5I2KB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
289
structure length
286
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 79
structure length 286
sequence length 289
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kB02
1SW5A 4YB6A 5ISUA 3E3KA 2UVIA 3PMVA 4IO7A 2QMWA 3H6VA 1J1NA 1B5IA 1BP5A 1MDP1 3TTMA 3MJNA 4OZ9A 4TOZA 3T96B 3TCGA 1URDA 1P1OA 1N04A 2XXRA 2NXOA 5J1DA 5ICTA 4FECA 3KJTA 2R71A 3I3VA 3MZ9A 4OWDA 3L6HA 4F1VA 1WVJA 1PBQA 1N7XA 1UTHA 4KD5A 2F78A 4XIGQ 4F1UA 1LAGE 2I0CA 1MQHA 3B6WA 2AL5A 1QUKA 2QSXA 3T93B 2V84A 2QJEA 1LFGA 4ZZEA 3V83A 5TPAB 1B58A 1M5CA 3BBRA 2RC7A 4YICA 5I58B 2I0BA 4K3FA 3I6VA 1IQ7A 2PBWA 2XD2A 2BJJX 1N3XA 4RNSA 4ZDMA 3UN6A 2B3BA 1SBPA 4NF8B 1PEBA 4IB2A 5CMKA 4DXCA 5AA3A 1Y1ZA 4JSOA 3C35A 1SYHA 4FATA 2XXIA 4OEUA 3DLNA 3K0VA 4E0WA 3DELB 1B32A 3WAEA 4KHZE 1MY2A 2O1LA 3KBRA 1QKAA 2DVCA 5DT6A 4OQOA 4Q0CA 3W9VA 4GFRA 1DMBA 1R6ZA 2ZYOA 4OXVA 3MPKA 1FTJA 3C36A 2XXVA 3JV9A 5TPAA 3TZAA 2HFBA 5I56B 3IO4A 4IO6A 4LZ5A 3O28A 5I58A 3FUZA 4X48A 4PFYA 1GTKA 4H67A 4IO5A 1LGBC 4WKMA 4O3BA 1MH4A 4FEBA 1B3GA 4NF8A 3FXQA 3EHUA 3IK6B 5HM4B 5KDTA 3PPRA 1P1UA 3KOSA 2OWSA 1R1NA 3G7WA 3FV1A 5I2NB 3LSFB 1DPEA 2I6EA 3PUYE 5K2XA 1A55A 1Y9UA 2F6PA 1DSNA 3O6GA 3VFJA 3O6IA 4ESWA 4YKIA 3QIMA 1YPNA 2H99A 1KWHA 2GRVA 3RT6B 4ZE9A 3HO7A 2UVGA 3FVKA 4MF3A 3FD3A 1SI1A 3PPNA 4C0RA 4PQJA 1CE2A 1XVYA 1AH5A 4X9TA 3MZ1A 4HS7A 2DOJA 2QL3A 5I56A 3CG1A 3GBAA 3IR1A 3PGFA 4C1TA 4PFTA 4G2ZA 3K1PA 1FW0A 3CR9A 2I49A 1LBBA 2VGQA 5KCJA 3PD9A 2F97A 2FA7A 3FGSA 5AE4A 3KSXA 3V5AA 1NFTA 3MVXA 4NMYA 1H43A 3PMXA 4F18A 1ZIUA 3ZKKA 1AL3A 1H76A 1A7LA 3P7IA 3K02A 3KG2A 3VVDA 3PUXE 3MC2A 4F3PA 3SESA 4IY5A 5I2NA 3SEXA 1I6BA 2VOZA 4U4SA 1VFEA 1QJMA 5ITOA 3LR1A 2O1MA 4ECFA 4FJPA 1RKMA 3U72A 1BTJA 2PT1A 3VE1B 4X1BA 2Z22A 3RQTA 1IXIA 4ZECA 3FJMA 3MVYA 1R9QA 3DP8A 4R75A 3PUVE 4ZZAA 1B3EA 2D3IA 3SKPA 3CFLA 3I5OA 