5AA3A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in the presence of tetrasaccharide and tetrapeptide
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 138
structure length 417
sequence length 417
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa3A02
1ANFA 3VXCA 4ZDMA 4LVQA 1MXWA 1ZKBA 3K4UA 1FQCA 3H6WA 2RKMA 1UIVA 4H6DA 3UORA 3E9XA 3CFLA 3PMWA 2DWIA 4RK2A 3T9UA 3IK6B 1BP5A 2XXXA 3MVZA 4NF5B 1ZMGA 3MWBA 4GFRA 4ZEBA 3PMXA 4KD5A 3CSBA 1XVYA 4NF5A 2ANJA 3DM0A 3M3FA 3G3KA 5ITPA 3W15C 1ZIUA 3ILUB 4I8CA 1VFDA 1Y3PA 1LFIA 4OYVA 4OEUA 1OQGA 2X7QA 5KZTA 3KOTA 2F78A 5AA3A 4JWXA 4I62A 1TFDA 4KI0E 3KG2A 4QFOA 5FTIA 3C33A 1LGBC 4Z7EA 2Z8EA 4DXCA 2DE2A 5H8FB 3FJMA 3VVEA 4YB7A 4F22A 2WKYA 2QS1A 4NF4A 3IL1B 4EQBA 4F19A 2DWJA 3CRBA 4ELOA 3TKDA 3PPRA 3V8XB 5DVJA 4LZ5A 5B70A 1B3EA 3S9NC 3C9HA 5B7DA 3OSQA 4XXUA 3QYTA 1JQFA 2FA7A 3PPPA 5IAIA 2I0CA 4AB6A 5DEXB 4EQ7A 4OFJA 3K00A 3Q28A 4IO4A 1R1NA 4DCYA 2Y7RA 5HBCA 5DEXA 4K3FA 4JBZA 3FV1A 3RPWA 2PVUA 3W9VA 3G3FA 2HCAA 5EYFA 3BKIB 1MG1A 1URSA 4ZEDA 1LAGE 3THIA 4OZ9A 3VE1B 1B4ZA 2DXYA 4LZ7A 3IR1A 3EHSA 1H44A 2D5WA 4EF1A 2DVCA 2RF1A 3HN0A 3KGCA 1EZ9A 3IO6A 5H8NB 4UACA 3D4GA 2VD3A 1POY1 4GVOA 3CVGA 4LUBA 4YB5A 5H8NA 1KWHA 3JZJA 4X1BA 5AA2B 5DVFA 3QK6A 4BDNA 4IY5A 5AA2A 2ZYMA 1B2HA 4ZS9A 1UIUA 5H8HB 5I2KB 5KDTB 1QJMA 2PX1A 1B51A 2R9JA 3DP6A 3TCHA 1GR2A 3N6TA 1OLAA 1LFGA 3BFUA 4U21A 5I2KA 5KDTA 3OO6A 4N13A 4BDRA 3HV1A 3I5OA 4MF3A 5JK4A 2FNCA 3G3HA 1IUDA 3A09A 1PC3A 3OO8A 4EXLA 3G3IA 2VGQA 3S9EA 1B58A 4X48A 2I3WA 1EZPA 1JETA 1A99A 4JWYA 3TELA 3EHTA 3PUWE 5TU0A 3TEPA 1MQIA 2V3QA 4NWCA 1R9QA 1VR5A 3SEYA 3S9LC 2V84A 4ELPA 5F1QA 4E0XA 5HPQA 4KQPA 2I3VA 3C31A 5CM6A 1O63A 3FASA 1NH8A 4RPOA 1WVJA 2VHAA 2RC8A 3PUYE 3TZAA 4FIMA 1SBPA 4ELRA 3FGSA 5TP9A 2OBGA 1B6HA 1DTZA 2I0BA 3K0VA 1I6AA 1MQDA 2UVGA 1B3HA 1MQJA 2Z8DA 4TLLB 3IOVA 1SYIA 1NL5A 1IXCA 4DIGA 1Y3QA 4OMBA 