5JEIA

Crystal structure of the glua2 lbd in complex with fw
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIACFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of partial agonism in AMPA-type glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA02
3O2AA 3KSXA 5IAIA 3G3FA 2V25A 3QAXA 3TTRA 1FTLA 2UXAA 3R7XA 1B5JA 1MXXA 1URGA 3B6WA 1IZ1A 3PUYE 2I3WA 3KEIA 1QUKA 3OELA 2OWTA 4F3PA 3O97A 5L9MA 4JB7A 3IJOB 3V8XB 1FTJA 2NXOA 4H5FA 3VLUA 4DXBA 1ZJLA 4KPTA 3FVNA 1MRPA 5CBRA 4NF8B 2A5TB 4XTCQ 3JV9A 3RUMA 4F18A 2O1MA 3FXUA 3TYHA 4RA1A 2E0SA 5H8FA 3OO7A 4GLIA 3K6XA 1UIVA 4I8CA 3W9WA 4ZEFA 3T22A 1NL5A 3CSGA 3PD9A 1L5TA 3TCGA 1OLCA 1R1NA 2Q9TA 3I5OA 4Q30B 1P1NA 1LAXA 4LA9A 3KN3A 3S9MC 4KFQA 2Y7WA 3H06B 3IOWA 5B7DA 3FV2A 1HSLA 4ZDMA 3M3FA 5IKBA 4G68C 1MDP1 2UYEA 4ISUA 4F2OA 1USYH 1TFDA 3RQTA 1I69A 4HCWA 3UIFA 2B3BA 3SEUA 1QW0A 4NMYA 4JXIA 4F2QA 1VSOA 2NOOA 4NF5A 2HFBA 3TTLA 5FHNA 1GR2A 1UIUA 3RY3A 4Q8RA 3V83A 1H76A 5H8NA 1N7WA 4BDMA 1POTA 2DWJA 3IOVA 4X9TA 4OWDA 2QPQA 2YPNA 3LSLA 3K1NA 5DYHA 3OO8A 4LP2B 5F1QA 5I57A 1B7UA 2Z8FA 4EUOA 1B3HA 1LAGE 2LAOA 1T0KA 3N5LA 4G4PA 4IGRA 2PBWA 1B40A 2QS1A 1Y20A 1FQBA 3UN6A 4ONYA 1MQGA 2O68A 1P1OA 1MM7A 3TEPA 3FVGA 4YU0A 3N6TA 3KJ7A 1NMUA 3MW0A 1SW2A 1MQHA 5ISUA 3PU5A 2DS9A 1MPBA 4AB6A 2FNCA 4N07A 2I49A 1ATGA 3LSFB 4IO2A 1MDQA 3C9HA 4F31B 1PBPA 1ANFA 1JQFA 2Q8JA 2XXPA 3EHTA 4H8JA 1QKBA 4Q5TA 3PMXA 4OXVA 4ND9A 5CMCA 1AH5A 3RPWA 1FCKA 3T93B 1M5FA 4OERA 1EZOA 3WAEA 2Y84A 3Q28A 4WKMA 2AIXA 3TCFA 3A3CA 3HSTA 3U93A 1PB9A 4LZ8A 4GXSB 4DXUA 1ZIUA 1Z7ME 3ILUB 3FVOA 3SEYA 3TUSA 4ZE8A 4DXCA 1ZLQA 3TZAA 4PE5B 3L6GA 2QL3A 5AA3A 4NTLA 5TU0A 3EHSA 2Q2CA 4F1VA 3HV1A 4JSDA 1FQDA 2Q88A 4O3BA 4I62A 1B7ZA 5FTIA 1OVTA 4PQJA 1UTBA 2OLBA 1MPCA 4F39A 4FEDA 3KFMA 3S9NC 1MY0A 2ZNTA 4AQ4A 2HAUA 4KYEA 1B52A 1Y1MA 2WKYA 1D9VA 4KYSA 3U72A 1O63A 4ZE9A 4Q0CA 4QFNA 4JSOA 1ZKBA 4HCYA 3K6VA 2CMOA 3G3GA 4KCCA 5H8FB 2QS2A 4C1TA 4G77A 5AA2A 3VXBA 5HPQA 3LUYA 5I56A 2X7QA 2DVCA 3MVXA 1B4ZA 5ITOA 1OIBA 4HTGA 3L6HA 5LOMA 5CRYA 4FJPA 2AL4A 2F6PA 1D9YA 1SD3A 1N0TA 1CB6A 2XXRA 4ESWA 3TELA 