5EYFA

Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
EDILERSKSTNEIIWGVKYDTRLFGMMDIESRTVQGFDVDIAKAITKKILGDNGKTEFVEVTSKTRIPLLKNGNIDAIIATMTITDERKKQVDFSDVYFDAGQALLVKKGSQIKSVDDLNASTTVLAVKGSTSAANIRQHAPDAKILELENYAEAFTALQSGQGDAMTTDNAILLGIADENPEYELVGGTFTNEPYGIAINKGQENFLKAVNQALEEMHADGTYDKIYQKWFPNETEGKVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of Solute-binding Protein from Enterococcus faecium with Bound Glutamate
rcsb
molecule tags Solute-binding protein
source organism Enterococcus faecium do
molecule keywords Glutamate ABC superfamily ATP binding cassette transporter,
total genus 71
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA02
5KZTA 4G68A 1MS7A 2GH9A 4XKNA 2ALUA 4LZ8A 5HBCA 1MY2A 1OVBA 2OK2A 3G3HA 4AQ4A 4EQ9A 5KDTB 1A8EA 5H8SA 3A09A 4RNSA 1H76A 5CRYA 3ZSFA 3L6GA 1Y3QA 3U72A 4RPNA 2DWIA 3OSQA 1ZKBA 4TLMB 2ZNSA 3O28A 1SI0A 1Y9UA 4JSOA 1HSEA 3QYTA 2FYIA 1T0KA 3IJXB 2GHAA 4GL0A 4GXAA 2H5YA 4ESXA 4LQ5A 3C33A 1PBQA 1MXYA 4QFPA 2DP8A 2ZMBA 1A54A 2H98A 4GF8A 3SERA 3ECRA 4DLDA 5EHMA 4MBPA 3TTNA 2DXYA 3TQLA 4E0WA 1MQGA 4NF4A 4ZDMA 3TODA 5CMKA 4N6PA 2B3BA 3GBBA 2ONSA 4MLVA 2Y84A 3M3LA 4X1BA 4OXVA 4F31B 3CG1A 2DVCA 4HS7A 1NFTA 5I57A 1CB6A 1B4HA 1H45A 2V93A 1IUDA 1LFHA 3K01A 2M8CA 1PEBA 3TAJA 4JXIA 1TWYA 1P1NA 2ZYMA 1N0TA 3S4UA 2QJEA 3HN0A 1M5BA 2YJPA 4POWA 1QW0A 4EQBA 3CR9A 1BKAA 3VFJA 1ZJLA 1Y4CA 5DT6A 3SEWA 2QL3A 4PFWA 1SW4A 1N76A 2X7QA 4U4XA 4DXCA 5BWJA 1RYOA 4NF6A 3KOTA 5K2XA 2DVZA 3MPLA 3AXFA 5F7VA 5L9SA 1VE4A 4BLAA 2FA7A 1FTMA 3K1PA 1B5IA 1QUIA 1ZLQA 4I8CA 1ZU0A 1ZMGA 3ONMA 4KPTA 5A5XA 3OELA 4XKPA 2I3VA 1Y3NA 5I58B 3TYHA 3PPQA 2Q9TA 1S7YA 3VLUA 3G3IA 1B32A 2REJA 1SYIA 2Y7WA 4RK2A 1UIUA 2XXUA 1MPDA 1RYXA 2O6AA 3CSBA 3HHGA 1II5A 4R6HA 4OVJA 3FJGA 