5J1DA

X-ray crystal structure of phosphate binding protein (pbp) from stenotrophomonas maltophilia
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
ATAVTGGGASLPADLYKGSADSILPANFSYAVTGSGTGKKAFLENNSALFSTTGTVHFAGSDSVLSSTELNTYNSTYNVSGDANRYGALVQIPSVATSVTIPFNKAGSAVDLSVTQVCGIFSGKITSWSQLAGLGRTGDIQVVYRGESSGTSELLTRFLTSACQPADVSSSNLKLTNGVPAFSVQSTFANLFTTVPSNFIAAPATGGTALYNAVYAIDGRVGYVGPDAIPSLTDATKVAKVKGFSPDEVSVQATLETAAPPTGAAAENPANWVPVFGNPSAGYPIAGYTNFVFGQCYKNATVGANVRGFLTKHYGSTVVNGVEQGPNDVAIRAHKFIPLTKAWRDAVRARFATATNAGAVNNPATCSGIGRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein binding
molecule keywords Phosphate binding protein
publication title Determination of crystal structures of proteins of unknown identity using a marathon molecular replacement procedure: structure of Stenotrophomonas maltophilia phosphate-binding protein.
pubmed doi rcsb
total genus 118
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5j1dA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 5j1dA01
2HEUA 1QUKA 3IOVA 3G3GA 4LZ5A 1B2HA 4JWYA 3PPQA 1BP5A 2F7BA 5AE4A 4DZ1A 5CMKA 5I58A 3THIA 4YMAA 2OWSA 3MP8A 5I84A 5L9OA 2Y7IA 4F1VA 3ZKKA 4JSOA 1JW5A 1EZ9A 1XHYA 3KGCA 1FTKA 2Q8JA 4QFNA 4LUBA 4OFJA 1USYH 3B6WA 3MZ1A 4YMBA 2NVUB 1B58A 2ZYKA 5J1DA 2OCUA 1LAFE 1LCFA 5H8HB 4NF5B 4QSEA 2X26A 1L5TA 3S2VA 3FJGA 2XD3A 3EHSA 3DP8A 4E0WA 4QFOA 1N76A 1A99A 4G8MA 3V5AA 4OYVA 2QS2A 5JTYA 5AA3A 2F6GA 1FQFA 1UTBB 4F29A 2O7UA 3H06B 3ZSFA 1FQAA 4H65A 4Q5TA 3EHUA 3MP6A 3SERA 2B65A 3I3VA 3TZAA 4BDLA 2QJEA 2UVIA 1TWYA 1MY2A 3PMWA 3OMBA 1US4A 2I4BA 1B3FA 2PVUA 1B32A 3FJMA 2UVHA 2VD2A 4KQPA 3RTFB 1SW1A 3CSGA 1ZTYA 3PD9A 4GL0A 2E1SA 5KDTB 2ANJA 4GQOA 2XXHA 4EDPA 4NWDA 4MF3A 3CFXA 4MLVA 3S9MC 4F2QA 4IY5A 4YKIA 1IITA 3DLNA 1AL3A 3I5OA 4MFIA 4IO4A 1QKBA 4GLIA 1MPDA 3KJTA 1URGA 1B05A 1NNPA 4Q8RA 2RC9A 1F9BA 1B51A 1N3XA 4GL8A 1BTJA 5JEIA 1USYE 1IXHA 2RKMA 4F39A 1NH8A 3G3HA 5FHMA 2ZNTA 3H6UA 4N07A 3U8QA 1ELJA 1R1NA 5TP9A 2F35A 2OK2A 4H5GA 4EF2A 3VVEA 3QUFA 4EXKA 2I4CA 3VV5A 2H9BA 2I3WA 5JK4A 