5JEIA

Crystal structure of the glua2 lbd in complex with fw
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIACFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of partial agonism in AMPA-type glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA02
3QXMA 5FHMA 3T9VA 1ATGA 4Z0IA 2Q89A 1DSNA 3K00A 5KZTA 1B1XA 1CE2A 3H7MA 3CG1A 1KWHA 1B5IA 4G8MA 1H44A 1POTA 4H8IA 5K2XA 4OTEA 4JB7A 3T9UA 2DWHA 4GIZA 3M3LA 2O1LA 1JVYA 2RC7A 4FIMA 4MFIA 5CMBA 5TP9B 2R9JA 1JEUA 1QVSA 1S7YA 1NNFA 2I4CA 1LBCA 1JW1A 5H8NB 3BFTA 2AL5A 3D4GA 2ANJA 2AIXA 3H6WA 3TPAA 3MAMA 1P1OA 4OVJA 2DYXA 3HO7A 2I4BA 4M4GA 4F18A 4X9TA 1AL3A 1UTHA 4OFJA 4PFTA 2PBWA 3RGYA 2Y7RA 1DOTA 4BDOA 2PT1A 1XOCA 3MQ9A 3VLUA 2I3WA 3TTNA 1MDP1 4XKPA 2HFBA 4Z7EA 3KZGA 3O28A 4H67A 5H8FB 2DVZA 3B6WA 2O84X 3CRBA 3Q25A 4JWXA 5BUUA 1HSLA 2D21A 4GWOA 4ND9A 3TQLA 4Q0CA 3SETA 5H8HB 4WEPA 1IIWA 2NVUB 3A3UA 4YKKA 4HTGA 4R2BA 4EQBA 2DE4A 3OEMA 4YAHX 1YTVA 3V5AA 2FYIA 4EF2A 3MVWA 3LBSA 1OLCA 1HSJA 2H99A 5ITPA 1NH7A 1GTKA 4OEVA 4F22A 4U22A 4F1YA 1LCFA 1D3KA 4F39A 2DVCA 3I5OA 4KYEA 1LLSA 4G68A 4H65A 1H3DA 1DPPA 4UACA 2ABHA 2QS1A 5CMKA 3B6TA 4KHZE 1B7UA 3IB0A 2PVUA 2LAOA 3O6IA 2O7UA 4TOZA 2G29A 2NOOA 4U2RA 3OO6A 3ZKLA 3MBPA 5KCJA 1UIUA 3Q26A 2DP8A 3PGFA 1NH8A 4KFQA 2ONKE 3MVYA 1XHYA 4GD5A 4RXLA 1B4ZA 4ZS9A 1MY3A 3BKIB 4RPOA 1L5TA 5ICTA 3JV9A 1PB8A 3PV0E 5AA2A 1I6QA 2D5WA 3TCHA 1IQ7A 3G3GA 3S9MC 1N7WA 4P0GA 4DXBA 1LB9A 4JDFA 4ZE8A 4EXKA 3K1NA 1GR2A 2ZNTA 3E3KA 3IR1A 2F34A 4DLDA 2XXTA 3O97A 2DE3A 1GV8A 4OXVA 4I62A 1B3GA 3MZ1A 1H45A 3FVNA 1XC1A 4HCYA 3K01A 2F7AA 4ZE9A 4GLIA 4R6KA 3RY3A 4G68C 3VVDA 2F97A 1MY1A 1Y1ZA 3TCFA 3MJNA 5DYHA 1BP5A 1SI0A 2QMWA 4RNSA 3VFJA 1GGGA 4N07A 1S9TA 3VLVA 2NWJA 2P0SA 5AA1A 3DLNA 4ESXA 4ISUA 1PBPA 4QF9A 3BFUA 4WXJA 5I2KB 4G77A 4F29A 3PMWA 4ZDMA 3CVGA 3FIRA 1MXUA 4U1OA 4RA1A 3SEVA 1HSEA 1N04A 3IL1B 1LSTA 4N13A 4DZ1A 1N84A 4YB7A 4JWYA 4C1TA 4KR5A 1N76A 4JWOA 2ZYOA 2A5TB 2UXAA 1JW5A 4F19A 1B3FA 3Q27A 2DS9A 3H4ZA 3TYHA 2A5SA 3C9HA 1EZPA 5I2NA 2DXRA 2VHAA 4FECA 2GRVA 3OSQA 2B3FA 3SESA 1BKAA 4Q5TA 3HCQA 1FTLA 5L9SA 5H8SA 