5AA2A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
419
structure length
419
Chain Sequence
KEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 143
structure length 419
sequence length 419
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A02
3A3UA 4IGRA 3KGCA 4H0WA 1ZKBA 5L8DA 4F18A 5CC2A 4YMAA 4BDRA 2RCAA 1MXWA 4DCYA 3K4UA 3U1OA 4GVOA 2HCAA 1MM7A 3M3KA 3MQ9A 3SEXA 3I3VA 3CRBA 5CBRA 2V93A 3BFUA 3IB0A 3SEWA 5I2NA 4JB7A 4YKPA 2VP1A 4KPTA 3FJGA 3I5OA 5A5XB 1QJMA 4IO5A 3PPQA 2NOOA 5CI5A 2Q88A 2VD2A 1GVCA 1GR2A 1MQHA 3FGSA 4JWXA 3KSJA 1LB9A 4PFUA 2R6GE 1FTMA 3VVEA 5CBSA 5TU0A 5KCJA 4EUOA 4QFOA 3K1PA 4WXJA 1TXFA 5HBCA 1OQHA 3V8XB 3FJ7A 5KDTA 3KZGA 3V83A 1ELJA 4KCDA 4JBZA 1AMFA 4JWYA 3MWBA 4F31B 3O97A 3S2VA 1H45A 1N04A 2D5WA 1SYHA 3TTNA 1N0TA 2H99A 1RYXA 3V89B 5L9MA 4C1TA 4ZE8A 3EHUA 2XXIA 1MDP1 3MVYA 3K6XA 4YB7A 2KLFA 3EPEA 4EXKA 5H8NA 2OBGA 2NXOA 4RYAA 1N84A 3A3CA 3OENA 3OSRA 4OHNA 4R2FA 4RY1A 1USYE 1VFEA 3OSQA 4YMBA 3VXCA 1D4NA 3RLFE 4ZZEA 1ZLQA 3CSBA 3HCQA 4LONB 2XXYA 1Z7NE 1PC3A 3OO6A 1M5FA 4NF4A 3RTFB 3K1MA 4EDPA 5J1DA 2F6GA 3MP8A 3MBPA 1VSOA 2HZLA 2I4CA 4ZECA 3C34A 4X1DA 3PU5A 5JEIA 2BJJX 2RF1A 1HSLA 1Y3NA 5K2YA 3KOSA 3OEKA 4KQPA 2GH9A 4DE8A 5H8HB 2Q8JA 4GXSB 2OCUA 4NMYA 2P2AA 2XXPA 3EF7A 1P1OA 3FXQA 2Q2AA 3TKDA 2VGQA 2RC8A 3CIJA 4EQ7A 1POY1 1IXCA 3C4MA 1P1NA 4N07A 2ALUA 4MBPA 5I59B 4NTLA 1SW1A 4F39A 1MY0A 2ONSA 3Q27A 3U72A 1JW1A 1MXUA 4YICA 2Y7RA 2ZMBA 3RY3A 1IZ1A 3C31A 1O64A 5I84A 3N5LA 1Y1MA 4HTGA 2DXYA 4X48A 4KYEA 4IO7A 2V84A 5CM6A 1MM6A 2WKYA 3H06B 1NNFA 1LLSA 1QUKA 2AYSA 3H7MA 4QRZA 3FD3A 4NF5A 3H6UA 1MH4A 2DE2A 3USDA 4DLDA 1FTOA 4OWDA 3TQWA 2E0SA 4OMBA 3N6TA 4FJPA 1B7HA 5ITPA 4F1YA 2QMWA 1ZTYA 3FVKA 1MDQA 4U4XA 2Y7KA 3Q25A 4EF1A 3N94A 2F78A 4F2OA 1I69A 5DEXB 4H5GA 3VV5A 3DELB 1JNFA 1NH7A 4BDMA 2PVUA 4U23A 1URSA 3Q28A 4BDQA 1MXZA 3PV0E 3M3LA 3SESA 1Y4CA 5HM4B 4QSEA 