5I57B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
277
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 277
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B02
3FXRA 2XXUA 3U94A 4YKKA 3KJ7A 1ELJA 3SETA 4XKNA 2RINA 1IZ1A 2H25A 2F36A 4KYDA 2ONSA 3WAEA 4YKPA 2QS2A 1T0KA 1OQHA 4F3BA 4O3CA 4H5FA 3QK6A 2XXQA 3QXMA 4R6YA 1LCTA 1UTHA 3IX1A 1A55A 4OXVA 3MP6A 3FJ7A 4QHQA 4GXAA 1M5CA 2QPQA 3G3IA 4PE5B 1YTVA 3HO7A 1IXIA 2VGQA 3EF7A 1MY0A 3CIJA 4XTCQ 3IOVA 4OQOA 4H6DA 3O28A 5DVFA 3PPQA 1PB9A 1M5BA 2A5TA 4IGTA 2X7PA 5KDTA 1A54A 1DMBA 1B05A 3CG3A 1MY2A 1MPCA 3T9VA 2DVZA 4ONYA 3VLVA 3B6QA 1Y3QA 2F7BA 1SYIA 1IIWA 3CFXA 3MWBA 3FZVA 5I58B 4YKIA 3T9UA 3S9NC 1ZJLA 5AA1A 5JEIA 3TQLA 4DXBA 1UIUA 4F1VA 4X9TA 3T66A 2DXYA 1CB6A 3G3FA 2O6AA 3V89B 3RT6B 3TODA 1D9VA 3R6UA 3LSFB 4HW8A 3N6UA 1JEVA 4KD5A 5H8QA 2DWJA 5I57B 4LP2B 3KOSA 1B3GA 1JEUA 4LZ8A 1B6HA 2Y84A 4JWOA 1NNFA 4NEDA 4NF4B 2NOOA 1US4A 1MM7A 1H44A 1MY3A 4JSDA 4OZ9A 1N76A 2E0SA 2OWSA 5H8FA 2Q8JA 3B6WA 4NWDA 4P0GA 5CMCA 3LR1A 1NMUA 5AA4B 4YZZA 2PMSA 2I4BA 2XXPA 3PMWA 3VVDA 2B65A 1JW4A 1IEJA 2AYSA 4ZECA 3KGCA 1BTJA 3H6UA 2DP8A 1XS5A 2KLFA 1Y20A 3U1OA 3O6IA 2NVUB 3O29A 3TPAA 5I2NB 3MZ9A 3ZSFA 3K4UA 4DE8A 3G3GA 4YB6A 2VHAA 2Y7WA 2ZNTA 3OSRA 3H6VA 3HHGA 1R9QA 4POWA 3RGYA 3H6WA 4GRKA 5I84A 4LVQA 4MF3A 3SEXA 3QSLA 4GWOA 3A3UA 4F1YA 4BLAA 4H8IA 2HEUA 2DWIA 1XVXA 2R6GE 3IOWA 1Y3PA 2DS9A 3RPWA 1GV8A 4GQOA 5CMKA 2XX9A 1FTJA 2YLNA 1FQAA 3FXQA 1BP5A 1FQCA 1OVTA 3MJNA 3HN0A 3F11A 5HM4B 3T9XB 5CBRA 1MQDA 1ZIUA 1O64A 1LB8A 5DTBA 1B51A 4XKPA 4ISUA 5L8DA 2PVUA 2RKMA 1MQJA 1Z7ME 3CVGA 3O2AA 4RNSA 5ELVA 5JTYA 4OERA 4Z7EA 1BKAA 3QAXA 3I6VA 2GRVA 1IXHA 3KG2A 4EXLA 1AIVA 5ISUA 2V93A 2I3VA 3G3HA 1AOVA 2O7IA 5KCJA 1US5A 4U23A 3RUMA 1OVBA 3UGWA 1J1NA 4EF1A 4UA8A 3N26A 4OHNA 3MW0A 1QUIA 4FATA 3WAFA 3VXBA 4YU0A 1MDP1 3MBPA 1SYHA 3MVXA 3L6HA 2BJJX 5B7DA 5CMBA 4I62A 1P1WA 3B7DA 1MM6A 5I2KB 3K01A 4IO6A 4HS7A 3UN6A 1A8EA 3OO7A 3W9WA 1UTBB 3R26A 1P1OA 3MQ9A 4Z0IA 4NF6B 1D4NA 3PUYE 3S2VA 1N84A 1EZPA 4HTGA 3PUWE 4BDLA 4C1UA 1ATGA 4F2OA 1D9YA 4XIGQ 