5I2KA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 85

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (61-73)S1 (7-12)AH2 (97-104)TVIa1 (15-18)S5 (76-81)TVIII2 (105-108)TVIII4 (206-209)S4 (51-59)EMPTYTII'1 (32-35)TIV5 (45-48)TIV4 (43-46)AH10 (270-279)AH9 (254-268)S7 (94-96)AH6 (182-188)TIV7 (90-93)S6 (89-91)TIV6 (82-85)TIV14 (238-241)S8 (109-110)TIV12 (232-235)TII'2 (233-236)S9 (115-116)AH3 (118-122)S16 (247-249)TII2 (249-252)TIV13 (234-237)S10 (124-126)TII1 (225-228)AH7 (196-205)S11 (131-140)TIV9 (140-143)TIV10 (146-149)AH4 (151-154)AH5 (172-180)TI1 (147-150)TI2 (155-158)TVIII3 (157-160)3H1 (189-191)S13 (210-214)AH8 (215-224)S14 (230-232)TIV2 (24-29)S15 (239-244)TI3 (156-159)S12 (165-166)S3 (36-43)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 85
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA02
2O7IA 4ESWA 1ATGA 1H43A 2F7CA 3VVEA 1LGBC 3TCGA 4G8NA 3TAJA 3MVWA 4EXLA 3FIRA 3ODBA 1Y1MA 3T9XB 3O28A 4RY1A 3TQLA 1USYH 1MXUA 1TFDA 1LB9A 1DTZA 3IO6A 1A8FA 1B32A 4MF3A 5L9MA 4ZEKA 1R9LA 3FVKA 1HSEA 1M5CA 2V84A 3TTKA 2G29A 3KSXA 3TPAA 3MC2A 3PGFA 5CMMA 3TODA 5A5XA 1OIBA 3S2VA 4LONB 1AOVA 4ELRA 4QSEA 5AE4A 5KZTA 3IAZA 3V8XB 2Y84A 2NOOA 1HSLA 3CVGA 2DXRA 3MAMA 3DP4A 1IEJA 4XKRA 1TFAA 4R9FA 4BDQA 2HCAA 1Z7ME 5CM6A 1B40A 4GXAA 3L6GA 3RTWB 4OEUA 4ONYA 1OQHA 4F3BA 2DXYA 5TPAB 3TTRA 4IY6A 2RINA 1SYIA 1UIVA 4PFYA 1MXYA 4UACA 2F97A 3A3CA 3FVNA 4OFJA 1PB8A 4Q8RA 4PP0A 5BUUA 1VR5A 5AA4A 1CB6A 1Z7NE 3KG2A 3K6UA 5L9OA 2ONRA 4DE8A 1B3GA 4Q0CA 2F7AA 3VDFA 2O68A 3LBSA 3F11A 2I6EA 3OEKA 4F3GA 3WAFA 3FATA 3Q25A 4NF6A 3BBRA 3HPIA 3H6TA 4NF5B 3RGYA 3E13X 4ESXA 1UIUA 2QSXA 1ZKBA 5JEIA 2W7YA 3O66A 4NF4B 4JWOA 2XXUA 4RPOA 4QHQA 4X9TA 4JDFA 2Y7PA 2XXHA 2ESNA 3G3HA 3HO7A 1VFEA 1UTBB 4N6PA 3PUZE 4YKJA 4Z7EA 2O1MA 5H8SA 1NNFA 3KN7A 3IO4A 3M3KA 1B7UA 3UP9A 1I6AA 3HSTA 2HFBA 2QMXA 3O6IA 3G3GA 3MP1A 4H6DA 1B4HA 4IO6A 3UA8A 4HTGA 5ITOA 3DP6A 3MW0A 1B0LA 1F9BA 4NF8B 3U1OA 1N0TA 3U72A 1POY1 4KD5A 2UXAA 3N94A 4F19A 