3K6UA 4U23A 2PT2A 1IEJA 3VLWA 2OK2A 5I57B 2I4CA 5KZTA 3PUWE 2IA4A 1Q1KA 4R72A 2VD2A 2XXTA 3HHFA 3LSLA 4LZ7A 1EZPA 2XHDA 5B70A 3C31A 1USYH 3LUYA 4OVJA 4BDLA 2XD3A 2Y7RA 4O3AA 4F22A 2PVUA 3IB1A 3FVNA 4U1OA 3UP9A 4LATA 1GGGA 4DCYA 3D4CA 3MAMA 2RC8A 3MPLA 4F29A 4DXBA 3OSRA 3MP6A 3IORA 3G3JA 1QULA 1H3DA 1URSA 1IXHA 5IKBA 4DXUA 1Y3QA 2H9BA 4H1XA 2GFEA 1GR2A 5I57A 3FJ7A 4DDDA 1BKAA 3LBSA 3U92A 3PD8A 3DM0A 4XKPA 5FHOA 4NF5A 2XXXA 3ECRA 2DWJA 4IO2A 3Q28A 1ZBMA 4PETA 1Y3NA 2UVHA 4QSEA 2ESNA 4YMBA 4DIGA 2DP8A 3CSBA 2QRYA 3EPEA 2Y84A 2YLNA 4GOTA 1XOCA 1WODA 2Q9TA 5ICQA 3B7DA 3OO9A 1AIVA 3Q27A 3GZGA 2CMOA 3C9HA 4LQ5A 3N94A 3TYHA 1MQIA 4QSCA 1B1HA 2F7CA 4THIA 2NUVA 2HZLA 4F3BA 3RGYA 4EQBA 2P1SA 4ONYA 4RJZA 1NH8A 3EHTA 1FQBA 3KOTA 3EQ1A 1IITA 3SEWA 4QFKA 2G93A 4YB7A 1B5JA 1MY4A 1PB8A 3CFXA 4LP2B 5I59B 1ZMGA 1B52A 2PYYA 4IY6A 1QUJA 3H3GA 2NWJA 1O63A 4ZS9A 4LQ2A 4Q5TA 3TODA 3OOAA 1LCTA 2VP1A 3ONMA 4OESA 4ZEIA 3K2DA 3RPWA 5F7VA 2F5XA 2AYSA 1NKXA 3UA8A 1OVBA 1I69A 2H25A 1A54A 3LSWA 1QKBA 2DE4A 3EHSA 1FTOA 2Q89A 5CI5A 4ELOA 2ZNSA 3ILTB 2UYEA 1XC1A 2WKYA 2OJTA 2ZNTA 3KN7A 1WDNA 1Q35A 1SI0A 4Z7EA 1MS7A 4JDFA 2ONKE 5CMCA 2DS9A 3TTKA 1Z7ME 3B6QA 3TCFA 5I59A 1NH7A 2GHBA 4PFWA 4ZEFA 2ZYNA 4R74A 3OSQA 1DTZA 2DSFA 1NNPA 1Y3PA 2O6AA 4KYDA 3T9HB 3O6HA 2QS2A 3N5LA 5ITPA 4OEVA 3TQLA 4PFUA 3S9NC 2UVJA 3C4MA 1HSEA 3TCHA 4FE8A 4TLMB 5H8QA 1ZLQA 5AA1A 4KQPA 3K00A 5H8NA 1LB8A 3IOUA 3K4UA 2XX8A 1HSLA 4H8IA 1B7HA 1GV8A 4IO4A 4EUOA 4EQ7A 1ANFA 4FAJA 5KDTB 4R2BA 1B3LA 3ILUB 3MQ9A 3FIRA 1DTGA 3MW0A 1QUIA 1JVYA 4U2RA 3CVGA 4IGRA 3MWBA 2P2AA 3CFZA 1A40A 3ZKLA 1MXVA 4OMBA 4GWOA 4QRZA 3TTNA 3LC8A 3OO8A 1SYIA 2H5YA 3BKIB 3VVFA 3OO7A 4N6PA 4U4XA 3IOWA 5K2YA 5I2KB 3CI8A 1P1WA 1D9YA 1I6AA 3CG3A 3FASA 1Y4TA 5HPQA 5DVIA 4ND9A 3PPOA 4BDRA 2DE3A 4RK9A 2X26A 4R73A 1FTLA 1YAEA 1EH3A 2B65A 2RINA 1S7YA 2I48A 5DYHA 3KN8A 1MPDA 4QF9A 5KCJB 