5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
4G8MA 1VR5A 1B3EA 1MY0A 5H8NB 2DWIA 3HV1A 3KBRA 1B4HA 5DVFA 3B7DA 3SETA 2AL4A 2X7QA 4F2QA 5DVIA 3O6IA 2DWJA 3MZ9A 1EZOA 3L6GA 1YTVA 3IOTA 3CRBA 4U23A 3T9XB 1OVBA 3MW0A 5L8DA 2DE4A 5KDTA 1PB8A 2V3QA 4DCYA 4O3BA 1SQYA 1OLAA 4BDRA 3HO7A 3G3JA 1JNFA 4FEDA 4Q5TA 4F1YA 1MY1A 3CFLA 5AA1A 4GLIA 1OMPA 3VDFA 4OEUA 3LSFB 1BLFA 2FA7A 3IOUA 3VVDA 3SKPA 2F7AA 2FNCA 2XHDA 2AYSA 3SERA 4XKRA 1A54A 1TFAA 1MXYA 4KHZE 3SEUA 3MVZA 1URDA 3H7MA 1M5EA 3FVOA 3ECRA 1SVXB 5A5XB 3TFLA 4IY5A 2F34A 2OCUA 3OSRA 3ZKKA 3H6UA 5CMCA 1JQFA 2XXQA 3UGWA 2OJTA 3HHGA 5H8FA 2XX9A 4X1BA 1VE4A 1VSOA 3FVKA 3O2AA 4EUOA 4TOZA 2VOZA 1S7YA 1JEUA 3THIA 1SYHA 5ITOA 2B3BA 4EF1A 3KN8A 5TU0A 3V8XB 2IA4A 3SEXA 1B9JA 2AIXA 4KPTA 4U1ZA 1R9QA 2PX1A 4XKQA 3VE1B 5I56B 1YCJA 4FIMA 1VFEA 2VHAA 4MF3A 4HTGA 1B0LA 1R6ZA 3VLUA 4YKIA 1VFDA 3DM0A 1WVJA 3TDJA 4PFUA 4ZZAA 3BFTA 3QK6A 4FATA 1S50A 1A8EA 2XD3A 1Z7ME 3JYRA 4F3GA 2DS9A 2UYFA 5FTHA 4OXVA 1NMUA 2O1MA 1FTJA 2W7YA 1SW2A 1P1QA 1MM7A 4Q30B 1CE2A 1POTA 4RK9A 2QS2A 1SW4A 4G4PA 5CRYA 4EF2A 4R6HA 3TKDA 5I2KB 1UTBB 3C35A 1MXWA 2F8DA 1IXHA 4MFIA 1R9LA 2H98A 3MC2A 4OEVA 3HSTA 3TTKA 4O3CA 2HXWA 3MPLA 1ZLQA 1MY2A 3FXUA 1B3LA 2I48A 1B7ZA 4KYEA 5DEXA 1SW5A 3K6VA 2HAVA 1TT1A 4DXUA 4NTLA 3N5LA 3TODA 2REGA 4U4SA 4QRZA 3T9HB 3VLWA 2PBWA 2Y84A 4F29A 3DLNA 4OYVA 4OFOA 1PBQA 1XC1A 2F5XA 5I58A 3TCHA 4LZ8A 1QVSA 3K2DA 4I8CA 4JBZA 3U8QA 3ZS6A 2ZNUA 4OENA 4F31B 3FASA 1B3HA 3K01A 1P1NA 3O28A 3HCQA 3IL1B 1N3WA 4YB6A 3U92A 1XT8A 1IEJA 3FIRA 1MPDA 1FCKA 4RJZA 5H8HB 1PDAA 4GXSB 3MP6A 2HFBA 1LB8A 1SD3A 2Y7WA 2DE2A 3BBRA 4ZEDA 4AB6A 2XXTA 3O6GA 3Q25A 2I4BA 3H06B 3IORA 1LAHE 4LP2B 4KR5A 2G93A 2B65A 1URGA 1B58A 3IO4A 5AA2A 3IOVA 4GIZA 3T9VA 1NH7A 2GFEA 3TQWA 1NFTA 3PMVA 4Z0IA 1MXVA 2ZNTA 4RPOA 4BDMA 1MXUA 3KOSA 2RC9A 4YKPA 4LVQA 1LCTA 1B5JA 4I62A 4XKNA 5CBRA 4H1XA 2RKMA 1P1WA 3FV1A 3PGFA 1UIVA 3D4GA 3FV2A 4R74A 4BLAA 4FAJA 2PT1A 1D3KA 1DOTA 3K4UA 1ELJA 2DYXA 3PU5A 3EHUA 3OSQA 3JZJA 1NNPA 1M5FA 3KN7A 3H03A 3RGYA 4R9FA 