3W9WA 4H5FA 1P1QA 4LONB 2UYEA 4GWOA 2PYYA 4FAJA 2V3TA 3PPNA 3PV0E 3KJTA 4QRZA 1B05A 2I6EA 3TTMA 4MFIA 1FTMA 1SI1A 1T0KA 1B1XA 3ZS6A 1XHYA 1B0HA 3EHUA 4R6KA 4TOZA 3FUZA 5ICQA 1B7UA 2QL3A 3CG3A 5LOMA 4P0GA 3HPIA 1SYHA 4G68A 2PT1A 3KEIA 1MQGA 3E13X 4JSDA 2XXHA 2DWAA 2V3UA 4BDLA 4XKNA 3T22A 3V5AA 4L17A 4TLMB 5F7VA 1II5A 2F7CA 3MW0A 3O2AA 4GQOA 4ONYA 3TTRA 3ZSFA 3ODBA 4XKPA 3MZBA 1RYOA 5A5XA 2YLNA 1Z7ME 3DELB 4P11A 3RUMA 1Y20A 1M5BA 2D3IA 5I2NB 1FQBA 2Y7KA 4RPNA 4H0WA 3RT6B 4KYSA 1B5JA 1PEBA 1LBBA 5AE4A 3N26A 3SESA 1PBQA 3I6VA 2AL5A 2QSXA 4EUOA 1M5FA 4QFKA 3R6UA 1USYE 5CMBA 3USDA 4R6HA 2GHBA 2AL4A 1MY4A 1LAHE 3H3GA 3UA8A 4U1OA 2QJEA 1GVCA 4KCDA 3TAJA 3O28A 4R9GA 2OWSA 1Y4CA 3KFMA 4OXVA 2VD2A 4QSCA 1QUIA 3UGWA 4YB6A 3PUZE 3IAZA 2Q88A 3VLWA 3OO9A 4G2ZA 4H8IA 1IXIA 5H8QB 3T66A 3MBPA 2H9BA 5I56B 4QFNA 4R2FA 3OELA 3IB0A 2LAOA 2NOOA 4NMYA 4KHZE 1LAXA 2O69A 1JW4A 5AA4B 3A3CA 3MC2A 1MXYA 5AA4A 4IO6A 1YCJA 3PPOA 1M5CA 3U92A 1SQYA 3H03A 4G8MA 3MAMA 1I69A 4FATA 1MRPA 2F6GA 4BDMA 1QW0A 3L6HA 3H6VA 2ZYOA 2DYXA 3N94A 2UVIA 4OERA 1USYH 1VE4A 4G4PA 4U4SA 2QS2A 4HCYA 4LZ8A 5CI5A 1LBCA 4QF9A 3K1NA 4ECFA 4XKRA 4U23A 1MPCA 1Y1ZA 3M8UA 1TT1A 2QPQA 2XXYA 3PUXE 4R72A 2GFEA 1QKAA 4NF6B 1B46A 3O97A 4IO7A 1OVBA 1SW5A 3TTKA 5TPAB 1QUKA 2XXWA 3K2DA 4WXJA 1UTHB 1URDA 3T9XB 5TPAA 3SEXA 2I49A 1MH4A 3GZGA 1UTHA 2ONSA 2RC9A 3SERA 1OVTA 3FJGA 3TCGA 1XC1A 3H4ZA 1Y3NA 1Y4TA 4QFLA 3TQWA 3TMGA 2GHAA 1FCKA 3R26A 4F2OA 2DQVA 4BLAA 3CR9A 4IO3A 1MXUA 1ZU0A 1HSJA 4MH5A 1B3GA 3WAFA 5KCJB 4F18A 2DE3A 4BDOA 5H8FA 1ZBMA 5KCJA 4HCWA 4LA9A 2CMOA 3O66A 3LSLA 1B40A 4OWDA 1P1OA 3DLNA 3VVDA 4LQ2A 1QUJA 4F39A 3H6TA 4ZE9A 3KZGA 2Q8JA 1DOTA 1B1HA 1O64A 4IB2A 3HSTA 1B3LA 3FXUA 5AA2D 2F6PA 4OETA 3H6UA 3CFXA 4YMAA 4XIGQ 3IOUA 1H3DA 1S7YA 2HZKA 4OFOA 3KN8A 3FV2A 1ZJLA 2W7YA 3LBSA 3UP9A 1B4HA 4DLDA 3KOSA 1JW1A 3UIFA 5BWJA 5CBRA 4THIA 3QUFA 1MS7A 5EHSA 1MDP1 