLFGMMDIESRTVQGFDVDIAKAITKKILGDNGKTEFVEVTSKTRIPLLKNGNIDAIIATMTITDERKKQVDFSDVYFDAGQALLVKKGSQIKSVDDLNASTTVLAVKGSTSAANIRQHAPDAKILELENYAEAFTALQSGQGDAMTTDNAILLGIADENPEYELVGGTFTNEPYGIAINKGQENFLKAVNQALEEMHADGTYDKIYQKWFPNETEGKVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Solute-binding protein
source organism Enterococcus faecium do
publication title Crystal Structure of Solute-binding Protein from Enterococcus faecium with Bound Glutamate
rcsb
molecule keywords Glutamate ABC superfamily ATP binding cassette transporter,
total genus 71
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA02
2IA4A 1MQGA 4RPNA 4P0GA 3JZJA 4OWDA 2XXVA 1LGBC 2FA7A 3FJ7A 1AMFA 2B3BA 2F78A 3PUZE 3G3FA 1B5JA 3UORA 4PFUA 3FVKA 3VE1B 3FVOA 4GWOA 1OIBA 3ZKLA 4O3AA 4FAJA 4PFYA 3L6GA 4U4XA 1RYOA 5JTYA 2V3QA 1B4HA 4U4SA 4XKQA 1EH3A 3KG2A 3H7MA 3ILUB 3SEXA 3IX1A 3E3KA 1JQFA 1PBQA 2O7UA 2DXRA 5FTHA 3Q29A 2UXAA 2GFEA 1DMBA 3MVWA 5AA4A 4OQOA 2NWJA 1GR2A 2QS3A 3EN3A 5M2VA 5AE4A 1OQGA 3MAMA 3MVYA 3QSLA 3TMGA 3HHFA 1LFHA 5AA4B 5I2KB 4G8HA 1ZJLA 2I0CA 3H4ZA 3VVEA 5CBSA 1RKMA 2REJA 4GFRA 4DCXA 2XX7A 2OK2A 1D3KA 2X7QA 4LP2B 3S2VA 1O7TA 3K2DA 3KFMA 1Y1MA 3Q26A 1IXGA 3CG3A 4C1UA 3FV2A 4NWCA 4HW8A 1LBCA 3EPEA 2REGA 3E4RA 4OHNA 1FQBA 1EZPA 2OJTA 2E0SA 2DVCA 5L8DA 3RTWB 4K3FA 2PT1A 1DTGA 3O6GA 1JNFA 3N26A 3QUFA 3B6QA 2PT2A 1VR5A 3KGCA 3TYHA 1N04A 3KEIA 4MBPA 2ALUA 4BDOA 4M4GA 4GIZA 3ILTB 3PV0E 4QFNA 3KJTA 3A3CA 2Y84A 4G68A 4NEDA 3RTFB 4OVJA 3GXAA 1LCTA 5TP9B 4KR5A 1H45A 1H43A 2F5XA 3KN7A 4H1XA 4RY1A 1NH7A 3GBAA 1LBBA 3VLWA 2XXUA 3RQTA 2CMOA 1QKBA 3MP8A 1YAEA 3PU5A 2ONRA 1LFGA 3MP1A 2H4IA 2Q2AA 3HSTA 3R26A 5EHSA 2UVIA 3CR9A 1QULA 3QUJA 4KHZE 2ABHA 1Y3PA 4KYSA 1GV8A 1S50A 5H8FB 3D4CA 2I3VA 2H9BA 