5H8NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with nam
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nB02
4H67A 4Z7EA 4F1UA 4F31B 1AL3A 3ILUB 3N5LA 2FA7A 3G3FA 1DSNA 1ZTYA 4F3PA 1DOTA 4NF4A 1QVSA 3VLWA 3EPEA 4KD5A 2VGQA 3B7DA 4LA9A 2HZKA 5ISUA 4BLAA 3UIFA 4GIZA 3CFLA 3ODBA 1PB9A 5J1DA 1T0KA 4PFUA 1NNPA 2OK2A 3FJGA 1XC1A 1EZPA 3V83A 3GXAA 1FCKA 2XXXA 2VOZA 3HHGA 2XXVA 3L6GA 3TCHA 1MQGA 3MP8A 4OESA 3KN7A 1NNFA 1MPCA 3OMBA 1FTOA 1NH8A 2G93A 5H8FA 3CG3A 4GXAA 4U21A 2O7IA 4ESXA 2DS9A 2DVCA 4GL8A 2OZZA 1B51A 4QSCA 2V3TA 2F6PA 2X7PA 4R9FA 1B3FA 3MP1A 3IB1A 2I0BA 3SKPA 3UP9A 2ESNA 3U72A 4POXA 3RY3A 3K1PA 4WEPA 3PMXA 4U4SA 4KPTA 4GWOA 1HSEA 1LB8A 4FEDA 1NKXA 4EQ9A 3PMVA 3MZ1A 4DCXA 2UVHA 2QS1A 1POTA 3BFTA 2A5SA 3E3KA 3TTKA 4TQUQ 2UVIA 4F2OA 1PDAA 3KN8A 1GV8A 3TTMA 1B1HA 3MC2A 4KYSA 3S2VA 3TODA 4F18A 1OQGA 1ZKBA 4QSDA 1DTGA 1DPEA 1TT1A 4IO3A 3CR9A 3CSGA 3FVNA 1MXXA 1B32A 3RTWB 4GRKA 4I62A 2RC9A 2Y7WA 5CMBA 3CSBA 1P1NA 3QIMA 4AB5A 3B6TA 4QRZA 1XT8A 4THIA 2XXRA 3PUVE 2XX7A 2B65A 1Q1KA 2ONRA 1H76A 3IAZA 1S50A 3T66A 4UACA 3WAFA 3I5OA 1B3HA 2ZNTA 5KDTB 2F78A 4F3GA 4NF6B 1MY0A 3M3LA 3VFJA 1Y20A 1URSA 1OLCA 2UVJA 2CMOA 4R6KA 3GBBA 1GTKA 3KSJA 2OWTA 1MXYA 3MVZA 3V5AA 1LAGE 4ZZAA 4G68A 3FZVA 3M8UA 3OXNA 2I58A 3MJNA 4Q30B 3O66A 3FVGA 3TCGA 4F3SA 1A7LA 4KQPA 2F7CA 1LFHA 1UTBB 3OOAA 3O28A 2H4IA 5AA2A 2DVZA 1EH3A 4F39A 3H06B 4WKMA 2DOJA 4DCYA 1MQIA 4YKPA 3QUJA 1MY4A 3SERA 4MF3A 2PVUA 2O1MA 2VP1A 3KGCA 1MRPA 2O1LA 2V3QA 1M5EA 2Q89A 2IA4A 1FW0A 2XXWA 5HBCA 4F3BA 3I3VA 3PUZE 3TFLA 3VVFA 4ELQA 2Z8DA 3MPKA 4YAHX 2REJA 5I2KB 3KOSA 5EHMA 3H6TA 4I8CA 3HPIA 1BKAA 3MQ9A 4YMBA 2G29A 5H8QA 1LLSA 2Q88A 3FGSA 3DP6A 3UN6A 4LQ5A 1USYE 4EQ7A 3KOTA 3IOVA 5CMCA 2XD3A 4LUBA 1IITA 4KYEA 1A8EA 3PV0E 2ALUA 3FIRA 1TFDA 3GZGA 5JEIA 3K2DA 5M2VA 2Q2AA 2UYEA 3TYHA 1KWHA 3G3IA 5DT6A 1I6AA 4O3BA 2I4CA 2Z22A 5FTIA 1A55A 1QUIA 3O6GA 4JWYA 2PX1A 1B4HA 4TLLB 3VVEA 3OELA 3DP8A 4JDFA 2QS3A 2XXPA 3A09A 3DLNA 1LAFE 2ZYNA 1S9TA 1Y3QA 3DELB 1QUKA 2NXOA 3QAXA 4DZ1A 5CRYA 1SD3A 4U23A 2AYSA 