5I2KB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
289
structure length
286
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 79
structure length 286
sequence length 289
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kB02
1PBQA 1MH3A 1B9JA 4RK9A 1CE2A 4YB7A 5CBSA 1B46A 1FTOA 4RYAA 3EHTA 2ESNA 3FVOA 1DTGA 4F3SA 3FV1A 4OHNA 2THIA 3TELA 4UACA 3OO9A 1NL5A 2HAVA 2XX7A 4H5FA 3RTFB 2QS2A 4DCXA 1P99A 4KFQA 3PD9A 2GHBA 4EQBA 4ELQA 5H8NA 4GL8A 4NWCA 1MXYA 3O6IA 4G2ZA 4LZ8A 4KCDA 5TPAB 1USYH 3RT6B 3C36A 4G8NA 2W7YA 1MXZA 1LAFE 4GOTA 1B2HA 4I9DA 3IOUA 3B6WA 3LUYA 4F2QA 4GQOA 1JEVA 2F35A 4LA9A 3VDFA 1FQEA 3BFUA 1OMPA 2A5TB 2QS3A 3LBSA 4OXVA 2ZYKA 3CVGA 4FECA 4P0GA 4X9TA 4EDPA 3GZGA 3MP8A 3THIA 5DVIA 2HFBA 5JTYB 4MH5A 1LSTA 4F1UA 5I57A 2ONSA 4YAHX 4C1TA 3ECRA 2V84A 4MLQA 3PPOA 3R6UA 3HO7A 4QSCA 3W15C 3SETA 2D21A 3VVEA 2O6AA 1LBBA 4OTEA 3SEYA 4R74A 4I62A 3IAZA 3LR1A 4DIGA 2FNCA 4QHQA 3W9WA 3OELA 1URSA 4QSEA 2DOJA 4U21A 3ZKKA 1QUJA 3PMVA 4KCCA 4NMYA 1AMFA 4QFKA 4R2BA 3KN7A 4BLAA 4NF5B 2RF1A 3RUMA 1LGBC 3MPLA 1EH3A 4NEDA 3UORA 2O7UA 4BDQA 2Q2AA 3MP1A 4KI0E 3S9MC 3IB0A 1B05A 4PFTA 1TFDA 4Z7EA 4ZS9A 2O69A 2R6GE 1MQJA 3PV0E 2FYIA 1FTLA 4QFNA 2YPNA 1BKAA 3OMBA 5A5XA 3TTNA 4IO3A 4DZ1A 1B52A 1US5A 3ILUB 2Y7RA 4F2OA 3T9UA 1POTA 1SI0A 3IORA 1LBCA 2PVUA 2I4BA 1NH7A 2XD2A 4HS7A 4XKRA 4E0XA 5H8HB 1EZOA 4H1XA 1N3XA 1M5EA 3VE1B 3I6VA 3KBRA 3FV2A 2Y7WA 1S7YA 3G3JA 3I3VA 4H65A 3SEXA 5K2YA 4BDNA 2Q89A 2XXTA 1M5DA 3QK6A 3T96B 4JDFA 4YU0A 1PB8A 3K6XA 3S9NC 2NXOA 1P1NA 3QUJA 5TP9A 3MVYA 4OEVA 2NUVA 3MQ9A 1B51A 1Y4CA 4OENA 4JBZA 2P1SA 5H8SA 3QXMA 4ZECA 4R72A 4KPTA 3MP6A 4DXBA 1A54A 2DE3A 4AQ4A 3E13X 4TOZA 1SYIA 3VLWA 5EYFA 3QAXA 4TQUQ 1OVBA 1ANFA 5H8NB 4QFLA 1OLCA 1LFGA 3OEMA 1TFAA 3C31A 2XXXA 2QS4A 3TCFA 4FEDA 5CRYA 4NF6A 3IX1A 1BP5A 3QIMA 4X1BA 3KSXA 2KLFA 5CMBA 2HEUA 2QS1A 3TCGA 1MXWA 5H8FB 5DVFA 5H8QA 