5I59A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx 007
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
282
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 83
structure length 262
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A02
1MM7A 1SBPA 3VE1B 3K6VA 4GD5A 3MWBA 4YICA 2Q9TA 1MQIA 2UVJA 1M5FA 5KDTB 4MF3A 3CFLA 4I8CA 3SEVA 3B6WA 1R6ZA 5FTHA 4IB2A 3W9WA 1Y1ZA 1MRPA 5EHSA 1FQEA 2O69A 1LSTA 3PMXA 4EQ7A 1OLCA 4PFYA 4ZE8A 2DVZA 1QUJA 2F5XA 4DXCA 1IXHA 2HQ0A 1IITA 3GXAA 5AE4A 1WODA 4MBPA 1SDXA 1DTGA 3N6TA 4IO4A 3N5LA 5I2KA 2ZXTA 2RC9A 4H5FA 1MY3A 1FW0A 2OBGA 4IGTA 4Q0CA 2UVIA 3TTNA 3SEUA 3ONMA 5TPAA 3MP6A 5AA2A 4F1UA 4IY5A 5AA2D 3SEWA 1BKAA 4LZ7A 3K01A 1FTJA 4OQOA 1A40A 4KYSA 1PB7A 4KYDA 2ONKE 1Q35A 4RYAA 1HSEA 5I2KB 3TCGA 4ZEIA 4QFPA 3PMVA 2F35A 1UTHB 3QUFA 3TKDA 4POXA 4O3BA 1WVJA 5TPAB 2O1MA 2DE4A 5H8QA 4HCWA 4F1VA 2Z8FA 2PMSA 5AA2B 3RTFB 2QS4A 1S50A 3KGCA 3MP8A 1GVCA 2D5WA 2KLFA 3IJOB 1Y4TA 3PUYE 4DXUA 4PFWA 4P0GA 2XXRA 3FV2A 1P99A 1SW4A 1MY4A 1VR5A 1B7ZA 1O64A 1ZIUA 2REJA 4GL8A 5BWJA 1BIYA 2Z8DA 2YPNA 2DE2A 1R9LA 3KJTA 4FAJA 3ZS6A 2Y7RA 3TTMA 2VGQA 3HO7A 4QSEA 4BDOA 3Q26A 4N6PA 3KN3A 1GGGA 3IOWA 3HHGA 1AMFA 1PBQA 3KOTA 2Y7IA 2O6AA 4JSDA 4KCCA 1LBBA 4PFUA 2DYXA 1B4ZA 3MAMA 3H4ZA 4ESWA 2Q88A 1XC1A 1MS7A 1MPCA 2O51A 4NWDA 1JW5A 2R71A 4XTCQ 1MXWA 4F2QA 5CM6A 2F7BA 3H6TA 5I57B 4X1BA 3CFXA 4ZEDA 1B46A 4JBZA 5L9OA 3UORA 5AA1A 2UVHA 1YAEA 3LSLA 1SYHA 2O7IA 2I58A 4EDPA 2BJJX 3G3IA 3C9HA 3MUQA 1H3DA 1PB8A 1GR2A 4UA8A 1Z7NE 5KCJA 5L8DA 1XS5A 4IO5A 3K02A 4MLQA 3I6VA 3OXNA 4YKPA 1A55A 3JV9A 5I58A 3BFUA 2RCBA 3MW0A 1JETA 3CVGA 3ILTB 3S9LC 3H03A 4ZZAA 3K6UA 1NKXA 4RXLA 4YB7A 4YZZA 4FJPA 3CFZA 4F3PA 5IAIA 2QRYA 3IAZA 4Q5TA 2ONSA 3T22A 5ITOA 1TWYA 5KCJB 2ZYNA 3OO9A 4I9DA 2LAOA 4Q8RA 2XXXA 2AL4A 4DLDA 4LVQA 5H8HB 3H3GA 2I3VA 1H43A 2A5SA 3I5OA 2V93A 4NEDA 4QF9A 4BDLA 4PP0A 2ANJA 3MQ9A 2HZLA 1R9QA 2DWIA 3HCQA 1MM6A 4ELPA 2REGA 1IQ7A 1B1XA 1UQWA 3E9XA 3QXMA 4PFTA 1IIWA 3FJ7A 2QS1A 2VOZA 3H06B 2NUVA 4G77A 2OJTA 3O6IA 3MJNA 2F7CA 1MY1A 2QSXA 2O7UA 2XXYA 5ICTA 4M1VA 4NE4A 2Q89A 