5DT6A

Crystal structure of the drosophila glur1a ligand binding domain complex with glutamate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
GSYDRNHTYIVSSLLEEPYLSLKQYTYGESLVGNDRFEGYCKDLADMLAAQLGIKYEIRLVQDGNYGAENQYAPGGWDGMVGELIRKEADIAISAMTITAERERVIDFSKPFMTLGISIMIKKGTPIKTPEDLTMQTDVNYGTLLYGSTWEFFRRSQIGLHNKMWEYMNANQHHSVHTYDEGIRRVRQSKGKYALLVESPKNEYVNARPPCDTMKVGRNIDTKGFGVATPIGSPLRKRLNEAVLTLKENGELLRIRNKWWFDKTEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Glutamate receptor 1
total genus 88
structure length 266
sequence length 266
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A02
3VLVA 4GD5A 2D21A 3PV0E 4F3BA 1MPBA 2DE2A 3MC2A 2R9JA 5B7DA 2ZYMA 2H5YA 3SEXA 2I49A 3M3FA 3C34A 3M8UA 4O3BA 1Q35A 5DVJA 2E0SA 3T9HB 4O3AA 3WAFA 3IJXB 4G4PA 2ABHA 4EF2A 1SQYA 4EDPA 2E1SA 2HXWA 1FQAA 4FATA 3DP4A 3LSFB 3CVGA 2F34A 3TUSA 3GLBA 2H9BA 2DVCA 3CFXA 3SERA 3O29A 2R6GE 2ZYOA 3TODA 1LBBA 1IXIA 4LUBA 3G3JA 1BKAA 2A5TB 1OQGA 4U21A 3SEVA 1JNFA 4IGRA 3KJTA 4KFQA 2F35A 4KPTA 4AB6A 2Q2CA 1R9LA 3W9VA 4PE5B 4TLMB 3IOUA 1IUDA 3KSXA 4G8HA 2XXQA 3TTRA 3VVFA 5FTIA 3U72A 1S7YA 1RYOA 1DTZA 1FTMA 3G3FA 1B1HA 3UA8A 3I5OA 4QFNA 4LP2B 2O6AA 4G68A 3TELA 1B1XA 1SD3A 3K01A 3VFJA 1MY0A 1LCTA 2Z8DA 3IOWA 1JVXA 3USDA 1FTJA 4I1DA 3TTLA 1MXXA 3CR9A 2ZNUA 4H5GA 1QKBA 4DCYA 3C33A 2QS4A 3MP6A 3MVZA 2H25A 4EUOA 1FW0A 3MQ9A 3UGWA 1B40A 2CZLA 2ZMBA 3FVNA 2F78A 2UYFA 3KOTA 4OYVA 2Y7IA 3OO6A 1BLFA 3TMGA 1DOTA 5CMKA 3C36A 1QW0A 1P1UA 4G68B 1MPCA 1PB7A 2D5WA 5EHSA 5JEIA 4R72A 3IX1A 3U1OA 5I58A 3VDFA 1BP5A 1JEVA 5BWJA 1US5A 4GL8A 3F11A 1PC3A 2RF1A 3CSBA 4R6YA 5CRYA 3FUZA 4YKPA 3GZGA 2GFEA 3DM0A 1TFAA 3C35A 2Z22A 3MJNA 3MVYA 3HPIA 4NF5A 3IJOB 3UN6A 1B5JA 3G3HA 4LZ7A 1B0HA 4IO3A 2DE3A 4R75A 2ZXTA 