5AA2B

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPPLKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 143
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
B PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2B02
2F34A 1H45A 4YU0A 2UYEA 1ZTYA 4U1OA 3KN7A 4ZS9A 4RY1A 1MY4A 4QSCA 3VV5A 3IK6B 2DS9A 1PDAA 1SVXB 5K2XA 1TWYA 2P0SA 4MFIA 3KJTA 2DE3A 3GZGA 3RUMA 2AIXA 2D3IA 3TCFA 4H8JA 2ZXTA 3Q27A 3ONMA 3C9HA 3MPLA 4YMBA 3D4CA 4FEDA 1HSJA 1MY0A 5CI5A 5HM4B 1D4NA 2ZYOA 3TKDA 3RT8A 3LBSA 3Q28A 1PB8A 4OFOA 1QKBA 3UN6A 1B3LA 1QVSA 5KDTA 3MZBA 2XX8A 4GWOA 2H98A 2HEUA 4OEVA 3IJXB 4OWDA 4GQOA 3S2VA 1SI0A 1I69A 1OQGA 2VP1A 2H9BA 1SW2A 5LOMA 3C31A 1FTLA 3FD3A 4YKJA 4C1TA 3FZVA 4ZE8A 1Y1ZA 3EF7A 1HSLA 3FATA 3TFLA 4QF9A 1N04A 2GHBA 3VLUA 1LB9A 1SQYA 4H1XA 4ZE9A 1JW5A 3GBAA 3FV1A 3W15C 3DLNA 3H3GA 1US5A 3IORA 3IOTA 1UTHB 2Y7PA 3MQ9A 1AIVA 5FHNA 2W7YA 2ALUA 3Q25A 4GXSB 4HTGA 4XIGQ 1R6ZA 2O7IA 3V89B 1FTKA 4U4XA 4NF4B 3H4ZA 3O29A 2RF1A 1B52A 4FATA 3QSLA 1B4ZA 2F97A 4OFLA 5TPAB 1LAGE 3TCHA 3N6UA 1EZOA 1Y3PA 1O63A 1FQFA 3ODBA 1B4HA 1IXHA 3C36A 1GGGA 1P1QA 3B6WA 3SESA 5I58B 5JTYA 1MXZA 5H8FB 2QMWA 4YB7A 3D4GA 2FNCA 4FECA 3TQWA 5DVJA 4DXUA 1GTKA 2O68A 4YB6A 2ZNSA 4Q30B 2H4IA 5EYFA 2ZYKA 2ZMBA 2OBGA 4OEUA 3FJGA 3T9HB 4DCXA 4EF2A 2H25A 2I4BA 5CBSA 4JSOA 4U22A 4OZ9A 4YMAA 3K00A 4ZECA 4R75A 2HAUA 1ANFA 3SEWA 4ZEBA 1Y20A 1AH5A 3DELB 4F1VA 1QUKA 4GF8A 4MLVA 2E1SA 3ILTB 2F6PA 3T96B 1UIVA 4EQBA 4JXIA 3FVNA 4JBZA 1QW0A 4DXBA 4BDQA 2A5SA 1HSEA 1NH7A 4QSDA 1M5BA 5ITOA 1FQCA 4LATA 5AE4A 3S9EA 4RA1A 4G68B 1S7YA 4KYSA 1Y9UA 2I58A 3CIJA 2QL3A 1B58A 2DYXA 3H6WA 3ZKKA 2LAOA 4ZDMA 1PB7A 2X26A 3S9MC 3SDFA 5DEXB 4G77A 4F29A 1OIBA 1RYXA 2REGA 2ABHA 1TT1A 3MJNA 4POWA 4G8NA 1Y3NA 1SW4A 1P1UA 3U1OA 4P0IA 4U23A 3EN3A 2V3QA 1NNFA 4E0WA 1D9VA 4G4PA 3K1NA 2OCUA 3VXBA 3IL1B 5EHMA 4F2QA 1R9LA 5EHSA 3TZAA 2HAVA 3MVWA 2ESNA 4GXAA 1CB6A 4R9GA 1UTHA 3PMXA 1B51A 5HBCA 4NF8A 4NTLA 3G3JA 3VVFA 3U8QA 3MWBA 1YAEA 4YKPA 2F7BA 1DPPA 2F36A 4DIGA 3OOAA 1SW5A 5L8DA 4NF4A 2V25A 1I6BA 3CI8A 3K2DA 5TPAA 4EUOA 5AA3A 1FQDA 