5A5XA

Crystal structure of se-met mltf from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
420
structure length
420
Chain Sequence
RVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
total genus 138
structure length 420
sequence length 420
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xA02
3FGSA 1SQYA 2AL5A 4OXVA 3L6GA 3FD3A 3OOAA 1LLSA 4OERA 1Y4TA 3IB0A 4ZEBA 3U72A 4ZEFA 1MQDA 3OMBA 4GRKA 3ILUB 1NH7A 4OEUA 3TMGA 3ONMA 2Q88A 4DLDA 4RPNA 5H8SA 2VHAA 4RYAA 1DPPA 2DVCA 2DS9A 1Y3NA 2Q89A 1QKBA 1DMBA 1PB7A 3OELA 3U92A 1P1WA 4AQ4A 3ECRA 3IB1A 4BDQA 2RF1A 2M8CA 4AB6A 1L5TA 2F36A 4OVJA 4ZDMA 4THIA 4EQBA 5AA2B 1B5IA 3G3FA 4MF3A 5DVFA 1XS5A 5KZTA 5TP9A 1QVSA 3EHSA 2REGA 2XXVA 3K6VA 1I6QA 2ZYMA 2DE2A 2F34A 4UACA 4DXBA 4RPOA 1MXWA 5CI5A 5ICTA 3RT8A 1XOCA 3TEPA 2ONSA 4ELQA 2VOZA 1DPEA 3SEYA 4JXIA 4IY6A 4FORA 3IOWA 2ZYOA 4YMAA 3VFJA 5AA3A 5CMBA 3WAEA 3G7WA 3FJGA 5K2YA 4OFOA 3PU5A 5J1DA 3A3CA 5FTIA 5H8FB 1BKAA 1MY3A 3M3KA 1B4HA 3B6QA 4F3BA 2Z8DA 3EN3A 4XKQA 4ZE9A 3HN0A 4G68B 2HXWA 3C36A 2X7PA 2XXUA 1D9YA 3Q25A 1LGBC 3I6VA 4ISUA 3GBBA 2DSFA 3PUXE 4E0WA 2YPNA 1SW4A 1JW1A 1NNFA 3MZBA 3T9XB 3TTLA 3IK6B 3O9PA 4C1UA 4BLAA 1JETA 2Z22A 1LB9A 3O97A 5DVJA 3VVEA 3KOTA 3TFLA 3S4UA 1D9VA 3D4GA 2XXHA 1SI1A 2V93A 3UN6A 3VLUA 1S50A 4QSCA 3HPIA 3PD8A 1N04A 4OWDA 1A8EA 3OO6A 4NMYA 4Q30B 2XX8A 5TU0A 1LB8A 3FVNA 2QS4A 4LZ7A 1OLAA 4YICA 4EF2A 1JNFA 3BBRA 4NWDA 3K01A 3TAJA 4FJPA 3S2VA 3MP8A 1JEUA 2V3QA 3FV1A 1ELJA 1MXXA 1AL3A 1B52A 4XTCQ 4H1XA 3LSFB 2PBWA 1MXVA 3CI8A 4H8JA 4OETA 4YB5A 3A09A 1FQCA 2NWJA 3G3HA 4GL8A 2D5WA 1MQJA 3RGYA 1NL5A 4GD5A 4POXA 3VLVA 4OZ9A 3O2AA 2H9BA 1I69A 2HZKA 4IO3A 3QIMA 4DE8A 2H4IA 3UP9A 1HSEA 4IGTA 3U93A 2QS3A 2R6GE 3QAXA 5H8HB 4EXKA 4RJZA 1B9JA 2DWJA 1N3WA 2E0SA 3R6UA 1YTVA 4JSOA 1LFIA 2F5XA 1ANFA 2F6GA 4I8CA 3D4CA 2OLBA 2V25A 4ELOA 2RC8A 5DVIA 2ZMBA 5JTYB 1MM7A 1UTHA 3F11A 3O29A 3N6UA 5H8QA 