5AA3A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in the presence of tetrasaccharide and tetrapeptide
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 138
structure length 417
sequence length 417
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa3A02
3CIJA 5ITPA 2R6GE 4EUOA 2F8DA 5EHMA 2NUVA 1P99A 1RYXA 4AQ4A 3FV1A 1FTOA 5L9MA 3VXBA 2X7PA 3E4RA 1WDNA 4QFLA 4TOZA 1DPPA 3DM0A 1Y4TA 3KN7A 3HCQA 2GHAA 1R9QA 2Q2AA 1B7ZA 4C1TA 3HO7A 1ATGA 2E1SA 3HHGA 1ZBMA 4MLQA 3D4GA 3HPIA 3IR1A 1LGBC 4GOTA 2AL4A 4XKPA 5HBCA 2UVIA 4NF6A 3LUYA 4KI0E 4MBPA 3VFJA 2PX1A 3K00A 2V3TA 1B0HA 4M4GA 1A8EA 3KEIA 1QVSA 5I84A 4JWXA 4I8CA 3QIMA 4WKMA 3O6IA 1P1NA 3QUJA 4FIMA 1BLFA 4ZZEA 3MP6A 1NNFA 1UTHA 4MH5A 1FQDA 5CMKA 2GH9A 4RY1A 4BDQA 3K1NA 2UVGA 4EDPA 2OWTA 2G93A 1A55A 1B3FA 2QS2A 1RYOA 1B58A 4GVOA 4DXCA 3LC8A 5CI5A 1MQJA 3I5OA 4DE8A 1XVYA 2F78A 1MY0A 3H03A 4MFIA 3U93A 5H8NB 4HCYA 4BDRA 4H8JA 1P1OA 4K3FA 4FAJA 2H98A 5AA4B 5JTYB 2Z8DA 3IAZA 4KFQA 4UA8A 5A5XB 1POTA 3OO6A 4NF6B 1XS5A 4U4XA 2VGQA 3MBPA 3M3LA 2I0CA 4RA1A 1LAHE 5H8QA 4LZ8A 4YZZA 3DP8A 2GFEA 3IB0A 4Z0IA 4FEBA 4XIGQ 2H99A 4QF9A 4DXUA 3MW0A 5DVJA 2OJTA 4ESWA 1ELJA 3BFTA 1S7YA 4ESXA 3MQ9A 5I2KB 4LZ5A 3K0VA 1ZMGA 2FYIA 1FQEA 3KOTA 2RKMA 2VD3A 4JBZA 4NF5B 1NNPA 4YU0A 3R26A 2XXXA 1UTBA 3DLNA 3OO9A 2ABHA 2HFBA 3W15C 4LONB 3VLVA 2O1LA 3QSLA 1SBPA 1AMFA 3HSTA 2X7QA 2YJPA 5H8FA 5L9SA 4PP0A 5AA2A 5DT6A 5I56A 2H5YA 3MP8A 3O9PA 1FCKA 2M8CA 4NWCA 5TPAA 4GIZA 4F2QA 1LFIA 3C32A 4U4SA 4G8MA 4ELOA 5LOMA 4HW8A 1OIBA 2UVJA 4JB7A 3B6WA 4BDOA 2HQ0A 3SEWA 3ZKLA 2HZKA 1B3HA 4NF8B 4THIA 2V25A 1IXHA 1OMPA 3FVOA 4TLLB 1MQGA 1AIVA 2HZLA 2HCAA 3IX1A 1DOTA 1FTMA 3RNNA 1JEVA 3O28A 2Z8FA 3I6VA 4OQOA 3IK6B 4JWYA 5AA2B 3KZGA 3U72A 4IO2A 1D4NA 1MM6A 4EF2A 5B70A 4IO7A 2XXQA 3PPNA 3USDA 2XXHA 3O6GA 1N04A 4LZ7A 1NNTA 3ZKKA 4YB5A 3H06B 1ZJLA 4YKPA 3KSXA 3K6VA 4ELQA 3RT6B 3KGCA 3RQTA 2Z23A 1LSTA 1URGA 4ZS9A 3S4UA 3TQWA 1BKAA 2PT1A 5CBRA 3JYRA 2OWSA 4QRZA 2OBGA 3HHFA 1NMUA 5KDTA 2VOZA 5I2NB 4IGRA 2AYSA 3C34A 5L8DA 3A3UA 2UYFA 1FW0A 5K2YA 2I4CA 1N76A 4XKQA 2D3IA 4NWDA 2DWHA 