5I59A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx 007
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
282
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 262
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A02
1B3FA 1SW4A 1N7XA 1P1QA 5H8SA 2XX9A 4Z0IA 3VLVA 3M3LA 4JWOA 3PGFA 4XKNA 2QS2A 3CG3A 4ECFA 3IJOB 1I6AA 3O9PA 2ESNA 3TPAA 4OMBA 2ZYMA 1LB9A 3IOTA 3L6HA 2VOZA 1AMFA 1MXYA 1Z7ME 4OWDA 3SDFA 1RKMA 3S9MC 3CI8A 4NF5B 2XX7A 1P1WA 4YKIA 1Y1ZA 1URGA 2DWHA 4IO2A 5M2VA 3MP1A 5JTYA 2XX8A 3V89B 1QKBA 4U1OA 3P7IA 3LSFB 2O7IA 3K0VA 3IOUA 1P99A 1IXHA 2OWTA 3CRBA 4ZZAA 4ONYA 2RC7A 3O66A 4HCYA 1MY4A 4LVQA 2Q89A 4MLVA 3PPNA 2GH9A 1MXVA 4KYSA 3HV1A 1MQDA 3U92A 1LFIA 4GOTA 1ATGA 2XXYA 3BKIB 3O97A 4NWDA 1TFAA 3FVNA 3SERA 3PMWA 2ZYOA 2DE2A 4F2OA 2QRYA 2QPQA 4GL8A 4OXVA 1LSTA 1MH4A 4F22A 2FNCA 3IR1A 2PYYA 3LBSA 3G3HA 5EHMA 3OEMA 4ZDMA 5A5XB 3T9VA 5LOMA 1UTBB 2VHAA 3E3KA 4ZE9A 5CMKA 4G77A 1AL3A 3IO4A 3Q25A 2I6EA 3SESA 2GRVA 3O6HA 4IO4A 4PFWA 1EZOA 2F97A 3VXCA 4KHZE 4N13A 3FVGA 1I6QA 2I4BA 4GF8A 3U93A 4PP0A 3DP6A 4QF9A 1A8FA 1ZJLA 2PT1A 3LSXA 3RQTA 3QUFA 5ICQA 5L9MA 4JWYA 3DLNA 3RLFE 4YU0A 4PFYA 3C35A 3PPPA 2XXIA 4OENA 2E1SA 3U1OA 4FORA 4YKPA 1EZPA 1FTKA 3U8QA 4C0RA 1MXWA 1DTZA 4JSOA 3TAJA 1YAEA 1M5EA 1LBBA 3LSLA 2VD3A 4RY1A 4GRKA 4YB5A 1B4ZA 1KWHA 4HCWA 1N3XA 3GXAA 2YLNA 2B3BA 1P1NA 2F6GA 3IOWA 2DYXA 5I2NB 2P1SA 2PT2A 5CI5A 4C1TA 3S9NC 1FW0A 5I58A 1VFDA 3OENA 2M8CA 1S7YA 2ALUA 3K2DA 1M5BA 2G29A 2H98A 2RC8A 3ECRA 5H8FB 2Y7PA 4DCYA 2UVGA 4UACA 1AH5A 4E0WA 3V83A 1B3EA 3FD3A 3FJMA 2WKYA 3H4ZA 3PD9A 2UYEA 2RCBA 1MS7A 3K6UA 1PB8A 1B1HA 1PC3A 1PBQA 3OMBA 1UIVA 1FTLA 4IY5A 4R9FA 3Q28A 2HAUA 2QS4A 3IAZA 3UGWA 4RJZA 4NF4B 3PPQA 3RTFB 2A5TA 1FQCA 1BTJA 4ZEDA 3ZS6A 1DPPA 3CVGA 4RPOA 4C1UA 3G3GA 4YKKA 2DQVA 4AB5A 2RCAA 5J1DA 2IA4A 3RY3A 1WDNA 3VVFA 4NF6A 1UTHB 3RUMA 4G8NA 4NE4A 4BLAA 1PEBA 1BIYA 5I57B 4OHNA 3RTWB 4IY6A 1QUKA 2R9JA 1SYIA 2THIA 3MJNA 4P0IA 4AQ4A 3T66A 1MY1A 4KCCA 1N0TA 3A3UA 3K02A 4U4SA 4F31B 1B3GA 1QJMA 1JVXA 1Y3PA 4QSDA 1SD3A 1ZTYA 3T9XB 1US5A 4I1DA 3FV2A 3MVXA 