5AA4B

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with cell-wall tetrapeptide
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 145
structure length 417
sequence length 417
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2015-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4B02
3C4MA 4N6PA 3V5AA 4F22A 3UK4A 2GFEA 4R2BA 2UVIA 3OSQA 4DE8A 1B0HA 1PBPA 3E3KA 1EU8A 4ESWA 2R6GE 3EHUA 3IK6B 2O6AA 4DIGA 3DP8A 3E4RA 3VXBA 4KYDA 1B51A 2DVZA 1MRPA 2E1SA 5CRYA 4OQOA 3VVEA 3MVXA 4IO3A 3C9HA 3TQLA 4R73A 2ZNTA 2HFBA 4BDMA 3USDA 3CRBA 4P0GA 4QFLA 3FZVA 1YAEA 4NF5B 1PC3A 3TPAA 4PP0A 4EF1A 3O66A 2O1LA 1B40A 4OTEA 1URGA 3N6UA 1LB8A 2Q2AA 1B3HA 1I6AA 1Y3NA 4NF5A 3VE1B 3QYTA 2GHBA 4F3PA 4OETA 5H8SA 3I5OA 4I9DA 4FEDA 3IORA 1Y4CA 3TQWA 3RN8A 3A3UA 3L6GA 3TEPA 3L6HA 1LFGA 2OJTA 3LSLA 1JVYA 4I8CA 1Y3QA 4FORA 1MDQA 5I59B 2NUVA 3MP1A 4K3FA 1QUIA 1A40A 4OYVA 4LZ7A 4LZ5A 3O9PA 3EQ1A 1UIUA 2NOOA 2NVUB 2Q88A 1HSLA 3G3KA 3O28A 3HHGA 4OEUA 3N26A 5I59A 5TP9B 4QFOA 5ELVA 5H8NB 2F7CA 2O7UA 5JTYB 3EHSA 1Z7NE 4BDNA 1IXHA 2I3WA 1EZOA 4G68B 3C33A 3H3GA 1ZU0A 3FVOA 4ZZEA 3PMVA 1LFIA 4IO4A 1DTZA 2Z8FA 3UA8A 1FQBA 5JTYA 4G68A 3FIRA 4BDLA 1GV8A 4MBPA 2QMWA 1OIBA 3DM0A 3TYHA 3K1NA 3MUQA 3O6HA 1LB9A 1ZBMA 2UXAA 2OWSA 4ZEFA 3WAFA 1R9QA 3Q26A 1T0KA 4F39A 1AIVA 2H25A 3KOSA 3PPPA 1Y9UA 4H65A 3V89B 1SW4A 1N3XA 3SETA 1O63A 4LQ2A 2O7IA 1P1UA 2XXIA 1YTVA 3OO8A 3HN0A 1IXCA 1D3KA 2XD3A 5FHOA 2ZYOA 2ANJA 1IUDA 1HSEA 3K02A 2XXXA 4PE5B 4ISUA 2XD2A 1QW0A 3O6GA 2QJEA 4RNSA 3LUYA 4LZ8A 4WXJA 4EQ7A 1ZJLA 3ILTB 3OO6A 2XX7A 2I4CA 1N7WA 5CC2A 1USYE 1SI1A 4H1XA 3DP4A 4X1DA 1JNFA 3TMGA 4TLLB 2ZYMA 3T22A 4ZE8A 3B7DA 2O51A 1BKAA 3IJOB 1SW1A 4JB7A 1JW1A 3TTKA 1SVXB 1B58A 4XKPA 1H76A 2F97A 2F6PA 1PDAA 2REGA 4IO6A 2GH9A 3B6TA 3TDJA 4EXKA 5I56B 3K1PA 3G3FA 1MH3A 2Z8DA 1MY2A 1UIVA 3MP8A 3H7MA 3E13X 3OOAA 2P1SA 2DE4A 3Q29A 5I56A 3IR1A 3S9EA 1LSTA 