5I2NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 81

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH2 (109-116)S1 (7-11)S2 (19-22)S4 (59-65)TI1 (24-27)S3 (43-48)TII1 (52-55)TIV2 (48-51)AH1 (67-79)EMPTYAH10 (277-286)S5 (83-87)TI3 (88-91)TIV3 (98-104)AH6 (193-200)S11 (174-175)AH5 (181-188)S6 (96-98)S7 (105-107)S13 (239-251)TVIII2 (117-120)S8 (121-122)AH9 (261-275)S9 (136-138)S12 (221-225)TIV5 (141-144)S10 (143-152)AH7 (207-216)TIV6 (158-161)TII2 (152-155)TI4 (159-162)TIV7 (169-172)TIV8 (177-180)TI5 (200-203)AH8 (226-235)S14 (254-256)TI7 (256-259)TVIII4 (217-220)TI2 (34-37)AH3 (130-134)TI6 (236-239)TVIII3 (170-173)3H1 (190-192)TVIa1 (14-17)O1 (124-126)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 81
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nB02
1RKMA 2O69A 3IAZA 1WVJA 3V8XB 4OQOA 1PDAA 3MPLA 4KYSA 1FTKA 3VVFA 2NWJA 1AIVA 4OTEA 4THIA 1OMPA 1B51A 3C35A 1S50A 1GR2A 3G3IA 5ELVA 4BDQA 1NH7A 4Z7EA 4MH5A 5AE4A 2G29A 5AA1A 3RT6B 2F6PA 1M5BA 4C0RA 1EZPA 4DLDA 5IKBA 1FCKA 3O6HA 4OYVA 2OCUA 3BFUA 1T0KA 5FTIA 3OSRA 5M2VA 5CM6A 4QSDA 1VFEA 4KYEA 5CMMA 4LQ2A 4PFYA 3G7WA 2PVUA 3C4MA 1AL3A 3G3JA 4OFOA 2QS2A 2I3WA 3CG3A 3IOWA 4BDOA 3D4GA 3HO7A 1QKAA 4F19A 2OK2A 4GRKA 3ZSFA 4U23A 1LCTA 3S9NC 4ZEKA 3T93B 2I0BA 3UA8A 4F1YA 5LOMA 3FUZA 1N7XA 2REGA 3OENA 4DXUA 3KZGA 1B1HA 3TAJA 4U21A 2Q8JA 5CBSA 3DP4A 3I6VA 1B7HA 4P0GA 2VD3A 1DTZA 3HN0A 4HTGA 1Y9UA 3PUXE 2X7QA 1B4ZA 3OO7A 4DDDA 2ONSA 2OZZA 4FIMA 3CVGA 1OLAA 1YPNA 4R6KA 3TTKA 4EF2A 3PMXA 2P2AA 2B65A 3TCFA 2F97A 1B05A 4YKJA 2GHBA 2O68A 4GLIA 3TQLA 3KN3A 4O3AA 4LQ5A 5B7DA 4QSCA 2RC8A 1IUDA 4F22A 3DLNA 4NTLA 3C9HA 3PD9A 4KD5A 1ZKBA 4G77A 4JXIA 2Z23A 1JW5A 3ILUB 4XKRA 3RNNA 2AYSA 3ILTB 4NE4A 4KYDA 4R6YA 3JYRA 1BP5A 4JWXA 1N3XA 4IO5A 1XOCA 4XTCQ 2PX1A 4EQ9A 1AOVA 3IL1B 3MP6A 3C36A 4N6PA 3EPEA 1POY1 2V25A 2NXOA 4KPTA 1TXFA 4XKNA 4QFNA 5CMBA 4MBPA 4MLQA 2H4IA 2THIA 3R7XA 1QUJA 3FVGA 5ITOA 3HSTA 1NH8A 1MPCA 3IJXB 1PB7A 1NKXA 4R72A 2F8DA 1OQGA 