5JK4A 1UQWA 2RC9A 2X7PA 3CFZA 2R71A 1B5JA 4ZEIA 4LA9A 3KJTA 2I49A 3QSLA 2OLBA 1DPEA 3HCQA 2O7IA 3RLFE 3UP9A 2HXWA 4KHZE 4GWOA 1ANFA 5ISUA 4QFKA 3RT8A 5FHOA 2ANJA 2ESNA 1EU8A 2V3UA 1CE2A 4C1UA 2I0CA 4EQ7A 3FJ7A 1WODA 5H8FB 3DP6A 3SDFA 3S9NC 5DEXB 2DE2A 1JETA 3FIRA 3PUWE 2Q88A 2A5TB 1MXXA 1SBPA 1H43A 3L6HA 3U1OA 2DQVA 4F3PA 3PMXA 3QAXA 1JW4A 3RUMA 2AYSA 2ZYKA 4GL8A 4P0GA 4QFOA 3RNNA 1R9QA 3UA8A 4PQJA 1PC3A 1SQYA 4LATA 2XXYA 2OJTA 4IO5A 4QHQA 5FTHA 4R9GA 3CVGA 1XS5A 2H9BA 1QKAA 3D4CA 4QSDA 3QUJA 2F35A 1EZPA 4QSEA 5JEIA 4FJPA 1LAGE 4ECFA 4ZEFA 4NMYA 2REGA 2VD2A 3T9VA 3PD8A 3V89B 3LSLA 1SDXA 1LLSA 3R26A 3D4GA 5DVJA 4EDPA 3G3KA 1Y1ZA 2QSXA 4ELOA 2NUVA 2LAOA 2XXIA 1M5DA 4OFLA 4R72A 5HM4B 1S9TA 3A3CA 3OEMA 4O3CA 3PV0E 3FATA 4YICA 5ELVA 3T9UA 5F1QA 4UA8A 4BDMA 2CMOA 2RF1A 3VLVA 2O7UA 2QS1A 4EXKA 1LAXA 1B3FA 3TMGA 4ZE9A 4JDFA 1MY4A 3OO7A 4P0IA 3FVGA 3OEKA 4XXUA 2Z8DA 1QULA 1RKMA 5AA2B 2RCBA 4THIA 1M5EA 1DTZA 5H8NB 2O1LA 4TLLB 3OO6A 3O9PA 3PMVA 4GIZA 2AIXA 3THIA 3DP4A 5I2NB 2XX7A 3MZBA 4YMBA 4QRZA 4R2BA 4F3SA 1VFEA 3IOVA 1FCKA 3V5AA 4YU0A 3SEVA 3KN8A 3TTLA 4FORA 4U1OA 3FD3A 4EF2A 4X48A 5M2VA 2HAUA 1B58A 4IGRA 3SKPA 4ZZEA 5I59A 4IY5A 3ZKKA 1N7XA 4DZ1A 4U1ZA 4JWXA 1IXGA 3IO4A 3P7IA 3KSXA 3OENA 3ZS6A 3VVDA 2F8DA 1MXUA 1IXCA 1MM6A 2UYFA 1NNPA 5CBSA 1MDP1 2QMWA 2BJJX 4KCDA 4DCXA 4O3AA 1B52A 3FVKA 4H65A 2X26A 1XVXA 1Z7NE 4ZECA 1P1QA 2XXRA 3VV5A 4R6KA 3MWBA 4M4GA 3B6QA 2YLNA 5TPAB 4ZZAA 3MVXA 4LZ7A 3OD7A 4HW8A 4IO2A 2OCUA 2DE4A 3T9HB 3FVOA 3TCFA 1LGBC 3I5OA 5JTYA 4IO3A 4EUOA 2F6GA 3U92A 1NMUA 1HSLA 4R74A 4RY1A 3IO6A 3SEYA 1AOVA 4U23A 4RXLA 1UTHB 4U2RA 3SEUA 4G8HA 4TQUQ 4Q30B 3LSXA 4AB5A 2O51A 1Y4TA 2FNCA 1IEJA 4HTGA 5H8HB 5CM6A 4H6DA 4GOTA 1URDA 4BDNA 3IORA 1B9JA 4GD5A 3I3VA 3FXQA 