5I2NA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA02
1SYIA 3H6TA 1MQJA 1VFEA 4QFLA 4YICA 1MXZA 4RPNA 3B6TA 2XHDA 3G3KA 1LAHE 1Y3QA 3DLNA 1B3LA 1LSTA 1AMFA 2GFEA 2UYEA 2FYIA 3O6GA 3SEUA 1IQ7A 4GOTA 1MXUA 2A5TA 4K3FA 4AQ4A 1DOTA 3KBRA 3S9EA 1O64A 2YPNA 3FV2A 3TMGA 3MP8A 3QIMA 4LZ5A 4G2ZA 3TTMA 5DVJA 1HSEA 3PPOA 2F35A 3D4GA 4GL8A 4LZ8A 5L9OA 4PFTA 3F11A 3WAFA 2AYSA 1LAXA 3W15C 4IGRA 4YKPA 1PBPA 4Q30B 3O66A 2ZXTA 4FORA 3RQTA 2OCUA 3LUYA 4XXUA 3TFLA 3RT8A 1GTKA 3LSLA 5H8NA 3EQ1A 4LONB 4F19A 3W9VA 3TTKA 1OQHA 4GXSB 1B40A 1JETA 2I58A 2DWAA 4GD5A 3IOUA 5H8QB 3BBRA 4YU0A 3K2DA 4ESWA 5IAIA 4PFYA 3SKPA 2QS3A 2IA4A 1PBQA 2V25A 1JW1A 2QS1A 1EZPA 1ZJLA 4U4XA 5AA2D 2V3UA 2DSFA 2DWJA 1MDP1 3U94A 4KCCA 4JB7A 1Y1MA 4IO6A 4XKQA 2H4IA 5I56B 1OLCA 1I6BA 3D4CA 1RYXA 5IKBA 3K02A 3OO6A 4BLAA 4LQ2A 4U2RA 1BLFA 2UXAA 4G4PA 1M5FA 1B0LA 2HFBA 4JDFA 1LB9A 3FV1A 3SEWA 4DDDA 1R1NA 2V84A 1ZLQA 3FUZA 1MS7A 5I84A 1HSJA 1MXVA 1FTLA 1VFDA 5A5XA 1QUJA 1AIVA 5HM4B 4KQPA 3MVZA 4ONYA 1D9VA 4KCDA 5FHOA 5I2KB 1LBBA 5K2YA 3MAMA 4H5GA 4F39A 4FAJA 1URSA 3Q26A 5LOMA 3VE1B 5TPAA 4WXJA 3G3HA 4BDRA 1P1WA 4MLVA 4ZEKA 4R9FA 3ONMA 4JWOA 3VLWA 4QFKA 3O2AA 5EYFA 2ZYKA 3S4UA 4KD5A 5I59A 2D3IA 1H45A 1LAFE 5TU0A 1J1NA 5JTYB 2XXUA 3IO4A 4ZZAA 4Z7EA 4THIA 4QF9A 5ICQA 1PC3A 5ITOA 2O69A 4IO7A 4HCWA 3H6WA 1OQGA 3VXBA 4GIZA 4OTEA 1LBCA 1MH4A 4E0WA 4NF8A 5I2NB 1UIUA 2CZLA 3Q29A 3L6GA 1ANFA 3ECRA 4H8JA 4DXUA 1A40A 1BP5A 3K0VA 2NOOA 3PUYE 3VVFA 4F29A 4NF4B 1EZOA 2OWSA 3H7MA 3FZVA 4IO3A 3KOSA 1JQFA 4ZE8A 2ZYMA 3CSGA 4OFOA 1NH7A 3R6UA 1US5A 4EDPA 2XXQA 1YCJA 4ELRA 3LR1A 1LB8A 3PPRA 1FQAA 2F5XA 4X1DA 4KYEA 3IX1A 1NL5A 1CE2A 4F3BA 2O7IA 4RY1A 5DEXB 3H4ZA 1H44A 5F1QA 1HSLA 3K00A 4M1VA 1P1UA 1YTVA 5CRYA 3KN3A 4IB2A 3KSJA 2Q9TA 2X7PA 4AB6A 4O3CA 1B2HA 5CBSA 4PETA 4WEPA 3JV9A 4XKRA 2YLNA 5CC2A 1LFIA 1FTKA 2F34A 2F97A 4G68B 3FXRA 1B05A 3K1NA 2OK2A 1PB8A 1SQYA 3FVGA 2VGQA 1SW5A 4QFNA 1MDQA 3T9XB 2I49A 4FIMA 2F8DA 1B5JA 2Z8EA 3LSFB 3PU5A 1GGGA 4ZDMA 1MY3A 1S50A 5CI5A 4R6HA 1MPDA 1XC1A 4KFQA 3TKDA 