2DXRA 2XX9A 1MXYA 1UTBA 1MPBA 3TAJA 3TTRA 1MXXA 1OLCA 4F19A 4TQUQ 5FHNA 4I8CA 2Q8JA 2NVUB 2I58A 1LCFA 5IAIA 2I3VA 1NNFA 2DE2A 2V3TA 3R26A 1P1QA 4KYSA 5H8FA 4F2QA 2M8CA 3FZVA 3H6WA 1OIBA 4ESXA 4M4GA 2DWIA 3OEKA 1ZU0A 4GVOA 1OMPA 4G77A 4JB7A 5AA2D 1P99A 2Y7PA 4UACA 1B3HA 4F1YA 5LOMA 1B7ZA 3CIJA 4X1DA 4R6HA 1EU8A 1EZ9A 1O64A 5CBSA 5I2KA 3Q26A 4YZZA 3W9WA 1Y1MA 4H8JA 1B0LA 1OVTA 4HTGA 1LAHE 3CRBA 1FQCA 4JWOA 1MXWA 3A09A 5TP9B 2O68A 2QS3A 4H5FA 4NWCA 1M5BA 3Q25A 3VLVA 1OLAA 4LA9A 1LAXA 1B4HA 3TMGA 5BUUA 1UQWA 3HHGA 1LAFE 1B9JA 2FYIA 3FVOA 2XX7A 4BLAA 3V8XB 4OFLA 2DVZA 4JWXA 3M3KA 3S4UA 1TFAA 4EXLA 2HCAA 5CMMA 4R9FA 3K6WA 4GLIA 3ZS6A 4LZ8A 3S9EA 2DWAA 3IB0A 3OELA 3S2VA 4LUBA 1LLSA 1ZKBA 5H8SA 3QK6A 1VSOA 1PC3A 1SW1A 4OHNA 4Q8RA 2HAUA 5TP9A 5EHMA 4EQ9A 5EHSA 1B51A 1MQDA 4EXKA 4PE5B 3C34A 2O7IA 3AXFA 4P11A 2Y7KA 1D9VA 5B7DA 3UIFA 3EF7A 3QAXA 2PMSA 5L9OA 2OBGA 5L9SA 4IGTA 4NF5B 1B05A 4JWYA 4R2FA 4QFNA 4RXLA 1S9TA 4F39A 1M5DA 2REJA 4O3CA 4F3GA 3SEUA 3K6VA 1PB9A 3G3KA 4JXIA 1A8EA 1BIYA 5F1QA 3RN8A 4GRKA 5L8DA 2ZXTA 1LFIA 3QUFA 2Q2CA 4OFJA 3SDFA 4N07A 4ELRA 3TELA 2F6GA 1Z7NE 1B5HA 2Z8EA 3QXMA 3KGCA 2ZMBA 2V3QA 1JEUA 4QHQA 2H4IA 1D4NA 3U1OA 3IL1B 4LONB 4KYEA 4KCDA 4G8HA 1B7UA 1TWYA 1SD3A 1VFDA 3CSGA 4G68A 3F11A 3O97A 3WAFA 4GL8A 4XTCQ 2V93A 2KLFA 4H0WA 5ELVA 1MXZA 1MQJA 1RYXA 1ZJLA 2LAOA 2F7AA 3ODBA 3OXNA 3MZBA 3C32A 3H06B 4U1ZA 4BDNA 2O7UA 3VLUA 2XXQA 1DPPA 1NMUA 2W7YA 3GLBA 3Q29A 1R9LA 1T0KA 3IO6A 3TEPA 1POY1 3IJOB 3M3FA 3N26A 1QVSA 1B1XA 3G3FA 3USDA 5A5XB 4QFPA 2O51A 4POWA 1JVXA 1JQFA 1N76A 2QMXA 3H03A 2YJPA 4NWDA 4YB5A 4U22A 1FQFA 4OETA 3T9VA 2GH9A 1B4ZA 2F7BA 1UIUA 5TU0A 1EZOA 1I6QA 5FHMA 2QS1A 3RTWB 3UK4A 4XKNA 1B3FA 1ATGA 1VR5A 3IJXB 2IEEA 5FTIA 2Y7WA 4KI0E 1TXFA 1N0TA 3MP1A 5JK4A 1II5A 2REGA 2NOOA 2V3UA 1US4A 3ZSFA 1IUDA 3SETA 4N13A 4RPNA 3T66A 4NF4B 4MH5A 3KFMA 2UYFA 2P0SA 2XXWA 5L9MA 1AOVA 