2I4BA 1R6ZA 1B46A 4C1TA 3PPQA 4PFUA 2NUVA 3O6GA 4BDQA 3K02A 5I58B 2XD2A 2RC9A 1NH8A 2BJJX 1PEBA 3THIA 5CMCA 3ODBA 4IO5A 1B7UA 3TCGA 1EZOA 4BDRA 3TZAA 1LAFE 1LGBC 1SW1A 3OMBA 4WEDA 1H43A 4F31B 3KJ7A 4FE8A 3M3LA 1D3KA 4NF5B 1Y3QA 3VV5A 3IOTA 3O66A 5H8SA 4OENA 4OMBA 4QHQA 4KCDA 4OFJA 5AA3A 3TTNA 4F1YA 4BDOA 3LUYA 3UORA 5L9OA 1MH4A 4Q0CA 4RJZA 3ONMA 2P2AA 3CSGA 1IQ7A 4P0GA 4U4XA 2D3IA 1B32A 3MBPA 4Q30B 2VGQA 4H0WA 3HO7A 4QF9A 1OIBA 3S9EA 3FASA 1NMUA 1OQHA 1R1NA 2XXIA 4ZEBA 2QRYA 1HSJA 3LSXA 2XXHA 2XHDA 2AL4A 2W7YA 3A3CA 4TOZA 1B3EA 4YB7A 1D9VA 2UVHA 1NNPA 1P1QA 2O1LA 1OVBA 4OEVA 2ZNTA 2DWJA 3CG3A 4C0RA 3KZGA 1MXUA 4JWOA 3VLWA 4LQ5A 3V83A 2ONSA 3O97A 4QFOA 4OEUA 3N6TA 5CBRA 4G2ZA 3U8QA 3OOAA 5B70A 4U4SA 2WKYA 3GBBA 2GHBA 3FXRA 3C4MA 4NE4A 2DVZA 4FAJA 4HS7A 4JWYA 4KYDA 2GHAA 3LBSA 5FHMA 3I6VA 1I6BA 3IB0A 1JETA 4JXIA 4NF4B 4HCYA 4JSOA 1URGA 1TT1A 4DXUA 4ECFA 4ELRA 2YLNA 1ZU0A 3SEUA 1B7ZA 1MXWA 1M5CA 2Y7PA 3UK4A 3FZVA 2KLFA 3MP1A 1AMFA 1B51A 2I48A 4KR5A 1VSOA 1B05A 1BTJA 1USYH 2F7CA 1T0KA 2Y7KA 3H6UA 3O6HA 5L9MA 2X7PA 3PMWA 3MZ1A 1P1OA 4IY5A 3N26A 4JDFA 1HSEA 3VXCA 4Z7EA 4GQOA 3GBAA 2QMWA 4OHNA 4WKMA 5BUUA 1Q1KA 4F1UA 2ANJA 3T93B 1DMBA 4FIMA 4H8JA 1I69A 3FGSA 5H8FA 4YKJA 1SW2A 4R6HA 3R7XA 3DELB 3RUMA 4Q5TA 4E0WA 2PBWA 1LFHA 2OJTA 3CI8A 2UVJA 4GVOA 4PFYA 3OENA 3MPKA 3K6WA 3D4GA 5KCJA 4XTCQ 3LSWA 3BBRA 1JVYA 4NEDA 5K2XA 3G3GA 1MRPA 2I58A 1YPNA 5TPAA 3TKDA 2XXPA 1XC1A 3E3KA 4GRKA 1F9BA 3QSLA 1S9TA 2Y7RA 1FQFA 3MAMA 3TTMA 4X1BA 3RT8A 1XS5A 3N5LA 2DS9A 5H8FB 3VVEA 1ZBMA 1D9YA 2I3WA 3P7IA 2V93A 3ILUB 3OEMA 1O64A 1MDQA 4IO7A 3BFTA 3T66A 1IXGA 2OWSA 1ANFA 5ICQA 4JBZA 4EXLA 5KCJB 2F36A 2O69A 2ONRA 4H6DA 1VFEA 4MLVA 5TPAB 5DVIA 1B3HA 5ITOA 1OLAA 1SI0A 3O2AA 3H6TA 3CG1A 