5H8FA

Structure of the apo human glun1/glun2a lbd
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
274
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 274
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA02
4GL0A 4OQOA 2XXQA 4LZ7A 4HS7A 4R6HA 1ANFA 2UVGA 1EH3A 2XX9A 4IY5A 1MPCA 1Y3NA 1UTBB 4KQPA 4U1ZA 1PEBA 3N6UA 3RNNA 1LAXA 4JBZA 3K1MA 1TFDA 4JSOA 1GGGA 4WEDA 2Y84A 1B5IA 3T22A 5DVJA 2A5TB 3UGWA 1YAEA 2B3BA 3WAFA 1US5A 1UTHB 3ZKKA 2THIA 3MWBA 1D3KA 2DVZA 2F5XA 2Z8FA 3L6GA 2XXTA 3VLWA 4Q8RA 1WVJA 1B0LA 2IA4A 4OERA 4EQ9A 3BKIB 3G3HA 4HTGA 3OO9A 1S7YA 3TTKA 3U92A 2VD2A 1MM7A 1PBPA 5I58B 4DE8A 4JWYA 3VDFA 5J1DA 5I57A 1RKMA 2I58A 4GWOA 4ELOA 3PV0E 3RGYA 1P1UA 3TEPA 3N5LA 3OELA 4OZ9A 2VOZA 4YZZA 2DE3A 1SW2A 1XHYA 2Z8EA 3OXNA 1SI0A 1OVBA 2X26A 2AL4A 3CSGA 3TUSA 1D9YA 1IZ1A 1M5EA 3LC8A 3MJNA 3S4UA 4LZ8A 2P0SA 4JB7A 3MZ1A 1N04A 2V3TA 2FA7A 2HFBA 3RT8A 5I2KA 2X7QA 1P1NA 2E0SA 2DS9A 5AA4A 4BDLA 4G77A 1H43A 1PB7A 4E0XA 5TP9B 3IR1A 3MPLA 2VGQA 3HPIA 2Y7IA 4NF5B 4OXVA 3U72A 3KN3A 3M8UA 2XXUA 2RCBA 4ISUA 2ZYNA 4U22A 1VSOA 1B7ZA 1R9QA 3K6VA 4IO5A 4LZ5A 1P1OA 5KCJA 1LAHE 4QSDA 3VE1B 4DLDA 4JWOA 1MXWA 3VVDA 2GHBA 4ZZAA 5B7DA 2AIXA 5H8HA 4NF6A 4DDDA 1MQDA 3B7DA 4KYDA 1N84A 4QF9A 3DP4A 4XIGQ 3C34A 1A8EA 2F97A 1GVCA 2DWJA 1WODA 3RTFB 5HPQA 1AH5A 3O2AA 1GV8A 3EF7A 2XXHA 1USYE 2DOJA 3K0VA 3O29A 2F34A 2H99A 4KFQA 4EDPA 3KGCA 3G7WA 3PPOA 1TFAA 4OEVA 1IITA 4TQUQ 3HHGA 4G4PA 1MS7A 3PUVE 3FATA 3SERA 4Z0IA 1AMFA 2R9JA 2VP1A 1MXXA 3H6VA 5AA2D 2UVJA 3W15C 1UIUA 4FORA 4WEPA 3K02A 4ZE8A 3CG3A 2QPQA 2REJA 4R9GA 4C1UA 1H45A 1P99A 2O7UA 4YAHX 3H6WA 4LA9A 4RYAA 3MAMA 3AXFA 1JW4A 3CG1A 1FQBA 1MY1A 5AA2B 4OFJA 4Q0CA 1SI1A 4BDOA 2B3FA 4OYVA 1B5HA 4I1DA 5TPAB 2Q9TA 3BFUA 5CRYA 3OO8A 3HHFA 1Z7ME 4U23A 5K2YA 1DTZA 1M5BA 4YB5A 2XXYA 3PUYE 1B32A 3G3JA 1ATGA 1SYIA 1NNFA 1CE2A 4RK9A 3GXAA 2F78A 1GTKA 3LUYA 2RF1A 2I0BA 4QFKA 1RYXA 3VFJA 2FYIA 2GFEA 2QL3A 3Q26A 1S9TA 1A55A 3N94A 1B05A 4MH5A 3S9LC 3FJGA 1EU8A 3O28A 3PUZE 4H65A 4H8JA 3O97A 1HSLA 1Y1MA 3TTNA 2WKYA 1MY3A 4F29A 1MPBA 1N3XA 1FW0A 4C0RA 1QKAA 