5FTHA 5H8QB 2DYXA 4R6YA 2Z8FA 4G4PA 5H8NB 4AB5A 5A5XA 3H6UA 4HCWA 5H8HB 1QW0A 1LSTA 1CB6A 3T9XB 2QPQA 3FV2A 4G8NA 1MY0A 2OZZA 5DEXB 3MUQA 1H45A 3S9LC 2PX1A 4DLDA 2ZYKA 4OENA 2ANJA 2VD3A 4MLQA 4YKKA 1JW5A 4YU0A 2XXPA 2XXYA 4DE8A 5AA2B 1ELJA 4G68C 4XKRA 2Y7IA 5CC2A 4YMAA 4RA1A 3LSXA 3TTLA 1OQGA 1MG1A 4NF4A 4QFLA 4XXUA 1H44A 4C1UA 3N6UA 2R6GE 2G29A 3K01A 3C33A 3MVWA 3IB2A 1MRPA 1UTBB 2E0SA 1Y4CA 4GL0A 3H4ZA 1NNTA 3RUMA 3VXBA 1PBPA 5H8HA 3KJ7A 2F8DA 5H8FB 3O9PA 1MXUA 4ZEKA 1MM7A 1MDQA 4LVQA 1JETA 1FTKA 5DEXA 4F2OA 2DWHA 4NE4A 3PUZE 5DVJA 3VDFA 1P1NA 4POXA 2YPNA 1A8FA 1HSJA 5AA2A 3U94A 1SQYA 4JSDA 1B6HA 4GXSB 1Y20A 3S9MC 4ZE8A 2XXUA 2RF1A 2XXHA 3UORA 3V89B 2RCAA 1FTMA 3HSTA 3T22A 2O84X 5CMBA 2E1SA 2VHAA 4OERA 2FNCA 3HCQA 3PV0E 3RT8A 3R6UA 2I3WA 2GHAA 3DP6A 1TT1A 4EF1A 4OFOA 3H7MA 4P0IA 2Z23A 3OO6A 2AL4A 5JTYB 1ZTYA 2Q88A 3RTFB 1XS5A 4BDQA 4H5GA 4DCXA 3N6TA 4KCCA 4FEDA 2DXYA 4FIMA 4DZ1A 4Q30B 3MBPA 2A5SA 4OTEA 3E13X 4GXAA 1MQGA 2AIXA 1A99A 3FATA 3M8UA 1IXGA 4RPOA 1NNKA 1PDAA 1POTA 4GIZA 3A3UA 1YCJA 3G3IA 1DOTA 4WEDA 1US5A 3RY3A 1SW4A 2RKMA 2DQVA 3K6XA 3TKDA 2A5TB 3H6TA 4I1DA 2V25A 5CM6A 1D3KA 1FQAA 3SERA 4L17A 2X7QA 4KR5A 3D4GA 2ZNUA 4FORA 1FQEA 4F31B 4RYAA 1IXCA 3PU5A 1F9BA 3BFUA 2Q2AA 1IZ1A 4GF8A 2H98A 3IX1A 4R6KA 5JTYA 4RK2A 3IOTA 4WEPA 4H6DA 4G8MA 4IO3A 3KEIA 1SVXB 2Z8DA 4F3SA 5BWJA 1MPCA 3DP4A 4EDPA 1N3WA 1M5FA 4GD5A 1LB9A 3PMWA 1MY3A 3PPQA 1N7WA 1MY1A 4NF6B 5DTBA 2HEUA 3QUJA 2O69A 3B6TA 4MFIA 3E4RA 3TQWA 1FCKA 2OLBA 2A5TA 3TUSA 3GBBA 3QYTA 4GQOA 4NEDA 2R9JA 4BDMA 4G68B 3FXRA 2RCBA 1FQDA 3RNNA 1SW2A 1SDXA 4I9DA 3OENA 4YKPA 3UGWA 4KFQA 2HXWA 3FVGA 4TLLB 2F36A 2ONRA 5AA4B 5EYFA 3SEVA 3T9UA 3K1NA 3TFLA 4OYVA 4R9GA 3FXUA 3A3CA 3VV5A 3MP8A 2THIA 3FJGA 1O7TA 5DVFA 1XT8A 3G3HA 1LFHA 1AMFA 3MVZA 4ZEDA 2HQ0A 3OEMA 4QFOA 4U21A 1M5EA 5M2VA 1B0HA 1B2HA 3GXAA 4I62A 4UA8A 2ONSA 1USYE 1PB7A 3BFTA 3O2AA 