5FHMA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-(aminomethyl)benzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at resolution 1.55 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhmA02
2V3UA 3MVZA 5L9OA 2QMWA 5I58A 1UIUA 3G3JA 3KOTA 1ANFA 3GXAA 2PMSA 4YZZA 4QHQA 3SEUA 4TLLB 4EDPA 1UTBB 1QUIA 2Z23A 4RA1A 3MQ9A 1Z7NE 4GRKA 1XOCA 1IUDA 2QPQA 4LZ5A 3H06B 5H8FA 1H3DA 4U21A 3A3UA 2HCAA 3VE1B 1LLSA 5TPAB 4ZDMA 5DVIA 4JSDA 3FVOA 3IB1A 4NF4B 1H44A 3K1MA 2REGA 4QRZA 3E9XA 4LZ7A 3TYHA 4N07A 3PMWA 3DLNA 3SERA 1HSJA 1FQDA 1ZJLA 4RK9A 4QSEA 3S2VA 1FQEA 3FVKA 1IXGA 3A3CA 2R71A 4KI0E 4LP2B 1B40A 3G3IA 4RK2A 4RPOA 3FV1A 3TTLA 4IY5A 2DQVA 1NKXA 2DOJA 1FCKA 2HZLA 1MY0A 3HV1A 5K2YA 3K2DA 3PUZE 5L9MA 5F1QA 4ZEKA 4R6HA 3C35A 3ZSFA 4TQUQ 1ZMGA 3L6HA 5H8NB 2ZYOA 4AB5A 5KCJB 4R72A 2H4IA 5H8HB 3PUVE 1B52A 4QSDA 4X1BA 4G77A 1H43A 4GL8A 4F2OA 1XVXA 1JW4A 2F6GA 3FV2A 1MXUA 1SW2A 1MXWA 4BDOA 1AMFA 1MQIA 2KLFA 5I2KB 3VXBA 2O7UA 1DOTA 4P0GA 4MLVA 3IB0A 3BFUA 3OOAA 4DCYA 5DEXA 3ILTB 3LSFB 2XXRA 4F39A 3CFZA 1P1NA 2X26A 3IR1A 2E0SA 4QFPA 1LFHA 5ITOA 1MQGA 2QMXA 3E3KA 4NF5B 4WEDA 5KDTA 3IAZA 3PPQA 4NEDA 2R9JA 1M5FA 4EUOA 1SVXB 1MPBA 1P99A 4POXA 4NF6B 1UIVA 3QSLA 4FJPA 4F31B 5HBCA 3C32A 1MY4A 2Q2CA 2UVHA 3ECRA 4IO2A 2RKMA 2DE2A 3OEKA 1O7TA 5F7VA 4G4PA 3USDA 2I0CA 4U4XA 3U72A 5AA1A 2GFEA 3TAJA 4PETA 1SD3A 4UACA 3T93B 2O7IA 3SEVA 2REJA 3O97A 3VXCA 3U92A 5AA4A 1N7XA 1Y4TA 4NF8A 2F5XA 4N6PA 1SI0A 3MP6A 2UYEA 1XT8A 2FNCA 1YAEA 2Z22A 3IO6A 4H65A 5EHMA 4OVJA 3JZJA 1VFDA 1AOVA 3M3FA 2ZMBA 2A5TA 4PFWA 1MPCA 2ZXTA 3PD8A 1JVXA 1MH4A 1J1NA 3K01A 4EQBA 1A40A 4KD5A 3RLFE 3CR9A 3QK6A 4C1UA 4LUBA 3CG3A 5HPQA 1PEBA 1S7YA 3CSBA 4BLAA 3RNNA 3I6VA 1NH7A 1R9QA 1B05A 3DELB 4F1YA 2DXRA 3KBRA 4GXSB 2P1SA 5AA3A 3PGFA 1WVJA 4BDQA 3PUXE 2OWSA 3HO7A 2DE3A 3O2AA 4G68B 4GIZA 5EYFA 1FTKA 2XD3A 2QJEA 1NNKA 4ZZEA 5CBRA 1DPEA 1USYH 3E4RA 1EH3A 2FYIA 4DXCA 3TCHA 4YICA 1HSEA 3RT8A 4OFLA 2I6EA 5JEIA 5CBSA 1B6HA 2H9BA 2Q8JA 3N26A 4Q8RA 4YKPA 2P0SA 1B7ZA 1JEUA 3SESA 2GHBA 2VHAA 4JXIA 4M4GA 1MG1A 3TTKA 5L9SA 3LC8A 4H6DA 