5HPQA

Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from pseudomonas aeruginosa bound to acetate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
ESRLDRILESGVLRVATTGDYKPFSYRTEEGGYAGFDVDMAQRLAESLGAKLVVVPTSWPNLMRDFADDRFDIAMSGISINLERQRQAYFSIPYLRDGKTPITLCSEEARFQTLEQIDQPGVTAIVNPGGTNEKFARANLKKARILVHPDNVTIFQQIVDGKADLMMTDAIEARLQSRLHPELCAVHPQQPFDFAEKAYLLPRDEAFKRYVDQWLHIAEQSGLLRQRMEHWLEYRWPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Cyclohexadienyl dehydratase
publication title Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from Pseudomonas aeruginosa bound to acetate
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa (strain atcc 15692 / pao1 / 1c / prs 101 / lmg 12228)
total genus 85
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature ec 4.2.1.51: Prephenate dehydratase.
pdb deposition date 2016-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA02
2H98A 1O7TA 2CZLA 4K3FA 2FNCA 2B3FA 3IL1B 3EF7A 2V3TA 4TLMB 4OERA 4R73A 3TELA 1GGGA 1R9LA 1WODA 1IXHA 1JEUA 1AOVA 1MDQA 2F8DA 3DM0A 4QSEA 3OO7A 4AQ4A 4F2QA 4IO3A 1UTHA 1B1XA 1MH4A 3A3UA 4WEPA 1Q35A 4H8IA 1B3HA 1R9QA 5JK4A 1ZBMA 5TP9A 4G4PA 4ELQA 2XXYA 2XXHA 1MY0A 2OBGA 1DPEA 4KD5A 1L5TA 2AL4A 1D3KA 2QS4A 3FXQA 4IO4A 3K1PA 2XHDA 2A5SA 3G3FA 3EPEA 3MQ9A 1OLCA 3PV0E 1PB8A 3IB1A 1P1NA 5HM4B 1MRPA 4TQUQ 3PGFA 1FQDA 4H5FA 3VDFA 4ECFA 4G77A 5H8HA 3AXFA 1ZMGA 4RPNA 4QHQA 4GFRA 4F3SA 2O6AA 4LP2B 3V5AA 4G8HA 3TAJA 1JQFA 3FJ7A 5ITPA 3LUYA 1ZU0A 3MVWA 2QS1A 3H7MA 2H4IA 4C1TA 4YICA 3W9VA 1IXIA 4ONYA 1I6AA 2PBWA 1A40A 1FTOA 1AMFA 3HN0A 4ZE8A 5BWJA 5FTIA 1ZLQA 4N13A 3IAZA 5FHOA 1SI1A 1M5FA 2H5YA 3JYRA 4DXCA 3UORA 4KYDA 2NUVA 4Q0CA 2F34A 3VVDA 1MXXA 3TPAA 3QIMA 3G3GA 2HEUA 3MP6A 4HCWA 3OEKA 2OK2A 3KJ7A 1UQWA 3IOTA 2RKMA 3K1NA 3V8XB 1USYE 3MWBA 5CM6A 3U94A 1IEJA 3MPLA 3T9XB 4U1OA 1B46A 3T9VA 3TMGA 2GRVA 3B6WA 4XKPA 2AIXA 4GVOA 4WEDA 4MF3A 1US5A 2THIA 2XXUA 1S7YA 2GHAA 4C1UA 3PU5A 2V93A 2QRYA 4JWXA 1BP5A 1SW5A 2YLNA 3CSBA 4NMYA 2ZYOA 4LZ8A 4AB5A 1B7UA 1GTKA 