5AA2D

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
416
structure length
416
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGRDDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 131
structure length 416
sequence length 416
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
D PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2D01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2D02
4OMBA 3MVZA 2QL3A 3MQ9A 3DELB 1PBQA 1LBCA 4FORA 4OFJA 3TCGA 4G77A 4AQ4A 3M3FA 2RCBA 2A5SA 5TU0A 3FIRA 5IKBA 5FHNA 1H76A 5CMCA 1D3KA 4HS7A 2Z8EA 1MH4A 1NNFA 1MQGA 2ZMBA 4YKIA 3O29A 1SDXA 1P1OA 3OO7A 1JEUA 1P1UA 3K6VA 5HM4B 3B7DA 2O84X 2F35A 2Q2AA 1MDP1 1LFGA 3PMXA 1S7YA 5DYHA 2HFBA 1LB8A 1TT1A 4EQBA 3USDA 3QXMA 1LAXA 5EHMA 3G7WA 1GTKA 2F34A 3IB0A 4NF4A 3LSLA 4U22A 1LAFE 1MPBA 3ONMA 1B3HA 3UGWA 4KYDA 4Q8RA 1RYXA 4HTGA 2VOZA 3E13X 3W9WA 3K1NA 2G29A 4RNSA 4M4GA 4JBZA 4XIGQ 2R71A 3ECRA 4ZEBA 5I56B 5FTIA 4GXAA 4YKJA 1B9JA 4L17A 3LSWA 4DIGA 3SERA 3CI8A 1P1QA 4AB5A 4Q5TA 2F7AA 5CC2A 4RK2A 1ZMGA 1B1HA 5I2NA 3K0VA 4LZ8A 2QS3A 4DLDA 2G93A 3E9XA 3T9XB 2VD3A 1RKMA 4OXVA 3V83A 4IO6A 4KCDA 4LZ5A 2KLFA 1SD3A 2QS1A 3IK6B 3T96B 3TAJA 3QK6A 1MQJA 2ZYKA 2REGA 2PT2A 1POY1 1NFTA 5BUUA 2GFEA 3PUZE 5AA4B 4THIA 3KJTA 4O3CA 4OVJA 4JWOA 4IY6A 4ZEIA 4KHZE 1GVCA 2Z8DA 5H8NB 4Z0IA 3G3GA 2HAVA 2ZNSA 3U92A 2UYEA 5I84A 1LCTA 3K6UA 1FTMA 4ZE9A 2AL5A 4FATA 1F9BA 1BP5A 2PBWA 3ILUB 1A55A 2D3IA 5ITOA 2RC8A 5H8QB 5K2YA 1UIUA 2ABHA 1OLAA 4QFLA 2FYIA 2E0SA 3V89B 1HSJA 1N7XA 3PD9A 1LSTA 1FTLA 1UIVA 3IL1B 4XKNA 4XKQA 3LBSA 4ND9A 3CFZA 2VD2A 4F18A 3HPIA 4QFKA 4F2OA 3O9PA 1SYIA 3I6VA 4XKPA 3A3UA 2XXTA 2I6EA 4F22A 1XOCA 1H3DA 3MVYA 4AB6A 1FTKA 2ANJA 1L5TA 2V25A 2REJA 3DP6A 3QUFA 4Q30B 4F2QA 4IGRA 1LFIA 1UQWA 4IB2A 1LAHE 1ZJLA 1CE2A 3RTWB 5CI5A 5I56A 4H67A 3V5AA 3TTRA 5CM6A 1JW5A 3RT6B 2Q88A 5CMMA 4BDQA 4GFRA 3SEYA 1AIVA 1SW2A 4GLIA 3K6XA 4I1DA 3EQ1A 5DEXA 2DQVA 5K2XA 1MH3A 3Q28A 5ISUA 3C32A 3FUZA 3SEXA 1DPEA 4PQJA 3D4GA 2UXAA 4OEUA 1SBPA 3EF7A 1UTBB 2XX8A 3K2DA 3THIA 4TOZA 3TQWA 5L9MA 3CRBA 4JSDA 2Z23A 3VVDA 1B0LA 4FECA 4F3PA 4X9TA 2IEEA 5FHOA 1N3WA 4LA9A 