3LSXA 3TYHA 4P0GA 3F11A 1ELJA 3TQLA 3TTKA 2XXIA 5ICTA 1B40A 5H8FA 1Y3QA 2D5WA 2OWSA 5BUUA 3K01A 3QUFA 4YAHX 3LC8A 1B5HA 1Y4TA 3AXFA 5AA4A 4U2RA 1JVYA 3C33A 2D21A 2XXHA 1ZIUA 3RTWB 5DYHA 3KOSA 2HQ0A 4ZZAA 3PPOA 4NEDA 2RINA 4FJPA 2AL5A 5I2NB 3FIRA 3M3KA 1B3FA 2PYYA 2DXRA 3L6GA 4F39A 4R73A 1JW4A 2ONKE 1URDA 4EXKA 2O69A 2UVGA 2B3BA 1AL3A 4G8HA 1Q1KA 1S9TA 3M3FA 3T9UA 4PQJA 4QFPA 3CRBA 1LAXA 4H6DA 2VGQA 1URGA 2XX7A 4KHZE 3M8UA 3RGYA 1XOCA 2QMXA 4RXLA 4FORA 4R2FA 2NOOA 2ZNTA 3PV0E 3KFMA 2OZZA 3CFZA 4RPNA 2GHAA 5H8HB 1Z7ME 2PVUA 4ECFA 1POTA 3WAEA 4LUBA 3RT6B 4G68A 5FTHA 1SW1A 2Q88A 4BLAA 2ZYNA 2DE4A 3DP8A 3IAZA 1LFIA 1XHYA 3FVOA 2R9JA 3OD7A 2Q2CA 3RTFB 3OSRA 3P7IA 3K02A 3E13X 1VFDA 1JETA 4ZEKA 1GR2A 2RC9A 4YICA 4O3BA 4OXVA 2OJTA 1MXXA 4KPTA 4XKPA 3TODA 4H67A 5CMKA 5JK4A 5CMMA 1A40A 4IB2A 2DVCA 3TCGA 4FEBA 5DTBA 3N26A 3FJMA 5TP9B 2XXVA 1IZ1A 3O6IA 4I1DA 1MRPA 1UIUA 1EZ9A 1LAHE 3MC2A 1B3EA 5AA2A 3UORA 2XXTA 4ND9A 4R2BA 1T0KA 1I6QA 1MM6A 3GBBA 3SKPA 4PFWA 2HXWA 1B32A 2DQVA 3MW0A 5KCJB 4KR5A 4FAJA 3ZKLA 2KLFA 3RPWA 1BKAA 3KZGA 4OVJA 1FQBA 1N3XA 1A8EA 4YZZA 2E0SA 2DWAA 2REJA 4GRKA 4WEPA 1Y1MA 4TQUQ 1LBCA 1MXYA 2Y7KA 3JZJA 1FCKA 1NH8A 4BDMA 4UA8A 4DCYA 1MQHA 4ELPA 4ONYA 3HHFA 4ISUA 2DWIA 3K6XA 4X9TA 1A8FA 4F19A 3S4UA 4NF6A 2AL4A 3C4MA 3WAFA 2Y7IA 3HHGA 2ZNUA 1O7TA 1MQIA 1UTBB 4DDDA 2UVIA 1ZMGA 3E4RA 3K0VA 3FXRA 1BIYA 2F8DA 5FTIA 4N07A 3IJOB 3EHSA 1DOTA 4XXUA 4PE5B 2I4CA 4NF5B 3HN0A 2QSXA 2VD2A 4U4SA 4X1DA 1B7HA 4X1BA 1BP5A 1QULA 3L6HA 4QFLA 2VD3A 3IOVA 3T22A 5CBRA 1N0TA 5I2NA 3MZ1A 1MXUA 3T93B 1B3HA 1JNFA 4KI0E 4NWDA 2UVJA 3EQ1A 4RJZA 5CRYA 1PBPA 5I59B 3OEKA 2GRVA 3TELA 4R6HA 1WDNA 1VR5A 3C34A 2Z22A 4Z0IA 3KSJA 1H3DA 1O64A 3KEIA 3U94A 2DSFA 2PMSA 1MPDA 3O6GA 5AA2D 4ESXA 1F9BA 3SETA 2XXYA 1B0LA 4U21A 2XXWA 4QFOA 5H8HA 2XXXA 3BFTA 3UK4A 3PD9A 5HPQA 4C1UA 2CMOA 1B5IA 4H5GA 2ONRA 4IO2A 3FXQA 5B7DA 5CMCA 3ZS6A 3TMGA 2GH9A 1QKAA 2F7AA 2NWJA 3K1PA 4G2ZA 5H8NB 1NMUA 4OTEA 3C32A 1B1XA 1LAFE 3VLWA 2Y7WA 5TU0A 3MP8A 3RNNA 1FTMA 2RC7A 2OLBA 1YCJA 4XTCQ 1SI1A 1NFTA 3E9XA 4KFQA 2QS1A 3PUVE 3S9LC 2F78A 