5I2NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB02
3AXFA 4M4GA 1I69A 4FEDA 4QFNA 3OO7A 2ALUA 2FNCA 1LAGE 3DP8A 1LFIA 2F78A 3D4CA 4MBPA 3OO9A 1FQFA 4GL0A 2XXRA 3SERA 1MPCA 3PGFA 3CVGA 1B51A 3RT6B 4EQBA 4IO2A 3H7MA 4QFLA 3GLBA 4NF6A 2HZLA 5HM4B 2ZNUA 3ZKKA 5L9OA 2DXRA 3SEVA 1BLFA 3FXRA 2V93A 3SEUA 1M5DA 1ZBMA 2QRYA 2XX7A 2Y7KA 4NWCA 3ZSFA 4RYAA 4R2BA 4H65A 4F31B 5AA4A 2DQVA 2XXIA 4F29A 5I59B 4RY1A 1ELJA 5CMBA 1Q1KA 3EHSA 3PMVA 3TTMA 3CFXA 1GR2A 2I3VA 3TPAA 4F2OA 3BBRA 1IZ1A 1D9YA 4HW8A 3RQTA 1POY1 3LSWA 3IO6A 3UGWA 1J1NA 2ZYOA 1MH3A 1RYOA 2F7AA 3ONMA 3OXNA 1US4A 4WXJA 3HHGA 1FQBA 3C34A 5KCJB 1US5A 2H99A 1MQIA 2H98A 4IO6A 2Q88A 2XXYA 4ELQA 5I2NB 3V83A 3V89B 3OSQA 2XX8A 2F36A 4EF1A 3K1MA 1M5BA 2ZYMA 1D3KA 2AL4A 1WODA 2UYEA 1LB8A 3MJNA 2B3BA 5H8SA 1SD3A 5CI5A 3VXCA 4FEBA 1O63A 1MXZA 4YB5A 4ZZEA 1Y1ZA 3N6TA 4ELOA 4YKPA 3O66A 4KYEA 4O3BA 5DTBA 2REGA 3M3FA 4BDMA 3RLFE 1I6AA 3VVFA 4AQ4A 1B5HA 5CBSA 4I9DA 1IQ7A 2QSXA 1B4ZA 4GD5A 4YICA 2D3IA 1SW1A 4TOZA 2DWJA 1WDNA 2RCBA 4IGRA 2X7QA 1FQEA 4XKPA 1MH4A 3IX1A 1FTOA 4YKIA 5JTYA 3TYHA 1SDXA 1P1UA 4F39A 5ISUA 3HSTA 2YJPA 1Y1MA 1XHYA 3L6HA 3FIRA 1NMUA 1LAHE 1H43A 1ZU0A 4PFWA 4UA8A 4KD5A 4YMAA 1MY0A 4YAHX 4X1DA 3MVWA 2P2AA 3CR9A 1UIVA 4WEDA 3VFJA 2B65A 3B6QA 3JV9A 1M5CA 2QS3A 2KLFA 1NFTA 3CSBA 4YKKA 3FASA 1OLAA 2CMOA 1Y4CA 1F9BA 4GXSB 2Y7RA 4RPNA 4IB2A 5EYFA 1JW5A 3N26A 4YMBA 4BDNA 3P7IA 3FXUA 2PT1A 2AYSA 1H44A 4PP0A 4MLVA 4E0WA 5JEIA 4I8CA 3VVDA 1YTVA 4G8HA 1A55A 1IITA 1MS7A 4AB5A 4M1VA 4TLMB 2Y7IA 1EZ9A 2XD3A 5DYHA 3CFLA 4KFQA 4LZ8A 4H1XA 1FW0A 1JEUA 3D4GA 4F3PA 3LSFB 5FTIA 3RT8A 2ESNA 1SI0A 3S9LC 2F97A 3T9XB 3B6TA 1LGBC 3MPKA 2WKYA 4EXKA 3HPIA 2DVZA 5I59A 3PPPA 3PUWE 1L5TA 3OMBA 3N94A 2V3TA 3K6XA 2GRVA 2YLNA 1RKMA 1B5JA 3THIA 1MDQA 1SVXB 4LP2B 1B7UA 4DLDA 3PMWA 2XXHA 1B7ZA 2QJEA 1MRPA 1A8FA 4UACA 3IL1B 4N13A 