5H8NB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with nam
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
285
structure length
282
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 282
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8nB02
1S9TA 5EHSA 1AIVA 2GHBA 3I6VA 3S9MC 4KD5A 2H99A 1JEUA 5ICTA 4PFYA 1TFDA 1PBQA 3FJMA 1B7ZA 3IJXB 2DYXA 1JQFA 1M5CA 1MQDA 3HCQA 1UQWA 1II5A 4EF1A 1SVXB 3SEYA 2X26A 4QRZA 3OEKA 3F11A 1F9BA 3K1PA 1NKXA 2VD2A 1MY2A 3RTWB 2DE4A 4F3SA 3W9WA 4R9FA 1D3KA 3K1MA 3HHGA 1RKMA 4R6YA 1TT1A 4ND9A 2VP1A 3DM0A 3DP4A 2RINA 5I57A 4ISUA 3VXCA 1XHYA 3QAXA 3LC8A 1Z7ME 1XOCA 3V8XB 5I2NB 3AXFA 4PFUA 4XXUA 1PDAA 4DCXA 2ZNTA 3CI8A 3TPAA 4G8MA 1M5DA 3IB0A 4BDMA 3D4GA 3M3FA 4NF6B 5A5XA 4NF5A 1SI1A 3IR1A 5TP9B 5I57B 1NMUA 1H3DA 1RYOA 2H5YA 4ZEFA 3FZVA 2UYFA 1A8FA 2F8DA 1T0KA 4LATA 3KFMA 3RPWA 1FTKA 4X1BA 1IITA 2P0SA 1B9JA 4KPTA 3RY3A 4IO7A 3UIFA 3PUXE 4PFTA 1ATGA 1BKAA 3G3KA 1MM7A 5ELVA 1VFDA 2GRVA 3TZAA 1UIUA 2A5TA 1LBCA 4WEDA 1B3HA 2OK2A 3PD9A 3S4UA 4GXSB 3ZKKA 4LZ7A 3K4UA 1M5EA 3LR1A 3EHUA 3FXQA 1QW0A 1LAXA 2XXQA 1VFEA 4YZZA 2F5XA 4TLMB 3CSBA 3TELA 4H1XA 3FIRA 2F35A 2YPNA 4IO5A 1GTKA 1Y3NA 4GF8A 3SESA 5H8HA 4U23A 4F1UA 4JSDA 3CRBA 3OMBA 1OLCA 1QKBA 2HQ0A 1MH3A 4RPNA 3PMXA 4IO4A 2H98A 1Y3PA 4FJPA 1LCTA 3ECRA 3ILUB 4OEUA 2RCAA 1JW4A 3TTNA 3VLUA 3H6UA 1A54A 3MVXA 4LQ5A 1Y3QA 3VVFA 1B1XA 2NOOA 1USYH 4MBPA 1XT8A 2I0CA 4JB7A 4PE5B 1TXFA 1MXYA 5I56B 3T93B 4GL8A 4GFRA 1ZTYA 4DDDA 1LLSA 3CFZA 4YB5A 1QUIA 4FECA 4C0RA 2Q88A 4FORA 2PX1A 3BKIB 3FV1A 3RQTA 4XKNA 5AA3A 1US4A 1FTOA 3OOAA 1PB7A 2H25A 3Q27A 3PMWA 2V3UA 1AL3A 2FA7A 1O7TA 2Q89A 1NH8A 4BDOA 3K02A 4POWA 2O7IA 3FD3A 5FTHA 5DEXA 1AMFA 1B3LA 2Y84A 3G3FA 4EF2A 4JDFA 2E1SA 3VDFA 2I4CA 3PPQA 2ESNA 5I59B 1GVCA 1YTVA 3N6TA 1URSA 2VD3A 3FVNA 1OQGA 4IO6A 4X9TA 4P0IA 1UTBA 4HCWA 3FXRA 4OMBA 2DWHA 1IXGA 3GZGA 4ZEIA 3UA8A 5ICQA 4JBZA 3M8UA 3SEWA 3ODBA 3MP1A 1IXIA 3TCFA 3OO7A 1OVTA 3V83A 3DP6A 3I5OA 2AL5A 2V93A 5H8SA 1BP5A 1MXXA 3IB1A 3GBAA 3RGYA 1FQBA 4IY6A 4ZEKA 4FIMA 3H3GA 2XXTA 1POY1 2KLFA 3K1NA 3OO8A 2PT2A 3S9EA 