3G3IA 5AA1A 3TFLA 3V83A 3OO8A 3UA8A 3E3KA 3KJ7A 3IR1A 5L9MA 2HZKA 3TTMA 3Q25A 3Q26A 2UYEA 4IO6A 4RY1A 2P0SA 3PPPA 1M5FA 2F97A 4P0IA 4MBPA 1GVCA 3T9HB 2ONKE 2IA4A 1B1HA 1LAXA 3VV5A 3SDFA 1IZ1A 1B7UA 3I5OA 1OQHA 5HPQA 4F3PA 2YLNA 2XXYA 3RT8A 4RK2A 3HSTA 2ZNTA 3FVKA 5JTYA 4ZZEA 1I6BA 3N6TA 5JK4A 2ONRA 1B0HA 2DSFA 1GGGA 5DVJA 1L5TA 5FHOA 2XX8A 2XD3A 2F6PA 3Q27A 1FTKA 3W9VA 5F1QA 2I6EA 4FE8A 1SD3A 3KOTA 3TKDA 4R9FA 1H3DA 4AB5A 2DQVA 1B5HA 3FJMA 2ZMBA 3MZBA 2PT1A 2CZLA 4L17A 3VFJA 3VVDA 4IO2A 1QKAA 5DYHA 4RPOA 5I59A 2ZNUA 5A5XB 1YPNA 3KEIA 4F3BA 1YAEA 2AYSA 3H7MA 4JXIA 4GXSB 2H99A 4GD5A 1GR2A 4KYDA 3MC2A 3EN3A 4R2FA 4IO7A 4MFIA 3VXBA 2QSXA 4OFLA 4DXCA 1FTJA 4ZEDA 1SW4A 4XIGQ 3MWBA 2V3UA 5HBCA 4BDLA 5TP9B 1JNFA 1P1QA 4NTLA 2XX9A 2UVGA 2Q88A 2OZZA 2R9JA 1PBPA 2B3FA 5L9OA 1QJMA 2G93A 1POY1 4F18A 3RTWB 3KG2A 3T93B 4Q0CA 1LB8A 1UIVA 2REGA 3B6TA 1VFDA 4GVOA 3KSJA 2DXYA 1IXGA 3TODA 1TXFA 1Y20A 3IOVA 4ELOA 3CIJA 1A55A 3FJGA 3DM0A 3U92A 3G3KA 4GIZA 5ISUA 3VLUA 1SYHA 5LOMA 1DOTA 4NF6B 4FIMA 4EXKA 3IJOB 4K3FA 2QRYA 5H8QB 3MPKA 4IY6A 3R7XA 2NWJA 1B5IA 3RNNA 1TWYA 2XXPA 4H5GA 4F1VA 3S2VA 5AA3A 3HHFA 4OFJA 1Y1ZA 1BTJA 3O2AA 2NVUB 2PBWA 4ND9A 2DP8A 1IQ7A 1ZTYA 1I6AA 3MJNA 1KWHA 1MY1A 3PUWE 1AH5A 1USYE 4RJZA 3UN6A 2O1MA 2WKYA 5I2NA 5H8FA 1ZMGA 4U1OA 1F9BA 1N84A 1SVXB 3KN8A 1D9VA 5IKBA 1R9LA 1IITA 4OZ9A 4RPNA 2OWSA 3Q29A 3RPWA 4M4GA 1B7ZA 2XHDA 4QF9A 1GTKA 1MPDA 4UA8A 1LAHE 4YB5A 5J1DA 1B4ZA 1A40A 4ONYA 2QJEA 3TEPA 3ZS6A 1N04A 4DLDA 4EQ7A 4PFWA 2DXRA 3T22A 2HQ0A 2DVZA 2OBGA 4XXUA 1PC3A 4KR5A 1IEJA 3L6GA 4ZZAA 3UGWA 4ZEIA 3B7DA 3TPAA 3TQWA 3LSLA 4QFPA 1OVTA 1R1NA 1CB6A 1LFHA 3FVNA 1NNFA 3EHSA 5I56A 3DELB 2HAUA 1N7XA 1JETA 5I59B 3OSQA 3VVFA 1MY3A 1B3HA 1JW5A 1I6QA 1TT1A 2F36A 3DP6A 4KHZE 1MS7A 2G29A 4NF8B 1H44A 3D4CA 1IXHA 1RKMA 4ZE8A 2I3VA 3QUFA 1AL3A 4F22A 1A99A 4LQ5A 5DT6A 3MBPA 1HSJA 3N94A 3RQTA 3H4ZA 