1IITA 4ZECA 3CFZA 1FCKA 1MXYA 3PMWA 1GTKA 3H6WA 3FVKA 2DXYA 4X9TA 2O68A 1D9YA 4R74A 4G8NA 3T9XB 3F11A 1JW5A 2XX9A 3OEKA 1ZIUA 3KFMA 1N0TA 1US4A 2UVHA 3MPKA 3IAZA 2IEEA 2D21A 3U94A 4F19A 4U4XA 3KOTA 3MP6A 3UGWA 1LLSA 5KDTB 3MW0A 1FTKA 1MQGA 3QUJA 1MPDA 3ZSFA 3PGFA 3MQ9A 3A09A 4OENA 1B1XA 4O3CA 1US5A 3N6TA 1XC1A 5FHMA 5KDTA 4U22A 5I2KB 5ISUA 4GLIA 2ESNA 4PFYA 3MC2A 5F1QA 1VSOA 1H43A 2ZYNA 2QMXA 3SEYA 3CSBA 1II5A 1POTA 4XKNA 5DT6A 3LSWA 4H0WA 5I2NB 3CVGA 4XKRA 5I2KA 4ESXA 4I1DA 4YICA 1B46A 4X48A 4WEDA 3TFLA 3RPWA 2DQVA 4YAHX 4ELOA 5B7DA 5DVJA 5I2NA 2FNCA 3T66A 3PUVE 4G4PA 1L5TA 4GOTA 3R6UA 5L9OA 3GBBA 1PB8A 5K2YA 1H45A 4KCDA 1ZLQA 1ANFA 2Y7RA 4R9FA 3QSLA 2DYXA 3SESA 1S7YA 1Z7ME 4R6YA 2F7AA 4FE8A 3FVGA 4H8JA 4WKMA 1S50A 1JETA 2RCBA 1MQJA 3K0VA 3PUWE 2XXVA 4NF8B 1Y3PA 3U1OA 4QRZA 3TELA 4ZE9A 5FTHA 3KJTA 2Q2CA 2DSFA 5DVFA 1FTLA 2ONRA 1QJMA 2GHAA 2AIXA 4H8IA 5M2VA 3CR9A 4NF8A 2OWTA 4OVJA 3PUYE 3TTLA 1MXXA 1MM7A 2QL3A 1BTJA 2XXWA 2XXUA 2DE3A 4PFWA 1RKMA 3FGSA 3BFUA 4F3GA 1AH5A 3OMBA 3KBRA 4NF6B 3I3VA 2B3BA 3FATA 5EHSA 4ZEKA 3RT8A 3G3HA 1DPPA 1LBCA 2ALUA 4GWOA 1SDXA 1M5BA 1Q35A 4NF4B 4DXBA 2Y84A 3UIFA 4KI0E 4IY5A 3C35A 3OELA 4ND9A 1B3LA 1P99A 4NF6A 4QFPA 4LVQA 1FQAA 1ZKBA 5H8QB 4NF4A 3MZBA 4GL0A 3GZGA 5DTBA 3GXAA 3ODBA 3OO7A 3H03A 4R75A 1ELJA 2RC7A 2YPNA 4GFRA 3VLWA 1MY3A 3H06B 1D9VA 2HZLA 4ONYA 4F1YA 4XIGQ 4GL8A 3G3IA 1EZPA 3TCHA 3QK6A 2G93A 2F5XA 1B05A 1A7LA 3KN8A 4OEVA 1OQGA 1B5HA 1R6ZA 3MVZA 1VFEA 2QRYA 3RQTA 3O2AA 2E0SA 4RPNA 2RINA 2Q8JA 4F1UA 3SEVA 2A5TB 2AYSA 1SW5A 3FJMA 1B4ZA 4KYEA 4YKKA 2REJA 3VFJA 2P2AA 3V83A 3IB2A 3O97A 4M4GA 3VLVA 3B6QA 4LONB 4Z7EA 3FASA 2XXQA 2OBGA 2Y7WA 1A8FA 2DE2A 4RK9A 2A5TA 2PYYA 1NNKA 3SDFA 1XS5A 4FEBA 4PFUA 1B7HA 1RYXA 3MWBA 4MFIA 2VOZA 4FJPA 4F2QA 4YKJA 2DXRA 3FUZA 4U4SA 3R26A 1NH8A 5HPQA 3TZAA 1LAFE 3ZKKA 5AE4A 3FV2A 2UYEA 2OCUA 5DVIA 3O6IA 5DYHA 4RYAA 2Z8EA 2O69A 4H5GA 