1MY1A 1FQEA 3OO8A 3RPWA 2PVUA 4YKJA 4ELPA 4EF2A 4R2BA 1P99A 1FTMA 4PQJA 3RT6B 3E9XA 1UIUA 4GOTA 4H5FA 4ZEIA 4ZEKA 4WKMA 4I1DA 3WAEA 4OFLA 3LSLA 1OQHA 3PPRA 3JV9A 3PMVA 3U8QA 3TAJA 3OENA 3A09A 5DT6A 4LZ7A 1P1NA 3CRBA 1B0HA 3MJNA 1M5EA 5I2NB 4TLMB 4ZS9A 4Q5TA 1FQDA 3K0VA 1MM6A 4X48A 3VVFA 3G3GA 3OSRA 1MQDA 1SW1A 2DWJA 1VE4A 2HZLA 4XKRA 1PB9A 1ZTYA 5ITOA 3V5AA 2Y7KA 3CIJA 5H8NA 4EQ9A 4IY5A 1D9YA 4YMAA 3N94A 1XC1A 3K6XA 3MBPA 4AB6A 5I56B 1SYHA 1LAFE 3M3LA 4XIGQ 2NVUB 2HAVA 3CFXA 4QFPA 5H8HB 5A5XB 2XX8A 1B51A 2O51A 3TZAA 1AH5A 3MPLA 3UK4A 3B6WA 1LFIA 3KN8A 3GBBA 3U92A 2ZYMA 3HHGA 1UTBB 2F6GA 4NWDA 2Z8DA 3TCGA 1NNTA 5I59B 1B1XA 5B7DA 4RPOA 4OFJA 1ZU0A 3OEMA 2RINA 1IEJA 5EYFA 1WVJA 4HTGA 4OENA 2XX9A 4F19A 3ZS6A 2Y7WA 2O7IA 5J1DA 4KYEA 4N6PA 1JEUA 1SD3A 2F6PA 3TDJA 2V25A 3T9VA 1IIWA 1B9JA 3TODA 1XVXA 4RNSA 1H76A 2WKYA 1MY3A 2VOZA 3S4UA 2H99A 1IITA 3O28A 1LAHE 1UIVA 1TFAA 1T0KA 1SW5A 3FASA 3PMXA 1I69A 2XXHA 3R7XA 2A5TA 5HM4B 1P1OA 4H5GA 4RK2A 4ZE8A 5K2XA 4NF5B 4TOZA 5B70A 4LZ5A 4FECA 3V83A 1R6ZA 5I57A 4Q0CA 4R2FA 1B58A 4F29A 2XHDA 3C9HA 1DOTA 2P0SA 4QHQA 4XKNA 5ICQA 1HSEA 2F34A 2HAUA 2V3UA 4ZEFA 4YICA 1QUJA 4U22A 3W9WA 5IAIA 3HV1A 3VV5A 1LB9A 4QF9A 4RJZA 5TPAB 4XTCQ 1FTOA 1H44A 1Q1KA 2BJJX 3H6VA 1UTHB 5CC2A 2OZZA 5AA2D 3TCFA 5I84A 4TLLB 1JVXA 3JYRA 5HBCA 2QL3A 1SW2A 3H6UA 2RCBA 1ATGA 2I4CA 2ZNUA 1FQAA 3QYTA 2G29A 4DXCA 4ZE9A 2HCAA 1MDQA 1R9QA 2I6EA 1M5BA 4AB5A 5CRYA 4I62A 1MXVA 1Y4CA 1B7ZA 3MC2A 4IY6A 1FQCA 3C35A 4R74A 1N7XA 2XXRA 4YB6A 4YAHX 4RYAA 4KYDA 4FJPA 3MP6A 1FQFA 2DWHA 5I58B 4F1YA 4OFOA 5KZTA 1IXHA 4KCDA 4RXLA 2ZMBA 1DPEA 4WEDA 2I0BA 1JETA 3H3GA 2ZXTA 3PD9A 2UVGA 1MDP1 1SQYA 5ELVA 1B3LA 4WXJA 3C33A 3IL1B 2GHAA 4IO7A 1PB8A 2QMXA 3V89B 1B3FA 1IXCA 1NH8A 