5FHMA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-(aminomethyl)benzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at resolution 1.55 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA02
4U23A 3OSRA 4F18A 2F35A 2H25A 1HSEA 4OWDA 3DP4A 1Y4CA 2A5SA 4JBZA 3WAEA 3PPRA 3CSBA 1LLSA 2FYIA 3VLWA 1SW5A 1SW2A 4OXVA 2NVUB 3VXBA 3TUSA 4IGTA 3G3JA 3FASA 2XXHA 4WEDA 4OFJA 5HBCA 1P1OA 2CMOA 4KPTA 1TT1A 3HPIA 3K6VA 4P0IA 4HS7A 1XHYA 3O6GA 1GR2A 1M5FA 3P7IA 5CC2A 1Y3NA 4KR5A 3RUMA 1H44A 3TEPA 2F8DA 2DQVA 4GVOA 4ZDMA 4U4XA 4QFKA 1JNFA 4GF8A 3VXCA 3L6HA 2UVJA 4GOTA 3MVXA 1B32A 4XKNA 3FATA 1MS7A 5L8DA 2F5XA 2VHAA 3TFLA 1DPEA 1XVYA 2DXYA 1DTZA 4RA1A 2I0BA 4R6KA 1AOVA 4HCYA 4LONB 1BP5A 5FHOA 2H99A 1B6HA 5B7DA 4G68A 1II5A 4BLAA 1TFAA 4X1BA 2PBWA 2PVUA 4U21A 3O29A 5I2NA 1ZMGA 1GVCA 2YJPA 3U1OA 4GD5A 3FJGA 1Y3QA 2Y7PA 1MXUA 1O63A 2HFBA 4PQJA 3TQLA 4F3PA 4ZS9A 3A09A 1BTJA 4RPOA 1N3XA 1MXZA 3MZBA 2Z8FA 2M8CA 4M4GA 4EUOA 4YB5A 1R9QA 1NH7A 4H8JA 3G3IA 2QRYA 2D3IA 4QSDA 2YLNA 4F1YA 5CBRA 2DE2A 3SEYA 3KBRA 5H8FB 3USDA 4LVQA 3IK6B 2VGQA 3PV0E 1LFGA 3PMVA 2A5TA 4YKIA 3KOTA 4X9TA 5IKBA 3K6UA 4NF4A 4DXCA 1OQHA 4OFOA 2I0CA 2Q2AA 2E1SA 4KI0E 1J1NA 3FIRA 3IB2A 3TTMA 3B7DA 2NUVA 4TLLB 3Q25A 4MFIA 1B5HA 5L9SA 3U93A 5TP9A 4I9DA 1B0HA 1NH8A 4XIGQ 2AL5A 1B51A 1IEJA 1EH3A 2I58A 3PMXA 3ZS6A 3PUXE 3V8XB 1Y20A 2P2AA 3BKIB 1B7UA 1B3LA 3T9XB 1NNFA 2I4CA 4RNSA 4O3CA 4HTGA 1AL3A 3C4MA 5I56A 1LB8A 2UYEA 3KN3A 5DEXB 2Q88A 1B4HA 1D3KA 4H1XA 3H6WA 1MXVA 1ANFA 4IGRA 3U92A 4MBPA 4YMAA 4OEVA 1IIWA 3MP1A 4G8NA 2DWJA 2G29A 2XXWA 2XXRA 3IO6A 1UTHB 4H5GA 1NNPA 3IOVA 2RC8A 3RT8A 4DE8A 2QL3A 3G3HA 3Q28A 4U1OA 4QSCA 3OO6A 1NNTA 1IITA 2OWTA 2IA4A 5CRYA 4NF8B 3OEKA 1NMUA 2RF1A 3TQWA 4OTEA 1DTGA 1MQJA 4F19A 1T0KA 1XT8A 1A40A 3K1MA 1I6BA 2XXIA 1B3EA 2DE3A 1DOTA 4FATA 1GTKA 1O64A 3O66A 2DSFA 4BDRA 4YICA 3SEWA 1DMBA 5H8HA 2OZZA 