5ITPA 4WXJA 2HZKA 4GVOA 4F19A 3PGFA 2I58A 3N26A 1B3EA 1MXZA 3KOSA 2PT2A 1B3HA 3PUZE 1FQDA 1GV8A 3R7XA 3H3GA 4F1VA 4HCWA 2F7CA 4Q5TA 3O6HA 1LCFA 3DP8A 3TCHA 2VD3A 4PE5B 1FTLA 1TXFA 3TDJA 1EZOA 3CIJA 5DVFA 4Q8RA 4FEBA 3K0VA 3C31A 3RGYA 3EHSA 1MQJA 1Q1KA 5K2YA 2UVGA 3Q25A 4TOZA 3C35A 1MRPA 3MC2A 4F39A 4PETA 3TKDA 4XIGQ 5I2KB 3QXMA 3T93B 2DWHA 2ONRA 3PPNA 3H7MA 3U8QA 3H6TA 5CMCA 2HZLA 1VSOA 4LQ2A 3LC8A 1KWHA 1B3GA 1ZBMA 1B0HA 2QMXA 1PBPA 1LFGA 3PD9A 1PB8A 1P99A 4YB6A 3T9XB 3H4ZA 4FEDA 3K6XA 4H5GA 3EHUA 3IB0A 4GFRA 3MVZA 1P1OA 4JWOA 1D3KA 3KSJA 4POXA 3C32A 3IOTA 3IB2A 1I6AA 1MH3A 3G3GA 2I0BA 4G2ZA 1D9YA 1LBCA 1M5CA 1B3LA 4ZEBA 2PVUA 1DMBA 3SESA 5H8NA 3DLNA 5L9MA 5AA3A 3IJOB 2I4BA 3T66A 4NF8B 2UVHA 5I2NA 4OMBA 2XXVA 4U4SA 4F18A 1B51A 3EN3A 1AL3A 4R2FA 3UORA 2KLFA 3VXCA 1YPNA 2I6EA 1USYE 2Y7PA 3PU5A 3RT6B 1MY1A 1D4NA 1LFIA 2ZYNA 3N6TA 3TTKA 3V83A 2XX9A 3TPAA 3HO7A 3EHTA 4BDRA 1NNKA 5FTIA 3M3KA 3MJNA 4C1TA 3ZKLA 4YMAA 2H99A 1O63A 4OENA 1SW2A 3VE1B 3FVNA 2CZLA 1DPPA 3Q29A 1GR2A 2XD2A 2F36A 2Z8FA 4OHNA 2Q2CA 1N3WA 4LZ5A 1NNTA 3E9XA 4LVQA 4HCYA 3LSWA 2V3QA 1OVTA 3E3KA 5H8QA 3C4MA 2NVUB 2V3TA 3O6GA 4F3GA 1JW1A 2XXHA 4YKKA 3LBSA 4NEDA 3FXUA 5HPQA 3FXRA 1MM7A 3N5LA 3OSRA 3USDA 1NL5A 2V25A 1ELJA 1AIVA 3BFUA 4FECA 5KDTA 5TPAA 4BDQA 2I3WA 4R6YA 5L9OA 3KN7A 3MP1A 3MZ9A 3BFTA 3K6UA 1UTBB 3N94A 3W9VA 3R6UA 3DM0A 3LUYA 1XHYA 3FGSA 3FJMA 4C0RA 1A8FA 2OBGA 1LAFE 4F1YA 5ITOA 1JVXA 3K2DA 4IO7A 4F2OA 3H06B 2NOOA 4LP2B 2Z23A 1YCJA 1UTHA 1DTGA 1FTKA 5AA4B 3H6VA 3IR1A 3IB1A 4DE8A 3QUFA 4U21A 1OMPA 3JYRA 2ONKE 2ZXTA 3V8XB 5H8HA 4R75A 4KYDA 4YB7A 3PPPA 2RC8A 4RA1A 1LB9A 3KZGA 2QS3A 1MQHA 3B6TA 1FTJA 1MPCA 3OXNA 4G77A 2F7BA 4IGTA 1LBBA 2PYYA 3K6VA 3E4RA 2Y7IA 1OQHA 1IZ1A 4MH5A 3CFLA 4QSCA 2HFBA 