5I57A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
281
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 281
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A02
1N7XA 4R73A 3ZSFA 1QUKA 1P1OA 2H98A 2I58A 1SI1A 2V3UA 1KWHA 4MH5A 2GHBA 1B32A 1MXVA 5HPQA 1NNFA 3TAJA 4KPTA 3OO8A 3E4RA 1MY4A 2XXIA 3S4UA 3OO9A 4R72A 4O3AA 4YMAA 2ZYOA 1DPEA 1JEUA 1SQYA 2DQVA 1Y3QA 5JTYA 5AA2B 3CIJA 1MXWA 4NF4B 2XXYA 3SESA 1A8FA 3TCFA 3OXNA 1UTBA 4HW8A 1ZMGA 3TDJA 1P1NA 1TFAA 4PE5B 5ICTA 4YKKA 2RCAA 3PPNA 2ONSA 1ELJA 2I4BA 1B5HA 3T9UA 4GOTA 5KCJB 2HQ0A 3UP9A 1QUIA 4EF1A 2REJA 1IIWA 3U1OA 1ZLQA 3C35A 2IEEA 3IOVA 3PV0E 3CFLA 3PPQA 1MS7A 1LAGE 1DTZA 1BP5A 5I84A 3PUXE 4EF2A 5KDTB 3G3GA 2OJTA 5EHMA 3S9NC 4YB6A 3G3JA 2H9BA 4G68B 1II5A 3PPRA 2NVUB 3I6VA 3IOUA 3JZJA 2Q9TA 4LP2B 1SW5A 1XOCA 4U1OA 5CM6A 3K1PA 3U93A 3ILUB 5DEXB 4YKJA 3C36A 4LATA 3ZS6A 3TFLA 4ZEIA 2Y7IA 3TQWA 1I6QA 3L6HA 2FYIA 4H5FA 1XVYA 4G8MA 5FHOA 1M5DA 4GQOA 3EF7A 5CMKA 2VHAA 4FE8A 1NMUA 1CE2A 3IX1A 3S9EA 3JYRA 4OENA 2OWSA 1MH4A 3FIRA 1LAXA 5H8NA 3H6UA 4OEUA 1M5CA 2ABHA 3BFUA 3VLWA 1URSA 2QMWA 4RK2A 4WEDA 4YAHX 2P2AA 4HCYA 4GF8A 1FQCA 1MH3A 2V3TA 3VDFA 3SETA 1JVYA 1ZTYA 1MY3A 4O3CA 4ONYA 5I2NB 2UYFA 2XX9A 4OFJA 3FXUA 3DP8A 3TODA 1O63A 2ZNSA 2HXWA 3RTFB 3Q28A 5HBCA 2XXUA 2ZXTA 4PETA 3O97A 5K2XA 4QFNA 2A5TA 1VE4A 4EQ7A 2DE3A 2VP1A 4F3BA 1JQFA 5ITOA 3DP4A 3ONMA 2DVCA 2VD3A 4NWCA 1LAHE 3HHGA 4R6HA 3V8XB 1TT1A 3QIMA 4AB6A 3LC8A 2ONKE 4OTEA 5CMBA 3T9VA 3MQ9A 4R9FA 1HSJA 4JWYA 4IO2A 5BWJA 5AA2A 4YB5A 4C0RA 1DOTA 3KGCA 5TP9A 1FTJA 1HSEA 2WKYA 1WODA 1H43A 3H4ZA 1FCKA 4GLIA 1OMPA 3TELA 1FW0A 2Q8JA 3KN7A 2H25A 2HFBA 5AA1A 4FIMA 2W7YA 5KCJA 3HPIA 1BKAA 4X1DA 4GXAA 3D4GA 5EHSA 1URDA 3UA8A 4ESXA 3PU5A 1MY0A 4F1UA 4U4SA 2HZKA 2Z23A 4RXLA 4RNSA 4H65A 4NE4A 3IJOB 4DXUA 4BDRA 2I3VA 1NNPA 1EZPA 4DXBA 3R26A 2RKMA 2A5SA 3FUZA 1BLFA 1Y1MA 3RY3A 3PD8A 4I1DA 3KEIA 2B3BA 3MZ9A 3RT8A 3UORA 5F1QA 3TCHA 2F8DA 2RC9A 2OBGA 3QUFA 1H44A 1R6ZA 2O51A 4KQPA 5DEXA 5AA4A 4DLDA 1SD3A 2PX1A 3T93B 3MZBA 2XXHA 2XX7A 2RCBA 1VSOA 2QS3A 2F78A 3L6GA 4U2RA 