5H8HB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne3419
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8hB02
3O2AA 2Q9TA 4U1OA 1XVYA 4AQ4A 4BLAA 2CZLA 3DP6A 3H6VA 2DWHA 3ZKLA 4GXSB 1DTGA 4JSDA 3MC2A 5H8NA 1Y4CA 1II5A 4KFQA 1B58A 3K6WA 1A55A 2XXVA 1AL3A 3L6HA 3KG2A 4GFRA 3OSQA 3I3VA 2A5TB 1URSA 3W15C 4N07A 1OLAA 1MRPA 2WKYA 1Y4TA 1UTHB 1Y1MA 3UGWA 5JTYA 3M3LA 1FQDA 1S9TA 4K3FA 1SI1A 1NNFA 3EQ1A 5H8FA 1GVCA 4PFWA 3S9LC 4OTEA 1IIWA 2A5SA 1JW4A 3KN7A 4E0XA 4PP0A 3QUFA 4GLIA 1SBPA 3GXAA 2DE3A 4FE8A 1AMFA 1QKBA 2V25A 3KZGA 5HPQA 2UVGA 3UIFA 1XC1A 2QSXA 4KHZE 2DQVA 2Q89A 3I5OA 3K6UA 4DCXA 2O69A 2HQ0A 1B2HA 4OESA 2XD3A 3JV9A 1JW1A 3Q29A 4R9FA 1POTA 2ZYNA 1MY1A 1P1NA 4N6PA 3UK4A 3IOUA 4F3SA 2XX9A 4OFOA 3KBRA 5KZTA 1LGBC 4RYAA 1O64A 4RXLA 2Z23A 4PFYA 1KWHA 2O7UA 2VP1A 5CMMA 3FASA 2DOJA 1SQYA 2IA4A 4FEDA 3B6TA 3ONMA 1B05A 5H8HB 3GBAA 3OMBA 4NF4B 2RKMA 3G3FA 3LSFB 1EU8A 3CSGA 5KDTA 1TWYA 4NF6A 1RYOA 3EHTA 1A8EA 5I57A 5CM6A 1LLSA 4HW8A 5KCJB 4JDFA 2H98A 4JB7A 3VXBA 4POWA 4X1BA 5I56B 4IO5A 5AA3A 1B3FA 1YCJA 1IITA 4LQ5A 3TEPA 1WODA 3E3KA 5L9SA 2VOZA 2O1LA 3THIA 3TUSA 4FECA 2V3UA 4ZS9A 1PB8A 4LZ7A 1SW1A 5CMBA 3D4GA 3PD8A 4H5GA 2XXRA 3Q26A 1SW2A 2QMXA 1B3GA 5F1QA 2ZYMA 4QFKA 2B3FA 2PT2A 3K4UA 2REGA 3O6IA 4U2RA 1O7TA 3H6UA 3VVFA 2NXOA 4LZ8A 1XOCA 4MBPA 2ONSA 2DSFA 1BKAA 4ZEDA 3H6TA 1NL5A 3FXRA 5TU0A 4L17A 1MDP1 2QL3A 4N13A 3H06B 1GR2A 5CMCA 3O97A 4JWYA 4GIZA 4R6KA 1M5EA 4KQPA 3TQLA 2NOOA 4FATA 1MXWA 1DPPA 2DVCA 3RY3A 1IUDA 3IOWA 1QUIA 2G29A 4H8JA 4Z7EA 1OVBA 2OWTA 1YAEA 3GZGA 4ZEBA 3CSBA 4ZZAA 5M2VA 3KJTA 3RT6B 4H0WA 1JQFA 4NF5B 3PMXA 2HFBA 3CI8A 2B3BA 1J1NA 3MUQA 4QRZA 4TLMB 5TP9A 5I2KA 3RNNA 3TCHA 2ZYKA 2X26A 3LSXA 3IX1A 4IO3A 5CMKA 1B9JA 1PC3A 4Z0IA 3RQTA 2XXXA 2XX7A 3OOAA 4NMYA 2F6PA 1MXYA 4ISUA 2F6GA 3DELB 1N3WA 4YB5A 3OO7A 4R2FA 3MP6A 1VFEA 3MZ9A 2P1SA 1SVXB 2F36A 2H9BA 1LAGE 4NE4A 1P1WA 4ZE9A 3TQWA 2UYFA 4H8IA 1Q1KA 3OO8A 2LAOA 3O29A 4GF8A 1FTJA 4NF8B 1I6BA 3PUXE 2I3VA 1FCKA 2F7CA 1USYH 1AOVA 1OLCA 4FIMA 5DEXA 1N76A 2Z22A 3QIMA 2G93A 2I48A 