5H8QB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne8324
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
284
structure length
281
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 80
structure length 281
sequence length 284
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qB02
4ZS9A 4X48A 4ZDMA 2Y7RA 3ONMA 3K4UA 5FHNA 3IK6B 4IB2A 5KDTA 1H76A 1MPBA 3K6VA 1B2HA 4OMBA 4FATA 1ZLQA 4GL8A 3CIJA 2QMWA 3EF7A 3FJ7A 1N3WA 5DEXA 5KZTA 1TT1A 3K6WA 4F18A 2Y7KA 1Y3PA 4F2OA 4X9TA 3SERA 5BUUA 2ZYNA 4IO5A 1Y9UA 4G68A 4YKIA 2DWAA 1IEJA 4YKPA 4YMBA 4OEVA 1R1NA 3GLBA 5ICQA 4BDLA 2F78A 1N84A 1IXCA 2QMXA 1SI0A 4UACA 2ONSA 1S7YA 3MPLA 3Q27A 3PPOA 2DXYA 5I59B 2DOJA 1VFDA 3UORA 5DYHA 4DXUA 3TMGA 1ANFA 4DE8A 4JWYA 2O7IA 5JEIA 3RT8A 2FYIA 1I6AA 4LQ2A 4G4PA 1JVXA 3MBPA 1B5JA 1I6QA 4BDQA 4OFJA 2PBWA 2P1SA 4HCYA 4UA8A 4ELRA 1VFEA 3FASA 2VD2A 3OELA 2QJEA 5B7DA 1N76A 3SDFA 5HM4B 4PQJA 4KPTA 1QW0A 4ISUA 3DLNA 3KGCA 1UIVA 1UTHB 1MRPA 1Y1ZA 1XHYA 3N5LA 5TP9B 2H25A 1B7UA 3C9HA 1MQGA 1US4A 3OMBA 4F19A 4IY5A 5KDTB 3PPPA 3PUZE 3LSXA 3K02A 5H8FA 3K01A 4ZZAA 1OMPA 2V3TA 3CVGA 3I6VA 3M3LA 1BP5A 2RKMA 1MPDA 3PMVA 3GBAA 3G7WA 3OENA 5AA4A 2PYYA 1B3FA 1HSEA 1NNFA 1MY2A 4DIGA 3DELB 3SEXA 1F9BA 3TQWA 4EUOA 3EHTA 2ZYMA 3KJTA 1A40A 4N6PA 5CI5A 1B5IA 5HBCA 4Q30B 2XXUA 1NNKA 4WXJA 1VR5A 5CBRA 3FVKA 2HCAA 3OEMA 4N13A 2G93A 4OQOA 2I3WA 1OIBA 3TEPA 3B6QA 3C36A 1A7LA 3FATA 1PBQA 4OESA 1FQFA 1M5DA 1MY4A 1PEBA 3W9WA 3Q26A 3K0VA 1LB8A 2UVGA 4KYDA 3ODBA 4H65A 3QUJA 4U1OA 3TTMA 3SKPA 3A3CA 3U1OA 5BWJA 2UVHA 3MC2A 3Q25A 4OEUA 4EQBA 2Q2AA 4RJZA 3IX1A 1FQEA 2ZYOA 1US5A 3VLVA 3OO8A 4QFNA 4HW8A 1JNFA 2CZLA 1B3LA 1QJMA 4Q5TA 5H8FB 4H1XA 3RY3A 1DTGA 2AL4A 3TDJA 2XXIA 1MXXA 3G3KA 5EYFA 3GZGA 1LB9A 4TQUQ 3TODA 1B7ZA 1NH8A 3K00A 3QIMA 3MJNA 2I48A 3L6HA 3JZJA 3UA8A 1B05A 2XD2A 4R6HA 2GHAA 3ZKKA 1TFDA 4GF8A 3SEVA 1LSTA 4C1TA 4MLQA 5FTHA 3CG3A 3ILTB 