4FEBA 2NWJA 3IJXB 1NNTA 5H8QA 3I3VA 4F1UA 4KPTA 1NKXA 3FVOA 3TZAA 2V3TA 3RTFB 3B7DA 3MUQA 5I59B 4R75A 1O64A 3FGSA 2Q88A 4E0WA 4HCWA 1JW4A 3VV5A 2HXWA 1LAXA 1GVCA 5FHOA 1JW1A 4I62A 2H5YA 4MLQA 3G3KA 3PUXE 1JVXA 2FNCA 5H8NA 3S9LC 2Z8DA 3FJGA 3FJMA 5B70A 3OD7A 2OK2A 3SESA 4WEPA 2DE4A 5AA2B 3FXRA 4NEDA 5KDTA 1KWHA 2P2AA 4K3FA 1QKBA 4U4SA 3BFUA 4FE8A 1Q1KA 1T0KA 4PFUA 5I84A 3S9NC 4FEDA 4IGTA 2H4IA 1MXWA 4WEDA 1SD3A 1B05A 5CI5A 4H5GA 1WODA 4DXUA 3TEPA 5DVJA 4JSOA 2DWJA 3SEYA 5CBRA 3Q27A 4TLLB 1N3WA 1FQFA 2NXOA 1CE2A 1TT1A 3OO9A 3CR9A 1IITA 4ELOA 2I3VA 2OCUA 3GXAA 1S9TA 4RXLA 1M5DA 5KCJA 1Y4TA 2DE2A 2QS4A 1UTHA 1MRPA 4F2QA 3FXQA 2OWSA 3CFZA 4QSCA 4XKPA 3N6TA 1MY1A 5I56A 1LAGE 3R6UA 5EHSA 5CC2A 1WVJA 3V89B 1QKAA 1MS7A 2AYSA 1MY4A 3K6XA 3IOTA 1LCFA 3CI8A 1D3KA 2M8CA 3MP6A 4OENA 2O51A 4LZ8A 5CMCA 2ZNTA 3EHTA 4KYEA 3CIJA 1OLAA 3M3LA 3U93A 4KYDA 3U8QA 1EZPA 1OMPA 3MWBA 2VD3A 2UVJA 1IXIA 2XX9A 2V93A 5I57A 2THIA 3HHFA 4NWDA 4XKNA 4BDNA 4OVJA 2R9JA 4F18A 4X48A 4OERA 1LFGA 3KJ7A 5ITPA 2YLNA 1AL3A 4I8CA 1OQGA 3U92A 3T9HB 1OVBA 5K2XA 1FQBA 2XXPA 1WDNA 4F3SA 2RCAA 2UVIA 4LZ7A 1SI0A 2WKYA 1B52A 2QRYA 1XVXA 2PVUA 4R74A 3EQ1A 3KN3A 4EQ9A 3VVDA 1MY3A 3KN8A 2I49A 1BP5A 2ANJA 3V5AA 2OWTA 4EQ7A 1PDAA 5CMKA 3GBBA 3K2DA 3QUFA 3TCHA 3H7MA 1JW5A 4FECA 1NH7A 3H6VA 4YMAA 4OTEA 3TYHA 3VE1B 1FTLA 3C36A 1MG1A 3OMBA 2QPQA 1MXVA 2FYIA 3RY3A 4ECFA 3C33A 4RJZA 4ZZAA 1MM7A 3KFMA 1MXXA 3JYRA 5I2NB 1B0HA 4KHZE 4THIA 1MDQA 5K2YA 5AA1A 1B5HA 3USDA 4Q5TA 1PB7A 4IO5A 4YKPA 3T66A 2PT1A 3OOAA 4LA9A 3K0VA 2QS3A 2E1SA 2F78A 2X26A 2AL4A 1JEVA 3LSLA 4YAHX 2CMOA 3O6GA 4F3PA 3C9HA 4IO3A 3VXBA 4F22A 2Q2CA 5H8HA 1LCTA 1N3XA 5TP9A 4MFIA 3VLUA 2R6GE 4H1XA 1OVTA 1B6HA 1ZU0A 3IX1A 1ZLQA 3KZGA 2ZYKA 1NFTA 5IAIA 3MVYA 1Y20A 5L9SA 4YMBA 4U1ZA 2UVGA 3N6UA 3N5LA 1BKAA 4TLMB 3P7IA 1NL5A 1B3EA 2NUVA 1DSNA 1B9JA 3OO7A 4F39A 3A3UA 4R2FA 2QL3A 4ZEIA 4DDDA 3MJNA 4MBPA 3VFJA 5DEXA 3IB0A 3SEVA 3CG1A 5I2KB 4GWOA 3MZ1A 1O63A 1B46A 4JWXA 2UYEA 5H8FB 2H99A 1SI1A 3PU5A 4O3AA 3FVGA 