5I2KA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kA02
1JQFA 2RCAA 2XXVA 3H4ZA 4FEBA 3KN3A 4DLDA 2I6EA 2I3WA 3IB0A 1OQHA 2QRYA 1SW4A 5CMKA 3KEIA 3DM0A 5L9OA 1SVXB 3OMBA 3MAMA 3C9HA 5JTYA 3G3IA 1LAHE 1PB9A 3W9WA 3ONMA 3SESA 4E0XA 4F22A 4O3CA 3B7DA 3OSQA 4WKMA 3FUZA 5JTYB 2F7BA 1PB8A 3S9EA 1MY1A 2VD2A 2I0CA 3MJNA 2I3VA 3MC2A 4LZ8A 4R74A 3C33A 1B5JA 3H6UA 3MVXA 3HCQA 3GXAA 5LOMA 4GOTA 3PUWE 1OVTA 1SYHA 1N04A 5JEIA 1T0KA 2G29A 2XXQA 4FJPA 3PUVE 1US4A 3VXCA 1XVXA 4F1UA 5H8FA 3H3GA 3GZGA 1MQHA 1OQGA 4HW8A 2CZLA 2UVIA 3DP6A 5IKBA 1LCTA 2DWHA 4XKPA 1USYH 3O6GA 3H06B 5H8FB 5ITOA 3V89B 1ZMGA 1RYXA 1P1QA 2QS4A 2FNCA 1DPEA 5KDTB 4DCXA 5DEXB 4IGTA 3MZBA 1ANFA 4G68A 2Y7RA 3T9XB 5KCJA 1B5HA 4K3FA 2REGA 2OK2A 2Y7PA 4KHZE 3BFUA 3T66A 1AL3A 3Q29A 3OEMA 1LFGA 2XXUA 3IAZA 2Y7WA 5KCJB 2ZYMA 5L9MA 4YKKA 3N5LA 1LB9A 5CMCA 1P99A 3JV9A 3EN3A 3VDFA 3ILUB 3KJTA 4H6DA 3VE1B 2DXYA 5EYFA 3KZGA 2ZYNA 3RLFE 4F3BA 3HSTA 4YICA 1D9YA 3EQ1A 2FYIA 2V93A 3U72A 3WAFA 4EXKA 3QSLA 2UYEA 2BJJX 2PMSA 2ABHA 3OEKA 1MXWA 4R2BA 3CFZA 1S50A 2D21A 1MM7A 4C1TA 4JBZA 1NFTA 2REJA 1XHYA 1POTA 4YB5A 4YMAA 3LSFB 1AIVA 4I62A 1SW1A 4YB7A 2QJEA 1DTZA 1B7HA 2AYSA 3JYRA 1YTVA 5FHMA 1B46A 2NUVA 1BKAA 4NE4A 1B58A 1Y3QA 1MS7A 4YKIA 2D5WA 1JEVA 4XIGQ 3TDJA 3SEWA 1MQDA 1B3LA 2HAUA 1IXHA 3QXMA 4G2ZA 1FTKA 1FQFA 4IO5A 3MVZA 3DP4A 2W7YA 2QS1A 4QFKA 4OFJA 4KPTA 2THIA 4X48A 3TQWA 2B65A 1XVYA 4ONYA 3L6GA 4E0WA 5I2NB 4F39A 2GHAA 4Z0IA 3PMWA 3HHGA 1FTLA 2AIXA 1POY1 3USDA 4LQ2A 3O9PA 4FORA 4MF3A 1S9TA 4YKPA 1RKMA 5JK4A 1J1NA 1MH3A 3U93A 2DE4A 4U23A 1MXVA 2NVUB 1FQEA 4R9FA 3ZSFA 1IIWA 1O64A 4R72A 4BDLA 4QFOA 5M2VA 2DS9A 4IY6A 1D9VA 2O69A 4F31B 4I1DA 1SD3A 4HS7A 3OO8A 3IB1A 2O1LA 2LAOA 4G8MA 3G3JA 4BDRA 3MZ9A 4MBPA 2RC9A 4U2RA 4PFWA 4OYVA 4KCCA 2XXHA 3PUYE 4OZ9A 2PX1A 1Y20A 4NWCA 3ZKLA 1N7XA 3UP9A 3FJ7A 3T9UA 4RNSA 