5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (6-10)TVIa1 (13-16)TIV1 (14-17)TIV3 (46-58)S2 (18-21)TI1 (23-26)AH1 (66-78)S3 (42-46)S12 (239-250)S4 (59-64)TI2 (87-90)AH2 (108-115)EMPTYTIV5 (95-104)S7 (105-106)AH8 (225-233)TVIII2 (116-119)S8 (120-121)AH3 (129-133)AH7 (206-215)AH6 (191-200)S10 (142-150)S9 (135-137)TVIII3 (140-143)TIV8 (216-219)TI4 (168-171)TIV7 (157-160)AH5 (180-187)AH4 (162-165)TI3 (158-161)TVIII4 (169-172)TII1 (176-179)S13 (253-255)TI6 (255-258)S5 (82-86)S6 (95-96)O1 (123-125)S11 (221-224)TIV2 (33-36)TI5 (188-191)AH9 (260-274)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
2Z8EA 4BDRA 5CC2A 4ONYA 2Q2CA 4LP2B 2DP8A 1M5BA 4C1UA 3PUYE 3MVYA 5LOMA 1JQFA 3S9EA 4GXAA 3HSTA 5A5XA 1NNFA 1MDQA 1BP5A 1DPPA 3E13X 1JEUA 1WDNA 5H8NA 3AXFA 2Y7WA 4KI0E 1QUJA 1P1UA 3MUQA 3WAFA 3C35A 4LQ2A 3G3KA 3VLVA 1MXZA 3K02A 3PUZE 3TZAA 3A09A 1OLAA 4EQ7A 1MM7A 3MZ1A 3S9NC 5AA2D 1LBCA 1P99A 1P1WA 1FQAA 1AOVA 4U4XA 3G7WA 5K2YA 1B7ZA 2QS1A 2Y84A 4GQOA 5HBCA 3T9VA 3O66A 1I6QA 3S4UA 1HSEA 3U1OA 2DVCA 4AB6A 1AL3A 4YB7A 1DOTA 4YKIA 4YKJA 4JDFA 5DVIA 2Q9TA 3K6XA 3K0VA 3SDFA 3C9HA 4QHQA 2D21A 5FTIA 2F34A 1N84A 2XX9A 2OLBA 2NUVA 4EDPA 1TFAA 4ZE8A 1CB6A 1PBPA 2P2AA 4UACA 1B0LA 3UP9A 5CMMA 1LCFA 3TCHA 2ABHA 4NMYA 4QSEA 2Y7KA 4EF1A 3ZKLA 1OMPA 3QXMA 1B6HA 3PMVA 2OBGA 1ZJLA 4YMBA 2O7IA 3C4MA 1D9VA 5ITOA 4ELRA 3H6TA 3V83A 1UQWA 1SW1A 2O7UA 2UVGA 1FQBA 2CMOA 3V8XB 2RF1A 1IXIA 1MPDA 1MQHA 4HCYA 3S2VA 1LAXA 4R6YA 3BKIB 3KJ7A 2XXYA 3R6UA 3MWBA 3T66A 3CFLA 3G3IA 1JNFA 1DPEA 1GGGA 5FHNA 1UTBA 5DYHA 3BBRA 1FQDA 1MQGA 3K00A 1ATGA 1Z7ME 1EH3A 3PMXA 1DMBA 2V3UA 1NH7A 3DM0A 2ZNTA 3T96B 3O97A 1B2HA 1B4HA 2NOOA 4I62A 3N5LA 1MXXA 2E0SA 4R73A 4H5GA 4R9GA 3K6VA 5H8HA 3TFLA 2V25A 4F3SA 3SEXA 1LCTA 1MRPA 1SD3A 2RCBA 4KFQA 4RPOA 4Z7EA 3PUVE 1NNKA 4POXA 1MY0A 2F35A 2F6GA 2LAOA 4JBZA 1P1NA 2H5YA 4NF4A 2Y7RA 2ZNUA 2OK2A 3UIFA 2XXUA 1EZOA 1YTVA 3DP4A 1MY2A 1OQHA 4IGTA 1R1NA 1DTGA 1EZ9A 5J1DA 