5I57B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
277
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 79
structure length 277
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B02
4G8HA 2OLBA 3UK4A 1B51A 3K6UA 1QKAA 3PPOA 2F5XA 5EYFA 4NF5B 4YKJA 4KCCA 2V25A 3U92A 4WKMA 3HHGA 1NKXA 4ISUA 2VD3A 4THIA 1RYOA 1S50A 1PDAA 3KBRA 2ONRA 3FASA 3OSQA 2QSXA 4F19A 1UQWA 2OBGA 3S9EA 4OFJA 3W9VA 4Z0IA 1UIUA 2UYFA 1T0KA 3OENA 2PT2A 3CRBA 3CR9A 1A55A 3KG2A 3Q25A 4IGTA 2O1LA 3PD8A 3G3GA 4I1DA 4R73A 1FTMA 2DSFA 1OMPA 1XOCA 3K4UA 1ATGA 4ELPA 2G29A 1LGBC 3K01A 1IITA 3CVGA 1N04A 2H99A 4PE5B 1LAHE 3MPLA 3FIRA 1N7WA 4EQBA 1DTGA 2D5WA 2O68A 1IIWA 1GV8A 4LZ7A 3QK6A 2Y7KA 1P99A 3FD3A 2AYSA 2DE2A 3A09A 2I49A 3O28A 3VLWA 3O97A 2V3QA 3PGFA 3IK6B 3PUXE 1B58A 4GXSB 4LQ5A 3V8XB 4HS7A 3KJ7A 2NWJA 5K2YA 1PBQA 3LSXA 1EU8A 4R6HA 5LOMA 3R6UA 3I6VA 3QIMA 1O63A 2BJJX 2DVCA 3TDJA 1FTOA 2X7QA 1MXYA 1FCKA 4EF2A 2HZLA 4M4GA 5L8DA 3OO7A 4KFQA 3S4UA 2PBWA 3BKIB 2F6PA 4Z7EA 4GXAA 4RA1A 2G93A 4ZZEA 1JVYA 1TFAA 1MY4A 1LAFE 4NWCA 2HZKA 1URSA 1MS7A 4JBZA 4U4XA 3EHUA 1QULA 4YKKA 3RGYA 1FQCA 4U1OA 3C31A 2UVIA 3KOSA 3S2VA 3UA8A 2P0SA 1NNKA 2DWIA 2Q2AA 3N26A 1AH5A 1VSOA 2H98A 4F22A 1MQIA 3T9XB 1PB7A 3D4GA 2KLFA 2F7CA 5CMMA 1JW1A 3S9MC 2I0BA 3BBRA 1SD3A 2GRVA 1N7XA 1SI1A 1YAEA 4OFOA 3OOAA 4DCYA 1JVXA 2XXUA 3KSJA 1MY1A 1PB9A 3FATA 1HSLA 3S9NC 2RCBA 2QPQA 3CI8A 5KDTA 3ODBA 1B7ZA 4JDFA 4O3CA 2R9JA 2H5YA 4YB6A 4BLAA 1SVXB 2NOOA 1VE4A 3SEWA 3Q27A 3ONMA 3M8UA 2FA7A 1XVYA 5KZTA 5ICQA 1OVTA 4PQJA 4DXBA 4GQOA 3I5OA 1ZKBA 2Z23A 1MM6A 1MPCA 3G3KA 4XKRA 1D4NA 2X7PA 2F7BA 2HEUA 4F3SA 2THIA 3KFMA 5I58A 1MY2A 2GHAA 5DVJA 1ZTYA 4HW8A 1Z7ME 5AA2D 3TQLA 2XXWA 5F7VA 2QMXA 5DVFA 3UGWA 3C4MA 5H8FA 2DE3A 3T93B 3MZ9A 3DELB 4ESXA 4BDQA 1LFIA 4ZEDA 1KWHA 2XXTA 2UYEA 1MXUA 4ZE9A 1D9VA 3MVXA 3IO4A 3SESA 4GOTA 4EQ9A 5I2KA 4L17A 1FTLA 3MVWA 3EN3A 