4ZE8A 4ZE9A 4DCYA 1R9QA 4GF8A 1JVYA 4H0WA 3PMWA 4EF2A 3PD8A 4RA1A 3O97A 1N84A 1FQEA 1N7XA 2DYXA 1LFIA 2A5TA 3CSGA 2Q2AA 1B3HA 1B3FA 1LSTA 3T9UA 3GBAA 4X1DA 4O3BA 3B6QA 2F36A 2PT2A 3E9XA 2P0SA 3TELA 4EQBA 2RC7A 4G68B 3RNNA 3SERA 5HPQA 2F6GA 1PBPA 1B1XA 3IK6B 1NNKA 1VE4A 3U94A 1YAEA 3M3FA 1ZTYA 4HCYA 1YCJA 1POTA 3PV0E 1URSA 3KOSA 2O69A 4ZECA 1US5A 5F1QA 1IXGA 1SBPA 2PX1A 5CMBA 3K01A 1SYHA 3CRBA 4QFKA 3C35A 4PE5B 2B3BA 1S50A 1QULA 2Z23A 4PETA 4FIMA 3TQWA 2KLFA 4EUOA 1P1NA 1H44A 4YKIA 2HAUA 1EZ9A 1B4ZA 3PPRA 4DCXA 2QS2A 1IQ7A 4KFQA 4C1TA 4DZ1A 3T9VA 4G8MA 3LUYA 3TCFA 5DVIA 4GXSB 1A99A 1SW1A 3ZS6A 1GGGA 1MY0A 3ONMA 1RKMA 5LOMA 4MH5A 3FXUA 3I6VA 4UA8A 1MH4A 5TPAA 5CRYA 5I58B 3M8UA 4X1BA 4FJPA 4G4PA 4MLVA 1ELJA 1MPBA 1SW2A 3E4RA 3V83A 3N26A 1EH3A 3GZGA 2AIXA 3K02A 5L8DA 1PBQA 2ZNUA 1MDP1 4U22A 1H3DA 1GR2A 4JSDA 2IA4A 3KOTA 3K00A 2OLBA 1Q35A 2DVCA 4KQPA 4ZDMA 1EU8A 3G3IA 4DXCA 4Z0IA 1DPPA 5ISUA 2O1LA 3OSQA 4PFWA 3RQTA 2R71A 3SKPA 2XHDA 4NF5A 1YTVA 1XHYA 4PFTA 2I4BA 5B7DA 3T93B 3LSXA 1YPNA 2X7QA 1AIVA 4RPNA 4QFLA 5ELVA 4M4GA 4RK9A 3KBRA 3W9WA 2YPNA 3UGWA 3C4MA 3EHSA 3H3GA 4TOZA 1Y3NA 3QSLA 1AH5A 4KYSA 1VSOA 3ZKLA 4U21A 2XXIA 5AA3A 3TMGA 2ONSA 3FJ7A 1RYXA 1UTBA 2Z8FA 2RC8A 3RLFE 3UK4A 3W15C 4JWYA 4KCCA 3ZKKA 1LBCA 3RT6B 1IXHA 2F7BA 3VVFA 3HHGA 1N76A 4IB2A 3DM0A 1GV8A 3EPEA 4R6HA 5ICTA 1MQIA 3HCQA 1R6ZA 3K4UA 2V3QA 4GLIA 1BIYA 2OBGA 1SVXB 4IY5A 2ZNSA 2V25A 1UQWA 2YJPA 1XVYA 1FTJA 5JTYA 2OZZA 2Y7WA 4NF8A 3AXFA 3OEMA 3G7WA 4YB5A 2QJEA 3HN0A 3L6HA 3LR1A 1JQFA 1R1NA 1ZMGA 2VGQA 5A5XB 5FTHA 4NMYA 3PMVA 1ZJLA 4BLAA 1NNPA 2FA7A 4N13A 4M1VA 3JZJA 3PPNA 3Q28A 4XTCQ 4ZS9A 3ECRA 3IB2A 4F2OA 1B2HA 3TTNA 4IO4A 1B51A 4YICA 3TKDA 1US4A 2PMSA 4YB6A 2XD3A 2DS9A 5AA2A 4RNSA 1B5JA 1EZOA 2ZYOA 4IGRA 5DTBA 3O9PA 1MPDA 1A7LA 3K1MA 4ZEDA 2E0SA 1DMBA 1O7TA 4TQUQ 1P1WA 5AA4B 4OWDA 1QUKA 1D9YA 4LQ5A 3A09A 2H9BA 3MVXA 4OESA 4GFRA 5TU0A 3MP8A 4U2RA 1IZ1A 1HSJA 2VOZA 4AB6A 4FATA 4AB5A 2H25A 1OLCA 1Y4CA 1JNFA 2BJJX 4G2ZA 4O3CA 1BTJA 5M2VA 