3PMWA 4XIGQ 3QSLA 5AA2D 2ZNUA 1DPPA 4GXAA 1Y3NA 1FQDA 1EZOA 1FTOA 3MVYA 4I62A 4IB2A 4H6DA 1IITA 3T9HB 3RGYA 2R9JA 2V3UA 1MQGA 4F39A 1PB9A 5H8HA 5DVJA 3E3KA 5FTHA 3UK4A 3CFZA 1NNKA 1B3LA 3IO4A 5DEXB 2QSXA 4EXKA 3K01A 1N76A 4WXJA 3SEXA 1MM7A 3KJ7A 3TKDA 4KCDA 3VDFA 1LAFE 3IB2A 1Y3QA 3MZ1A 4KHZE 3S9MC 2DYXA 3FJGA 3F11A 2OJTA 2CZLA 4F2QA 4MLVA 5H8HB 1MRPA 4POXA 3K1PA 4KFQA 2ESNA 4GOTA 2O1LA 3W9VA 3MZBA 2VP1A 1Z7ME 4BDRA 1MS7A 4F29A 5EYFA 5L9OA 3BKIB 2QL3A 3SKPA 4Q30B 1I6BA 3KOTA 1B46A 2I6EA 1Q35A 3KG2A 5A5XA 4NF5A 1LFGA 2DQVA 4ZEDA 3N94A 3SEVA 4K3FA 4G8NA 3CRBA 4H8IA 1IQ7A 1PB8A 3IB0A 2XXTA 1MG1A 5KDTB 3MP1A 3IORA 4NF8A 4IY6A 4H1XA 1I69A 2O51A 2ZYKA 3T66A 1FQEA 1URGA 1UQWA 5I59B 3EHUA 5A5XB 4NF5B 1SVXB 4ND9A 1MPDA 1CE2A 2YPNA 2NOOA 1MY3A 2HZLA 3SERA 3GBBA 4H67A 2XXRA 1LCFA 4NF8B 1MH4A 2G93A 4LP2B 4G68C 3OSQA 1QW0A 1USYE 3HPIA 3FD3A 1A40A 2QS4A 3OEMA 1IIWA 5DTBA 5ICQA 4U22A 1Y4CA 2B3FA 4OWDA 1BLFA 3BBRA 3EQ1A 1RYOA 1JEVA 2XXPA 4XXUA 2Q89A 1HSJA 4QFPA 2F7CA 2XXUA 3RQTA 5CBRA 3CR9A 5FHOA 2V3QA 3DP6A 4WKMA 1S7YA 3PUZE 4ELOA 2O7IA 1ZJLA 3LSWA 5HPQA 1Y1ZA 4R73A 2IEEA 1JVYA 1AMFA 1N0TA 3K6UA 2YJPA 4YAHX 4R9FA 4EDPA 4X48A 2XD3A 3LSLA 2Y7KA 2XX9A 4QFKA 2FA7A 1B9JA 1OLCA 1N7WA 1A99A 1A7LA 3CIJA 1WODA 2XXYA 4KI0E 1B4HA 4UACA 2VGQA 4FATA 2CMOA 1WDNA 4NF6A 5TPAA 1FQBA 5IAIA 1D4NA 5B70A 4IO3A 3R6UA 3OEKA 3MJNA 1PBPA 4DCXA 4H5FA 4ZEFA 2ZNSA 4X1BA 3T9XB 1CB6A 1NNTA 4R74A 2Y7IA 4DXBA 2O6AA 4QSEA 5I57A 5CRYA 1H45A 3Q25A 3O9PA 4NF6B 5TPAB 3KEIA 2XXQA 2WKYA 3E4RA 3FVOA 2DE2A 3SEWA 4F1UA 3OXNA 3H6TA 4LZ7A 4MF3A 3M3FA 5ITPA 5TU0A 2Z8FA 5AA3A 1MXUA 3PPNA 3QYTA 5TP9A 4LUBA 4DIGA 2V84A 1MQHA 3IOUA 5I57B 4U2RA 3C31A 1B3EA 3MWBA 2RF1A 3FATA 3CG1A 4TOZA 1Y20A 3N5LA 2ZMBA 1Z7NE 3U1OA 5K2XA 1QULA 1EZ9A 3H7MA 1B6HA 3B6WA 4UA8A 4I1DA 4F2OA 5TP9B 3IB1A 4EQ7A 4WEPA 1O64A 3VVDA 3H6VA 2W7YA 1J1NA 5JK4A 1MH3A 2RKMA 3H06B 3RPWA 3K6VA 4YB7A 3PUYE 4PFTA 4ELQA 3QK6A 3QXMA 1FQFA 3E9XA 2QJEA 4ZECA 2H98A 1GGGA 4RPNA 4OMBA 1EH3A 5H8NA 1M5EA 