4L17A 4DE8A 3IOUA 4QFLA 5EYFA 4GL8A 3SDFA 1LAXA 3DELB 2H9BA 3TYHA 1A99A 1LLSA 2F5XA 3RTWB 1BTJA 2RCBA 3SEYA 1A55A 2PYYA 1T0KA 3MVXA 4KYEA 5ICQA 4OXVA 5JEIA 2F36A 1PDAA 4NWDA 3V83A 3TTLA 3N94A 3C32A 2AYSA 1FQBA 3N6TA 1M5EA 3VVEA 1NNTA 3RPWA 5AE4A 2R9JA 1MQHA 2B65A 1B3EA 1PBPA 3V89B 4BDMA 1F9BA 2B3BA 4TLLB 1B51A 5JTYA 1I69A 4ZS9A 1AL3A 3FVKA 1R1NA 5AA2D 1MXUA 3TODA 3MVYA 5L9MA 3U1OA 3CFXA 3N26A 1XOCA 1SW2A 4PFUA 4I1DA 4OZ9A 1CE2A 4XKRA 2PT2A 1LB8A 2RCAA 1UIVA 4OENA 1PBQA 1QUIA 4OEVA 3FV1A 4MBPA 1B3GA 2XXXA 3RQTA 2O1LA 4JXIA 1AH5A 5ITOA 4BDLA 4YKKA 1NKXA 1MXZA 5KCJB 1LAHE 2HZLA 4PQJA 1MH3A 4G68C 3M8UA 3B6TA 5HPQA 5FTHA 1LBCA 2FA7A 3PUVE 2D5WA 1TFDA 2Z8FA 1OMPA 3B6QA 2X26A 4H0WA 4LUBA 1B4ZA 4RA1A 3SEUA 3FXRA 3UGWA 4PE5B 4PFTA 1B0LA 2ZXTA 4NF4B 3O6IA 4H8JA 5B7DA 4OHNA 1LB9A 1USYH 3FATA 3C34A 4JBZA 5ELVA 1B05A 3BFUA 2I49A 2NOOA 1MXYA 4R9GA 2ZYNA 3FGSA 2PX1A 1EZ9A 2F7CA 1QUJA 5I2KB 2GH9A 5L9OA 2REGA 1FQCA 1FTKA 1I6QA 3GXAA 3ONMA 4KHZE 5CBRA 2RINA 3SESA 1Q1KA 1AIVA 5A5XB 1P1OA 2I0BA 2VP1A 3PPOA 2HAVA 3IO4A 1GV8A 1B7HA 3S9LC 5B70A 1VSOA 4GIZA 2IA4A 4LONB 3TTKA 5CRYA 3KN7A 5KCJA 2DVZA 4X48A 3Q26A 1H76A 4ELPA 1TXFA 3GZGA 4M4GA 4RPOA 1B40A 2DE2A 3KG2A 1GVCA 2UYEA 3PPPA 4F22A 4YB6A 1FQEA 3BBRA 2F6PA 5H8FB 4POXA 1FQFA 1MY3A 3TTMA 5ICTA 3KGCA 3L6GA 4I9DA 3UA8A 2V3UA 3SEWA 1S50A 4NF4A 1PB9A 1IUDA 5KZTA 4DLDA 3T9UA 3ZKKA 3MBPA 1O63A 4RK2A 4FATA 4OESA 3HHGA 3VFJA 5TPAB 3OELA 1UIUA 3C4MA 5K2XA 4F2OA 3H6WA 4TOZA 1A54A 1LAGE 1MS7A 1VFDA 5L8DA 2OWTA 4NF5B 5I2KA 3TQWA 3FIRA 3KOTA 4E0XA 4F1UA 4KQPA 4YAHX 4ESXA 1QJMA 1VE4A 5I84A 1OVTA 4FIMA 4OETA 5A5XA 5FHMA 4ZDMA 2DWHA 2DWJA 4R72A 3RN8A 4O3BA 4NTLA 2I3WA 3N5LA 1BLFA 3OO6A 3KBRA 3MZBA 4JWOA 1D4NA 3H4ZA 3IB2A 1POY1 2DOJA 5BUUA 3M3LA 1MQDA 3G3HA 1R6ZA 1N3XA 4R2FA 3HPIA 1OIBA 3VLUA 4ZEIA 4YMBA 3TKDA 3MUQA 4X9TA 5H8FA 3T22A 3C33A 1OLAA 3KN3A 3CG1A 2WKYA 4XIGQ 1Y3PA 1B2HA 3E3KA 3U72A 3G7WA 1MXVA 2QS2A 2XXRA 3FVGA 4LQ2A 4IO2A 5TPAA 4JB7A 5H8SA 1J1NA 3K0VA 2NVUB 2UVGA 3MPKA 3RGYA 4M1VA 3H6VA 