4I62A 1Q35A 4N13A 4BDRA 4LZ8A 5TP9A 5ITPA 2ZYMA 4IO7A 3R6UA 2B65A 1JQFA 3MBPA 4TLLB 3KOTA 2HCAA 3N6TA 2WKYA 1MH3A 3KN3A 4IO4A 4QHQA 1JEVA 4Q0CA 2RCAA 2O7UA 2I0CA 4LVQA 4PFUA 4KCDA 4JSDA 3MAMA 4YB5A 4ELRA 1USYH 2UVHA 5ICQA 2XD3A 3C35A 5I56B 5ISUA 3OO6A 1LSTA 1JEUA 3MP6A 4POXA 3MPKA 3PPQA 3ZSFA 1MH4A 1US4A 3CG1A 3ILUB 2O84X 2Q89A 2M8CA 4OQOA 2Q8JA 3OO8A 1UTBA 4RK2A 3N5LA 3R26A 1MG1A 3LR1A 3K1MA 3V83A 1DMBA 2FYIA 4NF5A 3EHUA 1VSOA 3CFLA 1ZBMA 2HZKA 3RN8A 1M5EA 4QRZA 2PBWA 1QUJA 4LQ2A 1RKMA 4RK9A 3VLVA 4LZ5A 4DE8A 4QFNA 2RC8A 3OEMA 3PUXE 2DWJA 3SEYA 5H8SA 3ECRA 5FHOA 5B70A 5DVIA 3A3CA 3PUZE 5DVFA 4O3CA 1LFHA 2GFEA 2R71A 5I58A 4GVOA 1B6HA 5A5XB 1N76A 4JWXA 3IOWA 1POY1 3K6VA 3PMWA 2G93A 3OMBA 2OK2A 3PUYE 1BLFA 2QRYA 3DP6A 4N6PA 3BBRA 5I2KB 1GV8A 3I6VA 3IX1A 3TTMA 4OERA 4F22A 4K3FA 3V8XB 1XVXA 3USDA 1FW0A 4R74A 4IGRA 2ONSA 5F7VA 3SEVA 3PMVA 3LSFB 3G3HA 3CG3A 4G8MA 3OO9A 3VVEA 1P99A 3FJ7A 3CR9A 3FASA 3BFUA 2OWTA 5H8NA 5I57B 3U92A 4F2OA 3QUJA 3IO6A 4ZEFA 2AYSA 3OO7A 5JTYB 3A3UA 2P1SA 2YPNA 3CVGA 3K6UA 3H6VA 3K4UA 3KSXA 1N84A 1IEJA 5ELVA 3PPNA 1S50A 1TFDA 2F7CA 5CMBA 5CM6A 1OVTA 3K6WA 2F6GA 4PETA 1MXWA 4TLMB 3G3FA 1OLAA 1IITA 2IA4A 4NMYA 3PGFA 1XVYA 1YTVA 1VE4A 3B7DA 4PFTA 3M3LA 3RY3A 3IB2A 4U1ZA 3TTLA 2A5TB 4ZEIA 5DEXA 1LLSA 3VE1B 4E0XA 4EQ7A 4F3GA 5IKBA 4EF1A 1A99A 4IY5A 2QJEA 1B0HA 4L17A 2QS3A 3MUQA 1AMFA 5L9OA 3KBRA 1P1OA 1LCTA 3EHTA 4OENA 5J1DA 1YPNA 4G68C 4NWCA 4DZ1A 5F1QA 1TXFA 1ATGA 1I6AA 4JWYA 5I56A 3TEPA 1IQ7A 3OENA 4JWOA 3TPAA 4KQPA 2VHAA 4RNSA 2V93A 3JV9A 4HCYA 1XC1A 4EQ9A 4MLQA 1RYOA 2V3TA 1P1WA 1Z7NE 3PPRA 4THIA 1MQJA 1EH3A 4UACA 3QK6A 3I3VA 1TFAA 1WODA 4BDLA 2PX1A 2O51A 3FVKA 4R72A 3W9VA 3QIMA 1PB9A 3IOUA 1JVXA 3MVXA 3IB0A 4M1VA 1MS7A 2I3WA 1ZJLA 3SEXA 4OYVA 2I6EA 1M5CA 3HCQA 3H6TA 2YJPA 3HV1A 2F35A 4WKMA 2PT1A 2NXOA 2V84A 2I3VA 2PT2A 3TUSA 4KCCA 1R9QA 3G3IA 5A5XA 2NVUB 4R6KA 4F3PA 1J1NA 1MPCA 2RCBA 4WEDA 4I9DA 3FUZA 1D9YA 4KYEA 3SERA 3CFXA 3TAJA 4NF8B 3O6HA 4OETA 4R6YA 3H6UA 4I8CA 3U93A 1N7XA 5I2KA 4MF3A 4GL8A 1MDP1 1KWHA 2IEEA 1DTGA 2DOJA 2O1MA 1N7WA 3PU5A 3O9PA 