4QFOA 1TT1A 4FIMA 3FVOA 2F6PA 2PT2A 4OESA 3IK6B 3FXRA 5CMCA 4I62A 5JEIA 2QS3A 4RPNA 1A99A 3H4ZA 5DYHA 5DTBA 5IAIA 1JEUA 1SW1A 1IXIA 1KWHA 3CIJA 2QRYA 5I56A 3PPQA 4ZDMA 1B3LA 1US4A 1FQAA 3IJXB 2DE2A 3T93B 3EHTA 2H9BA 1LFGA 4ZEDA 5F7VA 5ITOA 1Y1ZA 2PMSA 4O3AA 2NVUB 4YICA 1ZBMA 3TZAA 4AQ4A 2R71A 5BWJA 3W9WA 1I69A 3THIA 1ZMGA 3T9XB 3S9MC 3ZSFA 4BLAA 4KD5A 4GXAA 1DTGA 4UA8A 3TTLA 1HSJA 2F35A 4QFLA 1AIVA 3QAXA 3Q27A 4F1VA 4GD5A 5TU0A 3LSLA 2XXIA 3MP1A 5I2NB 5B70A 3SEYA 5A5XB 3IORA 3E13X 5H8NB 3MVXA 1PB9A 2OZZA 2ABHA 1VFDA 3EHSA 4ZECA 2Q89A 4HCYA 2ZNSA 2HZKA 3K2DA 1URDA 4ZS9A 3K4UA 1B46A 2QSXA 3PMVA 2O69A 2DP8A 1D4NA 3VXCA 4WKMA 3H6UA 2I3WA 3I6VA 5FHMA 1B3HA 3IOUA 1NNTA 4OFOA 2DE4A 4ELQA 3Q29A 2UVIA 1JW1A 4PFUA 1JETA 5I59A 3S9EA 2RC9A 1Y4CA 2XXPA 5H8FB 1O63A 3CFZA 1MY0A 4HCWA 3D4GA 1B4ZA 4F31B 4LP2B 4R2FA 3C4MA 2YLNA 2I4CA 2ZYMA 3JV9A 3G3IA 4P11A 1JVYA 4PETA 3TKDA 2XXXA 4H67A 3IB2A 4N6PA 5L9MA 5JTYA 1UTBA 4DIGA 1MM6A 1B3FA 2KLFA 1H44A 3E9XA 1M5FA 1OQGA 4X48A 4DXBA 4TLLB 3E3KA 1B1HA 1MQIA 3HSTA 1DOTA 1B40A 4O3CA 1FTLA 2Q2CA 2I48A 2I0CA 2O7IA 2I6EA 4BDMA 2ONRA 2A5TA 2R6GE 4GIZA 1IXCA 1MPDA 2OWTA 3G3KA 4FAJA 2OJTA 4JDFA 4QSCA 4KHZE 1CB6A 1FTKA 3V5AA 3U8QA 1N0TA 1EZPA 3EN3A 1B5JA 1URGA 4NMYA 1I6AA 4U4SA 4F3SA 2RINA 3TYHA 4F2OA 1ZIUA 4KYEA 4THIA 3VLUA 5ISUA 2G29A 4F2QA 5H8QB 2Z8DA 3IOTA 5KZTA 4RY1A 3R26A 3CVGA 3A09A 4MFIA 3A3CA 5KDTB 4KR5A 3T9UA 4N13A 3ILUB 4F1YA 3TCGA 1FTOA 3RUMA 5AA4B 4RA1A 2Y7RA 3MZBA 3U94A 3IO4A 3KG2A 5F1QA 1JQFA 2DYXA 3F11A 3IX1A 2OLBA 3MP8A 2XXRA 1ZU0A 1OQHA 2W7YA 2CMOA 3Q25A 4F39A 3IO6A 2O1MA 2A5SA 4JXIA 3MP6A 5DEXB 3IB1A 1SD3A 5H8SA 4R73A 1Y3PA 3K6XA 1LFHA 3A3UA 3O6IA 1TXFA 4U2RA 5CBRA 3FV1A 1BIYA 1PC3A 2O84X 5H8HB 2V93A 5L8DA 3MPKA 2ALUA 3KJTA 3VVFA 1L5TA 3OENA 2F7AA 1R6ZA 1LAFE 2Y7KA 1JEVA 2H98A 1MY2A 1QUJA 1NNKA 2XD3A 3KSJA 4NF5A 3OSRA 2RC7A 3SESA 4F3BA 3FXQA 4F19A 3CR9A 3TMGA 2QJEA 4IO4A 1P1WA 4P0GA 3GZGA 1Y20A 2P2AA 1DSNA 3BFTA 3O6GA 4G68C 3C32A 4ELRA 4X1DA 4YKKA 4H8IA 1B0HA 2AYSA 3ODBA 2Z23A 3DM0A 4OMBA 4AB5A 5K2XA 4H1XA 1FQEA 3KOSA 3IJOB 3N26A 3PPNA 