1JVYA 4K3FA 1IQ7A 4RNSA 1FTOA 2HCAA 5DVJA 3VE1B 2Z8FA 3EHUA 4OVJA 1SW2A 1TWYA 2OCUA 3IL1B 1ANFA 3JV9A 4FJPA 3MZ9A 1MDP1 3FJ7A 5BWJA 2CMOA 3HHGA 2D5WA 1OMPA 2DE3A 5I59B 3ZKKA 1B0HA 1XC1A 3IO6A 3TODA 4NF8A 3H3GA 1LGBC 2UVHA 4YICA 2Y7IA 4GXAA 1B7HA 4NMYA 1AIVA 4QFOA 1PBPA 1GVCA 5JK4A 1QUIA 2R6GE 4OYVA 4I62A 3VDFA 1BLFA 1NKXA 2F35A 2XHDA 4JBZA 1P1OA 4YMBA 5I2KB 1VE4A 1RYOA 3FASA 3KG2A 3OELA 1TXFA 5DT6A 4IO7A 2P2AA 2BJJX 3B7DA 5H8NA 3G3KA 2Q2AA 4KPTA 1QKAA 1Y9UA 3K1NA 1N3WA 4F18A 2A5SA 5CRYA 3DELB 4ESWA 1B5JA 1OLCA 2QMWA 2B3FA 1H76A 4H5FA 1MRPA 2V3TA 3GZGA 3H7MA 1HSLA 1TFDA 3UP9A 1VSOA 2IEEA 1POY1 5BUUA 2ONKE 2UVIA 3FVKA 4H8IA 2PX1A 1MPCA 5KDTA 1BP5A 4ZS9A 5ICTA 4R75A 4Z7EA 3TELA 3ZKLA 1LFHA 2XXXA 4BDRA 1B4HA 1OLAA 1B1XA 3PPOA 4DXUA 2ZXTA 2AIXA 3KSJA 2YJPA 2DWJA 1MM7A 1USYH 5HM4B 3MVYA 2H9BA 3U94A 5I56B 2DVCA 3G7WA 2QS3A 3S9EA 3KEIA 3LUYA 4GWOA 4DXCA 4G8HA 3BFUA 2ZNSA 3K01A 2VP1A 2QSXA 4ZEBA 1SBPA 2Y84A 2RF1A 5TP9A 2I3VA 3O28A 4POXA 1SI0A 2P0SA 1B6HA 1XS5A 3HSTA 3KOSA 4ZECA 3K4UA 4NF6B 3FVOA 1H44A 1URSA 2UYFA 3TTRA 5IKBA 1FQEA 5DYHA 2ZYKA 3EPEA 3C9HA 4NTLA 4QSEA 3Q26A 4GIZA 4MH5A 5FHNA 2ZNUA 3IJXB 3RPWA 5H8HB 3C36A 5K2XA 2O68A 1CE2A 4WXJA 2HQ0A 4ND9A 2H25A 1NNTA 2FYIA 5DEXA 3TQWA 2V84A 1QULA 1IXIA 3PUYE 2H5YA 4XKQA 2HZLA 3MVZA 3CIJA 2XXPA 4O3CA 1SVXB 3W9WA 3N26A 3C34A 2XXQA 3MC2A 3ODBA 5FTIA 1JEVA 4FEDA 1A7LA 1LCFA 5TU0A 1JNFA 4OETA 3IB1A 1B51A 2B65A 4XKRA 1S50A 4MLQA 4KYEA 3VVEA 1O64A 4DDDA 5FHMA 1NH8A 5AA2D 4BDNA 1O63A 3ONMA 2OK2A 4DIGA 3SEWA 2DXRA 3VLWA 3O29A 1B3HA 4FE8A 1URDA 2KLFA 5ITOA 3H6WA 3I3VA 4PETA 5AA4A 2Y7RA 1A40A 1Y3NA 4F3BA 4R2BA 2E0SA 3V5AA 3HO7A 3FUZA 3TMGA 4DE8A 3Q29A 4JXIA 4PE5B 3SKPA 3VV5A 3O2AA 1WVJA 1YCJA 5CBRA 2DS9A 2H99A 4EXKA 2PBWA 1ZIUA 3TZAA 1D3KA 3OSRA 3ILTB 5I84A 3KFMA 4N6PA 4OFOA 3T96B 1B32A 1R9QA 3QXMA 5K2YA 4N07A 2XXVA 5F1QA 4HTGA 3TTKA 2O1MA 4FATA 5L9OA 4X1DA 4G68B 4RK2A 1SQYA 4BDLA 1O7TA 4OEVA 3JYRA 2ANJA 2RKMA 3ZSFA 4QFKA 3PUZE 3F11A 2XXUA 2F5XA 3PD8A 4XIGQ 2F34A 1POTA 4H0WA 3THIA 3WAEA 4KCDA 1LB8A 3MZ1A 4YB7A 4LZ8A 2GFEA 3OOAA 4OERA 3QK6A 5AA2A 