3RTFB 2DXYA 2PVUA 1Y3NA 1AL3A 1LFIA 3CVGA 2H9BA 4EQ7A 3EHTA 3M3KA 4H5FA 4GL0A 3E13X 2ONSA 3W9VA 4X9TA 1T0KA 3TQLA 1ZKBA 1B40A 3S2VA 1FQDA 2GHBA 5I56A 4F19A 3QYTA 1MY4A 1JVYA 3C34A 1MXXA 4XKPA 4FECA 4L17A 1Y1ZA 1H43A 1A8FA 2LAOA 1RYXA 1MPBA 4XTCQ 2A5SA 3TELA 2P0SA 3GZGA 2QSXA 4KYDA 4LZ5A 2UYEA 3LUYA 1Q35A 3H3GA 1P1UA 2VP1A 3EN3A 1LLSA 4OHNA 4G77A 4F18A 1FQAA 5I2KA 5IKBA 1UTBA 1FTMA 1UTHB 4BDLA 3BKIB 4GOTA 4U22A 5AA4B 3K00A 5CC2A 3MVYA 1RKMA 1Y1MA 1GR2A 5EYFA 2O1LA 5DVJA 4GF8A 5ELVA 2DVZA 3PPRA 2Z8DA 3MP1A 4ONYA 3PPPA 2GHAA 5CM6A 4Z7EA 2ALUA 4ECFA 3B6TA 3PD8A 4K3FA 5I2NB 1SYIA 4YB7A 4RA1A 2WKYA 2OWSA 1NNKA 3B6QA 4F3BA 5TPAB 3K02A 3QIMA 4R73A 3LSLA 4YKJA 3VXCA 1MY3A 1XHYA 2ZYOA 3TTRA 3OEKA 4TQUQ 3MPKA 2XXIA 5TP9A 4JSDA 2AL5A 1FTKA 3TCGA 3M8UA 1SI1A 3LBSA 3PV0E 3ODBA 3QUFA 3E3KA 5H8HA 5JTYB 4JSOA 2YLNA 4ZECA 3TEPA 2A5TA 2Q2CA 3MQ9A 2DWHA 1UIUA 3T96B 1IUDA 1IXGA 4OVJA 3FVNA 1IZ1A 2I0BA 2NOOA 4POXA 3PUYE 4IB2A 4NMYA 3VV5A 1MH3A 2ZNSA 3K6WA 1B1XA 3GBAA 3PPOA 3QXMA 4IO4A 3CG1A 3IR1A 1MS7A 4IO6A 3OO8A 3BFUA 1XS5A 2NUVA 1KWHA 1LCFA 2QMXA 3H4ZA 4C1UA 1OQGA 2OWTA 3A09A 4GL8A 3OO6A 3ONMA 1IQ7A 1MQGA 4F1VA 2F97A 1LFGA 1PBPA 4P0IA 2Q2AA 4QF9A 4FORA 4FEBA 3RTWB 3U94A 3K0VA 2QL3A 4F3SA 3CIJA 2RCAA 1MXZA 4M4GA 4ZE8A 5AA3A 1A7LA 3M3LA 2ONKE 1IIWA 1Y9UA 1M5DA 5LOMA 2HEUA 4QHQA 1NKXA 3HN0A 1FQCA 2Z22A 4QFPA 1L5TA 5H8SA 2QJEA 4AQ4A 2DSFA 1LSTA 4DIGA 3USDA 2OZZA 1B3GA 4C0RA 2F7BA 3S4UA 3CR9A 2REJA 4GXAA 3U1OA 3FUZA 3AXFA 4U1OA 2H25A 3VFJA 1GVCA 4NF4B 4NF8B 1BIYA 4NF6B 2F78A 4R6YA 3S9EA 4IGRA 1A55A 1FTLA 4TLLB 2B3FA 2Z8FA 3H6VA 3VVFA 1B46A 3KJ7A 4ISUA 4YMBA 3KEIA 1GGGA 1EU8A 4P0GA 4QFOA 3FXQA 1N04A 1NH8A 4ZEFA 4UA8A 5IAIA 2D5WA 1ATGA 4U4XA 3RN8A 2XXHA 1UTHA 3DP8A 1DSNA 1DMBA 3G3KA 1FW0A 3Q26A 3L6HA 5AA4A 3IOWA 2I6EA 3IAZA 1QUKA 4KYSA 1XVXA 1YPNA 5K2XA 4G8HA 4YMAA 3RPWA 4IY6A 2F6GA 2O6AA 2IEEA 2H5YA 3RT8A 1OQHA 4G68B 3N6TA 4DCXA 1HSJA 4P11A 5TPAA 1Y4TA 4GVOA 3E4RA 3G3FA 3MJNA 3C33A 4FJPA 4DLDA 1LGBC 3DP6A 2P1SA 3UIFA 5ISUA 1US4A 4WXJA 2DWAA 3F11A 3UP9A 