4JSDA 5KDTB 2UVGA 5FHNA 3FXQA 3SEWA 4AQ4A 2XHDA 1Y3QA 1MXVA 3RLFE 3O29A 3T9XB 1JQFA 3LSFB 4GXAA 3TELA 4H5GA 1T0KA 2QMXA 4QFOA 5ISUA 1OMPA 4LP2B 2OBGA 2DSFA 2O7IA 4LUBA 2HAVA 4GL8A 4N6PA 3RTWB 2O69A 4MF3A 3T96B 3AXFA 1SYIA 4YMAA 1N3XA 3IORA 2Z23A 5BWJA 1IXHA 4FEDA 3V83A 1QUKA 3C33A 4NF5B 4FEBA 1B3HA 1B9JA 2F6PA 2ZYKA 2QSXA 2PT2A 1TWYA 2V84A 2ZYNA 1OVBA 2QL3A 4OZ9A 4FATA 3PUVE 1IITA 4EQ9A 3K0VA 3U72A 5DEXA 1Y4TA 3KOSA 4P0IA 4LZ5A 1R1NA 3FV2A 4PP0A 3TAJA 1QUIA 4GL0A 2HCAA 4DXCA 3FGSA 1MS7A 1B52A 1R9LA 1BIYA 3OELA 4NF4B 3HSTA 4KCDA 4OYVA 5EHSA 3C36A 3N26A 3R6UA 1FQEA 1TT1A 3B7DA 2G93A 3PPOA 4OFLA 4I9DA 4ZEBA 1M5DA 3MW0A 3P7IA 1SD3A 2UVHA 2NXOA 3A09A 1B0HA 3CSGA 3S2VA 3E4RA 3CSBA 2CMOA 3OO9A 2YPNA 4YKPA 1US4A 4GVOA 1NNPA 2ZYMA 1ZBMA 3B6QA 3V8XB 3W15C 1TFAA 3O2AA 4IO2A 2KLFA 4AB6A 3KSXA 1PC3A 1XVXA 4DDDA 5CBSA 2OWSA 2OJTA 2FNCA 4DCXA 5AA2D 4GFRA 4EDPA 3N6TA 5TPAA 4FJPA 4NWDA 2F36A 2RC9A 1NFTA 3G3IA 3CFLA 2Y7WA 3K6VA 3VV5A 4QFNA 3MC2A 4BDRA 2OK2A 3HHFA 4QSDA 1Q35A 1XT8A 1I6AA 5I56A 4NF8B 3CR9A 5I57B 2V3QA 4GOTA 2XX9A 1VR5A 5DVFA 2F78A 2OZZA 3MP6A 1XVYA 3S9LC 4F3BA 3FVKA 3OENA 2IEEA 1EH3A 3MP8A 3SERA 3EF7A 1B40A 1FTOA 1A8EA 5EHMA 1P99A 3MZBA 2F6GA 5ICQA 2H98A 1M5BA 4NF6A 3GXAA 2F7BA 3LSLA 1FQCA 4F1UA 3LSWA 2V3UA 4RYAA 3RNNA 4IY5A 1FTKA 2NUVA 1UTBA 1PBQA 4OENA 1QULA 1VE4A 4QRZA 1B7ZA 4FE8A 2Q8JA 1PB9A 3OD7A 2I49A 2RINA 1R6ZA 2IA4A 4QHQA 4KCCA 1Y4CA 4BDNA 1OVTA 4PQJA 4DXUA 2Q2AA 3VXCA 5JEIA 5H8QA 1SW5A 3IJXB 3FUZA 5B7DA 2DWAA 3UN6A 3SDFA 3M8UA 1OLAA 1FW0A 3RT6B 5AA4A 3QUFA 4RJZA 1MH4A 1LBBA 3LC8A 1B46A 3A3CA 3H3GA 5A5XA 3C35A 3KG2A 4IGRA 2XXVA 2M8CA 4F1VA 2XD3A 3QK6A 1MDQA 3PPRA 3FASA 3O66A 1USYH 4IO5A 1B5HA 4L17A 3PMVA 1SI1A 4G8HA 3OMBA 1NMUA 4ECFA 1FQFA 1MXYA 4E0WA 5EYFA 3M3FA 1AH5A 3I6VA 3C34A 4IB2A 1QUJA 2OWTA 2OLBA 3QIMA 2RKMA 3EHUA 4WKMA 4ZEDA 2QS2A 2ZMBA 1IXCA 5I58A 1A99A 1Y3PA 3RTFB 2AL4A 1Y20A 4YZZA 2Y7KA 1ANFA 4KYSA 1SBPA 3Q28A 4OEUA 3Q29A 4GQOA 1A8FA 1UIVA 3KN7A 4IO4A 3FZVA 1N7XA 1QKBA 4OHNA 3TEPA 3IB1A 1Y9UA 3KFMA 1ELJA 3FD3A 2V3TA 3UIFA 3UP9A 2XD2A 3TCGA 2XXQA 1B5JA 3IOTA 3MVXA 