5AA2A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
419
structure length
419
Chain Sequence
KEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 143
structure length 419
sequence length 419
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A02
2DS9A 3M3LA 4C0RA 4H8JA 1MS7A 2RC7A 1Y4CA 2VP1A 4RY1A 3C34A 5AA2D 4FORA 4R6KA 3KG2A 4R9GA 2REGA 5CI5A 3IO4A 3U8QA 2O51A 3H03A 5FHMA 5JEIA 1M5CA 3LBSA 3UK4A 1FTOA 4ELPA 4IO4A 4KCCA 3K6VA 4Z7EA 2F36A 3C32A 4PFUA 5K2XA 5F1QA 1B9JA 4OHNA 2PMSA 3VFJA 4N13A 2P1SA 1ZIUA 2I58A 1POY1 1SW5A 1N84A 4FE8A 1PB7A 3O6HA 1F9BA 4EQ9A 1GTKA 1PDAA 4EDPA 2Z22A 5FHNA 1VFDA 5TP9A 3LSFB 3S9EA 3THIA 2F97A 3TUSA 5HBCA 2OBGA 1A8FA 5I2KB 3TCGA 3MPKA 4OERA 4H5FA 4ND9A 3IOTA 4PFYA 3T22A 4YMAA 3MZ9A 3T9UA 2XD2A 5M2VA 2DWJA 4LZ8A 3LC8A 4F3BA 4OVJA 4QFLA 3SEVA 3Q25A 4NF6B 2XXUA 2XXPA 1MH4A 4G8MA 1JVYA 4KHZE 5CBSA 2F5XA 2ABHA 2XXYA 1ZKBA 4JDFA 3MVZA 3C35A 1B46A 4R72A 1MQJA 1RYOA 1LSTA 4F2OA 4MF3A 1RYXA 2QSXA 3CI8A 2VGQA 2B65A 2XX9A 5CMKA 2XXIA 1LB9A 2RCAA 1MY0A 4OESA 1USYH 4U4XA 4R6YA 3IO6A 3E3KA 1DOTA 4ELQA 1LFIA 5AA4A 1FW0A 1FTLA 1KWHA 3RTFB 3USDA 1N7WA 1UIUA 2HEUA 5ITOA 2O6AA 3B6QA 1DMBA 1JW5A 3UIFA 3PV0E 4GFRA 1I6AA 3LSXA 4IGTA 4P11A 4F3GA 1B7ZA 1PC3A 3QUJA 3WAFA 1EZOA 5CRYA 5AA1A 2DYXA 1M5FA 1AH5A 4G8HA 1PBPA 4GVOA 4YKPA 3OSQA 2V3QA 3MAMA 1OIBA 4QSEA 2Q8JA 2ESNA 1OMPA 1H43A 3TKDA 2VD2A 1MH3A 1B3GA 3PUZE 4N07A 4K3FA 2XXQA 4FAJA 1GGGA 3N5LA 3O66A 4I8CA 3T93B 1UTBB 5EHSA 4XKQA 2ZNSA 1MPDA 1MXYA 5ICQA 4DXCA 1A55A 1JW1A 1MQDA 1YPNA 4RK9A 1SD3A 3S9LC 4X1DA 3GLBA 3ZS6A 1R1NA 5I57A 1MQIA 2PT2A 1B3FA 3BKIB 2XD3A 4YU0A 1WDNA 3TPAA 3OXNA 2WKYA 3TELA 3MBPA 1S7YA 2IEEA 4POXA 2HZKA 4FEDA 3FASA 3IORA 2I0CA 4E0WA 1MXUA 3O28A 3OO8A 3DP8A 2FNCA 4NF4A 5LOMA 2Q2AA 3FJMA 1VSOA 2YLNA 4ZEDA 2NVUB 3B6TA 1Y4TA 4ONYA 4BDOA 2H99A 3IR1A 3JZJA 2D3IA 1N3XA 4ZEIA 1JEUA 3CFZA 3RUMA 4LVQA 1A40A 