5DVIA 5TP9A 5HM4B 3K0VA 5KDTB 1MY0A 5B7DA 1SW5A 5ICTA 3K2DA 2W7YA 2R71A 1US4A 1DTZA 3CG1A 1WVJA 1B6HA 4F3PA 1OLAA 4OERA 1SW4A 4YKPA 4PP0A 2HXWA 3D4CA 3FXQA 3LUYA 3RPWA 4ZDMA 4U1ZA 2YPNA 2PX1A 1IEJA 3TTKA 3U8QA 2YJPA 2M8CA 5A5XA 2R6GE 3Q28A 1O64A 3C35A 3RLFE 2Z8FA 4X9TA 5I58B 3MWBA 3O29A 4F1UA 1B7UA 5AA2A 3OO9A 3WAFA 2XXRA 5AA4A 2ZYNA 3TEPA 3E9XA 1B5JA 5H8HA 3HPIA 4X48A 3A3CA 3USDA 1QJMA 5H8FB 2ZNSA 2F8DA 3ZKKA 2GFEA 3SEYA 5CBRA 1M5FA 4ELQA 1YPNA 5I2KB 2DYXA 3GBAA 5CMCA 4JWYA 3QUFA 2Z22A 3PUVE 3TTMA 2P2AA 1AL3A 1FQDA 3MJNA 5TP9B 1MXWA 4ZE8A 2OWSA 1B1HA 4DIGA 4PFTA 1QVSA 1A7LA 4Q8RA 2CZLA 4R72A 3A3UA 1EZ9A 1B9JA 4HTGA 1LBBA 3VVEA 1ELJA 4C1TA 3FXRA 4ELOA 4G77A 1B0HA 1B3FA 2DWHA 1POY1 3H6WA 5A5XB 3H6TA 4PFYA 4QSCA 4O3BA 2QRYA 3ECRA 1MXXA 3SERA 4ZEBA 5AE4A 2HQ0A 4POWA 2VOZA 5AA2B 2B65A 3I3VA 4K3FA 4PFWA 5AA4B 4I8CA 1QW0A 3VDFA 4RY1A 5H8HB 4ZZAA 3P7IA 4H6DA 3G7WA 3KEIA 3N6TA 3OO8A 4TLLB 3CFXA 3K6VA 3OSRA 3MW0A 2PYYA 4G2ZA 3TMGA 2XXIA 2UXAA 3B6TA 4KQPA 2P1SA 2XXXA 4YAHX 1M5EA 1DPPA 2F36A 2UVHA 4I62A 3UORA 5L9SA 2ESNA 2RC8A 2Z8DA 1Y1MA 2I48A 1AMFA 2NVUB 1A99A 3ILUB 4H65A 2CMOA 2B3FA 1TWYA 4QHQA 4ELRA 3MUQA 1Q1KA 4EXLA 1Z7NE 4NF4A 3K1NA 4YMBA 2DXRA 3RQTA 3T9HB 3T96B 1AIVA 1Y3NA 3Q26A 2DQVA 4X1BA 2H9BA 4U23A 3KOTA 4FAJA 4OXVA 1LFHA 3TCHA 3PU5A 1QKBA 1N3WA 3M3KA 4FE8A 4LQ2A 3H4ZA 1B5IA 4LATA 4F2OA 1TT1A 2ABHA 3PMWA 3UN6A 3FXUA 3SEVA 4F18A 4RK2A 3IOVA 2I4CA 3DP6A 3G3FA 4LP2B 4RPNA 3KSXA 1MM7A 3ZKLA 2RINA 1NMUA 2XD2A 2A5TA 4EUOA 2ZMBA 4ZEKA 4IB2A 2ZXTA 4YB5A 3QYTA 1ZIUA 4H1XA 1BLFA 4H5GA 2O7IA 2Y7WA 3TCFA 1EZPA 2HAVA 1R9LA 3CG3A 4NF4B 3MQ9A 4LA9A 3IJXB 1Y3PA 5FHNA 4RJZA 4UA8A 4AQ4A 1PEBA 1EH3A 3SEXA 4QFOA 4OHNA 1D9YA 3K00A 1FW0A 1F9BA 3HHFA 1FQBA 4QRZA 2E0SA 4MBPA 2QMWA 4LVQA 4IO3A 3TPAA 5CMKA 2PT1A 4AB6A 1LCFA 3GBBA 4NF6A 4OETA 1R1NA 1XHYA 3N6UA 1DPEA 4ND9A 3IORA 3LC8A 3C32A 3QAXA 1A54A 