5JK4A

Phosphate-binding protein from stenotrophomonas maltophilia.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
ETAVTGGGASLPADLYKGSADSILPANFSYAVTGSGTGKKAFLENNSALFSTTGTVHFAGSDSVLSSTELNTYNSTYNVSGDANRYGALVQIPSVATSVTIPFNKAGSAVDLSVTQICGIFSGKINNWSQLAGLGRTGAIQVVYRGESSGTSELLTRFLTSACQPADVSGTNLKLANGVPAFSVQSTFANLFTTVPSNFVAAPATGGSALYNAVYAVDGRVGYVGPDVIPSLTDATKVAKVKSFSPDEVSVQATLETAAPPTGAAAENPANWVPVFGNPSAGYPIAGYTNFVFGQCYKNATVGANVRGFLTRHYGSTVVNGVEQGPNDDAIRAHKFIPLTKAWRDAVRARFATATNAGAVNNPSTCSGIGRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 1.1 angstrom resolution structure of a periplasmic phosphate-binding protein from Stenotrophomonas maltophilia: a crystallization contaminant identified by molecular replacement using the entire Protein Data Bank.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alkaline phosphatase
molecule tags Transport protein
total genus 116
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature ec 3.1.3.1: Alkaline phosphatase.
pdb deposition date 2016-04-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jk4A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 5jk4A01
2DOJA 3OELA 3KOTA 2Q88A 3PPNA 5FHMA 3TPAA 4KFQA 1PB9A 4UA8A 1NKXA 4DIGA 3ZKKA 3PV0E 1Q1KA 3LUYA 2ONSA 1A99A 3TTRA 4ZECA 1JVXA 5AA4A 3IO4A 1A8FA 4ZE8A 2QS1A 3GBBA 3S2VA 3UGWA 2GFEA 2M8CA 4TOZA 3K6UA 4KCDA 5L9SA 5F7VA 2Q2AA 2GRVA 4BDOA 1LB9A 1QUKA 1NNKA 3W15C 1QKBA 1OQGA 3PUZE 3I6VA 2X7QA 2XXYA 4ZZEA 2F6PA 2IA4A 3QYTA 2V93A 1YCJA 3T9XB 3DP6A 3OO8A 3RTFB 2H4IA 4G77A 2P1SA 4X9TA 4NMYA 1IXCA 3OMBA 3PPQA 1QULA 5H8HA 3CFXA 3EHUA 3PUVE 3E9XA 3DELB 1UQWA 3QSLA 1POY1 4YMAA 3ONMA 3SETA 3MWBA 2VHAA 1H43A 1IXGA 2I3VA 4QSDA 2PYYA 3O97A 2O68A 4H6DA 1MXVA 3U72A 3FVNA 3PPPA 2RCAA 1BLFA 3N6UA 3VV5A 4BDRA 4K3FA 2XX7A 4LZ7A 1LAXA 4NF6A 1IIWA 4BDNA 4I9DA 3V8XB 3AXFA 3H06B 5HBCA 4H5FA 2XXUA 1O63A 3G7WA 4Q5TA 2KLFA 4H65A 3V89B 1AOVA 3ZS6A 2Q2CA 3TCHA 4NF5A 3EF7A 4RNSA 2VOZA 3VVFA 4JB7A 2XXTA 4YKPA 5L9OA 3CG3A 1SW1A 3MZ1A 4KPTA 1SYHA 2OLBA 4MFIA 3VLVA 4C0RA 4JSDA 3K6WA 2ZMBA 1B5JA 