5DEXB

Crystal structure of glun1/glun2a nmda receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-acepc
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
280
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of subunit selectivity for competitive NMDA receptor antagonists with preference for GluN2A over GluN2B subunits.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 81
structure length 279
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB02
3IR1A 2VP1A 1SI1A 1DOTA 3HHFA 5I59A 5ISUA 4MH5A 2I49A 4NF8A 1IUDA 1SW1A 3TCFA 2I58A 1L5TA 4C0RA 1DTZA 2B3BA 4NF6B 4TQUQ 3OO6A 1ZTYA 4IO5A 1WVJA 2XHDA 1SQYA 1Y1MA 1IXCA 1H76A 3IO6A 4FIMA 5H8SA 3KN7A 4QRZA 1D4NA 1POTA 4MF3A 1CB6A 1OVBA 5KZTA 2OCUA 1BIYA 3PD8A 3FATA 3RTWB 3O6GA 2F7AA 4ONYA 3VXBA 4GRKA 3CFLA 2Q89A 3P7IA 1MQIA 2Q9TA 2I4CA 2QL3A 1LFHA 1RYOA 4MBPA 3MVXA 3CR9A 3IJXB 2AL4A 2E1SA 2AYSA 3G7WA 1B7ZA 2GFEA 1KWHA 2Y7WA 1LCFA 3G3JA 3OSQA 5AA4B 4Z7EA 4N07A 3MC2A 1B5IA 3TEPA 5TPAA 3K1MA 3O29A 1SW5A 1B3GA 1ZU0A 5AA2D 5AA1A 4HS7A 4XKRA 5HM4B 1A55A 4EXLA 3M3LA 2E0SA 2ONRA 1MY0A 1B7HA 3A3CA 2PVUA 4RXLA 2F6PA 2Q2AA 3SDFA 4LZ5A 4QHQA 1Z7ME 4LVQA 5KDTB 1VR5A 2Z23A 3TZAA 3GZGA 4OEVA 1MQHA 1EH3A 4EXKA 3T9XB 3RN8A 5DVJA 3JV9A 4KQPA 4N13A 4QFOA 4ELRA 2NVUB 1LB8A 1SVXB 4F18A 3H03A 2O1MA 3HPIA 1UTBB 4GOTA 3VE1B 3K1NA 2V25A 2YPNA 1A54A 4ZDMA 1VFDA 3K01A 3K6XA 5ELVA 5A5XB 3ILUB 3RNNA 1B6HA 1B5HA 2D5WA 2FYIA 3O2AA 2HZKA 3TQLA 1IXGA 1QKAA 4OEUA 3KOSA 1F9BA 3FV2A 2OLBA 4I1DA 5AA2A 4G4PA 3OMBA 1MXXA 2IEEA 4JWOA 2UXAA 3PV0E 4JBZA 1DPPA 3CFXA 4PETA 4U22A 1QUKA 3MZ9A 3OOAA 2F35A 1Y3PA 2O68A 5LOMA 4NF4B 4C1TA 4U4SA 3PPNA 3B6TA 1FTLA 4OWDA 4Q0CA 3EN3A 4XKQA 4NEDA 3KN8A 1PB7A 4OVJA 2F6GA 