3DP6A 1VFEA 2H5YA 3VLUA 4Z0IA 3OXNA 3D4GA 4UA8A 3OELA 1Z7ME 2Q88A 4NE4A 3MPKA 2H98A 4KQPA 2QRYA 4C1TA 3PUYE 4F1UA 5L9OA 3QXMA 2GHBA 1D9VA 1IZ1A 4BDRA 3LBSA 2D21A 3RN8A 5JK4A 1N3XA 4GL0A 1B40A 4PE5B 5I2KA 4F3GA 1N0TA 3OD7A 4PETA 1M5FA 3IR1A 1YCJA 1XT8A 2O1LA 2VD3A 3RLFE 1Y1ZA 1DSNA 1I6QA 2PX1A 1SVXB 1A54A 4F39A 4E0WA 3PMWA 3W15C 2PBWA 4PP0A 1IQ7A 3U72A 5KDTB 1B32A 4P0IA 4EDPA 5BUUA 1MQIA 4MF3A 3U94A 3TFLA 3Q25A 3CI8A 4KD5A 1WODA 4F2QA 4H6DA 1JW1A 2O69A 5TP9A 1D4NA 1FTKA 4ZZAA 3C4MA 3HCQA 4OEVA 2LAOA 1MPBA 5DEXB 4U2RA 2Y7IA 1QKAA 3M3FA 3VXBA 1USYH 3FIRA 1JW5A 2NXOA 3LC8A 4H8JA 2ANJA 1US5A 3CVGA 2OLBA 1M5CA 4QFLA 4BDLA 4DZ1A 5CMCA 4R75A 3N6UA 3KJ7A 1USYE 1GTKA 2H25A 5H8FA 3K6VA 1VSOA 1XOCA 1OVBA 1LSTA 3K01A 3VFJA 1HSLA 4BDNA 1SW4A 1OMPA 5ICTA 1URSA 1ZKBA 2M8CA 2QSXA 3K00A 2DWAA 3PUXE 3PPPA 4NF6B 1XS5A 3SERA 1URGA 2AL4A 2I48A 2Q2CA 3G3HA 3I6VA 3UGWA 2VP1A 3FV1A 1I6AA 4I8CA 3MVXA 3G3JA 4G4PA 1BLFA 3ONMA 1A55A 5I2NA 4IB2A 2X7PA 1B05A 3EF7A 1US4A 3TTMA 3ODBA 4R6KA 3ZSFA 1A8EA 1ZIUA 4YB7A 1TT1A 2QS2A 3Q28A 2XXWA 2D3IA 4C0RA 2P2AA 2O6AA 4R9GA 4AQ4A 4H8IA 3KBRA 4QFKA 4R72A 3DELB 5CM6A 4Q8RA 4G68C 4YU0A 3BKIB 4YKPA 3UIFA 4FATA 4EF1A 4R6HA 4DE8A 3MZBA 3THIA 1MXZA 1ZBMA 3FUZA 1NKXA 3KOTA 1MM7A 1XHYA 2XD2A 2P1SA 2UYFA 1B7HA 4FEDA 4MFIA 5I56A 3KSJA 4ZEDA 3TCHA 4GVOA 3RGYA 2R71A 5H8HA 4HCYA 5A5XA 3TTLA 4JWOA 3N6TA 5H8QA 4G8NA 3RY3A 4LONB 1F9BA 4EUOA 3FXRA 2KLFA 4G8MA 4JWYA 1TFDA 1UTBA 4ISUA 3E13X 1A99A 5JEIA 5I59A 4NF4B 2HQ0A 4ZECA 2F97A 3LSWA 1DTZA 3U1OA 3S9LC 3IB2A 5H8QB 3T66A 1B3HA 4FEBA 3KOSA 2XXTA 1OVTA 4O3BA 4NF8B 4ELQA 5L9MA 1TXFA 4OTEA 4TQUQ 3SEYA 1A7LA 4Z7EA 1MY2A 5BWJA 2GH9A 4OMBA 2VHAA 3FXQA 4GQOA 4PFTA 4BDMA 3R6UA 1BP5A 4IGTA 1MQJA 1PB7A 4IO3A 2B3FA 1JEVA 