1Y3PA 3EPEA 2Y84A 2DS9A 4PFYA 1B3GA 3ZKLA 1H76A 2P2AA 5CC2A 1MY2A 4IGTA 4IO4A 1A55A 1SBPA 2VD3A 1NMUA 5IKBA 3H4ZA 4G2ZA 4H0WA 1ZTYA 1MXYA 3EN3A 1JW1A 2Y7IA 1N3XA 1UQWA 5I56B 1Y20A 1I69A 5A5XB 1ZLQA 2RC9A 2ALUA 1M5CA 3EF7A 5TP9A 2Q2AA 1BLFA 5IAIA 1KWHA 5JK4A 1NNPA 1MXXA 3V5AA 3PMVA 1B3HA 5CI5A 4MLQA 4E0XA 1QJMA 2OK2A 3RTFB 4F3BA 2ZYKA 1DMBA 1EZ9A 1LAHE 3U1OA 2D3IA 2DWIA 4JWYA 4G68C 1IZ1A 3SEXA 2XXXA 5H8QB 2OWTA 3P7IA 1MM7A 2UVIA 3S4UA 1EZOA 2O1LA 4KPTA 1R9LA 3TODA 3WAFA 1US5A 1I6BA 4ND9A 2DYXA 4U22A 1VSOA 3BKIB 3UN6A 4DIGA 3FJ7A 4OFJA 2ONKE 2F97A 4F19A 2YJPA 4XKRA 1B0LA 2Y7WA 3KGCA 3VLWA 1PBPA 4WXJA 5DTBA 5BUUA 5I2NB 3S9EA 1GGGA 3FVNA 1M5BA 4HCYA 1M5DA 1MXZA 4JSOA 4BDRA 3TPAA 2ONSA 4U4SA 3ZS6A 4WEPA 3UIFA 2V3QA 1RYXA 1JVYA 1OLCA 2B3FA 1ZKBA 4FATA 4ESXA 3S9LC 1UTBA 3MPLA 3O28A 4F18A 4GL0A 1QW0A 1A99A 3K6XA 3MP1A 3GZGA 3TQWA 4O3AA 1PC3A 4PFUA 3PUYE 1RYOA 1OQHA 4RNSA 1Y9UA 1SYIA 2IA4A 5FTHA 1XHYA 3HHGA 3SEYA 4NTLA 1AL3A 3CFLA 5TPAA 4BDLA 2ABHA 1B2HA 3OO9A 1I6AA 5M2VA 1XVYA 4LATA 1CE2A 3DM0A 3CFXA 4R6YA 4NF4A 1B4HA 3ZKKA 4GVOA 2V3TA 3T66A 4IB2A 3I3VA 3GLBA 3MW0A 5DVFA 3AXFA 1N76A 1Q1KA 3CI8A 3N5LA 3TZAA 2XHDA 3MP8A 4XKQA 3Q28A 4GXAA 4GLIA 1D9VA 3O29A 2IEEA 5I84A 5I59B 2Y7RA 2VP1A 3IL1B 4OESA 2HQ0A 4R9GA 2VD2A 4YB5A 1ZU0A 3B6TA 3U93A 4I8CA 4HS7A 2ONRA 3ONMA 2THIA 3RGYA 2QL3A 4F3GA 3FJGA 4RJZA 1HSLA 5H8NA 1YTVA 3HCQA 1B3LA 4GFRA 4C0RA 3VVFA 1A7LA 1FQCA 5KCJA 4O3BA 1OIBA 3K6UA 1VR5A 4P11A 1MM6A 5H8HA 3FJMA 1B3EA 3K0VA 3LSWA 3G3KA 1WDNA 2F36A 4YMAA 2UVJA 3H6WA 2F8DA 5AE4A 4LONB 2ESNA 3OD7A 4XXUA 5BWJA 4I9DA 1GVCA 3GBAA 5I57B 5ELVA 3MUQA 2W7YA 1VE4A 5I2KA 3T9VA 2M8CA 1B58A 2OBGA 4R2BA 5DYHA 3T9XB 1N04A 1FTJA 2I48A 1FQFA 3MZBA 1Q35A 2V25A 1ZIUA 4EXKA 3KN3A 4ZEDA 3OMBA 1XS5A 3EHTA 4IO7A 4LVQA 4IY6A 4YKIA 3L6GA 3KEIA 4OETA 2F78A 4F22A 4JWOA 3WAEA 2I3VA 2PT2A 3QUFA 2RCAA 4XKNA 4RXLA 2ZNSA 4NF6A 1TFAA 3G7WA 3FZVA 1DSNA 1MXVA 4MFIA 2DWHA 3OSRA 3TTRA 1OQGA 1TFDA 3U8QA 4QF9A 4ZS9A 4ZEBA 3FATA 3H6TA 5CMMA 1B5JA 3KN8A 2Y7PA 2H5YA 1QULA 4KHZE 4R6KA 4OHNA 2QSXA 3QUJA 3VLVA 1SDXA 4KCDA 