5B7DA 3MP6A 1VE4A 3HO7A 2QMWA 4DE8A 4KYDA 4R6YA 4G2ZA 3DP4A 4NMYA 2AIXA 2UXAA 3G3GA 1D9VA 4PFYA 3BBRA 5KDTA 4NF6A 4JWXA 1AIVA 3OO8A 3IO6A 5AA2D 3OO6A 2H25A 3L6HA 3THIA 1MXWA 4OZ9A 1USYH 1SBPA 1B46A 1B58A 3KJ7A 4O3AA 1IXIA 5I59B 2QS2A 2YJPA 4U1OA 1IQ7A 1MQDA 5IKBA 3VDFA 3C35A 1P1OA 4PE5B 4DXCA 3EF7A 1L5TA 1UTBA 2M8CA 3PU5A 3ONMA 1SW1A 4MFIA 2P0SA 3G3JA 2XXTA 1R6ZA 2ZMBA 3GBAA 1SQYA 1I6BA 4H6DA 4U22A 1JEVA 3K01A 3K1MA 2HAUA 4C1UA 1Y1ZA 1BLFA 1IIWA 2ZYKA 1SW2A 1MG1A 2OWSA 4ISUA 3VE1B 5I2KA 1GVCA 1MDP1 3LSXA 1URDA 3VXCA 1I6QA 4XXUA 4OXVA 4ESWA 2GHAA 1JETA 2F97A 1SI1A 1ZLQA 1B9JA 4POWA 1FTMA 4LQ2A 3ECRA 2QMXA 2XXIA 4KHZE 4F29A 2QPQA 4OETA 3K0VA 3IX1A 1MPBA 4X1BA 3TMGA 5CI5A 3MUQA 2FNCA 1AH5A 2F7AA 2ZYMA 1MS7A 4ZS9A 4H5FA 4IO5A 1B5IA 4FORA 4R2BA 1QJMA 4MLVA 1EU8A 4DXBA 2RKMA 1Z7NE 4G68B 2Z8FA 2ZNUA 1NH7A 1ZIUA 4RPNA 4I9DA 3Q25A 4XKPA 1H45A 4NEDA 5BWJA 4OMBA 3HN0A 4QFKA 2A5TB 1MXVA 5A5XB 4FJPA 3OSQA 4ELRA 4F1VA 3ZKLA 2XD2A 1P1QA 1CE2A 2PT1A 3SESA 5AA2B 4JSOA 4NF8B 1WVJA 1RKMA 3A3UA 4G8HA 3PPRA 3AXFA 3E9XA 3TCFA 5KZTA 4ZDMA 4IO2A 3K6XA 5EYFA 2VHAA 2V25A 1OMPA 1QUJA 4WEDA 5TU0A 4HW8A 5TPAA 4H65A 1P1UA 4QFLA 3TEPA 2ANJA 4KI0E 3LUYA 2THIA 3K02A 1ANFA 2RINA 4RK9A 1MY1A 3SEYA 2DE4A 3PUWE 1WODA 4QF9A 2DQVA 1MY3A 2V3UA 5I59A 5H8QB 1URGA 3RT6B 1GGGA 3MW0A 1LAXA 2UYFA 3FV2A 4G68C 4HTGA 2RCBA 3CI8A 3B6WA 1PB8A 3HV1A 1Y9UA 3FVOA 2H5YA 4OWDA 1XVXA 2H99A 4ZEKA 3C9HA 1PB7A 3HCQA 5ICQA 5AA1A 1D9YA 4XKNA 1AOVA 3E4RA 3K00A 4IY6A 5F1QA 4YMAA 5AA4A 4MBPA 1TXFA 5H8HB 3D4GA 2DP8A 3UORA 1JW5A 3UK4A 1UQWA 2OBGA 3Q26A 4EQBA 2HEUA 3BKIB 2NUVA 4F2QA 1FTKA 5DYHA 3U93A 3PPQA 3W9WA 1N3XA 1JQFA 3SEWA 4MH5A 2DWHA 4ELPA 3MWBA 5DVFA 3FD3A 3PD8A 4EXLA 2GH9A 1OVTA 4R9GA 1MPDA 4YKJA 3IK6B 1FQEA 3ZS6A 3G3HA 4R72A 1B40A 1O64A 1VFEA 4BDOA 5DEXB 1B3GA 1H44A 1A8FA 1JVXA 4ZEFA 1YAEA 1BIYA 4C1TA 5JK4A 5JTYB 3RUMA 3C33A 1FTLA 2NVUB 4F1YA 1OLAA 3PPPA 2H9BA 4NE4A 3H03A 3PPNA 2ZNSA 4H0WA 5H8NA 5CMMA 4Q8RA 4R74A 2Y7RA 3FASA 4Q0CA 2A5TA 5A5XA 1MXZA 4YKIA 4XKQA 2BJJX 3W15C 3RN8A 4NF8A 3FXQA 3KFMA 2GHBA 