5A5XB

Crystal structure of se-met mltf from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
total genus 141
structure length 417
sequence length 417
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
B PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xB02
1N0TA 4ZDMA 1HSEA 3AXFA 3G7WA 3M3LA 2XXQA 2GRVA 1JNFA 5DVJA 1NKXA 3ZSFA 1VE4A 1B5JA 4OMBA 4KHZE 1EU8A 4IGRA 1SYHA 4YKKA 1GGGA 4N07A 2ZNUA 1B3EA 1AL3A 4QSDA 4GD5A 4G4PA 5ITPA 1B7HA 2W7YA 1SW2A 4PFUA 2DE3A 3VLVA 1LAHE 3RT6B 2PT1A 2IEEA 3EHTA 1R1NA 1IXHA 1B05A 3P7IA 1VSOA 2IA4A 2QSXA 3L6HA 3V8XB 1D4NA 3TELA 1B7UA 2QS4A 3C33A 3KOSA 4DE8A 3TEPA 2REJA 3GZGA 3PD8A 4ZEIA 4YU0A 3K2DA 3MAMA 1II5A 3LUYA 4DDDA 1JETA 5L9MA 1ZBMA 1B0LA 5B70A 2H9BA 4F1YA 4DCXA 5I59A 4AQ4A 1ANFA 4R2FA 5AA4B 4ZECA 2Z22A 5F1QA 1JEUA 1OQGA 3E13X 5B7DA 3PPRA 5IAIA 4N13A 4U23A 4P11A 1UIVA 1A8EA 3A3CA 3IOVA 4NWDA 1JEVA 1MS7A 3C31A 1JW4A 3CRBA 3EHUA 4M4GA 3A09A 3UORA 1FQBA 3IJOB 3TQWA 2O51A 2OZZA 5FHOA 3BBRA 4XIGQ 3MJNA 3O97A 4LATA 3W15C 3IK6B 4Q5TA 4U4SA 5I84A 4JWYA 4I9DA 3PPOA 4F1UA 5DTBA 4ELOA 5I2KA 3JV9A 3PMVA 3FXUA 3KOTA 3KN8A 5FTHA 1HSJA 3TODA 2OCUA 1ATGA 3PPPA 4K3FA 5JEIA 3BKIB 4JSDA 3K1MA 1F9BA 3VDFA 2FYIA 4FE8A 3LSLA 1B4ZA 1N84A 1MXWA 1O63A 3I5OA 3M3FA 2QS3A 2RC8A 1D3KA 1EH3A 2OK2A 1DPPA 3KGCA 1QW0A 4QFLA 4KR5A 2Q8JA 1ELJA 5I2NB 5JTYA 2DWJA 4G8NA 1P1UA 4GWOA 4G2ZA 2OWSA 2QS1A 4ZEKA 5L8DA 4R72A 5H8QB 1M5EA 2HFBA 3PUWE 2ZYKA 2V3UA 3FUZA 4PFTA 5ICQA 4BDRA 4IB2A 3HHFA 4R74A 3E4RA 3RLFE 3RGYA 1PB9A 2I48A 1B6HA 2GH9A 3FJMA 4IO3A 3FVGA 3CIJA 4LZ8A 3H03A 3JZJA 2ONSA 1QUJA 3SESA 4QHQA 4EQBA 4NF5B 2A5TA 1UTBA 3IORA 2XXWA 2V25A 1NNKA 4GLIA 4TQUQ 3QYTA 3T9VA 4R2BA 4R6YA 4KI0E 4PQJA 3IX1A 3T9XB 4Q8RA 2E1SA 2ZYNA 4PETA 4QSCA 1XVXA 1LAXA 5DYHA 1B5HA 3ZKKA 3IOTA 1N3WA 4AB6A 2H99A 4WEPA 1XVYA 1NH7A 4P0IA 2G29A 4R73A 5JK4A 3TTLA 3UN6A 4H8JA 1IITA 3ONMA 3SDFA 2PT2A 5CMMA 2HAVA 