5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
4XKRA 4OVJA 4F29A 2GFEA 3VLVA 2ZNTA 1SDXA 2D3IA 1MQHA 4FORA 3RPWA 5I57A 4G2ZA 2AIXA 2F36A 2QS1A 3UA8A 1O7TA 2I6EA 1O63A 2HZLA 3KG2A 4P0GA 1JQFA 2XX7A 5B7DA 3KJTA 4YB5A 2DE2A 3BFTA 3LBSA 1YTVA 3CR9A 3R7XA 1Q35A 3E9XA 4JWXA 4XKNA 3SEYA 3RQTA 4RK9A 2IA4A 1XVXA 4XXUA 1JVXA 5I2NB 2LAOA 3N5LA 3LSFB 4GL8A 3CSGA 4ZZEA 3D4GA 2RKMA 3M3FA 4NF5A 1OLAA 2RF1A 1T0KA 1S9TA 4IO5A 3D4CA 3C34A 1UQWA 1B4HA 4R9GA 3C32A 1MQJA 2NXOA 5H8FA 1MPBA 3MC2A 3TTKA 4QSDA 3SEVA 2VD2A 1XS5A 4IY6A 4TQUQ 4HS7A 3K1NA 4OFLA 1ANFA 2F6GA 1SVXB 2RC7A 3QIMA 4NF4B 3IJOB 3Q28A 4U4XA 3IL1B 1GVCA 1YCJA 1JETA 3I6VA 1GGGA 4R2FA 4F19A 1B3FA 3GBAA 4H6DA 4WEPA 1Y3NA 1FQDA 4GWOA 2X26A 4YMAA 3TAJA 2I48A 4GRKA 3Q26A 4X9TA 1P1UA 5FTIA 4FIMA 4ELRA 1IXHA 3CG1A 3A3CA 3DLNA 2V93A 2F7CA 3IK6B 3FUZA 4ZDMA 5TPAA 4C1TA 4Q30B 1ZLQA 1LGBC 3PUXE 4OQOA 3SESA 1FTJA 4YAHX 2I4BA 1SW1A 4R6HA 1QUKA 1Y4CA 2HZKA 2AL4A 4LQ5A 3DP6A 4KYEA 1AMFA 2QS2A 2REGA 1EZ9A 2I49A 1Y20A 2XXHA 1MXUA 2DWIA 1I6BA 5J1DA 2H9BA 2XXTA 3MVYA 4TLMB 1B5IA 3K02A 3ODBA 3S9MC 4F1YA 3S9EA 4OERA 3C35A 4DZ1A 5K2YA 2I4CA 3PUYE 1YPNA 2PYYA 4GF8A 3SEXA 3KN3A 4HCWA 3OXNA 2DWJA 4MFIA 1B40A 4GVOA 3H7MA 3W15C 2ANJA 2F78A 4DXBA 2A5SA 4LQ2A 1B1HA 1MS7A 4K3FA 1MG1A 2GH9A 1FTOA 2RC8A 4NF8A 3UGWA 4P11A 4QF9A 2D5WA 3G3GA 4L17A 5K2XA 3VVFA 1FTLA 4F18A 4ZEKA 4NF6B 2PBWA 2PX1A 1PB9A 1USYH 4H67A 1MY2A 3K0VA 2O6AA 3MZBA 3VLUA 3SKPA 3RT6B 3VXBA 3A09A 4QSCA 5CM6A 4POWA 2KLFA 3CFZA 1R1NA 3HV1A 3FXRA 1Y3QA 2ZYKA 1B3GA 1M5DA 4H5GA 1B46A 1B4ZA 2X7QA 3CVGA 1NNPA 4EXKA 3AXFA 2DE3A 4POXA 4RYAA 5TP9A 1I69A 1PBPA 3KN8A 5I59A 4ZEBA 4YICA 3OEKA 3DP8A 3QUJA 5DVFA 2XXXA 3MAMA 5ITOA 1QVSA 3LSXA 2UVJA 1B0LA 5I58B 4F3BA 4PFYA 1MQDA 4RPNA 2XXIA 1OIBA 2ZYNA 4EQ7A 3L6GA 4YKKA 4LVQA 3VXCA 1A40A 2Z23A 3UN6A 1FQAA 4ZE9A 3Q25A 3H06B 1XVYA 1A99A 1B3HA 2VP1A 3U1OA 4LZ5A 4NE4A 3O97A 3SETA 4LZ7A 1FCKA 4ZEDA 1UTBB 3TODA 1POTA 1MPCA 3KZGA 4PQJA 4BDOA 4EUOA 4X1DA 5I2KA 2QMWA 3PU5A 1S50A 3IO6A 4GXAA 2O84X 1LFIA 1XT8A 3A3UA 1Y4TA 