1ZJLA 4RY1A 2ZYOA 4ZEFA 4G68C 5HBCA 3PPQA 2DSFA 1MXVA 5CMCA 4DCYA 4PFWA 1XOCA 5H8NB 1II5A 1MXYA 4Q5TA 4WKMA 1R1NA 1P1OA 3CIJA 5H8FA 1DTGA 2CZLA 4F1YA 5JTYA 2H5YA 3SEWA 4FAJA 3TTKA 4FEDA 2ESNA 3U93A 2XX7A 4NF5A 1IITA 5I57A 2UVIA 4DXBA 4OFJA 2O69A 2P1SA 3N6UA 3PUVE 1NH7A 3RUMA 2QS2A 1DMBA 3S9LC 4P0GA 4UA8A 2I3WA 3MVZA 1Y20A 3N6TA 3IL1B 4U21A 3UP9A 4I62A 5ITPA 3RTFB 3T9UA 1LGBC 4XXUA 2DP8A 2VGQA 1RKMA 2RINA 4FJPA 1IXIA 4G8HA 1A7LA 3PPRA 3VVFA 1LB9A 4MFIA 3TAJA 1B3FA 4PE5B 1Y9UA 4X9TA 3MP8A 4POWA 2DQVA 3K6VA 2B3FA 5FHNA 4ECFA 3IOWA 4H0WA 4F2OA 3OO8A 4YB5A 3TMGA 4RPOA 3K00A 2HQ0A 2HEUA 1I6AA 2Z8EA 3QUFA 1B4ZA 4BDNA 2XXTA 3VXCA 2REJA 4JSOA 1MPBA 4E0WA 1H44A 3CSBA 4OERA 2Z22A 3MWBA 2H25A 1GVCA 2A5TB 3L6HA 1B0HA 3FUZA 3KGCA 3TTLA 4WXJA 1B58A 1OIBA 1B4HA 3DLNA 1B3EA 4ESXA 4JB7A 4NF6A 3E13X 2G29A 3GLBA 3FVGA 4YKKA 4YZZA 1Q35A 2ALUA 3H3GA 3MVYA 3Q25A 4BDRA 2PBWA 2I6EA 4EQ9A 1XHYA 1FTJA 1MPCA 1A99A 1FTMA 2XXQA 4XKPA 3C9HA 3FIRA 1SD3A 1UTHB 1FQDA 2PYYA 3U1OA 4X1BA 2DWAA 2OWTA 4GL0A 3T9VA 1URGA 1GTKA 3U94A 3OEKA 1B05A 4TOZA 2GRVA 3EHSA 4QFPA 1LCTA 2V84A 4WEPA 1BTJA 3KJTA 4EUOA 5AA4A 3T93B 1LFIA 3O9PA 1MXUA 3IJOB 3LSLA 4F2QA 3UN6A 3I3VA 5CMBA 5AE4A 3VFJA 2UVHA 3Q26A 3R7XA 3MP6A 4IY5A 2AIXA 4TLLB 2DS9A 1FQEA 3TTRA 4R73A 1Y4TA 2H4IA 3C34A 5KCJB 3PMXA 4OETA 1O7TA 4H65A 2KLFA 1M5DA 5KDTA 3U8QA 4ELPA 1S9TA 5JEIA 3M8UA 1LAXA 3U72A 2VHAA 4KFQA 1A8FA 2XXWA 3PMWA 3UORA 2PT1A 5DVIA 1JEVA 1LLSA 1M5CA 5I2KB 4QSCA 4KCCA 1OVTA 4IGTA 3QIMA 4FATA 1MXWA 4BDOA 4U1ZA 2ZNUA 4ZE8A 1UTBA 1XT8A 4JDFA 5EHMA 4KR5A 5A5XA 3FVKA 1OLAA 1EZ9A 1EZPA 4IGRA 1POY1 1MM7A 5TU0A 1D9VA 4RJZA 2O7UA 3S9MC 1I6BA 3FZVA 4O3BA 1FTOA 1QULA 3QK6A 3A3UA 4EDPA 3HCQA 4H8IA 4U1OA 4F29A 4G8NA 