3MBPA 1B3EA 4NTLA 1PB7A 4AB6A 2GRVA 5BWJA 1POY1 1MY0A 1MG1A 4IO2A 4EF1A 1GTKA 3A09A 4UACA 5I2NA 3T9VA 1O63A 2GFEA 3Q27A 3RN8A 4ESXA 4YMAA 3RT8A 3TAJA 4KCCA 1Y3PA 4EUOA 2Y84A 5TPAB 4PETA 2F7AA 1P1UA 1NH7A 4HTGA 4KYEA 1L5TA 2Q2CA 1FQAA 5AA1A 1MDQA 3RLFE 4Q5TA 1A40A 1MXXA 4F2QA 2ZNSA 4YKJA 4QF9A 3C36A 3VLUA 3PPPA 4LP2B 4Q8RA 4OMBA 1B7HA 1FQFA 1UIUA 3RPWA 1D4NA 2AYSA 4RNSA 2DE2A 1N04A 1QJMA 1VR5A 2F78A 3SEVA 3A3CA 1M5FA 4ECFA 2ESNA 2DYXA 4IO4A 3UP9A 1B6HA 1VFDA 3H4ZA 1JVYA 1EH3A 1IXCA 1PB9A 4IB2A 2I58A 4RPNA 3C34A 2DS9A 1MXUA 1Z7ME 4YMBA 1AH5A 4MLQA 2F5XA 4F2OA 4ZE8A 2RCBA 2FNCA 4LQ2A 4X9TA 5JK4A 1JW5A 5H8NB 1B46A 3VVEA 2ZMBA 3MZBA 5I84A 3MP8A 4BDNA 3TTRA 4R2BA 3T22A 2O6AA 4GL8A 3TCFA 5HM4B 4I8CA 3FVNA 5FTHA 1S7YA 4PE5B 2OK2A 1DPEA 3P7IA 5JTYB 3H3GA 4DXBA 3PV0E 4EXKA 4X1DA 5H8FB 1UTBB 1ZMGA 4NWCA 2D21A 3MVZA 4U4SA 1QUKA 2XXYA 1MM6A 1SYHA 3IORA 2HXWA 1B3LA 3D4CA 2H4IA 1HSEA 4HS7A 1MQJA 4YZZA 3N94A 2HZLA 2GHBA 3K02A 3TTLA 2P0SA 1LSTA 4WEDA 3ILTB 3LBSA 4BDMA 3HPIA 1QVSA 1FQCA 4H6DA 3MWBA 2DWIA 2Z8DA 1N7XA 3C32A 3N6UA 3T96B 3IL1B 2I3WA 4P0GA 4KPTA 1R6ZA 2XXPA 2DE4A 2O1MA 3H03A 5A5XA 4DLDA 5EHMA 1I6AA 1NFTA 5CBRA 3H7MA 2UVIA 4Q0CA 2I0BA 4POXA 3OO6A 1UTHA 5K2XA 3G3GA 1NH8A 5B70A 3G3IA 3TELA 1D9YA 3FV1A 3TTMA 2HAVA 3FUZA 3KJ7A 2QRYA 4NF6B 3U1OA 2VD3A 3G3KA 1LCFA 3IB1A 2RC7A 2I0CA 3V89B 1AIVA 2E0SA 3MW0A 5I57B 3CFXA 4DE8A 3Q28A 3VFJA 4EQ7A 1QKAA 2Q8JA 1PBPA 2THIA 2DWJA 3VLWA 1PDAA 1FTKA 5FTIA 3SEWA 2YPNA 1PEBA 3IB2A 1TT1A 1P1OA 1ZU0A 4U22A 1WVJA 3FVGA 1LBBA 5J1DA 3PU5A 3LC8A 1B0HA 2DP8A 1NNPA 1HSJA 1MM7A 1UIVA 4R73A 1LBCA 1TFAA 4ND9A 3UORA 2KLFA 4OENA 1B51A 1B1XA 3FVKA 1B4ZA 5JEIA 4F1UA 3SEUA 5ITPA 4DZ1A 3PUWE 5IAIA 3FVOA 1MPCA 2FA7A 3IOVA 3TCGA 4LVQA 4XKPA 5DT6A 3G7WA 4DDDA 5K2YA 3WAFA 2RCAA 2Y7PA 5H8HA 4G8MA 4THIA 3G3HA 4NF4A 3MVWA 4U21A 2NUVA 4BDOA 5L8DA 2O84X 3PPNA 5I56A 3PGFA 1UQWA 3TKDA 3EHSA 1R9LA 4BDLA 2D3IA 4C0RA 1FTMA 1MH3A 4FORA 2PBWA 3FJ7A 4OFLA 3QUJA 1RYXA 3W9VA 1MY2A 4FJPA 1H44A 3EF7A 5DYHA 4OWDA 1XHYA 3O28A 3B6QA 3CG3A 3MPKA 3PMWA 2DVZA 1DOTA 