5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
1BKAA 3KSJA 3QUJA 3R7XA 1MG1A 3VDFA 3FXQA 3PGFA 3UGWA 3KZGA 4G8HA 1GR2A 1IXHA 3HO7A 4GVOA 5IKBA 4F1YA 4LONB 3ILUB 4LP2B 3TKDA 1B40A 2R71A 1YAEA 3KEIA 3PD9A 3RPWA 4LATA 2IA4A 4LUBA 1URSA 3CSGA 3IO4A 2NOOA 1NNPA 1P1NA 4Q5TA 4KHZE 4N6PA 1SW1A 2Q89A 3UIFA 4F39A 1USYH 3S2VA 2GH9A 1LFGA 2VOZA 3EHSA 4XTCQ 2XX8A 3TTRA 2REGA 2XXXA 2E0SA 2Y84A 2XXUA 2I4BA 3IOUA 1D4NA 1MH3A 3TQLA 3HHFA 2RC8A 3K1MA 1P99A 4F29A 2DWIA 4ZDMA 5K2XA 3ONMA 1GTKA 4OFLA 4UACA 5FHMA 2VGQA 2I3VA 3K02A 2O7IA 3PPQA 1S50A 2YPNA 3FXUA 2QJEA 3OOAA 3CSBA 4NF4B 4YU0A 3VLWA 1Q35A 1NMUA 4DZ1A 4U21A 3IB2A 1ZBMA 2A5TB 1RYXA 2XXHA 4H0WA 4F3PA 2RC7A 5I59B 2GFEA 4PFTA 2CZLA 3EPEA 1A40A 1JW5A 5AA4B 4ELQA 3IL1B 3PPOA 1XS5A 2DWJA 2I49A 1QVSA 1LAHE 2P1SA 4TLLB 3O2AA 1URDA 2F5XA 3U93A 1FTKA 3PMXA 1AMFA 4IY6A 4H1XA 4KI0E 3K1PA 4M4GA 2PX1A 3C32A 3D4CA 2ANJA 1M5FA 4G8NA 4YMBA 3CG3A 4Z0IA 2V3TA 4IO2A 1Z7NE 3KN3A 2V84A 3I3VA 3H6WA 3RQTA 4GLIA 5EYFA 1B7ZA 2RKMA 4LVQA 4QRZA 2Q9TA 3MAMA 4IGTA 1OVBA 1OLAA 3RY3A 1US4A 3CFXA 1P1UA 4YICA 2PYYA 3B7DA 1CB6A 3OSRA 3U92A 4EF1A 2M8CA 3KSXA 1M5CA 4F2OA 3B6WA 4POXA 1A55A 3KN8A 4NEDA 5L9SA 1ZLQA 3EHTA 4YB5A 4HS7A 3MVXA 4Q8RA 2W7YA 3OO7A 1FQAA 4DXBA 1WODA 3E3KA 2ESNA 4G4PA 3K6UA 5ICQA 3TTLA 3VXCA 4QSEA 2QS1A 2OZZA 3UK4A 3ZSFA 3DELB 3M3KA 3W9VA 2UXAA 3FXRA 3GLBA 3EQ1A 1QUKA 5ELVA 5I56B 1UTBB 2XXYA 3MVWA 3O29A 4HCWA 3QAXA 2RF1A 4JXIA 1II5A 1P1WA 5TP9B 1FQFA 4ELPA 4ZZEA 1NNFA 3K4UA 5TPAA 1LB8A 4RPNA 2HCAA 2O84X 2HXWA 2Y7IA 3HPIA 3IOTA 5H8FA 4KFQA 1H3DA 1DSNA 3PUXE 4O3BA 5JEIA 4X1DA 4KPTA 3N5LA 1MM6A 2Q2CA 3OEKA 3MC2A 1MS7A 3IJOB 3UN6A 5I57B 4UA8A 3JZJA 1US5A 1MY0A 2V93A 4GFRA 5FTHA 1NH8A 2ZXTA 1EH3A 1VE4A 4L17A 4U22A 4I8CA 3N6TA 4KQPA 1EU8A 4XKQA 4XKRA 5DTBA 3R26A 1ANFA 2OJTA 1B4ZA 2I0CA 3TTKA 3QUFA 4MF3A 1FTOA 1WDNA 3Q26A 3O28A 3FV2A 3KJ7A 1Y4TA 5HM4B 3CFZA 4F19A 2R6GE 2WKYA 3MVYA 3OO9A 3Q27A 3MP6A 4DIGA 3LBSA 2XX7A 1B05A 2DXRA 2ZYNA 4I1DA 3UA8A 5AA2D 3DP8A 3SEXA 1NNKA 1B1XA 3G3HA 3K6VA 3VLVA 4I62A 2F35A 