2DYXA 3K00A 3MP8A 1NFTA 1Z7NE 3CSBA 3CI8A 3TCFA 5DEXA 2XHDA 5HM4B 1LLSA 3QYTA 4ELPA 3QXMA 1BTJA 4EXLA 2YJPA 4BDQA 3IOTA 4XKPA 1DSNA 1VR5A 3H3GA 1R9QA 1NL5A 5AA4B 1NH7A 4F3SA 4JDFA 1QW0A 1BLFA 3VVDA 4OXVA 2NOOA 2DSFA 5I2NA 4XIGQ 2IEEA 2PMSA 1FTMA 3FJGA 1B7HA 4P0IA 3SEWA 4U23A 5KZTA 3B6WA 4QFOA 5H8QB 1H76A 3MVZA 4R72A 1NNKA 4IY5A 3IX1A 4GIZA 4Z0IA 3SERA 1F9BA 3HCQA 5EHMA 2DVCA 1B58A 4IB2A 1SW4A 2UYEA 3K6WA 4U22A 1EU8A 2RCBA 4WEDA 2F35A 4ZEIA 2O7UA 2NWJA 4GOTA 1MXXA 3L6HA 1MM7A 3TZAA 4I1DA 3KEIA 2DP8A 1TFDA 4NWDA 2Q89A 4I8CA 1LB9A 1MQIA 2V25A 4TLLB 3MP6A 4KYSA 3TELA 1ZKBA 1MH4A 1USYE 1M5EA 4PFWA 1MDQA 5HPQA 5AA2A 4H8JA 3RLFE 4GXSB 3VDFA 1VFDA 5BWJA 3MBPA 4Q8RA 1N84A 3O6GA 5KDTB 1IITA 1N7XA 2QL3A 5IAIA 3OD7A 1CE2A 3FATA 2XXYA 1MY4A 3CFXA 1LSTA 2DE4A 1NMUA 4O3CA 2YPNA 3HSTA 2O51A 4FAJA 4U1ZA 3FXUA 1B9JA 4U21A 2ONKE 1OVBA 4G68A 1Y1MA 3K01A 3PPOA 2FYIA 2D21A 4PFUA 4LZ8A 3E3KA 3C31A 1UIUA 4IO4A 2VGQA 4Q5TA 2ALUA 3DELB 3PMXA 3UORA 2ZMBA 3IORA 1AL3A 4OEUA 3T9UA 2NUVA 3WAEA 1US5A 3W9VA 3QK6A 3PMWA 1MDP1 1IUDA 4BLAA 2OWSA 4N6PA 2Y7WA 4G77A 2ZNSA 4OEVA 4NF6A 3N26A 1KWHA 4NMYA 3HHGA 1MXZA 4IO3A 2Z8FA 3ONMA 5FHMA 3MZ9A 2ZYMA 3OO6A 4FEBA 2HXWA 3S2VA 1QULA 3EN3A 2Q8JA 2VOZA 3ILTB 3OSQA 2XXQA 5DTBA 3G3IA 2QS3A 2ZXTA 4BDNA 4KCCA 2RCAA 2XXPA 2Y7IA 1B52A 1R9LA 1A8EA 2F34A 3RGYA 1RKMA 3PPPA 2E1SA 1HSLA 3PPRA 4NWCA 3G3KA 5H8NB 5L9OA 1VE4A 1SI1A 5ELVA 4R2BA 1P1NA 4BDMA 3RN8A 1CB6A 2XX9A 4F39A 4JWOA 2O68A 2G29A 1EZPA 3MQ9A 1B3EA 2Q88A 1B32A 2DWHA 2I3VA 3FD3A 5L8DA 4ESXA 2A5TA 2R71A 4ZZAA 3V83A 4OFJA 3O9PA 1AOVA 1UTBA 4ISUA 1JEVA 4PE5B 3I5OA 4M1VA 4H8IA 4AQ4A 1N3WA 4OTEA 2FA7A 4FE8A 3H6WA 2XXUA 3RY3A 1A55A 3KN7A 4G4PA 4DCXA 3U92A 1H45A 2Y7RA 1JNFA 5EHSA 3O6HA 2I3WA 2V84A 3K6VA 1MXVA 3TTRA 2I58A 2H5YA 3OELA 5KCJB 2O69A 4KHZE 2QSXA 4H0WA 4NTLA 1B7ZA 3IOVA 1AH5A 4EF1A 2UVIA 2HAVA 5CMMA 3KSJA 1SBPA 3T93B 1N76A 4ZEFA 3V5AA 2HQ0A 3EQ1A 4U4SA 1LAHE 1ZJLA 4RPOA 1IIWA 1QJMA 4UACA 5FHOA 2Q2CA 1OMPA 4KQPA 3OENA 1VFEA 3O28A 3USDA 4R73A 2B3BA 1N7WA 3FIRA 2RINA 3KOSA 