4ZEIA 2V25A 1MXVA 4NWCA 1QUJA 1EZ9A 1B0LA 4OVJA 2OK2A 5CMBA 1EU8A 3U92A 1Y4CA 3K00A 2V3TA 3WAEA 4OFLA 4X48A 3OEKA 3KN7A 2G93A 3FVKA 3TQLA 4I9DA 5AA2A 2XXXA 4BDMA 4ELOA 4OQOA 1MY2A 4MH5A 3ECRA 4F3PA 1XT8A 3ZSFA 2YJPA 3KN3A 3K2DA 1CB6A 3MZ9A 1I6AA 4ESXA 2XD3A 3VE1B 4KI0E 2Q8JA 2OBGA 4QSEA 2V3UA 1PB9A 2F5XA 2QS2A 3OELA 3I3VA 1ZTYA 4YKIA 4U1ZA 3FV1A 3Q26A 4DDDA 3OSQA 2G29A 4KYSA 5AA2B 1QJMA 1US4A 4I8CA 5ELVA 1ZKBA 1XVYA 4PFWA 5CMMA 4YICA 3R6UA 1QULA 4XIGQ 2RCBA 3T22A 4DXCA 5CI5A 3H6VA 4IY6A 2HEUA 2DWIA 2RINA 3RTWB 2ESNA 1B52A 5DVFA 4GF8A 5CM6A 5FHNA 4E0XA 2GRVA 2AIXA 2M8CA 2V84A 4KYEA 4M4GA 4PFTA 2NVUB 1A99A 2CMOA 3K6UA 4N13A 3GXAA 5TP9B 1B3FA 4R74A 3QUFA 2Q9TA 3PUVE 2OLBA 2VD2A 4P11A 5DT6A 1UTHB 2HZLA 3FJGA 1IZ1A 4IGTA 4ZS9A 2R71A 3LC8A 4F29A 1MS7A 2FA7A 3N6UA 3K6VA 1NNKA 3SDFA 1Y1MA 3SEWA 4KCCA 4HW8A 1TXFA 2B3FA 1L5TA 2VD3A 3C9HA 2XXUA 1OMPA 1ELJA 2PT1A 3PUZE 4MBPA 4RY1A 4G77A 2P0SA 2O7IA 1EZPA 3JV9A 4OFOA 3FXUA 4ZEKA 1MY4A 3T9XB 1DPEA 2H99A 5HBCA 1H45A 3Q29A 4THIA 3OD7A 2PMSA 4IO6A 2Z8EA 1XHYA 1MQJA 4LONB 4ZE9A 1WODA 3SETA 5I59A 5EYFA 4LZ8A 4OESA 3RNNA 1Y9UA 4ZE8A 1N7XA 2XX7A 4YB5A 4GLIA 3MP8A 4JSDA 3PU5A 4F39A 3FXQA 2O84X 4YMBA 1ZIUA 3E9XA 3G3IA 3E4RA 1UIVA 1MQDA 3TTKA 2UYEA 1O7TA 2OCUA 1A54A 3PUWE 3ZS6A 1N84A 1MDP1 4NWDA 3TDJA 1BIYA 4QFPA 2HFBA 4ND9A 1I6QA 1URSA 5AA4A 5FTHA 1O63A 1PBPA 2Z8FA 5I2KA 1SI1A 1B5HA 3EHSA 1DSNA 4WEPA 4NF4A 4UA8A 2O7UA 3EQ1A 3S2VA 3QUJA 3T9VA 1FTOA 1MY1A 5I59B 4ESWA 1KWHA 4Q8RA 1IIWA 1LFIA 3OXNA 4PETA 1A8FA 4YZZA 4R9FA 3EHUA 2XXVA 1B4HA 3RN8A 3FIRA 4OETA 3KBRA 1J1NA 1JQFA 3TFLA 3H7MA 3QK6A 3V8XB 5I84A 2THIA 1UQWA 4BLAA 2LAOA 2Q2AA 3T9UA 5LOMA 3PPNA 1A40A 1GV8A 3W15C 5AA4B 1A8EA 1Y4TA 3H4ZA 4G8MA 1JEUA 3OSRA 2DQVA 4LATA 5I2KB 