3C4MA 2YJPA 1TWYA 4H65A 4QSDA 2HAVA 1N3WA 1QULA 1HSLA 1OIBA 2DP8A 5FHNA 3LR1A 3K6WA 2ONRA 4GF8A 4FJPA 4N6PA 4MLQA 4POWA 1Y9UA 2Y84A 3HO7A 1DMBA 2PMSA 5L9SA 3EF7A 2XD2A 4O3BA 4PFYA 4F1UA 5H8HA 4C0RA 1QVSA 4EQ9A 3R7XA 3U93A 1PB9A 3S4UA 4C1TA 1MDQA 2H25A 4F1YA 3FZVA 2VP1A 5CBSA 4U2RA 5JTYB 1AMFA 1DSNA 3VFJA 4R2BA 2O84X 3MVXA 3G3JA 5JTYA 2CZLA 3RY3A 2P2AA 4N07A 3IORA 3OOAA 3PU5A 5IKBA 2V25A 1B7HA 1S9TA 1DTGA 2QS4A 4U4XA 3C34A 2R6GE 3FXRA 2IEEA 3HHGA 1D9YA 4LQ5A 1DPPA 1CE2A 2F34A 2XHDA 3M3KA 1OQHA 3OD7A 4DXBA 1I6BA 2RCAA 1P1UA 2DXRA 4C1UA 2F8DA 5I84A 4PFWA 1SW4A 2O6AA 3CG1A 3Q26A 3PD8A 5M2VA 4PFTA 3SETA 1MXXA 5I57B 3OMBA 2HEUA 3T9HB 4GL8A 3IJOB 2ZMBA 1Q35A 5I57A 1US4A 3SKPA 2XX8A 1MXVA 5DTBA 1LAFE 4OVJA 4F2QA 3B6TA 3FVKA 3HCQA 4G68C 2YPNA 3F11A 2Z23A 3MVYA 4YZZA 4YKIA 1M5EA 4YAHX 3IOTA 3KN7A 5FHMA 1P1WA 3KN3A 3HHFA 4HS7A 5I58B 3LSFB 5DYHA 3MP8A 2XXRA 3SEUA 4DZ1A 1D4NA 4E0WA 4PETA 2HAUA 2B65A 3IO4A 4XTCQ 4QHQA 3RN8A 5I58A 3V89B 5ITOA 3LSXA 4GD5A 2E1SA 2ESNA 2XXUA 4YKKA 2X26A 1XS5A 3H06B 1NH7A 5L9MA 1XVXA 3FJ7A 1UTBB 1D9VA 2OZZA 1FQEA 2Q2AA 4LP2B 1L5TA 4HTGA 3MJNA 4KYEA 2A5TB 4I1DA 1BIYA 3PD9A 3RGYA 2Q89A 4ZEIA 2A5TA 4WEPA 4JDFA 3TFLA 1NKXA 3K6VA 1DPEA 1SD3A 2QMWA 1SI0A 4F31B 1URGA 4R6YA 4GIZA 4AQ4A 2AYSA 2KLFA 5I2NA 1A55A 3CIJA 4QSEA 3CI8A 2Y7WA 3U1OA 3OEMA 3TTLA 3IB1A 4UA8A 1FTKA 3B6WA 3FIRA 4GOTA 3S2VA 2RC7A 4ZEFA 4ESXA 2DVZA 2I58A 3SEWA 2DE4A 2Y7PA 3B6QA 2Y7IA 1GTKA 4ELQA 4YKPA 1NMUA 4M1VA 1RKMA 5ICTA 3G7WA 2XXPA 3LSWA 4JWOA 2E0SA 3P7IA 2DSFA 2OJTA 1GV8A 1ZTYA 2R71A 2XXTA 1SVXB 5AA1A 4RA1A 1B32A 1LCTA 1A40A 3IB2A 1GGGA 3B7DA 2HZLA 4FECA 2UVHA 5H8QA 3QXMA 3O9PA 1JVYA 2ONKE 5I56A 4I9DA 1A8EA 1XT8A 2IA4A 5K2YA 3UK4A 4R74A 2B3FA 4IY6A 4GLIA 2O1MA 4DCXA 3OSRA 2D21A 4JB7A 2ZXTA 3O6HA 1LB8A 2I4CA 1IQ7A 2THIA 1YTVA 4O3AA 4RNSA 1H76A 1ZLQA 1WODA 1N7WA 4FE8A 4DE8A 1B7ZA 3MUQA 5FTHA 3ECRA 2DS9A 4RXLA 