1JEUA 1B5JA 3MBPA 1OVBA 3TYHA 4Q5TA 1LAHE 3SEYA 4H5GA 1JQFA 2XXXA 4YU0A 4G4PA 5HBCA 3B7DA 4U1ZA 3CFXA 4F1VA 3H6WA 2DOJA 4TQUQ 2Z8DA 3G3HA 1DTGA 1A55A 1DPEA 3UGWA 3VE1B 3RTFB 3KSXA 4U4SA 4OEUA 1SQYA 3I5OA 3ODBA 2E0SA 3CSBA 2FYIA 3PPOA 3K1NA 3OOAA 2HXWA 3Q27A 1XS5A 4YKPA 3VFJA 2YLNA 1FTJA 4Q8RA 3S9EA 1MY1A 3OELA 1M5FA 4ZS9A 5I56A 3M8UA 1UTBA 1O63A 3RTWB 3OO6A 3KGCA 4RK9A 4JWOA 1XHYA 3LSXA 1ATGA 4IO6A 4QFLA 3QAXA 5KZTA 3GBAA 4G8MA 3TEPA 4OVJA 3MUQA 2I49A 3ZS6A 5I58A 5F1QA 4O3CA 3TCGA 1H3DA 4NWCA 5I56B 1SI0A 1UTBB 3E13X 5DT6A 2ZYOA 1JVXA 3V5AA 1B3FA 4GL0A 1HSEA 1MM6A 4ELRA 4OEVA 5I58B 3O66A 4ZDMA 2HQ0A 2ONKE 2DP8A 1TFAA 4OFLA 1DOTA 3PV0E 3TZAA 5L8DA 1ZTYA 3LSFB 2E1SA 3CI8A 4TLMB 1P1WA 3O28A 5L9SA 4HCYA 3AXFA 2D3IA 5EHMA 1TT1A 3PGFA 3QUJA 3N26A 1IXGA 2Q88A 1B0LA 5FHNA 4E0XA 3T9VA 3K0VA 2QMWA 3IR1A 4NF4A 1KWHA 5BWJA 3S4UA 4ISUA 5ICTA 2RC7A 3R26A 1LAGE 3DM0A 2Y7WA 1ZU0A 2XHDA 1B5IA 1Y3PA 4PFUA 2DXRA 4ZZEA 3H3GA 3U93A 1FTLA 3O29A 2GH9A 1N04A 3WAEA 3A3UA 2M8CA 4NF4B 1BTJA 1YTVA 1MQDA 1QJMA 2XXIA 3H03A 3L6HA 4P0IA 4NEDA 1POTA 1NNPA 2Y7RA 3MQ9A 1D9VA 1B52A 1OVTA 1B58A 4F3SA 5JTYA 2V3TA 1D9YA 3JV9A 4YB5A 3FXRA 1H43A 3IOTA 4ZEBA 4N13A 2A5TA 4YMBA 1FQAA 3EHTA 3HHGA 1LB8A 3S2VA 3KN8A 5I2NA 1DMBA 3MPKA 3PPRA 4RNSA 3TTNA 3TUSA 3OD7A 4IGRA 1B1XA 4ECFA 2O1MA 1JETA 1FTMA 3PUVE 1NL5A 1ANFA 3VXCA 2P1SA 4GFRA 5JTYB 3B6TA 5EHSA 4R2BA 4KR5A 3CFLA 2QS3A 1GV8A 4ONYA 4ZZAA 1MDP1 5I2KA 5K2YA 2A5TB 4KQPA 4P11A 5I2NB 2H99A 1IXHA 1A8EA 2D5WA 2HAUA 1QUKA 2HAVA 1LGBC 2DSFA 3PPPA 1AH5A 4H65A 2GHAA 3SDFA 4NWDA 3IO6A 4BDMA 5DYHA 4G68A 5I2KB 5CI5A 4DZ1A 2R6GE 2ZXTA 4DXCA 4DCYA 3K4UA 2ZYMA 1PBQA 1XVYA 4NMYA 2PT2A 3FV2A 4HCWA 1B7ZA 4OZ9A 1IZ1A 2UVHA 1GVCA 3VVEA 3TTMA 5I84A 2PT1A 1SDXA 2XX8A 3FVNA 4G68B 1B3GA 4AB6A 2R71A 4QF9A 2DE4A 3T22A 4C1TA 1VSOA 4OESA 1PC3A 1B3HA 1LBBA 4YB6A 5H8FA 3Q28A 4RK2A 2OWSA 2GFEA 4GD5A 2P0SA 3EF7A 4R2FA 1SBPA 4EUOA 5AA4A 3TQWA 1I6AA 2HFBA 1MXXA 4U1OA 2UYFA 3VV5A 4FECA 5H8FB 4LZ8A 3OO8A 3MZ9A 1LSTA 2OLBA 