4ONYA 1IXHA 2F36A 3VVDA 1Y1MA 3JV9A 1SW4A 4N07A 1LB9A 1B4ZA 1N0TA 2VD2A 4AB6A 2AL4A 1LCFA 1OVBA 3K6UA 4P0GA 2E0SA 2DYXA 4HCWA 2XXQA 2R71A 4IY5A 4R6HA 1II5A 2I6EA 3IB0A 4YKKA 3EHTA 5DVIA 5L9MA 4JB7A 2DWIA 1MDQA 1N76A 3IOWA 1YTVA 4QSEA 4NTLA 3V89B 4U1ZA 2O7UA 4PETA 4R2FA 4H5GA 2Q8JA 4OVJA 2D21A 3IJXB 4GXSB 1Z7ME 1B3LA 5FHMA 4UA8A 4IO6A 5H8HA 2R6GE 3G7WA 3LSWA 2DE2A 4P11A 2ZXTA 2V84A 1TWYA 3IO4A 1Y3NA 3VLUA 1IXGA 2Y7KA 1TFAA 1LFIA 4H1XA 3C34A 3U94A 3N6TA 3ILTB 4RXLA 1QKAA 3U8QA 4JBZA 3KSXA 4LZ8A 3CRBA 4LZ7A 3FXRA 1ZJLA 4OQOA 4H8IA 3H7MA 4F22A 5TP9A 3MPLA 1JW1A 4FATA 3T9HB 5ITOA 4QFPA 1P99A 3OO9A 4PP0A 4N6PA 2WKYA 5DEXA 5TPAB 5I57B 5CC2A 1DPPA 3TUSA 5JTYA 2I49A 3FATA 1M5BA 2DWJA 1B1XA 2XXYA 1QW0A 3ZKKA 1M5CA 5L8DA 1B7UA 4RY1A 3C36A 3SEXA 3A3CA 1OIBA 3K4UA 5CBRA 4WXJA 2D5WA 2DE3A 4GLIA 1O7TA 4FECA 3JZJA 3U1OA 3P7IA 4JXIA 3IJOB 4HS7A 2HCAA 1YPNA 4RA1A 2ZYOA 5LOMA 4EF2A 4ELOA 3JYRA 3I6VA 2E1SA 3D4CA 4QFNA 3KZGA 1MM7A 3MBPA 2P2AA 5AA4B 3O2AA 2QJEA 5I84A 1US5A 1FQBA 4YB5A 4OENA 2HXWA 3KJTA 5CBSA 5L9SA 1PBQA 1LSTA 3IORA 1VFDA 3FVKA 4IO7A 4LONB 3OEMA 4KCDA 3IR1A 1SW5A 1MQHA 2GFEA 3GLBA 1EZOA 1JVYA 2CZLA 2HZLA 4ZEBA 1Q35A 2R9JA 3OO7A 3PGFA 1IXCA 4LZ5A 3MVXA 1VR5A 4ZZEA 2B3BA 5HPQA 4XIGQ 3S9NC 4OFJA 3QSLA 3M3KA 3LBSA 2F8DA 3QYTA 1B2HA 1Y4TA 3TPAA 1LFGA 1LGBC 3N94A 1IEJA 4EUOA 2UVGA 1A54A 1POY1 1SI0A 4LATA 4P0IA 3RTFB 3SETA 1R1NA 4RNSA 3T96B 4N13A 3Q27A 4GVOA 4Z0IA 5AA3A 2QRYA 3H6VA 2I3WA 4L17A 3KEIA 4OTEA 4ZE9A 1QKBA 3T9XB 5CMKA 4DXUA 4GQOA 3QK6A 2Z23A 3LSLA 4GF8A 3RT8A 5H8NB 1Y4CA 1A99A 1PC3A 4FAJA 3KBRA 4AQ4A 1JNFA 5DVJA 1VSOA 4PQJA 1B5HA 5DTBA 4BDLA 4RYAA 4E0XA 3USDA 4R75A 2XXUA 3ZSFA 3R6UA 5IAIA 4RPOA 1BP5A 3TTLA 4NWCA 5BUUA 3F11A 2I48A 1FQDA 5I57A 4RK2A 4HCYA 1HSLA 4G77A 3S9LC 2XXHA 4M1VA 3EHUA 3OEKA 1B0LA 3LSFB 4KFQA 3S4UA 1DMBA 2KLFA 3K6VA 3MZBA 3V8XB 2F7BA 1YCJA 2DXYA 3LC8A 5FHNA 3MVWA 2DWAA 3E13X 1ZMGA 2F5XA 1A40A 3H6UA 2PT2A 3B6QA 3HHFA 5I56B 1SYHA 4U4XA 3FV1A 3EN3A 2RF1A 5K2XA 1B5JA 3S9MC 4FE8A 1ELJA 1S7YA 2OJTA 4DLDA 3RGYA 2Y84A 3MZ9A 4PFWA 1N84A 