2O6AA 2OJTA 3OENA 1B7UA 1B0LA 2NWJA 5I2KA 1FQCA 4R6HA 2AL4A 5DVJA 1URGA 2V84A 4M1VA 1JW5A 4U4XA 3MQ9A 1B6HA 5I2KB 4NTLA 1XS5A 4GLIA 3MP6A 4ZE8A 3A3CA 1M5FA 5I56A 2ZYOA 3TEPA 3RPWA 3T93B 4GXSB 4F1YA 4F2OA 3KN7A 3C34A 3IO4A 2XD2A 3E13X 5I56B 3TCFA 3PMXA 4JSDA 1LAXA 2HXWA 3MW0A 4NWDA 2XX9A 3CFXA 3O2AA 4YB6A 1ZKBA 4OMBA 3H6VA 1PC3A 2DVCA 2XXXA 1SDXA 1A8FA 3HHFA 4C0RA 3PD8A 2XXIA 3QYTA 3T9HB 4IGRA 4GQOA 3SERA 2Z22A 2HFBA 4DXBA 1N7WA 2NOOA 2RINA 2ZNSA 4EF2A 3TTRA 5CM6A 1FCKA 4PFUA 1TFAA 2I58A 4DZ1A 1GVCA 3M3FA 2XXWA 2ZXTA 4QSCA 4U1OA 2Q2AA 3O6HA 2D3IA 3G7WA 2DYXA 4GL0A 4OVJA 3K00A 3FV2A 3PU5A 4JB7A 1MXXA 3U94A 4ND9A 1H3DA 2F5XA 2VP1A 4F2QA 1SI0A 5B7DA 1VE4A 1NH7A 3AXFA 4PP0A 1H44A 2Z23A 3M8UA 1FW0A 3K6WA 4H1XA 4U21A 1P1NA 1VFDA 3A09A 1UTHA 3PUXE 4YAHX 1BTJA 1YPNA 4FEDA 4RY1A 3JZJA 4Q0CA 1UTHB 4RK2A 4X1DA 4U22A 1HSLA 3PMVA 3SDFA 4XTCQ 2DXRA 5BWJA 4P0GA 4GD5A 2RC7A 4JSOA 3I5OA 4MLQA 3KN8A 4XXUA 1XC1A 3FVOA 3M3KA 1NKXA 5CBSA 5I59A 1EU8A 1IEJA 4OESA 4WXJA 5AA1A 1Y9UA 4NF4A 3K6XA 4LZ5A 3CFLA 4FAJA 4N07A 5F1QA 3MWBA 1HSEA 5CMBA 3GLBA 3PUZE 1CB6A 1CE2A 4YZZA 3PPQA 2H4IA 4HCYA 3S9LC 1SW5A 3THIA 2E0SA 1SQYA 1P1UA 1BIYA 1Y4CA 2HQ0A 3FZVA 1WDNA 2V3TA 3C35A 3FVNA 1TT1A 4I9DA 2Z8DA 3T9VA 3MVYA 2Y7IA 3TZAA 4NF6A 1B9JA 3OO9A 3UIFA 4OXVA 4KYEA 3QUJA 3OOAA 4G68C 5A5XA 5CC2A 5ISUA 4H8IA 2A5TA 1D4NA 1LBBA 5B70A 1MQIA 4G4PA 2GRVA 4NF6B 2YPNA 1MXYA 1LCFA 4GWOA 5A5XB 1B1XA 2A5TB 1NNKA 3K1MA 4YKJA 3N26A 5HPQA 4QFPA 4GVOA 1SYIA 1AMFA 1LB8A 1LFIA 2XD3A 4R73A 1PEBA 5TU0A 1VR5A 3OSRA 4G68B 1MY0A 3A3UA 5H8QA 3C4MA 2Z8EA 4RXLA 1UIVA 4KCDA 3UN6A 4ECFA 2GHBA 3KJ7A 2OCUA 3LC8A 5CMMA 4OETA 3SEYA 5H8QB 4OFOA 4KR5A 1NH8A 1QUIA 1FQDA 2V25A 1UTBA 1US5A 1B4HA 3FGSA 4JWYA 3Q26A 4H8JA 3TQLA 4OERA 4RYAA 3RT6B 2ONKE 1UTBB 1URDA 4ELPA 1B7ZA 1FTOA 3RY3A 2O7UA 4F19A 1M5DA 5J1DA 3TKDA 3TTMA 4ZDMA 2UYFA 