1LLSA 4LATA 4P11A 3U72A 2GRVA 4GLIA 1YTVA 1O64A 4QFOA 3KOSA 4JSOA 3M8UA 3R26A 4XKQA 1XVYA 1BIYA 4JWOA 4N6PA 3MUQA 4C1UA 3IB1A 2OLBA 2M8CA 3U1OA 1MY4A 5KZTA 4F31B 1URGA 3IB2A 3CG3A 4JSDA 3K6VA 2Z8FA 3H06B 3FJ7A 3G3FA 2RCAA 1QULA 5FTHA 3K1MA 4YKJA 1II5A 3H6WA 4IO5A 1OQGA 1Z7NE 3H3GA 4O3BA 4PE5B 3SERA 3GBBA 4JWYA 2H5YA 3BFTA 2F34A 4F3GA 3PUVE 3FIRA 3KFMA 3USDA 5I84A 1UTHA 2I0BA 1OIBA 3LC8A 3PPQA 2I48A 5I2KA 3K00A 3CR9A 1R9QA 3OOAA 1MH4A 1JVXA 4OVJA 3EHUA 3K1NA 1B7HA 3IOTA 3N6UA 1IXCA 2XXQA 3A3CA 4R6YA 3H6VA 1H76A 2XXUA 4BDOA 2Y7IA 1JQFA 1WDNA 5CMMA 5I2NB 4WKMA 2H98A 1JEUA 1MPBA 1M5CA 1Y1MA 1QUKA 2OJTA 2E0SA 4LONB 1ZKBA 4ZEKA 3F11A 5BUUA 1MQIA 3EF7A 3RN8A 1JW1A 3O97A 3B6QA 3FASA 4ZE9A 5ITPA 4U1ZA 3IO4A 3TAJA 1O63A 1YCJA 1URDA 4F1YA 3L6HA 3S9LC 1FTMA 2UVJA 3PPRA 5BWJA 2I4CA 3V8XB 3CSBA 1J1NA 3CSGA 3IJXB 3JV9A 5FTIA 5I58B 3FXQA 1MY2A 1T0KA 3U94A 1Z7ME 4R73A 1N7WA 3E9XA 2D3IA 1LB9A 2ZXTA 2I58A 5IAIA 5B7DA 4OFOA 2ZNSA 3IK6B 1FW0A 3HV1A 5I56B 3VLVA 3MZ9A 1ZIUA 4WEDA 1LCTA 2DVCA 4PFYA 1MXUA 1B6HA 4OERA 2F7AA 1H45A 2F7BA 2Y84A 3U93A 3FZVA 2OWTA 4E0WA 3TYHA 4EF1A 1NH8A 2RCBA 2O68A 1XOCA 5CBRA 2XXRA 2ZYMA 4G77A 3C32A 3M3LA 3HN0A 2F7CA 2OK2A 3MVZA 3SEUA 4U22A 1O7TA 4H8JA 4X48A 1WVJA 5CMKA 4HTGA 1XVXA 2RC8A 4R9GA 3P7IA 4NF8A 3FATA 3KGCA 2X7PA 3H6UA 4GXAA 3H6TA 2H4IA 4YKPA 2UYFA 4ESWA 4U4XA 4F29A 3S4UA 4U4SA 3SEWA 2I3WA 5CI5A 4ELRA 5DEXA 3LSFB 4Z0IA 3OENA 3FXUA 2AL4A 1Q1KA 2PT2A 2DE2A 1R6ZA 3IOWA 3O28A 1MM7A 3N26A 1MQDA 5DTBA 4XKNA 2BJJX 1DPPA 3RGYA 3A09A 3GLBA 1S50A 2DWHA 4FATA 1I69A 2QL3A 3CRBA 3FD3A 1DMBA 4FORA 4RA1A 3WAFA 4NF4A 3EPEA 4JWXA 3K0VA 1NNPA 1SW5A 3TQLA 1XT8A 3O29A 1UTHB 3K6WA 4DE8A 1QUIA 4OEUA 1B0LA 5I2KB 4LP2B 4ECFA 1PEBA 4ELPA 4KQPA 4Q8RA 1IUDA 3VXCA 4M1VA 2VD2A 5KDTA 1Y3PA 4X1DA 4G4PA 1Q35A 3IL1B 3ONMA 3M3FA 3TMGA 3DLNA 3UP9A 3C35A 4OETA 3U8QA 2CMOA 1WODA 1UTBA 4GFRA 4FJPA 3H03A 1SW2A 