3PUVE 2CZLA 2O6AA 4R75A 3U72A 5KCJA 4YB7A 3FD3A 3Q28A 5CC2A 1TWYA 4F1VA 5AA2D 3EQ1A 2ANJA 2Q9TA 3FV2A 3S4UA 3IORA 1EU8A 4HCWA 5I2NA 4X48A 4O3AA 1B3HA 2PVUA 4U1OA 3QUFA 1EH3A 1WVJA 1S9TA 5L8DA 1B7HA 3IK6B 4KYSA 3C36A 3G3KA 3RGYA 2QMWA 3QYTA 1SW5A 3KOTA 3QK6A 4ESWA 4JWXA 4YKJA 1PDAA 4MF3A 2Q2AA 4NMYA 3K6UA 5J1DA 3H3GA 1P1NA 4R74A 4NEDA 4NF4B 3K02A 2D5WA 3KSXA 3MWBA 2I0CA 4XTCQ 1M5EA 4U23A 1N04A 2UYFA 1MY4A 1AMFA 5FHOA 3H6WA 3M3KA 1S7YA 3KZGA 1OQGA 1N7WA 2PYYA 4XKNA 2DYXA 1XT8A 3VE1B 3H06B 4KYDA 4YU0A 1ZTYA 1IXHA 1DPEA 2XXXA 3O28A 1SQYA 3ODBA 1XC1A 4OTEA 5I56A 1JNFA 3MP6A 1EZPA 3FVGA 3E9XA 5TPAB 1MXXA 3PD8A 1B32A 5BWJA 3KJTA 3K0VA 1VFEA 3PU5A 1DTGA 4Q8RA 1MXUA 3UORA 3FJMA 5AE4A 3HN0A 3QSLA 3JYRA 3IOUA 3CG1A 5JK4A 1R6ZA 5L9SA 4BDLA 1PB7A 4OHNA 3QXMA 3WAFA 1UTHB 3S2VA 2O7UA 4JDFA 4DCXA 4I1DA 4IO7A 2V84A 1BKAA 5FHMA 1GVCA 3V8XB 5CM6A 1MY2A 4OFLA 4PQJA 2DWAA 3U94A 2E1SA 1LAXA 3SEYA 1SBPA 1ZMGA 5CMKA 4G68C 1O7TA 3H6TA 1GTKA 4C1UA 3OEKA 1AIVA 3ZKLA 1NH8A 4GFRA 3Q25A 3MBPA 4R2FA 1IXIA 4JXIA 1MY3A 3VLUA 1MPBA 5KZTA 4DXCA 2UXAA 1FQCA 1R9QA 3VXBA 4XKRA 4H8IA 3IB0A 4GQOA 2XXVA 4JB7A 3KN7A 1T0KA 3OO8A 1PBPA 5TP9B 4DZ1A 2OK2A 4X9TA 3GZGA 1MQHA 3C4MA 3LSLA 1LB9A 4H5GA 4EXLA 4GRKA 3R6UA 5ICTA 3TUSA 3DELB 2Z8EA 1OLCA 4AB6A 1Z7ME 4DXBA 2HAUA 3MVYA 3TCHA 3GBBA 2AL5A 2HCAA 3PPQA 2PT2A 1PBQA 4ISUA 5FTHA 2F35A 3LUYA 1I6QA 3UK4A 2GFEA 5F7VA 2VHAA 2HFBA 1LLSA 3DLNA 4H5FA 2OWSA 1B46A 4OYVA 1Y4TA 3A3UA 1IXGA 2DVCA 1IXCA 4U4XA 3TCGA 1B3FA 4DCYA 3BFUA 3HV1A 4ZEIA 4NWDA 1B58A 3TZAA 3MW0A 4XXUA 1I6BA 4R6KA 3IOVA 4PETA 3S9NC 2I6EA 3IOTA 1TT1A 2RINA 4Q30B 2H9BA 1Q35A 2FYIA 1LCFA 1MQGA 3EF7A 4JSDA 3TQWA 4G2ZA 2QPQA 3RUMA 1MDP1 3K2DA 1H76A 4G68B 4QRZA 5I2KA 3PUXE 3IO4A 4FECA 1NNFA 3FXQA 1Y3QA 3PPOA 4JSOA 4GWOA 4NF5A 4C1TA 4NF8B 5IKBA 5KDTB 5I58A 3S9MC 4LZ5A 5CMCA 3LBSA 4YB6A 3FJ7A 