2HAUA 2ONRA 4LZ5A 3M8UA 3MZ1A 4NF4A 5HPQA 3HHGA 3DP6A 1SD3A 5AA1A 4GQOA 1B52A 2A5TA 1MDP1 4IO4A 1LCFA 4U1OA 3G3JA 3FATA 5A5XB 4ECFA 5I59A 5CMBA 3FJ7A 3S4UA 4H5FA 1B7HA 1RKMA 3KOSA 3E13X 2BJJX 5AA4A 2QSXA 3JYRA 4F3BA 2CMOA 1VSOA 1CE2A 4YZZA 4GRKA 3MP1A 1MM7A 1YPNA 5I58B 1SW2A 3PUZE 2ZNTA 4R72A 1OVTA 4E0XA 5TU0A 4JWOA 3B6TA 2QL3A 4ELOA 3K6WA 1EZPA 2XXQA 4JDFA 2OK2A 3MPKA 1MQJA 4X9TA 2NVUB 2HAVA 4DCYA 4AB5A 4O3CA 3IJXB 1PEBA 1GGGA 4QFPA 1O64A 3MJNA 5I2NB 3LSLA 4AB6A 1ZIUA 2OBGA 4TOZA 2A5SA 2Q88A 2V3UA 3S9MC 1HSJA 2R9JA 4FEDA 3OELA 4OERA 1USYE 2I3WA 1NL5A 5I84A 4TLMB 3MUQA 4KYEA 3C35A 3OENA 1MXVA 1Y4CA 1SYIA 1MRPA 2ZYKA 4FIMA 3TYHA 5CMMA 1XHYA 1ZJLA 2DOJA 1ZTYA 3RN8A 1TXFA 3MQ9A 3H03A 4U4SA 1N84A 2X7PA 2AL5A 4YKJA 1B1HA 3K01A 3U8QA 1NNTA 4G68C 1SVXB 4ZE8A 1MQDA 2PVUA 1OLCA 1AOVA 1WVJA 3KOTA 2THIA 1MPCA 3ZS6A 3O97A 1T0KA 1N7XA 1M5DA 5H8NB 1H76A 2H25A 4K3FA 2PMSA 2ZYMA 2QMXA 3FVKA 3IR1A 4QSCA 3ILTB 1MXUA 4OZ9A 4ONYA 1POY1 1TFAA 4FEBA 3OD7A 3C33A 4P0GA 3RNNA 4JWYA 2F8DA 1R9LA 1N04A 3T96B 4C1TA 3KJTA 3IOWA 3USDA 4F3GA 5I56A 3OXNA 2H5YA 3K00A 4NE4A 3MZBA 1I6BA 2OWSA 4OHNA 5TP9A 3MVZA 1Y3NA 3K1NA 5JTYB 5BWJA 4OESA 3A3UA 4C1UA 3RGYA 3ZKKA 2ABHA 1SI1A 4QFLA 3K2DA 1D9YA 2O69A 4U1ZA 5CBSA 4THIA 3H6VA 5AA3A 5I57A 4JWXA 5BUUA 3H6TA 4IY5A 5DYHA 2PT2A 4RNSA 1QW0A 1DPEA 2Z8FA 2VP1A 3V8XB 4H8JA 4GF8A 3LSFB 3PD8A 4KYDA 2GRVA 4O3AA 3T22A 1MXXA 2DWAA 4X1BA 2PBWA 3DP4A 1B58A 4H6DA 2V3QA 4WEDA 3FGSA 2REJA 4OVJA 3SEWA 4ZECA 3T9XB 3KBRA 3TZAA 1DMBA 4PFYA 1IXIA 1P1OA 1UTHB 2HZKA 2RC9A 1FQDA 2UVJA 3S9NC 3SESA 3IAZA 4NMYA 1B6HA 5DEXB 3B6QA 4G68A 5CC2A 1B5JA 3VFJA 3H6UA 4WEPA 1A7LA 3N6UA 1LLSA 1Y20A 3WAEA 3FVGA 2F97A 3T9HB 3CIJA 5HBCA 1I6QA 5A5XA 1B3HA 3PPPA 4YKPA 3HSTA 2B3BA 4F2QA 1HSEA 1I69A 3T66A 2ZYOA 2XXVA 4R2BA 3C9HA 3M3FA 4JB7A 3BFUA 1IEJA 5I58A 4NTLA 4BDRA 4LQ5A 2P0SA 4X48A 2Y7RA 2GHAA 3QSLA 2QRYA 3TDJA 2Z8DA 1OIBA 5ITOA 5I2KB 2QS4A 3V5AA 2P2AA 2F78A 3CG1A 3EF7A 3FUZA 1FW0A 4RPOA 1B4HA 1VR5A 3MP8A 5I2NA 2Z23A 3KGCA 4QSDA 1MPDA 1TWYA 1B9JA 4FE8A 1QUIA 