3QAXA 4MH5A 3LC8A 1P1OA 1XOCA 1Y4CA 1ZU0A 5H8NA 3MBPA 4OFJA 5F7VA 4ELRA 2P2AA 2G29A 2Y7KA 1D9VA 2ANJA 2QS3A 4POWA 1PB7A 1N84A 1DPPA 3FZVA 3MAMA 3TZAA 2I49A 4NF5B 5JTYA 4G8NA 2UVIA 4KI0E 3JV9A 1Y3PA 2PMSA 3A3CA 5I57B 3TAJA 3GBBA 1B2HA 2OLBA 1PB9A 4ELQA 3K1PA 2I58A 4RY1A 4OWDA 4LUBA 5I59B 2R9JA 1QW0A 3ZSFA 4JDFA 4PFWA 3I3VA 3ILTB 4OMBA 1Q1KA 1B3FA 3LR1A 4F22A 4HW8A 1JEVA 2DOJA 4KCCA 4LQ5A 3K6UA 3EQ1A 3SEWA 3RY3A 2XXYA 2RF1A 4QSEA 1MG1A 3TUSA 5CMBA 2ZMBA 2O51A 4ELOA 4OERA 1ZBMA 1S9TA 4ZS9A 5A5XA 1LAGE 2RCBA 5HM4B 3C9HA 1P99A 3IJXB 1F9BA 1B1HA 4G2ZA 1JVXA 3TTLA 3PUWE 4QSCA 1IITA 5KZTA 2VGQA 4QSDA 3UN6A 5JEIA 3SESA 2ZYNA 5HPQA 3MZ1A 1LB9A 1I6AA 5H8QB 4F2OA 3O29A 3PMWA 3LSWA 2BJJX 1B6HA 1URSA 4PFTA 2H4IA 3FJGA 3C4MA 2ABHA 1Y3QA 1PC3A 3KJTA 3OENA 4IO3A 5ITPA 2VD3A 3T9UA 4C1TA 4E0XA 3HPIA 1GTKA 3VLVA 4IGTA 2Z23A 3KGCA 2Q88A 3PUZE 4NF4A 4ESXA 4NF6A 4QFLA 4PP0A 1H45A 4F39A 3WAEA 1B5IA 1BTJA 1R1NA 1B0HA 3OXNA 3V5AA 2GH9A 3H6TA 3FATA 4HCYA 3I6VA 1MPCA 4JXIA 4YAHX 3UK4A 2XXRA 4R6KA 4RYAA 4OESA 2YJPA 1NNFA 3PD9A 3T66A 5L9SA 3FJMA 2I3VA 3CFZA 3FJ7A 2QS1A 5DEXB 3FGSA 5DYHA 4H8IA 5CMMA 4LA9A 2NWJA 2UVGA 1SDXA 4YB5A 4BDOA 5F1QA 3OELA 3IB1A 4ZEIA 4G68A 4G68C 3SEVA 4DE8A 4JWXA 5ICTA 2THIA 2QPQA 2Y7RA 1PEBA 3FD3A 3TMGA 4ND9A 4LATA 1A40A 1FQEA 4DZ1A 2RC7A 3P7IA 1B7UA 3RNNA 4NWDA 1I6QA 1LAXA 4OFLA 1O63A 4OQOA 1TXFA 2DVCA 1D4NA 1MDQA 4PFYA 2XX8A 4YZZA 5I84A 1CB6A 3EHSA 2O69A 2CZLA 4KFQA 1FQFA 2ZXTA 5EHSA 4R72A 2V84A 5KCJB 2QS4A 3W9WA 4WEPA 3S9MC 1B5HA 5EHMA 4NF5A 4NEDA 4H5GA 3PUVE 5AE4A 2H99A 2XX7A 3O6HA 3OO7A 4FE8A 2Q8JA 5I57A 1OIBA 2HZLA 4M1VA 2PYYA 3UA8A 5CMKA 1H76A 5I59A 1AH5A 2R71A 2R6GE 3E9XA 5AA2B 4RXLA 2O7IA 4LQ2A 3N94A 2ZYKA 1ZMGA 3R6UA 2GRVA 1NL5A 1IXCA 3M3FA 3RT6B 3U93A 2XXVA 5ICQA 2Y7IA 4OTEA 1SW1A 4LONB 4RNSA 1D9YA 4QFNA 3G7WA 4ELPA 2HZKA 3N26A 3VVEA 1TFDA 3C36A 4X1DA 2HAUA 3ZKLA 1LBCA 4PE5B 4N07A 4DXCA 4KD5A 2Y7PA 2KLFA 3O9PA 2F7CA 4F1UA 3RUMA 5H8QA 3KSXA 3TYHA 1MQDA 3TCFA 4UACA 4ESWA 4R9GA 3OD7A 4PQJA 2OK2A 4ZEBA 3Q29A 1WODA 3K1MA 2O68A 