4EUOA 3DP6A 1N7XA 3SESA 1B5HA 4U22A 3T96B 5I57B 1M5DA 2Y7IA 2XXTA 3I6VA 4OESA 3Q25A 2E1SA 1DPPA 2HEUA 3MP1A 4NF5B 3PV0E 5B70A 2PYYA 5HPQA 4NF6A 5AA4B 4G77A 4H1XA 2ZYOA 2Z8FA 4DZ1A 2O84X 3CI8A 1VE4A 1SI1A 4RPOA 3IJOB 1GVCA 1MXXA 3T9HB 2ONRA 3PPNA 3OO8A 3E13X 1US4A 2ABHA 3FATA 2HXWA 3MQ9A 1TFDA 3P7IA 4YB5A 4MH5A 1P1OA 4F1UA 4H0WA 2Y7PA 1ZTYA 1MPBA 3EPEA 1LCFA 3CFXA 4F22A 2B3FA 5I58B 3N5LA 4PE5B 3O29A 1YPNA 3FIRA 2GH9A 3ZKLA 3M3FA 3OO7A 1O7TA 4FEDA 1B52A 3M8UA 3TQLA 3O6IA 4LVQA 3PUVE 1MQGA 2UVIA 2RC8A 3T22A 4JBZA 4OEUA 1VR5A 3OEMA 2AIXA 3TCFA 3IOWA 2XXHA 2UYFA 3HO7A 3VV5A 2UVGA 1Y9UA 1DPEA 2KLFA 1MY2A 2DE2A 1JVXA 3K6WA 2LAOA 1H3DA 3U1OA 3I5OA 1OVTA 3RY3A 3IB0A 2RCAA 3E3KA 4WKMA 2Q2AA 3PGFA 3OSRA 3W9WA 3ILTB 5CMMA 3KZGA 3FVNA 4F2OA 4HCYA 1B0HA 2QRYA 3S9MC 3N6TA 5H8SA 2H25A 2Z8DA 3G3FA 1Y3NA 4NMYA 5L9SA 1TT1A 3MZBA 2BJJX 1XVYA 4GVOA 4R6YA 3C31A 4M4GA 3ZS6A 4ZEDA 2PVUA 2REJA 2O68A 2R9JA 3KG2A 3CG1A 4ELOA 1LLSA 3T93B 2H98A 3KEIA 3SEVA 3TQWA 2DXYA 4ISUA 4NE4A 5H8HA 4RK2A 4FE8A 1B9JA 3O97A 2ZNSA 1UTHB 4GRKA 5KCJA 5H8FB 4LATA 5TP9A 3TTLA 2V3QA 3FVKA 5HBCA 1MY4A 1URGA 1B4ZA 2XXPA 3TZAA 1FQCA 2DOJA 2Y7KA 4EQ9A 4XTCQ 1DTZA 2F7AA 1B7ZA 1B3EA 3ZKKA 3H6UA 3VLUA 1QJMA 1B7HA 1A99A 1QULA 2DP8A 5K2XA 3S9NC 4NWCA 3OELA 2X26A 4C1UA 4XKNA 3N94A 2F6GA 1B1HA 2FNCA 2P2AA 3IO6A 3V89B 1M5CA 2X7QA 1OIBA 1B46A 1IXIA 4QSDA 5DVFA 3EHTA 4OFJA 3MVXA 2RC7A 2ZYNA 3L6HA 1USYH 2XX7A 4R74A 3FGSA 1MXWA 1PEBA 1B3HA 4KR5A 1ZMGA 2XXVA 3KGCA 3THIA 3PMXA 2NXOA 2CMOA 1XOCA 3QUFA 4FATA 2DE4A 4OXVA 1AL3A 4KYDA 3KJTA 4YZZA 1BTJA 5AA2B 4ELQA 4GFRA 4MFIA 2VD2A 4OEVA 1FTOA 1NH8A 5JK4A 4KI0E 1A55A 4RNSA 1JW4A 3FJGA 3G3IA 1UTBB 3O9PA 1A8FA 5L9MA 4LP2B 3DP4A 4R73A 4ZEIA 2B3BA 3AXFA 1IITA 1AOVA 3SEXA 3K01A 3PMWA 4Q5TA 3UN6A 4POXA 3RTFB 4C1TA 3C34A 4EQ7A 3LSXA 1OLAA 1JW5A 1Q1KA 2I48A 1O63A 3QK6A 4F3GA 3QYTA 2QMXA 1NNKA 1WDNA 3G3GA 4G8MA 3MJNA 2HQ0A 1LFHA 4ECFA 2V93A 3FASA 3R7XA 1SBPA 3VFJA 1MH3A 5CBRA 4RA1A 2AL5A 1B1XA 3SERA 4EF1A 4H6DA 2ONKE 1R9QA 3TELA 4ZEFA 2I3VA 4F1YA 4L17A 3UK4A 