1I6QA 4KYSA 2XXVA 3LSXA 1MDQA 2CMOA 4R9FA 1B3HA 1PC3A 1OMPA 4BDMA 4ELQA 2DXRA 4R74A 3PMVA 3AXFA 3Q27A 1LB9A 4F2QA 2F97A 2H99A 3TFLA 3K1MA 2FA7A 1BLFA 1FQFA 2E1SA 4U1OA 4H65A 3TTMA 3VV5A 2O68A 4NE4A 3CSGA 2R71A 5BWJA 4ZEDA 2Q88A 3TCGA 4OMBA 1XT8A 1URDA 2VD2A 5TP9B 5ICTA 3PU5A 4YB7A 2GH9A 4YICA 3MP8A 2DWHA 2QS1A 4LONB 4X1BA 4F39A 1JW1A 4IO5A 3RNNA 5DEXB 3ODBA 1JW5A 1P1UA 5I58A 1POY1 1RYOA 2NXOA 3VVFA 3PUZE 1MXVA 1M5EA 3KZGA 3OO8A 1SI1A 4FEDA 4BDNA 4TLLB 3OO9A 2Q89A 1NH7A 1DOTA 3VVEA 3V8XB 2HAVA 3LUYA 3ILTB 4Q5TA 1SBPA 1QUKA 5I57A 3RQTA 1B5IA 3OD7A 3MVZA 1S7YA 1I69A 1TFAA 1XOCA 1B52A 4JDFA 3BBRA 3TTLA 1Y3NA 4NF4A 4X1DA 1LCFA 4LZ7A 3Q28A 3H7MA 4R9GA 1BIYA 4AB6A 1N04A 2ZXTA 4BDQA 2D21A 5K2YA 4GXSB 5H8HB 2FNCA 4JXIA 3M3KA 4KI0E 5I56B 5AA4A 4DCYA 1JVYA 2AL4A 5FHOA 4G8HA 4EUOA 4MH5A 3T93B 3OEMA 4QSEA 3JV9A 2HXWA 2P2AA 1FTLA 1SD3A 4IGRA 2ANJA 2NWJA 4U1ZA 1Y4TA 4ZZEA 4GL8A 3RTWB 2Y7RA 2UXAA 3Q25A 3TUSA 3N94A 1EZ9A 5I2NA 5TU0A 1F9BA 2GFEA 2YJPA 4MLQA 1B5JA 1JNFA 4ZEBA 1EU8A 1B4HA 4G8MA 2RCAA 1AMFA 5H8NB 4FJPA 4TLMB 2O7UA 2P1SA 1OQGA 4RPNA 4RPOA 2DE2A 4QFKA 4U2RA 3THIA 1PEBA 4O3BA 2PX1A 1MQIA 1SW5A 3HSTA 3KJTA 2UVHA 2F5XA 2H9BA 3FV2A 1SQYA 2OCUA 5FTHA 4LA9A 5DT6A 4GFRA 2PT2A 1II5A 5BUUA 3LSWA 4ESWA 1WODA 1B1XA 1DSNA 5HBCA 4EQ7A 1QUJA 1Y9UA 4KCDA 1H76A 1N3XA 3PPRA 3FV1A 2I6EA 3M8UA 2UVJA 3O9PA 5FHMA 3VDFA 4OVJA 3S9MC 2F6GA 3BFUA 2HAUA 1VE4A 5M2VA 2HZLA 3S9EA 2DOJA 3D4CA 3Q26A 1URSA 3IO4A 2Z8EA 4ND9A 4MLVA 2AIXA 5L9OA 3TEPA 2ABHA 5A5XB 2Q9TA 3K0VA 3PPOA 1WVJA 3TCFA 1LSTA 4ZE9A 3I5OA 1O63A 2Z8FA 3KFMA 5JK4A 3MP1A 1MXZA 4G8NA 1B46A 4RK9A 3S4UA 3Q29A 4ELRA 3MVWA 1MY1A 3OEKA 3TAJA 3TKDA 5I2KA 2UYFA 1PB8A 3EQ1A 4C1TA 2H4IA 1UTBA 3OMBA 2XHDA 1S9TA 2ONKE 4NF6A 3C4MA 1M5FA 1XHYA 2CZLA 3K02A 4X48A 1QJMA 4M1VA 2O84X 4FIMA 1S50A 1M5DA 2I0BA 3TTNA 3FIRA 1IXGA 1P99A 1MXXA 3SKPA 4FAJA 3G3JA 3IO6A 2UVGA 4YMBA 4WKMA 4NMYA 3FVNA 3C32A 3IOUA 4KPTA 3S9LC 3LSLA 2V3TA 4OFOA 4DXUA 3P7IA 1P1NA 1VFEA 1VFDA 1OLAA 3PD9A 4H67A 2DWAA 2XXRA 1ZU0A 2VP1A 4EDPA 4YB5A 5DYHA 4DIGA 5TP9A 2GHAA 4GL0A 4GVOA 