3DLNA 2O69A 4G77A 3B6QA 2O7IA 3LR1A 4IO7A 5CI5A 1H76A 2HAUA 3N6TA 4YKPA 2XX7A 1NH8A 1DTGA 2I4CA 2RCBA 4DZ1A 4ZZAA 1POY1 4MF3A 1AOVA 2XHDA 3OEKA 5CMCA 3D4CA 2I3VA 4GF8A 1MXXA 3FVOA 3W9WA 3Q25A 4NF4A 1L5TA 3EF7A 5DVFA 2M8CA 4OZ9A 1LCFA 3A3UA 5M2VA 4DXBA 1PEBA 3MP8A 1D9YA 4U21A 3G3FA 2ZYOA 2V93A 2I49A 1H43A 1FTJA 3GBAA 1LB9A 5TPAA 4JB7A 2FNCA 3RPWA 2P1SA 5F7VA 2F78A 4U2RA 2YPNA 4C1UA 3TAJA 1JVYA 3OEMA 4BDMA 2YLNA 1LBCA 4ZE9A 5EHMA 2I0BA 5I59B 1DMBA 2F36A 3Q28A 5TU0A 2PMSA 1OLAA 5IKBA 3ODBA 5ICTA 2XXXA 1FW0A 1P1WA 1SQYA 3MQ9A 1B0HA 1M5FA 5HPQA 3TFLA 1MG1A 3S9NC 4G68B 4DXCA 4PFWA 3O2AA 2XXYA 1OIBA 1MY3A 3TCGA 3OO7A 4POXA 1DSNA 1IXIA 4FECA 5I57A 2THIA 1PBPA 5L9OA 4KD5A 1JQFA 4WKMA 1FQCA 3O6IA 1NNTA 1BTJA 3K6XA 1TFAA 3HCQA 2AIXA 4XXUA 3FIRA 3DP4A 4OTEA 4PE5B 3T96B 3DP6A 2HZKA 4ZE8A 3OD7A 4OEUA 4NF6A 3GLBA 3PD9A 4OETA 2ZXTA 3MPKA 3BFUA 1ZJLA 4O3AA 1N7WA 1SW1A 4TLMB 1TXFA 2PYYA 5AE4A 1FQAA 3CG3A 3V89B 1EZ9A 1KWHA 4XKPA 1YPNA 4FIMA 1I6BA 4FAJA 4TOZA 2Q89A 3RN8A 1M5CA 2DXRA 4NWCA 3MC2A 1FTMA 4OESA 3K1NA 3BFTA 3SEUA 3LSWA 4G8MA 5AA2A 1MM7A 1Y4TA 3O9PA 3MBPA 2DXYA 1B2HA 3PUYE 3QUFA 4L17A 4I62A 1FQDA 2OLBA 1MH3A 1LAFE 1IIWA 1US5A 4HW8A 3K6VA 1Y4CA 3FASA 2RCAA 4JDFA 3WAFA 4RJZA 4GFRA 5TP9A 4IO5A 4C1TA 1VFEA 2Y84A 1UQWA 2VP1A 3ZKLA 4MBPA 4IO6A 2DSFA 1N3XA 2YJPA 3IOUA 3T93B 1YCJA 2P2AA 3TZAA 1QKBA 2GHAA 1LFHA 2RF1A 5BUUA 4UA8A 4H5GA 2A5SA 1NNPA 2KLFA 3FZVA 4O3CA 4OFJA 5H8HA 4XKNA 3D4GA 1OQHA 3MZ9A 3DELB 1SVXB 2F7AA 2NXOA 4QFPA 2B3BA 4F1VA 3N5LA 4JXIA 2UYEA 4OQOA 3CI8A 3RTFB 2F6GA 3UK4A 4P0GA 4F22A 2OWTA 1Y1MA 2XX9A 1MM6A 4THIA 4KCDA 4QFNA 1B3HA 4OENA 3QSLA 3H7MA 2I3WA 4RY1A 3RY3A 4F19A 3MVZA 4NEDA 2H25A 4GXSB 4E0WA 1ZTYA 4DLDA 3TCFA 1N04A 3QXMA 3RTWB 1VFDA 2DE2A 4I8CA 4RK2A 1RYOA 2D3IA 3K6UA 3S9MC 4YKIA 4C0RA 3LBSA 4KYSA 4IY6A 3S4UA 5H8SA 1H44A 5DEXB 4GOTA 3SEWA 2ZYMA 3N94A 5TPAB 1A99A 1SW4A 3KJ7A 1N76A 