3OEMA 1MPDA 3FXRA 1LB8A 4OENA 1WDNA 5FTHA 1MH4A 1N3XA 3PGFA 2RKMA 1US5A 1A8EA 4JWOA 1EZ9A 4R9FA 2RC7A 2H5YA 3PD8A 3VV5A 3CRBA 3RLFE 4G2ZA 1N84A 2GFEA 3PUXE 3T9XB 2F78A 5DEXA 1VFEA 3D4CA 3FJGA 3U94A 3RT6B 1SYIA 3SKPA 2RCBA 4P0IA 4DZ1A 3MVWA 4NWCA 4NF5B 1Y3PA 4U21A 4FECA 4H6DA 1Y4CA 3GBAA 2O7UA 2HEUA 1A55A 3Q29A 4G68A 4XKRA 3R26A 4ZZEA 5I2KA 1OQHA 5H8NB 3ONMA 1KWHA 3FZVA 1ZU0A 1BKAA 2DYXA 1B5HA 1PC3A 3KBRA 2HXWA 3IL1B 4M1VA 2XX8A 5I58A 5K2YA 2Q2AA 2ZXTA 2B3FA 3UORA 3MVZA 2ZYKA 2R9JA 4ELQA 1LFHA 4NF6B 5DVJA 2I3VA 5CMBA 2G93A 5I57B 1M5DA 5AE4A 1JEVA 3RNNA 3RTFB 3MP1A 2F36A 1MM6A 3H03A 2DOJA 4H0WA 1USYE 1WODA 3RN8A 1YAEA 1YTVA 4XKQA 5I59B 3T96B 2H4IA 3K6UA 3B6QA 1O7TA 2I0CA 4OMBA 3VLVA 3MP8A 5F7VA 3ZS6A 4YB6A 1LBCA 1TWYA 1B7HA 4R2BA 1P1WA 3IORA 3MPKA 2DE3A 2IA4A 3TFLA 4F3GA 2OBGA 3OMBA 1QULA 4KI0E 2ZNUA 3OSQA 3MAMA 1A8FA 3IB1A 1IIWA 1QJMA 5HM4B 1IQ7A 1II5A 1B4HA 4PFWA 4IY5A 1B3GA 2F97A 4QFLA 5CM6A 4F3BA 3EF7A 4RK9A 4PFTA 4GIZA 3BFUA 4IO4A 2ZYOA 4R73A 2VP1A 2ABHA 4GWOA 5HBCA 2XHDA 4GVOA 1Z7NE 1XS5A 1SYHA 3SDFA 2FA7A 1TT1A 3CFLA 3MVYA 3KJTA 2P1SA 4MBPA 4I9DA 3RGYA 2G29A 3OO6A 1NH7A 5ITPA 4PFUA 4N13A 4GF8A 3QYTA 2PMSA 1GTKA 3K1MA 4QRZA 1PDAA 2DWAA 4H5GA 3SEVA 3SESA 3ZSFA 2XXUA 1R9LA 3LC8A 1MY4A 3W15C 1P99A 4DLDA 3GZGA 3UK4A 2RC8A 1OQGA 5M2VA 3C31A 4AB5A 4OESA 3OSRA 4TQUQ 3HCQA 3TKDA 1UTBB 4EQBA 3G3KA 4N6PA 1LAFE 1N04A 3GLBA 5AA2D 5K2XA 4JDFA 3S9EA 1F9BA 4BDRA 5I2NA 3KSJA 4KR5A 1RYOA 2Y7RA 4H65A 4KQPA 3OD7A 1R9QA 2R71A 3TTMA 4R9GA 3G3IA 3UA8A 2NUVA 2UVHA 4MFIA 5CMKA 1LB9A 2PT1A 2UVJA 1OMPA 1BP5A 5JEIA 3LBSA 3DELB 1I6AA 1MXZA 5AA2B 2A5SA 4X1BA 2P2AA 4LUBA 5AA4A 1XVYA 4DDDA 2XXXA 5I56B 4MLVA 1N7XA 3W9VA 4BDNA 1N76A 4ELRA 4QHQA 4HW8A 1A7LA 3H3GA 5CC2A 1UTHA 4NF6A 4ELPA 1B1HA 4HS7A 2UYFA 1MG1A 4NF4A 2THIA 5DVFA 3T9HB 3BFTA 1H43A 1NKXA 5A5XA 4H1XA 5I59A 3QSLA 3LR1A 3FGSA 1B3FA 3FVKA 3DP6A 5DEXB 1JEUA 4THIA 2DVZA 1B0HA 1MQJA 2XX9A 3EN3A 2Y7KA 1PB8A 4GD5A 3GXAA 3V5AA 2B65A 1SVXB 3PUZE 4LATA 2O7IA 4G68B 2ALUA 1S7YA 5I2KB 2DXRA 4OFLA 1D4NA 1SW1A 4U4XA 1FQAA 2REGA 3IX1A 4EQ9A 4BLAA 3THIA 1B9JA 5I58B 