3KBRA 1YPNA 3MBPA 3BFTA 4R2FA 5I2KB 4NF4A 4P0IA 3DLNA 4LATA 3A3UA 3K4UA 5CBRA 1AH5A 5TPAB 1B40A 3N26A 3RN8A 3GXAA 3TTRA 4KI0E 1QUIA 3U8QA 4AB5A 4EF1A 1CB6A 1ZLQA 2DE4A 2UYEA 4JSDA 4G2ZA 2XXPA 3O6GA 4F3PA 3FJ7A 3THIA 5ITPA 5AA4A 4OESA 3IR1A 1LAGE 2OWTA 5I57A 3KSXA 2F7AA 3MVYA 1SDXA 3QSLA 1P1OA 1ZU0A 2AIXA 4OFLA 2KLFA 2PMSA 2UVHA 2H98A 1MDQA 2V84A 2XXXA 4LVQA 3PMVA 4MLVA 5LOMA 5H8NA 5L9SA 2P0SA 1R9QA 2RCBA 4QHQA 2XX9A 1Y4CA 4YB6A 4O3CA 4X1DA 4POWA 3MVWA 4YKPA 2QSXA 2HAUA 1GVCA 2ALUA 2V3TA 3LSWA 3G3IA 1CE2A 1LBBA 3UK4A 4F31B 4NE4A 5AE4A 1QKAA 1NFTA 2I6EA 4F1VA 3KSJA 3MUQA 1LCTA 3CSBA 3ZSFA 5I58A 2XXIA 3OD7A 4TLMB 5CC2A 4XXUA 2DXRA 3MW0A 4F3GA 4ZZAA 1P1NA 2THIA 5B70A 2B65A 1UTBA 2ONRA 1LBCA 4IB2A 3W9VA 1MPBA 3Q27A 1A40A 4NF5B 3QUJA 1B0HA 3RT6B 1R9LA 1FQBA 1ATGA 1BP5A 3N5LA 4LZ8A 4F22A 3KGCA 1P1UA 2NUVA 4XKPA 1D4NA 1DOTA 3TPAA 3CR9A 4R6KA 5I84A 4QSEA 1FQDA 3C32A 1LAXA 1Y20A 3HO7A 4R2BA 3USDA 1JW4A 3AXFA 1XC1A 1JVYA 4OYVA 4HTGA 4LA9A 1POY1 4ZE8A 1H43A 1ZJLA 4H65A 3MAMA 1Z7ME 2G29A 2I49A 2YLNA 5HBCA 1USYE 3B6TA 3PPRA 1NNTA 2O6AA 4BDMA 1IQ7A 1FQEA 4NF8A 2X26A 4NF4B 4OHNA 3K1MA 1DTGA 2HZLA 2R9JA 3U94A 1P99A 1RYOA 2LAOA 4H5FA 2O69A 1B4ZA 3PV0E 3PPQA 2REJA 4KD5A 3LC8A 4F1YA 3R26A 1URGA 4ECFA 4DXUA 1YAEA 1IXGA 2F6PA 1SYIA 4U2RA 3WAFA 4BDOA 4JBZA 1TWYA 3FXUA 4IO7A 1MPDA 5B7DA 3K0VA 2W7YA 4Z0IA 2GH9A 4NEDA 2A5TA 4KCDA 3TODA 1B3FA 1XVYA 2XD3A 1VE4A 5AA4B 2DVZA 1NKXA 4G68C 5I57B 2GHBA 4JDFA 3MVXA 3H6UA 5JEIA 4LUBA 1OVTA 3K02A 1Y1MA 1N76A 1A55A 1M5FA 3IO6A 4GF8A 1XHYA 4R6YA 3E9XA 3T9HB 3V8XB 3KN7A 3MPLA 3OSQA 4YB7A 4BDNA 3C33A 4YU0A 5I59A 2XX7A 3HCQA 5DEXB 2DP8A 3DP4A 3RUMA 4P0GA 1ZTYA 4TOZA 1N3XA 3O6IA 2RC7A 2Y7WA 5IAIA 1B7HA 4PFWA 5DTBA 5KCJA 2FYIA 3I3VA 1B7ZA 3QYTA 3PUWE 3H03A 3LBSA 5JK4A 3VE1B 5A5XB 2CMOA 2FNCA 3PMXA 4GLIA 5FTHA 4U1ZA 4U22A 4OEVA 4PE5B 2X7QA 3E13X 3K2DA 2Y84A 3Q29A 1LSTA 1PEBA 2ABHA 1GR2A 3MP6A 