2QRYA 1SW5A 2X7QA 3PMWA 4GL0A 3VE1B 5ELVA 3IB2A 2V3TA 4ESXA 5I56B 1MRPA 3TQLA 3H6TA 3FJGA 4KYDA 1NFTA 1MY0A 3U72A 4H67A 1GR2A 2F5XA 3K4UA 1I6AA 3O28A 1O64A 4LA9A 2Y7KA 3U93A 2X7PA 4F39A 3SETA 4QFOA 3I6VA 5ITOA 3EPEA 2HEUA 1A40A 2O7UA 1A7LA 3IL1B 1BLFA 2XXRA 3K01A 2P0SA 2ONKE 3MP6A 3KG2A 4Z7EA 2R6GE 1US4A 2F34A 2QMXA 3IR1A 4ESWA 3T66A 3DM0A 2LAOA 4F3BA 3OELA 1Y3PA 3TYHA 3C9HA 1J1NA 1IXCA 1JVXA 1OVBA 3RT8A 2DWHA 3EHSA 3VXBA 3MZBA 3OO8A 4JWXA 1B46A 1T0KA 4EF2A 1IXGA 3DP8A 1B40A 1URDA 4NF6B 1ZLQA 3HSTA 1BKAA 1IZ1A 1QJMA 3U8QA 3FD3A 3TTRA 3ECRA 4MFIA 5AA2D 3GBBA 4YICA 4M1VA 4OVJA 3G3JA 1OVTA 4KQPA 2CMOA 1DTZA 2O6AA 1NL5A 3ILTB 3ILUB 3UGWA 1BIYA 4YAHX 4NF8B 2XXIA 1JW1A 1USYH 3CSGA 4MH5A 1R9LA 4ELQA 3B6WA 1LCTA 4ZS9A 4EF1A 3N6UA 3FXQA 4EDPA 1MXVA 1I69A 4OYVA 3V5AA 4EXLA 3IO6A 2DE4A 1B1HA 2VD3A 4GL8A 5FHMA 4FATA 4H6DA 1AH5A 3U92A 3KN3A 3OO9A 4O3BA 1B58A 5HBCA 3S9LC 4Q0CA 3MVXA 1Y3NA 1B1XA 1UTHA 4GVOA 2NUVA 1IEJA 4ISUA 4UACA 1B32A 4BLAA 3TPAA 1LBBA 4WEDA 4LP2B 3TKDA 2ZNTA 1MY1A 4MLVA 2ZNSA 1USYE 5I58A 4QRZA 4QSEA 5H8HB 5CBSA 3USDA 3IB0A 2QPQA 4LZ7A 4EUOA 3TUSA 1P1QA 3FGSA 2PBWA 3FVNA 2DQVA 1B5IA 1CB6A 3CR9A 2ALUA 4RYAA 4R9GA 4U1OA 1P1NA 1RKMA 2F7BA 3KSXA 3CFXA 3SKPA 1URGA 4GIZA 2O1MA 4OXVA 3KFMA 2F7CA 4LUBA 2ESNA 2RINA 2UVHA 4U1ZA 2AYSA 3OSQA 5AA1A 3PGFA 1M5BA 1NNFA 4F3SA 1H3DA 3VVFA 2CZLA 2XXHA 1EZPA 1WDNA 1WODA 5FHNA 4OERA 1MY4A 3CSBA 4KCCA 2RKMA 4KPTA 4QF9A 5I2NA 3KBRA 5I2KB 2XXVA 4ELRA 3MVWA 3TTKA 4GXAA 1TWYA 3TTMA 3OO6A 4PP0A 2UXAA 2REGA 1LGBC 3F11A 2Z8EA 3HV1A 1MQDA 3KEIA 2XX8A 3C34A 3PV0E 1GV8A 3VVEA 1FQFA 4E0XA 2B3FA 4RPNA 2Z8FA 3MUQA 3O66A 1FQEA 1TFDA 3MP1A 3WAEA 4IGTA 4YB6A 1MQIA 2VD2A 1QVSA 1MPCA 1QUIA 3O6HA 3VLWA 5DVIA 4YB5A 4NF5A 4MLQA 3VLUA 3G3GA 5JTYB 1OLCA 1LB8A 3K0VA 1A54A 3SEYA 4G68C 4FJPA 2AL4A 5H8NA 4BDOA 3HO7A 4RXLA 1OMPA 1Y20A 3C32A 4LVQA 4XKQA 2OBGA 4R6KA 2QMWA 4YKJA 2DS9A 3E3KA 