2H9BA 1B3GA 1LAGE 3DP4A 5BWJA 4KQPA 3W15C 4F3GA 5AA4A 4EDPA 1MY1A 3TUSA 3FJGA 3KG2A 1I69A 4IO7A 4MFIA 5AA2D 1A8FA 4JDFA 1BTJA 4E0WA 2I3WA 4DXUA 1URDA 1Y3QA 4BDLA 4POXA 4DDDA 3CFXA 4FEDA 5DT6A 5F1QA 2V3UA 3PUWE 3ODBA 4JB7A 3TCHA 3MPKA 3A3CA 5AA2A 5KDTB 2B3BA 4MLVA 3QYTA 3KOTA 2DSFA 5H8QA 3G3KA 4ELRA 5KZTA 3KN3A 4R2BA 2OLBA 3O6HA 3TTLA 2DXRA 5LOMA 4C0RA 1Y20A 2I58A 4NF5A 5CBSA 2DE3A 2UVHA 1A7LA 4I8CA 2UYFA 3UORA 4GQOA 4RPOA 2HZLA 2HXWA 3BFUA 1CB6A 3VXBA 1B05A 1PDAA 1MXVA 4YU0A 3TEPA 2M8CA 3JYRA 4X48A 5H8HB 1JEVA 3CFLA 1ZU0A 3IO4A 1VFEA 5HBCA 2ESNA 1ZLQA 3S9EA 2A5TA 2I4CA 3EHUA 4RY1A 4DCXA 1M5FA 4ZZEA 3S9MC 4TLLB 1NNKA 1DPPA 4JXIA 1H43A 2DE2A 4N13A 4OERA 3G3JA 4WKMA 1XVYA 4LQ5A 1MXUA 4ZZAA 3EN3A 3FXQA 1Y3PA 1IEJA 1UTBA 1QVSA 3L6HA 1FW0A 1JQFA 3ZKLA 3O6GA 3C9HA 2CMOA 1FQEA 1R9QA 1M5DA 3E4RA 5TP9B 4KD5A 3TMGA 1DMBA 1T0KA 3TKDA 3MZ9A 1Y4TA 2OCUA 4GVOA 1AL3A 4GWOA 3DLNA 2ZYNA 3MP8A 4KR5A 5L9SA 3RQTA 3TQLA 3KEIA 3MAMA 5L9OA 2DS9A 4YB6A 4E0XA 1JVYA 2NXOA 2H98A 4IO3A 3B6QA 2HZKA 1IQ7A 5KDTA 4H65A 4XXUA 3UK4A 4OESA 4H6DA 1M5BA 1B3EA 2NVUB 3I3VA 1JETA 5TPAB 2B65A 4OHNA 3RNNA 3UP9A 5ITPA 3KSXA 4ELPA 2XXHA 3N6TA 5M2VA 3H4ZA 4H5FA 1MPCA 1URGA 1FQDA 4GL0A 4Z7EA 1B2HA 3FVKA 4NF6B 5I57B 4PFYA 4G2ZA 4R6HA 2P2AA 1HSEA 3PMWA 3G3HA 4P0GA 5FHMA 3SEWA 1US4A 1P99A 4QFPA 3FVGA 1SYHA 2DOJA 4KFQA 2F78A 3M8UA 1B7HA 1YPNA 2R6GE 3N26A 4WEDA 2F7CA 1QKBA 3K01A 4IO2A 3QUJA 4F1VA 1MY4A 3UIFA 2HEUA 4NEDA 3M3LA 1Y1ZA 4R9FA 1PB9A 1JW4A 2ZYMA 1AMFA 2QS4A 3KFMA 3FGSA 4U21A 1PB7A 3MP6A 4PETA 2RC9A 3PGFA 2GH9A 2LAOA 2AL4A 1ELJA 2DYXA 1SW4A 2X7PA 3OEKA 4YB7A 4ZECA 3M3KA 3H7MA 4H8JA 2Z22A 3RT8A 5JEIA 3T66A 2XD2A 2QJEA 5ICTA 4FEBA 1EH3A 3VDFA 3MWBA 2F6GA 4QSEA 4JWXA 3WAEA 4F1YA 3R26A 5TP9A 4GOTA 3PV0E 1N0TA 3LC8A 3TTNA 3Q29A 2Z8FA 3PPNA 3EHSA 2OK2A 4U4SA 3C33A 2Y84A 1MRPA 5I58B 3CG1A 2XX9A 4G4PA 1ATGA 3V8XB 1QW0A 4LZ7A 3HV1A 5H8FB 2X26A 2YLNA 3OSRA 1TXFA 3FASA 4DCYA 1VSOA 2DVCA 3IAZA 4K3FA 3K1PA 4LP2B 3RTFB 5JTYB 1B46A 1N04A 1MXYA 3IOTA 3IORA 5ELVA 1FQBA 1R1NA 5EHSA 4DXBA 1EZPA 3Q25A 2FNCA 4BDRA 2DWIA 4OQOA 3GLBA 3W9VA 1IXIA 2ZNUA 3FVOA 3MZ1A 3LSXA 4NWDA 2ONSA 