3C4MA 2GFEA 4FECA 4H6DA 2QMXA 4YKKA 5I58B 3RQTA 3HHGA 4PFTA 3CSGA 1LCFA 4ELRA 5AA1A 3TYHA 4F2QA 3GLBA 2UVJA 3P7IA 3T66A 3CIJA 3PUZE 3T9VA 2P2AA 4NF6A 3LSLA 5I2NA 2B3BA 1Z7NE 2F7CA 3PMWA 3K6UA 5I56A 1FTOA 1URSA 1LAFE 5BWJA 2ZYKA 3W9WA 4G8NA 3KN8A 4KCCA 1LAHE 1MQHA 1TFDA 2XXQA 4U1OA 1GGGA 3FVKA 3T96B 4RY1A 4EQ9A 3C9HA 3H3GA 4EQ7A 4MLQA 4Q0CA 1FTJA 4NTLA 1B1HA 3G3JA 3FIRA 4FEBA 3KFMA 4X9TA 1N84A 3SEXA 1M5EA 2OWSA 3VV5A 5CM6A 4F18A 5EYFA 2NXOA 2ZXTA 4G8MA 4MFIA 4ELPA 3FXRA 4IO4A 2F8DA 2RKMA 3QUFA 3OO9A 2F7BA 5ELVA 3B6WA 4IY5A 3RTFB 4I1DA 2HEUA 5FHOA 3TTKA 4OMBA 1YCJA 5BUUA 2I3VA 3RPWA 4K3FA 4OQOA 2FA7A 4XKNA 3SKPA 1Q35A 2DYXA 4H8IA 4YAHX 1EZOA 4LONB 2XXTA 2ZYNA 3EPEA 3MPKA 1US4A 3IB2A 3T22A 2Z23A 4GXAA 4BDLA 3L6HA 4YZZA 2O84X 1IXIA 3U1OA 1Y9UA 4DDDA 2AYSA 2A5TB 2O7UA 4I62A 1B51A 3KOSA 3LUYA 4QFOA 1AOVA 1D3KA 4HW8A 4LP2B 5CRYA 1O63A 5KDTA 1JW5A 5TP9B 5L9OA 3ZKLA 2F97A 4OENA 3FJMA 1HSLA 2QPQA 5HPQA 4I9DA 4YKIA 3TQLA 4C1TA 4F1UA 3EHTA 1JVXA 3M3FA 5DYHA 2NOOA 4FE8A 3OSRA 3ZS6A 4PETA 3I5OA 1SI0A 1B3GA 3PUVE 4QFKA 2VD2A 5ISUA 4JWYA 4WXJA 4KHZE 1UQWA 2PT2A 2QRYA 3GBAA 3BKIB 1GV8A 1B5JA 1BIYA 3G3GA 4ONYA 5HM4B 1N0TA 3TCGA 2XD2A 1MXZA 1USYH 4LQ2A 4GL0A 2RCAA 4R9FA 3C31A 2I3WA 2P1SA 3TTMA 3S9EA 3OEKA 5AA2A 3ILTB 2ZNUA 4ZEDA 1AIVA 3CVGA 4ZS9A 4Q5TA 3VVFA 5EHMA 1I6AA 1B0LA 1SW5A 3S9MC 2UVIA 2F78A 3TUSA 3VXCA 3DP6A 4TLLB 2QS1A 2CZLA 3E3KA 3H06B 4NF6B 3O28A 5I2NB 1AMFA 4DCYA 1EZ9A 2YJPA 4O3AA 5IKBA 4OTEA 3JZJA 1GTKA 1B58A 4G4PA 2I0BA 4R74A 3T9UA 1B2HA 3RLFE 2PVUA 2XHDA 1IZ1A 1VR5A 4H0WA 4RK2A 5EHSA 3C34A 3CG1A 3CRBA 5AA2D 1MY4A 2I48A 4EUOA 4QSDA 1SW2A 3MZ9A 4IO6A 3IX1A 3O66A 4Q8RA 5H8FA 1O64A 1QUKA 1M5CA 4G68A 1WODA 3TCHA 1IIWA 1N7XA 4KYDA 2HAVA 2DWIA 2RC9A 1QJMA 4KQPA 4FATA 1TT1A 4RNSA 2R71A 1O7TA 2XXRA 1ZBMA 1M5DA 2F35A 3MWBA 5L8DA 1VSOA 4O3BA 3VXBA 1WDNA 4R72A 3V83A 1MQGA 4IO5A 1TFAA 2VD3A 1URDA 1TXFA 3KN3A 2A5SA 