4GXSB 4LUBA 1MY2A 3I5OA 2WKYA 4IO7A 5KCJB 1DTZA 1B4HA 2I3WA 5I2KA 1S9TA 3LBSA 4ESWA 1I69A 1N04A 2R71A 2O7IA 3OSQA 3K2DA 1UTBB 4H8JA 4OERA 4F39A 4RJZA 4LA9A 1GTKA 3M3KA 2VD2A 1TFAA 4ISUA 5FTIA 4YMBA 2O84X 3FASA 2Z8DA 4RXLA 1ANFA 4UACA 2QMXA 2DE3A 3C9HA 5H8NA 4G8NA 5TPAA 3LSXA 2I49A 3MP1A 3C36A 1LCTA 1VE4A 3SESA 4XKQA 5I59B 2Z23A 3A09A 5DEXA 2HAUA 4EQ7A 4I1DA 4OFJA 1L5TA 4GFRA 1VR5A 2DXYA 4F3BA 3WAEA 4YICA 5I2NB 4JWYA 4XTCQ 1N76A 1IQ7A 5M2VA 2PT2A 2RCBA 3FVOA 2NWJA 2RKMA 4BDLA 3H03A 2OJTA 4U21A 2ZXTA 4IO6A 3RNNA 1JW5A 5CMBA 1QW0A 4M4GA 1Y3NA 1PB8A 1O7TA 4X48A 3L6HA 4LQ5A 2O6AA 3KBRA 3H6WA 4FIMA 4JBZA 1T0KA 1UIVA 3MVXA 1S7YA 5JEIA 2G93A 3QXMA 1LFHA 2Y7KA 4GVOA 1PBQA 1ZU0A 2I4BA 4NF4B 1WVJA 4XKNA 1M5BA 1B4ZA 1P1QA 3TUSA 2DQVA 2UVIA 4AQ4A 3G3KA 4QSEA 4JSOA 3PGFA 3PU5A 5A5XB 2HFBA 1FW0A 2UYEA 4R6HA 3OEMA 4O3BA 4O3CA 4QFOA 4EXLA 5CRYA 1HSJA 3FV2A 2QSXA 4EQ9A 4MH5A 1I6QA 2FA7A 1Q35A 4EF2A 3FXQA 2Z8EA 1MQGA 5DYHA 4RK2A 4DCYA 5BUUA 3FVKA 3K01A 3FVGA 3MP8A 1POTA 4LATA 3USDA 1USYE 2F5XA 3O6IA 3B7DA 2ZYNA 3TODA 2QRYA 4IY5A 3N5LA 1WDNA 3MUQA 1H3DA 1LGBC 4PETA 3JV9A 2Y84A 3FV1A 4KYDA 4I62A 3IJOB 3K0VA 2F7BA 1B7ZA 3RPWA 3MC2A 4OEUA 2I58A 4OEVA 3IK6B 1PBPA 4Z0IA 1MQDA 2B3BA 2DE4A 4R75A 3H4ZA 4RPOA 4LVQA 3VLWA 1QKAA 1N0TA 1UTHB 2CZLA 2NUVA 5H8FA 2V84A 3M3LA 1URDA 3C33A 2REGA 1GVCA 4LZ8A 3GBAA 1Y4CA 4ZEKA 3OO7A 4AB6A 3RUMA 5IAIA 1Z7NE 3P7IA 3S9LC 3KSJA 1B3LA 1HSLA 4E0XA 4TQUQ 1XHYA 4N07A 1EZPA 4OENA 3E3KA 3KN7A 5H8QA 1B3FA 3T93B 1SQYA 1FTKA 1TFDA 3FGSA 4HCWA 1P1UA 4QFPA 3MPKA 3QUFA 1EZ9A 3KN8A 2O1MA 3PUYE 4QSCA 4BLAA 5AA2D 1JETA 2V25A 2AYSA 4DZ1A 4XIGQ 4RPNA 4R73A 4R9FA 1FCKA 1J1NA 3KSXA 1S50A 1URGA 2V3TA 1EZOA 1QJMA 2HZKA 2DWJA 3TFLA 1XOCA 1SW5A 1MQIA 3S9MC 3K02A 3T9VA 4F3PA 5CBRA 4U23A 2AIXA 4PFWA 4GLIA 1LFIA 5TP9B 1D9YA 2XXHA 4FATA 2ZYOA 2DXRA 4PFYA 3SEXA 1A7LA 1M5FA 4I8CA 5AA2B 1B52A 3ILTB 4Q0CA 4QHQA 5K2XA 4DDDA 2UYFA 1Y3QA 4YAHX 2YLNA 1QUJA 3FUZA 1P99A 2RINA 2W7YA 3IR1A 4F1YA 3T9UA 1CB6A 4N13A 5JTYB 1BIYA 2HQ0A 3VFJA 3SEVA 4C1UA 5FTHA 2XD2A 4U22A 4JXIA 3ODBA 4DXBA 3W9WA 