1LFIA 2HZKA 1RYOA 3TFLA 1B3LA 5HBCA 4BDQA 4JB7A 5DVIA 4RNSA 3T9HB 1MY0A 1I6AA 4KYEA 3U92A 4YZZA 4GD5A 3PV0E 3IK6B 3B6QA 1SDXA 3MZBA 3CFZA 2H99A 5CBSA 1N7WA 3OD7A 4XKNA 1VR5A 2UYFA 3G3KA 1S50A 3VLVA 1MXYA 2DVCA 3C31A 5I56A 3IJOB 1ZKBA 4H6DA 3C4MA 1VFDA 3PMVA 1WODA 1MH4A 3T9XB 3MBPA 3M3LA 1QVSA 2DYXA 2Y7RA 3PUWE 3BFUA 2I6EA 3PUVE 4ELRA 3VXCA 1XS5A 4NE4A 1B0LA 4FATA 4RK2A 4QFKA 2ALUA 5FHOA 1Y4CA 1NMUA 2UVGA 1B5HA 1DOTA 1QUIA 1D3KA 3TTLA 2O69A 3RPWA 4ELOA 1JW1A 3VDFA 3TCFA 1LAHE 5I2NA 3N94A 5H8SA 4HW8A 4R6KA 4H5FA 1B40A 4NF8B 2F6PA 2CZLA 3MUQA 1MXWA 1MPBA 2VOZA 3SEVA 3UORA 2W7YA 2ZYMA 1CB6A 1H44A 4PE5B 3D4GA 4E0XA 2HAVA 3MVWA 1WDNA 5H8FB 3FV1A 2NUVA 5I2NB 4IGRA 5KCJB 3VLUA 1H3DA 3IB1A 4THIA 1POTA 3QYTA 4XKPA 2XD2A 1MM7A 1PBPA 4LZ8A 4GOTA 4G68B 1QW0A 4HTGA 2ZNSA 3KOTA 1XVYA 2G29A 3CI8A 2DSFA 3TTRA 3TCHA 4G8NA 5H8QA 4FE8A 3AXFA 2OZZA 4XXUA 4IB2A 3K2DA 4DLDA 4QSCA 4FJPA 4NTLA 4F1UA 4L17A 3RUMA 2CMOA 3QXMA 3O6GA 3T66A 2H25A 1YAEA 5I2KA 4R72A 1UTHA 3MQ9A 4M1VA 2V25A 1B52A 3PMXA 3ILTB 4F31B 2AL5A 4H8JA 2ZNUA 3G7WA 2DWIA 3LR1A 4OTEA 1POY1 3FV2A 3PPPA 3E13X 2VP1A 3FIRA 3MAMA 3TTNA 1B3EA 3KFMA 3SEXA 5LOMA 3SESA 2FNCA 4ZZAA 3VXBA 3SEWA 3FATA 1JEUA 4KHZE 3OELA 4OXVA 2THIA 2HFBA 2VHAA 1EZPA 3R6UA 1OVBA 2D5WA 1OQGA 3R26A 1DPEA 2GHBA 3IL1B 3C33A 2Q88A 3TYHA 3SETA 1OMPA 3KBRA 4GVOA 4LVQA 5DEXA 2I3VA 1VFEA 3ZS6A 1XC1A 4FECA 3RN8A 1FTMA 1YPNA 3K00A 4F18A 3S9NC 1Y3NA 3E3KA 1FW0A 4YICA 2RINA 3LSWA 5L9MA 3SEYA 3H6TA 3Q26A 2F97A 3FASA 1Y4TA 3SEUA 1I6BA 3G3JA 3C9HA 1MY1A 3H6WA 5K2YA 5AA2D 4JWXA 2A5SA 1URDA 4GXAA 4U1ZA 4KPTA 3JYRA 1B5IA 4M4GA 1PEBA 1B46A 2M8CA 3BFTA 1A7LA 5TPAA 2O1MA 3PD8A 1LB9A 1SBPA 4NF6B 1R6ZA 4DIGA 4OFLA 1US5A 1XT8A 2B3FA 3UIFA 1S7YA 4ELQA 1FQCA 3MJNA 1MY4A 2D21A 3K01A 3IORA 1A8EA 4RYAA 1N7XA 2AL4A 1ZJLA 3MP1A 4G68C 3H4ZA 5CRYA 4DE8A 4G2ZA 3KSXA 4RK9A 1SW4A 4JDFA 2V3TA 2XX9A 5BWJA 1Y20A 2DE4A 3VE1B 2PYYA 3PPNA 1B4ZA 2XXIA 4C1UA 3O9PA 1Y3QA 5L8DA 3EF7A 5I58B 1O63A 5DVFA 3OEKA 4KI0E 4F2OA 4I62A 4EXLA 3T9VA 4QFPA 4Q30B 4QRZA 1LGBC 1T0KA 