5AA4A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with cell-wall tetrapeptide
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 142
structure length 418
sequence length 418
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2015-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4A02
1S9TA 3O97A 4OERA 4PP0A 2REGA 3VVEA 1IXIA 3LR1A 3ILUB 1YPNA 4KCDA 1HSLA 1CB6A 3MBPA 3GBBA 5H8HA 4OTEA 1Q35A 1LAXA 3HHFA 1MM6A 3TEPA 1B58A 1H3DA 3S9MC 1QKAA 2I58A 1US4A 1H43A 4F29A 1RYXA 1SYHA 3TKDA 2HZLA 4X48A 1CE2A 3U1OA 5CBRA 5CBSA 2QPQA 5H8QB 3O9PA 1HSEA 1LGBC 3T96B 4OZ9A 2ZNTA 5I58B 5H8FB 4G68C 2X26A 4EDPA 3KBRA 3FJGA 4ZEBA 3SKPA 4YKIA 5AA1A 5I2KA 3MVYA 2ZNUA 3GBAA 5A5XB 1MY1A 2DVCA 2Y7WA 4FECA 1ZTYA 3C9HA 4F39A 2NUVA 4O3CA 3TCHA 4I62A 4KI0E 1TFAA 1NL5A 1LCFA 3EHSA 2P0SA 4XKNA 4POWA 3TELA 3B6TA 1UTHB 4QRZA 3LSWA 2O7IA 2DSFA 5CRYA 4H5FA 4OHNA 5CI5A 1ZIUA 1PB8A 3F11A 3CI8A 1QUJA 1GTKA 1OLCA 1MXVA 3P7IA 4KYDA 1BIYA 1B51A 5CM6A 1N0TA 1B7HA 4IY5A 4DXCA 4EF2A 3SDFA 2O51A 1N3WA 2OBGA 1N7XA 2F78A 4R2BA 1OQHA 5F7VA 4JWXA 1Y3QA 3D4CA 2I49A 3TTNA 1B3GA 1Y1ZA 1AL3A 4H8JA 4FEBA 1N04A 1ZKBA 2X7QA 3MZBA 5TPAA 5K2YA 4XIGQ 1LB9A 2H25A 4QHQA 4ZE8A 2Z8EA 2I0BA 3N94A 4ZECA 1M5FA 3FXRA 4F18A 3KOTA 2P2AA 3HHGA 4F1VA 3HO7A 4PFUA 4PQJA 5DVFA 1IQ7A 3VLVA 3OO7A 3VXBA 1FQAA 4RNSA 2XXRA 1DMBA 4EXLA 4OVJA 2RC8A 3M3KA 3Q29A 3PPNA 1DSNA 3QUJA 1NH8A 1SQYA 1EZ9A 5F1QA 1MM7A 3KSXA 3C32A 3OMBA 4F1UA 3RQTA 4ZDMA 4F2OA 1B5IA 1Y4CA 2V84A 4BDNA 4R9GA 2UYFA 4GRKA 4QSDA 3FZVA 3H6UA 2Z8DA 3VLWA 3FXUA 5DVIA 4Q8RA 4LA9A 3PPOA 3DM0A 1PEBA 4P11A 3CIJA 2FNCA 2O6AA 3UIFA 2O7UA 3JZJA 3V8XB 4GXAA 4Q30B 3L6HA 4TOZA 4MFIA 4NF8A 3OD7A 5I57B 1PB7A 1P1UA 1WODA 2DP8A 4R6KA 3TYHA 5FTIA 5AE4A 4H0WA 3K00A 3PD9A 4AQ4A 1FQDA 3S9NC 2X7PA 1A55A 1VFEA 3N26A 1FQEA 2DQVA 1UTBB 1I6BA 1OLAA 3USDA 3IJOB 3MZ1A 3K6XA 3ILTB 2OLBA 4BDOA 4YAHX 3G3FA 1IIWA 3IB0A 2HZKA 1FTKA 