5I56B

Agonist-bound glun1/glun2a agonist binding domains with tcn201
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
DDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 83
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56B02
5HPQA 4KHZE 5H8QB 1F9BA 3B6QA 4OERA 4U1ZA 4E0XA 4I62A 5EYFA 1URSA 4FAJA 3RGYA 1LAHE 5AA4B 3I6VA 2NWJA 1P1NA 4HCYA 1JEVA 5I59B 4IO2A 4R6YA 1POY1 5CC2A 5I57B 4ZE8A 4ESWA 3OO6A 4XKRA 3W9WA 3T9UA 3SESA 4MF3A 2VP1A 3CG1A 1ZIUA 1USYE 2Y7RA 3FXQA 3TMGA 4LATA 3GZGA 1LBBA 3MVYA 4YMAA 1P1QA 2DE4A 5EHMA 3QK6A 4KI0E 1IXHA 2E0SA 3OSRA 1FQBA 3PUVE 4I9DA 2M8CA 5I2NB 3OENA 1WDNA 5H8SA 2H99A 5TP9B 3SKPA 1QUIA 4XIGQ 2QSXA 4Q30B 5DVIA 1QKAA 4YU0A 1GGGA 4ECFA 1SW2A 3RUMA 4RA1A 4QFNA 3I3VA 3IO4A 4ZDMA 1MH4A 5I56A 5DTBA 3WAEA 3KSXA 5AA2B 4IGTA 1P1UA 3H06B 3O29A 5DEXA 4IO7A 5AE4A 4Q5TA 1B52A 1B3EA 5L8DA 1HSLA 3N26A 4LONB 1ZKBA 4IY6A 3LC8A 4GD5A 3DLNA 4OFLA 4H5FA 2I49A 2P2AA 1LFGA 2RF1A 3C35A 4N07A 4PFWA 5A5XA 3ILTB 2VOZA 3B7DA 5B70A 4OETA 1EZOA 3CVGA 3CG3A 3DP8A 2XXQA 5TPAA 1L5TA 3OEKA 4NF5A 1YPNA 5BWJA 3LSFB 2D5WA 4ELQA 2QJEA 1LAGE 1EH3A 3EQ1A 1TWYA 1I6QA 4KYSA 4EXLA 2ZNSA 2QMXA 3TZAA 1B3HA 4L17A 3UA8A 1MS7A 5JTYA 5FHOA 4JWYA 4U23A 1PEBA 4LUBA 3TYHA 4M1VA 2HEUA 1VE4A 3IAZA 1ZBMA 2I4BA 4ZE9A 2AL4A 3SEYA 4RY1A 3SDFA 3ZKLA 4QFLA 1BLFA 4UA8A 2ZYKA 1PBQA 3FV2A 1M5DA 4IB2A 2H9BA 5J1DA 1B0HA 2D21A 5FHMA 2XX7A 2OK2A 2O51A 2HXWA 1AMFA 1AIVA 3QXMA 2H4IA 1UTHB 1XS5A 5DVFA 3TTLA 2QS2A 3UGWA 4FEDA 2QRYA 4LZ7A 1NNTA 4R73A 4RYAA 3O6GA 3GXAA 1ELJA 1Y1MA 3PV0E 2THIA 2DXYA 3T9VA 5DT6A 4ZEFA 2QPQA 1JNFA 3FJMA 5H8FB 1D9YA 4KYEA 1RKMA 1SYHA 3LR1A 1H3DA 2AYSA 4JWXA 5H8QA 1BP5A 3BKIB 2OLBA 4EF2A 1J1NA 3MZ9A 1S9TA 2ZXTA 4ELPA 2ESNA 1PBPA 3G3IA 2HZKA 2CMOA 3PPRA 4BDLA 4EF1A 2Z8FA 1O63A 4FORA 4NTLA 4EQBA 1R1NA 5K2YA 5KDTA 3MP8A 1Y1ZA 1OIBA 2CZLA 1OLAA 3H6UA 2QS4A 1DPEA 3DP6A 2W7YA 5I57A 5B7DA 2O68A 1BKAA 4TLLB 3OXNA 4IO3A 5AA1A 1MXZA 4C1TA 4RPOA 2E1SA 2HZLA 3TTNA 1MXWA 4ZECA 1BIYA 2O7IA 4F19A 2X26A 4EQ9A 1IZ1A 1B3GA 3HHGA 3RN8A 4O3BA 1KWHA 3C31A 4WKMA 4NMYA 2Y7IA 1DMBA 2QS3A 2I58A 1OMPA 