1JVXA 3G3IA 2VOZA 1S7YA 5AA3A 2V93A 3IB0A 4F3GA 4FORA 1J1NA 2M8CA 4YMAA 3EPEA 1BKAA 2F36A 3B7DA 3KOTA 3OXNA 4HTGA 4K3FA 5I58B 3KN3A 3IORA 4F3SA 4GFRA 1LAHE 1NNTA 2XD2A 1MS7A 1B0LA 3K2DA 4PFTA 4G2ZA 4OQOA 4YKJA 2Q88A 3U92A 3G3HA 1P1UA 3EHUA 3H6TA 3SEXA 1ATGA 3PUYE 2XXPA 1QKBA 4F3BA 2GHAA 4G68B 1NH8A 4N6PA 2DOJA 4RA1A 2OJTA 4F1VA 2F78A 1HSEA 1N0TA 1Y1ZA 2PX1A 5EYFA 3C35A 5DYHA 3FASA 1AH5A 5DVFA 4RK2A 5CRYA 1R9LA 1YCJA 3GXAA 1P1WA 1D3KA 2Y7PA 4OTEA 3VLWA 1QW0A 3MPKA 4I8CA 1B40A 3E3KA 4ZEDA 3FV1A 2I0BA 4BDQA 2NWJA 3B6QA 1B9JA 3VV5A 4P11A 3L6GA 4QSDA 2I48A 2DE2A 3TTMA 2XXIA 4HW8A 4MLVA 3FXRA 2H9BA 3QXMA 1ELJA 1NMUA 4OFLA 1FQBA 3M3KA 1NNKA 3TUSA 2V3QA 3E9XA 3Q29A 2UVGA 3TODA 1JW1A 3HSTA 1VE4A 4NTLA 1ZMGA 3K0VA 3CG1A 2DVZA 5I2NB 4EF1A 2NXOA 3C4MA 4P0IA 2RKMA 4O3AA 2Z8FA 1BLFA 2DVCA 1URDA 1MDQA 2A5TA 3V8XB 3FGSA 4Q30B 4AB6A 1MG1A 3RLFE 1JNFA 4DE8A 3PUWE 3CSGA 4GQOA 1M5BA 2HAUA 2G93A 3IX1A 2YJPA 5L9SA 3S9NC 2DWIA 3FVNA 3V89B 2ZYNA 2ABHA 4MLQA 3IAZA 4DXUA 3CI8A 3MVWA 1TXFA 1B46A 3SEVA 4ZS9A 1NNPA 2X26A 3LR1A 4KI0E 4GVOA 1Z7NE 3I5OA 4YAHX 4DXCA 2X7QA 3O66A 4M4GA 3DP6A 1UTHA 2DWJA 3H6UA 4RYAA 2Y84A 2ZYMA 1B2HA 2DYXA 5J1DA 4M1VA 2DXYA 4XKNA 4NWCA 3ZS6A 3QUJA 2RC7A 3CVGA 3H6WA 1QUJA 1Y4CA 4R75A 1NKXA 4F39A 2HZLA 5BUUA 1D9YA 5H8HB 5IKBA 3UK4A 3HO7A 4R6HA 4ND9A 3VVEA 4OMBA 3T66A 1ANFA 3N94A 2XX8A 3T96B 5I56B 3MAMA 2UYFA 4R72A 4F31B 4AB5A 3DP4A 1QJMA 3FVOA 4OZ9A 1JQFA 1QVSA 2BJJX 4IO6A 2R9JA 3ZKLA 4BDLA 1DPEA 1IEJA 4KYEA 1ZIUA 5I2KA 1UIVA 1B7UA 1MY1A 4GXSB 5CMMA 4EQ7A 3PD9A 3G3GA 1N7WA 1MY4A 3FXUA 3RT8A 4FEBA 5L9OA 1JETA 2ONSA 3USDA 4U2RA 1NNFA 3O28A 3PPPA 3D4CA 3PUXE 3TCHA 5I84A 2LAOA 4PFUA 4R2BA 3AXFA 1M5EA 3C31A 5CBRA 3KSJA 1MH4A 4I9DA 