3VDFA 4Z0IA 4IO5A 1M5DA 3C35A 3V83A 1B0LA 4RJZA 2REGA 1A54A 2NWJA 3E3KA 4R75A 4TQUQ 3VLUA 1FW0A 4ND9A 4R73A 4NF6A 3AXFA 1N84A 3TPAA 5L8DA 3RT8A 3FXQA 3K1PA 1B9JA 1D3KA 2H4IA 1Q1KA 1JEVA 3TYHA 1MPDA 3G3GA 1OLCA 1MM7A 4GXSB 2ZYKA 1AIVA 3O6IA 1I6QA 4F29A 1PDAA 3QSLA 2V93A 1N0TA 1UQWA 3TQLA 3S9MC 1MXZA 1B52A 2PT2A 4NEDA 4Q30B 2XX7A 1SDXA 4DDDA 3GLBA 2F7BA 4FORA 3EQ1A 3ZKKA 3Q25A 3RTWB 3OXNA 4NE4A 3QUJA 2HXWA 2FYIA 1IIWA 2F97A 4NF4B 3RQTA 2ZNUA 3O6GA 4NF8B 1HSEA 3MP6A 3MVWA 1A8FA 4NF8A 1MY0A 1Z7NE 2P0SA 3E4RA 3K6UA 1YPNA 1H43A 2Q9TA 5JEIA 3M3LA 1BLFA 4HW8A 1SW1A 3CFZA 3PGFA 2ABHA 2F7AA 2G93A 2OCUA 1TFAA 3U94A 3IOWA 1PB7A 2Z22A 4ZECA 4F3SA 1VSOA 1PB8A 1IXHA 3C32A 4PQJA 3KSJA 4YU0A 1B5HA 4ZZAA 4EXKA 2GRVA 3Q29A 1RYXA 4KR5A 4OESA 4P0IA 1YAEA 3K6XA 1FQAA 3K01A 4OENA 3VVFA 4F3GA 3MQ9A 4GXAA 3KSXA 1NNPA 1OMPA 4ZZEA 1ELJA 4ISUA 1EU8A 2VOZA 3GBBA 4FEDA 1Y1MA 2G29A 2DWHA 1FTOA 1F9BA 5CMCA 2O7IA 1PBPA 2OWTA 3VXBA 5DVIA 3PMVA 4DXUA 2DOJA 2X7PA 1N7XA 3VLVA 4GL0A 3FVNA 5BUUA 4M4GA 3FVGA 1P1NA 3A3UA 1NFTA 5H8SA 1QKBA 1S50A 4Q8RA 2ALUA 1J1NA 1H45A 1POTA 3L6GA 1NNFA 2UVJA 4Q0CA 1EZOA 4FEBA 2ZYNA 2RCBA 4OEVA 1IEJA 2RINA 1BKAA 1JVXA 1US5A 3N6UA 2O7UA 2BJJX 2H5YA 3T9VA 1N76A 4JSOA 4ZEKA 2QS3A 1BTJA 3TDJA 4XKQA 2HFBA 3C36A 4RYAA 1AL3A 4YICA 3RNNA 5CMMA 1FTJA 5TP9B 3U72A 3U8QA 3TTNA 3PPQA 5L9OA 4OHNA 1LB9A 1O7TA 3JV9A 2GH9A 3MPLA 3BBRA 5I59B 4EF2A 3MP1A 1FQDA 3CSGA 5I59A 3KBRA 2I4BA 4BDQA 4R9FA 3TUSA 2XXIA 2O1LA 2Z8FA 2F5XA 4KFQA 1AOVA 4U1ZA 4U22A 3I3VA 2XXQA 3IJXB 1SW2A 4G77A 1A7LA 1LSTA 2HQ0A 1JNFA 2ZNTA 3JYRA 3GBAA 5ISUA 3ONMA 1AH5A 3EPEA 2QMXA 4H1XA 1LCFA 1XOCA 3BFTA 4MBPA 4POXA 1FTLA 1N3XA 5J1DA 1LLSA 4G8NA 4G68B 2H99A 4OQOA 2B3BA 4H67A 3K02A 4H5GA 3WAEA 2REJA 4WEDA 4ESWA 3K1MA 4F3BA 4YKJA 1IITA 4NTLA 4IGRA 2P1SA 1UTBA 1N04A 1FQFA 1MY3A 3TODA 4KYDA 3DP8A 4LATA 5CRYA 4KCCA 5A5XB 3N5LA 1MQHA 2UYFA 4PP0A 4ZE8A 4PE5B 