4F22A 1IEJA 1MS7A 4QSDA 3TTMA 4EF1A 1B1XA 2ESNA 4X9TA 3OO8A 2Z8EA 2ZYKA 4MF3A 1NH7A 3QYTA 3MAMA 4G68B 3R7XA 3FIRA 3E13X 4C0RA 5I57B 3FGSA 5BWJA 1IXIA 3IJOB 2ANJA 1MH4A 4ZEIA 4JXIA 2DYXA 3RY3A 4GXSB 4UACA 2IA4A 1MDP1 4C1UA 4H6DA 1IUDA 1YPNA 1MXXA 2B3BA 4OYVA 4WEPA 2QL3A 1OLCA 3W9VA 3K6UA 2XD2A 3MC2A 3W9WA 4KCDA 1US4A 4PE5B 3FATA 5H8HB 4NE4A 4KR5A 3M8UA 3U92A 3TDJA 1B3GA 1R6ZA 3D4CA 4ZE8A 3SEXA 3G7WA 1IZ1A 3LSLA 4POWA 3V5AA 3VVFA 4RJZA 2QS3A 3PPOA 1M5DA 1B32A 1QKAA 5KZTA 3QAXA 1JW4A 4FJPA 4L17A 3OD7A 1MPBA 3DELB 1H43A 4XKRA 4JSDA 2A5TA 3C9HA 3B6TA 1LCFA 3OENA 3RLFE 4DDDA 4ONYA 3T66A 1Y3QA 4F2OA 2Q89A 4IY5A 3PMVA 3TPAA 2ONSA 3SEUA 2Q88A 1TFAA 4JWOA 3B6QA 3RGYA 1MG1A 1HSLA 3OSQA 4NF4A 2ZYNA 2OZZA 3A3CA 2DVCA 4OWDA 3V8XB 4PFUA 2DWJA 2O6AA 4F3BA 2G29A 1IXGA 5M2VA 3TODA 1NFTA 1B5HA 5ICTA 4LUBA 1SYIA 1YCJA 4Q30B 2HEUA 3H6WA 1Z7ME 2H9BA 3MZ9A 1MXZA 3RPWA 1EU8A 4EXKA 4IO6A 1Q1KA 3KOSA 4G8NA 3N6TA 3C35A 3IB1A 3PV0E 5I58B 3EPEA 5TP9A 3IOVA 5I59B 4RXLA 1B1HA 3S9NC 1QJMA 4OMBA 1MPDA 3ILTB 4U1ZA 3IOTA 3IOUA 3PD8A 1PB8A 4U23A 1PB9A 1B5IA 2I49A 1SYHA 4G4PA 4I9DA 3VVDA 2XXIA 1LBBA 3G3FA 2F5XA 4XTCQ 1I6AA 4FORA 4NF4B 4O3CA 1B52A 3N26A 3FASA 1DTZA 3IB2A 3MWBA 2IEEA 1B6HA 3SEYA 1JEUA 2V84A 3DP4A 1MXYA 5ELVA 3FXQA 1OQGA 2XXTA 2ZNSA 1CB6A 1MH3A 2RCBA 4GRKA 1M5EA 2GHBA 3H6TA 3UK4A 4R73A 3T9HB 2O1MA 3G3JA 1SW2A 4DXBA 3TTKA 3CG1A 2HAVA 3GZGA 4XKNA 3Q26A 3FD3A 4ELPA 1UIVA 1AOVA 5FHOA 4EQ7A 2F97A 4QSEA 3K4UA 2Z22A 1SD3A 1FQCA 1Y1ZA 3OEMA 2XXUA 4RK2A 3H4ZA 3EQ1A 5DVIA 1NNKA 2QRYA 4Z7EA 1B4ZA 2DOJA 3PUVE 4KCCA 5ICQA 2RF1A 4YKIA 4YMBA 3I3VA 2NXOA 2GRVA 3UIFA 4BDNA 1XT8A 1QUJA 3OMBA 4ZEBA 2Y7KA 3BBRA 5CC2A 3TUSA 1UTHB 4F1YA 1QW0A 3E3KA 3O66A 5JK4A 4IB2A 3K02A 1Y3PA 4P0GA 3PU5A 2NOOA 4N07A 1FQFA 1ZIUA 2VP1A 4LVQA 1N84A 1UIUA 4YAHX 3PPQA 4GXAA 1N7WA 2QPQA 3S9LC 5AA2D 3CVGA 1RKMA 4G2ZA 4FEDA 2VD2A 4JSOA 1URSA 4ZEKA 3T22A 4PFYA 1DMBA 3CSGA 2DWIA 3VXCA 4IO5A 4KQPA 4OENA 4HCWA 3IJXB 5H8QB 3UP9A 1B5JA 3VLWA 2NWJA 3FV2A 3MP1A 2D5WA 4I62A 4BLAA 1SW4A 2ALUA 1SI0A 2XXWA 3IO6A 1IQ7A 3LBSA 3L6GA 3UA8A 1JQFA 4DIGA 3G3IA 3BKIB 