5I84A

Structure of the xanthomonas citri phosphate-binding protein phox
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
DVTGAGASFIYPVMSKWSADYNAATKKQVNYQSIGSGGGIAQIKAASVDFGSSDAPLKPEELAAAGLAQFPSVIGGVVPVVNVPGIAAGTLKLDGKTLGDIFLGKVSTWNDPAIAALNPGVKLPEGKITVVHRSDGSGTSFNFTNYLSKVNPDWKGKVGEGTAVQWPTGIGGKGNEGVAAYVKQIKGGIGYVELSYALQNKMAYTAMKNAAGKFVQPSDETFAAAANSADWGTAKDFYLVMTNAAGDNAWPITATNFILVQKKPKNPAGLKNTLEFFRWVYTKGDAQAKQLDYVPLPDTLVTQIEAYWAKNLPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
publication title A gene duplication in phosphate-binding proteins from pho regulon of Xanthomonas citri: functional and structural studies
rcsb
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS
total genus 81
structure length 314
sequence length 314
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i84A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i84A02
3N6TA 1MPBA 3PUVE 5KCJA 3PPNA 3OO7A 4ISUA 1B0HA 3TYHA 3FGSA 2PMSA 4ELOA 3FXRA 5FHMA 1LBBA 4RY1A 1Y3PA 4ZE9A 4BDQA 3FXUA 1MM6A 1OIBA 3TDJA 3B7DA 1TXFA 1IIWA 4H8JA 3O6IA 3O97A 2REGA 5H8QA 1J1NA 3FVGA 4H0WA 3S9MC 4PFUA 2XXXA 2I3VA 5HPQA 3FV2A 1KWHA 4G8HA 4GXAA 1US4A 5I2KB 2ESNA 4F2OA 3GZGA 5AA1A 4X48A 4X1BA 4F1YA 4JSOA 1PC3A 4JDFA 4N13A 3IJOB 3PUWE 1BLFA 1A8FA 1P1WA 4R73A 1M5EA 3H6UA 3A3CA 3SDFA 4E0XA 4DZ1A 2I3WA 1D9YA 2DWIA 3TCGA 2NVUB 4LVQA 1NNFA 3EHSA 4MF3A 3PD9A 4G68A 1SI1A 1HSEA 3Q29A 1ZLQA 4EXLA 3TUSA 3MZ9A 3MVWA 1POY1 4OENA 2HAVA 1VSOA 1VR5A 2DWJA 1EH3A 1EU8A 4XKRA 1NH8A 2V3TA 1Q1KA 1UIUA 4NMYA 3B6TA 4PFTA 1XVYA 3T93B 4LZ5A 4QSDA 1B51A 3OXNA 2OBGA 1IQ7A 5FHOA 5AA2B 3RTFB 2R6GE 3KJ7A 2XXTA 3TTRA 1Y4TA 2NWJA 5CI5A 1YPNA 3MP6A 1RKMA 5DEXB 4C1TA 1PBQA 4LZ8A 4JWOA 3TTLA 1N04A 4M4GA 1JVXA 4WEPA 4QFKA 4P0IA 3KG2A 2F6PA 2OLBA 4XTCQ 5AA4B 3UN6A 4NF4B 1LAXA 