2HZKA 3TPAA 3IK6B 3THIA 5AA4B 3FV1A 3JZJA 3TDJA 2B3BA 1L5TA 1QKBA 2QPQA 2X26A 4O3BA 3V89B 1LB9A 2F34A 3Q26A 1SW2A 1IXIA 4FJPA 3C33A 1S9TA 3U92A 2DXYA 3T9UA 4FAJA 1MY4A 4PE5B 3FIRA 2X7PA 3OMBA 4YICA 1MY2A 2I48A 1ELJA 1H44A 1LFIA 1UTHA 4GIZA 1LBCA 4OETA 4YZZA 1MQIA 1B40A 2XD2A 4X1DA 1DSNA 1LLSA 1M5CA 3IJOB 1URSA 1SW5A 4EF1A 3VLUA 3PPQA 1OIBA 3M3KA 2Y84A 4BDLA 1O7TA 1MPBA 3IOVA 2KLFA 4BLAA 3N6UA 2I4BA 4FEDA 2QRYA 3D4CA 4LONB 3UN6A 2F35A 2DWJA 1UTHB 5H8SA 1LAXA 2ZNTA 1R9QA 2OWTA 2IA4A 4FEBA 4EXLA 4JB7A 4G8HA 1NNFA 3C34A 3O2AA 2Y7PA 3EN3A 3FVKA 3G3KA 3Q29A 3RLFE 1Y4TA 2OBGA 4HW8A 1B0HA 5FHMA 3FZVA 2ALUA 3MAMA 4Q0CA 1XT8A 5H8QA 2DE3A 3RT8A 3ONMA 2AL4A 3U8QA 3O97A 2VHAA 4GVOA 2H25A 3ZKKA 4HS7A 2HEUA 3QIMA 4LZ5A 4KCCA 4F3BA 2VOZA 5H8NB 4OHNA 1SW1A 2PBWA 4JDFA 5DVFA 2Q9TA 3A3CA 3V83A 2ZYNA 4F3GA 3FGSA 3FXQA 5H8QB 3KSJA 2HCAA 4RXLA 4PFWA 3TTLA 1TFDA 3UP9A 2GRVA 3K6WA 3MP8A 1MXWA 3K2DA 2F78A 1A8FA 1YCJA 1P1NA 1SYHA 4H8JA 1USYH 3TFLA 3S9LC 4QFOA 5JEIA 5HM4B 2I4CA 1MXYA 4GWOA 5CMCA 1MXVA 1OQHA 4JSOA 3ZKLA 1XVXA 5DVIA 1I6QA 5KCJA 3I3VA 3LR1A 3TODA 2UXAA 4F31B 4G2ZA 4IGTA 3SESA 2PMSA 1SI1A 2AIXA 3K02A 4QHQA 5AA2A 1RYXA 2VD2A 3TMGA 4LA9A 2REJA 3N6TA 1MDQA 4LVQA 4F18A 4N07A 4X9TA 1BIYA 3USDA 3DELB 1H76A 1SW4A 5KCJB 2UVIA 3RN8A 2O7UA 3A09A 1GTKA 1LFHA 2XXHA 1VFDA 3GZGA 4YKKA 3TELA 1ZIUA 1HSLA 5DEXA 5AA2B 2RCAA 3W9WA 3B6QA 2PYYA 3FJMA 5L9MA 4LATA 3RUMA 1BKAA 4M1VA 1URDA 2F36A 4OENA 1P1UA 2UYEA 3LC8A 2NUVA 4C1UA 3FASA 1TWYA 1B2HA 4ESXA 1B32A 4MFIA 2Z8EA 4XKQA 3SETA 3KN7A 3PUWE 2ANJA 3K6XA 4YMAA 4XKPA 3C32A 2AL5A 1N3WA 2F7BA 2RCBA 3WAFA 4ELPA 4AB5A 4OERA 4L17A 4E0WA 1IEJA 1N84A 1US4A 2BJJX 1VR5A 1F9BA 3KJTA 4IO7A 2DS9A 1MXZA 3GXAA 4RYAA 3U72A 4RJZA 4AQ4A 1R1NA 1D3KA 2RC9A 4IO4A 2H5YA 3TCHA 1II5A 1Q1KA 2F6GA 4GXSB 5KDTA 2F7AA 4QRZA 1A54A 3O6IA 2Z22A 2ABHA 3CSGA 3KFMA 4JSDA 5I59A 2QS1A 3HHFA 1R9LA 4RY1A 4ZE9A 2XXVA 3MVZA 3SEUA 2DWHA 1B5HA 4FE8A 1SD3A 5CC2A 5ISUA 1VE4A 3GLBA 1PEBA 3BFTA 1P1OA 3G3FA 3T96B 1NMUA 3UIFA 