3FVKA 4F31B 2NVUB 1LB9A 1EH3A 1B7UA 1FTKA 2I4BA 5AA3A 1POY1 1IXCA 3Q28A 5K2XA 1D9VA 3ZS6A 1D9YA 3QK6A 5J1DA 1B0LA 4GL8A 4F19A 1NL5A 3LSWA 4R6HA 1UTBB 2AL5A 3ECRA 2REJA 1A40A 4RPNA 1B40A 1LAGE 3CSBA 1BIYA 2I6EA 2LAOA 5H8FB 4H0WA 3C31A 4I1DA 2D21A 5TU0A 2CZLA 3Q25A 3E9XA 3CR9A 3V83A 4R6YA 3WAFA 4AB5A 5I56B 4U21A 1LBCA 5TPAB 4R75A 1OLAA 1NKXA 3OOAA 2ZNTA 3KN3A 5DEXA 1XOCA 3TYHA 4DLDA 3O97A 1B51A 4KYDA 4F1VA 3K01A 3FVGA 2HAUA 1F9BA 1PBQA 1H44A 3V89B 3KJTA 3O29A 3B7DA 1O64A 1VE4A 1N7XA 3IOWA 1B4HA 1A7LA 1YTVA 4QHQA 3PUWE 1N3WA 4Q5TA 2HXWA 5KCJA 3H3GA 3DP6A 4DCYA 1JNFA 3PUYE 1VSOA 1FQBA 4H1XA 5HPQA 2XX9A 4P11A 1OVTA 3OO7A 2DVZA 2F6GA 4WEDA 3EF7A 1GV8A 1JVYA 1SW1A 4HS7A 4FE8A 4ZEFA 2RCAA 5CMBA 3AXFA 3TZAA 4GQOA 4GWOA 5F7VA 1A8FA 5CRYA 2XXVA 4X1BA 1WVJA 1JW5A 2O7UA 1TWYA 1USYH 1MY2A 3N6UA 4Q8RA 2WKYA 4OTEA 5AA1A 1R1NA 4DZ1A 3OSRA 1XC1A 2F6PA 4GF8A 3OEKA 3T9VA 1SQYA 1ZLQA 4EQBA 4GLIA 2I48A 4GL0A 1LLSA 2XHDA 4R74A 4ZDMA 5KDTB 1N0TA 4FATA 1AL3A 2Y7WA 2P0SA 5FHNA 1P1UA 3RUMA 3EHUA 4KPTA 2PMSA 3ODBA 3KG2A 1H45A 4QSCA 4X1DA 5CMCA 3K1PA 2O51A 4OHNA 3CG3A 1MQDA 1S50A 2P2AA 4PFTA 2OCUA 4BDLA 2I0BA 2X26A 1L5TA 3TFLA 1KWHA 3EHTA 1B05A 4OEVA 4M1VA 1MXVA 3MPLA 1D3KA 1CE2A 4JDFA 1TT1A 4N13A 2DE4A 1XVXA 1Y4CA 5H8SA 5FTIA 1MY1A 1WODA 1PB7A 1S9TA 1M5FA 2UXAA 4QFKA 2THIA 4ISUA 4LP2B 1ANFA 2ZMBA 1DPEA 1MPCA 3LSFB 2QMWA 3K1MA 3SETA 4EXLA 3FJGA 3OXNA 3THIA 4HTGA 3PGFA 1H76A 3H6UA 4H67A 1MY3A 1Z7NE 2H25A 1EZ9A 3EHSA 4PFWA 1LFGA 3CI8A 2RINA 1EZOA 2OK2A 3UGWA 2VHAA 3TCHA 3MVXA 1UQWA 2RC7A 2B65A 4KHZE 3KBRA 4AB6A 2ONKE 3LSXA 4OETA 2A5TB 4E0XA 5HM4B 1H3DA 3RT8A 1MM7A 3H6VA 2QJEA 2XX8A 2YLNA 4X48A 2F7AA 2O69A 3CFLA 3T9XB 4LQ2A 1EZPA 1QULA 4ZECA 3WAEA 1BP5A 1VFEA 4NMYA 3TQLA 2DP8A 3GBAA 3RTWB 2E0SA 2Y7IA 4OERA 5H8NA 4O3BA 2I58A 2O84X 1P1WA 2Y7RA 1ZKBA 4E0WA 4ECFA 1FTJA 1LAFE 2QS1A 5AA4A 3OELA 5JTYA 1SI1A 4ZEDA 4OEUA 4KYSA 5A5XA 5DTBA 2Q8JA 3PD9A 3C33A 5AE4A 4RNSA 3S9MC 4RYAA 2R9JA 4QFPA 3CFXA 1O63A 3A09A 1HSJA 3VLUA 3Q29A 3JV9A 5ISUA 3MUQA 5EYFA 3VVEA 1PEBA 1SW5A 2XD3A 3FVNA 2Q9TA 1PBPA 1LCTA 3UORA 5TP9B 2XXRA 3M3FA 