3O29A 1DTGA 4U22A 2XHDA 2NOOA 1MXVA 4I9DA 4N6PA 3OO6A 5EYFA 1QJMA 3E9XA 3SDFA 1ZIUA 5EHSA 3U94A 2H5YA 1M5EA 4LZ7A 3IO4A 1MH3A 2AIXA 2KLFA 5TU0A 3O66A 3TEPA 3K1MA 4AQ4A 2XXXA 1TT1A 2QSXA 3CG1A 1MRPA 1S9TA 5JTYB 3DELB 4MH5A 1PB9A 1LBBA 3TTMA 1P1NA 3Q27A 4X1BA 3W15C 1J1NA 4ZEFA 1EZOA 4LONB 2F78A 3UP9A 1SW5A 4OEVA 2DOJA 1Y1MA 2O1LA 5B70A 1JNFA 3PUXE 2IA4A 4FEDA 1ZMGA 1B1XA 2XXYA 3Q28A 4DDDA 3HPIA 4P0IA 1JQFA 3QAXA 3LSFB 4IGTA 3ONMA 2OWTA 1IQ7A 3MZ9A 4X48A 5IAIA 5CBRA 3KN7A 2DS9A 1P99A 2DP8A 3K6UA 3ILUB 4RY1A 1QUJA 4KYDA 2XXUA 1SI0A 2Y7KA 3EPEA 4FAJA 3KOSA 3CFLA 4KCDA 4O3CA 3IOTA 4XIGQ 3N26A 4I8CA 2V3UA 3PPOA 4DXCA 2XXQA 1TXFA 5A5XA 2XXWA 4KD5A 1A55A 3KEIA 5TP9B 3T22A 2DVZA 4ZS9A 2Z8EA 3FJ7A 4EQ7A 1SYHA 3N5LA 2HQ0A 2R9JA 2QL3A 4F3GA 3O97A 4I1DA 4YKJA 2D3IA 2DWHA 3K6VA 2R71A 3EN3A 2A5TA 1GTKA 2YPNA 4R2BA 2F8DA 4BDMA 4ND9A 4UA8A 5CMMA 5ICTA 2XXPA 2V84A 3T9UA 4EF1A 5H8NA 5CMBA 1LFGA 4P11A 1NH7A 4GXSB 1LB8A 2DXYA 5F7VA 3E4RA 4ZEKA 1NFTA 1NKXA 4JWOA 2O6AA 2QMXA 4IO2A 4OQOA 3OO7A 5I59A 3FVOA 2B3BA 3W9WA 2XXRA 4TLMB 2Q2CA 2P0SA 3OSRA 1M5BA 5I56B 3TDJA 4PFYA 5H8NB 4KYSA 1VSOA 3TKDA 5AA2A 3OOAA 3K0VA 4YB6A 4QF9A 1B0HA 4K3FA 1M5FA 4OEUA 1LAXA 2XXTA 5AA4A 3MPKA 1HSLA 1R9LA 3TODA 4X9TA 2G93A 1DTZA 3GBAA 4H0WA 1AMFA 4ESXA 3HN0A 3JZJA 4ECFA 1PC3A 4ZZEA 4TLLB 4EQBA 4MLQA 5AA2B 3PPRA 4OMBA 4GRKA 4RPOA 4R75A 3N6UA 3GLBA 3B7DA 2DXRA 4N13A 2F5XA 5AA4B 4HCWA 1P1QA 4KFQA 2PMSA 1JVYA 4XTCQ 3CIJA 4R74A 4BDNA 4ZECA 1B5JA 1UQWA 1D9VA 3KG2A 3IR1A 3GZGA 1N3WA 2REGA 3C36A 3O6HA 3UGWA 3HO7A 2Y84A 3I6VA 3K02A 1NL5A 1OIBA 4LP2B 4QSDA 4LATA 5IKBA 1ZU0A 5H8QB 2O84X 4NF4A 1SD3A 3IB0A 1MXXA 1QULA 4WEDA 1FQDA 4JBZA 2Q2AA 1MS7A 2NWJA 3WAEA 2ZMBA 3L6HA 3T93B 4ZE9A 4G77A 5I2KB 3LBSA 4WEPA 4BDOA 1H45A 2QS3A 1NNTA 1UTHB 4POXA 4XKQA 4Z0IA 2FA7A 3HV1A 3MVYA 3QK6A 5ITPA 1NNFA 2NXOA 4IO5A 4KR5A 3MPLA 4U2RA 2DWJA 3FVKA 3SKPA 3K6WA 2QRYA 4ZE8A 3PUZE 4DCYA 1SYIA 1LCTA 1LLSA 2GFEA 3VLWA 1ZBMA 4OWDA 3FGSA 1P1UA 3TTKA 4EUOA 4IO7A 5CMCA 3OO8A 1QKAA 5DEXB 2OBGA 4GF8A 4FEBA 2F34A 3RGYA 1A40A 