3FZVA 2Q2AA 1MH4A 1VFDA 2GHAA 3FATA 1B1XA 3W15C 2E1SA 4H67A 3IOTA 3UIFA 3KZGA 1UTHB 3IOVA 3RY3A 5H8QB 2H25A 3TCFA 1MXYA 1MY2A 1FTMA 4QFNA 4TQUQ 1LFHA 3CFXA 3O6HA 1OQHA 2V3UA 3UGWA 3OENA 2OCUA 1H45A 4GQOA 3KEIA 4ZECA 1SBPA 1IXHA 2O51A 4C0RA 3SDFA 3C35A 3DP8A 2UYFA 4F2OA 2I4CA 2Y7KA 4F29A 1R6ZA 1Y3PA 3OO8A 3TDJA 1H3DA 2Q8JA 3HSTA 2UVGA 3OXNA 4X48A 1A7LA 5H8HA 2H5YA 1B3EA 4RXLA 3V5AA 4Z7EA 4KPTA 1MPCA 1A54A 4GOTA 4GVOA 3N6TA 4GWOA 1SD3A 3MC2A 3EQ1A 1POTA 2ONKE 3JYRA 3VLWA 5CMMA 4ESXA 4R75A 5JTYA 3PPNA 2B3FA 3H6VA 4LQ5A 1MRPA 3E4RA 1FW0A 5I2KA 4U4SA 2O1LA 2HFBA 2Z8FA 2Q9TA 2AL4A 5H8NB 3PPOA 1OQGA 1MXUA 5TPAA 5FHNA 1T0KA 4GFRA 3RTWB 2DWAA 1F9BA 1B3HA 2ESNA 3CFZA 3QXMA 2G93A 4WKMA 3IO4A 4G8HA 1A99A 4IGRA 3MZ1A 2QS2A 2OZZA 3FV2A 4PQJA 2Q2CA 2O7IA 1XVXA 3K6XA 4YMBA 4H5GA 1NH8A 2DXYA 3SERA 2Z8EA 4KYSA 4HS7A 2DE3A 3SESA 1FTKA 2D3IA 3B7DA 3QK6A 3ZKKA 3FVGA 4ESWA 1PDAA 1OLCA 4U23A 4G77A 1B05A 1UTBB 2OJTA 4M4GA 1FTLA 3MQ9A 3UA8A 3PD9A 4E0XA 1SW1A 1IITA 2O1MA 3H4ZA 1M5BA 3OO7A 3DELB 1US5A 4QRZA 4P11A 3H7MA 4U21A 5K2XA 4FAJA 2IEEA 4HCWA 1FQAA 3FASA 3DM0A 1A8FA 2WKYA 3V89B 2QL3A 1EU8A 1FQFA 1NMUA 4R73A 2GRVA 2Y7RA 3HV1A 1RYXA 1N7WA 1B7UA 1R1NA 4ZZEA 1Y1ZA 2DWHA 3KJ7A 1OMPA 4M1VA 4DXCA 3UORA 4JB7A 1ZIUA 4NF8B 3CG3A 3IJXB 2PT1A 4NF5A 1OIBA 4XKRA 1PB8A 2DOJA 3SETA 1H44A 1NNPA 5DT6A 5F1QA 3EF7A 1MQIA 4KFQA 1MY0A 1S9TA 3FUZA 4BDRA 5FHMA 3MP1A 3HHFA 4F3SA 1MY1A 3LSXA 3ODBA 3VDFA 2OK2A 5CBSA 2RINA 4EXLA 4GIZA 3VVDA 1EH3A 2XXYA 4GXSB 2I58A 4OFJA 4ZEIA 3KJTA 1JQFA 1PBPA 3PPPA 3FXQA 2H99A 5ITOA 1UIUA 5L9MA 3M8UA 3IOUA 1PBQA 4LZ5A 2PX1A 2OBGA 3MJNA 4RK9A 1Q1KA 1IXCA 1J1NA 1XT8A 5I59B 4KR5A 3BFUA 4N6PA 1II5A 1LFGA 1SYHA 3N94A 4UA8A 3IJOB 3IL1B 1ZMGA 1H76A 1Y3QA 1HSJA 3KG2A 3K00A 5KCJB 1RKMA 3H6WA 3IORA 4U4XA 1FCKA 2VP1A 4WEDA 4PFYA 4R9GA 1MDP1 2HCAA 2QMWA 1WVJA 2Y7PA 4R6HA 4QFLA 3MVZA 1B32A 1JEVA 3CFLA 2ANJA 2IA4A 1PB9A 4DZ1A 