4U23A 5TP9A 2CMOA 5H8NA 1B52A 1SI0A 3MZ9A 1FW0A 1F9BA 4NWCA 2BJJX 1POY1 3TUSA 3S4UA 3IL1B 4F18A 3O29A 1SYIA 4N07A 2LAOA 4KPTA 2XXTA 2RKMA 4Q30B 1S9TA 2DWIA 5BWJA 4O3AA 2NWJA 3TKDA 1FQFA 1M5FA 3S9LC 3Q27A 2IA4A 3TAJA 1N3WA 5J1DA 4HCYA 2F34A 2H5YA 4H67A 4OFJA 4RJZA 4G8HA 1MXVA 2DOJA 4N13A 4FECA 4JBZA 3Q25A 2QS4A 5KZTA 3K6WA 3PU5A 4OFLA 2B65A 2X7PA 3C36A 2VD2A 4FAJA 1H44A 1LFHA 4ZEIA 1MXUA 3MJNA 3LSXA 4QF9A 1WODA 1R9LA 4E0WA 3LBSA 4THIA 4JDFA 4DZ1A 3U93A 1Y1MA 2RC8A 4LP2B 3JV9A 2H98A 4EUOA 2Z23A 4KYSA 4OERA 3E9XA 3CIJA 2AL4A 1IXGA 5L9SA 1IXIA 3DP6A 3FXQA 4P0IA 2I0CA 4BLAA 4ZDMA 4RPOA 3P7IA 4U1ZA 3M3FA 1B6HA 4FATA 3H6TA 1USYH 4AB5A 4ECFA 3RTWB 1M5DA 3OENA 4G77A 3IOWA 3MBPA 3KSJA 4H6DA 4QHQA 3N5LA 4Q5TA 3RLFE 1MY4A 5H8HB 2B3FA 4R2FA 2QS1A 4YKIA 2W7YA 2P0SA 3OXNA 1YPNA 3CG1A 2H4IA 3M3KA 5CMCA 1XT8A 2Y7IA 1IIWA 3C31A 2V25A 3QAXA 1MG1A 1B5JA 5H8HA 1R1NA 3AXFA 1MPCA 5DEXB 1NNFA 3PD8A 4U1OA 4HW8A 1FQEA 1I6QA 5CMMA 3ZS6A 4LUBA 4LQ5A 1OLCA 2UVJA 2O84X 1WVJA 1B1HA 3IOTA 5DEXA 4JSDA 4YB5A 2DWHA 3K6VA 2V3TA 4NE4A 2XX8A 3PUXE 1LAXA 3TCFA 1EH3A 3HSTA 2HAVA 4KD5A 3OD7A 2RCAA 3N94A 4U2RA 1B5IA 4DCXA 1IEJA 1TWYA 3ILUB 5I58B 1GVCA 4R9GA 3D4CA 4H5FA 3TTMA 2I0BA 3QUFA 1MH4A 4KQPA 2O1MA 4DXUA 2H99A 5I58A 4ZZAA 3KSXA 3TTRA 3IJXB 4YKPA 3KG2A 1QUJA 3K6UA 1VR5A 3IB0A 4QFKA 4OZ9A 3FJGA 4POXA 5JEIA 2V3UA 4ZEBA 5FHNA 5FTIA 2F78A 1A8EA 1GGGA 4OESA 2M8CA 1OMPA 2PX1A 2RC9A 3G7WA 4L17A 2VP1A 5CBSA 2YJPA 1SQYA 5CBRA 5I57B 3W15C 1OVTA 4AB6A 4PQJA 2I3VA 3V8XB 3T9VA 4KCCA 4F2OA 5I57A 3MPLA 3JZJA 2YLNA 2ZXTA 5ICTA 1GR2A 1B3EA 3MVWA 4YMBA 4NTLA 1P1QA 3KEIA 2ZNSA 4ELPA 2THIA 2R9JA 3I6VA 4GD5A 5TU0A 3UN6A 3VVFA 4KFQA 2AL5A 4C0RA 3HV1A 2HQ0A 4GIZA 2DVCA 1NMUA 2PT1A 4AQ4A 3Q28A 3FD3A 1BIYA 3IO4A 4Z0IA 1B4HA 3MZ1A 5CI5A 4P11A 1ZTYA 1B7UA 3T9UA 1MPBA 4C1TA 3FXUA 4X1BA 1LAGE 3WAEA 1TFAA 2ZMBA 2V84A 2DWAA 5AA3A 3IX1A 1MQHA 1PB9A 2QSXA 3HCQA 1B32A 