2ONKE 3KSXA 4U2RA 1Y1MA 4JWOA 1ATGA 1B1HA 4EF2A 5FTIA 4Z7EA 2V84A 4LZ7A 2PT1A 3N6UA 3T22A 3N26A 2REGA 1LFHA 2AL5A 2GHBA 1LBCA 4NWDA 2IA4A 2RCBA 1P1UA 5ISUA 1MQDA 3TZAA 1II5A 3MVWA 4DLDA 3PU5A 3IJXB 3TCFA 1SYHA 1Y3NA 3PUXE 4G8HA 4NF4A 3G3GA 4H8IA 3IOWA 2F97A 3SEYA 4DCXA 2NOOA 4MFIA 5JTYA 2OBGA 1FCKA 1PDAA 5I2KB 4OETA 4OHNA 1Z7NE 1IXGA 1JETA 3MVYA 3C4MA 4AB5A 2YLNA 3RT6B 4M1VA 2QS4A 3CG1A 4R2BA 3N94A 4AQ4A 5L9MA 1I6BA 4G2ZA 4E0XA 4ZE9A 2XXPA 3CR9A 4NF8B 4NF6A 3FGSA 4NWCA 2YJPA 2HZLA 4ELPA 1FTMA 3KSJA 1OQHA 4KCCA 3VVDA 4G77A 1USYH 4ZEBA 4R72A 1AMFA 2DE4A 1IIWA 3O97A 4RPOA 4THIA 1ZMGA 1OLCA 1SQYA 2HFBA 2F7BA 5TPAA 4O3CA 3FXRA 3S2VA 1ZBMA 1N3XA 1DTZA 2E0SA 1GTKA 3ZKLA 2DYXA 1Y4TA 3IAZA 3OO7A 1YAEA 3UIFA 2Q2CA 3FUZA 4P11A 1NFTA 3MQ9A 3CFZA 2ABHA 3ECRA 4NEDA 2H4IA 1WDNA 4R75A 4YAHX 2PMSA 1IZ1A 4BDRA 2UVIA 2ZMBA 3O6GA 4FJPA 4NF5A 3H6UA 4GFRA 1B51A 4MBPA 4DDDA 5L9SA 4X1DA 4C1UA 4H5GA 5H8SA 3WAFA 1H3DA 2V3QA 3MVZA 2A5TA 2V25A 4NTLA 1XT8A 1TXFA 1XS5A 2REJA 1SW2A 2VOZA 3KZGA 5I56A 3FVGA 1RYXA 1BLFA 3CI8A 1LGBC 3B7DA 3FXUA 3M3KA 4OFLA 5DTBA 4GLIA 3E13X 1QVSA 2F6GA 1BTJA 1MQIA 2HZKA 3G3HA 3RLFE 5LOMA 4QRZA 2W7YA 3S9MC 5H8HA 3BKIB 1B4HA 3FV1A 4YMAA 1LBBA 3E4RA 3O28A 5CRYA 4F39A 4LUBA 3M8UA 4LZ5A 2O51A 4IO6A 1B32A 4IO2A 3U72A 1PB9A 4BDOA 5TU0A 2UYFA 4QF9A 3L6GA 5CMBA 4KCDA 2B65A 3WAEA 1SBPA 2I0CA 1NNPA 4PFWA 2H98A 2DXRA 4WKMA 4RY1A 3V83A 1MM7A 4GXAA 1MY0A 1O63A 5IKBA 3TKDA 5AA3A 2ALUA 3MPKA 4H8JA 3BFTA 2UYEA 4RK2A 5ITOA 3KN7A 3M3FA 4PFUA 1MY1A 4R9GA 1SI1A 5I57A 3GBBA 3RTWB 2DWHA 2A5TB 4OXVA 1EZOA 2OLBA 2I58A 1MXVA 1L5TA 1AIVA 4NMYA 5L8DA 4ESXA 4LVQA 1ZKBA 4QHQA 5I56B 2F7AA 2RC8A 3VXCA 4IO4A 4F1UA 5DEXB 2OZZA 4QSCA 3DM0A 4M4GA 5EHMA 4ZEKA 2OWSA 5I2NA 4JB7A 3W9VA 5B70A 1N0TA 2Y7PA 4G68B 2F5XA 2E1SA 3K1PA 4C0RA 1B7HA 1UTBA 5CMMA 2XXWA 4MH5A 3IL1B 4FEDA 1PB7A 4RYAA 1BKAA 2H9BA 1MDQA 1MPCA 2OJTA 2DSFA 2B3BA 4LA9A 