3UN6A 3LUYA 1JETA 1M5DA 2VOZA 4OFJA 1P99A 2F6PA 1AH5A 3IK6B 3FJ7A 3Q28A 5FHOA 1PDAA 1POTA 1SW5A 3PV0E 1LLSA 1LFIA 5DEXB 2XXHA 1MQJA 3O2AA 3M3FA 2B3FA 3SETA 4LZ8A 5AA2D 2PT1A 4YB6A 4OEVA 4JB7A 1H44A 1M5CA 1PBPA 2V93A 4RK2A 4QSEA 1FW0A 3TCGA 1DTZA 3T9VA 1WVJA 2M8CA 4BLAA 2V3QA 2PVUA 3ZKKA 3OXNA 2PT2A 2XXXA 1QVSA 3K01A 4LATA 3QUFA 5KDTA 5CMKA 4ELPA 2F8DA 1SI1A 4JWYA 4FJPA 1AMFA 2KLFA 4TQUQ 4P0GA 4DCYA 4F3PA 4ESWA 4OETA 3FV1A 2V25A 3T22A 1ZU0A 2DXYA 1B7ZA 4JSDA 5H8SA 4R75A 4F3GA 4NTLA 3MAMA 3RLFE 2I3WA 3OSQA 1B3FA 1M5BA 3TDJA 5K2XA 3U92A 3FVGA 4R72A 1P1OA 3C31A 1AIVA 2OK2A 4ZZEA 1B1XA 4DIGA 4OWDA 3GZGA 3RPWA 4MF3A 3OELA 4RXLA 2RCAA 1SVXB 5EHSA 4MLQA 5TP9B 4AB6A 2DE3A 4HTGA 4C1TA 1NNTA 2QS1A 3OOAA 3HN0A 4NF5B 4L17A 3G3IA 5L9OA 4OYVA 5ICTA 1QUIA 4JXIA 1IXGA 2ZYNA 3KG2A 2QS2A 3IOTA 3CRBA 2Y7PA 1O63A 3C4MA 2HXWA 3O29A 1ZLQA 1NNPA 4OFOA 2XXIA 3KGCA 3OEMA 4GL8A 1JVXA 4KHZE 2O68A 3FVNA 2VD3A 3SEVA 1TWYA 3G3HA 4O3AA 4NF4B 2DWJA 1IZ1A 4R6HA 5FHMA 2D21A 1H45A 4IB2A 4OFLA 1EZPA 1F9BA 1LFHA 2ZMBA 1SDXA 3MJNA 3UK4A 1S50A 3BBRA 2Z8FA 3HSTA 2D5WA 4NE4A 3FVOA 5ITOA 1QW0A 3FIRA 4P0IA 2ZYOA 4WEDA 3G3JA 2BJJX 3E9XA 3CG3A 2F34A 4X1BA 2PX1A 3SEUA 4H67A 3RN8A 1P1NA 2A5TB 2DYXA 4BDMA 4RY1A 2XX7A 3IOWA 3TAJA 1MPDA 2VGQA 4LQ5A 1JW5A 2Q9TA 1SD3A 4IO6A 1FTOA 1B6HA 4GQOA 3BFTA 3IO6A 4I8CA 2HQ0A 4OENA 1MQGA 3IB2A 3RTWB 5ICQA 1HSJA 3IO4A 1VSOA 3SESA 5I56A 4RA1A 1UIVA 1GGGA 2DWHA 4LP2B 1EH3A 1SBPA 1LBBA 1MQHA 1YAEA 1B0HA 1XHYA 1URDA 4R2FA 5BWJA 3EHUA 3HCQA 4KD5A 1A99A 4PETA 4LQ2A 3G7WA 3HPIA 2B65A 2ESNA 2Y84A 4Q0CA 3QSLA 1H76A 3CSGA 3EN3A 3R6UA 3ECRA 2VHAA 4EF1A 3K6VA 1R9QA 1NMUA 1XC1A 2DXRA 4DDDA 4THIA 1BKAA 4QFOA 1USYE 1SYIA 4QFPA 5LOMA 1BTJA 4C0RA 5I84A 3K1PA 3TTRA 1XVYA 1SW4A 2YLNA 3DP8A 4AB5A 5KCJB 4G8HA 4Q5TA 3PUZE 3K2DA 1AOVA 1ANFA 4MBPA 4YB5A 3VDFA 4LZ5A 5JEIA 4GFRA 1B2HA 3G3GA 1YCJA 1YTVA 1GR2A 2XX9A 1USYH 2UVGA 2IEEA 