5F1QA 1P1QA 4U1ZA 5CBRA 1B52A 2UYEA 4R73A 2A5SA 3VXCA 3BFTA 4QSCA 1UQWA 3C34A 3G7WA 3BBRA 3USDA 1FTLA 3OEKA 1N84A 4QSEA 3OOAA 3EHTA 5ITPA 4JB7A 1RYXA 4F3SA 2Z23A 3CSBA 3BFUA 3W9VA 4NF5A 4KPTA 1B6HA 4JSOA 2XXYA 2F7CA 2QMWA 3K4UA 2DE4A 3IB0A 3IOUA 4JWXA 3UN6A 2UVJA 3SDFA 1N76A 3TPAA 3S9MC 4GD5A 2AYSA 4ONYA 2AIXA 2VGQA 4RA1A 3CSGA 1OLCA 2RCAA 3PPQA 4EXLA 2UVHA 3UP9A 2ESNA 4POXA 1A40A 1Q35A 3CG1A 1JW4A 4GXSB 4YKKA 1SI1A 5TPAA 4MLQA 3C32A 1VFDA 1DPPA 4LUBA 3WAFA 1UTHA 3MVZA 1B5HA 2V84A 1B46A 1MXXA 3O9PA 3SEVA 2ONKE 1GVCA 1ZLQA 3H6TA 4EXKA 4LATA 2Z8FA 3O97A 4OZ9A 4U23A 4F18A 4H65A 4LQ2A 3P7IA 3Q27A 3GLBA 1ZMGA 4YKIA 5DVFA 3SETA 4LQ5A 2DWIA 1MS7A 5FHNA 1Y3QA 3OSQA 3IOWA 3FZVA 4LA9A 3OMBA 4QRZA 2OWSA 1MH3A 1NL5A 2X26A 1QW0A 5I58A 1P1UA 3SESA 5DYHA 4RK9A 3PUWE 4LVQA 2YJPA 4JXIA 3A3UA 1URDA 1IUDA 5AA2B 2DVZA 2O68A 3C36A 3EHUA 4WEPA 3H06B 3M3KA 4F1VA 3LSFB 4R9FA 2FNCA 2F36A 4GF8A 4F31B 1M5DA 3SEWA 1PDAA 4GL8A 3FJGA 3TQWA 3T96B 1N7WA 4DDDA 4OEUA 2HFBA 1SYIA 2QJEA 3GZGA 1S9TA 4O3CA 4OESA 4POWA 3K1PA 4IO5A 2QS1A 2OBGA 2DS9A 3TUSA 1R9LA 1EZ9A 3LSXA 1JVYA 1MRPA 4I9DA 2THIA 4U21A 3TTNA 3L6HA 4QFOA 4OETA 5DVIA 3TTKA 5JTYB 5KDTA 3IJXB 1MY4A 2W7YA 3KN3A 3V8XB 2DQVA 2PMSA 4NTLA 3O2AA 1I6BA 1N3WA 3TKDA 3IJOB 3OO9A 3KZGA 4XXUA 1BTJA 2IEEA 2Y7RA 3N5LA 4N13A 4FE8A 1KWHA 1P1WA 4QSDA 4P11A 2O84X 5DVJA 2ONSA 1B3GA 4BDQA 2R9JA 1Y20A 3OO7A 3K1NA 5DEXA 4G2ZA 1B5IA 1FW0A 2QPQA 4GLIA 3RT8A 5AA1A 2Q8JA 3G3KA 3C31A 1ELJA 2OWTA 3SEUA 1AOVA 2B65A 3RNNA 1O63A 4ZDMA 1MPDA 3TELA 3S9NC 4ESXA 2AL5A 2Z22A 3ECRA 1SBPA 2F7BA 2XXPA 1QUKA 3G3IA 1MPCA 3O66A 3CFZA 2F35A 3EHSA 5CMKA 2Y7PA 1LAXA 3DP8A 2HEUA 3FVNA 1BKAA 4OYVA 1MH4A 4NF6A 1Z7NE 2D5WA 1OLAA 2R6GE 4F22A 1LLSA 1AIVA 1S7YA 4FIMA 4YMBA 