4YZZA 4EXLA 3T9VA 2UVIA 2RINA 1LAGE 1RYOA 3CFZA 4EUOA 1ATGA 3PPNA 2O1LA 2D5WA 2DS9A 3M3KA 3PMXA 4KD5A 3A3UA 5L8DA 2V25A 2Y7KA 4JB7A 2RKMA 4OQOA 1ELJA 4FEBA 3OEKA 1EZPA 2QMWA 1MRPA 1A8EA 5FHMA 4G68B 5AA4A 4N13A 3QSLA 2I49A 1IIWA 1A7LA 1AIVA 1ZU0A 2Q8JA 5M2VA 5EHSA 4QSDA 4YKIA 1S9TA 1XS5A 2GHAA 1SDXA 4LVQA 4XTCQ 2H9BA 3S9EA 5ICTA 2VOZA 4POXA 1HSLA 3MVXA 4WEPA 3OO6A 1MQHA 4IY5A 4NWDA 1B58A 3MAMA 3TUSA 2UVHA 1A8FA 3OD7A 1MM6A 2O84X 3GXAA 2Q2CA 2O51A 3PUYE 1M5BA 4Q30B 1NNTA 5I58A 4ZEBA 4GF8A 1Y3QA 3JYRA 4MLVA 2Q9TA 1JVYA 4POWA 1SI1A 4BDMA 1RYXA 3OO7A 4EQ9A 4G8MA 1H43A 4THIA 2PYYA 3TTRA 3KN3A 2AIXA 4ZEFA 1NKXA 4GRKA 2DYXA 4OESA 3O6GA 4IB2A 1VE4A 4ESXA 4GWOA 3FVGA 1PB7A 4KYSA 4PFUA 4HW8A 2X7QA 3ODBA 2V93A 3V5AA 2GH9A 2NOOA 4MF3A 5DEXB 4H0WA 2Z8DA 3Q28A 2ALUA 1B3EA 3G7WA 4PETA 2IEEA 3K2DA 3BKIB 3HPIA 4DCYA 4AB6A 5HM4B 3G3HA 3SESA 3ZKLA 1XC1A 5CMCA 1HSEA 2F78A 1NMUA 1B32A 3CG1A 3SEVA 4OYVA 1ZBMA 3K01A 4KYEA 4NF4B 2F6GA 2ZYNA 1UIUA 3RLFE 4YICA 3K1PA 3PD8A 2X26A 1Y3NA 2FA7A 4N07A 3OXNA 4OWDA 3O9PA 4U2RA 1FQBA 1EU8A 4WXJA 3SKPA 5KDTB 3MW0A 1Y9UA 1LFIA 1P1UA 5B70A 4NE4A 1IXIA 5KCJA 4U23A 3RY3A 4LQ2A 4HCYA 4GL0A 3K6UA 1MXXA 4LUBA 3C34A 2QMXA 4DDDA 3C33A 1UTBB 3MVWA 3GBAA 1QKBA 5EHMA 5AA2A 2Z8EA 2XXVA 1B3GA 3C9HA 4R6KA 5CC2A 1BLFA 2DWAA 5CM6A 4ISUA 3E4RA 3N5LA 1US4A 2RC7A 3UIFA 1FQDA 2B3BA 3PU5A 1FCKA 3PUXE 1MPCA 1ZJLA 3IO6A 2V3QA 3JZJA 4XKPA 2GFEA 4PQJA 4O3AA 3UK4A 1D9YA 2Y7PA 2HZLA 2R71A 4RNSA 5AA4B 2I0CA 1MG1A 2DE4A 5K2XA 1B3LA 3OSRA 2VHAA 3TDJA 3TTKA 2P2AA 3O6HA 2V3TA 2DWJA 1D4NA 1N3WA 1B40A 3G3GA 1P1OA 5AA2D 2ABHA 3K02A 2ANJA 4ZDMA 3PGFA 2ZYOA 3HHGA 5TPAA 1B4HA 3V89B 2PX1A 1LCFA 4EF2A 2HXWA 4G68A 4RXLA 5I57B 1N76A 4OMBA 1SW1A 4O3CA 1MY0A 4H6DA 5L9SA 4LZ7A 3LSXA 4TLMB 2H25A 2XXIA 2F5XA 2A5TA 2XXWA 4Q5TA 1SQYA 2Z23A 4G8HA 4F19A 4C0RA 5FHNA 4G68C 2XXHA 1JW4A 2LAOA 4QRZA 1B3FA 2Z22A 3BBRA 4LZ5A 4R75A 