4R9FA 4GF8A 4X48A 3OXNA 4MF3A 2HZKA 1TWYA 3TCFA 5CRYA 4U2RA 1YCJA 5CMCA 4ZE8A 5KZTA 2Z8EA 4RYAA 4F1VA 4IO3A 3C4MA 2LAOA 1Z7ME 1P1UA 5FHOA 3N6TA 2PT1A 1BTJA 1MQJA 2DVZA 3ILUB 4Q0CA 3W9WA 3H6VA 2WKYA 1S50A 5JTYA 5AA2B 1DPPA 1H45A 4OWDA 4OXVA 1SYHA 2QS3A 4ZECA 3K1PA 2Q89A 2G93A 5CMKA 2RCBA 4G68A 4HCWA 3MJNA 4IO6A 4R73A 3RT6B 2O51A 3CIJA 3TFLA 4U1ZA 3O6HA 3KJTA 4YAHX 4E0WA 2AL5A 4R2FA 1O64A 3B6QA 1LFIA 3EHSA 5HM4B 3BFTA 2I49A 1PB9A 3MVXA 4KFQA 2XXPA 3TMGA 3OSQA 1M5EA 1URSA 4LQ5A 4MH5A 4EF2A 4XTCQ 3IJOB 1BIYA 3OO7A 3B6WA 1Y1MA 3C9HA 4DDDA 2F7CA 1OLAA 2DE4A 1QKBA 4YKJA 4KQPA 3M8UA 2G29A 1LBCA 4U1OA 4ZE9A 4F2QA 5FHNA 3G3FA 2RC7A 2R6GE 1ZBMA 3O6IA 1QUKA 1CB6A 1AIVA 2I58A 5ISUA 3R7XA 1B7HA 1ATGA 1NNTA 3RPWA 1FQAA 4WKMA 4GWOA 3Q29A 3C34A 2AL4A 2DVCA 3EQ1A 1UTHB 1NNFA 1IIWA 2NOOA 2OLBA 2FA7A 4Z0IA 3PD9A 3BBRA 3LR1A 3QIMA 4KYSA 5I56A 5ICTA 1N0TA 1N7WA 4FORA 3H3GA 5A5XA 3T96B 1MQHA 4RPNA 2Z8FA 4OEVA 3DP4A 4Q5TA 2O84X 1SW4A 4HW8A 1FTLA 3IB2A 1FTMA 2X7PA 4G8HA 3H7MA 3B7DA 1B4ZA 4BDNA 3S9NC 2GRVA 3O6GA 3OO6A 3FVGA 4P0IA 3IJXB 1JETA 3KFMA 3LUYA 1MRPA 3FXUA 4OYVA 4KR5A 1US4A 2CMOA 4RY1A 4F3PA 1EU8A 4ELQA 1MPDA 2HAUA 4PE5B 4F29A 3C33A 4NWDA 5K2XA 1IQ7A 1YPNA 3UK4A 1IEJA 1B5HA 4IO5A 2O1MA 1GR2A 1OMPA 2H25A 4JB7A 3TQLA 3VVDA 3H6UA 1MS7A 3RUMA 3D4CA 2F7AA 5H8SA 3MVYA 5FTIA 1PB8A 5I58B 4GQOA 1D9YA 2H99A 2QRYA 1FQBA 3RQTA 5L8DA 2XXWA 1F9BA 3G3GA 3KSJA 4EQ7A 2AIXA 2Y7KA 3U94A 4H1XA 1LAFE 4JDFA 4THIA 2XX7A 1P1QA 5I2NA 1XC1A 1B1XA 3Q25A 4G8MA 1R1NA 3TCGA 1LGBC 5B7DA 4ELRA 2YLNA 1D3KA 2F7BA 4F1UA 3TELA 3SDFA 3I5OA 3A09A 3SEWA 1MDP1 3PUWE 4YB7A 5CMBA 2DSFA 2ZNUA 5H8FB 1FTOA 3THIA 3PV0E 1Y1ZA 1PBQA 3PMXA 1JEVA 1FW0A 2DWJA 3KN7A 4H5FA 3O66A 3C31A 1JNFA 1OVTA 3F11A 1IXIA 2XX8A 4FEBA 1IXHA 2V84A 1LB8A 4OTEA 3JV9A 3O9PA 2DP8A 2HEUA 3FGSA 4EF1A 1Y4CA 4R75A 4QSCA 1S9TA 2CZLA 3MPKA 4R74A 4QFOA 1B9JA 3K6VA 4DZ1A 1SW1A 1BP5A 2XXHA 4Q30B 1B7UA 1MDQA 1OVBA 3MZ1A 4OENA 3UORA 3TDJA 2RC8A 2ZYMA 1GTKA 1LCFA 3V8XB 4OFOA 3FD3A 1USYE 1EZPA 3JYRA 4PQJA 3PPOA 5I59A 3DP6A 3TTNA 3GBBA 4AB6A 4YB6A 4OZ9A 4K3FA 3VDFA 2ZYNA 