5HBCA 1VSOA 2XXWA 5A5XA 5K2YA 3O9PA 3GZGA 3WAFA 5DYHA 1URGA 2PBWA 4JSOA 4ELOA 1BP5A 5ITPA 1M5DA 4BDQA 5AA4B 2HZKA 1AOVA 3CIJA 3K2DA 1N7WA 4QSDA 4GWOA 1Y9UA 4I62A 3MZ9A 3T96B 3TQLA 3OENA 3OSQA 3MVZA 2ONRA 2W7YA 3KOSA 4KD5A 3FVNA 1IXCA 2QPQA 2ALUA 5A5XB 3FD3A 1MQDA 3V8XB 5F7VA 4KPTA 2E1SA 3HPIA 1JVXA 1LB8A 1Q1KA 2FA7A 4MLVA 1BLFA 3GLBA 1JEVA 1NL5A 5AA3A 4H5GA 3LSWA 4POWA 3FXRA 4F2OA 4H67A 1B5HA 3TFLA 2ABHA 1ZKBA 4M4GA 2XXVA 2XXIA 3MVYA 3DP6A 3JYRA 4YKJA 1QW0A 1OQGA 4LQ2A 3FJMA 2XX9A 4BDMA 4YKIA 1P1OA 2NVUB 1UIVA 2R6GE 5CC2A 3CR9A 2PX1A 1SYIA 1I6BA 1PBPA 1OMPA 4HS7A 5CBRA 3K1PA 4OTEA 5DVFA 1ZTYA 3GBBA 1B40A 2DP8A 3M3LA 4WXJA 2V25A 1RYOA 3IL1B 4R6KA 3WAEA 1N04A 1DPPA 1TXFA 3UGWA 1Z7ME 3D4GA 2OWSA 1SVXB 4BDRA 1B3HA 1II5A 1MQJA 3UN6A 3KSXA 3MPKA 1B52A 2NXOA 3LSXA 1UTBA 1JVYA 5CI5A 3W9VA 3IOTA 4XKNA 2Z22A 1OVTA 4GIZA 5LOMA 1LGBC 1SD3A 4EXKA 1NNKA 4U2RA 1OVBA 3K0VA 2Y7KA 5H8FA 3CSGA 3IOUA 1Y3NA 3UIFA 3RT6B 3S9MC 3FVOA 3THIA 3VVFA 4OVJA 1LB9A 4ZEBA 1AIVA 4TLLB 4H1XA 1QUIA 1UTBB 3Q28A 4R74A 2DXYA 2Q8JA 1L5TA 4QFKA 3G3GA 3VFJA 4H6DA 4G8MA 1DMBA 4PQJA 4XXUA 2OCUA 5FHNA 4OESA 1YTVA 3GBAA 1B58A 5TU0A 1AH5A 2OK2A 4F3GA 5CMKA 1B05A 4F1YA 1ZMGA 4ZECA 3IO6A 3T93B 3EF7A 3IORA 3A3CA 4QHQA 3EHSA 4FATA 3KBRA 4OMBA 4OEVA 4QRZA 1XVXA 4KR5A 1VFDA 1DSNA 2VP1A 4H8JA 2F6PA 2G93A 3SERA 2RINA 2ESNA 2DVCA 3TELA 5I84A 4NMYA 3G3JA 2Q2CA 3FGSA 3RGYA 3R7XA 3SETA 2RF1A 1H45A 1B5IA 4QSCA 4F3BA 3T9VA 3DELB 3BFTA 1B0HA 4DCYA 2GH9A 1B3EA 2YJPA 3MBPA 3MVWA 5JTYA 4R73A 3VVEA 3V5AA 2GFEA 1MXVA 3DP4A 3FASA 2UYFA 4R72A 1DOTA 1MXXA 3ILUB 5H8QB 1JEUA 5CMCA 2Q2AA 1IXIA 3FVKA 3KEIA 1B0LA 2XX8A 5H8SA 4OEUA 1CB6A 1QUKA 1HSJA 2DE3A 3ZSFA 2AIXA 3N6UA 4G8HA 3TODA 1XOCA 3M8UA 1LAFE 1IEJA 3U8QA 1MG1A 1LLSA 4NF5A 4DIGA 2ZYOA 5JTYB 3O29A 4RK2A 1FTLA 3TUSA 3K1NA 4G68A 1JNFA 3LC8A 1UIUA 3IB0A 2UXAA 3QUJA 3RQTA 3FUZA 2UYEA 3U94A 5IKBA 2V84A 1FQAA 4MH5A 2V3TA 2OZZA 4U22A 2ZNTA 3KFMA 4OHNA 4HCYA 2GRVA 1H76A 4TLMB 4DE8A 1MXZA 3IB2A 1POTA 1NNFA 4G68B 3KZGA 3R26A 3RT8A 3TYHA 1B6HA 4DZ1A 4KQPA 4OENA 3PUVE 2F36A 2QMWA 3OELA 3U93A 1I69A 1P1NA 