1IXHA 3LR1A 4EXKA 4DXBA 3KSJA 3MPLA 5KZTA 3TYHA 3LSLA 3SKPA 1SW4A 4QSCA 2DSFA 3C31A 5ISUA 4ELQA 5DEXA 4IB2A 4GL0A 4DIGA 3KFMA 2F7BA 1POY1 4GXAA 4XKNA 4IO4A 3EN3A 3D4CA 2ZYKA 4RK9A 2UVIA 4YKKA 3K6XA 2F6PA 2Q89A 2I6EA 5H8HA 2F97A 1HSLA 3K4UA 3C32A 1AIVA 1FQDA 5H8QA 2O1MA 1JW1A 2AL5A 3MWBA 4LA9A 1PB8A 4RNSA 1MQHA 1LAHE 4N6PA 4POXA 1QVSA 3QXMA 1UTBA 4NF6B 4ISUA 3H6WA 4QSDA 5DEXB 2DP8A 1B6HA 4HCWA 3VLUA 5AE4A 3VXBA 3IO4A 5K2YA 3S9LC 5JK4A 3TAJA 1B3GA 4YAHX 4HTGA 2DYXA 2PX1A 2X7QA 4R2FA 1QUIA 2DWHA 5H8HB 3O28A 2RKMA 2DXYA 4RPOA 1AOVA 4DLDA 3CFLA 1NL5A 1JW4A 4MF3A 3UIFA 3V89B 5H8QB 5I57A 3MVWA 1PBQA 3M3KA 3DP8A 2NXOA 3UP9A 4NF8A 2HAVA 1N3XA 4FJPA 2I0CA 1H3DA 1YTVA 3JZJA 1UTBB 3S9NC 2GH9A 4FEBA 2Y84A 5ICTA 1VFDA 4POWA 2HQ0A 1IXCA 3IL1B 3EPEA 4G68C 4G8NA 1PDAA 2B65A 1FTKA 2F8DA 5H8NA 2IEEA 1Z7ME 4N07A 1N76A 5AA2D 2RC7A 4YMAA 3PMXA 4EQBA 3PGFA 1M5DA 1NKXA 1P99A 4F3GA 5I57B 3HHFA 3IR1A 2ZYNA 2O68A 1Y3NA 2AYSA 3A09A 3HHGA 3DP6A 1N0TA 1NNFA 2IA4A 3SEYA 5HM4B 4KD5A 4NF8B 1H44A 4TQUQ 2H98A 1FTLA 1LCFA 3HSTA 3OO9A 3H06B 4R6KA 5IKBA 3EF7A 3TQWA 4U2RA 4OXVA 3HN0A 1FCKA 4F1VA 1URDA 4FECA 4U22A 5H8NB 4XKPA 4ZEFA 3IB2A 3JYRA 4JB7A 4TLLB 2VOZA 5J1DA 1A7LA 1SDXA 3RGYA 3N94A 1P1WA 4GXSB 1B3LA 3QYTA 4H5FA 2RCAA 1N04A 1N3WA 4XKQA 1CE2A 1B5IA 3FJ7A 2OWTA 1MXYA 3RY3A 1ZMGA 4RA1A 2XXWA 3KOSA 2F7AA 4MFIA 1QUKA 3CFZA 3SESA 5TU0A 4AQ4A 4QFKA 1NNTA 4ONYA 3IOVA 5TP9A 2OZZA 1FQEA 3DLNA 3B6TA 3OO8A 2DOJA 1UTHA 1VE4A 3IO6A 3ILTB 2DE4A 4ELPA 5KDTA 1MH3A 5FHOA 4F2OA 2HAUA 4ZZEA 3FVGA 4K3FA 4RK2A 4O3CA 4PP0A 5I56A 3KG2A 2P1SA 4Z0IA 5JTYA 4R73A 1Y20A 4DCXA 4H65A 1A55A 5DTBA 3Q27A 1TFDA 2QS1A 3CIJA 3Q28A 3FD3A 1GR2A 1SBPA 1USYE 1LBCA 3B7DA 4EQ9A 1Y3PA 2XX9A 4KQPA 3B6WA 1WVJA 4KHZE 4GFRA 