4R6KA 3PMXA 2DWAA 1HSEA 1RKMA 2H25A 2QJEA 3MP6A 3IOTA 2ANJA 2A5TB 4HCWA 3DM0A 1H44A 1MQGA 2F78A 3O9PA 4R74A 3AXFA 1XS5A 3TODA 4YB7A 3EQ1A 3OMBA 3CSGA 1Q35A 3FVGA 2I6EA 1IZ1A 3JV9A 2ZNUA 4I9DA 3SDFA 4C0RA 3IAZA 3T22A 1ZLQA 4AB5A 3JYRA 4JXIA 4Q30B 3WAEA 3VLVA 1B3GA 3DP8A 4JB7A 3H06B 2UVGA 4JSDA 1MQHA 1OQGA 4NTLA 4ZEIA 1PC3A 1MPDA 1Y9UA 3V83A 4XKPA 2DXYA 1OQHA 4G68A 4P11A 3PMVA 4NF6B 1BP5A 5B70A 4OENA 2YLNA 3K02A 4U22A 3EPEA 1S7YA 3FGSA 4OEVA 4RNSA 1IUDA 1OLCA 4DDDA 4IO6A 2REGA 4G8MA 3V89B 1N76A 3Q29A 1HSJA 1B46A 1I69A 4IO2A 4PETA 3ZSFA 3MVZA 3MP1A 2Q2CA 4TLMB 5TPAA 1UTBA 1M5CA 1CB6A 3KJTA 1FQFA 5JTYA 1MPBA 5ELVA 1FQAA 3C34A 4F1YA 4FECA 3B6QA 5J1DA 5ITOA 3VVDA 1TXFA 1US5A 4KCDA 1JETA 2I0CA 2O6AA 5L9MA 4G68B 4U2RA 2I58A 3M3FA 2OWTA 4ZEFA 2DE4A 1BKAA 5M2VA 3RN8A 3OD7A 4H0WA 2PVUA 1P1NA 3OEKA 4OZ9A 1H43A 4UACA 1SI0A 1VFDA 4NWDA 4GWOA 1II5A 3IB0A 1NNTA 2HFBA 3LR1A 5TU0A 4U21A 2PMSA 5DTBA 1GVCA 1SYIA 4EF1A 4YICA 3TTRA 4GL0A 4R75A 2RKMA 1A40A 2X26A 2ZYOA 5IAIA 2F35A 3C9HA 2HCAA 3PV0E 5TPAB 1UTBB 3THIA 2DP8A 3FJ7A 2VGQA 1IXHA 3OEMA 3W15C 4NMYA 4XIGQ 1NH7A 3TKDA 4RK9A 1H76A 1NL5A 1N3XA 4KYEA 3FVNA 2V93A 1LCTA 2DS9A 3PUYE 1R6ZA 3PUWE 1FTJA 1POTA 4F1VA 4H8JA 4BDMA 1BIYA 3TZAA 5JK4A 3KZGA 1XT8A 1JEVA 2XX7A 1QUKA 3FJMA 3HCQA 1P1OA 4H5FA 5JEIA 1B40A 3EF7A 4E0WA 4F3BA 4N07A 1M5BA 2HAUA 3VVFA 3IOUA 3V5AA 1XC1A 3PPQA 4R9FA 3EHSA 1QUIA 3MZ1A 2VHAA 1IXCA 4MF3A 2IA4A 2Y7IA 4QFLA 4MLVA 4F2QA 3VFJA 2REJA 3SETA 4TOZA 1MDQA 1JNFA 1D3KA 2WKYA 2F97A 1I6BA 3B6WA 2I3WA 1YCJA 2OCUA 3MP8A 3O2AA 4QSDA 4R2BA 3SKPA 1YTVA 4ECFA 1N84A 4FJPA 4JWOA 4OTEA 3G3HA 1B7HA 4GLIA 3HN0A 1SW1A 3QXMA 3C33A 4M1VA 2NUVA 4Q5TA 1P1WA 4EXKA 3N5LA 1R9QA 4QFKA 4N6PA 5H8QA 3OO6A 4F31B 4F39A 1PBPA 2D3IA 3K6WA 1GR2A 2QL3A 4NF8A 2ONSA 1MG1A 1L5TA 1MH4A 1WDNA 1B1XA 4OYVA 3B7DA 5BWJA 3U72A 1UTHA 3LBSA 2F34A 5FHMA 2XXHA 3H03A 3IOWA 3H7MA 1UIVA 