5M2VA 4DXCA 3IOUA 3V89B 1EH3A 2Q8JA 1BIYA 4U21A 2IEEA 1MG1A 2A5SA 4QFKA 2XX7A 1YCJA 4YKKA 1MDP1 3T9UA 4I62A 3PV0E 3KN8A 4HS7A 1MH4A 4JXIA 1GGGA 2XXYA 4IO3A 4HTGA 2F7CA 1OVTA 1JW4A 2X26A 2VHAA 2HAVA 4NE4A 4DCYA 2Z8EA 5I84A 3T9XB 4RA1A 2HQ0A 1SW1A 3O6IA 5CM6A 1ZJLA 2WKYA 3VV5A 1OQGA 1B0LA 2DVCA 2ZYKA 3AXFA 4F3BA 3JV9A 3EN3A 1QULA 4N07A 4PFYA 4GXSB 1IXIA 1FTLA 4POXA 2QS3A 3ZS6A 5KCJA 4XXUA 2UXAA 2R71A 2QS2A 3C33A 4ESWA 1B6HA 3HN0A 3D4CA 4U23A 4F3PA 5CMCA 2RC7A 5EHSA 3S9LC 3B6TA 5ITPA 4ONYA 5AA4B 4GL0A 1MXUA 5JK4A 4KR5A 3ZSFA 4BDMA 4R9FA 3EHUA 5DVIA 3K1MA 3PPRA 2LAOA 3H6TA 4H0WA 3U93A 3IB1A 3FV2A 1H43A 1JQFA 3TTNA 4EDPA 3MW0A 1B40A 1B46A 4OWDA 1S9TA 2OK2A 3FVOA 5F1QA 1URDA 3FIRA 2DWJA 3CFXA 3T9VA 3HPIA 2QPQA 1FQDA 1Y3QA 2XX8A 4F1VA 1MY3A 3A09A 3THIA 2VD3A 1AH5A 1POY1 2FA7A 3SEWA 3MAMA 4JDFA 4Q0CA 2O7UA 4MLVA 4R6KA 1B3EA 2NXOA 1FTKA 3H7MA 3KBRA 3TTKA 3TUSA 3FJGA 3OD7A 1MXWA 3K6UA 3TQLA 2D5WA 4KFQA 2V3UA 1D4NA 1XOCA 3CFLA 1AOVA 3TAJA 2NWJA 2M8CA 3IJOB 3IOTA 1PBPA 4R2FA 3PGFA 3C31A 5KCJB 1J1NA 4YB7A 5DVJA 4FAJA 2O1MA 3S9NC 1TFAA 4GIZA 3KEIA 2R9JA 4DXBA 3MP8A 2H5YA 1QUIA 1JW5A 1UIUA 1A55A 1QKAA 4QFPA 3MWBA 2O69A 1B9JA 3QAXA 2P2AA 4GVOA 3O66A 4ZZEA 1I69A 4TLLB 1LAHE 4I1DA 4XKNA 3LC8A 3RQTA 1A8FA 3GXAA 4QFLA 5AA2D 1LFIA 3RUMA 3Q29A 1XVYA 4IGRA 2O84X 3K2DA 2F6PA 1MXZA 2Q9TA 4JWXA 4F3GA 3HHGA 4KQPA 4YB5A 3KJ7A 3KFMA 1B5HA 2B3FA 4XKPA 1Q35A 2XXTA 1QKBA 3LSFB 3D4GA 5AE4A 3SEUA 1SD3A 4O3AA 5AA1A 4U1ZA 3C32A 1R9LA 4F3SA 3UGWA 4KYSA 4NF4B 4G8MA 4FE8A 1M5BA 1M5FA 3C34A 3DP6A 3VFJA 4GD5A 3R26A 2Q89A 4EF1A 5JTYB 3USDA 3EHSA 5A5XA 3JYRA 1IUDA 3IO6A 1LCFA 2YPNA 4POWA 2DE3A 3U8QA 1RYOA 3BBRA 3ILUB 1MM6A 4H5FA 4O3BA 1OVBA 1EU8A 2FNCA 1N04A 5TP9A 3G3JA 2R6GE 2UVJA 1YTVA 3MZBA 3TFLA 1NL5A 4P0IA 4NF6B 1LAFE 3IORA 4ELOA 2RINA 1A54A 4I8CA 3CSGA 1Y4CA 2ZNSA 1MH3A 3PUVE 1IITA 3V8XB 1NNTA 4XKRA 2DP8A 3VVFA 3MZ1A 4BLAA 4GQOA 3C35A 