1OVTA 4BDRA 1DSNA 3BKIB 4OETA 4H8IA 3RN8A 3MZBA 3SEWA 1FQBA 3C33A 4YB6A 5AA3A 3OELA 4HCWA 1PB9A 1OLAA 3H7MA 1I6AA 5ISUA 5L9SA 2RF1A 4KCCA 1N0TA 4FECA 3IOVA 4RPOA 3TAJA 4DXUA 1N3XA 1DPEA 4GOTA 3W9VA 2QJEA 3FJ7A 3IK6B 4MLQA 3VLVA 3QSLA 3OEKA 2DVZA 4GLIA 3HSTA 3PMXA 3HHGA 1ELJA 4IGTA 2O7IA 3PGFA 5CBRA 3MW0A 2GRVA 2PBWA 4ELQA 3THIA 4R72A 3V8XB 4U21A 1Q35A 2A5SA 3T96B 3CSGA 2QS2A 1PEBA 5H8NB 4IY6A 1MXXA 3OMBA 4U4XA 2YLNA 2Q8JA 1IZ1A 2ZNUA 3O6HA 2PVUA 4ESWA 1I6QA 2DVCA 4R74A 3TTKA 4PQJA 4NF6A 3ILTB 3G3FA 2QSXA 2XX8A 1R9LA 1IXIA 2I6EA 2NXOA 2DWHA 4POWA 3O29A 3CFLA 2IEEA 3H6VA 1A8EA 5DT6A 4F18A 1USYE 3C36A 4RK2A 5DYHA 1T0KA 4NF8A 1AMFA 4L17A 3FIRA 3K01A 1DTGA 4NF5A 3OOAA 1B1XA 3FVKA 2Q2AA 4JXIA 1Y3NA 1LFIA 2E0SA 5M2VA 3HO7A 1GVCA 1B0LA 3U1OA 4BDLA 3H03A 4QHQA 3HHFA 4ZEIA 4ZE8A 2QL3A 3K1NA 2AL5A 4YICA 3ODBA 3FV1A 3MP1A 4ZS9A 1OQHA 1B3FA 2FNCA 3BBRA 5DVIA 1XOCA 1FQFA 3RPWA 5I58A 1B9JA 2V25A 4EXKA 1OLCA 4LONB 4KR5A 4C0RA 4E0WA 3IB0A 2F5XA 4G68C 3KN8A 1AH5A 2UXAA 4R6HA 2F6GA 4OEUA 5CM6A 4JWYA 4F29A 3R26A 2XXUA 2XXPA 3UP9A 4ZEFA 1B1HA 1QKBA 1H43A 3EPEA 2GHBA 4I62A 5AA2A 1B05A 2W7YA 3K1PA 5AA2D 4U22A 5I56A 4IO3A 4H65A 3GBBA 4PE5B 1M5DA 4Q0CA 2DE4A 5DEXA 4DIGA 3MVXA 3VVEA 1AIVA 3K02A 1O7TA 3OSQA 2Y84A 4OESA 1URSA 1SD3A 5I2NA 3UGWA 2F35A 4FJPA 3P7IA 2AL4A 1GV8A 3VVDA 3K4UA 1FQCA 4KD5A 5AA4A 3OEMA 3IOUA 3PPQA 1XS5A 5F7VA 4RA1A 3IB2A 3VVFA 1MY4A 3GLBA 1ZIUA 2UYEA 1DOTA 1MQGA 5H8HB 2E1SA 1LAGE 2Y7PA 1MDP1 4BDOA 3FVOA 1MPDA 1B52A 3M8UA 3TCHA 5ELVA 3WAFA 2RCAA 2UVIA 1B5HA 2QRYA 3C32A 3FASA 4YKKA 4DDDA 3KGCA 2O51A 4DCXA 4YB5A 2F34A 3I3VA 2VD3A 1XHYA 3N26A 5I84A 5FHNA 2Z8DA 3TQLA 4ZECA 1FQDA 1H3DA 1AL3A 5CRYA 2V84A 4RK9A 2NOOA 3VFJA 3QXMA 3ZS6A 2BJJX 4LQ2A 1MXYA 2WKYA 3M3FA 4TLLB 3TMGA 4TQUQ 1P1UA 2Z8FA 4KPTA 1LSTA 1URDA 1B40A 