3ODBA 3K6UA 2Q89A 2XXRA 4R6YA 4IY5A 2VD3A 1MY2A 5ITPA 4QFLA 3OELA 3IL1B 3VVFA 4JWOA 2AL5A 2DWIA 5CBRA 5KZTA 2PBWA 1MPCA 4ZEIA 3EHTA 1N0TA 4F1VA 3C36A 2Z8FA 1L5TA 4LP2B 1VSOA 4R75A 4G77A 5BUUA 2DWJA 3UA8A 3B6QA 1Y4TA 4PFTA 4PE5B 2I0BA 3IOVA 3BKIB 4IB2A 1KWHA 2HEUA 1EH3A 2P0SA 1JETA 5K2XA 1IXIA 5AE4A 3K02A 1MY4A 3IJOB 4DE8A 1EZPA 2X7PA 4F3GA 2IA4A 4LA9A 1O63A 3VLUA 4OQOA 4H5FA 3RTWB 1P1WA 3K2DA 2UVHA 3P7IA 3KOTA 3O66A 2RCBA 2I4CA 1A8EA 1FTJA 3EHUA 1Y3PA 3VLVA 1AOVA 4F3PA 3QUFA 2DVZA 1QULA 4NF8A 1OLAA 4ELRA 1LLSA 5FHOA 2FA7A 1BLFA 1M5CA 3FATA 4EUOA 2DE2A 1NNFA 3UGWA 3MP1A 3EHSA 4NF8B 1NL5A 3TTNA 3S9MC 1H45A 4DIGA 1OVBA 2Y84A 3KG2A 2ONSA 1B0HA 2PVUA 4MLVA 4ELQA 1FQAA 1LBCA 3TYHA 1DPPA 3V8XB 1I69A 2B3BA 3RUMA 4BDMA 4IO7A 2G93A 1M5BA 1UIUA 4WEDA 4RA1A 2QS2A 1ZJLA 1LFHA 3WAEA 4R6KA 3MZ1A 5I58A 5AA2D 3PPOA 4EQBA 5AA2A 3CR9A 2DWAA 4DXCA 5I58B 4QRZA 1B5IA 4ZECA 3ILTB 5AA2B 1A55A 4TLMB 2P2AA 4BDQA 1I6AA 2ZMBA 2H5YA 1BP5A 3VLWA 3Q25A 3TUSA 4O3BA 4X9TA 4EQ7A 2QPQA 1TXFA 3OD7A 4H67A 1OLCA 1B40A 3CSGA 4ZE9A 1EZOA 1B2HA 4R2FA 2DE3A 3V83A 2DSFA 5CRYA 4EF1A 2HZLA 3IORA 3HV1A 4XKNA 4Z7EA 1DOTA 4ZEBA 3UORA 4ELOA 3RNNA 3IR1A 1VFEA 4M4GA 1AH5A 2HAVA 2X26A 2OZZA 1GR2A 2ALUA 5DVFA 5H8HA 3SKPA 5FTHA 2Q9TA 3UK4A 1NNPA 2WKYA 1MG1A 3E4RA 1B51A 3KFMA 1MDP1 2XXPA 2V3QA 3FXUA 5H8HB 2KLFA 3S9NC 1DTGA 1B3GA 4RPNA 3N94A 2I49A 1RYOA 5DT6A 1FTMA 3PPNA 3FASA 4OEUA 4DCYA 3FXQA 5IAIA 3E9XA 3PPRA 4LONB 3FD3A 1IXGA 3VV5A 1IQ7A 2F36A 4GRKA 1JEUA 1MQJA 1Z7ME 4QHQA 4IO4A 4C1UA 2HCAA 3KSXA 1DSNA 1ZIUA 4XKQA 3FJGA 1R1NA 2O68A 3RTFB 3I3VA 4PQJA 1MM6A 4FECA 4ZS9A 1B3HA 4JDFA 4GL8A 3CI8A 3VVDA 4GXAA 3RN8A 2XX8A 3CSBA 1MPDA 3H6WA 1MPBA 3OO7A 2OBGA 2R9JA 2RKMA 3SEXA 1A40A 4P11A 1O7TA 3TELA 3CG1A 2F35A 4F18A 1GGGA 4OHNA 2DOJA 5I59B 2HZKA 4PETA 3DLNA 2DP8A 1MXZA 4G8NA 4NF4B 1JNFA 4I8CA 2QMXA 5EHSA 3QK6A 