2ZNSA 1LFHA 4RK9A 1VFEA 3OEKA 2XD3A 4AB5A 3MPKA 3MZ1A 2PBWA 3LUYA 1MY2A 2OLBA 1MM6A 5EHMA 2OK2A 5CC2A 3OENA 4RY1A 4MLVA 2UXAA 3FVOA 1WDNA 3QIMA 2XX9A 2A5SA 2NUVA 3UN6A 1R6ZA 3O29A 4X9TA 1JEUA 3PUVE 4G8HA 2M8CA 3GXAA 5K2XA 2Q2CA 3D4CA 4O3CA 2F36A 3FATA 3QAXA 2NXOA 1IXGA 1EH3A 3ZKLA 4EDPA 2O51A 3T96B 1R9LA 3FD3A 4IGTA 5CMKA 4X1DA 4H8JA 5ELVA 1JW5A 1TXFA 4OTEA 3VV5A 1NNKA 3DP4A 1B5IA 3OO7A 3EN3A 4QFPA 2H98A 3SDFA 5HM4B 3IX1A 2QRYA 1B3FA 2O68A 1CB6A 3H7MA 4IO2A 5FHOA 4Q5TA 2F35A 3Q27A 4GRKA 4JXIA 3TCFA 4YMBA 4OFLA 2NVUB 4F1VA 1MH3A 2I48A 3KJ7A 2AIXA 3RLFE 3SEVA 3MZ9A 4WKMA 4F3PA 3T93B 3RTFB 1MY1A 1ATGA 1MPBA 2XXVA 1IZ1A 1P99A 3ILTB 1NNTA 5DT6A 4NWDA 4KPTA 4PFUA 3LC8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ANFA 3VXCA 4ZDMA 4LVQA 1MXWA 1ZKBA 3K4UA 2WBBA 5EQ9A 1FQCA 3H6WA 5ET8A 2RKMA 1UIVA 1NUZA 4PFRA 4H6DA 3UORA 3E9XA 3CFLA 3PMWA 2DWIA 4RK2A 3T9UA 3IK6B 1BP5A 2XXXA 4NF0A 3MVZA 1INPA 4NF5B 1ZMGA 3MWBA 1FPFA 4GFRA 4H45A 4ZEBA 3PMXA 4KD5A 3CSBA 1XVYA 4NF5A 4OA4A 4JVCA 2ANJA 3DM0A 3M3FA 3G3KA 1FBEA 5ITPA 3W15C 1ZIUA 3ILUB 4I8CA 1VFDA 4HE2A 1Y3PA 1LFIA 4OYVA 4OEUA 1OQGA 2X7QA 5KZTA 3KOTA 2F78A 5AA3A 4JWXA 4I62A 1TFDA 4KI0E 3KG2A 4QFOA 5FTIA 3C33A 1G0IA 1LGBC 4Z7EA 2Z8EA 2FIEA 4DXCA 2DE2A 5H8FB 3FJMA 3VVEA 4YB7A 4F22A 2WKYA 2QS1A 4NF4A 3IL1B 4EQBA 4F19A 2DWJA 3CRBA 1FBDA 4ELOA 3TKDA 3PPRA 3V8XB 5DVJA 4LZ5A 5B70A 1B3EA 3S9NC 3C9HA 5B7DA 3OSQA 4XXUA 5IZ3B 3QYTA 1NV7A 1JQFA 2WYKA 2FA7A 3PPPA 5IAIA 4MAGA 5IZ3A 2I0CA 4AB6A 5DEXB 4EQ7A 4OFJA 1FPBA 4UABA 3K00A 3Q28A 4IO4A 1R1NA 4DCYA 2Y7RA 5HBCA 5DEXA 4K3FA 4JBZA 3FV1A 3RPWA 2PVUA 2XWVA 3W9VA 3G3FA 2HCAA 5EYFA 3BKIB 5IGAA 1MG1A 1URSA 4ZEDA 1LAGE 3ROJA 3THIA 4OZ9A 3VE1B 4P1EA 1B4ZA 2DXYA 4LZ7A 3IR1A 3EHSA 1H44A 2D5WA 4EF1A 2DVCA 2RF1A 3HN0A 3KGCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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