5CC2A

Structure of the ligand-binding domain of the ionotropic glutamate receptor-like glud2 in complex with 7-cka
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
VVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRSNGSENNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGNTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, delta-2
publication title Pharmacology and Structural Analysis of Ligand Binding to the Orthosteric Site of Glutamate-Like GluD2 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A02
3TTKA 2F7AA 1M5CA 3TTNA 2Y7PA 4FEDA 1TWYA 1POTA 3LSFB 5FTHA 3K0VA 4AQ4A 4ZDMA 3FZVA 1B51A 1DTZA 3C36A 4EXLA 5HM4B 4R6YA 3E13X 1MPCA 3G7WA 2VD3A 1YTVA 2D5WA 3DP6A 3PD9A 2ZYKA 1B2HA 5H8SA 3ECRA 4H8IA 4YKPA 4NF4B 1RYXA 4GFRA 1LAXA 3SEUA 2QMXA 2I4CA 2REGA 5I2KA 2Z8DA 1IXCA 3IK6B 3D4CA 1AH5A 3T9HB 1VSOA 2Q88A 1LAGE 3ZSFA 1R1NA 3PPPA 4H0WA 2OJTA 5AA1A 4PFUA 4U4SA 4GWOA 3TELA 4JDFA 2ANJA 1AIVA 1B46A 3FD3A 3Q29A 1MPDA 3KSJA 2FYIA 4EXKA 5I2KB 2QMWA 1A54A 1QULA 4QHQA 3M3FA 4EUOA 1B5JA 1GTKA 4H65A 4I1DA 2XXTA 5H8FA 4RNSA 2D21A 1PEBA 2VD2A 4ZS9A 1N0TA 1O64A 2RC8A 3MZ9A 4R72A 1TFAA 3K01A 4EQ7A 3FXQA 4G68A 3MUQA 4YKIA 2QS4A 4O3AA 3HCQA 1SYHA 3S9NC 2I49A 1LGBC 1LCTA 2RC7A 2Z23A 5FHOA 3K02A 4FEBA 3OEMA 4PE5B 1POY1 5L8DA 3TFLA 1ZJLA 3CI8A 2ONKE 4Q5TA 5H8FB 1HSJA 1QUJA 3ZKKA 2HFBA 4GLIA 1SW2A 1H3DA 1USYE 3FIRA 2V3QA 5CBRA 3TUSA 2PT2A 4NF8A 2DWJA 1MY4A 5IAIA 1B3HA 2DS9A 4F2QA 4GXAA 4G68B 5KCJA 1EH3A 4FIMA 1AL3A 2DOJA 4OYVA 4RXLA 3T66A 3IO4A 3C4MA 2YPNA 4YB5A 1D4NA 1DTGA 2B3BA 2X26A 4QF9A 4NF6A 3QYTA 2ONSA 3DM0A 5CM6A 1B1HA 4NWDA 3W15C 3MVZA 4ECFA 3PUXE 4NF8B 2F7CA 1L5TA 1B58A 1TT1A 2P2AA 4MBPA 1B4HA 3T96B 3CSGA 3MBPA 5DT6A 2I4BA 5DVIA 