4OENA 3UA8A 1MM6A 2O7UA 3L6GA 4LUBA 3VVEA 4UA8A 4NTLA 2ZXTA 3TFLA 1VFDA 1JW1A 3CVGA 2RC7A 4RXLA 4NF6A 4I62A 2FA7A 3OELA 4OETA 3FATA 5I57A 3KGCA 1QUKA 4G68B 4F3SA 4MBPA 5AA3A 1A40A 1O63A 3LR1A 4KI0E 4OWDA 2V3QA 2XHDA 3VE1B 4WXJA 3TYHA 2QSXA 3C36A 3H6UA 5DVFA 4MLQA 5I59B 2GHAA 4HW8A 2XXPA 3VLWA 4EQ7A 3C34A 1I6QA 4RPNA 4EQ9A 3KN7A 3SESA 1ZTYA 3IJXB 1DTZA 2DE4A 3DM0A 4R75A 4LATA 3K4UA 1B52A 2HQ0A 1SW5A 2O68A 3H03A 3HSTA 3TPAA 3BKIB 5CMBA 3PPOA 1B4HA 4OFLA 4QFOA 2QMWA 1GV8A 4POWA 3IJOB 4EXKA 2O6AA 1A54A 2YPNA 1B0HA 4R73A 1QUIA 4LVQA 4F3BA 4LQ2A 4IO5A 4GD5A 2UVGA 3C4MA 2XXQA 4LONB 3DP8A 3O97A 1N84A 1GR2A 4YAHX 3N6UA 1SQYA 3N5LA 3RPWA 3Q26A 2D21A 4GF8A 3PUVE 3H6VA 2DWJA 3MP1A 4OYVA 2ONRA 4H1XA 3BBRA 1PEBA 1N3XA 1M5CA 3TDJA 1B1XA 4PE5B 5DVJA 4BDNA 5A5XB 4G8NA 2DXYA 2CZLA 4O3BA 1EU8A 2VHAA 5H8NA 3S4UA 1VR5A 3CSBA 4TQUQ 3KZGA 1IXHA 3FXUA 5H8FA 4DXCA 3H3GA 1OVTA 1ANFA 4F39A 4PFTA 5JTYA 5KCJB 2XXUA 2AIXA 4BLAA 5AA1A 3RN8A 3U8QA 2Y7KA 1SI0A 2V93A 1O7TA 5I2KB 3FZVA 4HCWA 1USYH 1XHYA 1QULA 2GHBA 1ZIUA 2DVZA 1PBPA 3O2AA 4QFNA 3A09A 2O1LA 2H4IA 1Z7ME 4X1BA 4G68A 1MM7A 4R2FA 4H5GA 4H0WA 1QKAA 4JWYA 4R72A 1BLFA 3PMVA 4F29A 1MXZA 3U1OA 5HPQA 3TTMA 1FCKA 3O6IA 3UN6A 5I59A 5IAIA 2Q2CA 1SW1A 2PMSA 4U23A 2WKYA 1OQHA 3FVNA 3P7IA 1URSA 2V84A 5CMKA 1DOTA 4G8MA 1MQDA 4F1UA 4TLMB 4IO4A 3CIJA 4ELQA 2Q89A 4G68C 3B6TA 3Q27A 1H45A 4M1VA 1DSNA 4OTEA 1MY2A 3IR1A 1MG1A 1Y4CA 1NL5A 1MQIA 2I49A 3K00A 3OXNA 3TELA 2HAUA 4RA1A 1B3FA 1B7ZA 1N7WA 1JVXA 1D9YA 2HCAA 1XC1A 3KN8A 1TWYA 1KWHA 1MY3A 2PT1A 1B5JA 2Y7RA 1DTGA 4EUOA 4BDMA 4ESWA 3OEMA 2RKMA 3G3FA 3S9NC 4FJPA 2RF1A 1SI1A 1EZ9A 1YAEA 1LCFA 1I6BA 4ISUA 1NH8A 5A5XA 1A99A 1JNFA 1B32A 4WEPA 5CRYA 4NWCA 1MS7A 3BFTA 4H8IA 3PPPA 1FQAA 4YZZA 1QUJA 3TODA 4X1DA 4ZEDA 1J1NA 1IXGA 3EPEA 1NNPA 1R6ZA 4IGTA 3C35A 3S9LC 5KCJA 4EF1A 1I6AA 3H6TA 3T9UA 4PFUA 3PU5A 2OWTA 3D4CA 3ZKKA 1NNTA 3T22A 2F8DA 4QHQA 4YKKA 3RY3A 5I2KA 3TCFA 3S2VA 4YMBA 1Y3NA 5JK4A 2NWJA 3KJ7A 1YCJA 2I48A 1B58A 3IOWA 3T9VA 3CG3A 4R6KA 4NF8B 2QRYA 1RYOA 3MZBA 3MJNA 1MDQA 4QRZA 1BKAA 4EXLA 3OO8A 3PD8A 2I4BA 2AYSA 2X7QA 3GBAA 5H8HA 3OMBA 1GGGA 3FD3A 2DP8A 