5KCJA 3O6IA 5TP9A 4G2ZA 1FQAA 1SI1A 4XKQA 3V83A 3RPWA 1QJMA 4OYVA 4IO4A 4MLQA 4GVOA 1IIWA 3M3LA 4ESXA 3MPLA 1FTOA 4X48A 4H5GA 5F1QA 3T22A 1Y3NA 5ITOA 2XXWA 5AA2A 2ZYNA 1S7YA 3B6WA 2XXRA 4RJZA 3IOUA 3DM0A 5TPAB 3IJXB 4JBZA 2Y84A 3C33A 3FVKA 1B7HA 2FYIA 2ANJA 3FVGA 3PD8A 3TQLA 3HN0A 3B6TA 4BDNA 3MVWA 1SW4A 1IUDA 3K02A 1JW4A 3FZVA 5JTYB 1MY4A 1NKXA 2VD3A 4YB6A 3TFLA 4LQ5A 1B6HA 1N76A 3O97A 4ELRA 4LP2B 1IXGA 3K4UA 1AH5A 1A8EA 2V3QA 2VHAA 4PFTA 2XXPA 4F18A 3MC2A 4F3BA 3SETA 4YICA 4H0WA 2UYFA 1XHYA 4F3PA 2YLNA 3M3KA 2GH9A 1B0LA 3UIFA 2DOJA 3LSXA 4G68A 2ONRA 1DTZA 5CBRA 5DVJA 4QFPA 1LGBC 3U1OA 1DSNA 1MRPA 4U21A 1NFTA 3N6UA 3K00A 4KCCA 3RNNA 4ZEKA 4NE4A 4UACA 2Q88A 2ZNTA 3PUWE 4U4SA 1YCJA 3U94A 3TTRA 3VV5A 3UP9A 1PDAA 3G3KA 4GWOA 1SDXA 4QRZA 2XD2A 1B7UA 4PFYA 3H3GA 3AXFA 1A54A 4NWCA 1SVXB 4IO6A 3HO7A 3HSTA 2G29A 1O64A 1PB8A 4LA9A 5JEIA 1MY2A 2ZNUA 2WKYA 2F78A 1GVCA 1N7WA 3IOTA 5KDTB 5H8FA 5ISUA 1ZJLA 1HSJA 3FVNA 3W15C 4R6KA 4WEDA 1SD3A 3FJ7A 1NMUA 3IOWA 3A09A 4PQJA 1CB6A 4ZEDA 1AOVA 2AIXA 1US4A 3IB2A 5I58B 3G7WA 1I69A 1LFIA 2R6GE 3I5OA 4EDPA 3E13X 1I6AA 1P1WA 2PYYA 1FTKA 1LB9A 2LAOA 1NNKA 4JSDA 5I2KB 1S50A 4NF4B 2F6PA 5HBCA 1Y3QA 1B32A 3K1NA 1FCKA 1YTVA 5KCJB 4DXCA 4I1DA 4FIMA 2RC7A 2DE3A 1GV8A 1B4ZA 1JW5A 3QIMA 4KCDA 2V25A 4BDRA 1OQHA 3VVFA 5CMBA 4YZZA 1MXXA 3MW0A 3MZ1A 1M5EA 1O7TA 1OQGA 3HCQA 4M4GA 5DYHA 3OO7A 1N7XA 1B58A 1B5JA 2A5TB 1P1OA 1FQCA 3O2AA 3DELB 2O84X 4G77A 2UVHA 1DTGA 3PMXA 4KQPA 1JEUA 4BLAA 4RPNA 1MPCA 4OVJA 1XVYA 2IEEA 4HS7A 2XXIA 1D3KA 4FATA 3S4UA 3OELA 3O28A 4FE8A 1TXFA 1VFEA 1MM6A 1VR5A 1GR2A 2IA4A 2F7AA 1NNPA 1SBPA 3MJNA 1H76A 4POXA 3IORA 5AA2D 4DXUA 3UN6A 1Q1KA 4R2BA 3D4CA 2Q89A 4LZ8A 4OEUA 4R9GA 3FATA 1H43A 3O6HA 4HCWA 4ISUA 1GTKA 4NWDA 3MQ9A 3SEXA 1B51A 3IOVA 4THIA 4H8JA 3PUYE 2F34A 1NNFA 3EN3A 4R74A 3VXBA 3ZKKA 3ODBA 2B65A 4DDDA 4NF6B 3ZSFA 5CMMA 3SERA 5ICTA 2DS9A 4G68B 1M5FA 4Z0IA 1B3FA 5IAIA 4ZEIA 1JVXA 4U22A 1H45A 1VSOA 1JETA 1NH8A 4I8CA 2F7CA 4H8IA 4X1DA 4FJPA 1XC1A 2GFEA 4OQOA 3KSJA 4N6PA 2XXHA 2I0BA 3TKDA 4KPTA 2Q9TA 1B5HA 4YB7A 4RK2A 2I0CA 2OWSA 