4YMAA 4DXCA 5AA1A 4DCYA 3TTNA 3GLBA 4XTCQ 4MF3A 4OWDA 3K6XA 3KN7A 2UVGA 2DS9A 5AA2B 1NH7A 1Y4TA 4JWYA 3LR1A 2I48A 3ONMA 4OFOA 2WKYA 2X7QA 5F7VA 5ICQA 4G8MA 4JWOA 4YB7A 4U21A 5AA2A 5IAIA 2ABHA 1LCTA 5H8QA 4MLVA 5IKBA 1LGBC 4RY1A 1SYHA 3RNNA 3VV5A 3TCGA 2F35A 2QPQA 1AMFA 4QFNA 4QSEA 4O3BA 2OZZA 4EDPA 3KN3A 4R72A 1B3FA 1BLFA 4WEPA 2Y7KA 5ITPA 2HAUA 4YB6A 4F3SA 3GBAA 3C34A 1MM6A 1Q1KA 2HXWA 3MVYA 3EF7A 3H6VA 1J1NA 4Q8RA 1A55A 3KZGA 4LATA 5TPAB 5HM4B 4G2ZA 1XVXA 3T96B 3THIA 5L9MA 4Q0CA 1TXFA 3U92A 2ZYKA 1N7XA 3RGYA 2Q89A 4F1VA 2D3IA 1FQCA 3T9HB 5TPAA 5AA2D 2NXOA 1B3GA 1HSJA 2V93A 1DOTA 3G3GA 2F8DA 1VFDA 1TFDA 3K2DA 4EF2A 1WDNA 4DDDA 1DTGA 4R6HA 2XHDA 2XXRA 1FTOA 2HZKA 4KHZE 5KCJB 2VD3A 1O7TA 3VXCA 1UQWA 4POWA 3BFTA 3IOUA 3EPEA 1N76A 4IGRA 5KCJA 1M5CA 4HS7A 1I69A 3SEWA 3FVNA 3PPOA 3SKPA 5K2XA 4OHNA 3B6WA 1H3DA 3DELB 1EZ9A 3PPQA 1MXZA 4BDRA 1D4NA 2VHAA 4JSOA 5EYFA 3U8QA 4QSDA 4E0XA 3HO7A 1JEUA 1SBPA 3SEXA 4GXAA 1Y1ZA 4JXIA 1NL5A 1URDA 1JEVA 3K4UA 3BKIB 3FXRA 3VDFA 2OLBA 2F6GA 2VGQA 1OQHA 1QUKA 4JWXA 4OXVA 1KWHA 5ITOA 2XXHA 3K1MA 3PV0E 2PBWA 3CSGA 1FTMA 4F31B 4IY6A 3PPNA 1DMBA 1LBBA 4GQOA 4BDQA 3FV1A 4IO7A 1ATGA 2DWJA 3HPIA 4UA8A 1P1WA 4I62A 1FTJA 1MY1A 4XXUA 1ZMGA 3PUZE 1IQ7A 2D5WA 2PVUA 4OMBA 5I84A 4TQUQ 5EHMA 4XKQA 3W9VA 2F36A 4NWDA 1XHYA 5H8FB 3C32A 2Q9TA 2I58A 3FJ7A 5JK4A 2H9BA 4NEDA 2ZNUA 1MS7A 2I6EA 3K00A 1B2HA 4BDOA 5H8FA 1MY0A 4GVOA 1B0LA 4RA1A 2I49A 2R71A 1YCJA 1FQDA 4TLMB 3RUMA 4DLDA 1MDP1 3UORA 3ECRA 3UP9A 2Y7PA 3QXMA 1NNPA 1CB6A 1SW2A 1PB7A 3H4ZA 2FA7A 1IZ1A 2A5SA 5A5XB 4YZZA 3G3JA 5AA4B 4RXLA 2HCAA 3CFLA 5LOMA 3IOVA 4MLQA 4QSCA 2HEUA 1M5EA 3R7XA 3KGCA 5L8DA 5A5XA 3RTFB 4C1UA 4GRKA 2X26A 4UACA 5AA4A 1JQFA 4MH5A 1UTHB 1A99A 1CE2A 3CI8A 5CM6A 2XXYA 4NMYA 1MQDA 4KR5A 3K01A 1DPEA 1N04A 3JYRA 1UTHA 1PBQA 1JVXA 2I4BA 1I6BA 1URSA 1SD3A 3H6UA 1B7ZA 1XOCA 4YU0A 4IO5A 1QKAA 2QS2A 3KJ7A 1O64A 3T93B 4PETA 