1ZKBA 2ONKE 5K2XA 2CZLA 1B40A 3RQTA 4GFRA 4LZ7A 4KQPA 4IO2A 4YZZA 2X26A 2QJEA 4KYDA 3UIFA 4ZZAA 1N0TA 2P1SA 3IOTA 3H6VA 3QAXA 3R6UA 3TMGA 4G8HA 3DLNA 4GXSB 3H6TA 1DPPA 2ALUA 5CI5A 3HHFA 5AA4B 3LC8A 4YKJA 3CI8A 3PPQA 4OVJA 4WKMA 4R73A 3UORA 1HSJA 1F9BA 2QSXA 2B65A 1FQAA 1PBQA 3IJOB 3EPEA 3C31A 5HM4B 5JK4A 1D9YA 1S50A 1MY2A 3K1PA 1Z7ME 1JEUA 3B6QA 1LBCA 4XTCQ 4ELQA 4JXIA 4LATA 4C1TA 3K02A 1LSTA 1Y1ZA 3W9VA 1H76A 4NF5A 3TODA 3U8QA 4H5FA 1I6AA 1MG1A 3FXQA 3K2DA 2XXPA 3C36A 2F7AA 1A55A 2XXQA 4P0GA 1Y9UA 4JWYA 4R2BA 5H8FA 2B3BA 3RN8A 1IXGA 3D4CA 3IB0A 1FQFA 2DWIA 1FQDA 4JWOA 2I4BA 1JETA 5IAIA 3IJXB 3U72A 2P0SA 2KLFA 5EYFA 1MY4A 1CE2A 4F2QA 2O51A 1SBPA 1B7HA 3TYHA 2ZXTA 4HW8A 4R6HA 4AB5A 4DDDA 4Q5TA 1JW1A 1VE4A 1EZOA 3R7XA 1JW4A 1JQFA 4IY6A 4R72A 3K00A 4U4SA 1MXWA 4OENA 4BDNA 4C1UA 3I6VA 4BDOA 4OHNA 4ZEKA 2O84X 3DP6A 3TTNA 2V3QA 4LQ2A 1A54A 3H6UA 5A5XB 3S9MC 3F11A 3FZVA 3VVEA 2OLBA 2O1LA 4LQ5A 4F2OA 5L9OA 1GGGA 1B3HA 1AMFA 4EF2A 3N5LA 2Q89A 1B2HA 1P1UA 5DEXA 1IUDA 3TCHA 4RXLA 2QPQA 2I6EA 1OMPA 1FTJA 1XOCA 2HAUA 5DTBA 2VP1A 5EHMA 4QF9A 2DP8A 4G4PA 3ODBA 1FTLA 4LUBA 2QS4A 3MP6A 3SDFA 5H8QB 1CB6A 4QRZA 5DVJA 3DM0A 4Q8RA 3RGYA 5I59B 2V93A 1M5EA 4FJPA 1B9JA 1FQEA 3QIMA 3OELA 1JW5A 2I49A 1NKXA 5FHMA 3MVWA 2ONRA 1D4NA 3MAMA 4POXA 1DSNA 1MPBA 5FTIA 1SI0A 2V3UA 3TAJA 3HCQA 1MPDA 4Q30B 1R9LA 5ISUA 4ZEIA 4AB6A 4GXAA 3MVYA 1ZTYA 3QUJA 1YAEA 3IR1A 4PFTA 4F29A 4OQOA 3TCGA 2VOZA 1FW0A 4GQOA 5DVIA 3IAZA 3CFLA 3GBBA 1B3GA 2ESNA 3TCFA 5CMKA 5FHNA 3BBRA 1SD3A 4GWOA 1QW0A 2Z8DA 1N7XA 3KSXA 4OEUA 3T9HB 5AA4A 4KD5A 3FD3A 4NE4A 4DXBA 3QXMA 4OMBA 3M8UA 2B3FA 5CMMA 3RNNA 1KWHA 1MQIA 2REJA 4IO7A 5AA2A 3MZ9A 4JSOA 2F34A 3MZ1A 1Y3PA 2G93A 1USYH 1URSA 4MLQA 4U2RA 1POTA 1WDNA 4QFOA 2ZNSA 3SEVA 2WKYA 4Z0IA 1OLCA 3FXUA 1WVJA 4Q0CA 2ANJA 3VVFA 5ICQA 1HSLA 3MVZA 3V83A 3T22A 3PUYE 4N07A 2Y7WA 1N3WA 4FEBA 1POY1 4IO6A 4U22A 