3H3GA 3IO4A 4LONB 2XXVA 1ZTYA 2HXWA 3U94A 2QSXA 5K2YA 4YICA 3S9EA 5TPAB 1LAGE 2Y7WA 4H67A 2KLFA 3G3IA 1TWYA 1B4ZA 2V93A 3PPQA 4Z0IA 3O6HA 1P1NA 1B58A 5F7VA 1FW0A 2PT2A 3I5OA 1D9YA 3FVNA 1QUJA 2HEUA 3VDFA 1FQAA 3IB0A 2ANJA 3O9PA 3A3UA 1D3KA 1CE2A 3TCHA 4WEDA 1B1XA 4K3FA 4QFOA 4OTEA 5HPQA 4ECFA 2QS1A 2PX1A 3TPAA 2ESNA 1MQJA 3QSLA 2I4BA 4OVJA 3KN3A 4KHZE 2I6EA 1EZPA 3V5AA 4EXKA 4TLMB 1B0HA 4NF5B 5CBSA 3PUYE 5A5XB 4Q8RA 2RF1A 1DPPA 1XC1A 1JW1A 3OXNA 3PMWA 3VLWA 2XXRA 4R74A 3TTLA 2HAUA 1B3HA 3LUYA 4GRKA 3IR1A 4XIGQ 1NKXA 4JBZA 1A99A 3PD9A 1R6ZA 2ZXTA 4TOZA 4FEBA 1FQBA 1P1OA 4IGTA 5ICTA 4KD5A 4OFOA 4WEPA 1P99A 3T66A 4E0WA 3F11A 3VE1B 5H8HB 2RC9A 3RTFB 2Z8FA 3KOTA 1MXYA 4KI0E 1SDXA 5IAIA 4F31B 3K1NA 2QRYA 3OOAA 4FIMA 3T96B 2THIA 1VE4A 1UQWA 5ELVA 1JEUA 2I4CA 3PD8A 5K2XA 4LQ5A 3FZVA 4U4SA 3VVEA 4F22A 3LBSA 4BDNA 1Q1KA 2AYSA 2I3VA 2PVUA 3KG2A 2O6AA 1LAXA 1LFGA 3OSRA 4HCWA 4U4XA 4ZEDA 1MS7A 4F29A 2ONRA 2NUVA 4X1BA 1ELJA 1PB8A 4OERA 3B6WA 3FD3A 4MF3A 1HSJA 5I58A 2XXXA 2DQVA 4KYEA 2I49A 3MP1A 4U22A 1R9QA 2GH9A 4R73A 1T0KA 4OZ9A 3R7XA 2OWTA 3HHFA 5I57B 3HSTA 5AA2A 1SW4A 1YPNA 3R6UA 5DT6A 1SVXB 2GRVA 2X7PA 4EQ9A 1VSOA 2XX9A 1JEVA 3TTRA 2Z23A 3LSLA 3W15C 3DP8A 1M5EA 4XTCQ 1QUKA 1RKMA 1FQCA 3BFUA 4G68C 3TELA 5I2NB 3O2AA 3UP9A 3RN8A 1B52A 4JSDA 4YB6A 3OEKA 4P0GA 1LLSA 4FORA 1O64A 4JSOA 2D3IA 5I2KA 1UTBB 4ZEIA 3CRBA 4RK9A 2H99A 3P7IA 3MVXA 4PFTA 4AB6A 1D9VA 2BJJX 3MUQA 1A8EA 2Y84A 1P1QA 3E9XA 5H8QA 4NF8A 4GOTA 3EQ1A 4PE5B 4IY6A 2QL3A 1USYE 3HO7A 3HCQA 2G29A 3H6WA 4YZZA 1KWHA 1B3GA 3VLUA 1Y20A 3QUFA 2F8DA 3T93B 2DE2A 1XVXA 2VP1A 3FJMA 3TYHA 5FHMA 4ELQA 5I58B 1JVYA 2F34A 1H44A 3RNNA 1ZIUA 2D21A 1ZU0A 1DMBA 1LCTA 3H6VA 2RCAA 1SYIA 3K6XA 3PMXA 4L17A 3N6TA 3OO6A 5AA2B 4F1YA 3EPEA 1P1WA 5H8NA 3VXBA 1GV8A 4RXLA 4GWOA 1N7XA 3MP6A 1S50A 3H4ZA 3H06B 2DVZA 3MZ9A 2Y7IA 4F2QA 2X7QA 2XXHA 1POTA 4R6YA 1AL3A 3FXQA 1DSNA 1M5CA 3IOVA 