3H06B 2WKYA 1B52A 4F3PA 3U94A 4JBZA 1B4HA 2G93A 1O7TA 3HHGA 4FEBA 2H98A 1PDAA 4NTLA 4BDNA 2A5TB 1UTBB 2O1LA 4ZEBA 3UA8A 3Q29A 2XXUA 4H65A 4EQ9A 5ISUA 4BDQA 3KJTA 1JW5A 4H1XA 1MPDA 1XOCA 5A5XA 2D5WA 1AMFA 1ZMGA 2BJJX 3FV2A 1MXUA 3L6GA 5L9SA 3G3KA 4ND9A 2O84X 2NOOA 3T22A 4TLLB 3K02A 2QJEA 1B9JA 4RNSA 1TT1A 1FTOA 1QUKA 3KSJA 4RA1A 1H45A 4N6PA 1DOTA 3H6VA 1SI0A 5KZTA 4Z0IA 1MPBA 4WXJA 3O6GA 2ZMBA 3QAXA 4F2QA 1XS5A 3MPLA 5EHSA 4ZZEA 1B3GA 3CFLA 2F97A 1MQGA 1UTHB 3VV5A 2DVZA 2I58A 4OEVA 1SDXA 2FA7A 2H4IA 4GQOA 4Q30B 1LSTA 1R9QA 1M5DA 3IOWA 4NF4B 2V84A 1XT8A 2F6PA 4DXUA 1FTKA 1B3FA 2DVCA 4U4XA 5H8FA 1P99A 4G68A 3ZS6A 4R6HA 4JSOA 5I58B 4H0WA 2PX1A 4OWDA 3GXAA 3PUVE 1AIVA 4F2OA 1QKAA 2Q88A 3CVGA 3QUJA 4HCWA 4F3GA 3PPQA 3G3IA 3THIA 1POTA 4HCYA 3MW0A 3KZGA 2F8DA 3C35A 1Q35A 5KDTA 4GRKA 3PMXA 4F29A 4ECFA 3H3GA 4LQ5A 4ZEDA 2ABHA 3OENA 5KCJA 4OFOA 1MDQA 2R9JA 2D21A 1RYXA 4YZZA 3QK6A 4HS7A 2DP8A 3EN3A 3TCHA 3V83A 1GVCA 4X1DA 1S50A 4IO2A 4YMBA 4IY5A 3C4MA 1VR5A 4F18A 3FJ7A 1Y3QA 5CC2A 2VGQA 1YTVA 1MXYA 1MQHA 1LLSA 4F31B 1YAEA 4ONYA 4H8IA 3T9HB 4LZ5A 1ZKBA 5I57B 3Q27A 2ONRA 3K6WA 3R26A 1CE2A 4XKRA 1ZU0A 2I0CA 1I6QA 5FTIA 1QULA 3PU5A 1S7YA 2F35A 3S2VA 4G8HA 3S9EA 1EZOA 1P1OA 1S9TA 3R7XA 1FCKA 3E9XA 2O68A 2I6EA 3TMGA 3C36A 4NE4A 4AB5A 4EXKA 1A55A 2PVUA 3MWBA 4LONB 2Q2CA 3FVKA 4DIGA 1SBPA 4LQ2A 5CRYA 2E0SA 2HQ0A 2Z8DA 3FXRA 4KYEA 5CMKA 2X26A 3RQTA 5H8NB 1GTKA 2Q9TA 2H5YA 3LSXA 3R6UA 4KFQA 2OJTA 5K2YA 5AA2B 5BWJA 1B7ZA 3MVYA 5CMBA 4RPOA 1MQJA 2Y7IA 2UVIA 2UYFA 3CFZA 2VHAA 1WVJA 2Y7PA 3IB1A 2DYXA 5TP9B 1Y1ZA 3SEVA 5AA4A 2XD3A 4ZEFA 1LFGA 2I4BA 4R9FA 2AL5A 3T9UA 3PPNA 2XXTA 5AA3A 3M8UA 3B7DA 1R6ZA 5J1DA 1MH4A 2XXPA 1UIUA 4QFKA 4XTCQ 3VXCA 5CM6A 2B65A 5LOMA 3IAZA 4EQ7A 2HCAA 3UIFA 5A5XB 3H6UA 3QIMA 1XHYA 3OMBA 3K00A 3PUXE 2ANJA 3OSRA 5K2XA 1Y9UA 3UP9A 5HM4B 3Q26A 3OOAA 3H6WA 2GFEA 4YMAA 5DEXA 2DWIA 4JWOA 2Q2AA 2R71A 