3B6TA 3VXBA 3THIA 1M5DA 2I0CA 3FJ7A 3O6HA 1GV8A 1M5FA 2E1SA 2UXAA 1MPBA 4Q5TA 2ESNA 4N6PA 4ESWA 1MQJA 2Y7PA 3VLUA 2I4CA 4PFTA 2REGA 3RPWA 1Y4CA 3MC2A 2HQ0A 2REJA 1VE4A 1MY1A 3FUZA 2UYEA 1N0TA 4IO3A 3H6WA 3M3LA 3GZGA 1MS7A 4MLQA 3O28A 3TTKA 1J1NA 4F31B 4NEDA 2PT1A 1QUKA 2HAUA 3LSWA 4ZEFA 4DCXA 2V84A 4XKNA 1B7HA 3CI8A 1DSNA 4ISUA 2AYSA 3BFTA 5FHMA 1IITA 5EYFA 1SYIA 3SESA 1URGA 2KLFA 4DE8A 1XS5A 3FXRA 3B7DA 2X7PA 3O9PA 3SETA 3SEWA 1A55A 1B7UA 1XOCA 4NF5A 3Q26A 3BFUA 4FORA 1TT1A 4GVOA 5CMCA 2CZLA 1SI0A 3QUFA 2PT2A 3ODBA 3N26A 2ZYMA 4IY6A 2V93A 3QIMA 4K3FA 5CM6A 5KDTA 3U72A 2I6EA 4JB7A 4XKRA 4NF8A 4G68C 2R71A 2ZYNA 2ZYKA 1B51A 3MVXA 2H98A 1UTBB 3H4ZA 2X7QA 2ZMBA 3K1MA 1RYOA 1FTMA 3FD3A 1Y4TA 4FATA 3OEKA 2FYIA 1LFGA 2R6GE 5I2NA 2D5WA 1LB9A 4QSDA 4BDMA 3D4CA 1ANFA 1N04A 3K01A 4EUOA 3LUYA 3M3KA 2Y7IA 2F8DA 1UTHA 1EZPA 3V5AA 1MH3A 2O1MA 4TOZA 3G3HA 4JSDA 1UIUA 5I58A 3MZBA 1IIWA 1MXWA 2F6PA 5JK4A 4QFPA 3U94A 4IO2A 1PB9A 3DP6A 1QKBA 2I4BA 4QFNA 3HO7A 3E4RA 2AIXA 5I2KB 4GL0A 4BLAA 4EXLA 5KCJA 2GHAA 3HCQA 3SERA 4DLDA 1DTZA 2XXWA 4ELQA 4P0IA 4Q0CA 3O2AA 4F3GA 1L5TA 1MY3A 3T9UA 4R75A 3SKPA 3CSBA 5H8FB 2UVJA 3N94A 4ELPA 3FZVA 4YZZA 2DSFA 1A8FA 2F7BA 2IA4A 2UVHA 4MLVA 4OETA 3IOVA 4FAJA 4PFUA 1MXVA 2XXQA 1I6BA 4FE8A 2RCAA 1OVBA 2HZKA 3QAXA 5IAIA 3FVNA 5H8QA 5I56A 5ICTA 5DT6A 1SYHA 2QMWA 3RNNA 4EQBA 4IB2A 4XIGQ 2XXRA 1B0HA 3E3KA 3RN8A 4Q8RA 2VD3A 4C1TA 3CFZA 2THIA 1S7YA 3IOTA 2VOZA 3I5OA 1A54A 4KCDA 5DTBA 3PU5A 2XD3A 4G8MA 1JVXA 3USDA 1FTJA 3ILTB 5EHMA 1AMFA 3OO9A 3C34A 2AL5A 1ZIUA 3EN3A 1B3GA 4H8JA 2ZNSA 3OSQA 1XT8A 5FHOA 3IB1A 1BTJA 3E9XA 3KN3A 5AE4A 4F1YA 3LR1A 4MFIA 3RLFE 3C31A 4OEVA 1JW1A 4FIMA 1Y3PA 1B58A 1FQFA 4F3BA 5I57B 3IR1A 4DXUA 3A3UA 3DP8A 2GFEA 5KDTB 1MXYA 5HM4B 5TU0A 3QUJA 4BDNA 2YJPA 3GLBA 4N07A 3FIRA 2R9JA 2B3BA 1H44A 4X1DA 5EHSA 4ZDMA 2F78A 4H0WA 1Q1KA 3R7XA 4IGRA 4R6HA 4FECA 1B5JA 1BKAA 4ND9A 5KZTA 5IKBA 2QS2A 5AA4A 3W15C 1YAEA 3KGCA 1B5HA 1S50A 4OFLA 3D4GA 