4U22A 4MFIA 4R6YA 4BDOA 1JETA 1ANFA 2OWSA 4P0IA 4NF5A 1B7ZA 3C36A 5H8NB 1Y4CA 1DSNA 4GLIA 4OEUA 2ZNTA 3E4RA 1I6BA 3CI8A 3KEIA 4YB5A 2O7UA 2QJEA 3CG3A 4YU0A 1NNFA 3FUZA 2E0SA 3PMXA 3R7XA 1NMUA 2Q9TA 2FYIA 3O97A 2Q89A 1FTLA 4DDDA 4YMAA 1D9VA 1N7XA 4OQOA 1EH3A 1SI0A 4NF8B 3Q28A 3MVZA 4HTGA 1ZIUA 4YKIA 3TCFA 2G29A 4H6DA 3RT6B 2I6EA 3I5OA 2CMOA 2AL5A 1UTBB 4NF6B 2RC7A 3W9WA 2OZZA 3Q29A 4QSDA 4UA8A 2XD3A 3DP8A 5I2NB 2P2AA 4KI0E 5DEXB 4IGRA 1BIYA 1XHYA 4X1DA 3K2DA 2F6GA 4JDFA 5M2VA 1IQ7A 4KR5A 1XT8A 3SERA 3MC2A 1A8EA 4JSOA 1M5DA 3VE1B 3SKPA 3UK4A 2O1MA 2ZMBA 1B6HA 3PD8A 2V84A 4N07A 2Y7IA 2Z22A 1FQAA 1N84A 3D4GA 5ISUA 4EQ7A 1JW4A 4ZEKA 4E0WA 3PUYE 3JV9A 5FHNA 4KYSA 4Q30B 3T66A 2KLFA 1IIWA 2Z8EA 3CFZA 4ND9A 1Z7NE 1MPBA 5H8NA 3THIA 3H06B 5AA4B 2REJA 3TCHA 4BDQA 3FASA 1NNKA 4ELRA 2I48A 1A7LA 1OQGA 2UYFA 5DVIA 2Q2AA 1ATGA 2I0CA 1Y3NA 1LAFE 1IXCA 3ZS6A 4GOTA 4ZEFA 2HCAA 1URSA 4NF8A 2A5TB 3T96B 3O6GA 1SW4A 4F1YA 1N76A 1S9TA 2W7YA 1MY4A 2QL3A 1DOTA 2VHAA 1JVYA 1UTBA 4NF6A 4ELOA 4F29A 4EQBA 3S9MC 3PPQA 5I2NA 3C35A 3K6WA 5DEXA 3QYTA 4P0GA 1DMBA 2E1SA 4WXJA 4F39A 4FECA 4FAJA 5CBSA 3HSTA 3K6UA 3C31A 3LC8A 2G93A 2QSXA 2I3VA 2RF1A 2DP8A 3H03A 2P0SA 2UVJA 3SETA 2Q8JA 5DT6A 2DWIA 5CC2A 2RC8A 4R6KA 1P1WA 3O6HA 2O7IA 1DTZA 1IZ1A 3TFLA 3IB0A 4LATA 1JVXA 1Y4TA 1FTMA 4YKPA 3IR1A 4MLVA 3MZ1A 2D21A 1RYXA 1LSTA 2HXWA 2XXVA 5AA4A 3S9EA 3KN8A 3MZ9A 1QKAA 4PFYA 3CR9A 4QSCA 3VVFA 4YB7A 4HCYA 4H65A 3DP6A 3O66A 3K00A 3VV5A 2XX9A 1URGA 1HSLA 3LSLA 3ZSFA 2A5TA 1DTGA 3OD7A 1NH8A 2DXRA 4RY1A 5F1QA 4NEDA 1O64A 4GL0A 1Y1MA 3KJTA 1II5A 2VD2A 3EQ1A 4BDRA 3FJGA 1SDXA 2UXAA 2V25A 1CB6A 4IO6A 4LZ5A 4I8CA 2ZNSA 2Q88A 4UACA 4RYAA 4POWA 3FZVA 3UP9A 2QS3A 2QPQA 1XVXA 3DLNA 2HZKA 3USDA 4P11A 4Q8RA 3TUSA 3OMBA 1B32A 2F7BA 3G3IA 4F19A 1NH7A 3CIJA 2DE3A 3OSQA 3OXNA 4R74A 1HSJA 5F7VA 4XTCQ 2OJTA 3PPNA 3GBAA 3K1MA 1NFTA 2Q2CA 4YKJA 1US4A 3IOVA 2M8CA 3K4UA 3QSLA 1VR5A 2VOZA 1B3LA 3MW0A 1SVXB 2VD3A 2I4CA 3PMVA 1NL5A 2R71A 4QFNA 3GLBA 4WKMA 2I58A 4X1BA 3E9XA 5CMKA 3PUXE 3R6UA 