1QUJA 2OK2A 2RC9A 3H4ZA 3TTKA 1PB9A 2XD3A 3TTLA 3C34A 3LUYA 1H43A 4QHQA 2UVHA 3SERA 2Q2CA 1NNKA 2RCAA 1RYOA 4GLIA 3VDFA 3MPKA 3RTWB 3S2VA 4RJZA 5KCJB 3LSFB 3G7WA 5FTHA 1A8EA 4XXUA 1IXHA 4M1VA 3KSJA 1PC3A 3OO9A 1A99A 1I69A 3OO8A 3FV2A 1LGBC 3I5OA 1EZPA 2DWAA 3OSQA 1BKAA 3QK6A 3CRBA 2Y7RA 4POWA 3ONMA 5M2VA 4FIMA 4OFLA 5CBSA 1SW1A 3SESA 3IX1A 1FTKA 2XD2A 3W9WA 3EHUA 4XKPA 1Z7NE 3PMWA 1FTOA 1PB7A 4OESA 2ZNTA 2DS9A 4I8CA 5K2YA 1N84A 2XXTA 4F3SA 2D21A 1RYXA 3SEUA 4ISUA 3KG2A 3UA8A 3TELA 3TZAA 5A5XA 2Z8EA 4QFNA 4R9GA 3N26A 3V5AA 1OVBA 5DT6A 4RY1A 1VSOA 3MPLA 5AA2D 2UVIA 2XXXA 3W15C 3R26A 4DCYA 5CMCA 4XKRA 3M3FA 2RCBA 4RK2A 3T93B 3PU5A 2NXOA 1SI1A 5DVFA 1P1NA 4FORA 1B46A 4KYEA 1M5BA 5DYHA 2GFEA 3CR9A 3UP9A 4O3AA 4EQ7A 1YTVA 2IEEA 4UA8A 1MY1A 3L6GA 4ZEFA 4EXKA 2GHBA 3MBPA 5H8QA 5I59A 2DWHA 2HCAA 2FNCA 4MLVA 4F1VA 3FUZA 1M5DA 1QUIA 3ZKLA 3O97A 3VLUA 5H8NB 2NOOA 3CVGA 1AIVA 3KZGA 4BDMA 4FAJA 3CFZA 3FJ7A 3OD7A 2DVZA 1SW4A 2R9JA 4PETA 2GRVA 4ELOA 3CG3A 4F31B 3G3FA 3IOUA 3E3KA 4O3BA 4H8IA 3MQ9A 3KEIA 1LAHE 4MF3A 1H45A 2ONSA 4EQBA 3M3LA 2YPNA 4ESWA 3O28A 5AA3A 4JSDA 3IORA 2A5TB 2F7CA 3K4UA 4YKKA 2O69A 1QUKA 2PYYA 4KHZE 3PPNA 4THIA 1IZ1A 1SQYA 1Y1MA 2PMSA 4N13A 1TXFA 5EHSA 4X48A 1EU8A 3N94A 3PD8A 4GRKA 2ABHA 3QYTA 4R75A 4FECA 1AH5A 5TP9B 3I3VA 1B4ZA 1QKAA 1OLAA 3Q27A 1NFTA 2PX1A 4JDFA 2UXAA 5AA1A 4R74A 5TPAB 3GZGA 1SVXB 2AIXA 1B5JA 4K3FA 4XKQA 1MY3A 1ELJA 1FCKA 1QJMA 1UTBB 1SYHA 3O6HA 5JTYB 3FVKA 3HN0A 3LR1A 4ZE8A 3O2AA 3SEXA 1ZBMA 3HO7A 2H98A 3H7MA 4RPNA 3IO4A 5I56B 2GH9A 1EZ9A 3A3UA 2QMXA 5B70A 3FVOA 4C0RA 3C35A 4IO3A 3S9NC 1QKBA 1QVSA 4HCWA 3SKPA 1TFDA 2ZNUA 1WODA 3K6XA 1JEVA 4BDLA 4TOZA 2H9BA 4EQ9A 1ZIUA 5LOMA 4H65A 2OBGA 3EHTA 2O68A 1Q35A 3THIA 3MJNA 1MH4A 5KCJA 1O7TA 1OVTA 3VE1B 1Q1KA 3HV1A 3PD9A 3FXRA 3GXAA 1Y4TA 3ECRA 1YCJA 2PT1A 4N6PA 4I1DA 4P11A 3PPOA 2Q8JA 4LA9A 4ZEBA 3RT6B 3CG1A 