4DDDA 4DXUA 3K0VA 1FQBA 4POWA 1MRPA 3R26A 5I84A 1JVXA 1MY3A 3SETA 2ZYKA 1MXUA 3H6TA 1SBPA 3H7MA 5HM4B 1B3EA 2ZNUA 4LQ5A 5FHNA 3HPIA 4XKRA 3LSXA 2RF1A 2XXYA 4Q30B 3IOWA 3U1OA 3CG3A 4QF9A 3W15C 4TLLB 1YAEA 3IJXB 4EXLA 2F7CA 4PFYA 3LBSA 3TPAA 2X7QA 4ESXA 5KDTA 5DEXA 3QAXA 1URSA 1S7YA 4UACA 4GFRA 3TMGA 2DQVA 1Y1MA 2YJPA 3MP8A 4ZZAA 4RJZA 4YMBA 3I6VA 4LATA 2QS3A 1ZBMA 2H9BA 1Z7NE 4QSDA 3FJMA 2O7IA 3VFJA 2QSXA 4F29A 4N6PA 4KYSA 1IZ1A 1QW0A 2CMOA 3F11A 4OENA 2O84X 1PB7A 3DELB 2GFEA 3VXBA 4L17A 3U92A 3GBBA 4X1BA 4R9GA 3D4GA 4AB6A 3B6TA 3CRBA 4P0IA 3T22A 1WODA 3B6WA 1N76A 2O51A 1UQWA 3CIJA 1TWYA 3G3HA 1PBQA 1XT8A 3BFTA 3ZKKA 5F7VA 3R7XA 2I48A 3CVGA 1ZTYA 1A54A 1N84A 4LUBA 3FIRA 2F6PA 3FXRA 4OFLA 1R6ZA 3G3GA 3FV1A 4ZEFA 1PBPA 5AA4A 4JWXA 3Q28A 3TFLA 4KYDA 4ESWA 4WEPA 2VOZA 4FATA 5AA4B 3O6IA 1GV8A 1NNTA 4QFNA 3HN0A 5I57A 2XXTA 3KGCA 1B32A 3MVWA 2UVGA 2Q8JA 3PD9A 3VVEA 2UXAA 4MFIA 1H76A 3FVGA 5I57B 1TFDA 1XOCA 2Q2CA 4OTEA 1MDQA 1JW4A 5ELVA 4ZEDA 1D3KA 3K4UA 1ZU0A 4F3SA 1NMUA 3RT8A 3KBRA 4H65A 1II5A 2F8DA 3LUYA 4OWDA 3OXNA 1ELJA 4G8HA 1OIBA 3K1NA 2F34A 5I2NA 3LSWA 5FTIA 3T96B 1B3FA 3DP8A 4LVQA 2VGQA 4RK9A 3N6UA 4QSEA 2R71A 1EZ9A 5HBCA 2QMWA 3TCGA 4KQPA 4GIZA 1IXCA 4Q5TA 3K01A 3IOUA 4IO2A 2H25A 2PYYA 3MUQA 1I6QA 3PGFA 3TODA 2NXOA 1PDAA 1H43A 2OLBA 4U4SA 2YLNA 3FVKA 4POXA 3S4UA 4BDOA 4KI0E 3K1PA 5L8DA 3MPLA 5TPAA 3G3FA 2ANJA 1DMBA 1LAFE 2O1MA 2H99A 1R9LA 1B52A 1LSTA 3G3KA 5TPAB 3D4CA 3N6TA 4FIMA 2QL3A 4LZ7A 3RGYA 1F9BA 4BLAA 4ZZEA 1I6BA 4NEDA 3V5AA 3TTKA 3TTLA 1YCJA 1SW2A 4AQ4A 3R6UA 4H5GA 3L6HA 3IOTA 3C31A 1N3XA 1M5EA 4AB5A 2XHDA 3EPEA 2ZNTA 5DVIA 4NMYA 3IB2A 2ONRA 1Y1ZA 3GBAA 3LSLA 3SEVA 3Q27A 4BDNA 2H98A 5H8NA 1Y3NA 1B05A 3LR1A 1QJMA 1JVYA 1OMPA 5CI5A 4ISUA 5H8NB 3S2VA 1MH4A 1JW1A 1Q35A 1IUDA 1HSJA 4HCWA 2Y7KA 4EQ9A 4EDPA 1QKBA 3ZS6A 3W9VA 1SI1A 2B3FA 1B1HA 3PPPA 