4IO6A 3MJNA 3Q27A 1WODA 1LCTA 3KFMA 1ANFA 1USYE 1TFAA 4XTCQ 5ELVA 3PUXE 1BP5A 1M5EA 3V89B 1Y3QA 4H1XA 3HHGA 2V93A 2OLBA 2FYIA 1FTJA 3FGSA 2H25A 4XIGQ 4OZ9A 3RT6B 4RNSA 5CMCA 3L6GA 2HCAA 1JQFA 1TWYA 1B4ZA 2DSFA 2VHAA 3C33A 2O1LA 5I56A 1NL5A 2ONSA 3H6UA 2HAUA 2OK2A 3CFLA 5A5XA 2HQ0A 3KSJA 4O3CA 1D3KA 3H7MA 1B0LA 3PUVE 1HSEA 5B70A 1CB6A 4IO7A 3M3KA 3LSLA 3DM0A 2DE2A 2RKMA 4ZEKA 2NOOA 4KR5A 1FTKA 3D4CA 5H8QB 3E13X 3DLNA 3FXRA 3ZKKA 2F78A 3VVFA 3MPLA 1M5DA 4F3SA 3A3UA 3MP6A 1H76A 2GHAA 3V5AA 2HZLA 3K6WA 2QPQA 2GRVA 2I0BA 5HPQA 4RXLA 1JNFA 1Y1MA 3SEUA 5KCJA 3K02A 3QSLA 1SYIA 3IL1B 1QKBA 4L17A 3RGYA 3T66A 5L9SA 4X48A 3OEKA 1MDP1 1XHYA 3I5OA 3W15C 1A7LA 1SW2A 2M8CA 5DVFA 2ZYKA 3OO7A 4OQOA 3H3GA 1OQHA 5DEXB 1IXGA 4YMBA 4JSOA 1MM6A 4Q0CA 2GHBA 2UVJA 4KPTA 4F39A 2V3UA 4THIA 2O7IA 1VFEA 4X9TA 4F18A 3QAXA 1DTGA 3TDJA 3B7DA 1N76A 1I6QA 3RY3A 3PUYE 2I3WA 3RT8A 4IY6A 3HO7A 1XS5A 3K4UA 3EHUA 3HPIA 2PBWA 4ZE9A 3EHTA 4GXSB 3KN7A 3SEWA 3KOTA 4GD5A 4RPNA 2Z8DA 5DVIA 1XVYA 4PFWA 4JB7A 5H8NB 3S4UA 4YICA 1UTHA 1LBCA 2OZZA 3S9MC 4XXUA 1LBBA 4M4GA 5L8DA 2IA4A 1D4NA 1VR5A 2O84X 2DVZA 1DTZA 3FJGA 3MZ1A 3MVXA 4GOTA 4MBPA 3FVKA 1FQCA 4ESXA 2A5TA 1IQ7A 1B4HA 1JEVA 4OMBA 5I59B 3IOVA 1MPBA 2F7AA 3IB1A 1XOCA 4NWDA 1B40A 3PPNA 2QRYA 3W9WA 5BWJA 4BDRA 4RK2A 2DOJA 4F1VA 1SW4A 2AIXA 2RINA 3MW0A 2NWJA 4FEBA 3FV1A 3FJ7A 2XX7A 3RN8A 3ODBA 4P0GA 5AA2A 4HCWA 2YPNA 4EQBA 3K1PA 4QHQA 4GIZA 4G68B 4Q30B 3VLVA 4ZS9A 4WKMA 3PPQA 2RC9A 2OJTA 4GQOA 3T9XB 3C31A 3M8UA 3TQLA 1B5HA 3O2AA 4F1YA 1QVSA 4I9DA 4YB6A 3BFTA 3TYHA 1MXVA 2ZYNA 1SVXB 3E4RA 1B58A 2UYEA 4F1UA 3IOUA 1US4A 1NKXA 2X7QA 4QFOA 5JTYB 1FQAA 4NF8B 4H8IA 2GH9A 4NF5B 3VLWA 4LATA 3DELB 4BLAA 5EYFA 4LQ5A 1B32A 2UVGA 2F8DA 1IUDA 1TT1A 3G7WA 4U1ZA 1N7XA 3V83A 3UGWA 1B3HA 3QUFA 4DXUA 2Y7PA 4G77A 1B7UA 1OVTA 3CIJA 4I1DA 3K00A 1MXXA 4NEDA 2NUVA 1N3WA 4ZEFA 3U1OA 5KDTA 1D9YA 3PMXA 4OFJA 3CG3A 