3KN3A 5H8QA 3T9HB 3H06B 4R6YA 3V89B 5I2NB 2XD3A 5CMMA 2R9JA 5I58A 2H9BA 3O6IA 2Y7RA 3UGWA 5H8FA 1EZOA 2ZNSA 4H1XA 3GXAA 3V83A 5ISUA 3LSFB 3MVZA 1UIUA 3DELB 2AL4A 4LONB 3MC2A 4F2QA 4GXSB 1I69A 5L8DA 5A5XA 1Y9UA 2CMOA 2E0SA 5AA2B 3T66A 1IXCA 4KFQA 2F5XA 1NNKA 1OMPA 2GRVA 4U1OA 4IO3A 3DLNA 4G8MA 1UTHA 5FHNA 4XKQA 2ONKE 3K1NA 2E1SA 1JW1A 4O3BA 1MRPA 1MH3A 4H6DA 1DPEA 5H8NB 3MW0A 3PUYE 2XXTA 4ZEFA 3I5OA 1TFDA 2NOOA 2NWJA 1MPBA 3M8UA 4XKRA 1B3LA 1MPCA 4F1YA 3PUXE 4PFTA 3THIA 3TTKA 4ONYA 3GLBA 2QMWA 1Y4TA 3IJXB 3CVGA 1VR5A 2R71A 4UACA 5DYHA 4HCYA 5L9MA 3N5LA 2R6GE 4F31B 2QS4A 4YMBA 3EQ1A 1Y3PA 1MXYA 2G29A 1N3XA 1FQCA 5DTBA 1IEJA 3TFLA 1D4NA 4YMAA 2QS3A 5AA3A 2QMXA 2RC7A 4JDFA 5ITPA 3T93B 3CSBA 4NWCA 4YKKA 2Q88A 2GFEA 4RK9A 3SEWA 4HW8A 3FVKA 5ELVA 4U23A 4WXJA 3QXMA 3O66A 4EQ7A 1QUKA 5AA2A 1OIBA 4U21A 3VXCA 3S9LC 3MVXA 3C33A 3IB1A 3IR1A 2ZXTA 1RYOA 5BUUA 1B7UA 2F6GA 3ZS6A 2RC9A 5CC2A 1OVBA 3U93A 1B4ZA 1FCKA 2AIXA 3CG1A 2AYSA 2FA7A 2I4BA 3H7MA 1MH4A 4KR5A 1B32A 2QRYA 4U22A 2DVZA 4JBZA 3S4UA 1DPPA 3A3CA 2DS9A 4Z7EA 3BFUA 3G3KA 4M1VA 4DCXA 3VV5A 3KN8A 1B1HA 1MY2A 4FE8A 4TLLB 2Q2AA 1Y3NA 5CMCA 2THIA 3R7XA 1IUDA 3K4UA 4OESA 4BDQA 5I57A 3Q27A 4DXBA 1I6QA 5H8HB 2Q2CA 3TQLA 2XXPA 1A8EA 2I4CA 4Z0IA 4QFKA 5JTYB 2XXWA 4UA8A 4OQOA 4G8NA 1OVTA 2FYIA 4FORA 3TMGA 2P1SA 3VVFA 1LAGE 3VE1B 1UTBA 3VLUA 1SI0A 2Q89A 3VVDA 4EQBA 4QSCA 1NH7A 4KYEA 4IO2A 1QULA 1B5HA 4EQ9A 2RINA 2NVUB 2RKMA 4KCCA 1XT8A 3O6GA 4U2RA 4GIZA 2H4IA 5I2KB 3ZKLA 1I6AA 2RCBA 3QAXA 1B05A 4I9DA 4QF9A 2F7CA 3OEKA 1ZMGA 4RYAA 4N07A 2XXVA 3W9VA 1A54A 4WKMA 1QJMA 1MY4A 3FV2A 1ATGA 2XHDA 4ZEIA 5DEXA 4PFWA 4ESXA 1DTGA 1M5EA 1MG1A 2H99A 3DP6A 2XXUA 1NFTA 4IGTA 1JEVA 2DWAA 3JV9A 1P1QA 2REJA 2GHBA 5B70A 3U72A 2YPNA 4RPNA 5DVJA 2DE2A 3CR9A 4NMYA 5I59B 1MY0A 3AXFA 3O6HA 3TCFA 2F97A 3I3VA 5CMBA 2PYYA 2V3UA 3B6QA 1B3EA 4HCWA 2Y7IA 1LB8A 1FTMA 1SW1A 1OQGA 3H4ZA 1Z7NE 5L9SA 