1LAGE 1MXZA 4IO3A 5FTIA 3C4MA 3UK4A 4RPOA 2GH9A 1Y1MA 1HSLA 1Y20A 4H65A 2I58A 1ZIUA 5KDTA 5K2YA 2D21A 3FJ7A 1N7XA 3PUYE 4QHQA 2Q2CA 3DELB 1VSOA 3RT6B 1UIVA 1VE4A 3THIA 3WAFA 3IOWA 4NF4A 4DE8A 3DP8A 4KYEA 3U92A 1N7WA 1N0TA 4YICA 1LBBA 3MPLA 2HEUA 3UP9A 4U4SA 3UORA 4GLIA 1ZJLA 2GHAA 1B05A 4QSDA 2OWSA 3H6TA 1FW0A 3ONMA 4YMAA 3FXUA 2DWJA 2ZMBA 1QULA 1B0HA 1Y1ZA 3DLNA 5CI5A 1MXWA 5L9OA 1XS5A 3K2DA 3L6GA 1SW2A 3MZ9A 1P1OA 3O9PA 1MS7A 4F39A 5FHNA 1S50A 5AE4A 5IKBA 3KN7A 5I84A 2LAOA 3A3UA 1IXCA 1YPNA 3IO4A 5BWJA 3ZSFA 5I2KB 2QS2A 2XXXA 4YKIA 2AL4A 4QSCA 2QL3A 3QIMA 2ZXTA 3FASA 4FEBA 1M5BA 3H03A 4OFOA 2HAVA 4ZS9A 1FQCA 4MLQA 2V3QA 2XXUA 2ZYOA 1ZMGA 3FUZA 3EHSA 4HTGA 4M1VA 5H8QB 3EF7A 4O3CA 5JK4A 4THIA 3I3VA 3MZBA 4P0GA 3RT8A 2XX9A 3IORA 1ZLQA 4OYVA 1SYIA 4I1DA 4ZECA 5B7DA 4Q8RA 2IA4A 3TCGA 5I58B 2O51A 2RC7A 2V84A 5CMBA 2VOZA 1MXVA 3MUQA 4N6PA 4BLAA 5JTYA 3SETA 2HXWA 4LQ2A 5L9MA 1A99A 2V3TA 4R72A 1JW5A 4X1DA 2RKMA 5I2NA 1R1NA 1JVYA 4LP2B 2ZNUA 1S7YA 4F18A 2G29A 4H67A 4H8JA 5DVJA 3OD7A 3EHTA 4GWOA 4YKKA 4H6DA 4R75A 4NF6A 5JTYB 1MH4A 4QFPA 2Y7IA 4QFNA 5TP9A 1EH3A 1A55A 3IK6B 2XD3A 1XVYA 3O6HA 1GR2A 3SEVA 2RF1A 3OEMA 1B40A 3KN8A 5TPAB 1MPBA 2H9BA 3IAZA 3T96B 1P1QA 4WXJA 2VGQA 3U93A 3OENA 4NF8B 3OSRA 4IB2A 4JSOA 4AB6A 1LB9A 4DLDA 3S2VA 2UVIA 4TQUQ 4U4XA 3HHFA 2UYEA 4KYDA 1LGBC 1DTGA 1GV8A 4ELOA 5AA2B 3TFLA 1PB8A 1Y4CA 3MP6A 3HSTA 3PPNA 3WAEA 3KJTA 5IAIA 1P1UA 5F1QA 1DPEA 4R73A 4NE4A 4KR5A 4I9DA 1LCFA 1H76A 3M3LA 2DP8A 5AA1A 1WVJA 1MPDA 2XX7A 3EPEA 3K6VA 1DMBA 4QFLA 5KZTA 2HAUA 2ONRA 5ISUA 1CB6A 1UTHB 4PP0A 3KJ7A 1B3GA 3FVKA 1CE2A 3CR9A 3C34A 2CMOA 4EQ7A 1MXUA 3CSGA 4ESXA 2WKYA 4F3PA 4F22A 3V5AA 2V25A 4OQOA 4G68B 3VVDA 2W7YA 1JW1A 4IGRA 5EHMA 4R2BA 1EU8A 1MQIA 1GGGA 1R6ZA 3RLFE 1L5TA 3MC2A 1N3WA 2ALUA 4XKRA 2O6AA 5I56A 1SBPA 4R6KA 1BIYA 4TLLB 4OERA 1VR5A 2QMXA 3RTFB 2O69A 1B3FA 4KCCA 1A40A 1Q1KA 4F29A 1QJMA 3LSFB 3SEUA 3IOTA 2OCUA 3KBRA 4OVJA 4LZ8A 1SYHA 2F6PA 4L17A 3K6UA 3H06B 3QK6A 1IIWA 3T9UA 3LSWA 5CRYA 2Z23A 1SQYA 4YB6A 1N76A 4R2FA 3G3HA 2B3FA 1FQDA 4GL0A 2QS3A 1IXHA 1US5A 3FVGA 3OO6A 3GBBA 