4TLLB 5ICQA 1VSOA 1ZLQA 2A5SA 2YJPA 3T66A 4HCWA 4R6HA 5ELVA 1FQCA 2VP1A 5AE4A 3CFLA 1Y4TA 2UXAA 4YKKA 3DP8A 1EZ9A 2QPQA 4H8IA 1D3KA 3TZAA 5ITOA 1FQAA 1PDAA 2AL5A 4YMAA 1B1XA 4NF5A 4DXUA 2OCUA 3TCHA 4YMBA 3T9XB 3WAEA 3PMWA 1AOVA 4I1DA 1DSNA 1QW0A 1QVSA 2E1SA 3FUZA 1FQFA 3FGSA 1GV8A 1MQGA 2PMSA 3C4MA 1N0TA 5F7VA 2DWIA 3FXRA 3D4GA 5KCJB 1NNKA 4I8CA 3EQ1A 1SBPA 2REJA 1UQWA 1DPEA 4IGRA 3DP4A 4H67A 3HCQA 2HCAA 2F8DA 1VR5A 1XHYA 4IGTA 5H8HA 3CI8A 1B5JA 2O7IA 3ZSFA 3AXFA 4BDRA 1DTZA 4F39A 3CFXA 5AA2B 3LSWA 2VD3A 4IO4A 5TU0A 4PP0A 1PB9A 2VGQA 3QYTA 3ILTB 4FAJA 3KZGA 1NFTA 4YB6A 3O66A 5JEIA 1MDQA 3K4UA 3PUZE 2RC9A 3TTLA 1MDP1 3KJTA 1VFEA 1OLAA 1MXVA 3MZ1A 2B65A 1P1WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PBQA 1MH3A 1B9JA 2Y5LA 4RK9A 1CE2A 4PDHA 4YB7A 5CBSA 1B46A 2XWIA 1FTOA 3EKIA 2QVVA 3EHTA 4RYAA 2PCRA 2ESNA 3MSTA 3FVOA 1DTGA 4F3SA 3FV1A 4OHNA 2THIA 3MYUA 3TELA 4UACA 5LTCA 3OO9A 1NL5A 2HAVA 2XX7A 4H5FA 3RTFB 2QS2A 4DCXA 1NV1A 1P99A 2WYKA 4KFQA 3PD9A 2GHBA 4DI3D 4EQBA 4ELQA 5H8NA 4GL8A 4NWCA 2XWKA 1MXYA 3O6IA 4G2ZA 4LZ8A 2XXKA 4O8MA 4KCDA 5TPAB 1USYH 3RT6B 3C36A 2BJIA 4G8NA 4PF6A 2W7YA 1MXZA 3GYYA 1LAFE 4GOTA 1B2HA 4I9DA 3IOUA 4NAPA 3B6WA 3LUYA 4F2QA 4GQOA 1JEVA 2F35A 4LA9A 3VDFA 1FQEA 3BFUA 1OMPA 2A5TB 2QS3A 2WEFA 3LBSA 4OXVA 2ZYKA 3CVGA 4FECA 4P0GA 4N15A 4X9TA 4EDPA 3GZGA 3MP8A 1FPBA 3THIA 5DVIA 4GWZA 2HFBA 5JTYB 1AWBA 4MH5A 4MMPA 1LSTA 1NUYA 4F1UA 5I57A 2ONSA 4YAHX 4C1TA 3ECRA 2ZZXA 4HXVA 4P1EA 2WX9A 2V84A 4MLQA 3PPOA 3R6UA 1YXIA 3HO7A 4QSCA 3W15C 3SETA 2D21A 3VVEA 2O6AA 1LBBA 4OTEA 3SEYA 4R74A 4I62A 3IAZA 3LR1A 4DIGA 2FNCA 4QHQA 3W9WA 3OELA 1URSA 4QSEA 2DOJA 4U21A 3ZKKA 1QUJA 1FPGA 3PMVA 4KCCA 4NMYA 4N8GA 3RPLB 1AMFA 4QFKA 4R2BA 3KN7A 4BLAA 4NF5B 2WBBA 2RF1A 3RUMA 1LGBC 2CZHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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