3PUZE 2F7BA 3E9XA 5I59A 3T93B 1N3XA 5H8QB 3U93A 4F19A 3M3KA 3T66A 1B1HA 2VD2A 1CB6A 2HCAA 3V8XB 1OMPA 4XKRA 3UN6A 5L9OA 3FZVA 4OYVA 2H99A 3VE1B 5I58B 4ZDMA 1MPBA 3C35A 1PBQA 4XIGQ 4XTCQ 1FQBA 1URDA 3U94A 2ZYOA 3R7XA 2OJTA 1S50A 4P11A 3RTWB 4QSEA 3RGYA 1QUJA 3N6TA 2NVUB 1HSLA 4IO6A 4EDPA 4G4PA 4JSOA 4DXCA 1USYE 3L6GA 4YKIA 4LZ5A 1MS7A 1B4HA 4QHQA 4EQ9A 2ALUA 3PUVE 4R6HA 4OVJA 1B5IA 1IEJA 1B7UA 5DVFA 4F3BA 3SEXA 1WDNA 2W7YA 3O6HA 1LB8A 3TFLA 2RINA 3KEIA 4G8NA 5FHMA 1I6QA 1MQDA 1IZ1A 4ELQA 1N0TA 3GLBA 4LATA 3C9HA 4KI0E 2QS1A 1JEVA 4YKPA 4NF8A 3VDFA 1Q35A 4MLVA 1DSNA 3KFMA 4DXUA 4E0WA 1H45A 3PUYE 1US5A 3TYHA 1FTOA 3PPQA 1BTJA 3U92A 5HBCA 2H5YA 2QS3A 3LR1A 3CIJA 3G3JA 1EZ9A 4F18A 3ECRA 4GOTA 5CBSA 3HN0A 3PPRA 3FJGA 4G68C 3LSWA 3USDA 1LAHE 4OQOA 3K1MA 4HCWA 2V93A 2OZZA 3PMVA 2RC9A 1SDXA 4WEPA 5AA4A 2F35A 3KSXA 3CG1A 2F34A 4ZECA 1OQGA 2Q88A 1N7WA 2RC8A 1F9BA 3FJMA 1FQEA 3IAZA 4IY5A 4OFJA 1P99A 3WAEA 2X7PA 2O7IA 1ZJLA 2XD2A 5CC2A 3HSTA 3O6GA 2ONRA 3TTKA 1A54A 3VV5A 3IJOB 3RTFB 5FHNA 1P1QA 2OCUA 2P2AA 4JXIA 3CFLA 3B7DA 4JBZA 3BKIB 1ANFA 4H5FA 3TPAA 3U72A 2XXWA 2QPQA 3IR1A 2REJA 3K6VA 4WXJA 4DCYA 5AA2A 4G68A 5AE4A 2ANJA 3IO4A 1D3KA 3EHUA 1MQGA 2M8CA 4IGRA 3IK6B 3KSJA 1IXIA 4R6YA 3H6WA 1ZIUA 2I6EA 4C1TA 3CRBA 2DWAA 1FTLA 1GGGA 3ZS6A 2ZXTA 3HHGA 2F97A 4XXUA 3VLVA 3FXUA 1M5BA 3M8UA 2I4BA 4G8HA 4ELRA 4M4GA 3SKPA 3ZKKA 3ZSFA 2DXRA 3CVGA 1XVXA 1ELJA 1JNFA 2R6GE 1NKXA 2ZNTA 5EHSA 4PFUA 1LB9A 5CI5A 1CE2A 1OQHA 5A5XB 4ESWA 4IO7A 4TOZA 4O3CA 3KOTA 1EZOA 1H43A 1ZLQA 1JETA 4ZEFA 2XXIA 1FW0A 3V83A 1YPNA 4ELPA 3T9XB 3LSLA 4BDRA 4DIGA 2Y7RA 2HAUA 1UTBA 4JWXA 4OERA 4GL0A 4QFNA 1SW5A 4GXAA 1VE4A 3VVDA 4LA9A 4IGTA 1IXHA 4RA1A 1B32A 4EQBA 1OVTA 2YLNA 2A5TA 4KR5A 4ZZEA 2VHAA 1YTVA 3C31A 1SW4A 2Y7KA 4GRKA 3VXCA 3E13X 2GH9A 3PPOA 1R1NA 2RF1A 5KDTB 1A99A 3T9HB 3F11A 4HCYA 3OD7A 4O3AA 3FATA 3LUYA 2XXUA 4H67A 4EXLA 1MQIA 2XHDA 3MZ1A 3M3FA 5ICTA 2OLBA 5CRYA 4MFIA 2YJPA 2QS2A 3R26A 3SEYA 4PQJA 1XT8A 5BUUA 1ZKBA 4YU0A 4OEVA 4YAHX 3TTNA 1JEUA 2BJJX 1BLFA 2PMSA 1B3HA 2UYEA 1MH4A 3TMGA 