3QK6A 3TYHA 3S9NC 3FJMA 1B3GA 2O7UA 1SI1A 3PD8A 2P1SA 4H8IA 1LFIA 4H5FA 4TLLB 2XX7A 4RK2A 1Z7ME 4ZEBA 1T0KA 1FQEA 3VXBA 1IXHA 3IOVA 2NVUB 1JVXA 1R1NA 2A5SA 5F1QA 5KZTA 5BUUA 4DZ1A 2H5YA 2ZYNA 4ISUA 4BDLA 4U4SA 1UTHA 2VOZA 4TOZA 2H25A 1FTLA 4ZDMA 1URDA 3KJTA 4IO4A 1B3EA 2DS9A 4YZZA 2Q9TA 3KFMA 1Y1ZA 4LZ8A 4OQOA 5DTBA 4G68C 1ATGA 2O1LA 4X1BA 4RK9A 1ZIUA 1A40A 4KFQA 3T9XB 1FQDA 1B52A 2VD3A 2DVZA 3N26A 3MW0A 2QS4A 1QKBA 4POXA 5TP9B 1RYOA 3OXNA 3L6HA 3O9PA 2E1SA 4R2BA 1TFDA 3FZVA 2ANJA 2DSFA 4F3BA 1DSNA 1Y3PA 4K3FA 1B9JA 1N3WA 3QXMA 1B5HA 4C1UA 4PETA 3CFLA 2HEUA 4C0RA 1SBPA 1URGA 3G7WA 4G2ZA 3TDJA 1R9QA 1DTZA 1LFGA 4O3AA 2G93A 4DXCA 2ZXTA 5I58B 4ONYA 4YKKA 4U21A 4E0WA 4GXAA 4DXBA 5H8FA 2XX9A 2Y7IA 2A5TA 5B70A 3KN3A 1OQGA 3O29A 2ZYMA 5ELVA 3CFZA 3UORA 3EQ1A 3R7XA 1QVSA 3C32A 1MS7A 3U94A 3E13X 1J1NA 4OENA 4G8HA 2DWAA 4U22A 3EN3A 5H8QA 3G3IA 2B3FA 1EH3A 2DQVA 4ELPA 2ZNUA 3B7DA 2ZYOA 3CI8A 1YCJA 1WVJA 4IO2A 1USYH 5IAIA 4OEUA 3IOWA 3FUZA 3ONMA 2ZNTA 3IORA 4LVQA 2UVIA 3K2DA 2PT1A 3ZSFA 4FAJA 1LAGE 2OWSA 1JQFA 4BLAA 4YB5A 3FXRA 3RUMA 1MQGA 3O6HA 1PB8A 3ZS6A 2QRYA 4THIA 3DLNA 4LZ5A 4F22A 4HCWA 4G68B 1D3KA 3MPKA 5AA2A 2O1MA 2DXRA 4GQOA 3FATA 1FQCA 1ANFA 1XHYA 5FHNA 1IUDA 1CE2A 3GLBA 4R6KA 4GLIA 1DPEA 3K01A 3T66A 4M1VA 3TZAA 3K1NA 5TPAA 4Q8RA 2F7CA 3THIA 3VE1B 1CB6A 4I8CA 5AA2D 2QL3A 2QJEA 3GBBA 4QHQA 1MPCA 3IO4A 1LAHE 3D4CA 2R71A 1H44A 2Y7WA 3A09A 3OEMA 4JSDA 1JW5A 3RTWB 3IO6A 1HSJA 1B1HA 2HQ0A 3U93A 4R6HA 3L6GA 1B0LA 4FIMA 4F1VA 3MZ1A 2B3BA 1B2HA 1FQFA 2IEEA 2VHAA 4PFWA 2REGA 4IO6A 5M2VA 4L17A 3MVXA 2V3UA 2V25A 1NNTA 3C35A 3SKPA 3WAFA 2THIA 3UK4A 2I0CA 3MZ9A 3RT8A 1XVYA 3VLWA 1Q1KA 3RGYA 1B6HA 2O7IA 4YKIA 1GV8A 5DT6A 1N3XA 2QMXA 5I57A 4LATA 5DVFA 3BKIB 3DP6A 1JW4A 4F19A 1UTBB 5FTHA 1AL3A 1VE4A 1AH5A 2XXRA 1UQWA 4NF6A 3G3FA 3QSLA 1M5DA 1B3HA 3HN0A 3FASA 3C33A 3K02A 1WODA 4KCCA 5DVJA 2ZYKA 1DPPA 4N6PA 5I56B 