1SYHA 5KDTB 3EHTA 3VLVA 1IITA 4ZEBA 4Q5TA 2ONRA 4DZ1A 3R26A 2DE4A 4QFKA 4LQ5A 4N6PA 2OCUA 4Z0IA 1D9YA 3C9HA 1TWYA 2O51A 2DSFA 2ZYMA 3OEMA 1YTVA 1MM6A 4PP0A 1LCFA 3MJNA 4G2ZA 3ILUB 2O68A 2BJJX 1SBPA 4IO7A 4AB6A 3DP4A 2O84X 3PMWA 3H3GA 3RNNA 3EN3A 3QXMA 4U1ZA 2QMWA 4ESWA 4GRKA 3LSFB 4QF9A 3OO9A 1B3FA 2YJPA 2NWJA 2XXQA 2ONKE 1ZTYA 3ILTB 2HAUA 3RUMA 4DCXA 3RY3A 1GR2A 1SW1A 2I4BA 3FJMA 2O69A 2RC9A 1POTA 1QW0A 1LFGA 3CSGA 3UN6A 1PEBA 1B4HA 2PT1A 3B7DA 4MH5A 4OWDA 4OTEA 4R9FA 1N04A 4GWOA 4ZE9A 1LGBC 2ABHA 4NE4A 1B9JA 1B5JA 4EF1A 3BFTA 2ZYKA 2F7AA 5CMCA 2R6GE 4DIGA 2V3QA 2PMSA 3GBBA 3FXUA 4R75A 1VFEA 4H5GA 3S4UA 2XD2A 3PD9A 1Y3QA 5I58B 1MPDA 5DTBA 4XKNA 1JEVA 2VGQA 3A3CA 2UVHA 4RXLA 4LZ7A 2XXIA 4KFQA 5KDTA 4RNSA 3M3KA 3HCQA 3K02A 4C0RA 3EHSA 1B0HA 1N7WA 1SD3A 5I59B 4I62A 5TU0A 3O28A 5EHMA 3O29A 4JWYA 4OYVA 1FCKA 2OLBA 1B1HA 4GF8A 1HSEA 5L9SA 4MLQA 4PFWA 3TQLA 3U92A 1MQIA 3OSRA 2HQ0A 3H6TA 4ZZAA 4ZEDA 4IGTA 1SQYA 3LSWA 2Y7RA 1KWHA 4QFOA 1EZPA 4O3CA 4GQOA 4JSDA 1Y20A 5I57B 2DXYA 3QUJA 4LA9A 4EXKA 2DQVA 1SYIA 1LBBA 1P1QA 3PUWE 4FE8A 4F3PA 2DS9A 2F35A 2YPNA 3G3KA 3KZGA 1TT1A 3H6UA 3PPRA 3T9HB 4U23A 4O3AA 1MM7A 3O9PA 3S2VA 1MQGA 4F1VA 3I6VA 3IORA 2XX8A 1N0TA 4QRZA 5I56B 1WDNA 3VXBA 1H44A 4G68B 3G3JA 2DWAA 5JTYB 4GXAA 4FEDA 1XVYA 4FEBA 4ZECA 5LOMA 4U2RA 2ZNUA 5IKBA 3CRBA 3EHUA 4IY6A 4H67A 3U93A 4OFOA 3OENA 1QUKA 4DXBA 1JW5A 4U4XA 5I58A 3D4CA 3RLFE 3FVNA 3KFMA 2XXPA 1OVBA 4GXSB 3UIFA 5I59A 3LSXA 1MY2A 1BKAA 5J1DA 2Y7PA 3IJOB 1B5IA 4HW8A 1MPCA 1YCJA 4EUOA 1NNPA 5AA1A 1B52A 1H43A 1JW1A 4THIA 4BDNA 4GD5A 4KPTA 1JNFA 3TDJA 3QK6A 3IX1A 1XS5A 4EXLA 3SEVA 2X7QA 5I57A 3TTRA 5DVJA 3A09A 4IB2A 4R2BA 4BLAA 4OMBA 3F11A 3VXCA 3WAFA 2DVCA 3IK6B 1A8FA 2GFEA 2NXOA 1MQJA 4EF2A 1M5BA 4IY5A 3IO6A 1YAEA 2Y7KA 3BKIB 4XKQA 4PETA 2ESNA 5EHSA 3KSJA 2XXTA 3IOWA 3LR1A 1P1UA 2X7PA 4OVJA 3VLWA 5I56A 4G68A 2PVUA 2F78A 3RT8A 2XX7A 5IAIA 2D3IA 5AA2B 2H99A 4NWCA 4F3BA 1RKMA 5CMBA 1XC1A 3JZJA 3ODBA 2GHBA 5HBCA 3E13X 1FW0A 2ALUA 1MG1A 2Y84A 5H8QB 4G8MA 3MP8A 