2B3BA 4EF1A 4ZZAA 1OLAA 4KYEA 4BDLA 3C4MA 4YB7A 2LAOA 5H8HA 1YAEA 5JK4A 2R71A 4MLQA 3SKPA 5ITPA 2KLFA 5I84A 3HV1A 5TU0A 1P1NA 2XXRA 2XX8A 2O1MA 3MVWA 4F31B 2ZNTA 4KD5A 1NH7A 4HTGA 4QFKA 5TPAA 2YJPA 5HM4B 2OWSA 3K1MA 3KSXA 2QL3A 3S9NC 4F19A 2H4IA 1MY4A 1M5BA 4ZEBA 5I58A 4IB2A 1L5TA 1MXWA 1IXCA 3O9PA 4R73A 3VDFA 3VXBA 1S50A 3FATA 3KEIA 1IZ1A 1P1UA 3MP1A 3PD8A 3TAJA 5L9OA 4RJZA 5FHOA 1IXIA 2W7YA 4O3AA 1A99A 4LQ2A 1OLCA 1II5A 5I2NA 5CC2A 5H8FA 5IKBA 1P1WA 4IY5A 5AA3A 2QJEA 4OXVA 1BIYA 1BTJA 3DP4A 3Q26A 4DIGA 3K2DA 4U1OA 2DWIA 4R74A 2AYSA 3MP8A 2F35A 4EQ7A 4HCYA 4LZ5A 3TTNA 4JWXA 2F7BA 2DXRA 5CM6A 3U93A 3A3CA 5TP9B 1LAFE 5ISUA 2ZXTA 3PPOA 3T96B 4BDMA 1ZTYA 4YKJA 2I6EA 3G3HA 4JWOA 3ILTB 3FXQA 2RF1A 4H67A 1O63A 1N04A 4BDQA 4TQUQ 2UYFA 3CFXA 1IIWA 5DT6A 4F29A 3TTMA 4E0XA 4H0WA 1QUIA 1XC1A 3O29A 3HHFA 4EXKA 2UVHA 3KGCA 1A8EA 2Z8EA 4H6DA 3G3FA 4LONB 3I6VA 3K0VA 1QUJA 2CMOA 4OENA 4NTLA 1MY2A 4G68C 2VOZA 3IOWA 2PYYA 4WXJA 2QS4A 2H5YA 3ONMA 3O6GA 3H6WA 4OETA 2ZNUA 5AE4A 3MC2A 2THIA 2V3TA 1DPEA 2XXVA 3SEXA 5AA4B 3SETA 1PB9A 1Q35A 3LR1A 2D21A 4FIMA 2I4CA 1EZ9A 3OO6A 2H98A 4PP0A 3VVEA 1MM7A 4R2FA 1I6BA 3T9HB 4EUOA 3KBRA 2QS3A 3OEMA 4EXLA 1US5A 3KN8A 3AXFA 3U72A 3MWBA 4GF8A 3OMBA 2E0SA 3P7IA 1Y3NA 3RTWB 3OSRA 4FJPA 3OOAA 3OELA 3MVYA 3G3JA 4QSCA 3KZGA 1EH3A 3QXMA 4OFLA 3PMVA 1BLFA 1B5JA 4KFQA 4QFNA 1AIVA 3JV9A 3OO9A 5I57B 1GV8A 4P0IA 5I2KA 4WEPA 1LCFA 3TCHA 1LGBC 1H45A 4Z0IA 1LAHE 4YAHX 1BKAA 3K6UA 3PMWA 4U2RA 3RPWA 4LZ7A 1B05A 1TXFA 1B1XA 1R6ZA 3F11A 5B7DA 4NF4B 3FD3A 4NF6A 2OCUA 2GFEA 4OFOA 5IAIA 3TEPA 5CMBA 1LAGE 5EHMA 4KI0E 3ILUB 3W9VA 4KYSA 2F6GA 3E9XA 3G3GA 1J1NA 2XXTA 1FQBA 3PGFA 3Q28A 1JETA 1MPCA 4U23A 3VXCA 2G93A 3KJ7A 2B3FA 1FQDA 4KCDA 4X1BA 1JVXA 1XT8A 4EF2A 1H44A 3CVGA 1Y20A 3EQ1A 1Q1KA 5I56B 4ZDMA 1Z7NE 4MFIA 3JYRA 1URGA 4I62A 1FTMA 2I3VA 1SW1A 5A5XB 3H6VA 1H3DA 2NXOA 1DPPA 1MG1A 5CBRA 2DE4A 