3UORA 2F5XA 2XXWA 1FQCA 2I58A 3HCQA 3MVXA 4Z0IA 3OO9A 2LAOA 4PP0A 4U4XA 1JW1A 4FORA 4PETA 3ECRA 2RINA 4F3PA 4R6HA 1NFTA 3PD8A 3KBRA 1JW4A 3LUYA 4JBZA 3G3GA 2V93A 1ZBMA 1US5A 5CMKA 3FXUA 2NVUB 4BDNA 4H0WA 1UIVA 1FW0A 3MW0A 4YKIA 1P99A 4I9DA 2O84X 4GL8A 1QVSA 3LBSA 3U94A 3H4ZA 4PQJA 1EU8A 4DE8A 4ZEIA 2UVGA 3P7IA 1R6ZA 4ZE8A 3IX1A 1ZMGA 4R75A 1M5DA 3VLWA 3RY3A 3H6UA 3MC2A 2DWIA 2H9BA 4RPOA 1ZLQA 4I8CA 2XX7A 3L6GA 4M4GA 5F7VA 3VXBA 2FNCA 3VLVA 2A5SA 4OFJA 4R9GA 1MY0A 3O6GA 4IY5A 3PMVA 2ONRA 2QMXA 3FJ7A 4JWYA 4TLLB 5J1DA 3KOSA 3TTRA 4RA1A 1P1QA 1UIUA 4EQBA 1YAEA 2I3VA 1SYIA 3QUFA 1XC1A 2DVZA 1B7UA 1QUIA 3K1MA 3W15C 1JNFA 3DP8A 4OXVA 3MVWA 3EHSA 2DWAA 4WEDA 2DVCA 3K00A 3PU5A 4POWA 5BUUA 1Y1MA 3M3LA 2D21A 1IXCA 2Q2CA 4ESWA 2Q2AA 4GQOA 4GF8A 4IO2A 2UVJA 1MQJA 3HV1A 2I0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RKMA 2O69A 4P1LA 4N8GA 4PDHA 2B4LA 3IAZA 1WVJA 3V8XB 4OQOA 1PDAA 3MPLA 4KYSA 4XF5A 1FTKA 3VVFA 2NWJA 1AIVA 4OTEA 4THIA 4NX1A 1OMPA 1B51A 3C35A 4GWUA 1S50A 1GR2A 3G3IA 5ELVA 4BDQA 1NH7A 4Z7EA 4MH5A 5AE4A 2G29A 5AA1A 3RT6B 2F6PA 3PTYA 1M5BA 4C0RA 1CNQA 1EZPA 4DLDA 1INPA 5IKBA 1FCKA 3O6HA 4OYVA 2OCUA 2XWVA 3BFUA 1T0KA 5FTIA 3OSRA 5M2VA 5CM6A 4QSDA 1VFEA 4KYEA 4P9KA 5CMMA 4LQ2A 4PFYA 3G7WA 2PVUA 3C4MA 1AL3A 3G3JA 4OFOA 2QS2A 2I3WA 3CG3A 3IOWA 4BDOA 4NN3A 3D4GA 3HO7A 1QKAA 4F19A 2OK2A 4GRKA 3ZSFA 4U23A 2XWIA 1LCTA 3S9NC 4O8MA 4ZEKA 3T93B 2I0BA 3UA8A 4F1YA 5LOMA 3FUZA 1N7XA 2REGA 3OENA 4DXUA 3KZGA 1B1HA 3TAJA 4U21A 2CZIA 2Q8JA 5CBSA 3DP4A 3I6VA 1B7HA 4P0GA 2VD3A 1DTZA 3HN0A 4HTGA 1Y9UA 3PUXE 2X7QA 1B4ZA 1IMDA 3OO7A 4DDDA 2ONSA 2OZZA 4FIMA 3CVGA 1OLAA 1YPNA 4R6KA 3TTKA 4EF2A 3PMXA 2P2AA 2B65A 3TCFA 2F97A 1B05A 4YKJA 2GHBA 2O68A 4GLIA 3TQLA 3KN3A 4O3AA 4LQ5A 5B7DA 4QSCA 2RC8A 1IUDA 4F22A 3DLNA 4NTLA 4PAIA 3C9HA 1NV1A 3PD9A 1NV6A 4KD5A 1ZKBA 4G77A 4JXIA 2Z23A 1JW5A 3ILUB 4XKRA 3RNNA 2AYSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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