2ZYMA 1BLFA 2F34A 3KN3A 3O66A 1JNFA 2F35A 4NF6A 3G3GA 1TFDA 3OMBA 3EN3A 4QSDA 1YTVA 4ELPA 1MH3A 3RLFE 1N84A 1OQHA 2HZKA 3TPAA 1LBCA 4AQ4A 3HV1A 3VXCA 3JYRA 3HPIA 5CRYA 3IAZA 3TDJA 1JEVA 3R7XA 1B40A 4JBZA 5AA4A 4ELQA 3KSJA 3U93A 3KZGA 3OD7A 1GVCA 5CBRA 2OWTA 3IOVA 3K1MA 3JZJA 4KPTA 3VVEA 2QS4A 2ALUA 4E0XA 4Z0IA 4YKJA 3SEYA 2OCUA 3O29A 4HCYA 4NTLA 4ZEBA 4EF2A 5HBCA 3M3LA 4WXJA 4XKQA 1VE4A 1NL5A 4MLVA 4M1VA 1S50A 1B46A 2ABHA 2D21A 3PPPA 4HW8A 3W15C 3L6GA 4ISUA 4RY1A 2CZLA 3U8QA 4PP0A 4BDOA 1MM6A 5I84A 3HN0A 2RC9A 5JEIA 4AB6A 3E9XA 4H65A 1L5TA 4MBPA 2X7PA 1UTHB 2HAVA 2D5WA 1JW4A 1XHYA 1URGA 3QSLA 4YAHX 1UIVA 1RYOA 4P0GA 1XVXA 3THIA 2B3FA 1IIWA 2UXAA 1JW1A 2I4BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SW5A 4YB6A 5ISUA 3E3KA 2UVIA 3PMVA 4IO7A 2QMWA 3H6VA 1J1NA 1B5IA 4NX1A 1BP5A 1MDP1 2WBBA 2L5VA 3TTMA 3MJNA 4OZ9A 4TOZA 3T96B 4IR8A 3TCGA 1URDA 1P1OA 1N04A 4OANA 2XXRA 4PAFA 2NXOA 3QMFA 5J1DA 5ICTA 4FECA 3KJTA 2R71A 3I3VA 3MZ9A 4OWDA 3L6HA 4NGUA 4F1VA 4PGPA 1WVJA 2ZZXA 1PBQA 1N7XA 1UTHA 4KD5A 2F78A 4XIGQ 4F1UA 1LAGE 2I0CA 1MQHA 3B6WA 2AL5A 1QUKA 4LN5A 1FBPA 2QSXA 3EKIA 3T93B 2V84A 2QJEA 1LFGA 4N91A 4ZZEA 3V83A 5TPAB 1B58A 1M5CA 3BBRA 2RC7A 4YICA 5I58B 2I0BA 4K3FA 4P47A 3I6VA 1IQ7A 2PBWA 2XD2A 2BJJX 1N3XA 4N81A 4QXDA 4RNSA 1NV7A 2XWVA 4ZDMA 3UN6A 2B3BA 5ET5A 5I5PA 1IMEA 4GWUA 1SBPA 4NF8B 1PEBA 4IB2A 5CMKA 4DXCA 5AA3A 1Y1ZA 4JSOA 3C35A 1SYHA 4FATA 2XXIA 2CZIA 4OEUA 3DLNA 3K0VA 4E0WA 3DELB 1SPIA 1B32A 3IFAA 3WAEA 4KHZE 1MY2A 2O1LA 1FSAA 3E79A 3KBRA 1QKAA 2DVCA 5DT6A 4OQOA 4Q0CA 3W9VA 1FBGA 5ESYA 1K9ZA 4GFRA 1DMBA 1R6ZA 2ZYOA 4OXVA 3MPKA 1FTJA 3C36A 2XXVA 3JV9A 5TPAA 4OVQA 2HFBA 3TZAA 5I56B 3IO4A 4IO6A 4FBPA 4LZ5A 3O28A 5I58A 1NUWA 3FUZA 4X48A 4PFYA 4AS5A 3BIHA 2B4MA 1GTKA 4H67A 4IO5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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