2Q2AA 2ZXTA 3C36A 3H06B 1FQDA 1LFIA 4G8MA 4ZE9A 4R74A 5FHNA 5EHSA 1PDAA 3ZS6A 3Q28A 1B4HA 4H5FA 2XX7A 1TWYA 1LBCA 4BDQA 4XXUA 3TTMA 4ELPA 1I6QA 1B1XA 1O64A 1N3WA 3O66A 3MZ9A 1OLAA 1R1NA 1HSEA 5DT6A 4ZZEA 4YU0A 3G3GA 2PYYA 2V3QA 1SDXA 3TAJA 4Z7EA 3PD9A 1FTJA 3CI8A 2F7BA 3UORA 1PB8A 3UK4A 5CM6A 2ZMBA 4XKRA 4IO7A 2YJPA 2GRVA 4GL8A 2QS4A 1MXVA 3TCFA 1I6BA 1NH8A 5AA2A 4LUBA 4RNSA 4F3PA 4L17A 4Q5TA 1XS5A 3H03A 3FXUA 4DXUA 3TFLA 4GFRA 4R6YA 4OEUA 3QYTA 1AOVA 2IEEA 1B51A 1MQHA 1QVSA 2QS2A 4YMBA 4M4GA 3MC2A 3K1NA 4PFTA 3GBAA 4NTLA 3MW0A 5M2VA 5CC2A 4POXA 5IKBA 1BKAA 4RK2A 1XOCA 2XXVA 3H6TA 4QHQA 4XTCQ 3ILTB 3T9VA 1QJMA 3M3LA 1J1NA 5I56B 5HM4B 2OWSA 4I9DA 1LGBC 4PQJA 4KCCA 3FGSA 3QIMA 2H4IA 3ONMA 3LSFB 2NOOA 2V3UA 3V89B 3TCHA 3KN7A 2GH9A 3B6TA 3R7XA 4DCXA 4Q30B 5ITPA 2OK2A 2RCAA 1ZLQA 1PBQA 3I3VA 3EQ1A 3PMWA 2QS1A 3OD7A 3MVZA 4GF8A 1B2HA 1B58A 3CSBA 2HAUA 4OTEA 2PVUA 1MRPA 1B6HA 4H5GA 2DWIA 3EHUA 4P0IA 2DSFA 3C9HA 3IL1B 4G68B 4BDNA 4IGRA 4UACA 4DZ1A 1MXUA 1QW0A 4R75A 1IXGA 4ONYA 3UP9A 4NF8B 2PT1A 3RQTA 1M5DA 4NE4A 1NMUA 4GOTA 1IXHA 3KEIA 4IO2A 3QUFA 1XVXA 2O51A 3KSXA 3U93A 3V83A 2PBWA 4X9TA 4GVOA 1POTA 4XKQA 3KN8A 2UYFA 4WXJA 1VE4A 4ZEIA 2HZLA 4R9FA 4ZEBA 1Y3QA 4POWA 1Y4TA 3FVNA 3PMXA 3R6UA 2Q88A 5CMMA 1FCKA 4NF4A 3PD8A 4MF3A 2O68A 2ONKE 1XC1A 4U4XA 3M3FA 3KBRA 3QSLA 1DMBA 2H5YA 5A5XA 3KOTA 2HQ0A 3TDJA 5L9SA 3SDFA 2F7CA 5AA3A 1IEJA 2XX8A 4GRKA 2V84A 5ICTA 2DXRA 3SKPA 3UA8A 5FTHA 5LOMA 1R9LA 3PUXE 3FASA 5JTYB 2XD2A 3FVKA 1B7UA 3OEMA 1MQGA 4M1VA 5I84A 2OBGA 3FUZA 1JNFA 4OVJA 4GQOA 1B7HA 1MH4A 4NWDA 5H8FA 4K3FA 4FEDA 4IO3A 4YKJA 2B65A 3FJMA 4EUOA 1FTMA 2NUVA 3SEUA 1MY4A 3B6QA 3PPRA 4FJPA 3LBSA 4DCYA 5I57B 2DVCA 4AB6A 1M5CA 3G3FA 1UTHA 3LSXA 4LQ5A 3N6TA 1OVTA 2F36A 1IIWA 3UIFA 3C33A 3TQLA 1QULA 5DVIA 4OHNA 2UVHA 1ELJA 4F3GA 4BDRA 4FECA 2NXOA 3IAZA 4QFPA 2PX1A 3RT6B 3DP8A 2UXAA 2DWAA 4KPTA 3SEVA 2CZLA 2Z22A 4QSEA 4KCDA 4ESXA 1RYOA 1ZTYA 3H3GA 3RY3A 4DXCA 5I58A 5I2KB 3OO7A 5CBSA 1LB9A 1LAGE 5CI5A 3ECRA 3CFXA 3VVEA 2ZYKA 4LONB 4NEDA 5ELVA 3ZKLA 4OETA 4RJZA 3JYRA 5AA1A 2G93A 4G2ZA 3HN0A 