1JEVA 1FTJA 5I59A 1OVBA 1Y20A 3K6VA 4EF1A 4Q8RA 4XXUA 4JB7A 3RT6B 2PYYA 4RXLA 4F39A 1MY3A 2RKMA 3HN0A 5IAIA 4OFLA 4Q5TA 4YKJA 1AOVA 5DTBA 4YZZA 2AYSA 4H1XA 4R9GA 4O3AA 4OVJA 1QKAA 5JK4A 1ZU0A 4ZZAA 3MZ1A 3FJMA 1NFTA 2ZYOA 1MXWA 3W9WA 3O9PA 3UK4A 3VE1B 2OJTA 3O28A 3PMVA 1I6BA 3S9LC 1H44A 1A54A 2B3BA 3IB1A 1PB8A 3UORA 2P1SA 3N94A 4FEBA 1R1NA 5KZTA 3D4CA 4Z7EA 4JBZA 1N76A 4X9TA 1MG1A 1MY2A 3CVGA 2QS1A 1LCTA 2V3QA 3F11A 4BDNA 3RNNA 3MC2A 4MFIA 3ZKLA 5AE4A 3ZKKA 4FE8A 1QUKA 2DP8A 3L6HA 1RYOA 4F2QA 4ZEBA 4IY5A 4KI0E 1IEJA 2KLFA 4IO4A 1MDQA 5I57B 1MQJA 1B46A 1FTKA 2QS4A 4XKPA 1A40A 3TTMA 1XVXA 1P1OA 5ITPA 3LSXA 2OWTA 2UYFA 3I5OA 3S9EA 3MUQA 4R2BA 2O1MA 4OQOA 2PT2A 2ZNTA 4KCDA 4ECFA 2I58A 1WODA 5DVFA 1FQEA 4U1ZA 3MWBA 1FTMA 2H4IA 3SEXA 2DXRA 3AXFA 4GF8A 4YB7A 4N07A 1Y9UA 1LAHE 1JETA 4F31B 1SW2A 3C35A 4WEDA 2Q88A 1B4ZA 3RUMA 4QRZA 4KFQA 4QFPA 1N3WA 3PPOA 4KHZE 4MH5A 1Y1ZA 3SEYA 3CI8A 1A99A 3IX1A 1N7XA 3RTWB 4EUOA 3O6GA 1DTZA 5TPAB 2O1LA 2UVHA 2OWSA 4ZEKA 1MQIA 1II5A 1GTKA 2XXWA 4GWOA 2VGQA 3L6GA 4EQBA 1IITA 4WXJA 4YKPA 1YTVA 5L9OA 4P0GA 2VD2A 1OMPA 4RPNA 1B4HA 2GFEA 4GIZA 5H8HA 3EHTA 3U8QA 1RYXA 1SDXA 4HS7A 4Z0IA 3A09A 3G3IA 1I69A 4H6DA 1QW0A 3H6TA 2HAUA 1B7ZA 4ELRA 3IR1A 2A5TA 3JZJA 3MVZA 2DOJA 2XXRA 4XKNA 3T9XB 2XX7A 1UTBB 4HW8A 2Y7RA 5EYFA 3OO9A 3QUJA 2H99A 2F97A 4LQ5A 4AB5A 4POXA 3C9HA 5K2YA 1CB6A 2RC9A 3SESA 3K1MA 3S9NC 5H8QB 3HPIA 3K00A 3U72A 4F3GA 5CMKA 3V5AA 3K2DA 4XKQA 1O64A 1SBPA 3PV0E 1YAEA 1URGA 1TFDA 4QSEA 3RGYA 4PFYA 2ANJA 3E9XA 1MXZA 2XXHA 3S4UA 3R6UA 5LOMA 3FD3A 5I2KA 4LUBA 4G8MA 1NKXA 2ONKE 4OFJA 2ZMBA 3KN3A 4THIA 3QYTA 3G3JA 1UTHB 2FYIA 2QPQA 1JW4A 5B70A 4I8CA 2O6AA 3FXQA 3KN7A 3QK6A 4F3SA 3PMWA 3KZGA 2V3UA 1LCFA 4YU0A 3SEUA 1Z7NE 3C4MA 4FIMA 1SW1A 2XXYA 3MAMA 1DPPA 3GBAA 1NNTA 4F3PA 4LZ7A 4GFRA 