4FE8A 5F1QA 3TTKA 3C31A 5ISUA 3S9NC 2QJEA 2I0CA 2QMWA 3EPEA 4WXJA 1KWHA 5L8DA 3FIRA 1I6BA 3HV1A 3VXCA 3FXRA 1IZ1A 4IY6A 5KDTA 3MZBA 2UVJA 3HSTA 3O66A 3RTWB 3ZKLA 2H98A 4FJPA 5LOMA 1MQJA 1MY1A 1FQAA 1SI1A 1B46A 2HXWA 2OBGA 2QS4A 5KCJA 2VGQA 4NF8A 3TTMA 3IOTA 4PFTA 4BDQA 1FTJA 4MBPA 1FTOA 4NEDA 1AH5A 4RY1A 5ICQA 2ESNA 3FXUA 4LONB 1O64A 1ZLQA 3MZ9A 1FQDA 4NWCA 1P1NA 1JNFA 1B0LA 3OD7A 4OFLA 1JEUA 5I59A 1B51A 1OLAA 3HHGA 1R9QA 4FORA 3TQLA 5CM6A 1NNTA 2RC8A 2X26A 4IGRA 4Q30B 4OYVA 1F9BA 1LLSA 1IUDA 3HN0A 5I2NA 2F6GA 1FTLA 3BFUA 4HTGA 3B6QA 5EHMA 2Y7RA 4KQPA 1SW4A 2LAOA 4LQ2A 4G4PA 1ZKBA 2Y7WA 4ZEIA 5CBSA 3PUWE 1IXHA 1LSTA 3K1MA 5H8HB 1ELJA 3MVZA 3B6TA 2V3QA 1GV8A 1JEVA 2D21A 3U93A 3K1PA 5I57B 2VP1A 2ZYMA 3RT8A 4IB2A 4QFLA 1B3GA 3R26A 2XX8A 3O2AA 3FATA 1B5IA 1B32A 2DVCA 4IO2A 1II5A 2IEEA 4PQJA 4NF4A 2H9BA 3KFMA 3FD3A 1UIUA 3SDFA 1US5A 5ITPA 4G68A 1QVSA 4R72A 3TDJA 4EF1A 2Q9TA 1SVXB 1NMUA 4OQOA 3RY3A 4YKJA 2D5WA 4NF6B 2FYIA 1OVBA 3BKIB 4PFUA 3JZJA 2PVUA 2XXVA 2GHBA 1LAHE 3MAMA 3M3FA 3CIJA 1SDXA 5FHOA 4KD5A 4QF9A 4RYAA 3SEWA 1LAGE 2ZYKA 1I6AA 2OWTA 1B0HA 1A8EA 4YB6A 5ELVA 1P1WA 4F18A 4GXAA 2AL4A 3N6TA 3TKDA 3Q29A 4P11A 2ZNTA 4KYEA 3TMGA 2QS2A 2I6EA 1Y1MA 3V83A 4G68C 2V3UA 5CI5A 4P0GA 3R7XA 1WODA 4GIZA 3H6UA 3LSWA 1AIVA 3EHTA 4F31B 5I84A 4H1XA 3U94A 3TEPA 3VDFA 3LSLA 2YPNA 1MM7A 4ELQA 3CRBA 1XT8A 1LBBA 1MY3A 3E4RA 2H99A 3HPIA 2DWHA 3CFLA 2GH9A 1NL5A 3ECRA 5I56B 1TT1A 5H8NB 3LR1A 2DSFA 5TPAB 3Q26A 4EXKA 2AL5A 1D9VA 5B7DA 4KHZE 3TQWA 3D4CA 2XXIA 1MXXA 2HCAA 1OQHA 4HCYA 4F1VA 1AL3A 2O69A 1M5CA 3M8UA 4NE4A 3F11A 2HZLA 3KN3A 4H0WA 2DP8A 4ZEFA 5DVFA 3RQTA 1FQEA 5CMMA 1MDQA 4PE5B 1MM6A 3IORA 3E13X 4IO5A 3DP4A 4THIA 4H5GA 2ALUA 3PUXE 2XXRA 4IO3A 3IB0A 1FQBA 5EHSA 2UXAA 2UVHA 4P0IA 1BTJA 3IX1A 3H7MA 4U4SA 1B40A 1M5DA 1MPBA 3PMXA 4MLVA 1LFGA 2A5TA 4YZZA 3MBPA 1B3HA 1MQHA 2H25A 3D4GA 4BDMA 4QRZA 2Q8JA 3IAZA 1D4NA 1B9JA 2ABHA 3K4UA 3SEUA 3B6WA 3MVYA 3G3JA 1RYOA 4EUOA 1MXWA 3KG2A 4Q8RA 3FJGA 4OWDA 3RN8A 1FQFA 4YKIA 3GXAA 1VSOA 1Y4TA 2B65A 1EU8A 3H6VA 5AA2A 2PT1A 3IL1B 4LP2B 4ELOA 