4OEUA 3EN3A 1GVCA 4ZEKA 5DVJA 4OETA 3FATA 5DEXA 3KBRA 5F7VA 2VD3A 3QYTA 3ZKLA 1D3KA 3IJXB 3OOAA 3K6UA 2X26A 3T9HB 4PQJA 3RN8A 2QL3A 3ONMA 3DELB 1UQWA 4ZZAA 2HQ0A 3OENA 3MPLA 1FTOA 2I4CA 1DTGA 3MPKA 1FCKA 1B5HA 2ZYOA 4JBZA 3C34A 4EQ9A 4EXKA 1NKXA 5ITPA 4KR5A 4R73A 3EHTA 2H98A 3BKIB 1FW0A 4ELOA 1NFTA 4P11A 2XD3A 4U21A 3N6TA 2G93A 5L9MA 1Q1KA 1DTZA 2IEEA 2F7CA 3H4ZA 1QKAA 3FUZA 3K1PA 3QUJA 1B2HA 4ZDMA 3TTKA 3U93A 1EZOA 3E4RA 1IXCA 3FVKA 4G68B 1A99A 4AQ4A 5H8HA 2ZNUA 3KN8A 4C0RA 3G7WA 3FVOA 1LAHE 1HSLA 5FHNA 3UK4A 5I56A 1N3WA 2F34A 4Q0CA 3ILUB 2VOZA 4F31B 3GZGA 4U4XA 5AA2D 4HCWA 1MRPA 2ONRA 3K2DA 1GTKA 3JYRA 1AL3A 1UIVA 5I59B 1XC1A 1IQ7A 4QFOA 4UACA 4R6HA 2RC8A 1USYE 5HPQA 3L6GA 3SEYA 1DPEA 1MY4A 1SDXA 3B6TA 4F19A 3ECRA 3U72A 4ESXA 3JZJA 3KN3A 3GBAA 3HPIA 2F6PA 3MZBA 3IR1A 3PMXA 4IO7A 5DVIA 4RXLA 5H8NA 4XXUA 3FXUA 1PB7A 4YMAA 1OLCA 4NF8B 1ZBMA 1R1NA 4Q30B 3TDJA 5TPAB 5L9SA 3DP4A 3PPPA 3T22A 5J1DA 3W15C 3I3VA 3PUXE 2ZYNA 2DQVA 4QF9A 4DCXA 2B3FA 3QUFA 3G3KA 1Y1MA 4DZ1A 4RJZA 2X7QA 4OEVA 1Z7NE 2DSFA 3IB2A 3RLFE 3A3CA 4IY5A 3T96B 4BDOA 4F3PA 1EH3A 1L5TA 1LBCA 4KQPA 1JVXA 4XKRA 3SEUA 3SEVA 4RYAA 3IB1A 1ANFA 3TMGA 1A40A 1IITA 2Q2AA 3TQWA 4FORA 3OO6A 3VLWA 1TXFA 3GXAA 3PPNA 4GD5A 4QFNA 4NWCA 4POXA 1VR5A 5A5XA 1LBBA 4F3GA 3IL1B 3D4GA 3SEWA 1Y1ZA 5H8SA 3KSJA 3EHSA 4FEBA 4F1UA 3FGSA 3C33A 1B9JA 4GOTA 1LAXA 4L17A 2Z23A 2A5SA 1MXYA 3VE1B 4JB7A 1ZLQA 1NNKA 1TFDA 5FTIA 3OELA 4QSCA 1I6AA 3HCQA 4NF5B 3OSQA 1LLSA 4PFWA 3MUQA 3CG1A 2XXTA 4G4PA 3IORA 3TZAA 3O66A 1LAFE 3CRBA 2F7AA 2DE4A 2HZKA 1FQBA 2M8CA 2RC9A 3O97A 1B4ZA 2Y7IA 4WXJA 2IA4A 4F3SA 1B7HA 2UVIA 2I0CA 3CI8A 4U22A 2Z8DA 5CRYA 5AA2B 4NTLA 5CI5A 1N0TA 4G68C 3FD3A 4GF8A 5ICQA 2QJEA 5B70A 4OTEA 2QSXA 2D5WA 4F29A 1FQDA 5CBSA 4I8CA 1B3FA 4QSDA 1N7XA 3KEIA 1PBQA 2QMXA 1LGBC 2ESNA 4FECA 3GBBA 4YAHX 1B3LA 3MVYA 1B0HA 3CR9A 3DP8A 1MQGA 2V3UA 3E13X 4Q8RA 4R2BA 4RK2A 2OBGA 4H5GA 4MFIA 4O3AA 2HCAA 2F78A 2QMWA 1R6ZA 4I9DA 3K1NA 4OFJA 2OWTA 1PDAA 1FTMA 3N5LA 5LOMA 3V5AA 4AB5A 2H5YA 4QFLA 4OWDA 4JSOA 3HV1A 4PFTA 2XD2A 3VXCA 3UORA 1MQHA 