2Q9TA 3UGWA 2O6AA 5H8HB 2HXWA 2REGA 1UTHA 3OO7A 3VLVA 2HZLA 2DOJA 3SETA 2V25A 3PUWE 4G2ZA 1N76A 4KFQA 3DELB 1LFIA 1H3DA 2R6GE 3K6WA 1P1WA 1B3FA 5TU0A 2OCUA 4NF8A 3BFTA 1P99A 4DLDA 3TTRA 1MRPA 4OETA 5I2KB 2R71A 2ZYMA 4IY5A 3O9PA 4KYSA 4I62A 3G3GA 1XC1A 4H0WA 4DIGA 1FQBA 3E4RA 2UVGA 2BJJX 2OJTA 3K0VA 3EHSA 4G8MA 3DP8A 2O1MA 5ELVA 4PFYA 3C33A 5J1DA 4R6YA 3RPWA 4ECFA 3PPPA 3OMBA 4DXUA 4YB6A 3U94A 3N6TA 3D4GA 1UQWA 1PEBA 1TWYA 2GHAA 3CIJA 4QSEA 1P1QA 3VVDA 3LSWA 3S4UA 2F7BA 1ZJLA 4NF5B 1M5CA 1ZU0A 3RY3A 1SDXA 2XX8A 4EDPA 1XVXA 5H8SA 2V3TA 4NEDA 4OYVA 2Y84A 4OERA 4ZZEA 5H8NA 3LBSA 4F3GA 2E0SA 4ELRA 4E0XA 2FA7A 4WEPA 1GV8A 2H5YA 3OOAA 3FV1A 3S9LC 1LBBA 2XXUA 2ZYNA 1FTMA 4NF6B 2Y7IA 1B5IA 2Y7KA 5ITPA 5I57B 2W7YA 3FVGA 4YU0A 2X7QA 1MM6A 2ZYOA 4YKPA 1A7LA 1MDQA 4IO5A 1MXXA 2I3WA 1LAFE 2I48A 1YPNA 3FJMA 3FGSA 3KJTA 1B58A 2DE4A 5I58B 2ZYKA 5CMBA 1RKMA 2RKMA 5F1QA 2Z23A 3KGCA 1MPCA 2F78A 1LAXA 1ATGA 2XXVA 1URDA 4X1DA 1IXCA 1LCTA 1VFEA 1N04A 2H4IA 2RC7A 5KDTB 3N6UA 1MQHA 3HSTA 1OIBA 2QS3A 2XX9A 4F1UA 1IXIA 2X7PA 4MH5A 3VFJA 1B7ZA 1MDP1 4EXLA 4QFLA 3HHGA 5TPAA 1N7WA 5L9MA 4KCCA 4R9FA 3TKDA 3AXFA 1UTBA 1MH3A 5JTYA 1BLFA 3Q26A 3K1NA 5BWJA 2PT2A 4H67A 3ILUB 4LZ5A 4FEDA 1B05A 3ILTB 1L5TA 2DXRA 2QS1A 1MXYA 1USYE 4U1ZA 4H6DA 4PFUA 1LCFA 1B1HA 3MW0A 3S9EA 2AYSA 4KCDA 2DYXA 2D5WA 3LSLA 3PUZE 3C9HA 3C32A 3IOWA 4GL0A 3PUVE 3CFXA 1JVXA 5ICTA 5F7VA 4F22A 1US5A 4ZE9A 4IO4A 4YAHX 3MUQA 2F6PA 4RK9A 1UIUA 2O7UA 4OZ9A 4G68B 4PP0A 3OENA 3RLFE 2VD3A 3V89B 4GL8A 4ELPA 2O7IA 2LAOA 5I2NB 4F39A 3KJ7A 3VV5A 4AQ4A 5CM6A 4PFWA 4JWXA 5KZTA 4IB2A 3TDJA 1R6ZA 4WXJA 1R1NA 3RTFB 2V84A 3EF7A 5BUUA 4F3BA 1S9TA 3T9VA 4R2FA 4ZECA 3MC2A 3MWBA 3EQ1A 2F97A 2HEUA 1URGA 3K01A 4ND9A 2HAVA 4L17A 1PDAA 1US4A 5I2KA 1MQDA 3KN8A 4DZ1A 4ESXA 3OXNA 2ZMBA 4LZ8A 1OQGA 2XX7A 4LP2B 2XHDA 3MP8A 1PB8A 3WAFA 4NMYA 2NWJA 1B52A 3T66A 2F6GA 5AA2B 2THIA 