2I4BA 4KYSA 1LBCA 5TP9B 1A40A 3H4ZA 4IB2A 1IXHA 3OENA 1P1QA 2XXUA 2O7IA 3OEMA 4QSEA 3TFLA 2UVJA 4YKPA 1MM6A 3MW0A 1MPDA 1H43A 5IAIA 4F19A 4ELOA 4OHNA 2NOOA 3H7MA 4KD5A 1I69A 2UYEA 5I58A 3B6WA 3K02A 4NE4A 2XXHA 1N3XA 1OQHA 3PU5A 3ODBA 3DM0A 4H67A 4HCWA 3PPOA 2OK2A 3S9EA 1MH3A 5FHMA 1SW4A 4YICA 3TKDA 2Y7KA 4XIGQ 4R6YA 4H5GA 2ONKE 4DLDA 3H6VA 1B1HA 4GIZA 4ZEKA 4WEDA 4F22A 3E4RA 5L9MA 3KZGA 3I6VA 2RCBA 4DIGA 1TT1A 2DWHA 4Q8RA 4AQ4A 3ZKKA 4GL8A 4G68A 1FQFA 2Q8JA 3QSLA 3R26A 1EU8A 3R6UA 3RT6B 2O51A 2QJEA 5H8QB 2XXYA 4F3PA 3V83A 1IIWA 3KJ7A 1URSA 1AIVA 1VSOA 3N5LA 2FA7A 5EHSA 4IO7A 3QAXA 3CRBA 4OESA 2F8DA 3WAFA 5CBSA 2QS4A 1IQ7A 3FJ7A 3MQ9A 3S2VA 2DXRA 3W15C 3SERA 4IY6A 4LONB 4ELQA 3EQ1A 3C33A 2I3VA 3MPLA 1MRPA 1WODA 2RCAA 2F97A 3ILTB 3VLUA 2I0CA 5FHOA 3SETA 1FTKA 3PGFA 4G77A 5K2YA 4GLIA 1NL5A 3H06B 1BP5A 2GHBA 4ZZEA 4U4XA 2F7BA 1HSLA 2QSXA 4NF4A 2Y7IA 5I2NA 2W7YA 3SEUA 1XVYA 3SEYA 2O84X 3RY3A 5BWJA 4X48A 1ZLQA 4F1UA 3LC8A 2ZMBA 3IB2A 4ZEBA 5ITOA 2VD2A 5CMKA 4KHZE 4R6KA 1H45A 5B70A 5F1QA 3CG3A 2RC9A 4GF8A 1R9QA 4O3CA 1O64A 3W9WA 5H8NA 4NMYA 1Q1KA 1EZOA 4THIA 4LATA 1MXZA 3WAEA 3BKIB 1FCKA 3K1PA 3GBAA 3ZSFA 4QFKA 4IO2A 1PEBA 1SI0A 2OBGA 1SYHA 1AMFA 3K6UA 3N26A 3MZBA 2HCAA 3KG2A 4BDMA 5FTIA 5F7VA 3DP8A 3IOUA 2PMSA 4ISUA 2GH9A 4FECA 5FTHA 5DEXB 3S4UA 3MUQA 1N3WA 1I6QA 4JWXA 3Q28A 1GR2A 2R6GE 4ZECA 1S50A 4PQJA 3HV1A 1B32A 1IZ1A 2ZXTA 1B3LA 4X1DA 4R9GA 1N84A 1UQWA 3K6WA 1LSTA 3LSXA 1T0KA 1MY2A 1XC1A 1US4A 3JYRA 3F11A 5ICTA 1R6ZA 3MP1A 2NUVA 2Y7RA 1FW0A 3EHTA 2HAVA 3LSWA 1MDP1 2F5XA 4QFNA 4JSDA 3BBRA 5DTBA 3LBSA 3VLVA 2AL5A 3RQTA 5H8HA 1GGGA 3ECRA 1B5JA 4U23A 2D21A 5I59B 3IK6B 5M2VA 4ZEIA 4NF8B 4KYDA 5JK4A 1SDXA 1FQAA 2HFBA 4LZ7A 1NFTA 3MJNA 