3VVDA 2GFEA 1FQBA 1ATGA 5BUUA 3UK4A 5I56A 4F22A 5H8FB 4X48A 1MM7A 3PPOA 1SYHA 3SERA 3MVYA 2O84X 4NTLA 4OHNA 1FQEA 3A09A 1AOVA 1JEVA 3CSGA 3TTNA 4G4PA 4U23A 4LZ5A 4OVJA 4Z0IA 4E0XA 1FQAA 3B6QA 1L5TA 3G3HA 4DE8A 4NF8B 3PUYE 3IR1A 4KYDA 1DSNA 2FNCA 1FQFA 2QSXA 4ZEBA 3V83A 4FAJA 1XVXA 4GD5A 4KR5A 2QS4A 3GZGA 4KCCA 4XKNA 1US4A 3MC2A 4F3PA 3ZKKA 2OK2A 3TZAA 4EQBA 3QUJA 3MP8A 2CMOA 3CG3A 4FJPA 1JVXA 3IOWA 2RC7A 2YLNA 3V89B 4I9DA 1N04A 4OFLA 2DWJA 2Z8FA 2OLBA 3MVZA 3OEKA 1Y3PA 4NF5B 4O3BA 3TMGA 1PEBA 5I58B 3QXMA 1EH3A 3O6GA 1D3KA 3HN0A 2CZLA 3MUQA 2O1LA 4ZEKA 3PGFA 2QL3A 3MZ1A 3VVEA 5DVFA 2AYSA 4LONB 5I2KB 1OLCA 3S2VA 3GXAA 4KYSA 4OYVA 4ELPA 1BIYA 3KSXA 2DE4A 1O64A 1Y9UA 3N94A 2PYYA 2DXRA 3T66A 3WAEA 4ND9A 3N26A 4Q5TA 2F7CA 1LCFA 2XXVA 4M4GA 2OWTA 3USDA 1ANFA 2F36A 4QF9A 4R75A 4JBZA 3T96B 1POTA 3IB0A 3R7XA 4JWXA 1MPDA 4RYAA 4OFOA 1NKXA 3M3LA 3PD9A 1IZ1A 2Y7KA 5H8QA 1GV8A 4GFRA 4F3SA 2YPNA 1N84A 1UTHB 4R6YA 2XD3A 4DXCA 3KOSA 2F34A 3LBSA 4KFQA 1A8EA 4IGTA 2E0SA 1B51A 3LSXA 2F5XA 2F97A 4R6KA 4HTGA 4RJZA 1OQHA 1AL3A 2DWIA 2REGA 2Z8DA 4H5GA 2P0SA 3OSQA 3TTMA 2PT2A 2UYEA 1A55A 3RGYA 2F6PA 4G68C 2Y84A 4R2FA 2Z8EA 1SDXA 1R1NA 1OIBA 3M3FA 4QFKA 4OXVA 4I8CA 3MJNA 2GH9A 3D4CA 3PMVA 1SW1A 1R9LA 3E13X 4AQ4A 2DYXA 3U94A 4MLVA 3ODBA 1SW4A 3LSFB 3HSTA 4DCXA 2VGQA 2Q2AA 4F31B 2Q89A 4IY6A 1LBCA 4THIA 1S7YA 1MPBA 4LQ5A 3C9HA 2D3IA 4MFIA 3T9HB 1B9JA 1XHYA 2RC8A 5DTBA 3IO6A 3VV5A 3HV1A 4LQ2A 1IQ7A 3E3KA 2X26A 3B6WA 3K6XA 1POY1 3OEMA 4FEBA 5TPAA 1JW4A 4KCDA 4JSDA 3FVNA 1H45A 4C1TA 1B52A 5F7VA 1Y20A 3OO6A 2O68A 4PQJA 4G2ZA 1H76A 4QFPA 4OEVA 4NF6A 1P99A 3FXRA 1USYH 1UIVA 3DM0A 2YJPA 2I4CA 4H6DA 1VFEA 3MVWA 4QSDA 4ELQA 4OERA 3CRBA 5JK4A 2VD2A 1IEJA 1FTLA 3MBPA 3HO7A 1I69A 4FEDA 2XXRA 2FA7A 4GVOA 2D5WA 3TKDA 3A3UA 4OMBA 4OESA 4I62A 4JDFA 4QRZA 3RUMA 5A5XB 3E9XA 4F29A 5HM4B 1LLSA 1VFDA 5EYFA 4IY5A 5TU0A 1RYOA 1SW2A 4AB5A 3CG1A 4XKPA 3KOTA 1Y4CA 4ZEDA 3MWBA 3B7DA 2QJEA 4PFWA 3CI8A 3MPKA 3FZVA 3EHSA 2I48A 2X7PA 2UVHA 1LFIA 4X9TA 3ILTB 4YMBA 3BBRA 4GL8A 3I5OA 2Q88A 2I0BA 3IK6B 4OETA 1B4HA 4NEDA 