1Z7NE 5KDTB 1R9QA 3OO7A 5CBSA 3O9PA 4R9GA 4R2BA 1N7WA 5DYHA 1Y1ZA 3RTFB 5I56B 1DTGA 1ZJLA 5JTYB 2QS3A 4EQ7A 3PPRA 4P0IA 3T96B 2QSXA 1M5EA 3EHTA 1YCJA 1IEJA 5A5XA 4XXUA 2B3BA 3BFUA 3MUQA 3PPOA 4NMYA 1LLSA 2FNCA 3VVDA 1XOCA 1GVCA 3R26A 5I2NA 1XVXA 4GWOA 1MXZA 3H3GA 5AA1A 3L6GA 1LSTA 1MM6A 3PMVA 1B4ZA 3BKIB 2HZKA 3KGCA 3S9MC 1M5FA 4FORA 1GGGA 2VHAA 3IK6B 3RT6B 1IITA 1B7HA 1WDNA 2V3QA 4LQ2A 3FATA 3K0VA 2XX8A 1MY3A 4RPNA 2QPQA 3G7WA 4LVQA 2ONKE 3PUXE 1YAEA 3MZBA 4F18A 3RLFE 1OVTA 1B58A 4C1UA 4OERA 5F7VA 4BDNA 4GOTA 5A5XB 2QJEA 1MQIA 4H8IA 4YB6A 2HCAA 3MVXA 2I0BA 1JW5A 3AXFA 3U94A 5I2NB 4RXLA 2UXAA 4L17A 2YPNA 3RPWA 2XXYA 3K1MA 1B2HA 1TWYA 1SYHA 2PYYA 1M5BA 3K1PA 2UVGA 1RYXA 3FJMA 2I4CA 4PQJA 4WXJA 2I3VA 5M2VA 5F1QA 3ZKKA 2DXRA 3IORA 3TCHA 2XXRA 4ZDMA 4DZ1A 1DPPA 1SVXB 4QRZA 5ITPA 2A5SA 4X9TA 3CRBA 3TPAA 4EF1A 2O51A 1D4NA 4OWDA 1LB9A 3K1NA 3V5AA 1NH7A 3S4UA 3MW0A 5CC2A 1P1NA 2DWAA 2Q88A 2Y7WA 5L8DA 1LB8A 4H67A 3FV2A 4GIZA 4F19A 2REJA 3IAZA 3O6IA 2ALUA 3E13X 4UACA 4AB5A 2QMXA 4IO2A 1GTKA 1AL3A 2F6GA 3L6HA 3HV1A 4NF6A 2RC8A 4LZ5A 1UIUA 2PT2A 3TEPA 1POTA 3KEIA 2X26A 1AH5A 3FVOA 3PUYE 1II5A 1MG1A 1H76A 4I62A 3HCQA 3A3UA 4U1OA 4H1XA 1B9JA 4DE8A 3H03A 1EH3A 2ZNSA 4OZ9A 1LAGE 1LAXA 4ZEDA 3PD9A 3G3KA 1MM7A 1SYIA 4F2QA 4OTEA 5IAIA 2QL3A 2XXTA 3IB1A 2FYIA 4FEDA 1SW5A 4M1VA 4QFLA 2H4IA 1QKAA 4X1DA 5EHMA 4MLQA 4F3SA 3Q25A 1S50A 3B6QA 3U93A 2PVUA 4F22A 4ZZAA 1MQGA 4YU0A 3W9WA 1RKMA 4U23A 3KN8A 1ATGA 3RQTA 3QAXA 5HPQA 3ZKLA 4NTLA 3TCFA 4XKRA 4JWXA 2NWJA 2NOOA 4RYAA 4BDLA 1FQCA 1OLCA 1FQBA 5L9SA 3PPPA 1LFGA 2Z23A 3QIMA 1MPDA 1ZLQA 1VR5A 4ZECA 3PD8A 2REGA 1NFTA 2A5TA 2VP1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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