1UIVA 3IB1A 3OEMA 3LSXA 4TQUQ 3JV9A 3B6WA 4E0WA 5JEIA 1VFDA 5HPQA 4G77A 2F36A 3JZJA 3QUFA 1LAGE 1LFHA 4ZEDA 3T9UA 3UK4A 4JB7A 3G3KA 2HZKA 4NF4B 2I3VA 1I6QA 1PBPA 4ONYA 1MQGA 1MY0A 1FQCA 1BIYA 3KFMA 4NWDA 3M3KA 1NL5A 2QS2A 1ZLQA 2OWSA 4QFPA 2AL4A 4FE8A 3ZKKA 2Z22A 4UACA 1A8FA 4RYAA 3PGFA 3H06B 4EF1A 3H03A 3KOSA 4DCXA 4BDQA 3BFUA 3ZSFA 1MM7A 4PE5B 3A3CA 1QULA 2DVCA 3IL1B 5I84A 1SYIA 3FVNA 4NF6A 4YB7A 1LB9A 3H3GA 3B6TA 5AE4A 4YMBA 5I57A 3Q29A 2RINA 3CSGA 3T96B 3GLBA 2XXYA 1S7YA 4NTLA 5I58A 3E13X 1XS5A 1B0LA 4GIZA 4Z7EA 2VD2A 3EN3A 3GBAA 3JYRA 4TLMB 3E9XA 1D9VA 2UYFA 3O6IA 3QSLA 4NWCA 1JVYA 1B1XA 3KN7A 1IQ7A 4G68C 5KDTA 1VR5A 2QMWA 3TPAA 2HQ0A 5ITOA 3UN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U23A 3OSRA 4F18A 2F35A 2H25A 1HSEA 4OWDA 3DP4A 1Y4CA 2A5SA 2CZKA 4JBZA 3WAEA 1RDYA 3PPRA 4N17A 3CSBA 1LLSA 2FYIA 3VLWA 1SW5A 1SW2A 4OXVA 4MCOA 2NVUB 3VXBA 3TUSA 4IGTA 3G3JA 3FASA 2XXHA 4WEDA 4OFJA 2B4MA 5HBCA 4OVTA 1P1OA 2CMOA 4KPTA 1TT1A 3HPIA 3K6VA 4P0IA 4HS7A 4PE3A 1XHYA 3O6GA 1GR2A 1M5FA 5EYHA 3P7IA 5CC2A 1Y3NA 4KR5A 3RUMA 4NAPA 1YZ0A 1H44A 3TEPA 2F8DA 2DQVA 4GVOA 4ZDMA 4U4XA 4QFKA 1JNFA 4GF8A 3VXCA 3L6HA 2UVJA 4GOTA 3MVXA 1NI9A 1B32A 4XKNA 3FATA 1MS7A 5L8DA 2F5XA 2VHAA 3TFLA 5EQ9A 1DPEA 1XVYA 2DXYA 4OVQA 1DTZA 4RA1A 2I0BA 4R6KA 2QVUA 1AOVA 4HCYA 4LONB 1BP5A 5FHOA 2H99A 1B6HA 5B7DA 4G68A 1II5A 1FPKA 4BLAA 3RPLA 1TFAA 4X1BA 2PBWA 2PVUA 4U21A 3O29A 5I2NA 1ZMGA 1GVCA 2YJPA 2V4CA 3U1OA 4GD5A 3FJGA 1Y3QA 2Y7PA 2P3VA 1MXUA 1O63A 2HFBA 4PQJA 3TQLA 4F3PA 4ZS9A 4P9KA 3A09A 1BTJA 4RPOA 1N3XA 1NV1A 1EYKA 1MXZA 4NF0A 3MZBA 2Z8FA 2M8CA 4M4GA 4EUOA 4YB5A 1R9QA 1NH7A 4H8JA 2Q8MA 3G3IA 1K9YA 2QRYA 2D3IA 4QSDA 1NUWA 2YLNA 1FBCA 4F1YA 5CBRA 2DE2A 3SEYA 3KBRA 5H8FB 3USDA 4LVQA 3IK6B 2VGQA 3B8BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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