2BJJX 3C32A 1MG1A 3HV1A 1B7HA 3QYTA 3UK4A 1JNFA 2GH9A 3L6GA 4R72A 1GVCA 3FATA 3ZKKA 4MLQA 4OFOA 3IB2A 1LAHE 1URDA 3G3FA 1MRPA 2X7QA 2VD3A 3W9VA 3N94A 3GBAA 3K6UA 4OWDA 1BLFA 2I0BA 2ALUA 2VP1A 1FCKA 3S9NC 4OESA 4EF1A 2UVJA 4PE5B 5CI5A 4X48A 3TTLA 3CIJA 5JTYA 2Q9TA 3PUWE 3KN8A 5ELVA 2GHAA 4DIGA 3G3JA 4EXLA 4IO3A 4R2FA 3PMXA 2Y7IA 3FJMA 4NMYA 4NWCA 4ZEFA 5LOMA 4KPTA 3DM0A 5DVJA 1B3LA 4JSOA 1IEJA 1SW2A 4KYDA 4C1UA 5TP9A 3GLBA 3PPNA 3DP4A 3JZJA 5H8NA 3K1PA 4Q30B 2W7YA 2XXUA 1IUDA 2HEUA 4JBZA 2ZNUA 3IOWA 4XKNA 3LUYA 1DMBA 4G68B 5I59B 2QPQA 4NEDA 2F7CA 1NKXA 2RCBA 1IXIA 5FTIA 4RPNA 1FTMA 5HPQA 4LQ2A 1TXFA 2ONSA 3QAXA 3UGWA 3SEXA 3C4MA 1SDXA 3K4UA 3RPWA 5H8FA 1MY2A 1ZMGA 2QS4A 2ONRA 4ESWA 5KCJB 3L6HA 3K2DA 5DVIA 4M1VA 1ZU0A 4F3SA 1SW1A 3VVFA 4QFLA 4TLMB 1MQJA 5K2YA 4U1ZA 5H8HA 4E0XA 2F35A 1MPBA 1O64A 4JXIA 1ZKBA 1IZ1A 3KOTA 1A40A 5F1QA 3KSJA 1QJMA 2XXHA 3M3KA 5B70A 1FQAA 2GFEA 2Q2CA 4ELPA 1LFGA 3IJOB 3CFZA 5AA2B 4R9FA 4DCYA 3KBRA 4LQ5A 4YICA 3TZAA 5ITOA 2XXXA 4R6YA 2QJEA 3USDA 4C0RA 2X7PA 4TLLB 1NNKA 1OQGA 4LVQA 2B3BA 2CZLA 4FAJA 2Y7PA 3H03A 4U4XA 3OXNA 4PFWA 3VVEA 1AMFA 2FA7A 4GXSB 4R9GA 1B0LA 1A7LA 2O51A 2E0SA 1DPEA 2YLNA 3I3VA 1PB7A 4OQOA 3TMGA 3OO7A 1FQBA 1SW4A 4QFKA 1D9VA 3RUMA 1H43A 1PDAA 3D4CA 3PD9A 5CMCA 3PPPA 1WODA 4R73A 5I84A 4GRKA 4ZZEA 1FQDA 2P1SA 3G3KA 3CG3A 2Z8FA 1Y3NA 1US5A 1EU8A 3KN3A 1XS5A 3FJGA 1LFHA 4MLVA 5CRYA 3ILTB 1DTZA 4THIA 1MQGA 1JETA 4HW8A 3OEKA 3H6UA 3RQTA 1YCJA 5CC2A 4PFUA 3R7XA 4F3PA 3MWBA 5I2NB 4F3GA 1B58A 3PUXE 3H06B 2DOJA 1LAFE 1WDNA 1QKAA 3TDJA 1N0TA 2HZKA 4POWA 1SQYA 1OQHA 1MQIA 1M5FA 4ZZAA 2Y84A 3TQWA 4EUOA 1Q1KA 1EZOA 2Z22A 3FXUA 4MBPA 1VFDA 2VGQA 3TTMA 5IAIA 3GBBA 3MPLA 3C31A 4ELQA 1UQWA 3THIA 4XKRA 3K6XA 5DTBA 5I2KA 2VD2A 4QFPA 4EQ7A 1D4NA 4NTLA 3PU5A 4H0WA 1MY0A 3KGCA 2R71A 3WAEA 4LATA 4ELOA 5TU0A 3EPEA 1B4HA 3FVOA 2A5TA 2HXWA 1DTGA 3TODA 3RN8A 4AB5A 3K02A 5J1DA 1QW0A 1J1NA 1VSOA 3EN3A 5L9OA 1POY1 1MPCA 2XXIA 2O1MA 1MPDA 3O9PA 4P11A 3PUZE 1B2HA 4F31B 3FXRA 4FORA 1JW4A 4IY6A 4LONB 1P1NA 3S9EA 5HBCA 1LB8A 2OCUA 2Q88A 4F2OA 1B3EA 1LCTA 5JK4A 1NNTA 5KDTA 