5EHSA 5B70A 4LVQA 4YZZA 4X48A 5KZTA 1H44A 1LCFA 3BKIB 2DSFA 2H25A 3PMVA 1MXYA 1TXFA 4KCDA 3CI8A 4YKIA 5ICQA 2Z22A 4F22A 2O84X 4XKPA 3T9UA 2Z8EA 3MPLA 2F7CA 3PUWE 1N3WA 3FJ7A 4YMAA 2ONRA 3H6TA 5DT6A 4FE8A 1FTKA 1PEBA 1QUJA 2NWJA 2VD3A 4R72A 1JVXA 3LSXA 1M5EA 4OETA 1S9TA 4LQ5A 4YMBA 3C33A 4F29A 1SI0A 2D5WA 4IO7A 3OO9A 3N94A 4YB5A 3UP9A 2PT2A 2F34A 3EPEA 5FHOA 4IO3A 3VVEA 5BWJA 3R6UA 4YKKA 3FASA 2XXQA 4OZ9A 3QUFA 4O3AA 1LFIA 3IK6B 2DE4A 2V3QA 1BTJA 1HSJA 3V89B 1J1NA 4FIMA 4G8NA 4R2FA 2OJTA 2Y7PA 5EHMA 1B0LA 1JW4A 4ZEBA 5L8DA 3T9VA 1SBPA 4OHNA 2M8CA 1O64A 2I4CA 4U2RA 4QFKA 4MF3A 3FD3A 2HAVA 4G8HA 4R6HA 2UVGA 5H8QA 3ILTB 2O69A 3CSBA 3OXNA 4R6YA 1VE4A 3FV1A 3VLWA 1NH8A 1EH3A 4ZEIA 2QMXA 2XXWA 3TQWA 4UACA 3MJNA 4DIGA 4RYAA 4F3SA 2D21A 5H8HA 1ELJA 2YLNA 4C0RA 1RKMA 4QFOA 5KCJA 3K1PA 3C32A 4ZS9A 4ZZAA 4XIGQ 4U4SA 3HO7A 3HN0A 1QVSA 5JK4A 2I4BA 5I2NB 3H6VA 3I6VA 4MH5A 1Y1ZA 4X1DA 3MZBA 2I0BA 3VFJA 1FQCA 2GRVA 4ZEKA 5TP9A 1Y9UA 1GV8A 1XT8A 1URDA 1AL3A 1B6HA 2QMWA 3TQLA 3K02A 1M5CA 4GL0A 5EYFA 3ZKLA 5ICTA 4L17A 4OTEA 5AA4B 4PP0A 3O6HA 1LGBC 4QF9A 5KDTA 4P0GA 2P0SA 4EXKA 2O51A 3FJMA 3MBPA 3K01A 2PX1A 2HZKA 3S9LC 1UTHB 4OQOA 3MZ9A 1A54A 3QUJA 4QSCA 1P1UA 2VD2A 4NF4B 4GL8A 1M5BA 5A5XB 4WXJA 2Z23A 4U1OA 2RINA 3Q26A 2V3UA 3HHFA 2XXIA 5BUUA 1H45A 4RPNA 3K4UA 2OCUA 2O1LA 1QUIA 1SI1A 3B6TA 4H67A 1MQIA 1HSEA 1QKAA 4U1ZA 2QSXA 4Z7EA 2DWHA 4JBZA 1DTZA 3O9PA 1EU8A 3USDA 3MC2A 1GGGA 2NVUB 3F11A 1B3EA 4GRKA 3N6UA 4XKNA 1URSA 3EHUA 1SW5A 5FHMA 1XOCA 4YKJA 3E9XA 1IXHA 2DWIA 4Z0IA 5TPAA 1MS7A 5JTYA 3IO6A 2XD2A 4DCYA 3PPRA 3M3LA 2AL5A 2XXVA 1MXVA 1IITA 1JW5A 2V3TA 2X7PA 3K00A 2FYIA 1SDXA 2Y7IA 3H6WA 4ZECA 2HQ0A 1B51A 3BBRA 1MH3A 4TLMB 1LAHE 4YICA 2PVUA 3MZ1A 2ANJA 1XC1A 1VR5A 4G8MA 1S50A 3C35A 3FATA 1R6ZA 4FEBA 4BDOA 2QS4A 5DTBA 1JNFA 4R74A 4ELOA 1DMBA 3ZKKA 3U8QA 4FORA 1BIYA 4EQ7A 3U1OA 3HPIA 3Q27A 2F7AA 2DE2A 4R75A 3KN8A 3D4GA 4YKPA 4H8IA 2XXYA 4I1DA 1A40A 3K2DA 4NWDA 1MQDA 2ZYNA 1NNKA 2F8DA 3S2VA 3TMGA 3GBBA 1Y3NA 1CE2A 3CFZA 3FUZA 2CZLA 3DLNA 4F1YA 3IB0A 4POXA 2Q89A 2F35A 2RC9A 1EZPA 1Q1KA 4GQOA 4XXUA 3CVGA 