4NEDA 1LB8A 3PUZE 5I2KA 2ZNUA 4YB6A 4Q0CA 1M5BA 1QKBA 1PDAA 3P7IA 4NF5A 4ELRA 3FXRA 4POXA 4WXJA 3KFMA 2B3FA 3TCGA 4ZZAA 1I6BA 1OQHA 3T96B 1MY4A 3MPKA 1P1QA 1Q35A 2Y7PA 3RTFB 1SVXB 4F3SA 4OFOA 4OXVA 5FHMA 3MVZA 1IITA 3Q27A 3FJ7A 1BTJA 4R9GA 3C36A 2UYEA 3FZVA 2F7BA 3TTRA 3U94A 2XXYA 4H5GA 1LAXA 4F1UA 2PVUA 4PETA 1FTLA 3CRBA 1USYE 1HSEA 1ZTYA 1B46A 2DWAA 1SDXA 4NF8A 2F35A 1MRPA 5DVFA 2F34A 1VFDA 3N5LA 3SDFA 3GBBA 2ZYMA 3L6HA 2I3WA 3TAJA 1LFHA 3MVYA 2ONRA 4XXUA 5EHSA 4YB7A 3S2VA 3G3KA 5DYHA 3S9EA 2Q2CA 1GR2A 1MQHA 2FA7A 1VR5A 4F29A 1FQAA 4U22A 5B7DA 3QXMA 2PYYA 5BUUA 4O3AA 4QFOA 3VV5A 3SKPA 3M3KA 1MXUA 5FTHA 3MZBA 1Y1MA 1A99A 5IAIA 3JZJA 1JETA 4G77A 3IORA 3SEVA 1MQIA 3TCFA 2DE2A 1MDQA 1QUIA 1B9JA 3PPPA 1I6QA 1YAEA 4MLVA 1NH8A 3O6HA 3ZSFA 4IO3A 5F1QA 2QSXA 4IGTA 1PC3A 5I2NA 5L9OA 3HN0A 2YPNA 4LATA 4R2BA 1O7TA 4F39A 4KYEA 3TTLA 3BFUA 3K6XA 2PBWA 3KN8A 1GVCA 4R9FA 3F11A 4OZ9A 2RC9A 4G68A 2DSFA 3U8QA 4U1OA 5I57A 3IO4A 1US5A 2RC8A 1OVBA 3LR1A 3EN3A 2CMOA 1B3LA 3HV1A 1QUKA 1B3EA 3VDFA 3PMWA 2V93A 1URDA 5IKBA 3TTNA 3KSJA 4QFNA 5CM6A 4TQUQ 3MVWA 5DEXB 3N94A 4TLMB 3K6WA 2DXYA 4G68C 4G8HA 4IO4A 4PQJA 3SESA 5H8HA 5ITOA 1T0KA 3TMGA 2AIXA 3K2DA 2R71A 4N6PA 1A54A 4YKJA 4DCXA 2OLBA 2Y84A 4H5FA 1R9LA 4H8IA 3TEPA 3U1OA 3ONMA 2FNCA 3MZ1A 3KJ7A 2O68A 3G3HA 1JVXA 4ZE9A 2DE3A 3GLBA 1AH5A 1Y9UA 2ZYOA 5JEIA 2H4IA 4ND9A 2QS4A 5KCJB 3VE1B 3SERA 4RK9A 2F36A 3FXUA 4LA9A 3GXAA 4P0IA 1B7HA 2BJJX 4NTLA 5CMMA 3C4MA 3T93B 2XXPA 3RN8A 4YICA 4GFRA 1GGGA 1Y20A 2V3UA 3O2AA 4OFLA 2DQVA 4BDMA 3ILUB 4F3PA 3PMXA 1DTGA 1MXWA 3MJNA 1II5A 1GTKA 1JW1A 3R6UA 4YMAA 4GD5A 4KD5A 3UN6A 4EQ9A 4OVJA 2O7IA 4YKKA 4H65A 1TXFA 1IIWA 3QUFA 2A5SA 2F7CA 5CBSA 4F3GA 4IY6A 3PUXE 2PT2A 3TELA 1Y3NA 2DXRA 3FJMA 2KLFA 3IL1B 4R6KA 1J1NA 2P1SA 2DS9A 1XHYA 5I58A 1I69A 3FUZA 2I3VA 3PPRA 5I59A 2XX7A 1ZU0A 2ZXTA 2W7YA 4OESA 4R2FA 2QMXA 4FECA 2REGA 1B2HA 4RPOA 4LQ5A 4U2RA 1TFDA 1DSNA 2UVHA 3T9UA 3G3GA 3H7MA 1N3XA 4R72A 2V3QA 4F18A 3CFZA 4OFJA 3TKDA 1M5CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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