3FXRA 4F3BA 1SQYA 1AH5A 2FYIA 4U4XA 1XOCA 3CR9A 3IX1A 1B6HA 2WKYA 1MXUA 3KN3A 5KZTA 4DXUA 4KCCA 4YKPA 1N04A 1ANFA 5F1QA 3PUYE 2X7PA 3OO9A 3H03A 1FTJA 1IEJA 3A3CA 1TFDA 2QMWA 4LQ5A 4IO3A 4YB5A 1B3GA 2E0SA 3BBRA 3TAJA 3CVGA 3L6GA 3V8XB 3DP6A 4XKRA 1JW4A 2QS1A 3CG3A 2REJA 2ZYNA 2IEEA 1Q1KA 3TQWA 3TCGA 5H8HA 1CE2A 3MW0A 4NF5A 4RXLA 4OERA 2F36A 4G8HA 5TPAB 4H1XA 3GXAA 2F7CA 1RKMA 1MG1A 3O6IA 1MQIA 3R7XA 2H98A 2V3QA 1I69A 2HZLA 1FTLA 4F3PA 2BJJX 4POWA 4F3SA 5AA1A 4GIZA 1UTBA 3HHGA 1IXGA 1OVTA 2I0CA 5DTBA 3OENA 1IUDA 1XVXA 1MQHA 1M5DA 1FQEA 4OFOA 4TQUQ 1H43A 1FCKA 2I0BA 1MM6A 4ISUA 3FXUA 4C0RA 1IZ1A 4F22A 2X7QA 3O28A 1SW2A 4ZEIA 5KDTA 1PDAA 4PFUA 1YTVA 1I6QA 3K4UA 2ZXTA 1N84A 4X1DA 4ESWA 2Z8FA 1HSEA 1GR2A 2GRVA 3T96B 1A8FA 4TOZA 1D9YA 3KJ7A 4NEDA 4PETA 3IOUA 4R9GA 3LSLA 4RA1A 1LFHA 3IO6A 1JETA 1MPCA 2Q89A 2Y7WA 3WAFA 4NWCA 3F11A 1YCJA 3TUSA 4U23A 2YJPA 3PGFA 2AYSA 3FUZA 4OETA 4YAHX 1PB7A 3BKIB 2QS4A 4BDRA 1AOVA 3H7MA 3RLFE 1P1OA 2ZYOA 4F1YA 2Q9TA 3MWBA 2Y7PA 1BIYA 2Z23A 2O7IA 3FXQA 4EQ9A 4OVJA 1Y3PA 3MVXA 4DCXA 4HCYA 1MDQA 2ONSA 4BLAA 3G3IA 4OZ9A 3U1OA 5CI5A 5HM4B 4YB7A 3G3FA 2ESNA 2ONKE 2HXWA 4WXJA 1B7ZA 3JV9A 3MVZA 4R73A 2RF1A 4QFLA 3CSBA 1OLCA 3FVGA 3RNNA 1ATGA 3HSTA 2YLNA 1RYXA 3ZKLA 3UA8A 4F19A 4R2FA 1II5A 4YKKA 2F7AA 5EHMA 1Y9UA 3EHTA 1MQJA 3OSQA 2OLBA 2RC7A 3ODBA 4ZEBA 4R6HA 4R6YA 2VGQA 2QPQA 3H3GA 5FTHA 5A5XB 3Q25A 3FZVA 4IO6A 4WKMA 3FD3A 3LUYA 4OHNA 4R9FA 3K1PA 2UYEA 4ZDMA 1DPPA 3OXNA 4PQJA 3C35A 1R9QA 4OESA 3S4UA 3KZGA 3RT8A 5ISUA 3U93A 1GVCA 4AB5A 2RCAA 2UVJA 5CM6A 3V83A 1O7TA 3H6VA 1EH3A 3PU5A 5DVJA 4O3AA 5DYHA 4FIMA 2A5TB 4DXBA 2O51A 4IY6A 2RC8A 1D4NA 1MXZA 2UXAA 3HCQA 1MQGA 5ICQA 1LAGE 1FQBA 4HS7A 4C1TA 2GHAA 2P2AA 1OQHA 4NF8A 4ELPA 3RY3A 4YU0A 2ABHA 5M2VA 3O2AA 4UACA 3U72A 3UK4A 1LSTA 3M8UA 1Z7ME 1B4HA 1PB8A 3ECRA 4PP0A 1O64A 1JEVA 2HCAA 2PBWA 5I59B 5H8FA 2I49A 4OENA 5KCJA 4QHQA 1VE4A 4Z7EA 3QIMA 1KWHA 4O3BA 2DE3A 5L9SA 4AB6A 5I57A 1JVXA 2GH9A 4H67A 1Y1ZA 3VVFA 3C32A 4G68A 3USDA 2R6GE 3M3FA 4GFRA 4GWOA 4LA9A 4P0GA 3GBBA 1Z7NE 