4LONB 3SEYA 4U4SA 1QKAA 5I58B 4YAHX 1NFTA 2DE2A 3IORA 2RKMA 3RTFB 4I9DA 3RT8A 3TTRA 4G68B 1HSLA 1CE2A 4H5FA 1KWHA 2NWJA 4F22A 2OWSA 3PGFA 3MPLA 4GD5A 2PX1A 2QJEA 4OFOA 3KBRA 4C0RA 3RGYA 1SBPA 4KYDA 1LAGE 1PC3A 1TWYA 4OFJA 1IZ1A 2WKYA 4NF6A 2RC9A 4X48A 2H99A 2Z8FA 4U1OA 3ZKKA 3K6WA 2OJTA 2P1SA 3LSXA 1ELJA 1A8EA 4HS7A 4F1VA 4BDOA 4RPNA 4AQ4A 4PFYA 3KN8A 4POWA 2DE3A 2VGQA 1GR2A 3KG2A 2GH9A 1B3LA 3P7IA 1IQ7A 4GOTA 3EF7A 1II5A 5JTYA 4WKMA 4Q30B 2UYFA 4IO6A 3OOAA 3VE1B 4GWOA 5DVJA 3FVKA 3JV9A 2OZZA 1SW5A 5A5XB 3RQTA 4OERA 3IO4A 4PETA 1FQCA 3TQWA 5H8NB 5DEXA 3MP1A 3MJNA 4RNSA 2D3IA 4LATA 4EQ9A 4QSCA 3KOSA 4R6KA 4FEBA 4DXCA 1LAHE 3HN0A 2XHDA 4NWCA 1B52A 2DWJA 4DCYA 4OXVA 4XTCQ 1B4ZA 3HV1A 4XKQA 3OSRA 1PDAA 4ZZEA 1OQGA 3ZS6A 3L6HA 1XC1A 1F9BA 1MXUA 2XXIA 4PP0A 2QPQA 3FXQA 3M8UA 1I6AA 4YKKA 1N3XA 1YPNA 2XXTA 3I6VA 3HHFA 5F1QA 1MPCA 1I69A 5AA2A 2F97A 2DQVA 2Q89A 2Q88A 2RINA 1PB8A 3VLWA 4DXBA 3IAZA 1JEVA 1ZKBA 4ZEBA 4OWDA 1NH8A 3TCFA 2HZLA 5AA4B 5CMKA 5K2XA 3Q28A 1MQIA 4G8NA 3FJGA 1N76A 3B6QA 2I48A 2G29A 3FVOA 3K6UA 1P1OA 1FTLA 3TAJA 3IB0A 4WXJA 1M5EA 4H6DA 4EXKA 1A7LA 2QSXA 3TDJA 3G3GA 3LC8A 4KR5A 1SVXB 2DXRA 3DLNA 1B1XA 3PD8A 2RC8A 3FGSA 1VFEA 5I59A 2DE4A 3Q29A 3C36A 5F7VA 1O7TA 1RYXA 5CBSA 4R2FA 4U2RA 2I49A 4NTLA 5ICQA 4RY1A 3GBAA 1Y9UA 1POY1 1D4NA 4N13A 1B5IA 3EHSA 3MBPA 4XXUA 3KN7A 3JYRA 4IO4A 2NXOA 4BDLA 3RUMA 2DVZA 2QRYA 4OESA 4U1ZA 4RYAA 4MH5A 1OVTA 3B6WA 4FEDA 3PPPA 5CBRA 5DVFA 2I0BA 3EPEA 4O3BA 3IB2A 5JTYB 3UORA 4F29A 1H45A 4XKPA 3IJOB 2A5SA 4ZECA 4YMAA 3LSFB 3VDFA 5H8HB 3RT6B 1N3WA 4H1XA 1LGBC 3G3JA 1B32A 2ONRA 3SEUA 1LLSA 4NF4B 1TFDA 1NL5A 3RY3A 2O69A 3CIJA 4RA1A 3KEIA 2H25A 3OENA 3L6GA 1N7WA 5B7DA 4ZS9A 1ZBMA 3ONMA 4KYSA 3HHGA 1QUIA 1NMUA 4OMBA 1ZMGA 2H4IA 3O6IA 4DZ1A 4THIA 3PPOA 3F11A 1MM6A 4PE5B 1B05A 2GHBA 2V3TA 4ZE9A 3FV1A 2XXHA 3OELA 1IUDA 3PMWA 4KHZE 3IOUA 5L9MA 2PMSA 4QF9A 3UGWA 2GRVA 1NNPA 1SQYA 1LAFE 1US5A 3JZJA 4QFLA 1Y1ZA 4HW8A 1Y1MA 2FNCA 2B3FA 