1EZPA 3PPPA 5B7DA 2F7AA 5ISUA 3RQTA 2XX8A 3IOUA 1M5CA 1B0HA 1EZOA 3LSXA 2QSXA 3OO8A 3TTKA 4E0XA 1BIYA 3QYTA 1B4HA 4F3PA 4UACA 3N6UA 3U8QA 2D21A 2DWIA 3MVWA 3H6VA 2UXAA 3SETA 2Z8EA 1FTKA 4QFNA 3PGFA 3T96B 3UP9A 3SDFA 1P1QA 4MFIA 5I2KB 4YB6A 4P11A 1JVYA 2QPQA 2R9JA 3IB1A 1FW0A 1JEVA 4AB6A 5FTIA 3ECRA 4OFLA 4GD5A 5AA4B 4I62A 1H76A 3H6TA 4O3CA 2AL4A 2Z8FA 2GHAA 3B6QA 3LR1A 4R9FA 4QFLA 5DVIA 1BTJA 1B5JA 5JTYB 1MRPA 3VLUA 1KWHA 4I1DA 4KR5A 1IXIA 3VDFA 1SI0A 4P0GA 4ESWA 1SW2A 4GRKA 2IA4A 3IOTA 2UYFA 3HO7A 1F9BA 1MY1A 1I6QA 2XXVA 3E3KA 1QKAA 3PMVA 2D3IA 3LUYA 4Z0IA 2I3WA 2FYIA 3V5AA 4H67A 4ZS9A 1OLAA 3KG2A 4F1UA 2AIXA 4JSOA 4LQ2A 4EF2A 2REJA 4BDOA 1PBPA 5AE4A 4XXUA 4KD5A 4OZ9A 4H8JA 2YJPA 3CSGA 3W9WA 2Y84A 1LCFA 3IJOB 2O51A 3MPLA 5ITOA 2XXTA 2F8DA 3I6VA 3IJXB 4O3BA 3TTRA 1Y20A 4QFKA 3G3GA 4KHZE 3M3FA 1B51A 3WAEA 1LAXA 1TWYA 4H6DA 3TPAA 1VFDA 1MXYA 2V3TA 3BFTA 1II5A 2M8CA 3TCFA 2OK2A 3Q29A 3KOTA 3T22A 3Q26A 1L5TA 5I59A 1OMPA 2F7BA 3R6UA 3O6IA 4OYVA 5F7VA 4N13A 4AQ4A 4WKMA 1MQIA 2W7YA 1MG1A 1MY3A 3RT6B 4NF8B 3G3JA 3PUXE 3RPWA 3H4ZA 3ILUB 4IY5A 2XD2A 3OD7A 4DXUA 3T93B 3JYRA 3FXUA 2PBWA 1GGGA 3ZKLA 2HZKA 4ZZAA 4H65A 1P1WA 2RCBA 1DTGA 2X26A 4IGTA 1NKXA 2X7PA 3HHGA 3VFJA 3KSXA 2DE3A 4OETA 1OVTA 3CR9A 1P99A 1VR5A 2Q89A 4YU0A 5BWJA 3GZGA 3R26A 1AIVA 2PT2A 2AL5A 2I0BA 2UVGA 1O63A 2H9BA 3T9VA 4PE5B 2G29A 1B40A 5AA2B 3UA8A 3C36A 1DOTA 1RKMA 3CG1A 4LZ7A 5DEXA 1PB7A 3PUYE 3B6WA 4PP0A 5CMCA 5EHMA 4GIZA 3MUQA 4KYDA 5I2NB 4I9DA 4R74A 1JETA 2RC7A 1FQBA 4DIGA 3MC2A 4LQ5A 1N76A 4QSCA 3O2AA 3K6VA 5ICTA 3PMWA 5L9SA 4ESXA 3OMBA 2I4BA 3TMGA 5KCJB 2DWJA 4EXLA 1MXXA 2PX1A 2RC9A 4WEPA 4MLQA 3CVGA 3O6GA 4DDDA 3U92A 4WEDA 3RN8A 4F3GA 5KDTB 2I49A 3LSLA 1B5IA 1A55A 1LSTA 1LGBC 1R6ZA 2DE4A 4F3SA 4YAHX 2F34A 1IXGA 3H03A 5ICQA 2OLBA 4NEDA 1LAFE 1S9TA 3CFXA 1A54A 3TQLA 4FATA 1S50A 3TELA 3VLVA 3GBAA 4XKRA 4U1ZA 1PBQA 1QULA 3TODA 