1B7ZA 3MBPA 4NF6B 2I4CA 4DXBA 3I5OA 1M5EA 1LFHA 4R72A 4QFOA 3GLBA 2PYYA 4Q30B 2G93A 4LP2B 3LSWA 4JXIA 3RPWA 2XXQA 3PUVE 1Y3PA 4LZ5A 2I3WA 2DWAA 3Q29A 3Q26A 2D5WA 2ZMBA 2ZYNA 2HEUA 2QMWA 3OSRA 1B1HA 2GFEA 3H4ZA 4LVQA 1QVSA 3OXNA 3PPPA 1N7WA 2XXVA 2HQ0A 1A40A 3K6WA 3TFLA 4G77A 2XXWA 4ZZEA 3HV1A 3EF7A 2RC9A 2DP8A 4OMBA 3ZSFA 1URGA 1SQYA 2F8DA 1FQDA 5EHMA 1PEBA 3G3FA 1P99A 4YU0A 1A54A 1H45A 1A55A 3OO6A 1P1QA 5ICQA 2REJA 4BDMA 2Y7RA 4QFPA 2RCBA 3OELA 5H8QB 4F1VA 1XT8A 1DTGA 1A8EA 2I48A 3C32A 3FZVA 4OFOA 1VFDA 2DWIA 3WAEA 3OO8A 4R2BA 5F7VA 3SEWA 4POWA 2Q89A 4DLDA 4RYAA 4XIGQ 3LC8A 3S9EA 1NMUA 2I0CA 3UIFA 1FW0A 1XC1A 3IORA 4GL8A 1M5BA 1FTMA 5HM4B 5H8NB 4GOTA 1IXCA 3TUSA 4FAJA 3E3KA 4XXUA 2B3FA 3PPOA 3D4GA 3C34A 2I58A 1FTOA 1N04A 2Q9TA 3IOUA 4OHNA 5KDTB 4HW8A 2Z8EA 1Y9UA 4QF9A 3UN6A 1P1OA 1FCKA 4E0XA 2OJTA 3QAXA 1MXZA 4ELQA 3FUZA 4ELPA 4H67A 3PD9A 1LAHE 3MQ9A 2A5SA 2GRVA 2Y7IA 3DP8A 2F34A 4P0GA 4F1YA 4P0IA 3OENA 1PB9A 1QW0A 4ZEFA 1XOCA 4KCDA 5I2NA 4U4XA 1MH3A 3K1PA 4NTLA 1B7HA 1MQGA 2XXTA 3EHUA 1BLFA 2VP1A 5KCJB 3IOWA 4QSDA 4OXVA 1B58A 1QUJA 1UTHB 3VXCA 3UORA 4LQ2A 4R6KA 3VLWA 3FV2A 1NH8A 1MY2A 3O2AA 4P11A 3SEXA 4H8JA 3TTLA 2XD2A 2I0BA 3MVZA 1FQCA 5I56B 4OEVA 4G8HA 4BDLA 4C1UA 1MQJA 4H65A 4NWCA 3S4UA 4C0RA 3KJTA 3IL1B 3CFLA 1L5TA 3IR1A 3IJOB 1I69A 4OYVA 1LBBA 4GIZA 1QUIA 5JTYB 4F31B 5J1DA 1J1NA 3ILUB 1D9VA 4OETA 1LLSA 2ALUA 2XX7A 3ILTB 2F6PA 1I6BA 2Q8JA 3D4CA 1SDXA 1QJMA 2PBWA 5HBCA 4RK2A 3QYTA 3THIA 5I2KA 5JK4A 5I57B 3PPQA 3CSBA 4ND9A 1Y1ZA 4R73A 3JV9A 3RUMA 5H8FA 5BWJA 3PMXA 3MPKA 3TTMA 1SW4A 1LAFE 3DLNA 1B3LA 2RKMA 3K6VA 4GL0A 4LUBA 4L17A 3LSFB 2VHAA 4HS7A 3QK6A 4H8IA 3EN3A 2CZLA 1TXFA 3PUWE 4GQOA 3BFTA 2REGA 4G68A 3S9MC 2GH9A 3G3JA 1IUDA 3KEIA 4NE4A 2DOJA 4OZ9A 4YZZA 3O29A 5IKBA 4NF4A 2LAOA 3MPLA 4ZEBA 4I9DA 4PQJA 3QIMA 4KR5A 3KGCA 2ABHA 2H98A 4QRZA 3H6UA 3FD3A 4EXKA 3RT8A 4WKMA 2UYFA 2NVUB 1URDA 5AA2D 3TDJA 1JETA 1ZBMA 3QXMA 1AMFA 4GRKA 1FQAA 4JBZA 1RYOA 2QS1A 2D21A 4JB7A 4LATA 4N07A 1USYE 5FHMA 4GD5A 4BDOA 