2ESNA 1LAGE 5ICTA 1IITA 1USYE 5TP9A 2XX7A 1Q1KA 3TAJA 3ECRA 3RQTA 3MBPA 3C32A 1QUKA 2F6GA 3E3KA 4THIA 4HTGA 2R6GE 2UVJA 1MQGA 5TP9B 1LGBC 2F97A 3IX1A 3TCHA 2V3UA 5L9SA 3BBRA 3KOSA 4ZEKA 1ZLQA 2F78A 4UA8A 3MPKA 1P1OA 2A5SA 3U8QA 2PT1A 4YU0A 2VHAA 1A99A 4JXIA 4TQUQ 2GH9A 3PV0E 4IO6A 4NF5A 3KSJA 2RC8A 4U1ZA 1QVSA 4KD5A 3O28A 5K2YA 1GTKA 2Q88A 3EF7A 3K6VA 1QKAA 5AA3A 2I4BA 3IK6B 4NF5B 4RPOA 1WVJA 1B4ZA 4H0WA 5ICQA 1QUJA 3SEUA 1R9QA 2PT2A 4MH5A 3OO6A 5H8SA 3M3LA 3HO7A 1A7LA 5EHMA 2IEEA 4TOZA 4O3AA 2F7AA 5DTBA 1ATGA 5DYHA 4FE8A 3QIMA 4IO3A 3O97A 2OWTA 2M8CA 3H03A 4N13A 3IO6A 1N3WA 4OEVA 4GF8A 4Q8RA 4KFQA 2E1SA 2OWSA 2P1SA 3O29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JQFA 2RCAA 2XXVA 3H4ZA 4FEBA 3KN3A 4DLDA 2I6EA 2I3WA 3IB0A 1OQHA 2QRYA 1SW4A 5CMKA 3KEIA 3DM0A 5L9OA 1SVXB 3OMBA 4NAPA 3MAMA 3C9HA 5JTYA 3G3IA 1LAHE 1PB9A 3W9WA 3ONMA 3SESA 4XEQA 4E0XA 4F22A 4O3CA 4N6KA 3B7DA 3OSQA 4WKMA 3FUZA 5JTYB 2F7BA 1PB8A 4P3LA 1MY1A 3S9EA 1NV7A 2VD2A 1FPFA 2I0CA 1NV4A 3MJNA 2I3VA 3MC2A 4LZ8A 4R74A 3C33A 1B5JA 4GWUA 2WYKA 3H6UA 3MVXA 3HCQA 4NG7A 2KR0A 3GXAA 5LOMA 4GOTA 4MNIA 3PUWE 1OVTA 1IMDA 1SYHA 1N04A 5JEIA 1T0KA 1NV0A 2G29A 2XXQA 2PCRA 4FJPA 3PUVE 1US4A 3VXCA 2FIXA 1XVXA 4F1UA 4H46A 5H8FA 3H3GA 3GZGA 1MQHA 1OQGA 4HW8A 4MIJA 2CZLA 5EQ8A 2B4MA 2UVIA 1FSAA 3DP6A 5IKBA 1FPJA 1LCTA 2DWHA 4XKPA 1USYH 3O6GA 3H06B 5H8FB 4OA4A 4GX4A 5ITOA 3V89B 1ZMGA 5IM2A 1RYXA 1P1QA 2QS4A 2FNCA 4HE2A 1DPEA 4NN3A 5KDTB 4DCXA 5DEXB 5LDZA 4IGTA 3MZBA 1ANFA 4G68A 2Y7RA 3T9XB 5KCJA 4GWWA 1B5HA 4K3FA 2REGA 2OK2A 4XF5A 2Y7PA 4KHZE 3SZPA 2DDKA 3BFUA 3T66A 1AL3A 3Q29A 3OEMA 1LFGA 2XXUA 4P1EA 3IAZA 2Y7WA 5KCJB 2ZYMA 5L9MA 4YKKA 3N5LA 1LB9A 1VDWA 5CMCA 1P99A 3CHGA 3JV9A 3EN3A 3U65A 3VDFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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