4OEVA 3CRBA 1D9VA 3CSBA 1LB8A 1Y9UA 4FATA 3VLUA 3OD7A 1PEBA 1TFDA 1IEJA 1B1HA 3K1NA 4C1TA 4BDNA 2RC8A 4ELOA 1JW4A 3IK6B 3HN0A 1UTBA 4DZ1A 3PPPA 3SDFA 5F7VA 3LUYA 1MXZA 3SERA 2Y7KA 4C1UA 3ECRA 5CMMA 2Z23A 3U94A 1LFGA 5KCJB 4FECA 1QULA 3EPEA 3FV2A 5H8SA 2R6GE 4KYDA 4JXIA 2REJA 1FQEA 1R9LA 2DWAA 4TOZA 3V8XB 1YCJA 4NMYA 4TLMB 4QFPA 3C36A 3GBAA 4YB5A 2QMWA 2PVUA 3OENA 4IO5A 4YKKA 4WEDA 2XXXA 1SYHA 3QYTA 3UN6A 4F3PA 4DLDA 4ESWA 4ISUA 1AOVA 2DVCA 1CE2A 3D4GA 4R6HA 3EF7A 2CZLA 4HS7A 3DP6A 2F6PA 4F22A 4H65A 2XHDA 1ATGA 3UA8A 1HSJA 2E1SA 1NFTA 4QSDA 4TLLB 4OWDA 2F34A 2DP8A 2V84A 2G29A 4RA1A 2PX1A 3SESA 2O7UA 4UA8A 2R9JA 3TTLA 1QJMA 4N6PA 4PETA 1MDQA 1UTHB 3C9HA 1B51A 4IGRA 4NWCA 4U4SA 4R2BA 1AMFA 2Z8FA 1WVJA 4DDDA 1OVBA 4MH5A 2A5TB 3TQWA 4PFTA 1O64A 2UXAA 3UORA 2ONKE 3O6IA 3IB2A 4GXAA 2HXWA 3CR9A 1SBPA 5L9MA 1B2HA 2QMXA 4U22A 3GBBA 4NE4A 2DE3A 1B6HA 1ZLQA 5H8QA 3TODA 2O68A 2XXWA 4OYVA 3B6WA 5AA2B 3I3VA 2Y84A 2ZYOA 1OQGA 1B5IA 2Y7RA 3N6TA 3G3IA 4XKRA 1MRPA 1P1QA 1ZJLA 4M1VA 3FXUA 2Y7WA 2I48A 2V25A 2Q89A 1VE4A 3CSGA 4DE8A 1NNFA 3PPRA 3TCFA 3TMGA 4F2QA 3T9VA 1MQHA 4KQPA 3U92A 3IAZA 1URSA 3UP9A 1N0TA 1SDXA 4RYAA 3GXAA 1LLSA 4RPOA 2AL4A 3FVGA 4G2ZA 5DEXA 1Y1ZA 4IO2A 3VV5A 3IB0A 1MY1A 5K2YA 4GLIA 1EZPA 2ANJA 1B3LA 4IO3A 3R7XA 1NNPA 2Y7IA 3BFUA 1ZMGA 4G8NA 2OWTA 1PB8A 4AB6A 2UVIA 5FTIA 4MLVA 3KJTA 2AL5A 3IJOB 3SEYA 1A54A 1URDA 3VVDA 3TTKA 4XKNA 2Q9TA 3MQ9A 3PU5A 2HAVA 2Q2CA 3FIRA 3FUZA 1NNKA 4DXBA 1MQGA 2X7PA 1QW0A 1B0HA 4QF9A 1P1OA 5KDTB 2HFBA 4JBZA 3WAEA 4AQ4A 1SI0A 1DSNA 3KN3A 1POTA 1P99A 1B7HA 5H8HB 3PUWE 4YZZA 5H8NA 4UACA 1QKAA 3IJXB 3ZKLA 4QRZA 4H5GA 2O69A 3RQTA 3M3FA 1AL3A 1GVCA 3R26A 1LAXA 5TPAB 3G3KA 1ZBMA 1QUKA 1I69A 4OTEA 1IXHA 4Q8RA 3L6HA 2F7CA 3H6TA 3N26A 5I59A 2H9BA 1LFHA 4R9FA 4OEUA 2Q88A 5I58B 3H06B 3ZSFA 3EN3A 1PBQA 3VE1B 4ZECA 3QK6A 1B3EA 5DVJA 1B52A 4G68A 4ELRA 1ZU0A 1UQWA 1NNTA 2ZMBA 