3P7IA 2DP8A 3CSBA 3TPAA 2XX9A 4IGRA 3OOAA 4KD5A 3H4ZA 3Q29A 4GF8A 3W9VA 2DE2A 3CI8A 3H6TA 3BFTA 3R26A 3ILUB 3E3KA 2R9JA 3WAFA 4AB5A 3C32A 1BTJA 4F22A 4E0WA 3TELA 3EHUA 4X9TA 2REGA 1IQ7A 2PMSA 2KLFA 4GLIA 3O9PA 2I3VA 3KN7A 3K0VA 4QF9A 4AB6A 2RC8A 1MDP1 1FW0A 2GHAA 4QSCA 1OVTA 1LAXA 4F31B 3VVEA 4DZ1A 3K6VA 4N13A 3EHSA 4R6HA 1MQJA 2VGQA 3EPEA 2G93A 5IKBA 1SW1A 2PVUA 5K2XA 4GFRA 2ALUA 1N3WA 3MBPA 5H8HB 3T93B 1VFDA 4WEPA 3KOSA 4QFKA 5I58A 3TTKA 1B2HA 2Q8JA 2DYXA 4XTCQ 3TQWA 1MXUA 1II5A 4MH5A 4YKPA 1MG1A 3BBRA 5CMKA 5I2KA 4YKJA 1MQGA 3MVZA 4GXAA 2NXOA 4NF4A 2OJTA 1R6ZA 2QL3A 2XXYA 3C9HA 3KZGA 4MFIA 4DIGA 3KEIA 2P0SA 1USYH 3C36A 5M2VA 3CR9A 1IXIA 3QAXA 1WVJA 2I6EA 3IB0A 4JSOA 3CFLA 3N5LA 2Q2CA 1MY1A 1XVXA 3K1MA 3OSQA 1NH7A 1MH3A 2XXVA 3PUZE 2A5TA 1QUKA 1B7ZA 3OMBA 2B3BA 3RQTA 1H44A 4G68C 3ONMA 1MPBA 4F39A 1M5CA 4G8HA 1QW0A 3M8UA 2GRVA 3H6VA 1DPPA 3U93A 3Q27A 4R2FA 1MM7A 2DSFA 1ZMGA 3S9MC 4DE8A 3VE1B 3G3FA 3BFUA 1MY0A 1FTMA 4O3AA 1R9QA 5F7VA 4G4PA 2F97A 3KBRA 1UIUA 3N6TA 4DXBA 3H6WA 3S9LC 4X1BA 4PE5B 4TQUQ 4OFJA 5EHSA 2Z8DA 3VFJA 3FXUA 3IB1A 4JB7A 4P0GA 5FTHA 3RT8A 3R6UA 2XXUA 5CM6A 1MXYA 5CRYA 3KOTA 3KG2A 3K1PA 3G3GA 4NF6A 5FTIA 2UYEA 4P11A 3K6WA 1RYOA 1FQFA 2VD2A 3IX1A 3EF7A 3FIRA 4F1UA 4QSDA 3FGSA 3FD3A 3D4GA 4DCYA 2O1MA 1IEJA 3Q28A 2QMWA 3FXRA 2NOOA 3FVOA 2XD3A 4G8NA 1EZPA 4GIZA 2UXAA 4BDQA 4TOZA 4GXSB 4H1XA 1ZTYA 3JZJA 4ONYA 4YMBA 3UK4A 1LAFE 3A3CA 2PT1A 4GOTA 4OZ9A 4BDOA 3H7MA 2D3IA 4DCXA 1R9LA 4U2RA 4EQ7A 4POWA 4WXJA 2O69A 5AA3A 1OVBA 3USDA 1B5IA 1LB8A 4ZZAA 3VXCA 1XT8A 2I3WA 2ONSA 3S2VA 3LBSA 2GHBA 3MZBA 4LVQA 3RT6B 2OWTA 4F1VA 2DVCA 1RYXA 1Y9UA 2DWIA 1MPDA 3IJOB 4KR5A 4GL0A 3MUQA 4FEBA 5L9SA 1B3LA 3F11A 4C1UA 4OXVA 4PP0A 4QHQA 2Z8EA 3FASA 1AL3A 4KFQA 2HCAA 3QYTA 2F35A 3IR1A 4Q0CA 1OLCA 4OEVA 1B05A 2REJA 2I4CA 1MY3A 5H8HA 1A99A 5ELVA 3GBBA 3SEVA 5H8NB 3MPKA 4OMBA 4NF8B 4ELOA 5JK4A 3K6UA 5TU0A 3FJGA 2YJPA 2PT2A 1FTJA 1A7LA 4BDMA 4XXUA 4F3GA 4K3FA 1TFDA 2NVUB 3JYRA 4F29A 3HV1A 3QUJA 2X7PA 1IITA 4O3CA 1T0KA 1EU8A 2HFBA 1UTBB 2RCBA 4ND9A 3TCGA 2H5YA 4RK9A 4F2OA 2ZYMA 1Y4CA 2H98A 