1MG1A 3I5OA 1UQWA 2I0BA 1MXXA 1QUJA 4GD5A 3TUSA 3B6QA 2NVUB 2CZLA 4YAHX 3IK6B 4ELOA 2R71A 4FEBA 5HPQA 3K1MA 1XOCA 3QAXA 4TQUQ 4QFNA 4U23A 3TDJA 4OTEA 3K6WA 1MPDA 2O84X 3HPIA 2DOJA 3KSXA 3VVDA 1B52A 2HFBA 3MW0A 4KD5A 2YPNA 2OZZA 2XXWA 3IOVA 4IGTA 1CB6A 5CMCA 4NWCA 1EU8A 1MQHA 1PB9A 2ONSA 5JTYB 2F8DA 1OIBA 4LZ7A 3QUJA 1ZLQA 5TPAA 4XXUA 4M4GA 3QYTA 1D9VA 2NXOA 4GVOA 1GGGA 1XHYA 4JWXA 2XXHA 4YMAA 2FA7A 3D4GA 3K6VA 1FQDA 4MF3A 4DLDA 3OO9A 3S2VA 4OFLA 2W7YA 3KGCA 2F7CA 3CR9A 1FCKA 4OZ9A 2UXAA 2ZNTA 4OFJA 1NMUA 3PMXA 4LATA 1A55A 1OVBA 2ABHA 3RNNA 2VD2A 1OQHA 3VXBA 1USYE 1D9YA 4NF5A 4RYAA 2OJTA 4F19A 3N6UA 3H6TA 3V8XB 2F36A 3G3JA 3D4CA 4OESA 4M1VA 4WKMA 3MBPA 3TCGA 3C33A 3S9LC 2ONRA 4Q0CA 1LLSA 1IXCA 5ITPA 3DP4A 1LAGE 3TQLA 1H45A 3MQ9A 3M8UA 1US4A 1B7ZA 3UN6A 1GR2A 4DZ1A 3H03A 1H43A 1NNPA 1ELJA 1PB7A 4IO6A 2XD2A 3RGYA 4R74A 1Q1KA 1GTKA 1MDQA 4EQBA 3PMVA 2F7AA 3OEKA 4LZ5A 4ZEIA 1EH3A 1A99A 1OVTA 2NUVA 4TOZA 4ESXA 5DVIA 2PVUA 2Z8EA 1LBCA 3OXNA 2O6AA 5A5XA 3EN3A 4F39A 5KCJA 1NL5A 1WODA 3SEXA 3E9XA 4FECA 2DE4A 5EHSA 2V93A 3RN8A 4KFQA 4LA9A 3SEUA 3N5LA 3OD7A 3PUWE 4X9TA 5H8QA 4F3SA 4O3AA 2I58A 3TKDA 1H3DA 4RA1A 4R6KA 3LC8A 2AYSA 3OO8A 3G3FA 3CSGA 5I58B 1QVSA 2REGA 4RK9A 3KN8A 2HAVA 2X26A 2O1LA 1MPBA 1B5IA 1MM6A 4H5GA 5ISUA 4R6YA 3DP8A 4ELPA 2F6PA 3K1PA 4QFLA 3T9UA 3B6TA 4P11A 4IGRA 1MXUA 3IORA 2Q88A 3FATA 3BBRA 3KJ7A 3C4MA 4X1BA 3FXUA 2I48A 4H67A 4E0XA 4F29A 4XTCQ 2LAOA 3S4UA 2UVJA 2A5TB 2Y7WA 2Q8JA 2F78A 5I2NA 1ZU0A 3UA8A 5B70A 1MQGA 2Z8DA 4LP2B 4LUBA 1Q35A 4AB6A 1MY3A 4FIMA 1A8EA 2PMSA 2G93A 5H8FA 4Q5TA 4OEUA 2DWIA 2XXTA 1YPNA 1N76A 1JW1A 3TCHA 4JB7A 3EHSA 3FZVA 3TCFA 1DSNA 4EUOA 1IZ1A 2REJA 1MY0A 1B46A 4G68C 1L5TA 4EQ7A 1XT8A 4NEDA 2Q2CA 2Z22A 1M5CA 4BDOA 4F1VA 3N6TA 1RYXA 4F1YA 4NF4A 4LQ2A 4EF2A 3MUQA 1IIWA 4MBPA 5DTBA 3EF7A 3I6VA 3MP6A 4HS7A 3HHFA 5HBCA 1B7UA 3E13X 1I69A 3EQ1A 1Y1MA 3PV0E 3FXQA 1UTHA 4NF8B 3SETA 1B9JA 5CC2A 1VFEA 4U1ZA 5I57A 1UIUA 1N7WA 1GV8A 1IUDA 2OLBA 3H06B 4EQ9A 1R1NA 2OWSA 1Z7NE 4ISUA 4ZZEA 4F3GA 3O6IA 5CM6A 1OQGA 4PFTA 4F3PA 4FAJA 3FXRA 3JZJA 3PU5A 2DP8A 1B05A 