3KN7A 1MRPA 1A8EA 1JW5A 3BFTA 4KR5A 2XXYA 2Q9TA 1DSNA 2DVZA 1Y3QA 5KCJA 3W9WA 5I59A 3T66A 5DT6A 4DCXA 3HSTA 2XX8A 2RC7A 4ZECA 3N94A 1Y20A 3RY3A 5H8NA 1ZMGA 4KYSA 4TQUQ 1B4ZA 5DEXA 2NXOA 3UP9A 4O3AA 3PPRA 1B0LA 1OIBA 4G8NA 4EQ7A 2RC9A 3MZBA 3VXCA 5H8QB 1TFDA 1USYE 3IR1A 3LSWA 3FV2A 2QS2A 4QSEA 5CI5A 5FTHA 1MH3A 3K1MA 3RTWB 4NF8B 3VXBA 3G3JA 5I56A 2GH9A 1UTHB 3O6IA 2Z8EA 2D21A 2AL5A 4NE4A 1B2HA 2Y7PA 4FIMA 1SQYA 4XTCQ 4RPOA 3IB2A 1JW4A 4RYAA 4XXUA 3E3KA 2Q88A 1IXIA 2ALUA 2B3BA 4LUBA 2XXQA 5KCJB 5I59B 1B4HA 4IO4A 4MFIA 3KN3A 2O1MA 4X1DA 3TFLA 4IGRA 3TUSA 5H8NB 4KI0E 3LSFB 5DEXB 4YZZA 3CFZA 3QSLA 3FV1A 2E1SA 3E4RA 1NNPA 3IO6A 1SYHA 4OFLA 1MY3A 1LAXA 4DXCA 4LZ5A 4QF9A 3T9VA 1XVXA 2XXPA 3FUZA 1B3EA 4DZ1A 1O7TA 1EZOA 3PD9A 2ZYMA 3OELA 4F29A 2XD3A 5ISUA 3CIJA 5I56B 3O6GA 4BDNA 3RT8A 3R7XA 3RUMA 2Q89A 1IQ7A 4P0GA 1FQEA 4C1UA 5CM6A 4FATA 3C36A 4H8IA 1Y1ZA 3TELA 3O66A 1MDP1 1SBPA 4JWXA 3TAJA 2V3UA 4MH5A 3TTNA 2RF1A 3U94A 1LLSA 3FVOA 2XHDA 3CSBA 3QUJA 1WODA 3K6XA 4QFPA 3KN8A 2IEEA 1Y4CA 1B3HA 2O7UA 1M5DA 3TYHA 3E13X 3PUZE 1I6QA 3IL1B 3EHTA 5L9OA 1VR5A 1IXGA 5H8SA 2GHBA 3FVKA 3HO7A 5EHSA 3L6GA 4U4SA 4OWDA 4BDOA 4BDLA 1MXVA 1B52A 1PB8A 3G3IA 3PPNA 4GL8A 1A8FA 2F6GA 4N13A 2DWJA 3CFLA 4LONB 4KPTA 5CBSA 5HBCA 5CRYA 3IB1A 1LB9A 3S9LC 4R6YA 4FORA 4DXUA 4R2FA 1H3DA 2V3TA 1VFEA 1OVBA 4P0IA 2I4BA 4FEBA 5CMBA 4MLQA 2O51A 4GFRA 1URGA 3ILTB 1B05A 4IY5A 3M3LA 2O84X 5I57A 1S9TA 1H45A 4ESWA 3LSLA 3TCGA 3PPPA 2F7AA 2QS3A 4WEDA 5ITPA 1CE2A 5IKBA 3F11A 4IO5A 5AA1A 1MQDA 1AOVA 1Y4TA 1RYXA 3GZGA 4LZ8A 3UIFA 4DE8A 5JTYB 3VE1B 4OQOA 1J1NA 2XXVA 5FTIA 4R9GA 2ZYKA 3RT6B 2Y84A 1SW2A 5HPQA 3OXNA 3MPKA 5AA3A 4GF8A 3TTLA 1ZBMA 3JZJA 3T9UA 1B5HA 3IJOB 1BTJA 4KYDA 2Y7RA 5FHOA 4FEDA 1B3LA 3MBPA 1LAGE 3MC2A 1NFTA 2LAOA 4OMBA 5DYHA 4ZS9A 2O69A 2ONKE 5I2NA 3H6VA 2RCAA 3IX1A 1ZJLA 3RTFB 3MVYA 3VV5A 1N0TA 4G68C 4YKIA 5I57B 3DP4A 