3OMBA 1NNTA 1M5BA 4WKMA 4IO5A 1N0TA 1MM6A 1AMFA 3PUXE 2NVUB 1I6BA 4X48A 2M8CA 1DPEA 2DQVA 4JB7A 4EQ9A 2Z8EA 4N13A 4R2FA 5DTBA 2D21A 1J1NA 3RLFE 1ANFA 3DP4A 3CSGA 3O66A 3KG2A 3RQTA 1AIVA 4ZEKA 3S9NC 2V25A 1FQBA 3H6WA 1EZ9A 4OETA 4Q8RA 4RPNA 1USYE 4I9DA 1O64A 5AA2D 3KN3A 2I3WA 1QKBA 1YAEA 3CG3A 4ZDMA 3IB2A 5BUUA 2I0CA 2QMWA 1XVYA 1QUIA 1N76A 3MP8A 5I2NA 4LZ7A 1USYH 4R2BA 1DTGA 1FTOA 4YICA 3IB0A 4E0WA 3IJOB 1GV8A 3MUQA 3G3HA 1SBPA 3Q27A 3QUJA 3O97A 3LSXA 4ZZEA 1MH4A 1H44A 2X26A 2DP8A 3EF7A 2RC8A 4EQBA 4TLMB 5CBSA 5TP9B 3SDFA 4GFRA 4PETA 3KFMA 2NXOA 4GD5A 1MQJA 4YU0A 5JK4A 3IO6A 2UXAA 3ILUB 1N3XA 3A3UA 4MLVA 4Q0CA 2XXPA 5FTIA 5BWJA 2OBGA 2A5TB 3K6XA 2F6PA 5KCJA 5L9MA 5KDTB 2HQ0A 5B7DA 4NWCA 4OZ9A 3UORA 5FHOA 2QRYA 1EZPA 3C32A 3CFXA 4R75A 2F35A 2E1SA 3G3IA 3GLBA 1Y20A 1ZJLA 2I4CA 3CSBA 3R26A 1JETA 1B52A 4O3AA 1O7TA 1B4ZA 2VD2A 5B70A 2DXRA 1B05A 3MZBA 3C31A 3IK6B 3VXBA 3IX1A 3MWBA 4U2RA 2HCAA 3V83A 4KQPA 3G3GA 3U72A 4JWOA 4EDPA 4IO2A 1US5A 5HBCA 2V3TA 1ZIUA 1IXIA 3T22A 5H8FB 4GWOA 4F3PA 1OLCA 1AOVA 4H8JA 5J1DA 2YPNA 3GXAA 3TTMA 3TTNA 1QULA 2ESNA 4H65A 4HCWA 4H0WA 2ZYMA 4HS7A 1LBBA 4RK2A 3WAFA 2UVJA 4H67A 3MVWA 2F36A 3T93B 4EXKA 5L9OA 3PMXA 4H6DA 1JW5A 2Q9TA 4XXUA 1II5A 4JWYA 4ZE9A 2XXXA 2RINA 1N7WA 1MRPA 4NF8A 1MQHA 4YKKA 1B32A 4EXLA 4QFKA 4U21A 3CI8A 4BDQA 3FVGA 4AB5A 2DE3A 2X7PA 3KOTA 3PPQA 5CI5A 5FHMA 1QKAA 1WDNA 2O84X 1SI0A 3S9LC 4MLQA 5FHNA 2E0SA 1H3DA 1BP5A 4GRKA 4KCDA 1LFHA 1M5CA 3OO9A 2CMOA 1QJMA 3QSLA 3W15C 4N6PA 4I1DA 1JW1A 3MVXA 4XIGQ 1B51A 2D3IA 3EPEA 3DELB 2ONRA 4IO7A 4THIA 4MBPA 1A99A 2O7UA 4GQOA 1HSLA 2UVHA 5M2VA 3KSJA 1POY1 4WEDA 1EH3A 1LAFE 3V89B 4DXBA 3KZGA 3Q28A 2XD2A 2FYIA 3I5OA 1UQWA 5K2YA 5I58B 3N6UA 2Q89A 1N7XA 3R7XA 2V93A 1MQIA 5DT6A 3D4CA 3HHFA 2XXWA 1BKAA 1ZTYA 3K1NA 2PT2A 4NE4A 2V3UA 4BDNA 1MDP1 3PPNA 3TPAA 1OVTA 3OOAA 1TWYA 1DTZA 4DDDA 1HSEA 1Z7NE 1QUJA 3SEYA 1I69A 3FXRA 1JW4A 1RYOA 2XXUA 3B6WA 3OEMA 1B7HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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