5J1DA 4H6DA 4EQ7A 3QYTA 2Z22A 3UK4A 1SW5A 3U92A 2I0BA 3UN6A 1FTJA 3PPNA 1PC3A 3HV1A 4LP2B 1NH7A 3E3KA 3T9HB 1N7WA 4ZE8A 4LATA 1URGA 2F35A 3IB2A 3S4UA 4ZEFA 5FHOA 1H45A 4ND9A 1URSA 4RPNA 3OSQA 2OCUA 4RNSA 1WODA 5H8QB 4FECA 3KOSA 2P0SA 3I3VA 1OLAA 3RPWA 5L9OA 3RGYA 2NVUB 1GVCA 1DPEA 2DS9A 3SESA 1GR2A 1CB6A 2CMOA 2XHDA 2XXQA 3H03A 4IO7A 4LZ8A 4OYVA 1DOTA 4DZ1A 4G8NA 1EZ9A 1IXHA 2Z8DA 2O68A 3DP4A 3O29A 3G3FA 3LSWA 3LR1A 1HSLA 5CC2A 2ZNTA 2ZNUA 5I59A 2DWIA 4YKJA 2GFEA 5DVFA 1MQHA 1WVJA 4QSEA 3CSBA 4ZECA 5H8NB 1O7TA 2Q88A 1IQ7A 2VGQA 5CMKA 3QK6A 2O1LA 4OENA 4XKQA 1FTOA 4QSDA 4YU0A 1Z7ME 2XD3A 3Q28A 1NMUA 2F36A 3QXMA 4EXLA 4PP0A 4I9DA 3OO9A 3TCGA 2AIXA 3PUWE 3SETA 1UTHA 4PETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2RKMA 1MPDA 2P3NA 3RPLB 3PMVA 4N8YA 4PTKA 3GBAA 3G7WA 3OENA 2JJKA 5AA4A 2PYYA 1B3FA 1HSEA 4NX1A 1NNFA 1MY2A 4GWUA 4DIGA 3ISPA 3DELB 3SEXA 2BJIA 1F9BA 3TQWA 2WYPA 4EUOA 3EHTA 2ZYMA 3KJTA 1A40A 1LBVA 4N6PA 5CI5A 1B5IA 5HBCA 4Q30B 2XXUA 1NNKA 4WXJA 1VR5A 5CBRA 3FVKA 4PFBA 2HCAA 3OEMA 4N13A 2G93A 4OQOA 2I3WA 1OIBA 1NUZA 3TEPA 3B6QA 3C36A 1A7LA 2FIXA 3FATA 1PBQA 4OESA 1FQFA 1M5DA 1MY4A 1PEBA 3W9WA 3Q26A 3K0VA 2WBBA 1LB8A 2UVGA 4KYDA 4H65A 3QUJA 4U1OA 3TTMA 3SKPA 3A3CA 3U1OA 3NOHA 5BWJA 2UVHA 3MC2A 3Q25A 4OEUA 4EQBA 2Q2AA 4RJZA 2XWKA 3IX1A 1FQEA 2ZYOA 1US5A 4GWYA 4O7IA 3VLVA 3OO8A 4QFNA 4HW8A 1JNFA 2CZLA 1B3LA 1QJMA 4NHBA 4H46A 4Q5TA 5H8FB 4I3YA 4H1XA 3RY3A 1DTGA 2AL4A 1K9YA 3TDJA 2XXIA 1MXXA 3G3KA 5EYFA 2PCRA 1FPBA 3GZGA 1LB9A 3KBZA 4TQUQ 3TODA 2VPNA 1B7ZA 1NH8A 3K00A 3QIMA 5I5PA 3MJNA 2I48A 1QGXA 3B50A 3L6HA 3JZJA 4OA4A 3UA8A 1B05A 2XD2A 4R6HA 2GHAA 3ZKKA 1TFDA 4GF8A 3SEVA 1LSTA 4C1TA 4MLQA 5FTHA 3CG3A 3ILTB 2ONKE 3KSXA 4XEQA 4U2RA 1Y1MA 4JWOA 1ATGA 1B1HA 4EF2A 5FTIA 4Z7EA 2V84A 4LZ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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