2NUVA 4FEBA 1RKMA 4TLLB 4F18A 1VSOA 1A8EA 5AE4A 3V8XB 1N7WA 3RPWA 5EHSA 3UA8A 1Y4CA 2H9BA 3BFTA 3C35A 3V5AA 1TWYA 3GBAA 1M5EA 4DIGA 2RINA 2OBGA 4R75A 4DE8A 3PD8A 3MVYA 2Q88A 4ZE9A 2DVCA 4EF2A 3N26A 3HHFA 2OJTA 2F7BA 4QSEA 1B32A 3CSBA 3MP6A 4G8NA 2XXRA 1L5TA 1LAGE 2NVUB 4YB7A 1B3FA 3FXQA 1AH5A 3C36A 4RXLA 1TFAA 2PX1A 2UVHA 5H8QA 1B4HA 2A5TB 1XT8A 2I4CA 2Q89A 3PUXE 2R6GE 1EZ9A 5DVIA 2HZLA 4YMAA 1NFTA 3IAZA 3TUSA 3UP9A 1A54A 1OVBA 2Y7RA 2HAVA 4LUBA 1B51A 1MQHA 4YKKA 3RT6B 1FCKA 4IO2A 1I69A 3HCQA 4F31B 2Z22A 1N76A 2NWJA 3QUJA 3FJ7A 1ZBMA 4DXBA 1BIYA 3SETA 1MRPA 1IXCA 1SI0A 1B58A 5H8NB 4OENA 4I1DA 1EH3A 4EXKA 2H99A 3CRBA 1D3KA 2I0BA 2QSXA 3HPIA 3KFMA 3VDFA 4LA9A 5B7DA 1N3WA 4LQ5A 1FTMA 1JEUA 4U1OA 5CMCA 1DMBA 1EU8A 3CFLA 3IR1A 2QJEA 4R2FA 1IUDA 5I2KA 3QSLA 2O7UA 3EF7A 1MQDA 1B5IA 4U1ZA 3GZGA 3LBSA 1P1NA 2G93A 1QKBA 4DCYA 4BDMA 1T0KA 4I8CA 3PUWE 3OMBA 2RF1A 2WKYA 1MPCA 1USYE 3IOTA 2XX9A 4C0RA 4ZECA 3IORA 3V83A 3A3CA 1QKAA 4AB5A 5JTYA 1ZIUA 3E9XA 2XXYA 1S7YA 1SDXA 1KWHA 1N04A 3TCGA 1MXYA 1II5A 2I0CA 2GHBA 4OFLA 2QMWA 4OYVA 2D5WA 5A5XB 5I2NA 1Y4TA 4UACA 2GRVA 4GWOA 3CVGA 2QL3A 1B6HA 2DWHA 4NF4A 4GL0A 4PQJA 5JEIA 3VXCA 5FTHA 1JNFA 4OWDA 1MM6A 5TPAB 4ND9A 1H43A 1QUIA 3IK6B 4TLMB 4BDQA 4I62A 5ITPA 3HN0A 2AL4A 2ALUA 3WAEA 2XXWA 4H65A 4YKJA 4R9GA 3RLFE 3MPLA 5I59B 2W7YA 5BUUA 3PPPA 3TEPA 4X1BA 3CG3A 4QFOA 4ESXA 3MW0A 5DYHA 1BKAA 3ZSFA 1S9TA 4F1VA 2D21A 4FJPA 3OSQA 2DQVA 1NKXA 1Y3PA 3ILUB 3TTNA 3TODA 3TCHA 4QFPA 4DCXA 5DEXA 3HV1A 4Q8RA 3MPKA 4NF8B 4OMBA 5CM6A 4XIGQ 3A3UA 1SVXB 2VP1A 4KHZE 2F6PA 4DXCA 3U8QA 3G7WA 1Q35A 3JYRA 3RGYA 5CMBA 3TPAA 3RN8A 2HCAA 4BDLA 1MQIA 1FQEA 1ZKBA 1MY0A 1SW1A 4I9DA 4G68A 4MLQA 3B7DA 3TYHA 3GXAA 4DLDA 2XD2A 1I6QA 3KN8A 1Y1ZA 3E4RA 4H8IA 4EQBA 4JWXA 3KOTA 3CR9A 5AA3A 3I3VA 2G29A 3IOVA 1NNTA 4IY6A 1MG1A 3MUQA 3MZ9A 1FQBA 3R26A 1NNFA 3C9HA 4ELPA 2REGA 4JWYA 3SDFA 3UIFA 5AA1A 4U4SA 4TQUQ 5I57A 1LGBC 4FECA 4BDOA 1R6ZA 2I3WA 5F7VA 4R72A 5KDTA 3CIJA 4JSDA 1CB6A 4NF5A 2DXRA 2ZMBA 4POWA 5AA4A 1GR2A 1MM7A 1UIVA 3ODBA 1URDA 3RNNA 