3VXBA 2O69A 1YAEA 4F2QA 3PUVE 1ZTYA 3B6WA 1JQFA 1URSA 1O7TA 3CSGA 4IO6A 3M8UA 4M1VA 3MUQA 2XXXA 4OETA 1B46A 5I2KA 2UXAA 1MQIA 1Q35A 2G29A 2F78A 1BLFA 1US5A 2QPQA 1JVYA 1FQCA 3JZJA 2AL4A 3K02A 2IA4A 2V84A 3H6UA 4RJZA 2R6GE 2OWTA 5I56B 2RCAA 3M3FA 3MP8A 2B3FA 3SEXA 3KBRA 4PFYA 1B7UA 4JB7A 3MAMA 3VLWA 4F22A 1FQEA 1B0LA 5AA1A 2ABHA 1ZIUA 4PFTA 2VP1A 4I62A 2HQ0A 2OZZA 4YKPA 3EQ1A 4FAJA 1OLAA 3Q27A 1PDAA 2DSFA 4ELRA 4KFQA 4KI0E 2XXTA 1B7HA 3IK6B 5KCJB 3IX1A 3ODBA 4PFUA 4ZS9A 2VGQA 3GXAA 1MQDA 2IEEA 1LCTA 5I58A 5DVIA 3BBRA 3KEIA 3ILTB 2GRVA 4NF8A 2PX1A 4MFIA 2Q8JA 1WVJA 3GBAA 1JNFA 5TP9B 2G93A 3FV1A 2F97A 3A3UA 1OLCA 3TTRA 1DSNA 1IXHA 1J1NA 3TELA 2O1MA 3TEPA 3MBPA 4LUBA 3G3FA 1B1HA 4DIGA 2UVIA 4ND9A 2F34A 4OTEA 2O84X 2RINA 2E0SA 4YAHX 1MY0A 4G8MA 1ATGA 1L5TA 2DS9A 1I69A 3IOUA 3UIFA 3KJ7A 2DOJA 2VHAA 4KYEA 5J1DA 1NNFA 4KR5A 1R6ZA 4N13A 4GQOA 4F1UA 2I4CA 3MP6A 4G4PA 1YTVA 1IXIA 3MW0A 4F3BA 1MPBA 3PUXE 4N07A 2GFEA 3H6WA 3TTMA 3EPEA 4U22A 3KG2A 4G8NA 3FV2A 1A55A 2E1SA 5DYHA 5B7DA 3LSFB 3VVFA 4EF1A 2VOZA 5H8FA 1NH7A 4NTLA 2D3IA 2P0SA 5DEXA 4MLQA 2A5TA 3DELB 4K3FA 3KFMA 3RN8A 2F6PA 2THIA 4QFLA 1IITA 1UTBA 3OO9A 2NWJA 1GGGA 2XXQA 4IY6A 3EF7A 2XXPA 3LR1A 1UIVA 1B7ZA 1TT1A 1XVYA 3WAEA 1QKBA 4IB2A 4NF5B 4Q0CA 3VDFA 4YKJA 4FIMA 3U94A 5AA4A 4H8IA 4ISUA 1JEUA 1QUJA 1S50A 4E0XA 1AMFA 3TFLA 2HEUA 1P1WA 3MPKA 5L8DA 2PBWA 3RY3A 5CMBA 3HHFA 5AA2D 4ONYA 5FHNA 4WEPA 1B2HA 2DXRA 4KCCA 3K6WA 3OMBA 4WEDA 4KD5A 1XOCA 4H67A 4FATA 1PB7A 1FQFA 4XKQA 1VFDA 1D9VA 1SW1A 2W7YA 1AH5A 1JW5A 2Z8EA 3KN3A 3PUYE 4Z7EA 4NWCA 4ELQA 1TFDA 1BIYA 1BTJA 3CG3A 3TCGA 1Y1MA 5EHSA 2P2AA 4ESWA 1F9BA 4RYAA 3FUZA 1GVCA 5LOMA 1MH4A 1Y20A 2R9JA 3UGWA 5AA2A 3O97A 1XT8A 1Z7ME 5I59B 1FQBA 1MG1A 2Y7KA 4H8JA 3BKIB 3K1MA 