5DYHA 3B6TA 1DPEA 1Y3QA 2XXRA 2IEEA 4QFNA 4AQ4A 3IOVA 2O7UA 3KSJA 3SETA 2DWHA 4R6YA 3MZ9A 3SDFA 3H6WA 1MPCA 2RF1A 4U23A 2AL5A 2X7PA 3MZBA 5H8HB 2ZYMA 3FASA 1TWYA 2B65A 3R7XA 1GTKA 5TP9B 3H06B 2DE3A 5EYFA 1S7YA 3DELB 1LB8A 1SW5A 2HAVA 2ZXTA 1MM6A 2XXYA 5I59A 2HZLA 1P1UA 1D4NA 2VD2A 1PC3A 4IO2A 1I6QA 4KI0E 2F5XA 4R9GA 3CFXA 2DQVA 4F29A 4YKKA 3SEUA 5I58A 3CG3A 1H76A 4WXJA 4I1DA 2F35A 4H5FA 5DVFA 5DEXB 3K1NA 2V3UA 2GHAA 1XS5A 2Z22A 3C31A 3BKIB 4OFLA 5FHNA 5CBSA 2DVZA 3W9VA 3R26A 4EF1A 1ZIUA 2XX8A 1JEUA 2UVHA 3FV1A 1FTKA 4OQOA 3T96B 4ISUA 3B6WA 2XXXA 2HZKA 3IB1A 1II5A 1M5FA 2ONKE 5DT6A 2DSFA 2A5TB 4FORA 3QUJA 2Y7KA 3PUYE 3H03A 2O84X 1MQDA 3RN8A 2GHBA 2O6AA 4XKQA 3T22A 5FTIA 4EDPA 1ANFA 1IIWA 2P1SA 3VLVA 4YB7A 4DIGA 1DOTA 1B5IA 4G68C 4POXA 4BDRA 1MQHA 4GVOA 2D3IA 4U1OA 4IO7A 3O6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N6KA 4GWWA 2O7IA 4ESWA 1ATGA 1H43A 2F7CA 3VVEA 1LGBC 3TCGA 4G8NA 3TAJA 3MVWA 2Q74A 4EXLA 3FIRA 3ODBA 4GWSA 1Y1MA 3T9XB 1INPA 3O28A 4RY1A 3TQLA 1USYH 2R8TA 1MXUA 1TFDA 1LB9A 1DTZA 4N91A 3IO6A 1A8FA 1B32A 4MF3A 5L9MA 4ZEKA 1R9LA 3FVKA 1HSEA 1M5CA 2V84A 3TTKA 4P9KA 2G29A 3KSXA 3TPAA 3T1BA 3MC2A 3PGFA 5CMMA 4LN5A 3TODA 5A5XA 2QVVA 1OIBA 1RDZA 1YXIA 3S2VA 4LONB 1AOVA 4ELRA 4QSEA 5AE4A 5KZTA 3IAZA 3V8XB 1CNQA 2Y84A 1NV5A 2NOOA 1HSLA 3CVGA 2DXRA 3MAMA 3DP4A 1IEJA 4XKRA 1TFAA 4R9FA 4BDQA 4O94A 2HCAA 1Z7ME 5CM6A 1B40A 4GXAA 3L6GA 3RTWB 2WBBA 4OEUA 4ONYA 1OQHA 4F3BA 2DXYA 5TPAB 3TTRA 4PGPA 4IY6A 2RINA 5I7IA 1SYIA 1UIVA 4PFYA 1MXYA 4UACA 4FBPA 2F97A 3A3CA 3FVNA 4OFJA 4GWYA 4OVPA 1PB8A 4Q8RA 4PP0A 5BUUA 4PBHA 1VR5A 1JP4A 5AA4A 1CB6A 1Z7NE 3KG2A 3K6UA 5L9OA 4N6DA 2ONRA 4P56A 4DE8A 1B3GA 4Q0CA 2F7AA 3VDFA 2O68A 3LBSA 3F11A 2I6EA 2WYPA 3OEKA 4F3GA 3WAFA 3FATA 3Q25A 4NF6A 3BBRA 3HPIA 3B8BA 3H6TA 4NF5B 3RGYA 3E13X 4ESXA 4GBWA 4PCDA 5IM2A 1UIUA 2QSXA 1ZKBA 5JEIA 4PFRA 2W7YA 2OWZA 3O66A 4NF4B 4JWOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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