1MH3A 2XXHA 1USYH 2PYYA 4IO4A 2XXXA 3LBSA 4DLDA 4DDDA 1ZKBA 5IAIA 1TT1A 3CSBA 3RTFB 2WKYA 3C35A 1YAEA 2Y7KA 2XXYA 1GR2A 3GLBA 1MS7A 1JQFA 3CFZA 4N07A 2V25A 5AE4A 1HSEA 1POTA 5F1QA 2ALUA 3QIMA 3ZKKA 3O6GA 5EHSA 1NNTA 4H0WA 3IOTA 1UTHB 4WEPA 3PUVE 2RCBA 3MAMA 1SW1A 1NH8A 4G68A 1TWYA 3DM0A 4YKJA 3U8QA 4IO3A 2ZYMA 3FASA 2G29A 5K2XA 2DVCA 1DPPA 4ZEFA 1ZMGA 4G77A 3UIFA 1H43A 3IAZA 4KFQA 1QKBA 3DLNA 4U4SA 4DXCA 1I6BA 4ZEIA 2PT1A 1H45A 2I49A 1HSJA 2FYIA 3C36A 2GHBA 2Y7PA 1NL5A 4EQBA 1SW4A 3PD8A 2A5TB 2XXWA 1CE2A 2B3BA 5KDTB 5CMMA 5I59A 2Q2CA 5AA3A 1QW0A 4I1DA 1URGA 2QS3A 4THIA 4R6KA 3H06B 1A8FA 2Z22A 3TELA 4PFYA 2R9JA 4KHZE 3IB0A 2D3IA 1QVSA 3H6TA 3R7XA 4H1XA 3E9XA 2ZNSA 4LATA 4QRZA 3OXNA 2LAOA 4GLIA 3LC8A 5KZTA 4TOZA 1R9LA 3K00A 1SI0A 4MBPA 2RC7A 2THIA 2P0SA 3SESA 2I48A 4NF8A 1KWHA 5TPAA 2XXIA 4F22A 2REGA 4OESA 1AH5A 3EHUA 3CFLA 1LFGA 4ZS9A 1B58A 2W7YA 5H8QB 2I3WA 2RF1A 4M4GA 3IJOB 1B7UA 3ZS6A 1MPDA 3FVGA 4KCCA 1MH4A 4WEDA 2O69A 1QULA 1GGGA 4KYEA 2DYXA 3A09A 2NUVA 3C31A 1B7ZA 2QRYA 3RY3A 2OJTA 1B32A 3IK6B 1Q35A 1MPBA 4R2FA 4R75A 3O6HA 4RA1A 4XKQA 5H8FB 2ZMBA 4OFLA 3W9VA 2HFBA 4F18A 1Y4CA 3BFTA 4IY6A 3V83A 3MZ1A 2XX7A 1PBPA 3RT8A 1FQEA 4LZ5A 4JWXA 4E0WA 4K3FA 2V3QA 4E0XA 2OLBA 1RKMA 5ITOA 1FTKA 4ECFA 3C9HA 4IO2A 3PGFA 1SW2A 3UA8A 5IKBA 2ZYKA 2QS4A 4G2ZA 1MG1A 2I58A 4N6PA 2V84A 3UP9A 1YPNA 1JETA 3U92A 2AL5A 4H8JA 3DP6A 1MXWA 2REJA 4LQ2A 1B1HA 4IB2A 4EF2A 3EPEA 4NF5A 1XVYA 3VFJA 1OIBA 1VSOA 4ELPA 1B40A 1A7LA 4QFPA 2OZZA 3VLUA 3H03A 4PETA 2UYEA 3KSXA 1LFIA 4P0IA 3FJMA 1NNPA 4TQUQ 2O1MA 4OYVA 3SDFA 2PBWA 1RYXA 5AA2A 4JWYA 5JTYB 5EYFA 4GIZA 1IUDA 2F8DA 3TCHA 1ZTYA 1B3EA 4N13A 4PFUA 3KOTA 1P1QA 1MXUA 1B0LA 4R72A 3FJGA 1YCJA 5KCJB 3HHFA 2YPNA 2DE3A 3K6XA 3MC2A 5CC2A 4BDRA 4RY1A 4FE8A 1N7WA 4PP0A 3TTRA 3M3FA 1H3DA 3SERA 1LFHA 3E3KA 3H3GA 2OK2A 4OENA 3K6WA 1LAGE 3M3LA 3USDA 2O51A 3K6VA 4HCYA 2O1LA 3KN7A 1WDNA 4ZE8A 5EHMA 4LQ5A 3PV0E 3TYHA 2F35A 1SVXB 2XX8A 4LUBA 1O7TA 5CM6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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