1NMUA 2PYYA 4G8NA 2GRVA 4FEBA 2O69A 1LBBA 5KCJB 1SVXB 4IO4A 4KCCA 3W9VA 4YZZA 4DIGA 4NWDA 2PMSA 4G8MA 3O29A 4K3FA 1J1NA 4E0WA 1P1WA 3H4ZA 3RLFE 2H98A 4XTCQ 4C0RA 5I2NB 4M4GA 3PD9A 2PBWA 4EXKA 5TP9B 2O51A 1PEBA 2O84X 2HFBA 3FUZA 4OEUA 2OCUA 2F35A 2RC8A 1XOCA 1N7WA 3TQLA 5FTHA 3UA8A 3OENA 1B52A 4GOTA 2I3VA 2F6GA 1SDXA 2Q2CA 4X48A 4IB2A 4KR5A 3TTNA 3H6WA 3T22A 1UIUA 4F19A 4OFLA 2Q9TA 5HM4B 1MY2A 3CFXA 2REGA 5ELVA 2OLBA 2FYIA 3EQ1A 5CM6A 1XVYA 1GR2A 4IGRA 1MQJA 5AE4A 5FHOA 1XS5A 3M3FA 1LAHE 2YPNA 2XHDA 2O68A 4JSDA 1M5DA 2Y7PA 5L9OA 2P1SA 1LCTA 4OERA 1QULA 1D4NA 4DDDA 3C31A 3WAEA 4QFOA 4OHNA 2I0CA 4XKRA 2IEEA 2QL3A 3O6IA 4U2RA 3HSTA 1UTHB 3UGWA 4OFOA 4GD5A 4BDQA 1I69A 3C4MA 3BFUA 3DM0A 2XX8A 4YB7A 3IB2A 4JWOA 4R73A 4ZEDA 3OD7A 3VV5A 1OQHA 2D3IA 1AMFA 3RQTA 1R9LA 2DSFA 4BDRA 3CFZA 1IZ1A 5I58B 3O97A 4NF5B 4ZE8A 1UIVA 3K1NA 1SYIA 5I56A 5ITPA 1MXUA 2QSXA 3T9VA 3VXBA 1XHYA 4BDMA 1WDNA 1JEUA 1EZ9A 4ZEIA 1NNTA 2B3FA 1B0HA 3PPOA 2HAVA 5H8SA 4TLMB 4ECFA 1B7HA 2LAOA 2W7YA 3O9PA 4ND9A 2RC7A 1F9BA 4QHQA 5KCJA 2F34A 3N26A 4EDPA 3KN3A 4NF4B 3FJMA 3MVYA 4BDNA 4G4PA 3IOUA 2XX9A 2ABHA 2I4BA 4YB6A 1DTZA 1MM6A 4YICA 4OEVA 3QUFA 5I2NA 1M5FA 3MAMA 4RJZA 1FQFA 3EHSA 3CIJA 2QS4A 3Q28A 3K6WA 3TTRA 5K2YA 3KG2A 1ATGA 1JW4A 3T9UA 1D3KA 3OSRA 1H43A 1NL5A 3SEUA 3TQWA 3O6HA 2Z8EA 5ICTA 4GFRA 1NNKA 2YLNA 4PFTA 5H8FB 3PUYE 4YU0A 5EHSA 2ONKE 4IGTA 4MLQA 4X9TA 3R7XA 3IOTA 3CG1A 1B7ZA 4OYVA 3PUXE 3C32A 5B70A 3PMWA 3N6UA 4LVQA 3Q29A 2DXRA 3S9EA 2RCAA 4O3CA 3QXMA 4LP2B 1Y3PA 3TELA 1O63A 1CB6A 1N04A 2NOOA 1LBCA 3RPWA 1MH4A 3FJ7A 2AL5A 3TKDA 4I1DA 4Q5TA 1UTHA 3LR1A 1NFTA 2HQ0A 4H8JA 2NWJA 1BTJA 1ZBMA 3TAJA 1N7XA 3H3GA 4X1DA 1PBPA 1FTJA 3IL1B 1US4A 3SDFA 2ONSA 1R9QA 1RYXA 3T93B 2V93A 1FQCA 1N3WA 1MH3A 1B3EA 1ZU0A 1B6HA 2Y7IA 3VLVA 3G3KA 5I58A 4NF5A 1B05A 5F7VA 1H3DA 4GL0A 3R26A 3U92A 3FXUA 4EF1A 1HSJA 1RYOA 2O6AA 3CVGA 4FIMA 3TZAA 2VD3A 3RNNA 2X26A 4TOZA 2X7QA 4ZECA 3SEVA 1IUDA 3TDJA 1FQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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