1FTOA 5I57A 2UVGA 5L9MA 3S2VA 3LSWA 4IO2A 3CFZA 3ILUB 5FTIA 3EQ1A 1H45A 5CMCA 2HZKA 4NWDA 5TU0A 1BP5A 4ZEDA 2ALUA 4QFOA 4IO7A 5L8DA 3DP6A 3VXBA 1FTLA 3SEVA 3CR9A 2IA4A 1US5A 1VFEA 1R6ZA 3FVNA 1O63A 1M5CA 4NF4A 2FA7A 2B65A 1B5IA 2D5WA 4HTGA 2DQVA 2Y7KA 5A5XB 2X7QA 2H98A 4NTLA 3V83A 2QMXA 2RCBA 3G3HA 2X26A 4PP0A 4K3FA 5CBSA 3EHUA 5H8FB 1CE2A 4G8NA 4U1OA 3QAXA 2HQ0A 4KYSA 1B7UA 4GL0A 3TCFA 1D4NA 4DE8A 4QFLA 3EN3A 3RLFE 1B5JA 4U2RA 2DYXA 4ND9A 5TPAA 1D9VA 3FUZA 2D21A 5K2XA 2GH9A 4LP2B 1Y3QA 4Q30B 2I48A 1S7YA 3E4RA 3VDFA 3PU5A 4FORA 3CIJA 1ZKBA 4EQ9A 4OERA 1NL5A 1LB9A 3TEPA 1F9BA 3ONMA 4AB6A 1MPCA 4LATA 4G2ZA 3U93A 2Y7IA 3G7WA 3O2AA 3M3KA 3USDA 2Q9TA 1NNKA 1JW5A 3K6UA 3Q28A 4X1DA 1B2HA 1LB8A 2QS3A 4AQ4A 4R2FA 3RT8A 2I4CA 5JEIA 2PX1A 2ABHA 5CMBA 4NF6B 4IGRA 3R7XA 3IJXB 3CG1A 5H8NA 2XHDA 3MP8A 3M3LA 1FQAA 2H5YA 2THIA 4OWDA 2G29A 2O68A 3Q27A 1H76A 3K0VA 3O66A 4RYAA 1JW1A 4GVOA 1A55A 3DP8A 1N7WA 3TTNA 4NF8B 1SQYA 4QF9A 4NF5B 2O84X 1SW5A 2HCAA 1JQFA 2DXYA 3DLNA 1JEUA 3EF7A 5BUUA 2RC8A 2R9JA 1IXHA 4DLDA 2XX9A 3FZVA 5JTYB 2Z8EA 2OK2A 3T9VA 3KSXA 2P0SA 1ZBMA 3B6QA 4KYEA 3PUXE 1B3GA 4FAJA 1MXUA 4IO6A 5DVJA 3CFXA 4R75A 4F1UA 2ONRA 5ICQA 5I58B 3TZAA 3ZSFA 2DS9A 1NH7A 5HM4B 4PFWA 4N6PA 4P11A 5F1QA 3BFUA 3Q25A 2AIXA 1UTHA 2ONSA 3IOWA 1USYH 4TOZA 1LAFE 2ZYMA 2I0BA 4G4PA 1Y4CA 1HSJA 4H5FA 3MPLA 4R6KA 5TP9B 3H06B 2DE3A 4O3CA 2REJA 3IO4A 3C31A 2I0CA 1QJMA 4OFOA 3TQWA 1P1QA 1B6HA 1SYIA 4JSDA 5I56B 1B58A 3A3UA 4OZ9A 1R9QA 1LGBC 1PDAA 2LAOA 3RY3A 5BWJA 2YJPA 1TFAA 1PBPA 3VV5A 5I2NB 5J1DA 2XXVA 1WDNA 4MBPA 1N84A 3C34A 1JNFA 4RNSA 3MBPA 1IUDA 1QUIA 2H25A 3QIMA 1XC1A 4HCYA 1MQDA 3TODA 1SW4A 4H5GA 2ZYKA 4I9DA 3OO6A 5KDTB 3KEIA 4OYVA 2DE2A 3VLWA 4IO5A 3LUYA 3T66A 3V89B 3MQ9A 5A5XA 2F7AA 3FJGA 1M5FA 3IAZA 1Z7ME 1HSLA 3HCQA 2HFBA 