3IB2A 1DPEA 1JW1A 3PD9A 4JWOA 1YTVA 1H44A 3OENA 5JTYA 3SERA 1LAFE 1D3KA 4YB7A 3C32A 2DE2A 3CI8A 3UP9A 5FHNA 4Z7EA 2ZNUA 1B7UA 1BP5A 1IEJA 5BWJA 3MQ9A 2Y7PA 1OIBA 5DVIA 2D3IA 3BBRA 3T66A 4OFOA 4R6YA 1PDAA 3CR9A 4F19A 1MS7A 4OVJA 2GHAA 1TXFA 1LB8A 2RF1A 4F3GA 3Q27A 3T96B 3HO7A 3IJXB 1R1NA 2RC7A 3CFZA 4G8HA 5DVJA 4O3AA 4LZ5A 3UN6A 4R6KA 1SD3A 1JW4A 1MY0A 1B05A 3EN3A 2ONRA 4OXVA 1DPPA 5K2YA 3RLFE 1NFTA 4GRKA 1MXUA 4ZEBA 4M1VA 2B3FA 4F1UA 2QS3A 1N3XA 1FTMA 1HSEA 3KGCA 2I48A 1QUIA 2DS9A 1B1HA 3ILUB 3MVWA 1A55A 2Z8FA 3G3GA 1ZJLA 3UA8A 4U1OA 4GQOA 5H8QB 4HW8A 5CC2A 4R74A 2FNCA 3VVEA 3S9EA 4OMBA 2E1SA 2F34A 4GL0A 1N7XA 2XX9A 5HM4B 1MY4A 3WAFA 1ZIUA 4F3SA 1RKMA 3C34A 1ZTYA 1ATGA 1Y9UA 2P2AA 1JQFA 3FJ7A 3TTLA 4IGTA 3PPOA 5H8SA 4ZDMA 4F29A 4OESA 4AB5A 5I58B 3PMVA 4ONYA 4HS7A 1NNPA 3PPRA 3TYHA 4ELRA 4E0WA 4ELPA 5CMCA 4U2RA 1B5HA 3OSRA 1N3WA 2ONKE 2NVUB 4OTEA 2X7PA 1DOTA 3CSGA 2YJPA 2OWSA 5AE4A 4GL8A 3VXBA 5L9MA 5ITOA 3DP8A 4KCCA 2XXPA 1UTBA 4X1BA 5I57A 4R2FA 3GLBA 4U1ZA 1SYIA 2THIA 3HHFA 1VFDA 3LC8A 3GZGA 3BFTA 1EH3A 3KEIA 4XXUA 1ZMGA 4DXUA 3UK4A 2HAVA 3OOAA 3OO6A 1FQCA 2Q89A 3T22A 5AA4B 2HEUA 3JYRA 2PX1A 4R2BA 3VE1B 4MF3A 4RK9A 3U1OA 2G29A 3TCGA 1XVXA 1SBPA 2I0BA 1DTGA 4ESXA 2XXQA 3G3FA 4WKMA 5JK4A 3IB1A 5KDTB 3A3CA 4H67A 4EDPA 1XS5A 4G2ZA 1SW2A 5EYFA 3UIFA 1SI0A 2CMOA 1BKAA 2E0SA 4TLMB 4ZS9A 2H5YA 2R9JA 4ZEDA 2PBWA 3CSBA 4ND9A 1B1XA 2F97A 1M5EA 3MP6A 3TTNA 5B70A 3S4UA 4F2OA 2R6GE 1MPCA 2F7AA 4NF8B 3C35A 3QUJA 4FECA 2REJA 4NTLA 4ZE9A 2QPQA 5AA3A 1B3EA 1VFEA 3N26A 2NXOA 3QK6A 3IOUA 3I3VA 4EQBA 4JDFA 4GWOA 1MRPA 4X1DA 5TU0A 1MH3A 5I56A 1IITA 3W9VA 1GR2A 4GD5A 3TELA 2Z22A 3A3UA 1LCFA 2P0SA 5A5XA 2ZNSA 4F2QA 1MG1A 2A5SA 1DSNA 4NF5B 2DWAA 5J1DA 3Q25A 4QFKA 1Z7ME 3DM0A 4WEPA 3EHSA 3O9PA 2O51A 4KI0E 1OLCA 3IOVA 3K6XA 1GGGA 1NH8A 1Y3PA 1LBCA 5ICTA 2XHDA 1H76A 4FAJA 5I2KB 1TWYA 3O29A 1MXYA 4ZZAA 1Y1ZA 4NWDA 3K1NA 1R6ZA 3LSFB 3RGYA 4MLQA 3O6HA 1R9LA 2OCUA 3R6UA 1XC1A 1H45A 2PMSA 4N6PA 3KZGA 1B2HA 3PD8A 1IXIA 2DYXA 3SKPA 1US4A 1MDP1 1JVYA 4OETA 4G68B 4G8MA 4RA1A 1UTHA 2DWIA 3UORA 5DEXB 