4GF8A 1QULA 1AOVA 3W9WA 1TT1A 1P1OA 1JW4A 1A54A 3S9MC 5CMBA 2DP8A 2ONSA 1MQIA 3IO6A 2XXPA 3U72A 3PMXA 2OK2A 2FYIA 4EXLA 1NNTA 5CMKA 4FIMA 1MXWA 5BUUA 3QIMA 4TOZA 4LA9A 3LC8A 4ZS9A 4RK2A 3A3CA 3EHTA 1N84A 4GXSB 2UYFA 3LSFB 2ONKE 3RT6B 1OLAA 1NKXA 3PD9A 1P1NA 1XVYA 2RF1A 4IGTA 2CZLA 4HCWA 1QVSA 3BBRA 4G68C 3D4GA 3ZKLA 4PFTA 1OVBA 1VE4A 2Z22A 3CG3A 2G29A 4F29A 2PMSA 3DLNA 3IB1A 3OEMA 1AL3A 3SERA 4R6KA 1RYOA 5B70A 1BP5A 3RY3A 4ZEDA 3VLUA 2QS3A 3CFXA 5HBCA 4HTGA 3M3LA 3OO9A 3SEUA 4EQBA 2PT2A 1LCFA 4IB2A 3MAMA 2GRVA 3PPRA 4M1VA 1PEBA 1DSNA 3HHFA 4F3BA 1UTBB 4IO2A 2F7BA 3VVDA 2V3QA 1B9JA 3S9NC 1QKBA 3TODA 1Y20A 4ELRA 4EQ9A 1NFTA 1LAHE 4ELQA 3EN3A 3OSRA 1UTBA 3M8UA 3S2VA 2KLFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C4MA 2ZZWA 4N6PA 3V5AA 4P47A 4F22A 3UK4A 2GFEA 4R2BA 2UVIA 3OSQA 4DE8A 1B0HA 1LBZA 1PBPA 3E3KA 1EU8A 4ESWA 1XI6A 2R6GE 3EHUA 3IK6B 4GX3A 2O6AA 1NUWA 4DIGA 3DP8A 3E4RA 3VXBA 4KYDA 1B51A 2OWZA 2DVZA 1MRPA 2E1SA 5CRYA 4OQOA 3VVEA 3MVXA 4IO3A 3C9HA 3TQLA 2MKZA 4R73A 2ZNTA 4PDDA 2HFBA 4BDMA 3USDA 3CRBA 4P0GA 5ET7A 4QFLA 3FZVA 1YAEA 4NF5B 1PC3A 3TPAA 4PP0A 4EF1A 1EYJA 3O66A 2O1LA 1B40A 4OTEA 1URGA 3N6UA 1LB8A 2Q2AA 1B3HA 1I6AA 1Y3NA 1FJ6A 4NF5A 3VE1B 3QYTA 2GHBA 4F3PA 4OETA 4HE0A 5H8SA 3I5OA 4I9DA 4FEDA 3IORA 1Y4CA 3TQWA 3RN8A 3A3UA 3L6GA 3TEPA 3L6HA 1LFGA 2OJTA 3LSLA 2HHMA 1JVYA 4P56A 4I8CA 1Y3QA 4FORA 1MDQA 5I59B 2NUVA 3MP1A 2ZZXA 4K3FA 1QUIA 1A40A 4GWZA 4OYVA 4LZ7A 1G0HA 4LZ5A 3O9PA 3EQ1A 1UIUA 2XWOA 2NOOA 2NVUB 2Q88A 1HSLA 3G3KA 3O28A 3HHGA 4OEUA 3N26A 5I59A 4GX4A 5TP9B 4QFOA 5ELVA 5H8NB 2F7CA 2O7UA 5JTYB 2WBDA 3EHSA 1Z7NE 4BDNA 1IXHA 2I3WA 1EZOA 4G68B 3C33A 3H3GA 1ZU0A 3FVOA 4ZZEA 3PMVA 1LFIA 4IO4A 1DTZA 4OVTA 2Z8FA 3UA8A 1FQBA 5JTYA 4G68A 3FIRA 3RYDA 4BDLA 1GV8A 4MBPA 2QMWA 1FBHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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