1HSLA 1SI1A 3SEXA 2Z23A 4IO4A 4POWA 3W9VA 2NVUB 1ZIUA 3K1PA 4NMYA 1PB7A 2HXWA 5I56A 3RNNA 3FATA 4U22A 3VFJA 3SERA 3LC8A 1D9VA 3TDJA 1N7XA 1LFIA 3HPIA 3PUZE 5DT6A 1URSA 4H5FA 1DPEA 4RK9A 4ELPA 5EYFA 3KN7A 5H8FB 1Z7NE 4I1DA 2Y7WA 3N26A 4YB7A 3TTNA 1A8FA 3OXNA 1IQ7A 5H8QA 1FTLA 2QL3A 2QS2A 2XD2A 4BDLA 1Q1KA 1BP5A 1B3LA 2UVGA 4R75A 5CBRA 1PB8A 5KDTB 1PBQA 1MY2A 3EQ1A 2VOZA 3IJXB 3O29A 4X9TA 2RC9A 3JYRA 1PC3A 4FEDA 5KCJB 2DWAA 3VVDA 4OHNA 3I3VA 3IO4A 1SD3A 3RUMA 2NWJA 4PFYA 2V3QA 3LSFB 1Z7ME 4OFLA 1B51A 3CG1A 4X48A 1IUDA 1LAGE 2DOJA 4X1BA 3HN0A 3FV1A 4HTGA 3U1OA 1MXZA 2RC7A 2GHBA 1SYIA 3B6TA 3MZ1A 4FORA 3M3KA 4DCYA 1NMUA 1XC1A 3G3HA 2UVJA 2HZLA 1MDP1 2Y7RA 4NF8A 3H4ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N0TA 4ZDMA 5ET5A 1HSEA 2FBPA 3AXFA 3G7WA 2WBDA 3M3LA 2ZZWA 2XXQA 2GRVA 1JNFA 5DVJA 4JVCA 1NKXA 3ZSFA 1VE4A 1B5JA 4OMBA 5EQAA 4GX4A 4KHZE 1EU8A 4IGRA 1SYHA 4YKKA 1GGGA 2F3DA 4MCOA 5IGAA 2XXKA 2ZNUA 4N07A 1B3EA 1AL3A 4QSDA 4GD5A 4G4PA 5ITPA 1B7HA 2W7YA 1SW2A 4PFUA 2DE3A 3VLVA 1LAHE 3RT6B 2PT1A 2IEEA 3EHTA 3T1BA 1R1NA 1IXHA 1B05A 1FPLA 3P7IA 1VSOA 4P8BA 2IA4A 2QSXA 3L6HA 3V8XB 1D4NA 3TELA 1B7UA 2QS4A 3C33A 3KOSA 4DE8A 3TEPA 2REJA 3GZGA 5EQ9A 3PD8A 4ZEIA 4YU0A 3K2DA 3MAMA 1II5A 1FBHA 3LUYA 4DDDA 1JETA 5L9MA 1ZBMA 1B0LA 3IFCA 5B70A 2H9BA 4F1YA 2ZZXA 4DCXA 1NUYA 5I59A 1FPGA 4AQ4A 1ANFA 4AS4A 4R2FA 5AA4B 5EQ7A 4ZECA 2Z22A 1LBXA 5F1QA 1JEUA 1OQGA 3E13X 3GYYA 5B7DA 3PPRA 5IAIA 4N13A 4U23A 4P11A 1UIVA 1A8EA 3A3CA 3IOVA 4NWDA 1IMCA 1JEVA 1MS7A 3C31A 1JW4A 5IZ3A 3CRBA 3EHUA 4M4GA 3A09A 3UORA 1FQBA 3IJOB 3TQWA 2O51A 2OZZA 5FHOA 3BBRA 4XIGQ 3MJNA 3O97A 4LATA 1KA0A 3W15C 4Q5TA 3B8BA 4U4SA 3IK6B 4HE2A 4O7IA 5I84A 4JWYA 4I9DA 3PPOA 4F1UA 5DTBA 4GWYA 4ELOA 5I2KA 3JV9A 3PMVA 4MIJA 3FXUA 3KOTA 3KN8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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