1MXXA 2NOOA 4ZS9A 1B2HA 3OELA 1JETA 2HAUA 5H8HB 1IXCA 3FASA 3MW0A 4F19A 4NF4A 4EDPA 2V84A 4M1VA 4Q0CA 2DOJA 4FORA 4KHZE 1M5FA 3I3VA 1MRPA 4WKMA 2PVUA 3KFMA 2KLFA 1MG1A 1B3FA 1URGA 1ZKBA 3RTWB 3QAXA 1B7ZA 4XIGQ 1I6AA 4E0WA 2R6GE 3VVFA 1AH5A 1RKMA 1B7UA 2ESNA 2O69A 4C1UA 2O7IA 1SVXB 5I57B 5KDTA 3H6TA 1FTMA 1PB7A 4G68A 3TUSA 5J1DA 4IO3A 3SEYA 4F39A 2X7QA 2AIXA 2QRYA 1OVTA 4MLQA 1XC1A 3KZGA 3GBBA 4NWDA 4RA1A 4F18A 2HZLA 1XT8A 3AXFA 1WVJA 1GVCA 3VLVA 4QFOA 1D9YA 3O6HA 3S9MC 3LSWA 1MPCA 3N6UA 4TQUQ 4ELRA 1T0KA 5JTYB 4DDDA 2Q2CA 1N3XA 1UIUA 3C31A 1UTBB 5CBSA 3SEVA 3MAMA 5FHNA 5AE4A 4YU0A 2ZNTA 4BDQA 2PMSA 1MDP1 2H5YA 4L17A 3M3KA 2Z22A 1PB8A 3PMXA 1MY1A 3T9XB 3QYTA 1LB9A 1ZIUA 4G77A 4EUOA 4F1VA 1FQDA 5L9MA 2ANJA 2UXAA 4KYEA 4TLLB 1GR2A 5I2NA 3FD3A 3OD7A 1UQWA 5CC2A 2ZMBA 1A7LA 4H8JA 1M5BA 4NMYA 4ZECA 2ZYMA 4HS7A 1S9TA 3VXCA 1B0HA 4H8IA 3BFTA 3W9VA 2UVJA 1H3DA 3VFJA 1B7HA 1GTKA 4U4XA 1OVBA 1R9QA 4K3FA 1J1NA 3KJ7A 1HSLA 3FJGA 4LVQA 1EZOA 1N76A 4OZ9A 3Q29A 2I3WA 1PDAA 1MQJA 2R71A 3TYHA 3FJMA 2RINA 3EPEA 5FTHA 2F7AA 3JV9A 1Y3NA 4ELOA 3DLNA 4GL0A 1EU8A 3IORA 5DYHA 1YTVA 2Y7PA 3LR1A 3N6TA 5H8NB 4XTCQ 1S50A 2DP8A 2F35A 3V5AA 2HCAA 1B05A 2XHDA 4EXKA 4N07A 2XXWA 3VXBA 3U8QA 2Y7RA 4F3GA 3S9LC 3K6VA 2O6AA 3THIA 2RF1A 3B6TA 2I6EA 1B1XA 4RPNA 2A5TB 3H06B 4N13A 3HHFA 3MP1A 1NFTA 3LSLA 4GRKA 4QFLA 1MM6A 1ZBMA 5M2VA 1AMFA 4XKQA 3ZKLA 5CI5A 3P7IA 1B3EA 1ZU0A 4GXSB 1QULA 4GWOA 2B65A 3K01A 2OCUA 4ESWA 3RNNA 3UIFA 3TEPA 3O6IA 2G29A 4LZ8A 3K1NA 1P1WA 4IO7A 3C34A 1A54A 2R9JA 3FJ7A 2XX8A 2GRVA 1D9VA 1CB6A 4RK9A 3SDFA 1IXHA 1A99A 5L9OA 5TP9B 3DELB 3K6WA 1LCTA 5ELVA 4Z7EA 3MP6A 3MVXA 3TPAA 3RLFE 2XXXA 5H8FA 1F9BA 1O7TA 2XXTA 4MF3A 4ZE8A 4LZ7A 3K6UA 1MXZA 3C4MA 3U92A 3LUYA 1LSTA 4XXUA 4U22A 1N7WA 1B0LA 1P1QA 4NF8A 1DPPA 3KG2A 2DWHA 4TOZA 2BJJX 3KSJA 2QS1A 1B5IA 2OZZA 3O9PA 5L8DA 3F11A 3PMWA 1QKBA 3EHUA 3O2AA 1B40A 4PFUA 4OWDA 4Q30B 4F2OA 2V3QA 3TTLA 1IXIA 4DZ1A 5IKBA 1OQGA 5L9SA 4JB7A 2O1MA 4BDMA 1SYIA 4H67A 5CRYA 3G3FA 4F1YA 1B6HA 1PB9A 3CSBA 4P11A 1MQHA 3T22A 1NNKA 3CVGA 2QS2A 4MBPA 5AA4B 