3QXMA 2PMSA 2I3VA 1POTA 3MBPA 1OLAA 2PVUA 3E9XA 4R74A 1B6HA 3RUMA 5K2XA 4IGTA 2DOJA 3KSJA 3IL1B 5I59A 1URDA 1QUJA 4IO2A 1TWYA 1FCKA 3C33A 4WEPA 1HSJA 1ZBMA 4DZ1A 4BDNA 1BTJA 4MF3A 2P2AA 4GQOA 3HO7A 3C9HA 4NWCA 4GVOA 3VE1B 3PPPA 2F78A 2P1SA 3O6GA 4I8CA 2X7QA 2Q9TA 1N04A 3OELA 3TEPA 4EQBA 1XC1A 5AA4B 1DPPA 1H45A 3TQWA 4BDRA 3QUFA 2F6GA 1Y4TA 3VXBA 4E0WA 2HZKA 3CG1A 2NVUB 3FVOA 4RY1A 3Q29A 4FATA 3E3KA 3BFTA 2Y7KA 3TODA 4EXKA 3PPRA 1SW1A 1I6BA 3T22A 4ZEBA 1USYE 2OLBA 1H43A 1LAFE 1FQAA 1MY0A 1H44A 4ZE9A 2UVJA 4AB5A 4OENA 2ONKE 2R6GE 4YKPA 4RNSA 3O2AA 1MY3A 1PBPA 3PMVA 4F1YA 1LAHE 4G8NA 1B4HA 3D4CA 1FTLA 2QS4A 4U22A 1Z7NE 1B46A 3C31A 4HS7A 3UN6A 3TMGA 2UXAA 4R6HA 2DWIA 2RC8A 3A3CA 1OIBA 2HZLA 2DXRA 3HPIA 2O84X 2AYSA 4NTLA 4GXAA 4EUOA 5I2KA 4OTEA 4ONYA 3RNNA 2Z8EA 3KGCA 3U94A 1MG1A 1B2HA 5L9SA 3K0VA 2FYIA 4YMBA 3IOVA 2PT1A 3CVGA 4OZ9A 4ELPA 3MVYA 1DSNA 3MVZA 3O97A 5H8QA 1O64A 3O66A 1I69A 1QVSA 2DE3A 2ZYKA 5KCJB 4G68C 3TTKA 2NUVA 4Q5TA 1O63A 2XXVA 2ZYNA 1M5FA 4GIZA 1SW5A 3O6IA 3USDA 2I48A 4F31B 2XD2A 5I58A 2CZLA 1B0LA 2HCAA 3MP8A 5HPQA 1MPCA 3UGWA 2BJJX 4Z0IA 5CC2A 4GRKA 3MAMA 4C1TA 3B6WA 4TOZA 5JEIA 3KSXA 3KZGA 3ZKLA 1IUDA 3T9HB 2F36A 1QKAA 3C36A 3QUJA 4NMYA 1P99A 4DIGA 3FV2A 3EQ1A 4LA9A 2VHAA 5CMMA 1JVXA 3LSXA 4LZ5A 4F2QA 4F2OA 3RN8A 3TUSA 1KWHA 2OZZA 3SKPA 3U72A 1B7HA 3MW0A 3R26A 4H8IA 1OQHA 4P11A 2F97A 3A09A 5HBCA 3CFXA 3FGSA 4KHZE 4YB7A 4EDPA 3G3GA 1OMPA 2DVZA 4H5FA 3VLWA 3PUWE 1B32A 5TPAA 3VV5A 1PEBA 1SI0A 4H0WA 2RCBA 1B5JA 1P1WA 1WDNA 5CBSA 4F19A 4RA1A 5J1DA 4DXUA 4NF8A 1MQJA 5CMKA 4YAHX 1RYXA 3PD8A 4PQJA 3M3KA 1MQHA 3QSLA 4MFIA 3MWBA 2IEEA 2UVGA 2Y7RA 4M4GA 5AA2A 3FJGA 2DQVA 2DVCA 3JZJA 1FTMA 1Q35A 1B1HA 4ZEDA 4QF9A 2GFEA 2X7PA 5LOMA 4XKQA 3IB2A 4ZZEA 3VFJA 4OETA 2D5WA 3Q25A 3U1OA 3OSQA 3LUYA 1NL5A 3IX1A 3MJNA 3H6WA 1XVXA 3MPKA 4ELRA 4GD5A 1J1NA 4ECFA 3N5LA 4YKJA 4JWOA 3TTMA 1A7LA 4KI0E 3V89B 1ZKBA 2DSFA 3SDFA 1URGA 2F7BA 5ITPA 1UTHA 4QFKA 4LUBA 2ANJA 5CBRA 3N6UA 3B6TA 4G8HA 4F1VA 3G7WA 5DT6A 5ITOA 3TTLA 2OWTA 1MDQA 1TFAA 2DWAA 3Q26A 2UVHA 4G68A 1B51A 2PYYA 3ZS6A 4QSEA 4FAJA 3SEXA 