1M5EA 2NWJA 2I58A 2HFBA 5H8NB 4FEBA 2I3VA 3B6TA 2ABHA 5TP9A 1LB8A 2ZNSA 3EHSA 3KN8A 2H98A 5JK4A 2Z23A 4NF6B 4KYSA 1N7WA 1A8EA 4G77A 3T9UA 3W9VA 4ELRA 2UVJA 3FVNA 3HSTA 3PPNA 3IL1B 3SERA 1US5A 4R73A 2PMSA 1ZU0A 4NF4B 4LA9A 5AA1A 4R75A 1Y4TA 3HPIA 3SEUA 3K6UA 4R6YA 4GL0A 4JWOA 4M4GA 1OLCA 3QIMA 2Z8DA 5I58A 3UIFA 2LAOA 3SEYA 4OFOA 1SQYA 4Q30B 2NUVA 1HSEA 4G8NA 1XS5A 2Q2CA 5K2XA 3S4UA 4RNSA 1BP5A 4IY6A 3H3GA 1B7UA 4IB2A 5CRYA 2CMOA 1MY2A 4UA8A 1SDXA 4FEDA 1IQ7A 3KN7A 2UYEA 4JXIA 3OOAA 3TCGA 2XD3A 3RNNA 1UIVA 4ZEFA 5H8SA 3VVDA 3P7IA 3VVFA 4GWOA 3OO7A 5EHSA 3HV1A 4ELQA 4YKJA 1LBCA 1NNKA 4RA1A 2GHBA 4NWDA 1NL5A 4HW8A 2RINA 2GRVA 1ZJLA 3IB2A 3DM0A 2V3QA 3QAXA 3TAJA 1GTKA 3JZJA 2O6AA 3TTLA 2UVHA 2HAUA 4NF5B 4G68A 4GL8A 1B05A 2XXQA 3PUVE 4U2RA 3KBRA 3W15C 1Q35A 3GXAA 5HPQA 2QS3A 2F6PA 5AA3A 2F35A 3LBSA 1FQAA 3TTMA 1XOCA 1MPDA 4RPNA 2FNCA 4POWA 4LP2B 3KEIA 2FA7A 3OO9A 1N7XA 1I6BA 3IR1A 4GF8A 3PD9A 5A5XA 3QUFA 1A99A 2ONRA 1S7YA 3PPOA 3MJNA 3PUWE 2O69A 3F11A 5LOMA 2DOJA 2PYYA 4MH5A 1D9YA 3S9LC 3MVZA 4ZEKA 4TQUQ 1NFTA 3S9EA 1A7LA 3TEPA 1Y9UA 4G8MA 1XC1A 1MY4A 1BKAA 4FECA 1M5BA 1QUIA 4XTCQ 3CG3A 2ESNA 3ODBA 1MH3A 3O28A 4IO3A 4OERA 4F29A 3TUSA 4NWCA 1EU8A 1NH8A 2XXHA 4XKPA 4R72A 1UTHB 4HCYA 1ZMGA 1IITA 3FV1A 3DP8A 4EQ9A 5CMMA 2HXWA 5FHOA 1B4ZA 1JEUA 3ILTB 3PPRA 5CMKA 2ONKE 2DVCA 4ND9A 1MPBA 2F5XA 3UN6A 2DP8A 2YLNA 1UTBA 2Z22A 1UIUA 1PB9A 4H1XA 4P0IA 4EQBA 3K00A 1B46A 1LCTA 2YPNA 3IX1A 3G3KA 2Y7PA 5I56A 3E9XA 1DMBA 3OELA 1NMUA 2RKMA 1MQDA 2I48A 3LC8A 1YPNA 2CZLA 2OWTA 4XIGQ 2HAVA 5DYHA 3LSWA 5H8HA 4OXVA 3FVOA 4ZE9A 5L9OA 4AB5A 2F36A 4RPOA 3SEVA 3TFLA 2XXUA 5I2KA 2DWHA 2XXXA 1O7TA 5H8FB 1LFHA 1US4A 4GFRA 2A5TB 3C9HA 4OTEA 3K6WA 4PFTA 1QUJA 2I6EA 1YTVA 1TT1A 4MF3A 4F2QA 3T9HB 1IEJA 1B7ZA 1PDAA 3KJ7A 3G3HA 5AA4A 1SW5A 5H8QB 5IKBA 1B1XA 3ZKKA 3PMXA 3M8UA 4JDFA 2QS1A 4NE4A 4G4PA 3QUJA 1SW4A 5JTYA 4TLMB 1B32A 