4U2RA 1EZOA 3MBPA 5DVIA 4IY5A 1MPDA 3QAXA 1MQHA 3PPRA 3E3KA 2QPQA 3U94A 2XXXA 1SVXB 1B51A 3VV5A 1Y1MA 2XX7A 2XXRA 4JSOA 2I3VA 1B4ZA 1FTOA 3JV9A 3HHFA 1S9TA 2Q9TA 4MH5A 3SETA 4FE8A 3MVWA 2R9JA 1BIYA 3GXAA 5DEXB 2THIA 1B3LA 3IB2A 3CR9A 1YTVA 4ZEKA 3SDFA 4GL8A 1OVBA 3QSLA 4G8HA 4ECFA 5DTBA 1LBBA 4FAJA 3KSJA 5F7VA 4C1TA 1B5IA 1Q1KA 2NOOA 1WODA 3RLFE 2O7IA 2P1SA 2YJPA 3IX1A 4U1ZA 2F5XA 4OEVA 2XXYA 1B40A 2XXVA 3T93B 2W7YA 3EHTA 4ELOA 3VXCA 2IA4A 2OJTA 3HN0A 2E1SA 4F19A 4KPTA 1XVXA 3FJMA 5ICQA 1S50A 1P1WA 1QJMA 5EYFA 3MPLA 2GRVA 2OBGA 1UTHB 1OIBA 3VVFA 1LLSA 4R6YA 4R9GA 3SEVA 4NMYA 3OENA 2OWSA 1XT8A 2DWHA 1MXWA 2F36A 1TFDA 4FIMA 5TPAA 2I0CA 2PX1A 2ZYOA 5AA2B 3PPQA 4QSCA 4GXSB 2O51A 2H25A 4RYAA 3B6WA 4NF8A 4YMAA 1B5HA 4ZDMA 4NF5B 3VLUA 2RINA 3H6WA 3PUXE 4F31B 4GIZA 1IZ1A 1Y9UA 2VP1A 5CBRA 4U4XA 3LUYA 2Y7WA 1O64A 1OMPA 2PYYA 4PP0A 2XXWA 4EF2A 1ZKBA 1LFHA 4RJZA 3U93A 3C31A 4YKPA 3FXRA 4KYEA 1NMUA 3G3IA 3RUMA 4ZE8A 4ZS9A 4XTCQ 5B70A 2A5TB 3HCQA 1AH5A 1H44A 4DE8A 3IOUA 4ONYA 1II5A 1WDNA 4KYSA 3PUYE 2O69A 1OQGA 3O28A 5FTHA 2BJJX 2Q8JA 3ZSFA 1B7UA 1IIWA 3CSGA 3MUQA 3VLVA 3HHGA 2F6PA 2VGQA 3QIMA 2ALUA 4GRKA 1MY0A 3WAFA 2UVIA 3AXFA 3IB1A 3R6UA 3HO7A 2NUVA 1PB8A 3OD7A 4YB5A 1M5EA 2QS2A 1HSLA 4OZ9A 3GZGA 3K1MA 2PVUA 3H06B 4RK9A 5I58A 5B7DA 4I9DA 1NH7A 3I5OA 1IUDA 2OZZA 3RGYA 1LB9A 2I0BA 2H99A 1FQFA 3FJ7A 3FV1A 4O3AA 4P11A 1UTHA 4ESXA 1US5A 3LSFB 4N6PA 1Z7NE 1FTJA 1OLCA 1NKXA 3MC2A 1PC3A 2F97A 1VE4A 3MVXA 3ILTB 2P0SA 4Q0CA 4BDOA 1R9LA 1B6HA 3N94A 3SEUA 3OO9A 2V3TA 3ZS6A 4UACA 3FV2A 3JZJA 2D5WA 3SKPA 4NF4B 3U72A 4PFWA 3VFJA 4XKRA 4OFOA 4R74A 2ONKE 2B3FA 4KCCA 1A8EA 1P1NA 4C1UA 1N76A 1AOVA 3TTKA 4NE4A 1D9VA 1FQCA 2H5YA 3K6WA 4QF9A 1LGBC 3TZAA 4QSDA 3OSQA 2F7BA 2ZNTA 4P0IA 4ZEFA 1TFAA 2RCAA 1MXXA 2QMXA 4DZ1A 5I2NB 3IOVA 1POTA 2XD3A 5L8DA 3MW0A 3IO6A 1Q35A 4U1OA 1XS5A 4MF3A 5J1DA 5H8SA 1IITA 2Y7IA 2Y7PA 4N07A 2O1MA 5AE4A 1USYE 3O66A 4YICA 3OOAA 1D4NA 2DWAA 1WVJA 3R7XA 1IXCA 3F11A 2UVJA 3K02A 1ZBMA 3OO6A 3T9HB 3KBRA 3KOSA 2XXIA 3GBBA 4HCYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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