1OIBA 1A40A 4G77A 3T22A 2YPNA 5AA1A 2DOJA 2ONKE 3MVZA 2ANJA 4OQOA 4X9TA 4RXLA 3GXAA 5FTHA 4MBPA 1LSTA 4FJPA 2XXPA 2F36A 5TP9A 1US4A 3M3FA 2B65A 5L9SA 1QJMA 2ZYOA 1GTKA 3IX1A 1QW0A 3GBBA 3O6GA 1JW4A 1BIYA 1SW4A 4R74A 2DXYA 2F7CA 3G3FA 4JWYA 3TELA 5I59B 3EQ1A 3T9HB 1Y3NA 4NF5B 2PYYA 5M2VA 4GFRA 2QL3A 2OWTA 4O3AA 3TTNA 4LZ7A 3UK4A 3FVGA 1D9YA 1ZU0A 4DIGA 1NKXA 4M4GA 2A5TA 3ZSFA 4ZEDA 1ZTYA 3VXCA 4E0XA 4GLIA 4F1UA 4TLMB 4NF8B 4GF8A 1WODA 3CG1A 4PQJA 4YU0A 1VR5A 2VHAA 1S9TA 1LBBA 1ZLQA 1URDA 4L17A 1D3KA 4KPTA 3PUXE 5I2NB 2UVIA 3CSGA 1MDP1 1IXGA 1MY4A 3EHTA 4TLLB 3HPIA 2M8CA 4LA9A 3RTWB 4GXSB 2XXXA 1Q35A 1P1QA 5BWJA 3CVGA 3IOWA 3QK6A 4JSOA 1LFIA 3Q27A 1UTHB 4LVQA 3K4UA 4WEPA 2XX7A 3QSLA 4NE4A 2HFBA 3KFMA 5ISUA 3TODA 4I8CA 4Z0IA 5CI5A 3FXUA 1VFDA 3OEMA 5TPAA 5KCJB 3LBSA 3SEVA 4NWDA 3W9VA 2PBWA 1O64A 4H65A 4ZEKA 1PB7A 2O84X 1RKMA 1Y20A 2DWIA 1AH5A 2Z22A 2W7YA 4AB5A 3I3VA 1SI1A 1O63A 2VP1A 5L8DA 1HSJA 3H7MA 4YB6A 1USYH 3VFJA 1A99A 1AIVA 4KD5A 3ILUB 3VV5A 4HTGA 5H8QB 5I56B 4TQUQ 3MW0A 1LFHA 3FATA 2QS3A 1XVYA 4R9FA 4MF3A 4OEUA 3VVFA 2OCUA 2IEEA 2QMXA 4IO7A 1LB8A 4BDQA 2HEUA 4ELOA 4F2QA 3MVWA 5I84A 4U22A 3PV0E 3OXNA 3C32A 1Z7NE 3FV2A 5TP9B 1MQDA 3IO6A 2BJJX 3T9XB 2I58A 5CRYA 2RC7A 2XX8A 4QRZA 4WEDA 4X1BA 1B46A 4JWXA 1B9JA 3S9MC 2V3QA 1FTOA 1YCJA 2O68A 4RK2A 5ELVA 2F7AA 4F39A 5I2KA 1MH4A 3A3CA 2A5TB 4PFWA 4JWOA 2DS9A 3OO8A 3H03A 3VVDA 1VSOA 4LQ5A 4P0GA 2O6AA 2O51A 4OENA 5H8FA 3TUSA 2PVUA 1QULA 4O3CA 2P0SA 1TXFA 1FCKA 4ZZAA 4H67A 3VVEA 1H43A 3CR9A 1B3EA 3H6VA 1IXHA 5HPQA 3UN6A 4F18A 2HAVA 3PPNA 2AL4A 4GIZA 1Y3QA 5H8SA 3CRBA 4E0WA 3TMGA 2NVUB 3PUWE 5BUUA 3OMBA 1R9LA 1FQEA 3LSLA 5ITPA 4OZ9A 4IY5A 1EU8A 3Q25A 3EHUA 4RK9A 2Q8JA 1B1HA 4G2ZA 3KOTA 1B3FA 3K1NA 3ECRA 3KSJA 4IO5A 3PPRA 2I3VA 1QVSA 1WVJA 3PPQA 5TPAB 4GL8A 1FW0A 4QFKA 3MZ9A 1JW5A 1B3HA 3FJMA 3K2DA 4KQPA 4OTEA 3C33A 4YKPA 1JETA 1XHYA 2FA7A 3TQLA 1JVYA 1SDXA 4NF6B 3R26A 3N6TA 2DYXA 3TEPA 3CFXA 4G8HA 1NNTA 1PBQA 4YB5A 