5FHOA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-chlorobenzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at 2.3 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
254
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 254
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhoA02
3HHGA 4OFOA 2E1SA 4YB5A 5I58A 1ANFA 2DE3A 2XXUA 3WAEA 4BDOA 2XXIA 4N6PA 1I6QA 1O64A 1UTHB 1NNTA 2D21A 3SEXA 5I84A 1SW2A 4KYDA 3QYTA 4KCCA 1B6HA 1IIWA 5CC2A 4I9DA 4GWOA 1VFEA 2X7QA 3MBPA 4U22A 1FW0A 1GV8A 4LONB 5ITOA 1T0KA 4F2QA 4ZS9A 1VR5A 2OCUA 2ONKE 4G2ZA 3LSWA 3R26A 2NVUB 4OMBA 1P1QA 1DMBA 4F1UA 4QF9A 3U92A 4ZEKA 1VSOA 5K2XA 1USYE 3RN8A 4Q8RA 3HN0A 2Z8EA 3C31A 4KR5A 4POXA 1XOCA 2H99A 2ABHA 4LQ5A 4UA8A 1FTJA 4K3FA 5FHOA 1VE4A 4RK9A 1UIUA 1DPEA 1NH7A 1FQFA 4H8IA 4MLVA 4YKJA 2XXXA 3O6IA 4G68B 3SERA 3TDJA 4G68A 3HPIA 2P2AA 3M3LA 3CRBA 3N94A 1O63A 5DYHA 3OO8A 3SETA 1ZLQA 4GVOA 1ZKBA 5JEIA 1P99A 1Y1ZA 3MJNA 3PUVE 1A55A 1DTGA 1P1OA 2V25A 3GBBA 5I56B 3PD9A 5I56A 3VFJA 2ZNTA 2DOJA 5H8SA 4H8JA 2QS3A 3S9EA 2Q88A 1B51A 3PD8A 1M5CA 3FVGA 3OEKA 1LB8A 1B0HA 1D3KA 1QUIA 3K6UA 5ELVA 3QAXA 1MY3A 5JK4A 4NMYA 1D4NA 2QRYA 1WVJA 3QUFA 2Z22A 2OWTA 3O6HA 3VVEA 4XTCQ 4KCDA 1AH5A 4TLLB 3TZAA 1KWHA 3E4RA 2F34A 1JVXA 5LOMA 1XVXA 1TFDA 3EHUA 3MP1A 4PFTA 1BIYA 3FZVA 2H9BA 4RPOA 4XKRA 1ZTYA 3RTWB 1QJMA 4YICA 3TTLA 3V89B 3DP8A 2CMOA 3EPEA 5FTHA 4JXIA 3UGWA 5IAIA 1FQCA 2E0SA 4GL8A 1S50A 3OEMA 3H6TA 4MFIA 4BDQA 2UVJA 3MP6A 4JB7A 3ILUB 4GQOA 4DZ1A 4OETA 4EQ9A 3I5OA 1IXCA 1R9QA 2QS4A 2O68A 4GD5A 4YKKA 3QUJA 1Y3PA 1II5A 3E3KA 4FATA 3PUYE 3SDFA 4OESA 3G3FA 1Y3NA 3TODA 3C4MA 3WAFA 1SW4A 4OYVA 2HFBA 4THIA 3T93B 5DT6A 4JWYA 1Y20A 2F7BA 1CB6A 3IK6B 4IO7A 3SEUA 5TPAB 2Y7IA 2PT2A 4FJPA 3SKPA 1BP5A 3HO7A 3TQLA 4ZEDA 4GFRA 5TPAA 1A54A 3T66A 1N3XA 4FEBA 1IXGA 1ELJA 4ZE8A 3KEIA 2A5TB 1SQYA 3CVGA 5BWJA 3TKDA 4ZEFA 1URGA 4XXUA 3FASA 2A5TA 3SEVA 1LLSA 2QPQA 2ZNUA 5HM4B 3G3IA 4GLIA 5KCJA 3H7MA 4IO5A 4G77A 4F3BA 4F19A 3T9UA 3TTKA 1TFAA 3FVOA 1DOTA 1OLCA 4KHZE 1PDAA 2UYEA 1Y4TA 4U4XA 5L9SA 1QUJA 3Q29A 4H5GA 1HSJA 2RC8A 3F11A 1H45A 2HXWA 2R71A 