3Q26A 4Q8RA 2FNCA 4OWDA 4H67A 1B1HA 3RTWB 2Z22A 2DXRA 2RINA 2Y7PA 3TAJA 2I48A 1MXVA 3HHFA 3C34A 3TDJA 3PMWA 3V5AA 3E4RA 1Z7NE 1B9JA 3IL1B 2Y7KA 1PB7A 1QKBA 3U8QA 2YPNA 4MLVA 3IO6A 2ONKE 4YKKA 3GBAA 4H65A 4OHNA 3T9XB 1SI0A 4RXLA 1ANFA 2F6GA 3KN8A 4GRKA 3Q25A 2O7UA 1I6BA 1UIVA 3T96B 3TCHA 4EUOA 4IY5A 4EXKA 3PUXE 1CE2A 3FUZA 1LCTA 5L9OA 3V8XB 1D9VA 3VLWA 3G3JA 2UVJA 1LBCA 3K2DA 2PBWA 3VLVA 3IK6B 2Y7WA 1ZU0A 4QFOA 1Z7ME 3R7XA 2ZYOA 3RLFE 1FQDA 2DQVA 3VLUA 4YB5A 4MBPA 4JDFA 4JXIA 1JVYA 2XXXA 1URDA 4JWOA 3MP6A 3MAMA 4XKNA 3G3HA 2H25A 2HQ0A 1LCFA 4AQ4A 4OENA 2HAUA 3PMVA 4KYDA 1YAEA 1IXCA 3UORA 1PC3A 1LFHA 3C4MA 3U92A 3CRBA 3PPOA 3DP4A 1QUJA 3THIA 1A40A 3N94A 3PPNA 2DWHA 1PB9A 4OESA 5I84A 2XHDA 3OD7A 4OFOA 1FQEA 2O6AA 5KZTA 1POTA 3MWBA 3A3UA 1B4HA 5AA4A 4U1OA 2V84A 3LSWA 2DWAA 4NEDA 4R9FA 2RC9A 1Y4TA 2UVGA 2QS1A 5I59A 2RCAA 5BUUA 1Y3PA 3PGFA 4Z7EA 3TODA 4F1YA 3KN3A 4YAHX 1SYIA 2F36A 2AL5A 1M5BA 4R75A 3H03A 2F8DA 3T66A 3KGCA 2B3FA 4GL8A 2ZMBA 2P1SA 3SEWA 2R71A 2DVZA 3TTMA 3MVXA 5H8NA 5LOMA 3OO8A 5I56B 1TFAA 3O66A 4NF8A 2PX1A 2DWJA 1B46A 1URGA 3CFZA 5I2NA 3PPQA 2HAVA 3CSGA 5DEXB 1D4NA 1US5A 1A55A 3MP1A 4OTEA 5CI5A 1ATGA 1B40A 3TEPA 1Q35A 4IO5A 1Y20A 3PU5A 3L6GA 3CIJA 2V93A 3QUFA 4GQOA 4G8MA 4YKIA 4TLMB 5ITPA 3LUYA 1UQWA 4U4XA 3EHTA 1QULA 4XKPA 3TCFA 4DLDA 2A5SA 3FV1A 3KFMA 2F7BA 3OO9A 4FECA 1LLSA 2X7QA 3QSLA 2F5XA 4F2QA 1SW5A 5A5XB 1EZ9A 2BJJX 1UTBA 4ZZEA 4LZ5A 1JQFA 1QVSA 1JW1A 1LSTA 3PPPA 2XX8A 3K6XA 4NF5B 3VVDA 3L6HA 1A8FA 2V3TA 4QSEA 3V89B 3TUSA 3K01A 3PD9A 1TT1A 1N04A 1HSEA 1N0TA 3JV9A 1MQDA 3U72A 3CFXA 1MQHA 1XOCA 2XXTA 3S9NC 1MQIA 5FHNA 1WODA 4HTGA 2ABHA 5CMCA 1FTLA 4RNSA 1MDQA 3RTFB 2FA7A 3M3FA 2O1LA 3E9XA 3LSLA 2Q2AA 4LQ2A 2OCUA 2OBGA 2NUVA 3RY3A 3OEMA 4ZS9A 3T9HB 3SEUA 1N3XA 3KJ7A 4PFUA 3KJTA 2UVIA 5L9MA 4ZEBA 1P99A 3GLBA 5HM4B 1NL5A 1SQYA 2OZZA 4PETA 3HPIA 2Z23A 2RKMA 4F3SA 1ZLQA 1N84A 4R72A 4HW8A 4H6DA 3VDFA 3ECRA 4P0IA 5ICQA 1B1XA 2V3UA 5CBSA 1DOTA 3ZS6A 4C0RA 1UTHA 3S9EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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