3TPAA 4R2BA 5I57A 3MPKA 4U23A 2HCAA 3H6UA 4ESXA 2QS4A 3KSXA 3OD7A 3MP8A 4OVJA 3CG3A 2O1LA 4ZEIA 4KYEA 3DELB 1GVCA 4RJZA 3T93B 4I1DA 3OO7A 5L9OA 3TCGA 3N6UA 4JXIA 1UIVA 3H06B 2ONSA 1PEBA 3TKDA 2XXVA 2G93A 5B70A 2ZXTA 3TYHA 3KJTA 1B40A 2F5XA 4KCCA 4G4PA 2H9BA 3WAEA 5DEXB 2HXWA 1POTA 1IEJA 3U93A 1OLCA 4QFOA 1FTKA 4F3PA 2Z8DA 2DWAA 4M1VA 4UA8A 3MQ9A 2XD2A 3U92A 4GRKA 2DWHA 5JEIA 4U21A 2I3WA 3PD9A 1MG1A 2X26A 4LZ5A 3FASA 3H3GA 4YICA 4G68A 4DDDA 4P11A 3TTLA 3U8QA 4LZ8A 4HCWA 1IXCA 1T0KA 4R72A 3OO6A 3IL1B 1BLFA 1R6ZA 3UA8A 4H8IA 3K1PA 4ECFA 4OYVA 2YLNA 3S9LC 2Q2AA 4OHNA 3MP6A 2Z23A 5AA3A 2ALUA 1URSA 5AA2B 3KZGA 3IJXB 3QYTA 1H3DA 3IK6B 1USYE 1N7XA 4LUBA 3O29A 3W9WA 1H76A 1SW2A 5CMBA 1XVXA 4EF2A 4F2OA 3V89B 1M5CA 3MAMA 3TTMA 2VD2A 4F19A 1R9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z8EA 4BDRA 5CC2A 4ONYA 2Q2CA 4LP2B 5DW8A 2DP8A 1M5BA 4C1UA 3PUYE 3MVYA 5LOMA 1JQFA 3S9EA 4GWWA 4GXAA 3HSTA 5A5XA 1NNFA 4OA4A 1MDQA 1BP5A 1DPPA 3E13X 1JEUA 1WDNA 5H8NA 3AXFA 2MKZA 2Y7WA 4HE1A 4KI0E 1QUJA 1P1UA 3MUQA 3WAFA 2F3BA 3C35A 4LQ2A 1EYJA 3G3KA 3VLVA 1MXZA 3K02A 3PUZE 3TZAA 4N6KA 3A09A 1OLAA 4EQ7A 1MM7A 3MZ1A 3S9NC 1FTAA 5AA2D 2PCRA 5ET5A 1LBCA 3E79A 4I3EA 1KZ8A 1K9YA 4MJOA 1P99A 1P1WA 1FQAA 1AOVA 4U4XA 5ESYA 5T3JA 3G7WA 5K2YA 1B7ZA 2QS1A 2Y84A 4GQOA 5HBCA 3T9VA 3O66A 1I6QA 3S4UA 1HSEA 3U1OA 2DVCA 4AB6A 1AL3A 4YB7A 1DOTA 4YKIA 2WBBA 4YKJA 3CHGA 5EQAA 4JDFA 5DVIA 2Q9TA 3K6XA 3K0VA 4MNIA 3SDFA 2ZZVA 3C9HA 4QHQA 2D21A 5FTIA 2F34A 1XI6A 1N84A 2XX9A 4NG7A 2OLBA 2NUVA 4EDPA 1TFAA 4ZE8A 1CB6A 1PBPA 2P2AA 4UACA 1B0LA 3UP9A 5CMMA 1LCFA 3TCHA 1FPEA 2ABHA 4NMYA 4MCOA 4QSEA 2Y7KA 4EF1A 3ZKLA 1OMPA 3QXMA 4PCDA 1B6HA 3PMVA 2OBGA 2PFYA 2Q8MA 2VPOA 1ZJLA 4YMBA 2O7IA 2XWVA 1JP4A 3C4MA 3HFUA 2ZZXA 1D9VA 5ITOA 4ELRA 1KA0A 3H6TA 3V83A 1UQWA 1SW1A 2O7UA 2UVGA 1FQBA 2VPNA 2CMOA 3V8XB 2RF1A 1IXIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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