3HV1A 3C33A 4RY1A 1TXFA 4F39A 3SETA 3DP4A 5H8SA 4YKKA 4MF3A 3K1NA 4I1DA 3OO9A 3UA8A 1Y3QA 4AB5A 3CFZA 4YB6A 2Z8EA 1T0KA 1BIYA 2GHAA 1URGA 3OELA 1DTZA 2ABHA 4G2ZA 3DM0A 4TLLB 3OEMA 4R75A 1JVXA 3QAXA 4F22A 3DP8A 3IJXB 1SI0A 1B40A 4H65A 1OIBA 1ZTYA 4RK9A 3S2VA 5ITOA 3BBRA 3K2DA 1SYIA 4JWOA 5KCJA 3FGSA 1NNTA 4RJZA 5I59B 5LOMA 4EF2A 1MXZA 4QFOA 5ICQA 2XXQA 2Y7WA 1A8FA 1R9QA 1MY4A 3CR9A 4LUBA 5TP9B 1NNKA 5I2KB 1I69A 4OZ9A 3KN8A 1M5DA 1DMBA 2V3TA 1MQHA 3S9MC 3KN3A 3QSLA 1GV8A 2QS4A 4MH5A 1RKMA 4NEDA 1SD3A 4R74A 2O51A 2PX1A 4PFTA 4NWDA 3FXQA 4OETA 3N26A 3PD9A 3MQ9A 3S9NC 1EZPA 3OEKA 2VGQA 3BFUA 1B52A 3R6UA 2XX8A 3K0VA 3MVXA 3O66A 3MJNA 3K00A 3C4MA 4ZEKA 4TQUQ 5DVIA 1H3DA 3FIRA 4OXVA 2OWSA 5FHOA 2UXAA 1N84A 5DEXB 3SDFA 2E1SA 2AIXA 3RUMA 2XXHA 4KYDA 2UVHA 4RK2A 1M5CA 3HO7A 1LFHA 3JYRA 4F1YA 1B5HA 4KD5A 2OBGA 3BFTA 1MPDA 1LAXA 1NMUA 2QJEA 5B7DA 5H8QA 2UVJA 4NF5A 4FAJA 4ONYA 5ISUA 3QYTA 3MAMA 3A3UA 2HEUA 5I2NB 1US4A 4GVOA 3K01A 1IQ7A 3S9EA 2F8DA 3KGCA 1H76A 4O3BA 4QFLA 1XS5A 4GQOA 2IEEA 4QFPA 2V3QA 5I58A 1QW0A 4I9DA 1Y3NA 2Z8FA 4R9GA 3OSRA 4ZEIA 4F3GA 2X7QA 3JZJA 4QSCA 2ZNUA 4KCDA 2H25A 1LFIA 4RPOA 5EYFA 4XKQA 3T9UA 3I6VA 2PYYA 3TZAA 1LAFE 1B0LA 4LONB 3Q25A 4WKMA 2PVUA 4G77A 4X48A 3EPEA 3U8QA 5AA4B 4C1UA 3QK6A 2V84A 4QSDA 5DTBA 4R72A 3TDJA 1IXGA 3EN3A 4U4XA 5L9MA 4ELOA 3SESA 5F7VA 1A7LA 3IOTA 3W9WA 4Q30B 4OHNA 3V5AA 5ELVA 1Y9UA 2AL4A 1MY3A 4M1VA 3AXFA 1ATGA 2B65A 2I49A 3FV2A 3TODA 1ZBMA 4GD5A 1LCTA 2Y7IA 4KYSA 3MP1A 1B7ZA 4I62A 4BDQA 3IO6A 3E4RA 2ONKE 4F3PA 2DXYA 3S4UA 4FEBA 2XXTA 3OXNA 5TPAA 5DVJA 2Q2AA 2I4CA 4F29A 3O9PA 1Z7NE 4F1VA 3IB0A 4IY6A 3K6XA 4YB7A 3K1PA 5AA2B 4G68B 1TFDA 4H1XA 3GBBA 2R9JA 3FD3A 3SERA 3HHFA 4GWOA 2QMWA 2FYIA 1Y1ZA 3DLNA 3HCQA 2PT1A 1LFGA 2AL5A 2HZKA 5IKBA 5AA2D 4XKNA 1BP5A 3QXMA 1VSOA 1D9VA 2O68A 3N5LA 3KOSA 3ILUB 4YICA 3MVYA 1Y20A 4F31B 4P0IA 2R71A 1MXVA 3B6WA 4U1ZA 1B5JA 4U23A 1QULA 2CMOA 2D5WA 4UA8A 3OENA 3MPLA 2NWJA 4OEUA 3ODBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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