1I6QA 2I0CA 1ZLQA 1XT8A 3C35A 3VLUA 2DWAA 2P0SA 1BTJA 3LUYA 1NNTA 4U1OA 4F39A 2DWHA 4OETA 3Q27A 4ZEKA 3FVGA 3IOVA 4YB5A 4DDDA 3QYTA 4GL0A 2AL5A 4U21A 4P0IA 3O66A 3IR1A 4ZE9A 1MQHA 1XHYA 3K4UA 1I6AA 2H9BA 1SW5A 4U23A 3SESA 4Z0IA 1ANFA 5H8NA 5I58B 3USDA 1DPEA 2I3WA 3VLWA 3SEYA 1P1WA 3H6UA 4F18A 2Z23A 3Q29A 3UP9A 1FCKA 3K00A 1P1QA 4LUBA 3OSRA 3UA8A 1LAXA 1NMUA 4RK9A 1EH3A 3CG3A 1EU8A 3N26A 2HCAA 3CRBA 3D4CA 1QULA 5J1DA 3JZJA 4TQUQ 1MY0A 2O1LA 1QVSA 5H8NB 4ISUA 1AL3A 4GRKA 3G3KA 4ZEFA 3MP1A 4G4PA 4RA1A 3W15C 5DEXA 4EF2A 2V3UA 3G7WA 3PUWE 1VE4A 4R9GA 5DT6A 3U92A 2ZYKA 4XKPA 3PUXE 1B51A 4HW8A 1WDNA 4XKRA 2M8CA 2Y7PA 3IJXB 1VFEA 4LZ5A 3RY3A 4ZDMA 2OLBA 1MDQA 3PPRA 2HAVA 5TP9A 3TZAA 2RC7A 2DQVA 2HEUA 4THIA 4N07A 3O97A 1B7UA 2QJEA 3ZKKA 4H0WA 5DEXB 2O68A 2R9JA 1GTKA 4IY6A 2THIA 3FATA 2FNCA 4U1ZA 4F29A 1LAHE 2VD2A 3TTRA 3KSJA 3V89B 1LFHA 5F1QA 3BKIB 2DSFA 4F3SA 2ZNSA 3QAXA 1MPDA 3DLNA 4ONYA 4ZZEA 2I0BA 5B70A 1Y20A 4RPNA 2ZYMA 1SW1A 1IUDA 2G29A 5DVIA 1OLAA 2QS2A 2XD2A 1A99A 1NNPA 4IO7A 4EQBA 4F31B 3P7IA 1KWHA 2GHAA 4ND9A 3S9NC 1T0KA 4I1DA 3O6HA 1USYE 3Q25A 4RY1A 1PEBA 3QIMA 3O28A 2DOJA 3HSTA 3TMGA 1IXGA 3O6GA 1RYXA 3FXQA 3T66A 5BUUA 5KDTA 1B4HA 2IA4A 4LZ8A 4QFOA 2XXHA 1D4NA 4ECFA 2F8DA 4OERA 4E0XA 3B7DA 4DCXA 3TQWA 1ZU0A 3EHTA 4G8NA 4K3FA 1GV8A 2ZNUA 3TCHA 1LAGE 3OOAA 3G3HA 4GXSB 2QS3A 2I4BA 1ZBMA 2Y7WA 1B3GA 1M5EA 4OXVA 2QL3A 1NH7A 1D9VA 2NOOA 4YU0A 4FEBA 3OO6A 5CMBA 2UVGA 4IO6A 3K6WA 3RLFE 3R6UA 3TEPA 1JW4A 3TCFA 1DTZA 2X7PA 4RPOA 4AB6A 4KYEA 4P11A 3C36A 2DXRA 4OYVA 1MXUA 3VXBA 1Y1MA 3U72A 2XXTA 1FQBA 5I56A 5JEIA 1TFAA 1B32A 2E0SA 2F34A 3ODBA 4QFLA 2H5YA 2RCAA 5H8FB 5DTBA 4IO3A 3MZBA 1MXYA 3KN7A 4YB6A 1EZOA 3E3KA 1Y3PA 3O2AA 4O3CA 2Y84A 4EQ9A 3TDJA 1YPNA 1ELJA 1M5BA 2QMXA 4YMBA 1J1NA 3FXUA 1UTHA 1LBCA 1OQHA 3OD7A 3LR1A 4NF8A 2IEEA 1MH4A 3RPWA 4EUOA 4OZ9A 2XX7A 2VHAA 1N3WA 1POY1 5I56B 5DVJA 1URDA 2CMOA 2V3QA 3MZ1A 1D9YA 5L9SA 1JW1A 3PGFA 2X26A 2Z8EA 1O7TA 2XD3A 3VV5A 1RKMA 1N0TA 1FTKA 3VLVA 4JXIA 3F11A 1YCJA 4C1UA 3CG1A 2B3BA 2D3IA 4GXAA 4NF8B 4ZS9A 4G2ZA 1N76A 3V83A 3T9XB 4F19A 1USYH 5FTIA 