4HTGA 3W9WA 2VD2A 2DOJA 4ZDMA 1B9JA 3MVXA 2UVJA 5DT6A 2A5SA 4ONYA 2ZNTA 3TFLA 4OESA 1DMBA 1TFDA 1TXFA 4ZZAA 2DSFA 4ZE8A 5H8FB 3O29A 5AA1A 4R9GA 1HSLA 3T93B 1HSJA 3RY3A 3TTKA 1USYH 3UIFA 2A5TB 2OWTA 1QKAA 2LAOA 4POXA 1DPPA 4Z7EA 5A5XB 3IAZA 1UQWA 1UTHA 2M8CA 4QFKA 3EHUA 2V3QA 2NWJA 2GHBA 1SI1A 5H8HB 4QF9A 2HQ0A 2HAVA 3N5LA 1P1QA 1YCJA 3T96B 2RCAA 4JWYA 2NOOA 3O6IA 4U2RA 1H45A 4MH5A 5K2XA 2O68A 1LCTA 5DVFA 2NVUB 2ZYKA 3O97A 1Y3NA 2QS2A 3OO6A 1SYIA 3FJGA 3Q29A 1JVXA 1B1XA 2F7BA 3FUZA 3PMXA 1ZJLA 2Z8FA 3O2AA 3O9PA 5TP9A 3G3HA 3M8UA 4YZZA 3ZS6A 2GH9A 1B5IA 3U8QA 1N3XA 5ELVA 4DXUA 3G7WA 1FQAA 1QJMA 1P1WA 1AOVA 4LQ2A 2XD2A 2H5YA 4R6HA 2F34A 3OSRA 4OEVA 2F5XA 3MQ9A 2UVHA 2YPNA 3IB2A 3W15C 4G77A 4NF6B 2R6GE 2DE3A 4QSCA 3CSGA 4IY5A 2Q89A 1XVXA 3G3FA 2QMXA 1OVBA 5IAIA 5EHMA 2O1MA 4LUBA 4HCYA 1JQFA 1R1NA 1QW0A 1MM6A 5CMMA 3H6VA 1B1HA 1N3WA 4ZEDA 4R72A 2AIXA 4H67A 5F1QA 1N84A 3B6WA 3KG2A 1MPDA 1JW1A 3LC8A 2O84X 4IO3A 4Q0CA 4LZ7A 1JEVA 2QS4A 3ECRA 2DXYA 4IO4A 5I84A 1BTJA 1ANFA 2PBWA 4KCDA 3SKPA 4OERA 4OMBA 1GGGA 5BUUA 1H3DA 2QS1A 3I5OA 5HPQA 4ESXA 3T9UA 3QAXA 3G3GA 1B6HA 4ZEBA 2XXWA 2F8DA 4NF8A 1JETA 3EN3A 3TDJA 3KSJA 3TAJA 1B4HA 1JW4A 2ZNSA 3C35A 3O6HA 2I48A 1URSA 4OFJA 4I62A 1KWHA 2NXOA 1A8EA 2V3UA 3CFZA 5H8QB 1MY1A 4DE8A 4BDQA 3HCQA 3FZVA 2I3WA 4JBZA 3SESA 4NTLA 2RF1A 2ONRA 3U92A 3TELA 1VR5A 4LVQA 4P0IA 2BJJX 3FVOA 3HHFA 4THIA 3TTLA 1A40A 3DM0A 2X7PA 1MXWA 3TEPA 5DEXB 4U21A 4Z0IA 2OLBA 1POTA 3H03A 2IA4A 1HSEA 3MAMA 4TQUQ 1N0TA 2FA7A 4R73A 3KOSA 3T66A 4BDOA 1MQDA 1AH5A 1QUKA 3MZBA 3PV0E 5H8HA 2Y84A 3DP6A 3A09A 4IGTA 4GL8A 4F18A 3U1OA 3WAEA 2Z23A 1B05A 3CIJA 1URGA 1N7XA 3HO7A 1FTMA 4GXAA 3IOWA 4OEUA 3UA8A 3RTFB 4XKQA 4R9FA 4F22A 1PB9A 3H6UA 1MXVA 4NE4A 1MG1A 3VLVA 4OENA 2RKMA 3W9VA 3SEXA 4GVOA 2PMSA 3ILTB 2XXPA 4MFIA 1B0LA 3VV5A 1B52A 4KQPA 3UP9A 4DIGA 2Q2CA 3MP8A 