4X1DA 1JW4A 4WEPA 1UQWA 1S7YA 1B7UA 3N6TA 4ND9A 3RGYA 3V5AA 4C0RA 1EU8A 2ANJA 4GIZA 4YZZA 3CSGA 3H6VA 1ATGA 1EZPA 1MXZA 2CZLA 1B1XA 3D4GA 3IAZA 4ECFA 4OQOA 3IL1B 3UK4A 3H4ZA 5ISUA 2REJA 2DS9A 1P1WA 5KDTB 4BLAA 2VGQA 2THIA 4X48A 4R6KA 1MPCA 5KDTA 4PETA 3IJXB 4U2RA 3U8QA 3TTNA 4I8CA 4Q0CA 2P1SA 3KN7A 4QRZA 1PEBA 4EUOA 3SESA 4G8NA 1RYOA 3H6WA 2LAOA 1B7ZA 2G29A 3N26A 3HCQA 3EQ1A 2O1MA 3K01A 3PMXA 4AB6A 3RUMA 3SEYA 2PT1A 4HCWA 3QXMA 4XIGQ 5DTBA 1US4A 3TAJA 2Q2CA 4O3AA 3VE1B 2M8CA 1LBBA 1PBQA 3KGCA 1PB7A 4R9GA 1B0LA 4ESXA 4X1BA 4FE8A 4NTLA 4R6YA 1LGBC 1URDA 2OJTA 3FJMA 4NF5B 2Y7KA 1NKXA 1A40A 1Y1MA 1FTOA 4NF5A 4MF3A 4PFUA 2PYYA 4U1OA 1URSA 3THIA 4LQ2A 2IA4A 2UVHA 3FD3A 5CBRA 4F31B 5M2VA 5FHNA 3IX1A 4O3BA 4I62A 3VDFA 2R6GE 1MPDA 2DSFA 1GVCA 2QJEA 1MXYA 4YAHX 4LUBA 4DCYA 4BDMA 1MXVA 2NUVA 4RK2A 3R7XA 3T9VA 3C35A 1MH3A 2REGA 3S9MC 5I58B 3W9WA 2DVZA 3ZKKA 4X9TA 3EN3A 2QS2A 4H0WA 4R2BA 2ZYOA 3FIRA 4G8HA 3G3HA 2AYSA 1LBCA 5CBSA 1Q1KA 1Q35A 3MZBA 2WKYA 4OEVA 3OO7A 4NWDA 4U4SA 2V3UA 4LZ8A 4E0XA 3U72A 4GL0A 2ZXTA 2F7CA 3IB2A 2PBWA 5I57A 4LA9A 1MQIA 4WKMA 1B1HA 3KBRA 3V83A 3K1PA 2O51A 3KN8A 4JWOA 5CMKA 1YPNA 3O6GA 2D3IA 2I0BA 5K2YA 1FQEA 5I2NB 3N5LA 2XXWA 3T96B 3O2AA 1R9LA 4FEDA 5I2NA 3B6TA 3B6QA 1ZMGA 3H6UA 5J1DA 4BDNA 5B7DA 1LAGE 1MXWA 3PGFA 3EF7A 1YTVA 1H76A 1LSTA 3K6XA 4ZE9A 1MDQA 2DQVA 4IO3A 4RNSA 3TEPA 2HAVA 2HZKA 4LZ7A 1MXUA 3EHTA 2FYIA 2QL3A 4E0WA 3IO6A 3FV1A 1RKMA 4ESWA 2XX9A 4R73A 4Z0IA 4IO4A 4IGRA 4R6HA 1XS5A 3FGSA 4IY6A 2I3WA 2B3FA 1UIVA 2NOOA 3OXNA 3Q28A 4RYAA 2RCBA 1FTMA 4PP0A 3LBSA 3QK6A 4ZZEA 5L8DA 1QULA 3O97A 4DCXA 3CG1A 3TMGA 4WXJA 4MLQA 4EQBA 3E9XA 2DVCA 3S2VA 5H8FA 3OSQA 3VLUA 2O6AA 3LUYA 1MQDA 2XXQA 2XXYA 3DP4A 1PC3A 2DWAA 2OLBA 3CFZA 3VVDA 3PPQA 5IKBA 3TFLA 4IO6A 3TPAA 3TCGA 3CR9A 2F78A 3LR1A 2Y84A 4YKIA 3KJTA 5CRYA 3U1OA 4F3SA 2HAUA 2Q8JA 1OMPA 4Q5TA 4DIGA 3RQTA 2A5SA 2QMWA 5AA1A 1AOVA 2Y7RA 4PFYA 1LCTA 1BLFA 4DXBA 2V3QA 4HS7A 2H5YA 5EYFA 1GR2A 1NNFA 3RTFB 3OMBA 1MRPA 3ZSFA 3Q26A 4U1ZA 3LSXA 4TQUQ 3OELA 1JNFA 3MW0A 1CE2A 4U23A 4MH5A 4EF1A 2O7UA 3W9VA 1N7XA 4G8MA 3H3GA 4YMBA 1GTKA 