1GV8A 4DZ1A 5LOMA 5KCJB 4ESXA 3TCFA 1QKBA 3TEPA 1MQDA 1UIVA 3K6XA 2DQVA 3I5OA 3U93A 2XXHA 5B7DA 2ZNSA 4EQ9A 1B7HA 1MXZA 4NF6B 1UIUA 2HQ0A 1SW4A 3RTFB 3O6HA 1ZU0A 5KZTA 3V83A 3KSXA 4G2ZA 2DE4A 4ZE8A 2ZXTA 2QPQA 4Z7EA 3RT8A 4OETA 3O28A 4OZ9A 1PB7A 1JW5A 2HEUA 3LSXA 3F11A 1NH7A 4MH5A 1SQYA 1NH8A 1RYOA 3VVEA 4DCYA 1QKAA 4POXA 3H03A 2HCAA 2H9BA 4JB7A 1WODA 1MXWA 5H8HA 5JK4A 3K4UA 1IXGA 4ZE9A 1LFIA 3HHFA 4RK2A 4GVOA 1Q1KA 1KWHA 1ZMGA 1DPEA 4WEDA 1SW5A 1BIYA 3ZKLA 4ONYA 4EF1A 3PV0E 2VGQA 4NEDA 3V5AA 2ESNA 4QSCA 3O29A 3RNNA 3UGWA 4NF5A 2UVJA 2Q9TA 1MQHA 3IOWA 1VR5A 4TLLB 2A5SA 1MDP1 1OIBA 3MAMA 5H8HB 2DVZA 4YAHX 1GR2A 4LP2B 2RCBA 2F6PA 2CMOA 3N6TA 2V93A 4ZZAA 3A3CA 1T0KA 1P1WA 1Y4TA 1B9JA 1F9BA 4F1UA 4O3CA 3IJOB 4G8HA 2XXPA 2X7QA 3IAZA 2DSFA 3EF7A 5AA4A 3OXNA 1JVXA 4NF5B 3K1PA 2RKMA 5EHMA 2NXOA 4LATA 4PFYA 1Z7ME 1ZTYA 4QFNA 2OK2A 3JYRA 1B5IA 2XXIA 1PB9A 4U21A 4KQPA 3OO8A 2Q8JA 1M5DA 3FVOA 1HSEA 5A5XA 3BFUA 2PX1A 3ODBA 1WDNA 3VXBA 5AA4B 4LUBA 3SKPA 5I56A 4OEUA 1P99A 3KJ7A 1IXHA 3N5LA 2AL4A 3D4GA 3QSLA 1BKAA 3THIA 1ZKBA 5AE4A 5K2XA 1MXVA 3C31A 5BWJA 4KFQA 5H8NA 2F97A 4EF2A 1J1NA 3LSWA 2H98A 2E0SA 3S9EA 4M4GA 3M3LA 4OESA 1OLCA 1YAEA 5HPQA 2NWJA 4IO6A 4DCXA 5H8QA 3QXMA 2O7UA 3WAEA 1USYH 1TFDA 1MDQA 3ILUB 1SYIA 3KZGA 3UK4A 1II5A 1SI1A 1MY1A 5I56B 3CG1A 1PBPA 1FQCA 5FTIA 2RF1A 1EZ9A 4DXUA 3TAJA 4GQOA 3TQWA 5H8NB 3EPEA 4U23A 4GIZA 3GXAA 4OFLA 2B65A 2HAUA 4NWCA 4F18A 2KLFA 4PP0A 1QUIA 5F1QA 5H8QB 3G3HA 1PBQA 3U72A 2QL3A 3OOAA 1IITA 1MPBA 3CVGA 3SERA 1JQFA 2XXUA 4C1UA 3MWBA 2PBWA 4ZEBA 3IR1A 1QJMA 4R6KA 3T22A 1Q35A 3R7XA 4X9TA 4PFTA 3MVYA 3DP8A 3SEVA 4F22A 3KOSA 3VLWA 5TPAA 5I58A 3W9VA 3MVWA 4U1ZA 4IO2A 1MY3A 3FGSA 2A5TA 3CR9A 4Q30B 5TP9A 1LFGA 2HXWA 1Y3NA 