1MY1A 1ZKBA 1M5FA 1DPEA 4IO3A 5IAIA 3PUWE 1IUDA 3G7WA 1LFGA 2XX9A 2P2AA 1P1NA 4ZEDA 5I57A 5I84A 1NL5A 1OVBA 2HFBA 2XXQA 4EDPA 2DE2A 1OMPA 2I48A 2QS4A 1IIWA 5KZTA 4FIMA 4GLIA 3QYTA 2DVZA 5AA4B 4OFJA 4Z7EA 2RKMA 3RLFE 4XKNA 1WVJA 3O97A 4AQ4A 2Q2AA 5K2YA 3JYRA 4BDOA 2G29A 1L5TA 3UGWA 1FQEA 4LA9A 3N94A 1FQAA 3LSWA 3PD8A 3DM0A 1ZLQA 4H0WA 2THIA 2XXPA 4H5FA 1LGBC 1EU8A 1MQDA 1MY2A 3UP9A 4IO5A 4QSEA 3IB1A 4O3AA 2A5TA 1SD3A 4EXLA 1EZPA 3THIA 4AB6A 4LONB 1MDQA 3B6TA 4ZZEA 4GD5A 1B05A 1NNKA 3VXCA 4LZ7A 1LCFA 1H43A 4F1YA 1FTJA 3V5AA 1NNPA 5H8QB 4GIZA 4OHNA 3VFJA 3IR1A 3A09A 4P11A 2CZLA 3Q26A 2Z8FA 3GXAA 3KN8A 1B1HA 3G3KA 3S9NC 5JEIA 2Y84A 1UQWA 1DTZA 2UXAA 5KCJA 1NKXA 1OQHA 4F3SA 1B2HA 3VVDA 1FTOA 4F1UA 4HW8A 3G3GA 4FE8A 3BKIB 3B6QA 4LQ5A 1MQGA 4F18A 2XXRA 3EPEA 1MY3A 3LSLA 4F31B 3TTRA 2I0BA 1NNTA 2X7PA 3DP4A 4Q5TA 3TDJA 4DLDA 1XT8A 4RPOA 2X7QA 3FVGA 1A54A 2B3FA 1R1NA 3GLBA 1SYHA 3I5OA 5DT6A 2HZLA 3UA8A 2Z8DA 3MVYA 1II5A 4GOTA 4HCWA 2VOZA 5AA2B 4PP0A 4IY6A 3H7MA 1OLCA 2Y7RA 4KYDA 3O28A 3Q29A 3HSTA 1A7LA 2DWHA 3KGCA 1XS5A 4MBPA 1CE2A 4MH5A 1AOVA 1B7ZA 2R6GE 4H8IA 5KDTB 5FHMA 1QUIA 2F5XA 1BTJA 3MP1A 3CSBA 3H06B 1LBBA 5CC2A 1MPBA 1PEBA 1B7UA 2H5YA 3OSQA 3OELA 4IGTA 1MXVA 2O1LA 3SEUA 3T9VA 1N3WA 4H65A 4ESWA 4ELQA 4QFKA 5BWJA 2V3UA 4NE4A 4AB5A 2QS2A 1M5DA 4R9FA 4YKKA 1IXIA 3FXUA 4OESA 5I59A 2NUVA 1B5JA 1B46A 4NF6B 1D3KA 3O2AA 2ANJA 3T66A 1PBQA 1LB8A 4M4GA 3HPIA 4DXCA 4OMBA 2Z8EA 4XKRA 3CSGA 3KJ7A 4PFYA 3MZ9A 4GFRA 1IXCA 4RYAA 3IO4A 3U72A 4WXJA 1DSNA 4C0RA 2XHDA 1MM7A 4F3BA 1VFEA 5L9SA 3T9XB 1QJMA 4HS7A 2UYFA 1JW1A 2Z23A 3H03A 3OXNA 4GL0A 4X48A 4TOZA 1ZU0A 5AA1A 2XD2A 1SYIA 3MVZA 4JDFA 2O6AA 3RQTA 1A55A 1H76A 1B9JA 3UIFA 2H99A 2BJJX 3KG2A 3QAXA 1USYE 1B3GA 2DXYA 3QXMA 3LUYA 3FGSA 2YLNA 2QPQA 5L9MA 4XKQA 1IXGA 1SBPA 2XXUA 3O66A 3FV2A 4BDNA 5M2VA 1H44A 1SDXA 1PC3A 2FA7A 5H8QA 3W9WA 3VDFA 4YKIA 2DP8A 4JB7A 1GVCA 2I49A 2Q9TA 3R7XA 3PPPA 4KD5A 4ELOA 1Y4CA 4LP2B 4IO6A 1URSA 3TTNA 4Q8RA 3HO7A 3E3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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