3LBSA 3H6WA 4WEDA 3MC2A 4KHZE 4N13A 5M2VA 4E0WA 1B2HA 1XVYA 3E4RA 3PD8A 4JDFA 1US4A 1LFIA 1CE2A 4QFNA 1EZ9A 3MPLA 4C1TA 2RC8A 2D21A 4TOZA 4R75A 4NF4A 2H98A 5HPQA 2HAUA 3TAJA 3T9HB 3OEMA 1LCTA 5FHMA 3VDFA 1FTOA 4KI0E 3PD9A 4LONB 1MY2A 5ELVA 3H7MA 1SI0A 2PT2A 2DS9A 1FQDA 1N3XA 2WKYA 1H44A 1A8FA 1D3KA 3IK6B 4H8IA 1LFGA 4KCDA 3RN8A 2PYYA 2VD3A 3PPPA 4WKMA 3B6TA 4JWOA 4Z7EA 4AB5A 1FTMA 5I57A 3UK4A 4YMAA 4AQ4A 1N7XA 1SI1A 2PVUA 2I48A 4GFRA 2NWJA 4NF4B 4UACA 1SQYA 5FHOA 3CSBA 4KFQA 4U4XA 4NF5B 3EQ1A 4NF6A 1MDP1 2ZMBA 1S9TA 2GHBA 1QKBA 3M3FA 1R1NA 4LA9A 5CMMA 3PUZE 3BBRA 1M5CA 3FIRA 5ICQA 2I49A 3IO4A 3PU5A 4FEDA 4GLIA 3K1MA 3OEKA 1ZJLA 1O63A 3SDFA 2B65A 2H25A 4OFJA 4GQOA 4FIMA 1NH8A 4DXBA 1A54A 1HSLA 3SEXA 3G3FA 3L6GA 3QK6A 2X7QA 3KJ7A 1JQFA 4R6YA 4R2BA 4NF6B 1S7YA 4U4SA 4Q30B 5EHMA 3QSLA 2F78A 3AXFA 2AYSA 4LATA 3S9EA 3FV1A 1US5A 2I6EA 5H8HA 1IZ1A 3U1OA 5HM4B 3EPEA 3MVXA 4NWCA 4O3AA 1N84A 4BLAA 4X9TA 3B6QA 4PETA 3M3KA 1TFDA 4OFOA 1SW2A 3VVDA 3VXCA 3C4MA 3IX1A 1NFTA 4EF1A 3RTWB 5JK4A 4XKQA 1MH3A 2YLNA 2FYIA 1MPBA 5CRYA 1QJMA 3I3VA 2HXWA 3KN8A 1A7LA 1ATGA 1FQFA 3OO7A 3S4UA 2RKMA 1PC3A 3DM0A 4IGRA 3PPNA 1B3LA 5AA4A 3N94A 3C33A 4RJZA 3PMWA 5KZTA 3E13X 2CZLA 2P2AA 4JB7A 4X48A 1FQCA 4LP2B 3S2VA 4GOTA 2H4IA 3RUMA 3ZKLA 4MFIA 4YKKA 3HV1A 5I59A 4C0RA 4X1DA 1B7HA 5CBSA 3H6VA 4GVOA 1TT1A 2I4CA 3C34A 3PPOA 2H99A 3PPQA 4YAHX 3TPAA 1P1UA 2F6GA 4F22A 3C31A 3LSFB 3FJGA 4FE8A 3PV0E 3L6HA 4FECA 1B3FA 2XXQA 3RNNA 1Y3QA 5I59B 5TP9B 4R2FA 5EYFA 4RNSA 4GF8A 3KG2A 4NTLA 5L9MA 4ESXA 1B5JA 2XHDA 4BDNA 5ISUA 4PE5B 4JWYA 2A5TA 3T9UA 3CI8A 3A3UA 3EHUA 2F97A 4R6HA 3ECRA 2HFBA 1PDAA 3DP8A 1B1HA 2O84X 3FZVA 3IB1A 4OFLA 4G68C 5I2NA 3HHFA 4OWDA 4ELRA 1MQGA 2OWTA 4H65A 1URSA 3A09A 2F7AA 3OO8A 2XXUA 3K6XA 2DWJA 2P1SA 3OMBA 4FORA 4IO2A 4JWXA 1B9JA 4XIGQ 1Y4CA 3TTLA 2A5TB 1QKAA 4L17A 3SKPA 3TTKA 1LCFA 1OIBA 3EN3A 1PB9A 2B3FA 4EXLA 4R9FA 4HTGA 2XXPA 3C32A 5K2XA 2PT1A 4ELQA 5I2NB 4WEPA 1EZPA 1A8EA 3HN0A 5B7DA 1F9BA 4LQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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