3MC2A 3S9LC 2LAOA 2DQVA 4RJZA 4ONYA 1B7HA 4JXIA 2XX8A 1OLAA 4U21A 3C34A 2I58A 1M5CA 4JSDA 5I57B 4RPNA 3A3UA 1WVJA 4ZEDA 2Z8DA 1PBQA 3LC8A 1IIWA 3RTWB 3K6XA 2P1SA 3S9EA 1BKAA 3IB2A 1GV8A 4G4PA 3TPAA 3IJXB 1GGGA 3QUJA 2H4IA 2OJTA 1TFAA 2DE2A 3V89B 1UIVA 3VFJA 3DM0A 1A54A 3KSJA 1DSNA 2PT2A 4PFTA 3RT6B 1URSA 2PT1A 4LQ2A 1FTOA 2Z22A 1EU8A 4U1OA 3B6TA 4MBPA 3D4CA 4H8IA 3CRBA 3M3KA 5K2XA 3UN6A 3W9VA 1B9JA 2V93A 1B3HA 3DP4A 3FVNA 5B7DA 4NF4B 5HPQA 1N0TA 5ITOA 4U4SA 3TMGA 3N6TA 3TELA 3LSXA 2I48A 3TQLA 1Q35A 2XX7A 5CC2A 1B7UA 2VD3A 4Q0CA 5ELVA 1H76A 3HHFA 1ZLQA 3K1NA 3VVDA 5DT6A 3Q29A 1MY3A 1MQDA 2RCBA 2XXVA 5FTIA 1IXIA 3IAZA 3RQTA 3KN8A 1P1WA 5FHNA 4NF6A 1B1HA 4PFWA 1LBCA 2DWAA 2O68A 1DMBA 4NMYA 2PX1A 3A09A 3IOWA 1MDP1 2ONRA 2HAUA 1NNKA 1AIVA 1IXCA 1SI1A 1SVXB 1UIUA 5BUUA 1BLFA 3OEMA 1HSJA 3QSLA 4FORA 3EQ1A 3P7IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1IXHA 2RKMA 4F39A 1NH8A 3G3HA 5FHMA 2ZNTA 3H6UA 4N07A 4PAFA 3U8QA 1ELJA 1R1NA 5TP9A 2F35A 2PFYA 2OK2A 4H5GA 4EF2A 2FIXA 1NV3A 3VVEA 3QUFA 4EXKA 2I4CA 3VV5A 2H9BA 2I3WA 5JK4A 1LFIA 2HZKA 1NV7A 1RYOA 3TFLA 1B3LA 5HBCA 4BDQA 4JB7A 5DVIA 1LBYA 4RNSA 3T9HB 1MY0A 1I6AA 4KYEA 5ET7A 2QVVA 1DCUA 4PDDA 3U92A 1FBPA 4MJOA 4P47A 4YZZA 4GD5A 3PV0E 3IK6B 3B6QA 1SDXA 2JJKA 3MZBA 3CFZA 2H99A 5CBSA 1N7WA 1FBDA 3OD7A 4XKNA 1VR5A 2UYFA 3G3KA 1S50A 3VLVA 1MXYA 2DVCA 3C31A 5I56A 3IJOB 1ZKBA 4H6DA 3C4MA 1VFDA 3PMVA 1WODA 1MH4A 3T9XB 3MBPA 3M3LA 1QVSA 2DYXA 2Y7RA 3PUWE 3BFUA 2I6EA 1IMBA 3PUVE 5LDZA 4ELRA 3VXCA 1XS5A 4NE4A 1B0LA 4FATA 4RK2A 1XI6A 4QFKA 2ALUA 5FHOA 1Y4CA 1NMUA 2UVGA 1B5HA 1DOTA 1QUIA 4NG7A 1D3KA 3TTLA 2O69A 2L5VA 3RPWA 4ELOA 1JW1A 3VDFA 4PBHA 3TCFA 1LAHE 5I2NA 4MNPA 3N94A 5H8SA 4HW8A 4R6KA 4H5FA 1B40A 4NF8B 2F6PA 2CZLA 3MUQA 1FPJA 4O8MA 1MXWA 1MPBA 2VOZA 3SEVA 3UORA 2W7YA 2ZYMA 1CB6A 1H44A 4PE5B 1FBHA 3D4GA 4E0XA 2HAVA 3MVWA 1WDNA 5H8FB 3FV1A 2NUVA 5I2NB 2QVUA 4IGRA 5KCJB 3VLUA 1IMDA 1H3DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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