3IORA 3KEIA 2ONRA 4ISUA 2I3VA 1A8FA 4X9TA 5B7DA 1J1NA 3T9XB 3SERA 2ZYKA 1URGA 4ZZAA 5KZTA 2GH9A 1POY1 3MPKA 3E13X 2ZYMA 5HM4B 3MQ9A 2O1MA 4NEDA 5IKBA 2F7AA 4YICA 4FATA 5JTYA 4U4SA 5TPAB 3H6WA 4MH5A 1LAFE 1ZBMA 4NWDA 1Y20A 1A40A 1SW2A 2DOJA 3UORA 3EF7A 3WAFA 4G68B 1MQIA 2ONSA 2I0CA 4G2ZA 3BKIB 1MY3A 3PMXA 2IA4A 3TUSA 3N6TA 1TXFA 3KSJA 5TP9A 5M2VA 4NF5A 4DZ1A 3PU5A 2OWTA 3A09A 1JEUA 3KZGA 4DE8A 1A7LA 1MXWA 4X1DA 2OCUA 1B0LA 4ELRA 4FAJA 3IOUA 1DOTA 1B3HA 3H3GA 2OWSA 1WDNA 1MXUA 4MLVA 4F19A 3ONMA 3C35A 3RNNA 4NF4A 3FATA 5I59A 2NXOA 3QIMA 1VE4A 2B3BA 2XD2A 4H8IA 2ALUA 3T9UA 4EXKA 3W9WA 3LC8A 1MDQA 4NF6B 3FGSA 1JQFA 1TT1A 1O64A 4NF8B 4RPOA 5TU0A 4IO7A 1LSTA 3OENA 2QSXA 1PBQA 4FEDA 3C36A 3KFMA 1PC3A 1MXXA 1GV8A 4KYSA 4E0XA 2A5TA 4GVOA 2F7BA 2O1LA 4GL0A 2HEUA 3TTMA 3B6WA 3TTLA 3Q25A 3RT6B 2HFBA 2RF1A 4R73A 4F3BA 3QYTA 4G68A 2DE4A 3SEYA 1D9YA 1MDP1 1GVCA 3PGFA 2LAOA 3D4GA 4IO5A 4XTCQ 4ELOA 2G93A 4KPTA 3HV1A 3H6TA 3SEXA 1MXZA 3UA8A 4OEUA 1B9JA 3MWBA 3PMWA 1Y1MA 1NKXA 3FUZA 5DT6A 2ANJA 5EHMA 3FD3A 3KN7A 2HCAA 1R1NA 1FTJA 3OO6A 2AL5A 3FJMA 4PE5B 4U1ZA 4ZE9A 1B4HA 1FQFA 1IXHA 4OMBA 3S2VA 3RT8A 3TODA 4GF8A 3H03A 3MPLA 3K6UA 1ZJLA 2A5SA 1Q1KA 3KJ7A 2UYEA 3W15C 5KDTB 3PD8A 4DXUA 5KCJA 2HAUA 4POXA 2Y7KA 5FTHA 3ODBA 4NF6A 1D3KA 1B52A 2ABHA 3S9EA 3VFJA 1O7TA 2D3IA 1L5TA 2Z22A 2F35A 1B46A 4G4PA 1FQBA 3FASA 5HPQA 3PUWE 4IO4A 1T0KA 3TQWA 2UXAA 4YZZA 3R26A 4PFYA 1LFGA 1N84A 4ND9A 3V5AA 5I2NA 4N13A 4ZEKA 3H6VA 2V3TA 4TLMB 4LUBA 2XXYA 2Z23A 4YB7A 3K6WA 3LSXA 1R6ZA 4FIMA 4QFLA 3KOSA 3TPAA 2OZZA 3QK6A 3K02A 2I6EA 3A3UA 3K0VA 1JNFA 4U4XA 4QFNA 4WEPA 3PMVA 1B40A 2PMSA 1PB9A 1FTLA 1JVYA 2PBWA 2QL3A 1UQWA 1XOCA 3CFZA 4LVQA 3PUVE 4H5GA 2DWIA 5AA4B 2H5YA 2H98A 5EYFA 4C1UA 2I48A 1US5A 3EHTA 4K3FA 3IX1A 1KWHA 3Q26A 4EUOA 5H8NA 3MUQA 1QKBA 4IGRA 1R9LA 3PPRA 1BP5A 3RTFB 3IOVA 2O69A 3PPPA 4XXUA 1LCTA 1BLFA 4GLIA 3OO8A 3E4RA 2VD2A 3ZSFA 