4OWDA 1AL3A 4KCCA 2VD3A 2ZMBA 3OENA 1UTBB 4L17A 2I49A 3F11A 1Y9UA 1PEBA 3ILUB 2Z22A 4FIMA 4KPTA 1IIWA 1B3GA 3S9EA 2DWHA 2X26A 1LBCA 2OCUA 4ELRA 4G8MA 5K2YA 1NL5A 1B2HA 1VSOA 2B3FA 2Q8JA 1FTLA 3TTRA 4OFOA 1USYE 3EHTA 2UVIA 2ONSA 4QFOA 1D9VA 2W7YA 5AA2B 3V5AA 1QVSA 3TKDA 1Y20A 4ELPA 3T22A 3LSXA 4K3FA 4LATA 5I57B 3FV1A 5B7DA 2REJA 2ZXTA 1LFGA 2PX1A 4PFTA 3UN6A 5DVIA 3I3VA 4QSEA 2OJTA 3RPWA 4RA1A 4ECFA 4BDRA 3BKIB 3FGSA 4F1UA 3T9VA 1OMPA 1QUJA 3K01A 1OIBA 3PUYE 5AA3A 2E0SA 3FVNA 1A99A 1ZIUA 2Z8DA 4WKMA 3O6GA 2ONKE 4U1ZA 3OOAA 4RJZA 4RK2A 2HZKA 4NF4A 2DP8A 4G4PA 4GLIA 4EF2A 2GHAA 4OVJA 1NNKA 3KN8A 2THIA 1VE4A 4LONB 4IY6A 3C9HA 3KJ7A 3PPRA 3TMGA 5H8QA 4R6YA 4GF8A 4TLLB 3IB1A 3QIMA 2VOZA 5CBRA 1P1OA 1XS5A 3N6UA 1LBBA 1B3LA 3KGCA 3USDA 2OZZA 5TPAA 3FATA 5H8NB 1D4NA 3MC2A 2HXWA 3PD9A 3M3LA 5DEXA 1QULA 1R9LA 4WEPA 4IO5A 1PB8A 4GOTA 5ITPA 2XXUA 3TODA 4POWA 4XIGQ 2DE2A 1IUDA 1LSTA 3I6VA 4ZEKA 1GV8A 1B3EA 4PFYA 1M5FA 5I56B 2I4BA 5M2VA 5ITOA 4H6DA 3K1PA 3CI8A 3RN8A 1QKBA 4FATA 4OETA 1A7LA 1QUIA 4FAJA 2O51A 2F6GA 3KFMA 3MZ1A 1ZKBA 4ND9A 4KR5A 4EQ9A 3K6WA 4N6PA 1XVYA 3KBRA 1ZLQA 3E3KA 3TQLA 2VGQA 3LR1A 3KEIA 5L9MA 5CRYA 3KN3A 1RYXA 2DS9A 1TFAA 4RK9A 3E13X 3CRBA 3K1NA 3C32A 4F1YA 4FORA 4P11A 1YAEA 2RC7A 1Z7NE 4KI0E 1BIYA 2NUVA 3IJXB 3VLWA 2ABHA 3TCFA 1LFHA 3Q27A 4O3CA 4RNSA 4X1BA 3IR1A 4MLQA 2Y7PA 3FVKA 3E4RA 1UTBA 3MUQA 3B7DA 3R26A 4PE5B 1N76A 2G93A 3SETA 5HBCA 4ZECA 1ATGA 1DTZA 4OXVA 4C0RA 3G3JA 4ZE9A 1B0HA 2H4IA 1FTJA 4HS7A 4QHQA 1CB6A 3OD7A 1VFDA 1NNTA 2DWIA 5ICQA 4PFUA 2IEEA 3QUJA 5AA2A 2I4CA 2XHDA 5EHSA 2HEUA 5I57A 4F2QA 4Q5TA 1SYHA 3RTWB 4LA9A 2UVGA 4GIZA 5AA4B 3TTNA 2F6PA 2XX9A 3EPEA 3MPLA 3C31A 3DP4A 4FJPA 4F3SA 2RC8A 1MQJA 2O69A 4EDPA 1B40A 3Q26A 3SDFA 3K00A 1MXYA 1OVTA 2O1LA 1FCKA 2D21A 4G8NA 4E0XA 3MZ9A 1IEJA 1P99A 4FE8A 2XXQA 4G68A 1NKXA 4RPOA 4H0WA 1MM7A 