3IO4A 2XXQA 1POTA 1JQFA 3M3LA 3K00A 3LBSA 3VV5A 4G8NA 5AA2D 3FXQA 3IOUA 4GD5A 4F3SA 3T9UA 1TXFA 2D21A 3SKPA 4TOZA 1SW5A 4ISUA 3PPNA 4EXLA 1P1OA 1LAGE 3OELA 1D4NA 1TT1A 1LB9A 1RKMA 3IOTA 3PU5A 5DEXB 2Q9TA 3IK6B 3MWBA 2YPNA 2ZNTA 3TKDA 2HAVA 1QUJA 4O3CA 1B32A 2D5WA 3MBPA 3IOVA 1B1HA 1AH5A 4FECA 1VFEA 5I57A 4M1VA 4NWCA 2XXYA 2X7QA 5KDTB 3E13X 3V89B 5J1DA 5ITPA 4DXBA 4U23A 4QFKA 3UGWA 3CVGA 4FAJA 4NF5A 4AQ4A 2F6PA 3TTMA 1MH3A 2ANJA 5LOMA 2PYYA 1LCTA 1ELJA 2BJJX 4LQ2A 1JW5A 3PPRA 3RY3A 1B3FA 5AA4B 4NF8B 4C1TA 3TEPA 1URDA 3M3KA 3T9HB 2XXUA 2NUVA 3FASA 3K02A 1LFGA 3V83A 3PPPA 1N84A 2A5TB 2O69A 2I4BA 4ONYA 1MY1A 3OENA 1O63A 3MZ9A 2UVGA 4QFNA 2HXWA 3KOSA 3D4GA 3HN0A 3ODBA 4IGRA 5DVJA 3IX1A 3CG1A 4LA9A 1L5TA 4DE8A 4X1DA 3UP9A 2GH9A 3OO8A 2Q88A 5ICQA 3RN8A 2B3BA 3MC2A 1A8EA 1PDAA 2VOZA 1LSTA 3K4UA 1N3WA 1LBBA 5JTYB 3QYTA 3K6WA 3KG2A 1Y3QA 1DTGA 4H67A 1QVSA 3Q27A 5AA2A 4JBZA 1B46A 1POY1 2NXOA 4PFTA 5B70A 4YU0A 3TUSA 2B65A 2HFBA 4H5GA 2E1SA 4DXUA 1B0HA 4KYEA 4I1DA 3EHUA 4YMBA 1II5A 3R6UA 2OJTA 1IXCA 1QKAA 1MY3A 3N94A 2O6AA 2QS2A 3N6UA 4ZEIA 1IITA 4ELOA 4QFLA 5CM6A 3RTWB 1P1WA 3LSLA 1B51A 4L17A 3IOWA 2VGQA 3VFJA 4XKPA 2XX9A 4ESWA 4DLDA 4ELPA 3CSGA 1URGA 4NMYA 4GOTA 4H8JA 3KZGA 5DT6A 2RINA 3VLUA 4ZZAA 1PB7A 3KSXA 3FUZA 3K1NA 2Z8DA 3FXRA 4X9TA 3UA8A 4ZEFA 4KYDA 3S9MC 4MBPA 2NVUB 4PP0A 2GHAA 4OMBA 2UYFA 2UXAA 5EHSA 2OCUA 4XIGQ 4I62A 2I4CA 2DWAA 5TP9B 1NFTA 4ECFA 3QXMA 1UTHA 3OEMA 2AYSA 3R26A 1B5IA 4TLMB 1LAXA 3C36A 3SETA 2I0BA 4YKKA 4FE8A 2O68A 2A5SA 1NH8A 1MQDA 4OQOA 2I3WA 4OERA 3G3HA 2F34A 4FIMA 2QS4A 1WODA 1GV8A 2XD2A 2F35A 1A8FA 2XXVA 1I6QA 3DP8A 4KCCA 3FIRA 3T22A 3CRBA 4JWXA 2XXIA 4OEUA 1T0KA 3IORA 4LZ8A 3QAXA 1Y3NA 1R6ZA 3MVWA 3W15C 2XXTA 4EQ9A 4Z7EA 3HPIA 1SI1A 3HSTA 2V93A 2PVUA 2NWJA 1BKAA 5H8QA 2DXYA 3KJ7A 4FEDA 5TU0A 4H8IA 3MAMA 3LSXA 3W9VA 2QS1A 4HTGA 3Q26A 1A54A 4POWA 2OZZA 4UA8A 4N13A 1NL5A 3H03A 1SQYA 5FHMA 3HHFA 1DTZA 3VVEA 4NE4A 4BDMA 2H98A 2RF1A 4DCXA 2PX1A 2PBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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