2I0CA 2BJJX 4PFUA 3PUYE 2ZNSA 3G3KA 4N07A 3SEWA 1QW0A 4IO2A 3TELA 1QUJA 2O68A 1B6HA 1B5HA 2D21A 4ZEKA 5DEXA 3FVOA 3Q28A 5I56B 1NNKA 1B46A 1DTZA 1OVBA 1SVXB 2XXWA 5M2VA 2DQVA 4FIMA 4MH5A 4JWOA 3R7XA 3H6TA 1MG1A 1DSNA 2HQ0A 5A5XA 4DCXA 1MS7A 4QFPA 1VFEA 3M3LA 4XIGQ 4QF9A 4N13A 1BTJA 4HCYA 4MBPA 1MM6A 3LR1A 5CMKA 3TQWA 4FEDA 2UXAA 1KWHA 3K1PA 3IAZA 4NWCA 4PP0A 4F39A 3K1NA 1IEJA 3TKDA 1MH3A 1I6BA 1P1QA 3SEVA 3RNNA 3TTNA 2I4BA 1ZKBA 4DIGA 1EZPA 4L17A 3EHUA 2VGQA 4WEPA 2NVUB 5F7VA 2ZNTA 2QJEA 4ND9A 4EDPA 3S9LC 3JV9A 4X1BA 3K6WA 5CMCA 3TZAA 4JWXA 4YKJA 1QULA 3GZGA 1B3LA 1BLFA 4RA1A 3SEUA 3Q26A 4F19A 1UIVA 1S7YA 5KDTB 3S9NC 3PGFA 4KYEA 2PYYA 1IUDA 3OEMA 2Y7IA 5ICQA 3T93B 1PC3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FGSA 1SQYA 2AL5A 4OXVA 4XF5A 2QVRA 3L6GA 3FD3A 3OOAA 1LLSA 4OERA 1Y4TA 3IB0A 4ZEBA 3U72A 4ZEFA 1MQDA 3OMBA 4GRKA 3ILUB 1NH7A 4OEUA 2WEFA 4MNIA 3TMGA 3ONMA 2Q88A 4DLDA 1IMDA 4RPNA 5H8SA 2VHAA 4RYAA 1DPPA 2DVCA 2DS9A 1Y3NA 2Q89A 2WYPA 1QKBA 1DMBA 1PB7A 3OELA 3U92A 1P1WA 4AQ4A 3ECRA 3IB1A 4BDQA 3GYYA 2RF1A 2ZZXA 2M8CA 4AB6A 1L5TA 2F36A 4OVJA 4ZDMA 1YYZA 4THIA 4EQBA 5AA2B 1B5IA 3G3FA 4MF3A 2FBPA 5DVFA 1XS5A 5KZTA 2FIXA 5TP9A 1QVSA 3EHSA 4PGPA 2REGA 1KZ8A 2XXVA 1KA0A 4P56A 3K6VA 5ET5A 1I6QA 2ZYMA 2DE2A 2BJIA 2F34A 2ZZVA 4UACA 1FBFA 4DXBA 4RPOA 1MXWA 5CI5A 5ICTA 3RT8A 1XOCA 3TEPA 2ONSA 4ELQA 2VOZA 2P3NA 1DPEA 3SEYA 4JXIA 4IY6A 4FORA 3IOWA 2ZYOA 4YMAA 3VFJA 5AA3A 5CMBA 3ISPA 3WAEA 3G7WA 4NHBA 3FJGA 5K2YA 1NUXA 4OFOA 3PU5A 5J1DA 3A3CA 1NV4A 5FTIA 3CHGA 5H8FB 3A29A 1BKAA 1MY3A 3M3KA 1B4HA 3B6QA 4F3BA 2Z8DA 3EN3A 4XKQA 4ZE9A 3QMFA 3HN0A 4G68B 2HXWA 3C36A 2X7PA 2XXUA 4OVSA 1D9YA 3Q25A 1LGBC 3I6VA 4ISUA 3GBBA 2DSFA 3PUXE 4E0WA 2YPNA 1SW4A 1JW1A 1K9YA 4XFEA 1NV7A 1NNFA 3MZBA 3T9XB 1FPJA 3TTLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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