2UVGA 1B5JA 1N3WA 3QK6A 3IJXB 4FECA 4NF5A 2DXYA 2NUVA 5I58A 1MXYA 3FV2A 1NNTA 2XXQA 3TTKA 1YAEA 1MQGA 4YB7A 5I56B 5JEIA 1NL5A 2QMXA 3FVKA 3Q25A 3OENA 5IAIA 3SKPA 2UVIA 5I2KA 4JWOA 3FVOA 3SEXA 4FATA 1B3GA 3ECRA 3TQLA 1JW1A 2HEUA 4WEPA 2I49A 2THIA 2I0CA 3Q27A 1QUJA 4HCWA 4ZDMA 5ITPA 1WDNA 3SEUA 3VLUA 1QJMA 3K00A 3N5LA 5CBRA 3PUWE 4U1ZA 3G3IA 3EQ1A 4IO4A 3GBAA 4QSEA 4XKRA 4BDOA 2M8CA 2F6GA 2F7BA 2ONRA 2AL4A 3CFXA 3KJTA 4POXA 1QVSA 3IL1B 4QSCA 4PP0A 5B70A 3UN6A 3K4UA 2XD2A 1TFDA 5I59B 1USYE 1NH7A 2DSFA 4P0GA 5K2YA 1B3HA 3RN8A 5AA2D 2V93A 5ICQA 1DMBA 1PBPA 1UTHA 2NXOA 2O7UA 4Q8RA 4KD5A 5B7DA 1B58A 5H8SA 3GLBA 2IA4A 1OLAA 4WXJA 5FHMA 1Q1KA 3PUVE 4ZEFA 1MQDA 2ZYKA 1M5EA 4EQ9A 2ALUA 4EXLA 1QW0A 3M8UA 3IO4A 1JW5A 1NH8A 4RPOA 1TXFA 3IB2A 2GHAA 3O28A 4LA9A 2DS9A 3O66A 1LGBC 1EZ9A 1Z7NE 4ZE9A 2PBWA 3RT6B 4POWA 5DVJA 4U21A 2NWJA 3EHTA 3HCQA 4JSOA 3MPLA 1LB8A 4X1BA 3PUZE 4R9GA 3H03A 3SEWA 2QPQA 1LFHA 3QSLA 3TTRA 4KI0E 3K0VA 4IGRA 4YKIA 5ISUA 2HAVA 5CMCA 4IO6A 4GIZA 3FVGA 3OMBA 1MY2A 5H8QB 1SI0A 3C32A 5DT6A 5DVIA 4QHQA 4DIGA 4ZZAA 4N6PA 4R2BA 1A40A 5KZTA 3CFZA 1ZJLA 4H1XA 3C33A 4YZZA 4BLAA 1P1UA 4OQOA 4ZZEA 1XS5A 3FXQA 3KBRA 3WAFA 1DTGA 3IOTA 5FTIA 3PPPA 1Z7ME 4YICA 3RQTA 3IAZA 1VR5A 1FTKA 2Y7WA 4PFTA 3O29A 3H7MA 1PBQA 4TLMB 2DVZA 4PFYA 2V25A 3EN3A 1IXGA 4G8HA 2ZYNA 1Q35A 3IB1A 3KN3A 4IO5A 4YKPA 4RY1A 1B1HA 5A5XA 1B4ZA 2DE2A 2G93A 1US5A 1MQIA 1PC3A 3UGWA 4P0IA 4BDNA 5LOMA 5AA3A 3G7WA 1B3LA 3R6UA 1Y1ZA 3FGSA 4LUBA 3BKIB 3H6VA 1MDQA 1IUDA 2VOZA 5I59A 4BDLA 1D4NA 4ECFA 2H99A 1N0TA 1YPNA 2B3FA 4H0WA 1TWYA 2AL5A 3CR9A 4G8NA 1QKAA 1MXUA 5H8HA 1LAFE 3RPWA 4R74A 1JNFA 3KN8A 5TPAB 4IB2A 4DCYA 3W9WA 3OOAA 2P1SA 3OO7A 3H3GA 1GGGA 2E1SA 4NF6B 1RYXA 2LAOA 1IITA 2DWAA 1SBPA 3FATA 2PT1A 3OSRA 1LBBA 3DP6A 1FTOA 2H4IA 3K02A 4F2QA 1BTJA 3TCGA 4ISUA 3U72A 2ZNUA 3A3CA 3Q26A 1I6BA 4JXIA 1LFGA 3VE1B 5CMMA 1Y4TA 2XXPA 3K1MA 3K2DA 1B46A 3G3KA 5I57A 4UA8A 3H6WA 1AIVA 2D21A 1YCJA 4UACA 3W15C 3FV1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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