4ESWA 4XKPA 1NNFA 2F8DA 4L17A 1B4ZA 2PYYA 2CZLA 1TWYA 4IGRA 3IAZA 4X9TA 3HO7A 1PBPA 4DCYA 4G68B 4DLDA 3TQLA 3FATA 3T93B 3PPNA 4DXUA 1Y4TA 4JDFA 3O6IA 1QUIA 1EU8A 4IO2A 1O64A 1LAGE 3T22A 1FTJA 3MW0A 4H0WA 4ELOA 2XD3A 2DYXA 3FD3A 3MWBA 4H67A 1B3EA 4JSDA 1MQHA 1PEBA 2RC9A 1B0LA 3PUVE 1AL3A 3EQ1A 3FXUA 3CFLA 4OXVA 4MLVA 2O1MA 3IOVA 4GRKA 1H3DA 3O6HA 4Q30B 3VDFA 4FORA 3M8UA 3UA8A 1SI0A 3T9HB 4ZZEA 1NNPA 2DE2A 3K6WA 3QIMA 4BLAA 4E0XA 2DOJA 2G93A 2Q9TA 2VD2A 4NF4A 1FCKA 4KFQA 3IK6B 3AXFA 1B2HA 5F7VA 4NF8A 3OO6A 3B6TA 2XXXA 3F11A 3QK6A 5DTBA 3H03A 5TU0A 2DP8A 3I3VA 1CB6A 1Y9UA 5L9SA 2E1SA 4IO6A 5CMMA 4ELRA 3QAXA 4JBZA 1II5A 3FJMA 3IOTA 4F3BA 1POY1 3FGSA 3I5OA 2ZYOA 1QJMA 4NMYA 2FYIA 3HN0A 3PPOA 1HSJA 3IB1A 1J1NA 1GGGA 5H8NB 1MY0A 4UACA 2ZYKA 1WDNA 2Q89A 3VVDA 3HPIA 4N07A 4KI0E 3K6UA 3T9XB 1NFTA 3ZKKA 3MZ1A 3T9UA 1SDXA 2V93A 4HCWA 5EHMA 3VLVA 3PD8A 4IO4A 2HXWA 3TEPA 5HPQA 5H8SA 3SKPA 3TTRA 4OERA 2F7AA 2RC7A 4F3PA 2I4BA 5ISUA 3PGFA 1MXWA 4KCCA 2NOOA 3O29A 1Y3NA 1ANFA 2HZKA 4DXBA 1NNKA 4YB5A 4EQ7A 2YLNA 2NUVA 5FHMA 4ZEBA 3DM0A 4PFWA 1CE2A 3MZ9A 3H6WA 4ECFA 3MUQA 3FVGA 4M1VA 4EQBA 1MXYA 3K02A 5FHOA 1EZOA 1IXIA 3LUYA 4G77A 4MH5A 4DIGA 3DP4A 2YPNA 1MG1A 3IO4A 4THIA 1LCFA 3U93A 5CI5A 2RC8A 2ZYNA 1BIYA 2DE3A 4F2OA 5AA3A 2A5TB 5KCJA 2ZNTA 5K2YA 5LOMA 2I3WA 2QS4A 5CMBA 5FTIA 4LZ8A 3LR1A 3IORA 1POTA 4R6YA 2V3TA 2GRVA 1YPNA 1B1HA 1R1NA 2I58A 1A8FA 1PC3A 5KCJB 3DLNA 5I57B 1L5TA 2ZNSA 5IKBA 4GXAA 5AA2A 2OCUA 2DSFA 4X1BA 4HS7A 2I49A 1MXUA 3RUMA 3MQ9A 3K1MA 4ND9A 2RF1A 1XVYA 2DXYA 4U1OA 3B7DA 1LB8A 3S9EA 2Z8EA 1QVSA 2RKMA 3KSXA 3IO6A 4YZZA 1B7UA 1YTVA 2XXIA 1NMUA 4X1DA 2XXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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