2ZNTA 1R9LA 4RK9A 3GBBA 4YAHX 4X48A 4MBPA 2OZZA 3K1MA 5M2VA 1SYHA 2QS2A 3IB1A 3JZJA 4GQOA 4YB6A 1ATGA 4BDNA 2O1LA 4IO5A 2IEEA 4ZS9A 3IJXB 2HAUA 5I58A 3IB2A 4G8HA 3GLBA 3KSXA 3MZ1A 2UVJA 4X9TA 5ELVA 4O3AA 4ZZEA 2Y84A 2I6EA 2DE3A 3T66A 4P0IA 3EHUA 4OVJA 3H3GA 1F9BA 3K4UA 2ZNUA 3C32A 1XHYA 4NF6B 3UORA 5J1DA 4QRZA 5BWJA 2Y7WA 3TDJA 3K6XA 2ESNA 1XS5A 4O3BA 4UA8A 4NWDA 3B6QA 1NMUA 1FQFA 4JSOA 4P11A 3O28A 4R2BA 1FW0A 3BKIB 2V3TA 2O1MA 4P0GA 4H5FA 4Q0CA 1N84A 3EN3A 2DYXA 1XVXA 1JVYA 4U23A 3N6UA 1Y20A 2DWIA 4OQOA 2M8CA 1QUKA 4PP0A 4PFWA 1SW4A 4R6KA 2XX8A 2PT2A 3VVDA 1Z7NE 3M3LA 4NTLA 3VVEA 4KYSA 1OMPA 5ICTA 2Q8JA 5FHMA 4KPTA 2FA7A 5L8DA 3UGWA 1IIWA 3DM0A 4WEDA 2XXIA 3O6HA 3K6UA 4G68C 1UTHA 3S2VA 1POY1 2Z23A 5H8FA 4N07A 3HHGA 3C4MA 4XKPA 4H67A 2PMSA 3OXNA 1TXFA 2F36A 3VLVA 4RJZA 1IZ1A 1Z7ME 2B65A 2E0SA 3TTRA 4MF3A 3USDA 3H03A 1YAEA 4Z0IA 3M3KA 2RC9A 4E0XA 4NEDA 5KZTA 4HS7A 1B7UA 1P99A 2THIA 4GLIA 5FTIA 1B3GA 5FHNA 3MWBA 2PT1A 3IL1B 1I6AA 4YMBA 3KN7A 4N6PA 3LSWA 3FD3A 2RCBA 5EHMA 5I56A 4OETA 3MVWA 5H8HB 4F3SA 1FTJA 4QHQA 5DTBA 2Q2CA 3H06B 3B6WA 1N0TA 2VHAA 5KCJB 3C33A 2A5SA 1SD3A 3HSTA 4GF8A 1PDAA 5TP9B 1N3XA 1WODA 4YKIA 1UQWA 1H76A 1LCTA 1JEVA 3RTWB 3DP8A 2VOZA 1A7LA 4OERA 2O6AA 4LZ7A 2F7CA 5AA2A 3K1PA 2RKMA 1IXGA 1D4NA 2DS9A 3KJ7A 4EXLA 3U72A 3MC2A 3QAXA 3LC8A 4N13A 4ZEBA 4F3PA 1UTBA 2H5YA 2P1SA 1NNPA 4U21A 1LFGA 3U92A 4GXAA 1PB7A 4RYAA 2O51A 3CFZA 5KDTB 1RYOA 4QSCA 1WVJA 3DELB 1ZU0A 3OOAA 1DSNA 3PMVA 2GHAA 1DTGA 1FQDA 4OHNA 1ELJA 2F78A 1GV8A 2QPQA 3Q28A 3FJMA 4IGTA 2P0SA 2YJPA 1IEJA 4IY5A 2QS4A 1SW2A 3BFUA 3OO9A 4TOZA 2I4BA 3K6VA 3PPQA 3T9UA 2OLBA 3RUMA 1POTA 3SEYA 3EHSA 2VD3A 3A09A 3G3JA 4PFUA 4HTGA 2R71A 1M5BA 5ISUA 3OEKA 4F2QA 3Q27A 3MBPA 1IXHA 2ANJA 2OWTA 3PD9A 3PUZE 2PBWA 3FXUA 2DVZA 3H6VA 1QW0A 5CMKA 3TAJA 2XXXA 3OD7A 1QVSA 1D9YA 5DT6A 4OZ9A 3T9VA 3FVOA 3U93A 1P1QA 3S9LC 3OENA 2XD3A 2HZKA 3QXMA 4IO4A 4HW8A 1PB9A 4JXIA 1MY1A 2ONSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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