2A5SA 2VD2A 3FJGA 3DLNA 1JQFA 4OVJA 4PFUA 3O6HA 1LBCA 3BFUA 5BUUA 4IY6A 1JEUA 4KD5A 4BDRA 2AIXA 1ANFA 4OEUA 3GLBA 4POXA 2OJTA 1MXZA 4Q0CA 2XX9A 3VLUA 4GD5A 3SEUA 5F1QA 2Q8JA 4JSOA 4GRKA 3KGCA 3U1OA 1B32A 2DOJA 4NF5A 3L6HA 1DOTA 2OK2A 1USYH 4YMAA 1P1QA 3RNNA 4RXLA 4EDPA 4OESA 2QS1A 5K2XA 1DMBA 1P1UA 1LFGA 1GTKA 5EHMA 2UVJA 4IO7A 4H67A 4KHZE 4ONYA 4HCYA 1GGGA 1I6AA 1ZU0A 4DLDA 2VP1A 4WXJA 5I2NB 4F3GA 1SDXA 2I3VA 1LB8A 1QUJA 5I84A 2V84A 3H6UA 3HV1A 1NH8A 5CC2A 1NNFA 3ZS6A 3U93A 2QS4A 3FZVA 4NEDA 4GIZA 2AL4A 3K1PA 4XKNA 2FNCA 1URDA 3R26A 2FYIA 3TQWA 4YU0A 3GXAA 1MQJA 4XKQA 3H3GA 4GVOA 2OZZA 4WEPA 1LSTA 2H4IA 2ZNTA 1FTKA 4E0XA 3MAMA 4QFNA 4G4PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IMF A;  4G8H A;  2OLB A;  3UK4 A;  3RPL B;  1B51 A;  3K6U A;  3B8B A;  1QKA A;  4DI3 D;  3PTY A;  3PPO A;  2F5X A;  5EYF A;  4NF5 B;  4YKJ A;  4KCC A;  4O7I A;  4AS4 A;  2V25 A;  3U92 A;  2WX9 A;  4WKM A;  3HHG A;  1NKX A;  4ISU A;  1QGX A;  2VD3 A;  4GX4 A;  4THI A;  1RYO A;  1S50 A;  1PDA A;  1EYK A;  1NUY A;  3KBR A;  2ONR A;  1FBD A;  3FAS A;  3OSQ A;  2QSX A;  4F19 A;  1UQW A;  2OBG A;  3S9E A;  4OFJ A;  3W9V A;  2QVU A;  4Z0I A;  1UIU A;  2KR0 A;  2UYF A;  1T0K A;  2CZI A;  3OEN A;  2PT2 A;  3CRB A;  3CR9 A;  1A55 A;  3KG2 A;  3Q25 A;  4MAG A;  4IGT A;  2O1L A;  3PD8 A;  1IME A;  3G3G A;  5LDZ A;  4I1D A;  4R73 A;  1FTM A;  1NV0 A;  1FSA A;  2DSF A;  1OMP A;  1XOC A;  3K4U A;  1ATG A;  4ELP A;  2G29 A;  1FPB A;  1LGB C;  3K01 A;  1IIT A;  3CVG A;  4N8G A;  1N04 A;  2H99 A;  1RDZ A;  1LAH E;  4PE5 B;  3ISP A;  1G0H A;  4N6K A;  3MPL A;  1IMC A;  3FIR A;  1N7W A;  4EQB A;  1DTG A;  2D5W A;  2O68 A;  1IIW A;  1GV8 A;  1FPI A;  4NF0 A;  2PFZ A;  4LZ7 A;  4OA4 A;  2XWK A;  2DDK A;  3QK6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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