3MVZA 3K4UA 3U93A 1FTKA 2V25A 3SEWA 5TU0A 1A54A 5KDTA 3L6GA 1LAFE 4EUOA 3PPNA 2Y7WA 1JVYA 3OELA 1DOTA 3OEMA 3G3IA 2H25A 5B70A 3VDFA 5I2KB 1SW4A 4QFPA 5FHNA 5H8NA 3R7XA 2QL3A 1NH7A 1Y3PA 3CG3A 3C33A 3MP1A 3GXAA 5H8FA 4NF5B 4EQ7A 4P0GA 4JWOA 1OQHA 3RNNA 3JZJA 4LQ5A 1DSNA 5I58B 5DVJA 1XOCA 4F19A 2A5TA 1O64A 2I0BA 3T9HB 1S50A 2RC9A 4F3GA 4QSDA 3A3CA 5A5XA 1BP5A 2DE4A 4OZ9A 4ZS9A 2P1SA 4U4SA 1FQDA 2ZYNA 4H8JA 2VP1A 1CE2A 4DDDA 2R9JA 1PC3A 2O7IA 4OQOA 5JTYB 5LOMA 3PUZE 1NNPA 3IJOB 4F3BA 1II5A 1UIUA 4U22A 2OBGA 4RXLA 2G29A 2F7CA 3BFTA 2P0SA 4ZEFA 1URDA 2R71A 4N07A 1YPNA 1SW2A 4BLAA 2I58A 3GBAA 3VVEA 2XXTA 4KHZE 1EZOA 3H4ZA 3K6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AXFA 4M4GA 1I69A 4FEDA 4QFNA 4PF6A 3OO7A 4NQ8A 2ALUA 4PCDA 2FNCA 1LAGE 3DP8A 1FPJA 4PAFA 1LFIA 2F78A 3D4CA 4MBPA 3OO9A 1FQFA 4GL0A 2F3DA 4MNPA 2XXRA 3SERA 1MPCA 3PGFA 3CVGA 1B51A 3RT6B 4EQBA 4IO2A 2MKZA 3H7MA 4QFLA 3GLBA 4NF6A 2HZLA 5HM4B 2ZNUA 3ZKKA 5L9OA 2DXRA 4GBVA 3SEVA 1BLFA 4PFIA 3FXRA 2V93A 3SEUA 1M5DA 1ZBMA 2QRYA 2XX7A 2Y7KA 4NWCA 3ZSFA 4RYAA 4N81A 4R2BA 4H65A 4F31B 5AA4A 2DQVA 2XXIA 1FBGA 4N8YA 4N15A 4F29A 5I59B 1FPFA 4RY1A 1ELJA 2B4LA 4NN3A 5CMBA 1Q1KA 3EHSA 3PMVA 3TTMA 3CFXA 1GR2A 2I3VA 3TPAA 4F2OA 3BBRA 1IZ1A 1D9YA 4HW8A 3RQTA 1POY1 3LSWA 3IO6A 3UGWA 1J1NA 2ZYOA 5ET8A 3B50A 1MH3A 2HHMA 1RYOA 2F7AA 3ONMA 3OXNA 1US4A 4WXJA 3HHGA 1FQBA 3C34A 5KCJB 1US5A 2H99A 5EYHA 1MQIA 2GQ1A 2H98A 4IO6A 2Q88A 2XXYA 4ELQA 5I2NB 3V83A 3V89B 2XA5A 2XX8A 3OSQA 1RDXA 2F36A 1NUXA 3FBPA 4EF1A 3K1MA 4PGNA 1M5BA 2ZYMA 1D3KA 2AL4A 4I3YA 1WODA 2UYEA 4GX6A 1LB8A 3MJNA 2B3BA 5ET7A 5H8SA 1SD3A 5CI5A 3VXCA 4FEBA 1O63A 1MXZA 4YB5A 4ZZEA 1Y1ZA 3N6TA 4ELOA 4YKPA 3O66A 4KYEA 4O3BA 5DTBA 2REGA 3M3FA 4BDMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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