2Z8EA 2RF1A 5DEXB 2XXPA 3DELB 3N6UA 3MPKA 4IGTA 4PFYA 4R74A 2QS3A 1M5CA 5I59A 3LSXA 1MH3A 3T93B 3FVGA 2HZLA 4NE4A 4YU0A 5FHOA 5FTHA 1I6BA 5HM4B 1MXXA 3TTKA 5L9MA 4H6DA 3IO6A 2XX7A 2VOZA 3MUQA 1ZTYA 1LGBC 3IAZA 2UYFA 4Q8RA 1B1HA 4O3CA 3K6WA 3T9HB 3N5LA 1MY4A 2H9BA 5F7VA 3S4UA 4LZ8A 3V89B 3EQ1A 1A54A 2F5XA 5L8DA 1P1WA 3IOVA 3PUYE 1LAXA 4PETA 3F11A 4NF5A 1MQHA 1MQDA 4LZ7A 2QRYA 1VFEA 3HN0A 3GZGA 3W9WA 1H76A 1B51A 2E1SA 4OETA 5M2VA 2DQVA 1RYOA 3SEYA 5AA3A 4BDQA 5AE4A 1WVJA 4MH5A 2THIA 4O3AA 5TPAB 2AYSA 3ILUB 4QSEA 1R9QA 2H5YA 1Y1MA 2DXYA 2I48A 2RC8A 4U23A 1RKMA 4NF4A 2DWIA 3T66A 4HS7A 5I56B 1YPNA 1Z7ME 4I1DA 4YB5A 2XX8A 4XXUA 4XKQA 3EHTA 1P1QA 1ZJLA 1TFDA 5DT6A 4GF8A 2I58A 3VE1B 4X1DA 1LAGE 4I8CA 3TKDA 3IX1A 1UTHB 4IO7A 3MVZA 4BDMA 2PX1A 4YB6A 4RK2A 4WEDA 4ELRA 3ODBA 1SVXB 2XXWA 3VXBA 3G7WA 3LR1A 3ZSFA 2DWJA 1B6HA 5CM6A 2V93A 4NF6B 2UYEA 4O3BA 5IKBA 3UORA 3FV1A 3RT8A 4ZEKA 1EZ9A 3IOUA 3JYRA 3ZS6A 2O6AA 2WKYA 2REGA 3VLWA 1YAEA 1UTBB 4IO6A 5CBRA 2PMSA 1ZLQA 4G8NA 1USYE 4YMBA 1A55A 1MXZA 3U8QA 4NF8A 4H5FA 3E9XA 5I57A 2D3IA 4U21A 2I6EA 3U92A 5H8QB 2UVIA 1JVXA 2HAUA 4G4PA 3H6TA 2PYYA 4R6HA 3TUSA 3UA8A 2H25A 3U1OA 1MXWA 3HHGA 3OOAA 5AA4B 1PEBA 2O68A 1NL5A 2XXRA 3BBRA 3EHSA 3VDFA 4LA9A 4RY1A 1AOVA 4BLAA 3PPQA 2R6GE 5A5XB 1D9YA 1S50A 3ECRA 3KJTA 3CFXA 4OERA 1FTJA 4QSCA 1O7TA 1JEVA 3FJ7A 4XTCQ 3MP1A 2RCAA 2ESNA 4X1BA 4TQUQ 2XXYA 2I0CA 3MZ9A 1IXGA 3WAFA 4H8JA 3E13X 3HPIA 4POXA 4YKJA 2P2AA 1ZIUA 1O63A 1I69A 4DE8A 3PD8A 2GHBA 1II5A 2REJA 4KD5A 4K3FA 2B65A 3TTRA 3TFLA 3R26A 5I58B 2Z8DA 4RK9A 4H1XA 1RYXA 1M5EA 1Z7NE 3O6GA 2DE2A 3IO4A 1BTJA 3DP8A 1SYHA 1OIBA 4BDLA 3IK6B 3H6VA 4R75A 3DP6A 4YKIA 1LFIA 3U93A 2YJPA 3OO8A 3KJ7A 1URGA 2V25A 4KI0E 1B32A 2ZNSA 1MM7A 4ZEIA 3O6HA 4F2QA 3QUJA 2ZXTA 5CMMA 1MM6A 1N3WA 4ONYA 3QSLA 3SKPA 3K1MA 3ONMA 1URSA 4KQPA 4U4SA 3T22A 1P1UA 4G2ZA 2HQ0A 3CI8A 2I3VA 3KEIA 2X26A 1B05A 3G3HA 1CB6A 1AIVA 4OMBA 1F9BA 4XIGQ 3U94A 2F8DA 2H4IA 3OSRA 4UA8A 5JTYB 3SEUA 4HCWA 4ZECA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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