4GWOA 1NMUA 3H4ZA 3PD9A 2VD3A 3RNNA 4GL8A 5I2NB 3LSWA 5H8FB 2A5SA 4GL0A 1O7TA 1XVXA 3K6XA 1UIVA 4POWA 1MY3A 2ZYMA 5KZTA 2QS1A 2DWHA 4O3BA 1SQYA 2DQVA 2QS2A 3K01A 5J1DA 3HSTA 1RKMA 5DTBA 4R75A 2DXYA 4DCYA 4ZZEA 5JTYA 4NF8A 4NF5A 1GR2A 2I49A 3N94A 4DCXA 3TFLA 4YKIA 2ONRA 5DYHA 2X26A 2I4BA 3GZGA 2RCBA 3RLFE 3HCQA 3FZVA 4LP2B 1R9QA 4ZE8A 4Q5TA 1S9TA 2ALUA 4HW8A 1YTVA 3A09A 4JWYA 3S2VA 2PT1A 2XXHA 5ICTA 1Z7ME 3Q29A 4JSDA 4PQJA 1NH8A 2FA7A 5BUUA 4PE5B 1FCKA 3QIMA 1SI1A 3FVOA 3BBRA 5FTHA 4GRKA 3EHSA 3MUQA 3TTRA 4G4PA 1HSLA 3R6UA 3KOSA 1T0KA 4AB5A 2BJJX 3MZBA 2D5WA 4U21A 1EU8A 4ECFA 1Y3PA 3TZAA 4LUBA 1IITA 4LA9A 1ELJA 3IX1A 3N6UA 4XKPA 1FQFA 3O97A 2P2AA 3FVNA 3CG1A 2P0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MNPA 1FPBA 2DS9A 3M3LA 5ET8A 4C0RA 2GQ1A 4H8JA 4NX1A 1MS7A 2RC7A 1Y4CA 2VP1A 4RY1A 4MHFA 3C34A 5AA2D 4FORA 4R6KA 4OANA 3KG2A 4R9GA 2REGA 5CI5A 3IO4A 5IZ1A 3U8QA 4N6DA 2O51A 3H03A 1K9YA 5ET6A 1FPJA 5FHMA 3FXBA 5JEIA 1M5CA 1CNQA 4PFRA 3LBSA 3UK4A 1FTOA 4ELPA 1EYIA 4IO4A 4KCCA 2B4LA 3K6VA 4Z7EA 4PAKA 2F36A 3C32A 4PFUA 5K2XA 5F1QA 4AS4A 1B9JA 4OHNA 2FIXA 2PMSA 3VFJA 4N13A 2P1SA 2WEFA 1ZIUA 2I58A 4GX3A 1POY1 1SW5A 4NG7A 1N84A 4FE8A 4H45A 1JP4A 1PB7A 3O6HA 1F9BA 4EQ9A 1GTKA 1PDAA 4EDPA 2QVUA 2Z22A 5FHNA 1VFDA 5TP9A 2OWZA 3LSFB 3S9EA 3THIA 2F97A 3TUSA 5HBCA 2OBGA 1A8FA 5I2KB 3TCGA 3RPLB 3MPKA 4OERA 4H5FA 4ND9A 3HFUA 3IOTA 4PFYA 3T22A 4YMAA 3LV0A 3MZ9A 4PTKA 1FJ9A 3T9UA 5I3SA 2XD2A 5M2VA 2DWJA 4N4UA 4LZ8A 3LC8A 4F3BA 1FBFA 4OVJA 4QFLA 2ZZVA 4X04A 3SEVA 3Q25A 4NF6B 2XXUA 2XXPA 1MH4A 4G8MA 1JVYA 4KHZE 5CBSA 2F5XA 4P1EA 2ABHA 2XXYA 1ZKBA 4JDFA 3MVZA 3C35A 1B46A 4R72A 1MQJA 2ZZXA 1RYOA 1LSTA 1NUZA 4F2OA 4MF3A 1RYXA 2WYPA 2QSXA 3CI8A 4UABA 2VGQA 2B65A 2XX9A 5CMKA 2XXIA 1LB9A 2RCAA 1MY0A 4OESA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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