1JW1A 4DDDA 1AIVA 3GBBA 1GV8A 2QS4A 1QKBA 3FZVA 2ESNA 3FJ7A 5FTHA 3M3LA 3KBRA 3JYRA 4JSDA 3MPLA 5JK4A 5I56B 1PBQA 3V8XB 3G3HA 3LSWA 1I6AA 3DM0A 4GD5A 3GLBA 1ZU0A 4FATA 2XX8A 3K1MA 3MPKA 3QSLA 3TYHA 5L9SA 4WKMA 1MY3A 2QMXA 3PUVE 1WODA 4XTCQ 4N13A 1NNTA 3SEUA 3FJMA 5BUUA 2HFBA 1LAXA 3OO8A 1TT1A 1J1NA 4YKIA 1M5FA 2DQVA 5CRYA 1GTKA 1XOCA 5KDTA 3VE1B 4DIGA 1LCFA 4H5FA 1IXCA 4N07A 2Y7KA 4PETA 4YB6A 3KOTA 1DOTA 4I9DA 4TOZA 2YLNA 2NVUB 1GR2A 3P7IA 1PB8A 1B5JA 3CG3A 3UP9A 4HCYA 1IXGA 2RC9A 3HHFA 3CIJA 1B5HA 5CBSA 3PD9A 4HTGA 1LBBA 4R75A 2FNCA 2Q9TA 4H65A 1B6HA 1IXIA 1B05A 3THIA 1B1XA 3HN0A 3PGFA 3TDJA 3OEMA 4FECA 4G8MA 1US4A 5AA2D 1A8FA 1FQFA 4E0XA 1R6ZA 3FVGA 1LAGE 1URGA 3C36A 4YB7A 3EHUA 1QUJA 4LATA 4FEDA 4F2OA 3FVOA 4X48A 3M8UA 4QRZA 3F11A 1MM6A 1PDAA 3JZJA 4G8HA 1IEJA 5H8HB 4IGTA 4KI0E 3EHSA 3BKIB 4NF4A 1B7UA 4G8NA 3OSRA 4LONB 3RNNA 2DXYA 3PV0E 2AYSA 5JEIA 4GLIA 1FQCA 1S7YA 2X7PA 3TCHA 5A5XB 3SDFA 3R26A 3VLWA 3HPIA 1LFGA 4YKJA 1IQ7A 1SI0A 3TQLA 4M4GA 4HW8A 4QFNA 4LA9A 3IB0A 3TTLA 4JWYA 3IO4A 2O7IA 1UTHB 5H8NA 1XHYA 3KGCA 4KD5A 3R6UA 3O6IA 1SYHA 3PPQA 4DLDA 3TCGA 3S9NC 3H6UA 4GQOA 5IKBA 2PT1A 3PUZE 5TU0A 3VFJA 4AB5A 2F8DA 2P2AA 2UYFA 3IB2A 3K1PA 2H98A 4E0WA 3U94A 3OO9A 3RUMA 4F2QA 2O1LA 2Z8EA 2GHAA 4YMBA 3IR1A 3KFMA 1ZIUA 3EF7A 4ZE8A 3Q27A 2F6PA 4H1XA 4KCDA 5DEXB 1ZBMA 4UA8A 3U72A 3ZSFA 5EYFA 5AE4A 3FV2A 3C4MA 1OVTA 1MH3A 3K2DA 3TUSA 1RYOA 3H4ZA 5I84A 3VV5A 3KJ7A 4Z7EA 3IB1A 3H6VA 3IOUA 3B7DA 5JTYB 5KCJA 3S9LC 2O1MA 5DVJA 5M2VA 5CMKA 2I0CA 4F1VA 4IO7A 3TEPA 2QJEA 4IO6A 1LCTA 3ZS6A 4F22A 4KPTA 3EHTA 4MLVA 1DTZA 4C1UA 3RTWB 1D3KA 1B3LA 1Y9UA 1QKAA 1Y3PA 2Y7PA 2XXRA 3ZKLA 3N94A 4RNSA 3MJNA 1TWYA 1MY0A 2BJJX 4KFQA 1WVJA 2DOJA 4MBPA 3FVKA 4AB6A 3G3JA 4OENA 4DXCA 3GZGA 4ELOA 4R9FA 3MW0A 4ND9A 2Q2AA 4THIA 4G68C 5H8SA 3HO7A 4YZZA 4BDLA 4BDRA 3ILUB 5ICTA 1YAEA 3T9XB 3MZ1A 1WDNA 4JBZA 3O29A 1B0HA 4PP0A 3E4RA 4OETA 3IOWA 3MVXA 5I58A 1JW4A 1MXWA 4RJZA 3I3VA 2G93A 3K6XA 1ZTYA 3UIFA 3C33A 1L5TA 3JV9A 5I56A 5AA2B 4Q0CA 1BP5A 3PMVA 2F7AA 2M8CA 5DT6A 