4RPOA 3TZAA 3GLBA 3RQTA 2UYEA 1M5FA 3HPIA 1BP5A 3IAZA 3VVEA 2UVJA 3Q28A 3O6IA 3OO8A 4DCYA 2RC7A 3MVYA 1WDNA 4PP0A 2D21A 5BUUA 4I9DA 3C34A 2DWAA 4NWDA 3S2VA 2Z22A 4FE8A 1B40A 5FHMA 5I56A 5CC2A 2F5XA 4I1DA 1XC1A 2DYXA 3RPWA 4G68B 1Y3PA 1N7WA 1R1NA 1MDQA 4UACA 4MF3A 4OWDA 4YKIA 3W15C 3K4UA 1A7LA 4OERA 2ZNUA 1A99A 3QK6A 4OFOA 2D5WA 1I6QA 4OQOA 1B05A 2QS2A 3S9LC 5JTYB 4OESA 3F11A 4KQPA 4AB6A 5KCJA 3B7DA 3HSTA 4L17A 2XXWA 2PT1A 4YB5A 4OEUA 1VR5A 3S9EA 4GXSB 4OFJA 4O3BA 3GZGA 5TP9A 3T96B 3MVWA 1POY1 3KGCA 1USYH 3PPRA 4GLIA 2ZNTA 3UK4A 2AL5A 3O29A 3O66A 3HV1A 1EH3A 5I84A 2WKYA 2Q2AA 4ZEDA 3E13X 1NKXA 4GRKA 1JEVA 1MXWA 4QF9A 4G68C 4JSDA 4NF4B 1IIWA 1SVXB 4IO4A 1H44A 3UN6A 3PMWA 1P1UA 1SD3A 5B70A 4NE4A 1H3DA 2H4IA 1QUKA 3TUSA 3MQ9A 4P11A 2O68A 1O64A 1DOTA 4ZEKA 3SETA 4QFNA 5I57B 5DTBA 1FW0A 1N3XA 1US4A 2NXOA 3CFXA 4XKRA 3ILUB 4OYVA 4WKMA 3FASA 2F7AA 4ELPA 3C9HA 2HCAA 2QRYA 2DE3A 4OZ9A 1PB9A 4H0WA 3G7WA 4R73A 3K1NA 3IOWA 2H25A 4LONB 2ZYOA 3TQWA 1MY3A 1FQAA 4XTCQ 1A40A 3G3JA 3N6UA 2XX8A 3RTWB 3WAFA 2A5SA 4ZE8A 3U93A 2B65A 1B6HA 4NF5A 3PPOA 4OEVA 3CRBA 3QIMA 3O2AA 4NF6B 4X9TA 2Q89A 2I48A 1FTOA 4H5FA 5IAIA 1N04A 4DDDA 5A5XB 1URGA 3FZVA 4KYSA 1B4ZA 4DXBA 2XD3A 1EZ9A 2XHDA 5CMMA 1SW5A 1SYHA 1MXVA 5ICQA 2GHBA 1B1XA 1OQGA 2Y7RA 2DWJA 5CBRA 4BDLA 2YPNA 3CI8A 4YZZA 5TU0A 1TFAA 4X1DA 4BDOA 3OOAA 1HSJA 3IL1B 3S9MC 1LB8A 3C36A 3W9WA 3T22A 1OIBA 1QVSA 2QS4A 4R9FA 4H1XA 3K00A 4JBZA 4DXUA 4EXLA 2OWSA 1B5HA 5ICTA 1LAHE 4Z0IA 2P1SA 1QJMA 1SI1A 1POTA 3JV9A 1GTKA 1I6BA 1IQ7A 4JWYA 1N84A 3RTFB 1R9LA 3Q26A 2PMSA 2RKMA 3H03A 3I6VA 1LSTA 5AE4A 5H8QB 4RK9A 5EYFA 1NH8A 2HAVA 4F29A 3MZ1A 5CI5A 5IKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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