5DVFA 3PGFA 4C1TA 5H8QA 3TODA 3I5OA 4KI0E 4R72A 1P1QA 2ZNUA 1XVYA 1MH3A 5KDTA 4H6DA 4GLIA 1MXZA 2O6AA 3B6WA 3VV5A 4LATA 3KZGA 3HO7A 3OO6A 5KCJB 5BUUA 1LCFA 1II5A 3RLFE 1OIBA 1BLFA 3FZVA 3C31A 3K01A 1B52A 2ZYOA 3O9PA 4NF6B 2RC8A 2F8DA 2O1LA 4TOZA 3QK6A 4X1BA 1ZKBA 5TP9A 3FIRA 3K1PA 1DPPA 4EQBA 5DEXA 2OCUA 3WAEA 5AE4A 4F18A 4ESWA 4G8HA 4FATA 1O7TA 3O6HA 3JZJA 3DELB 4LQ2A 2ESNA 1AL3A 2ZNTA 2XXWA 1Z7NE 1SW4A 1A40A 3TELA 2FNCA 4OENA 2Y7WA 1B3GA 4IY6A 5CMKA 4KYSA 1N76A 4EQ7A 4R6KA 2Y7PA 3GBBA 1FQCA 3KFMA 3L6HA 4OFLA 3FJ7A 2ONSA 3M3KA 3DP6A 4XKPA 3USDA 5EHMA 1VFEA 5L9OA 1YTVA 2BJJX 4NWCA 1IUDA 4IGTA 3T96B 3MUQA 1A54A 5FHOA 2V25A 4QFNA 1LB8A 2X7PA 3V8XB 1GR2A 3P7IA 4G8NA 1NNPA 1SW5A 2VHAA 1MDP1 4YB7A 4H0WA 1N7XA 3LR1A 4HW8A 1A7LA 2D5WA 3MVYA 1LLSA 4E0WA 3OMBA 3W9VA 1XT8A 3RPWA 2HXWA 1URSA 4O3BA 1QKBA 4OWDA 1NKXA 3OOAA 3VLVA 4F22A 3TTRA 2XHDA 1A8FA 5FTIA 4IB2A 1B9JA 3PPPA 3T9HB 4YMAA 1FQFA 4FE8A 4N07A 3VXBA 3GLBA 3CRBA 1YPNA 1H76A 1NL5A 4F1UA 5TPAA 4R2BA 1EZ9A 1MXYA 1Q1KA 2YPNA 3MVWA 3K6WA 2UYEA 5JK4A 2H25A 3KJ7A 4EF1A 5ICQA 3IB0A 4RPOA 1YCJA 4MLVA 3E4RA 1UQWA 4IO6A 2D3IA 4RXLA 3UN6A 1DPEA 3IOVA 3FD3A 3SETA 1F9BA 2M8CA 1Q35A 3PUWE 2NWJA 1BTJA 3C35A 2DWHA 3D4CA 1NFTA 1UIVA 3SEXA 4PFYA 3PU5A 5HBCA 4LVQA 1D9VA 2REGA 2I49A 3FV2A 1IQ7A 1WDNA 3IOWA 4PE5B 1POY1 4PP0A 4EXKA 3TQWA 3QUJA 3RTWB 3TPAA 3OEKA 1SBPA 1EZOA 2AL5A 2DXYA 3DLNA 4FEBA 1OLCA 4XKNA 4U21A 2P1SA 4PFWA 1QUKA 2I3VA 4ZEKA 1MDQA 4YB6A 2E1SA 4EXLA 1OMPA 1MQJA 2RKMA 3H7MA 3K6UA 1MG1A 2DQVA 3S9NC 1JW5A 1BP5A 4JWXA 1LSTA 1USYH 2F6GA 3T66A 1VR5A 1SVXB 1B3EA 1SQYA 3QXMA 2LAOA 1Y9UA 3K00A 4GXSB 1H3DA 2D21A 3U1OA 3MQ9A 4TLMB 1LBBA 3OSQA 3HCQA 2I4BA 4ND9A 3CFLA 1SYHA 1ZJLA 1T0KA 3MBPA 1NH7A 2VD3A 4ZEFA 4JSDA 4QRZA 4NF4B 4MBPA 4I8CA 2HEUA 2HAVA 4G68A 3EPEA 2QMWA 3S2VA 3LSWA 1JVXA 4EF2A 4ECFA 2ANJA 4NF8A 2GHAA 5EYFA 1QUIA 4MLQA 1LCTA 5I59B 2QMXA 3FVGA 5CMBA 5I2NA 3HV1A 3BBRA 4YKPA 2Q8JA 3RN8A 5H8NA 4U1OA 1S50A 4YKIA 2HCAA 1N7WA 3SEWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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