4DXUA 4DE8A 3V89B 4I62A 3O66A 1URDA 4OHNA 2GHBA 1PEBA 4MLQA 2Z22A 4X1BA 3PUWE 1N04A 3ECRA 3EPEA 5HBCA 1P1WA 1JW5A 3CRBA 1TXFA 4IO2A 5CI5A 3GXAA 4PFTA 2ZYOA 2P1SA 3DP4A 2QRYA 1MRPA 4EF2A 5I57B 3KSXA 4OWDA 1MXYA 1OLCA 4YU0A 3BBRA 1N0TA 2ZNUA 4JSOA 1LB8A 4G68B 3FV1A 1NNFA 4OYVA 2WKYA 2DS9A 1H43A 3IJXB 3H03A 2B65A 1DPEA 3LR1A 3T96B 3H6TA 2R6GE 4JB7A 4R74A 1MQGA 5ICQA 2ABHA 3RT8A 4OESA 2THIA 4ZS9A 1Y1ZA 3MUQA 3QUFA 4GFRA 4NF5B 5AA4A 5CBRA 3TTMA 1SD3A 2UVHA 2V3QA 4C0RA 1P1OA 3T9HB 3MVWA 4XKQA 5H8FB 1M5BA 4GL0A 4U1OA 3VVEA 3TQWA 1LBCA 2AL5A 2XD3A 3W9WA 4IGRA 3UK4A 1RYXA 3M3KA 4LUBA 1FW0A 3ZKKA 2V3UA 3MWBA 5H8QA 2HCAA 4YKPA 2H99A 3U93A 5CMBA 2XD2A 5F1QA 3FVNA 4OZ9A 2ONSA 4EDPA 5AA1A 4NEDA 3T66A 1D4NA 5H8HA 4ECFA 1QUIA 3BFUA 2OZZA 3MP1A 2HAUA 5LOMA 4ELQA 4R6YA 2GRVA 4WXJA 1PC3A 1NKXA 3PPNA 3OMBA 2F7BA 2B3FA 1JEUA 5DYHA 1LAFE 1FQBA 5ISUA 3LSLA 4MH5A 4O3BA 2UXAA 5A5XA 5TPAB 3C9HA 1SW2A 2QPQA 4QSEA 1I6QA 4QFLA 1DTGA 1ELJA 2OWTA 2OCUA 1TFAA 3K6UA 3CFLA 2VD3A 2XXVA 2CZLA 2REJA 4OMBA 1OQHA 3FGSA 3O2AA 1FTKA 2Z8DA 4QHQA 2I0BA 1UTHA 4OFOA 3Q29A 3K4UA 4ONYA 2A5TB 5B70A 3WAFA 3FASA 3T9VA 4O3AA 1FQEA 3OO7A 5F7VA 1O64A 1XC1A 4ESWA 1B2HA 5FHNA 3S4UA 2OBGA 4F31B 2UVGA 3TKDA 4JXIA 2XXWA 1EH3A 1A54A 1SYIA 2VHAA 3OOAA 4EQ9A 1PB7A 3E13X 1A7LA 1DPPA 1P99A 1SW5A 1MY1A 3B6QA 4R6KA 3N6TA 1D9VA 4ZECA 2P0SA 1URSA 4KR5A 1II5A 2DXRA 3LC8A 1B51A 3TTNA 1UIVA 2ONRA 5AA3A 4NF8B 2OLBA 4RXLA 1IZ1A 5ITPA 5L9MA 1ATGA 3U8QA 2OK2A 1M5CA 1BIYA 5JTYA 1LFHA 3B6TA 2PT2A 3IAZA 4KYDA 1BKAA 1NH8A 4DCYA 2H4IA 3G7WA 2OJTA 4F3GA 1VSOA 3N6UA 1HSEA 4FJPA 1H3DA 4RA1A 1D9YA 1HSJA 4MF3A 4QFPA 3G3FA 1Q1KA 3TMGA 2V3TA 1ZMGA 1EZOA 5TP9B 4QFKA 3TPAA 5CC2A 5I59B 4F3PA 2F5XA 1DMBA 4RY1A 2DVZA 2CMOA 3T22A 2DWAA 1N3XA 3PD8A 1OQGA 1JVYA 5DVIA 1SQYA 2R9JA 3FXQA 2E0SA 2W7YA 4U2RA 4F1UA 3QAXA 1P1QA 3RTFB 2PVUA 2Y84A 1POY1 2HEUA 4LP2B 1MPDA 3TFLA 1Z7ME 2F97A 1H44A 4RK2A 4EQBA 3LUYA 5CMCA 5I2KB 2H25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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