2VHAA 3N26A 3VVDA 2OWSA 3C34A 1IXIA 2XX7A 5H8QB 1P1QA 1Y4TA 1DTGA 2R6GE 4FATA 3TTKA 4E0WA 2V93A 3DP4A 3SEWA 1SQYA 1NNTA 4LONB 3KOSA 3C36A 2I58A 2XXHA 4WEDA 5H8HB 3OEKA 3K6WA 3VVFA 4IGTA 4NE4A 5CMMA 3G3JA 3OENA 3C4MA 5KCJB 4IY6A 3M3KA 4RNSA 2XXTA 4DCXA 2OK2A 3VDFA 2DQVA 4RK2A 3M8UA 3T66A 4OYVA 3H7MA 4EF2A 3KG2A 3PV0E 2H99A 4RXLA 2OZZA 1MXUA 2GHBA 4P11A 2F6GA 3CFXA 5TP9B 3TAJA 4KHZE 1PB7A 4GXAA 3K0VA 1DSNA 3MP6A 1JW1A 3KN7A 3PPQA 1LBBA 4OEUA 3CIJA 2I48A 1Y3QA 4LQ2A 3B7DA 3DP8A 5KDTB 3A09A 4UA8A 3E4RA 1WVJA 5H8SA 1H3DA 2ONKE 3IOUA 1US4A 1B2HA 3TDJA 5J1DA 2YJPA 5L9OA 4OFOA 1Q35A 4EDPA 1B3LA 4ESXA 1SW4A 1DOTA 3H6UA 3ECRA 1DPPA 2KLFA 3HHGA 1LCTA 1FW0A 4POWA 4QSDA 4TOZA 4LZ7A 1ZTYA 4C1UA 3E13X 3KGCA 1IXCA 4PFYA 1YCJA 1FTOA 4DE8A 4NF8A 2A5TA 4U23A 4YB7A 3FXQA 2REJA 1OVBA 2Z8DA 3O28A 2VOZA 1JETA 5CI5A 3O29A 3PPOA 2UVIA 3PPPA 1FTMA 1B5IA 3S4UA 1A99A 2X26A 1AOVA 3KOTA 4K3FA 3MQ9A 3E3KA 1XVXA 3VXCA 5TPAB 4ZEDA 1JVYA 5JTYB 2O6AA 1NNPA 1D3KA 1B32A 2QJEA 3CG3A 1I6BA 1OLAA 3PUVE 3EQ1A 3TTNA 3DM0A 1LFGA 3LSWA 1VFDA 3AXFA 3ODBA 4ECFA 2GHAA 4OFJA 1MY1A 2QRYA 4U22A 3WAFA 3TODA 1LSTA 2HCAA 3OOAA 1B58A 3PPNA 3QXMA 4YAHX 1GVCA 1POY1 4QSEA 2PYYA 3SETA 3JZJA 4EF1A 1I6QA 4WEPA 4KYDA 4BDQA 4E0XA 2F5XA 2VGQA 4M4GA 2E1SA 1AIVA 1B1XA 1MY3A 3O6GA 3O6IA 3IAZA 3RTWB 4GOTA 1LLSA 2GH9A 2ZYMA 4JWXA 4OVJA 3QIMA 3IR1A 1IUDA 1ZMGA 3TPAA 5DVIA 4RJZA 4IO5A 1MXWA 3I3VA 2BJJX 4GFRA 3IB2A 2ZMBA 3U92A 3A3UA 2ONSA 5L9SA 1ZBMA 3IJXB 4FAJA 1IEJA 4BDLA 1BLFA 4OEVA 4O3CA 3MUQA 3MWBA 2F7BA 3Q25A 3FIRA 3P7IA 3CG1A 1UQWA 2D3IA 3IOTA 1YPNA 3JYRA 1NFTA 1NNFA 1PBQA 4EXLA 3QK6A 1B46A 2HZLA 3VE1B 1FQEA 3PMWA 3IO4A 4KD5A 1AMFA 1DPEA 3SERA 4IO6A 2H9BA 2RF1A 2AYSA 2ESNA 5ELVA 4MLQA 2DP8A 2RCAA 2H98A 4F19A 4TLLB 4IB2A 3RT8A 1TFAA 3SEXA 4RY1A 3G7WA 1IXGA 3UGWA 2XD3A 4QFPA 4F1UA 3H4ZA 2V84A 1MY2A 1RYXA 3TCHA 5I84A 3G3HA 1XHYA 4R6KA 3CR9A 2ZNSA 4PETA 3O66A 5AA1A 1FQFA 4NEDA 5CBSA 2I6EA 4LZ5A 4RPOA 2IEEA 3KZGA 1B05A 2DXYA 2QS3A 2W7YA 4JWYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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