3MZ1A 5I56A 4EF2A 1RYXA 4R74A 2QPQA 3BFTA 2O6AA 4GXAA 1US5A 4POXA 4YB6A 3JZJA 5B7DA 2ANJA 3UGWA 3PUZE 4DCXA 2XD3A 3TTNA 4H5FA 2YLNA 5L8DA 3OELA 2WKYA 1FQCA 2QS1A 3Q27A 4KPTA 1B52A 2OZZA 1YPNA 3IB1A 4PP0A 4LP2B 4H6DA 5TP9A 3C36A 1PDAA 4IO4A 2X7PA 1MQJA 5TPAB 4ZZAA 3PMVA 2DE3A 4RK9A 2PT2A 5HPQA 3G3KA 3TELA 2REGA 3VVDA 2QS3A 1XVXA 2ZNTA 5DT6A 1PC3A 4R9FA 4BLAA 4NWDA 3EF7A 3TQWA 4R2FA 4QFLA 1YAEA 4Z0IA 4GWOA 2P0SA 3RGYA 2QMWA 4DZ1A 5CC2A 1B1XA 4RPNA 1P99A 3T9HB 4L17A 1JVYA 4C1UA 3C32A 3A09A 2IA4A 3OO7A 3MBPA 4H1XA 2P2AA 3IO4A 4ESWA 1ZKBA 1TFAA 2B65A 5KCJA 1N7XA 1MY3A 2A5SA 3KEIA 2ZNSA 4OYVA 2RF1A 1ZBMA 1TFDA 4PFYA 4YMBA 2VD3A 3D4GA 1OMPA 5CI5A 1PB8A 2H98A 2XXRA 1SBPA 1B51A 4JWYA 3VDFA 5AA2B 5ICQA 2F34A 5H8QA 3OD7A 3LSFB 2V3UA 3O6HA 1HSJA 4LZ8A 1OLCA 4YKIA 2ZYKA 4G8MA 4E0XA 4LA9A 1DSNA 4YU0A 3TYHA 4ZE9A 1VFEA 3HN0A 1LBBA 4GD5A 1JW5A 4UACA 3TDJA 2F7CA 2XX9A 3UA8A 1PBQA 2THIA 3DELB 4TLMB 3FJMA 3IOTA 1AL3A 1GV8A 1AOVA 1USYH 1B3HA 1Y3NA 5H8FB 3FD3A 1SW2A 1MQDA 2FNCA 5JTYB 2CMOA 3HHGA 4FE8A 3THIA 2O1LA 1O63A 2QRYA 3RPWA 1WDNA 4NF5B 3OSRA 4HCYA 4LQ2A 5I57B 4RNSA 4OXVA 1N76A 4OFOA 3UIFA 1CE2A 1LAFE 3QYTA 2OWSA 4KCDA 4JXIA 3OO9A 3TPAA 1H3DA 2V3TA 3T22A 2HXWA 2RC8A 1LAGE 3GBBA 3LUYA 2Z8DA 5K2XA 2XXXA 4XTCQ 2Q2CA 1Y3QA 3KBRA 3O97A 2QMXA 3FXQA 3V5AA 1QUIA 3CFZA 2H99A 1OQGA 4EQBA 5CM6A 1TWYA 3M3FA 4LQ5A 4IO3A 4OENA 1JW4A 3SKPA 1A8EA 2XXVA 2D3IA 1MQGA 1XS5A 3KFMA 4QF9A 3O6IA 1USYE 5DEXA 1N04A 1JEUA 1M5FA 3W9VA 3KSXA 4YB7A 3BFUA 1YTVA 3G3FA 1PB9A 1SYIA 3K4UA 1LFGA 1P1NA 3TCGA 3ONMA 2DE4A 4LUBA 4DDDA 1UIUA 2R71A 3SESA 3IOVA 4H8JA 1PBPA 3FJGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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