4M1VA 1WVJA 1OLAA 3B6QA 1MH4A 4C0RA 4RK9A 1MXXA 3PPQA 1DOTA 1MQGA 1ANFA 3RTWB 2H4IA 2QJEA 3LBSA 1SDXA 3CIJA 5JTYA 3ILTB 1B6HA 3PPNA 3S9LC 1XVXA 3VLUA 2XX9A 1LBCA 2I3VA 4ELRA 3RQTA 4OEVA 5TPAB 5I58B 4U2RA 5ELVA 1VFEA 3C32A 3T93B 2PYYA 3G3IA 3TODA 3KOTA 5DYHA 2A5TB 1ZLQA 3TZAA 5TP9B 2OWSA 2HAVA 3V89B 3OD7A 2QS1A 3HSTA 2DWHA 3FVKA 4JSDA 1NFTA 4L17A 3PGFA 4YMBA 4IO4A 3VFJA 4LONB 4GRKA 2VP1A 2QRYA 5JTYB 3PD8A 3H6WA 3FASA 2ONRA 3EQ1A 4POWA 2Y7KA 4FECA 1QVSA 3FJGA 1B32A 1SW1A 3HHGA 2R6GE 2IEEA 1PC3A 3R26A 3IOUA 1MG1A 3BBRA 2V25A 2Q89A 3K6UA 4HCWA 1M5BA 3TCHA 4G77A 3E3KA 4MLVA 4KD5A 2FA7A 1FQFA 5CMBA 1MXYA 4F31B 2WKYA 3EHSA 2F34A 5KDTA 3T9XB 2ABHA 2AIXA 3E4RA 3H6VA 2Z8FA 3LR1A 3O97A 1DMBA 4PQJA 1IQ7A 1ELJA 4QFLA 5AA2D 4H8JA 3R6UA 1XT8A 4RY1A 3SDFA 3O9PA 5F7VA 4R9FA 1MXUA 1SI0A 4NMYA 3E9XA 3H4ZA 1B0LA 4EQBA 4RPNA 2REJA 2VHAA 1O7TA 3PUZE 4OVJA 4PFWA 4OMBA 5KDTB 2ZNTA 3Q26A 5CMKA 1NNPA 2F8DA 4F1YA 2OLBA 3RLFE 2GHBA 4FAJA 1JVYA 1FCKA 1PDAA 1LLSA 1CE2A 4DIGA 3ZS6A 4QRZA 1A7LA 3M3KA 4QFPA 3KJTA 2DWIA 3AXFA 2D3IA 1S50A 3B7DA 2F35A 2BJJX 1N7XA 4KI0E 3G3KA 3MP8A 5L9SA 3IOTA 3FUZA 3GZGA 3H3GA 2Z22A 2NUVA 2HZLA 4C1TA 1XC1A 2OBGA 2UVIA 1JEVA 1H45A 1VFDA 3UA8A 4YKJA 3TQLA 3PUYE 4FE8A 4DXCA 4RYAA 1FTLA 4KYSA 5FHMA 3FJ7A 4ZEKA 1A99A 4U22A 1N3WA 2I0CA 2Y7WA 1OQHA 1UTBA 3TKDA 3CFXA 4IO5A 2RINA 1FW0A 3H06B 5TU0A 1DPPA 4X1BA 3K6VA 3TTLA 4P0IA 2I0BA 3TTMA 4BDQA 2O1LA 1B7ZA 3HO7A 3MJNA 2ZMBA 4RA1A 3OO7A 2O1MA 4F3SA 3T9UA 1D9YA 3TCGA 3QAXA 4GL8A 2GFEA 4IY6A 4LZ7A 4YB6A 2ZNUA 1B3LA 4ELOA 1JETA 4F3PA 2XXWA 4FORA 4YB7A 1IEJA 5ITOA 2GHAA 3PPOA 1UTBB 3O6GA 3IX1A 4G4PA 1GVCA 1LB8A 3VLVA 3VV5A 4K3FA 1A40A 4NE4A 3EHTA 1ATGA 5JEIA 4R74A 4ZEIA 3GBAA 4JWYA 4JWOA 3JZJA 3RY3A 