3O2AA 4G8NA 1N3WA 3OO8A 2ANJA 4YZZA 1FTJA 5K2YA 1LFHA 4RJZA 3HO7A 3MP1A 4OFLA 3HV1A 2F97A 3TCGA 4OFJA 1ZKBA 3IJXB 4LVQA 1ZJLA 3KSXA 1MXWA 3PUZE 1Z7ME 4EQ9A 4Z7EA 1LFIA 3CFLA 3L6HA 3QUFA 2LAOA 4F18A 1IXGA 2Z23A 2XXWA 2Y7WA 1DPPA 1WVJA 2QMXA 4IO5A 1H45A 5AA3A 4RK9A 4H1XA 4R6HA 4KCDA 5CMMA 1URDA 1EZOA 4F31B 1PB7A 1H3DA 3OOAA 4EDPA 3SEXA 1P99A 5DVFA 3K01A 3TTNA 1ELJA 3ECRA 5CI5A 1OQHA 4ZZEA 3T93B 1PC3A 1Y1ZA 3I3VA 3QAXA 2IEEA 3TEPA 3KOSA 4DCYA 1TFAA 1LCTA 1YPNA 3FV2A 5AA2A 1Y9UA 3N6UA 1UTHB 3MAMA 4FJPA 4KCCA 3M3FA 3HHFA 3LBSA 4HS7A 4ISUA 4XXUA 1M5CA 1B58A 5H8QA 2UVIA 5TP9B 2DYXA 5DYHA 3W15C 2H25A 3Q27A 1RYOA 4U4SA 3WAEA 3P7IA 2Z8DA 2HFBA 3TZAA 1MY1A 3S9NC 1B5HA 1EU8A 2P1SA 1QULA 3FVOA 1QVSA 4FORA 3FD3A 1MDP1 2ONSA 3RTFB 4DXUA 4U21A 1QKBA 3K6XA 4F3GA 3Q25A 3CVGA 5H8HB 3U8QA 4QFPA 3ZKLA 3K6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H98A 2XXKA 1O7TA 4QXDA 4GWZA 2CZLA 1DK4A 5I3SA 4K3FA 2FNCA 1Q9DA 2B3FA 4MNCA 3IL1B 3EF7A 2V3TA 4TLMB 4OERA 4OA4A 4R73A 3TELA 1GGGA 1R9LA 1WODA 1DBZA 1IXHA 1JEUA 4AS4A 1AOVA 1MDQA 2F8DA 3DM0A 4QSEA 3OO7A 4AQ4A 4F2QA 1NV6A 4IO3A 1UTHA 1B1XA 1MH4A 3A3UA 4WEPA 1Q35A 4H8IA 1B3HA 1R9QA 1D9QA 4H46A 2VPOA 5JK4A 1ZBMA 5TP9A 4G4PA 4ELQA 2XXYA 1NV1A 2XXHA 1FSAA 1MY0A 2OBGA 1DPEA 4KD5A 1L5TA 4N6KA 2AL4A 5IZ3B 1D3KA 2QS4A 3FXQA 4IO4A 3K1PA 2XHDA 2A5SA 3G3FA 3EPEA 4KXPA 3MYUA 3MQ9A 1OLCA 3PV0E 1AWBA 1PB8A 4N91A 1FTAA 4HXVA 3IB1A 1P1NA 5HM4B 1MRPA 4JVCA 4TQUQ 4QBAA 1KZ8A 3PGFA 1FPDA 1FQDA 4H5FA 3VDFA 4ECFA 4UABA 4G77A 5H8HA 3AXFA 1ZMGA 4RPNA 4QHQA 4GFRA 4F3SA 2O6AA 4LP2B 3V5AA 4G8HA 3TAJA 4MIJA 1JQFA 3FJ7A 5ITPA 3LUYA 1ZU0A 3MVWA 2QS1A 3E79A 3H7MA 2H4IA 4C1TA 1RDXA 4YICA 3W9VA 1IXIA 4ONYA 1I6AA 2PBWA 1A40A 1LBZA 1FTOA 1AMFA 1IMFA 3HN0A 4ZE8A 5BWJA 1FBDA 4HE1A 5FTIA 1ZLQA 4N13A 3IAZA 5FHOA 1SI1A 1M5FA 3FXBA 2H5YA 3JYRA 4DXCA 3UORA 4KYDA 2NUVA 4Q0CA 2F34A 3VVDA 1MXXA 3TPAA 3QIMA 3G3GA 2HEUA 3MP6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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