2E1SA 1LGBC 1PBQA 1IZ1A 4RXLA 4EF2A 3U1OA 3FIRA 4BDNA 2DVCA 4JSDA 4EDPA 3FVNA 3PV0E 4H65A 4ZZAA 1NKXA 3IK6B 4HW8A 3H7MA 1P1QA 3WAFA 3EHUA 1LFHA 2QPQA 2NWJA 3CRBA 3KFMA 1MQHA 3SKPA 1ATGA 1LAFE 1DTGA 4RYAA 2DE3A 4F22A 4MLVA 3PPRA 2XX9A 4EUOA 1N3WA 1H45A 3O6IA 1LAXA 4RJZA 5EHSA 3UP9A 3UORA 1DTZA 4JBZA 4Q0CA 3TODA 3C36A 2F7AA 1LB9A 3VVFA 3SETA 1QJMA 1B7UA 4RK2A 4F1UA 1PB7A 4YB6A 1JVXA 5H8NA 4G77A 3H3GA 3OO6A 3K0VA 2D5WA 1IIWA 3W15C 2F7CA 4KCCA 2ZMBA 1PB8A 2ZNSA 3GZGA 3TTMA 2F6GA 4OENA 3A3CA 4GL8A 2DSFA 5B70A 4NF5B 4F1VA 1Y3PA 1D9VA 4F18A 2I0BA 2UYEA 4OEVA 4ZS9A 4G2ZA 1A99A 4G8MA 3RT6B 1MPBA 5JTYA 1B51A 2LAOA 4HTGA 3U94A 1MXWA 2UYFA 4IGRA 2F7BA 4GIZA 4DLDA 3LUYA 5KDTB 4C0RA 3SDFA 3U72A 4RK9A 3RUMA 2RCBA 3F11A 4IB2A 4ZEBA 2F36A 1JQFA 2ALUA 5KZTA 4OYVA 1JEVA 5H8QB 4LZ7A 4EQBA 4NWCA 3CFLA 5DVJA 4GXSB 4XXUA 3PPNA 1GVCA 4PE5B 4LZ8A 2H9BA 1SDXA 1H44A 4JSOA 4U2RA 1SQYA 3GBAA 1MY1A 5H8SA 4ZEKA 2D3IA 5KCJB 1Y1MA 1Y9UA 5L9MA 4PETA 2AL4A 3H06B 1B0LA 3VLUA 5L9OA 2O1LA 1UTHA 4R6YA 4RA1A 4BDOA 3FASA 1F9BA 1R6ZA 5DEXA 3DLNA 1XVXA 4OMBA 3G3FA 2F6PA 2Z8EA 2OCUA 4PQJA 4ESWA 3FZVA 2XD3A 4YB7A 4BDLA 1UQWA 1IUDA 2FA7A 3TEPA 4IO3A 5DT6A 2I4CA 5F1QA 5DVFA 3HCQA 4N13A 1FTJA 5K2YA 1JW4A 2QS3A 3VVDA 3O6HA 2RINA 2OLBA 3GXAA 4QFOA 3IB0A 4XKNA 1PBPA 4IO7A 2ONSA 3MWBA 4ZE9A 3ZKLA 2UVHA 3EN3A 3IOVA 2X26A 3JV9A 1B32A 1JVYA 1S7YA 1ZMGA 3FJMA 1Y1ZA 4GWOA 1O63A 3QIMA 1QULA 1AIVA 1MY2A 3BKIB 1YTVA 4PFWA 1XOCA 5B7DA 4XKPA 1B5IA 1BTJA 2XXRA 4YAHX 3PUWE 3IB1A 1QKBA 5LOMA 1AL3A 2XXTA 5CMCA 4H5GA 4XIGQ 4OEUA 4R74A 5FTIA 1JEUA 1JETA 4GXAA 3RTWB 1UTBA 4GD5A 1B3FA 4EXLA 4HCYA 3KG2A 4TQUQ 3C31A 3O66A 4NF8B 2DYXA 1IXCA 4OXVA 1XC1A 1Z7ME 3FD3A 2YJPA 5IAIA 3K6XA 1MH4A 3LSXA 4P0IA 1MQIA 5CBRA 2OWTA 3TELA 2FYIA 5FHNA 1MY4A 2XXIA 4OTEA 4DE8A 1PC3A 1S9TA 3ECRA 4OQOA 1GV8A 2XD2A 4GL0A 5DVIA 2YLNA 1LFIA 2QS2A 5CRYA 3S9EA 1A54A 1Y3QA 3BFTA 1PDAA 3VXBA 1A8EA 2DVZA 1FQCA 5L8DA 3TQWA 3VE1B 2DQVA 4NF5A 3TAJA 1IQ7A 4R2FA 3LC8A 1TT1A 4FATA 4NWDA 4ND9A 4R6HA 4NF6B 3TTNA 4KR5A 4I9DA 4E0WA 2DXYA 