2F7CA 2G93A 2QJEA 3H6VA 4LVQA 4KQPA 3H7MA 3R7XA 1JEVA 1AOVA 2XXHA 4MH5A 3PPOA 2I3WA 3GXAA 5A5XB 5FHMA 4NF5B 2H4IA 4DXBA 1B52A 4F3GA 3E13X 1NNPA 4OHNA 1MRPA 5H8FA 3U8QA 5FHOA 4FEDA 4RK2A 3L6HA 3PU5A 4OESA 5M2VA 3T9XB 2DE2A 1EZPA 1EZOA 1LSTA 4DXCA 2YJPA 5DTBA 4PFWA 5DVIA 5H8NA 3KN3A 1D9VA 3N94A 1MM6A 5F7VA 1DTZA 3TTRA 2A5TB 3GLBA 4N07A 2Y7PA 4POXA 3VLVA 1Y9UA 5H8FB 3LBSA 1OVBA 4ZZAA 3PUZE 2O7UA 2I6EA 2F7AA 3TAJA 2A5SA 2I0BA 4F3BA 4ZE8A 1N84A 4HW8A 4XIGQ 3TQLA 5H8NB 2ONSA 4EQ9A 4G2ZA 5H8HB 4ELQA 1YCJA 1LFHA 1MY4A 2Z22A 2Q8JA 2QSXA 1PB9A 4FE8A 2XXWA 4O3BA 2XXYA 2QPQA 2XX8A 2D3IA 3JV9A 3K6XA 2REJA 1QUKA 2DXYA 2ABHA 2PBWA 1B5IA 1FTJA 1HSEA 4O3AA 5AA4A 4OXVA 1B5HA 4OFLA 2I4BA 2ZNSA 1FQEA 3CIJA 2DS9A 4OEVA 4DCYA 3G3IA 4UA8A 4U21A 3TCHA 3N26A 1I6AA 2F34A 3PGFA 2XXRA 4AQ4A 1LFGA 5DVFA 3CG3A 3O29A 4U1ZA 4WKMA 1ANFA 4NEDA 3K6WA 3T9VA 1JNFA 4ESWA 1PC3A 2THIA 4IY5A 3MQ9A 4I62A 3C35A 3SERA 1NNTA 2OJTA 3CFLA 1EZ9A 2R9JA 1ZU0A 1IQ7A 4Z7EA 4JWXA 3IO6A 4GOTA 3LSLA 3BBRA 2FNCA 3TDJA 3KEIA 1A8EA 2Y7WA 3Q28A 4U1OA 4MLVA 5DEXB 2QMWA 3S9NC 5HM4B 2NWJA 1SD3A 4U2RA 4RJZA 4E0XA 2O1LA 4QFOA 4KCDA 2ZYMA 1UTBB 2HFBA 4BDQA 2M8CA 1D4NA 2Q2AA 1I6QA 4X48A 3OO9A 1IEJA 5L8DA 1SW4A 2YLNA 5AA2D 3H4ZA 1BLFA 1NNFA 4OWDA 4RXLA 2XHDA 3TYHA 4Q0CA 1R9QA 1D9YA 3MVWA 3KG2A 4XTCQ 5KCJA 3T66A 2E0SA 4HCYA 1B7UA 2OBGA 1MY1A 3OXNA 3B7DA 5CM6A 2Z8FA 3HN0A 4JXIA 2XXIA 5CMCA 1YAEA 3ILTB 1MQGA 1NNKA 2O1MA 3KOSA 2QRYA 4JWYA 5KDTB 4RYAA 1FQFA 1AH5A 5B70A 3FATA 4OFJA 3K01A 4EXLA 3MZ1A 3K00A 4H5GA 4Q30B 2NXOA 4YU0A 4C1UA 5TU0A 1DOTA 2REGA 4PETA 4XKPA 3PV0E 2B65A 4NF4B 1NH7A 4KYSA 3E4RA 3JYRA 4K3FA 3P7IA 3G3JA 1IZ1A 1NFTA 4RK9A 3W9VA 3TKDA 3O28A 1LFIA 1R9LA 2RC9A 4G77A 5BUUA 2R71A 3EN3A 1B4ZA 3PUVE 3VVEA 5DYHA 3B6QA 3HV1A 1B3EA 2B3BA 4R9GA 3R6UA 1LB8A 4UACA 3QYTA 5EYFA 1B58A 1WODA 4G4PA 1P1NA 3C32A 3KOTA 4KFQA 1N3XA 2I49A 1ELJA 1SDXA 2Z8DA 2O68A 1JETA 3BFUA 4ZDMA 3S9LC 2AIXA 4NWDA 3IOUA 3IJOB 2QS1A 4N13A 4BDLA 3W15C 4LONB 2XXPA 1MDP1
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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