3L6HA 4OENA 2R9JA 4OZ9A 1JW1A 1A99A 1Y3QA 4QSDA 1SBPA 1A8EA 1POTA 3ECRA 2Q9TA 3PUWE 2UYFA 3FVNA 1YCJA 4KD5A 5CI5A 1I69A 1IEJA 3VXBA 4F2OA 3L6GA 4R9FA 2GHBA 3TTRA 3UN6A 5H8QA 4F3GA 3PPOA 2Y7WA 3Q25A 1LAFE 3CFXA 4NF4B 1Z7NE 5JTYA 2F8DA 5F7VA 3OOAA 4NF4A 5KCJB 3KJ7A 1YAEA 2DP8A 1PB9A 4H6DA 4WEDA 4RA1A 2Q89A 1EZ9A 4JSOA 2XHDA 4HCYA 4POWA 1N7WA 1O7TA 4QSCA 1OVTA 3DELB 1IITA 1GGGA 1JVYA 2O84X 3P7IA 3O66A 4BDRA 3PU5A 4KFQA 1NMUA 4O3CA 1D9YA 3T9HB 1DPPA 3HHFA 4H65A 4HTGA 3VVFA 2ESNA 1SW1A 3RY3A 1OLAA 3GZGA 3FXQA 4EXLA 4FIMA 3S4UA 1LFGA 2XXRA 4EDPA 2DWJA 1JQFA 1N76A 4OFJA 2ONRA 3O29A 2ALUA 3ODBA 1MM7A 2IEEA 2X7PA 3RPWA 3ONMA 1MXXA 4H1XA 1RYXA 4ZEBA 1B5IA 2ZYKA 3C32A 3MP8A 5HPQA 4L17A 2XD3A 1JETA 5A5XA 3PUZE 2AL5A 3JV9A 2H4IA 1FQAA 1BKAA 4EXKA 3T22A 3MVYA 1B3EA 2DXRA 4ELPA 2ZNSA 3U94A 1POY1 4JWXA 5AA3A 3MZ1A 4F18A 3IOWA 4KI0E 3H06B 3TQWA 2YPNA 2YLNA 2UVIA 4NWCA 2ZYMA 5DVJA 1B3LA 3IOUA 1AL3A 1MM6A 4Z7EA 5CMCA 4FAJA 5L9MA 1SD3A 3IOVA 3D4CA 5F1QA 3DLNA 5KZTA 5DVIA 2O1LA 2NXOA 4LZ5A 2XXTA 4DE8A 2F7AA 2UXAA 2RCAA 2Z23A 3IB0A 2VD3A 4YB7A 3BKIB 1ZIUA 5I59A 1S9TA 4RJZA 1OVBA 2OK2A 4RPNA 2I4BA 4JDFA 4JBZA 3G3JA 4F3PA 1IQ7A 4ELRA 5ICQA 1OQGA 4QFKA 1XC1A 1AMFA 2VHAA 4BDLA 3FJ7A 2H98A 4M4GA 1A7LA 4YKPA 3N6UA 1B40A 4OEUA 4EQ7A 1F9BA 3PUXE 3I6VA 3W15C 1R6ZA 4ZDMA 2Y7PA 1XT8A 3MVWA 4P11A 1FTLA 2HEUA 3KSJA 3LC8A 1AIVA 2I49A 3B6WA 1B32A 3M8UA 2DE2A 5AA2D 1DTZA 2H25A 4QFNA 3MAMA 2F36A 4F1VA 1B7HA 3IR1A 1LAXA 3KOSA 1TT1A 1LCFA 1Y9UA 3KZGA 3I3VA 4I1DA 3EHSA 4YU0A 4AB5A 2RKMA 3VXCA 5EHMA 3OO9A 1PB8A 5I57B 1UTHA 1XHYA 3KFMA 3IOTA 3FATA 3A09A 1TXFA 4F39A 5BUUA 3USDA 1FQDA 5DVFA 2ONSA 5TU0A 4G4PA 4KYEA 1NH8A 3KN3A 4DXCA 1JEUA 2V3TA 3GXAA 1MQGA 2F6PA 1TWYA 2O69A 3AXFA 3VV5A 4OWDA 2F5XA 1USYH 4NEDA 3TCFA 3TYHA 4H67A 5DEXB 2AIXA 1B3HA 1B58A 5DEXA 3CG3A 3TTMA 2OWSA 4ZZAA 3KG2A 1MQHA 4OFLA 2D5WA 1H44A 2X26A 4GRKA 5ITPA 4NF8B 5L9OA 1XVYA 2QSXA 3FXUA 4DXUA 2Q2AA 1PBPA 4NF8A 3SEWA 3K00A 4GXAA 4QFPA 4DDDA 1IXIA 2GHAA 3LSLA 3UA8A 1QUKA 2I6EA 1P1NA 5TP9B 1WODA 4OERA 3U93A 2Z8FA 5TP9A 1M5EA 2B3BA 3RLFE 2XX8A 2F6GA 1B05A 1OQHA 2FNCA 2HQ0A 