3Q26A 1MY0A 4DXBA 5H8FA 1QULA 1B32A 3OENA 3WAEA 2DSFA 4GQOA 5B7DA 2M8CA 1SYHA 3MVYA 3TPAA 3PUZE 1D3KA 3I6VA 4F3BA 2DWAA 4EDPA 3PPRA 1WVJA 2XD3A 1SI0A 4F19A 2Z22A 3ECRA 1VE4A 4I1DA 2XXIA 4UACA 1DMBA 5KCJB 2Q89A 2V93A 3SETA 3TELA 2GHAA 2CMOA 3UA8A 3H6WA 1S50A 1L5TA 5I59B 4WKMA 2I4BA 4MLVA 1UQWA 3CRBA 4EF2A 2NUVA 4GXSB 1MY1A 4C1UA 2Q2CA 1UIVA 3IOTA 1QUJA 3GXAA 4BDMA 3UIFA 5CC2A 1EZOA 3VLUA 4F22A 4GD5A 5CMMA 1A7LA 3JYRA 2XXQA 2R71A 2UVJA 3LC8A 2F8DA 3N5LA 1ZJLA 4OHNA 2ZXTA 4NEDA 3SERA 3LBSA 2OCUA 3U92A 2X7PA 3JV9A 4OMBA 1BIYA 3HV1A 1QVSA 3VXCA 4O3BA 3G3GA 1P1NA 3KOSA 4ZZEA 5JTYA 1GR2A 1XT8A 3G3KA 2VOZA 4DXCA 3H4ZA 3IL1B 3DM0A 3K6XA 3OD7A 1ZMGA 1MRPA 2F78A 3KSJA 4G68B 4QFNA 1TWYA 2HEUA 3U94A 1YCJA 4KYDA 1EZPA 1S9TA 3K6WA 3PPPA 1BKAA 1PB7A 4OXVA 3BFTA 1MH4A 1GGGA 2G93A 3W15C 5H8SA 1MH3A 5ITOA 4BLAA 1POTA 2QMWA 2VHAA 3KJTA 4DCYA 1MXVA 3LSFB 5FTHA 4QSCA 4FEDA 1P99A 4R6YA 2H9BA 1MQHA 1B3HA 4YKIA 1EZ9A 4ESXA 2O69A 5ICTA 3KBRA 1LLSA 4U4SA 3CG3A 3KFMA 3SKPA 2YPNA 3LR1A 3KOTA 5TP9A 1B3EA 2O7UA 1IXCA 4OTEA 4XIGQ 4YMAA 3DELB 4YAHX 2PT1A 5IKBA 4TLMB 2B3FA 3TKDA 3IORA 4YMBA 2CZLA 3N6UA 4F1VA 1OQGA 3OSRA 4ELPA 4IB2A 3IO6A 4NE4A 3FATA 3RQTA 1VFDA 1LFHA 1ANFA 1SVXB 3T22A 4PETA 2Y7WA 3QUFA 1ATGA 2P2AA 1FCKA 1NMUA 3PD8A 4RJZA 3T9HB 3E3KA 3MPKA 2F7BA 5EHSA 4GRKA 2Z23A 3PUYE 1NNPA 4ONYA 4G77A 2HXWA 1B3LA 3MJNA 1ZTYA 4FATA 1Y1MA 5KDTA 1MS7A 2RINA 1BTJA 4R9FA 3DP4A 2VP1A 4LA9A 2F7CA 3CSBA 1B7HA 2A5TB 2RC7A 4U23A 1LFGA 4ZDMA 1JVYA 1M5BA 5EHMA 4GL8A 4NWCA 1TT1A 3LSLA 2ZNSA 4OEVA 5HBCA 1IXGA 4M1VA 4H67A 2XD2A 3B6WA 2I49A 2OZZA 2ZYNA 3H3GA 2F36A 4UA8A 1FW0A 1LBCA 4JWXA 1UTBA 3E13X 3TFLA 3D4GA 2HZLA 2D3IA 4EQ7A 1MM7A 4KQPA 3T9UA 3OO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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