2LAOA 1IZ1A 4ZEFA 3TYHA 4R6HA 5EYFA 4JXIA 4YICA 4AB6A 1I6AA 5ICQA 3CSBA 4KHZE 3GBBA 4OFOA 1MQIA 2F6GA 3QK6A 1H43A 1IUDA 2HZKA 2F78A 4ZEDA 3O2AA 4F3GA 4BDOA 1FQEA 3TTRA 1QUKA 3VE1B 2OWTA 5I84A 4ND9A 3MPLA 1P1NA 4IY5A 3K1NA 3KFMA 3IOVA 5I2NA 3GLBA 2Q2CA 4QSEA 1N3XA 5ICTA 1AMFA 1FQDA 1Y20A 4QFKA 2XX7A 2ZYMA 3MZBA 1LBBA 2O51A 3KGCA 3H6TA 5ITPA 2O84X 1XS5A 4H5FA 3OEKA 4N13A 1LFHA 5CRYA 4XKPA 5B70A 2AL5A 3MPKA 2OZZA 3LC8A 3PMVA 3OSQA 1ZIUA 4IGTA 4F3BA 4QFOA 4WKMA 1H76A 3K6WA 4HS7A 1NNKA 1UTHA 3PMWA 5I2NB 4MFIA 2CZLA 1Y1ZA 2XX8A 1FQBA 4XKQA 1Y4CA 2G93A 1N7WA 4LZ5A 3B6TA 4F2OA 1OQGA 1O63A 1AOVA 5J1DA 3FVNA 2R9JA 2H25A 4FJPA 4WEPA 3PUWE 4G68C 4TQUQ 3G3GA 2ZYNA 1S7YA 5ISUA 1CB6A 2F5XA 3IO6A 1NMUA 4GOTA 3U94A 4KCCA 2XXYA 3MZ1A 1UTHB 3EN3A 4F39A 1B5HA 1R9QA 3MP1A 1JNFA 2M8CA 3ONMA 2QS3A 3KN7A 3C9HA 4KYEA 2E1SA 3K00A 3RGYA 4KCDA 4P0GA 4FATA 1SVXB 4R75A 4F29A 4JSOA 3OO9A 3C34A 5CC2A 4N07A 2AYSA 1FTOA 4WXJA 1MH3A 1MRPA 3QUJA 3VXCA 4IO3A 4R2BA 4MF3A 2UXAA 2W7YA 2ZYOA 3V8XB 3RN8A 1XOCA 3HPIA 2H5YA 2DE3A 1D3KA 2O68A 4LQ5A 5DVFA 4BDRA 4OHNA 5L9OA 4I8CA 4JWXA 4LQ2A 2PMSA 3BFTA 2NVUB 2PVUA 2XD2A 1URGA 4ISUA 2PT1A 4OTEA 4RJZA 3S2VA 2O7IA 3VDFA 3IORA 4Q0CA 3PU5A 3U1OA 4F1VA 1LB9A 2DXRA 3FXUA 4BDMA 2XXVA 3DP4A 4OXVA 5DVJA 1NKXA 1B3FA 3KEIA 1Y3PA 4DLDA 3SETA 1B3GA 4AB5A 3QUFA 4XIGQ 1PB8A 5DEXA 1ZBMA 4DXBA 2UVGA 4TOZA 1FTJA 1US4A 4LA9A 4BLAA 4KR5A 3KN8A 3MC2A 3TMGA 2GH9A 1D9VA 2V3TA 3SEYA 4PETA 1MS7A 4DE8A 3P7IA 4OQOA 4KPTA 2XD3A 3Q25A 1P1OA 3OSRA 3IB2A 3S9MC 1EU8A 1FTKA 5DEXB 3G3FA 4R2FA 5IKBA 1A55A 2RC9A 3MQ9A 2ALUA 4ZECA 1B05A 4R9GA 2QSXA 1BP5A 4X1DA 4YMAA 5AA2A 1M5FA 3IB1A 3N26A 3Q27A 4IB2A 2I58A 2QS2A 4GD5A 3C33A 2DYXA 3JV9A 2OCUA 1IIWA 3DELB 1HSLA 3IB0A 1P1QA 