1M5FA 3FVKA 3MVXA 2GH9A 3O28A 1B5JA 3FXRA 2AL4A 5H8FB 3RT8A 2G93A 4LP2B 4KQPA 4XKNA 3KSXA 3MVZA 3C9HA 2W7YA 3O9PA 1HSEA 4GF8A 4PFWA 1NFTA 2QS1A 4ELOA 1NL5A 2UVGA 1LFHA 1LB9A 4R72A 3DP6A 1B2HA 2I58A 1QW0A 4F1YA 2OZZA 1A8FA 3RNNA 1VFDA 4C1UA 4XKQA 2HCAA 4EF2A 4YMAA 3MZ9A 3UP9A 1FQBA 1MPBA 3S9NC 1I6AA 2RF1A 4FORA 3T9XB 3B7DA 2RC7A 1US5A 3ZS6A 4NF6B 3K6WA 4NF6A 4ISUA 4F29A 4GOTA 4NE4A 3OO6A 2DYXA 2QMXA 4U21A 5ICTA 5H8NB 4IO2A 2XX7A 1D9VA 2Z8DA 1I6BA 1SDXA 3TUSA 2VOZA 1FCKA 5H8NA 2B65A 3QSLA 3H03A 5H8HB 2XXHA 1MG1A 5H8HA 4IGTA 4P0GA 3UORA 4OTEA 4KPTA 4LATA 4M1VA 1N84A 1B9JA 3FV2A 3JYRA 2VP1A 2HZLA 3GBAA 1NNKA 5AA4B 2DWHA 1EH3A 3FJGA 3PPNA 2ZYNA 5AA4A 3FUZA 5H8QB 4KYSA 4HW8A 3ILTB 2I48A 3BFTA 3MPKA 3RT6B 1B4ZA 4XKPA 5JTYB 4N07A 1BTJA 3MPLA 5CMMA 4QSEA 2DE4A 1N3WA 1N04A 3IB1A 2XXPA 1MY4A 4OVJA 1B46A 3KOTA 4AQ4A 4JSDA 4Q30B 1N0TA 1ZJLA 3VLWA 4ELQA 1SW5A 5B70A 4ZEIA 2YJPA 3DM0A 3S9LC 3G7WA 2F35A 2V84A 2V93A 3MWBA 4H5FA 2GFEA 2FA7A 1ZU0A 1ZBMA 3MC2A 3VLVA 3A3UA 3GLBA 4QFOA 1UTBB 1QKAA 2KLFA 1SVXB 4P0IA 2OBGA 4TOZA 1B3GA 1UTBA 3ZKLA 3OENA 2NWJA 4G68C 2RC9A 3E13X 2PX1A 3PMVA 4ZECA 1R1NA 2BJJX 3R6UA 3PV0E 3Q27A 2RINA 3K2DA 3PPRA 1H3DA 1NNPA 5HBCA 1EZOA 3K1NA 4DLDA 2DWIA 2XD2A 4FECA 5FTIA 1QVSA 5A5XB 1MQJA 2ZMBA 4OHNA 2I0CA 3K4UA 1LAHE 1SYIA 4QHQA 4MBPA 4IY5A 1IZ1A 4YB6A 1M5DA 5CM6A 1SYHA 3JZJA 3K0VA 1MDP1 3CI8A 4PE5B 2GRVA 1SI1A 3CSBA 1Z7ME 1MY0A 3G3GA 4R75A 1MS7A 3CFLA 1HSLA 3M3FA 4UACA 3K6VA 1IUDA 3QIMA 1B3FA 2PVUA 3C34A 1SI0A 4RY1A 3IO4A 1WDNA 2F97A 1B5HA 3OSRA 3PMWA 2VD2A 4QFLA 1P1UA 3MUQA 4RXLA 1MY1A 1B4HA 1LFIA 1L5TA 2XXVA 5I59B 3HSTA 5I2KB 3TELA 2DXYA 3BFUA 3TCHA 3IORA 3UIFA 1MH4A 4R2FA 1QKBA 4PQJA 5I2KA 3IJOB 3G3KA 4OXVA 3HV1A 3V8XB 1B52A 5AE4A 1IXHA 1M5BA 1JW5A 3M3KA 1JEVA 1OIBA 2P0SA 2I4CA 1J1NA 4F22A 5AA2B 3CIJA 5FHMA 5AA2A 2PMSA 2I3VA 4LVQA 3C36A 1FTKA 3C33A 4R74A 3K1MA 4TLMB 3LSFB 2O7IA 3PPPA 4GXSB 4N13A 1Y4CA 3K02A 5EHSA 4ONYA 4IB2A 4C1TA 5CMBA 1H43A 3A3CA 3BBRA 1DSNA 3OD7A 3MQ9A 1MY2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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