1LBCA 2UVIA 2YJPA 1VFDA 1II5A 3FXQA 1Z7ME 3CFLA 4JSOA 4YKPA 3LSLA 1ELJA 4M4GA 3DP4A 3E3KA 5JK4A 4ZEDA 3B7DA 2O84X 3L6GA 4GWOA 4R74A 3KJTA 4ECFA 4H65A 3N6UA 4ZS9A 2XX8A 4ELQA 2F36A 3OSRA 4BDRA 1NNFA 3O28A 2VP1A 3IL1B 1URSA 1N7WA 3U8QA 4DLDA 4IY6A 3OO9A 3RGYA 2UVJA 4GD5A 1B5JA 2QJEA 2W7YA 2Q8JA 4YKJA 1JW4A 1IITA 5J1DA 4YU0A 3U94A 3I6VA 2GHAA 5HBCA 2OJTA 4F3SA 4GOTA 3IAZA 1RKMA 3C34A 5I56B 3MP1A 1XS5A 4I1DA 1EU8A 3TZAA 4R9FA 4OXVA 2UVHA 2HAVA 1MS7A 3MP8A 4N6PA 4BDLA 5AA4A 4RJZA 2XXQA 3CFXA 3JYRA 3MZ9A 3PPQA 1LAHE 1MQDA 4G77A 1P1WA 1XVXA 4JWOA 3RY3A 3WAEA 3K1MA 3UP9A 5IAIA 4KQPA 3EPEA 4XKPA 2WKYA 3M3LA 4E0WA 1D9VA 3MVWA 4F22A 2CZLA 3MP6A 4LZ7A 3LBSA 1N76A 1S7YA 4HS7A 3RUMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S9TA 3O97A 4OANA 4OERA 4PP0A 2REGA 3VVEA 1IXIA 4HE1A 3LR1A 3ILUB 1YPNA 5EQ9A 1NUXA 4KCDA 1HSLA 1FPGA 1CB6A 3MBPA 3GBBA 5H8HA 4OTEA 4PAKA 1Q35A 4N8GA 1LAXA 3HHFA 1MM6A 3TEPA 1B58A 5F24A 1H3DA 3S9MC 1QKAA 2I58A 1US4A 1H43A 4F29A 1RYXA 1SYHA 3TKDA 2HZLA 4X48A 1CE2A 3U1OA 5CBRA 5CBSA 2QPQA 2WYKA 5H8QB 3O9PA 1HSEA 1LGBC 3T96B 4OZ9A 2ZNTA 4FBPA 5I58B 5H8FB 4G68C 2X26A 4EDPA 3KBRA 3RPLB 3FJGA 4ZEBA 3SKPA 4YKIA 5AA1A 5I2KA 3MVYA 2ZNUA 3GBAA 5A5XB 1MY1A 2DVCA 2Y7WA 1YXIA 4FECA 4O94A 5IZZA 1ZTYA 3C9HA 4F39A 2NUVA 4O3CA 3TCHA 4I62A 4KI0E 1TFAA 1NL5A 1LCFA 3EHSA 2P0SA 4XKNA 4POWA 3TELA 3B6TA 5LDZA 1UTHB 4P8BA 4QRZA 3LSWA 2O7IA 3U65A 2DSFA 5CRYA 3MSTA 4H5FA 4OHNA 5CI5A 1ZIUA 4PFRA 1PB8A 3F11A 3CI8A 1QUJA 1GTKA 1OLCA 2XXKA 1MXVA 2B4MA 3P7IA 1BIYA 4KYDA 1B51A 5CM6A 1N0TA 1B7HA 4IY5A 4DXCA 4EF2A 3SDFA 2O51A 1N3WA 5EQAA 1RDYA 2OBGA 1N7XA 1NV7A 2F78A 4R2BA 1OQHA 5F7VA 1NUYA 4JWXA 1Y3QA 3D4CA 2I49A 3TTNA 1B3GA 4N15A 1Y1ZA 1AL3A 4H8JA 4OVQA 4FEBA 1N04A 1ZKBA 2X7QA 4GBVA 3MZBA 5TPAA 5K2YA 1RDZA 4XIGQ 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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