5CMBA 2I0CA 3ILUB 3Q27A 3CFLA 4DXBA 5H8NB 4YZZA 4THIA 1N04A 4OQOA 3EHTA 1LAXA 5KCJB 3LSWA 5I59A 1XVYA 1B58A 2HZKA 2V3UA 4WEPA 1SW1A 4PQJA 1NH7A 4ZE8A 1ZBMA 4H6DA 3GBAA 5H8QB 3KOTA 4LQ5A 3FV1A 1LAFE 3C31A 1M5FA 5L9SA 1FTJA 2AL5A 4Q30B 1SYHA 3W9VA 2I4CA 3MAMA 3KN3A 4EDPA 2VGQA 5CMMA 5KDTB 1ZMGA 1DMBA 2QL3A 4GXSB 3HCQA 5I2KA 4QFPA 3B6WA 3MVWA 2O69A 3H6VA 3SEVA 1Y20A 4QRZA 3UORA 3G3IA 2Y7KA 1NNFA 1B2HA 1FQFA 3BFTA 5EYFA 1I6BA 3OO6A 3PPRA 4GFRA 5KZTA 4G2ZA 4I9DA 3PUXE 5IAIA 4O3BA 5TP9B 2XD3A 2V25A 4QSCA 3CSBA 4ELQA 4KYDA 3U72A 1AOVA 2Z23A 4UA8A 1PDAA 4BDMA 3TTLA 1HSEA 3GBBA 5JEIA 3MPKA 3E4RA 1FTMA 4KR5A 2GHAA 2DWAA 3R26A 1ZKBA 1Y4TA 3C32A 1MY2A 1MQIA 3USDA 4R2FA 4MFIA 3HN0A 5B7DA 5I56A 1DTGA 4EF1A 2RC9A 2QMXA 3RT8A 3W15C 4G8MA 1Y4CA 5DEXB 1MH3A 5L8DA 4JSDA 3KN7A 3K00A 5F7VA 1NFTA 4U21A 4H8JA 1JW5A 1DOTA 1N84A 2I49A 1R9LA 1NNKA 2ZYNA 3TYHA 1LCTA 1JW4A 2OBGA 4BDQA 3H6UA 3OO7A 5AE4A 4KI0E 2ZMBA 3DM0A 4F1UA 2QS1A 5DVFA 3O6GA 1B3LA 2F7BA 3MZBA 4POWA 3VFJA 4IB2A 3CFZA 2O51A 2NWJA 1IEJA 2DXYA 4IO5A 1XVXA 3KBRA 3FIRA 4TLLB 1P1UA 5H8HA 4H1XA 4GQOA 4L17A 1JQFA 1SDXA 1JETA 1M5DA 3M3FA 4ZEFA 5ELVA 4GL0A 3TEPA 3N94A 2NOOA 2DSFA 4KQPA 4U2RA 4ZEKA 4R9GA 3PUVE 5AA4B 3LR1A 1LFGA 1IITA 3UK4A 1FQAA 4ELRA 1BKAA 2DVZA 5FHOA 3T22A 3RT6B 1FQBA 4XKPA 2X7QA 1VR5A 2HEUA 1R6ZA 4DCXA 3WAFA 1A54A 4QHQA 3A09A 2QJEA 1TT1A 1YTVA 3VLUA 2AL4A 3QSLA 1F9BA 1SI1A 3K6XA 3AXFA 4G4PA 3L6GA 5AA1A 3R7XA 1UTBA 1B40A 4JDFA 4EXLA 1EZ9A 4IO3A 1B0LA 4I8CA 2H4IA 2X7PA 3QIMA 1S9TA 4U4XA 3IB0A 3SEYA 3KZGA 3T93B 3A3CA 2D3IA 3TFLA 3OSQA 2XXRA 4TLMB 4LONB 3IB2A 3KJTA 3MWBA 4R72A 3GLBA 4RXLA 5AA2B 3FGSA 3FJGA 2D21A 4F2QA 3M3KA 4GLIA 2Q9TA 3R6UA 4H65A 1IXGA 4R73A 2O7UA 1T0KA 4RPNA 4YB6A 3TTMA 3CFXA 1D4NA 1Y3QA 1HSJA 4YKJA 3CG1A 4PFUA 1DPEA 4WEDA 1MXZA 2V3QA 1JEUA 1II5A 4G68A 2RINA 2HXWA 1LAHE 4P0GA 3T9HB 2GHBA 4U22A 5AA3A 1QW0A 5CBSA 3TTNA 4HW8A 4Q8RA 1MQJA 1J1NA 4R6HA 1B5HA 5FTHA 5TPAB 1SW5A 3IX1A 3MP8A 2I3WA 3MPLA 3UIFA 4X48A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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