2VHAA 3TCHA 1XT8A 1I6AA 4MH5A 2Y7KA 5H8HB 1QKAA 3HN0A 3MW0A 5KDTA 1JNFA 3T9UA 1EZOA 4ELRA 4FORA 4ZEDA 1SW4A 1J1NA 3W9WA 3FVOA 4IO5A 4MBPA 2HQ0A 5H8QA 2DE2A 1N0TA 4FAJA 1PB9A 1H43A 1DOTA 3IX1A 4ESXA 1SYHA 1OMPA 3BBRA 3G3IA 2DP8A 1LSTA 3SEYA 3Q25A 4ZEFA 1NH7A 2B3FA 2Q8JA 1SW5A 5M2VA 1MDQA 4IO6A 1ZU0A 5J1DA 5KCJA 3R6UA 1AH5A 1LCTA 2I48A 2X7QA 3TCFA 1POTA 1VFEA 2KLFA 1LAGE 2D21A 5AA2B 1OQHA 3MBPA 1LBCA 3OMBA 3QK6A 1A8FA 4MFIA 4WKMA 1BP5A 3LSWA 2F34A 1D3KA 2I6EA 1B46A 3GBBA 3CI8A 2IEEA 3VVEA 3OSQA 3KN7A 1FTMA 1DPPA 4FECA 2I58A 4YMAA 5JK4A 2UVIA 1VFDA 1L5TA 3VV5A 1Q1KA 4ZEIA 4QFKA 3N94A 2O68A 4RY1A 2FNCA 2G29A 1SBPA 3LR1A 4P11A 3SERA 5CI5A 5ISUA 4Z7EA 5F7VA 3FV1A 4OFOA 5ITPA 4U23A 4QHQA 4LA9A 3PMVA 4R73A 3O6GA 2GHBA 2Y7PA 3CVGA 3G7WA 4M1VA 1FQEA 4LQ2A 1LBBA 1FCKA 1RYOA 1URGA 3I5OA 3D4GA 2Z22A 4ISUA 3FJGA 3C4MA 4H67A 4KYSA 3MPLA 4EQ9A 4GOTA 3A09A 3RLFE 2PT1A 3AXFA 4BLAA 4OWDA 1B2HA 3TUSA 3DM0A 2RCAA 2B65A 1TFDA 3E4RA 2DS9A 5ICTA 4N07A 2ONKE 1BLFA 2Y7WA 1UIVA 2AIXA 1B0HA 2G93A 2VD3A 3SEVA 3PUYE 4NF8A 3TCGA 1N76A 4PFUA 5EHMA 4YKKA 4BDQA 3E9XA 1M5BA 3CR9A 3L6GA 3RTFB 3T93B 1UIUA 2DE4A 1N7WA 1MQGA 3G3KA 4QFNA 3I6VA 1QUJA 2NXOA 5CMKA 3N26A 4OFJA 4R6KA 4F31B 1XVYA 3O9PA 1FQBA 1B3EA 3S9LC 1NFTA 3THIA 2Q2AA 4G68B 3TPAA 2HFBA 2HZLA 2XXWA 4EXKA 4QF9A 1BIYA 3RT8A 2NUVA 1M5EA 3OO8A 3QXMA 3OEMA 4R9FA 3M3LA 1B5HA 3ODBA 4NF6A 4WXJA 1MXYA 2H99A 1B3LA 1ZKBA 3PUVE 5H8HA 4H8IA 4DDDA 1MXZA 2H4IA 4F3SA 3G3GA 1SI0A 3T9VA 4DXCA 3TMGA 1IXGA 3TFLA 4DXUA 1MY3A 4BDMA 3HV1A 3L6HA 4KD5A 4AQ4A 1OQGA 4EQ7A 1HSLA 2O51A 2XHDA 5FHOA 4Q30B 2DWHA 1N3XA 3Q29A 4POWA 3PMWA 4U4XA 3MZ9A 3QYTA 2UVGA 2H98A 1R1NA 2O7UA 5CM6A 4FJPA 1ELJA 1FTLA 2VD2A 5AA2A 4PP0A 3PU5A 2V25A 3IORA 3SEUA 2XXPA 1KWHA 2ZNUA 2O1MA 4MLQA 4OETA 3C34A 3P7IA 2HEUA 5I2KA 1O7TA 4R9GA 1B3GA 4YKIA 4DCXA 2O6AA 1YCJA 2QMWA 4KCDA 1JW1A 3V83A 3H4ZA 4R75A 3Q28A 3IO6A 1EZ9A 1R9QA 1IITA 2AYSA 5TPAB 5H8FB 5AE4A 3V89B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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