3H6TA 4OZ9A 4DCXA 3DLNA 1A40A 1PC3A 3T9HB 4PP0A 3PMWA 4R9GA 1RYXA 3SEYA 1PB7A 2OZZA 4XKRA 4DXCA 2O1LA 5IKBA 3O6GA 5AA1A 1Y20A 3Q28A 3O28A 1NH7A 3THIA 2F35A 3H3GA 2Y7IA 3G3IA 3FZVA 4DLDA 4GF8A 1XVYA 4U4XA 1A54A 4F22A 1YPNA 4H8IA 3KOSA 1URSA 3C4MA 5DT6A 3CG1A 1P1OA 3MW0A 3U8QA 1OMPA 4YU0A 4OHNA 3TAJA 3K6VA 1CE2A 4XKPA 2F78A 3V5AA 1AMFA 3IO6A 2XXWA 3MJNA 4KYSA 3OEKA 3VLUA 1N84A 5TP9A 2O7UA 4C1TA 1YAEA 2XD3A 3TCFA 2ANJA 2DVZA 1N7WA 1MH4A 1DMBA 4DE8A 3KJ7A 4QFNA 3QAXA 5KZTA 1OVTA 4ECFA 3N94A 1ZBMA 3KJTA 3TZAA 1B58A 2UVGA 4FEDA 4FEBA 4POWA 3VVDA 2RC9A 3FJMA 4WEDA 2F8DA 2VD3A 3RT6B 3IOWA 5DTBA 4IO4A 2F36A 3U92A 2NOOA 4JWXA 4YB5A 4POXA 3OXNA 3HCQA 2A5TB 2BJJX 4TLLB 3G3HA 1MPDA 1B6HA 1MXZA 3EQ1A 4GOTA 1USYH 3K00A 3QIMA 5I58A 5CMKA 3CVGA 3OO9A 2F7CA 4KR5A 2OK2A 4YKKA 1PEBA 3MPLA 5H8FB 5HPQA 2XXXA 1NNFA 4L17A 2I4CA 3ZSFA 3L6GA 2QL3A 1B7HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DOJA 3OELA 3KOTA 2Q88A 4PTKA 3PPNA 5FHMA 3TPAA 4KFQA 1PB9A 4UA8A 1NKXA 4PGPA 4DIGA 3ZKKA 3PV0E 1Q1KA 3LUYA 4KXPA 2ONSA 1A99A 3TTRA 4ZECA 2VPNA 2KQZA 2ZZXA 1FPIA 1JVXA 3NOHA 5AA4A 3IO4A 2Y5LA 1A8FA 4ZE8A 2QS1A 3GBBA 3S2VA 3UGWA 2GFEA 2M8CA 4TOZA 1FPEA 3K6UA 2CEXA 4KCDA 5L9SA 5F7VA 2Q2AA 2GRVA 4BDOA 1LB9A 4O94A 1QUKA 1FPLA 1NNKA 3W15C 4PAFA 1QKBA 1OQGA 3PUZE 3I6VA 2X7QA 2XXYA 4JVDA 5I7IA 5LTCA 4ZZEA 2F6PA 2IA4A 1LBVA 3QYTA 2V93A 1FSAA 1YCJA 3T9XB 3DP6A 3OO8A 3RTFB 2H4IA 4G77A 2P1SA 4X9TA 4NMYA 1IXCA 4OANA 1JP4A 3OMBA 3PPQA 1QULA 5H8HA 3CFXA 3EHUA 3PUVE 3E9XA 4NN3A 3DELB 1UQWA 3QSLA 1POY1 4YMAA 5ET8A 3KBZA 5LDZA 3ONMA 3SETA 3MSTA 3MWBA 4GX3A 2VHAA 4O8MA 1H43A 1IXGA 2I3VA 4QSDA 2PYYA 3O97A 2O68A 4H6DA 1MXVA 3U72A 3FVNA 3PPPA 2RCAA 3GYYA 2CZHA 1BLFA 3N6UA 3VV5A 4BDRA 1CNQA 1IMCA 4K3FA 2XX7A 4LZ7A 1LAXA 3B50A 4NF6A 1IIWA 4BDNA 4I9DA 3V8XB 3AXFA 2CZIA 3H06B 5HBCA 4H5FA 2XXUA 1O63A 3G7WA 4Q5TA 2KLFA 2FIEA 4H65A 3V89B 1AOVA 5I3SA 3ZS6A 2Q2CA 3TCHA 4NF5A 3EF7A 2V4CA 4RNSA 2VOZA 3VVFA 4JB7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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