3FIRA 3H6WA 4GOTA 3TCHA 1MXVA 4QFPA 4HS7A 4Q0CA 3LSFB 1OVBA 4OVJA 3EHTA 2O84X 3O66A 4ELOA 3MAMA 4OFJA 1QW0A 1Y3QA 3D4GA 1B3LA 4X9TA 1H43A 3PUZE 1SVXB 4DCXA 3UGWA 1XVXA 4Q5TA 3DP4A 1MQJA 1SYIA 5TPAB 4FE8A 1B3FA 3JV9A 4BDNA 1IIWA 1YAEA 3E4RA 1PEBA 4QSDA 4XKNA 3MP1A 4KI0E 3K0VA 4FORA 4MLVA 4OEVA 2B65A 3S9MC 4U1OA 4RXLA 2F97A 5CMBA 4PFYA 1H3DA 3MP6A 2O68A 1NNPA 1AOVA 3IAZA 1ZBMA 2GFEA 1R9LA 1WDNA 4LUBA 2XXWA 1POTA 4RJZA 1OIBA 5FHMA 3AXFA 4XKQA 1SD3A 1B58A 4OESA 4QF9A 1EZ9A 1FTJA 2P0SA 1BLFA 4R9GA 3MZBA 1TFAA 2OZZA 3FVGA 4NF8A 4ZEDA 1D9VA 4ZEIA 1A8FA 1FCKA 3HHFA 2H4IA 4ECFA 2OJTA 2X7QA 2DYXA 2QS2A 3BBRA 3IK6B 5EYFA 5I57B 4PQJA 1I6AA 2XHDA 4Z7EA 1P1UA 3FV2A 1XT8A 1LBBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A3UA 4IGRA 4IR8A 3KGCA 4H0WA 1ZKBA 5L8DA 4F18A 5CC2A 4YMAA 4BDRA 2RCAA 1MXWA 4DCYA 4MMPA 3K4UA 3U1OA 4QXDA 4GVOA 2HCAA 1MM7A 3M3KA 3MQ9A 3SEXA 3I3VA 1AWBA 3CRBA 5CBRA 2V93A 3BFUA 3IB0A 3SEWA 5I2NA 4JB7A 4YKPA 5EQ7A 2VP1A 4PDHA 4KPTA 3FJGA 3I5OA 1KZ8A 4PE3A 5A5XB 3T0JA 1QJMA 4IO5A 5J16A 3PPQA 2NOOA 5CI5A 2Q88A 2VD2A 1GVCA 1GR2A 1MQHA 3FGSA 4JWXA 3KSJA 1LB9A 4PFUA 2R6GE 1FTMA 3VVEA 5CBSA 5TU0A 5KCJA 4EUOA 4QFOA 3A29A 3K1PA 4WXJA 4P1EA 4PBQA 1TXFA 5HBCA 1OQHA 3MYUA 3V8XB 3FJ7A 5KDTA 3KZGA 2CZKA 3V83A 1ELJA 4KCDA 2XWOA 4JBZA 1AMFA 4JWYA 3MWBA 4F31B 3O97A 3S2VA 4N8GA 4DI4B 1FRPA 1H45A 4FBPA 1LBWA 1N04A 2D5WA 4GX4A 3U65A 1SYHA 3TTNA 1N0TA 2H99A 1RYXA 5IZ3A 3V89B 5L9MA 4P47A 4C1TA 4ZE8A 2B4MA 3EHUA 2XXIA 1MDP1 4NGUA 2HXRA 2QVUA 3MVYA 3K6XA 4YB7A 2KLFA 3EPEA 2FIXA 4EXKA 5H8NA 4P1LA 2OBGA 2NXOA 4RYAA 1N84A 3A3CA 3OENA 3OSRA 4OHNA 4R2FA 2GQ1A 4RY1A 1USYE 1VFEA 3OSQA 4YMBA 3VXCA 1D4NA 3RLFE 4ZZEA 1ZLQA 3CSBA 3HCQA 4O94A 4LONB 2XXYA 1Z7NE 1PC3A 3OO6A 1M5FA 4NF4A 3RTFB 3K1MA 1FTAA 4EDPA 5J1DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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