2RCAA 2V3UA 4OENA 4TLMB 4OWDA 4ESWA 4DDDA 4H1XA 2GRVA 4XKNA 3H7MA 5AA2B 1B0HA 2DVCA 4ELPA 4THIA 3K2DA 2R71A 4JBZA 3A09A 4EDPA 1B7UA 4N6PA 2F7BA 3DLNA 2FNCA 3CFZA 1BTJA 3CRBA 2Y84A 3FV1A 3O66A 2O6AA 4IO7A 1YCJA 2YJPA 3PPRA 3EHUA 1JW1A 1MY2A 3TPAA 4UA8A 1B4ZA 2IA4A 3FATA 1GGGA 1P1UA 1TXFA 5I59A 3QIMA 3OO6A 3TDJA 1MQJA 1A8EA 5FHNA 2YLNA 3SEWA 4X48A 3IJXB 1B52A 4HTGA 1EZOA 3U8QA 1QW0A 1BLFA 1M5EA 4LVQA 2DP8A 3CG3A 2I48A 3M8UA 4H6DA 3B6WA 1EZPA 4GF8A 1B1XA 2Z8EA 3H6UA 3I3VA 4YU0A 3N6UA 1MY0A 3KBRA 5AA3A 2UVHA 5I57A 5I59B 1R6ZA 4LZ8A 4H67A 3SESA 3RUMA 4HW8A 4GXSB 2XXXA 3CFLA 1I6QA 3FJMA 2B3FA 1DSNA 4I9DA 2I6EA 1LSTA 5BUUA 3KN3A 1S9TA 2NOOA 4H5GA 4R73A 4U1OA 2P0SA 3N94A 3WAFA 2Y7RA 3U92A 1JEUA 1OMPA 1OVTA 3PUVE 4Q8RA 4KYDA 2P1SA 4YZZA 4YKKA 5CMMA 1URSA 5HBCA 1UQWA 3MP6A 3PMXA 2DWAA 2UYFA 3LUYA 3BKIB 4OFJA 3HN0A 3VVDA 3MVXA 5I57B 2G29A 3USDA 4XKRA 2I3WA 5CMCA 2XXRA 3HV1A 5EHSA 2DE2A 4I62A 4UACA 1MM7A 2XXQA 1NL5A 3UN6A 3RT6B 3FVGA 5DTBA 1Y3QA 3L6HA 4P11A 1LAFE 3A3UA 3OELA 4E0XA 3O6IA 1Y1MA 1IXIA 2F36A 5CBSA 1URDA 5CI5A 3C35A 1LCFA 1XHYA 3UIFA 4E0WA 4G8NA 3K1MA 4HCYA 1Z7NE 3Q28A 4F19A 3VVFA 4BDLA 3W9WA 1B3EA 1US5A 1R9LA 2H99A 2DXYA 1FQAA 1N04A 1NNTA 1SD3A 4XTCQ 3RPWA 4ELQA 1N76A 4U4XA 1I6BA 2O69A 1Y9UA 4IGRA 1VE4A 3FXRA 3OMBA 4GL0A 1A8FA 1LAHE 3SEXA 1RKMA 1YPNA 5L9MA 5A5XB 4Z0IA 2THIA 4ZZEA 5M2VA 1H44A 4NTLA 1OVBA 1FTMA 1MM6A 2Q2AA 4RPOA 3LSLA 3FV2A 1I69A 1XVYA 4XXUA 4OERA 3T9VA 3S4UA 1NNFA 3IL1B 3L6GA 3MW0A 3G3JA 2X7PA 4BDNA 3I6VA 1N84A 4O3BA 1SBPA 2UYEA 1B40A 3UP9A 2V84A 4G8MA 2XHDA 4MLQA 3UORA 3OENA 4QSDA 4NF4A 5K2YA 2Y7IA 1JW4A 2VOZA 3KG2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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