5JTYB

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
276
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 79
structure length 276
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyB02
3CR9A 4I9DA 2I6EA 1LAHE 4BLAA 3IB2A 3PUXE 4LVQA 4DCXA 3I6VA 2CMOA 2OWTA 4H8JA 4RY1A 3MPKA 3SETA 5L9SA 1ZMGA 4NF6B 1N7XA 3WAFA 3IR1A 2H4IA 3PPRA 4C1UA 1MRPA 3SKPA 1FTLA 1Y3NA 4IY6A 3FUZA 4I62A 4BDNA 2VHAA 1FQAA 1LFGA 3OO8A 2Y7KA 3KFMA 4I8CA 2REGA 3K4UA 2DWIA 1Z7ME 5ICQA 3TTRA 4U2RA 3EF7A 2RC7A 4IO7A 4KYSA 3UK4A 2I4BA 4ESXA 1MM6A 3K1PA 2QJEA 1MXZA 1PB9A 5M2VA 5CC2A 2B3BA 1BLFA 1PDAA 3S9MC 3SEXA 1NMUA 2Q2CA 4HS7A 4L17A 1TXFA 2F5XA 3H6TA 5KDTA 1B40A 2GRVA 1Y4TA 1FQDA 1O64A 1OMPA 2CZLA 1LSTA 2XX8A 4R6KA 3FIRA 1PBQA 2PVUA 4EXKA 3K1NA 5ISUA 4N13A 2YLNA 3ZKLA 1FTKA 3M3LA 1BIYA 3TYHA 2UVHA 4RJZA 1IXHA 5DYHA 5I84A 2QRYA 3IOUA 1QULA 5LOMA 3DELB 3GZGA 4DE8A 2G93A 3VDFA 1S9TA 1SBPA 1B7HA 4PFYA 1M5CA 4OXVA 1H44A 2F7AA 2XXXA 1EZ9A 2NOOA 4G4PA 1H76A 1XOCA 1B3EA 4EQ9A 4KCDA 3DM0A 2DQVA 5I2NA 2O7UA 5ITOA 4EDPA 2UVJA 2WKYA 3KN3A 4R9GA 3FJGA 3KJTA 2M8CA 1SYIA 3O6IA 5TP9B 1UQWA 1I6BA 1KWHA 3B6QA 2VD3A 2O7IA 5TP9A 1EH3A 5H8SA 4WEPA 1B58A 3TTKA 4ZE9A 3FASA 2XXRA 1PB7A 2XXUA 2F97A 3RT6B 4EQBA 4M4GA 1MY4A 2AIXA 2OCUA 3TCGA 5AA2B 3I5OA 5H8FB 4F19A 2Q8JA 1A7LA 2NVUB 4XKNA 3FJ7A 1TFAA 4KYEA 5AA2A 1OVBA 1SW2A 5H8FA 4O3BA 4F3PA 4Q5TA 4QFOA 2DOJA 5DT6A 4TLMB 1IITA 1JVXA 4FORA 1LFHA 1IQ7A 4OQOA 1FQFA 2BJJX 4F29A 1ZTYA 1Y3QA 4C0RA 2YPNA 3V83A 3OO6A 1YCJA 4YMAA 1BTJA 2AL5A 3G3GA 4F1YA 1DPEA 1FTMA 4F39A 4GFRA 3VE1B 5KZTA 3ECRA 3O6GA 3MP8A 3MC2A 3VXCA 3U92A 1LB8A 3Q29A 3PPOA 3I3VA 3KN8A 2R9JA 3S9NC 1Y3PA 3RNNA 4DZ1A 2QL3A 2UYEA 4U4SA 3IX1A 4GRKA 4IO2A 4ELOA 1Y4CA 2DE4A 2QMXA 3N6UA 4IO3A 4R73A 2XXPA 4NMYA 1JETA 2DSFA 1VE4A 3RUMA 4PQJA 1MDP1 3CIJA 4ZDMA 1NKXA 1ZIUA 3D4GA 3MPLA 3C31A 1URDA 5ELVA 5A5XB 5CM6A 2RC8A 3ZKKA 3PUWE 5CMBA 4IY5A 1SW1A 5H8QB 4G77A 1H43A 2Y7PA 4LQ5A 4QSEA 3MBPA 1ELJA 3TUSA 1JEUA 3USDA 1EU8A 4H67A 1AMFA 2Q9TA 4ECFA 2ABHA 3E13X 5TPAB 2ZYKA 2OJTA 3AXFA 3UORA 2UYFA 5I58B 5HPQA 3V89B 4PETA 1N0TA 5CMKA 5FHOA 4JBZA 4KR5A 3RTWB 4LA9A 4IGTA 5I58A 4KCCA 2GHBA 3HPIA 2I3WA 3L6GA 4QSDA 1AH5A 3DP6A 1NFTA 3KBRA 4GL8A 4GL0A 1LAXA 2D3IA 3L6HA 2AL4A 5F1QA 4R2BA 1XC1A 3VFJA 2ZNTA 2R6GE 3T9HB 3T9XB 3T93B 2F34A 5FHMA 5EYFA 2HCAA 3OEKA 2RF1A 3TPAA 1JQFA 3H7MA 3T9VA 2QPQA 3MWBA 2D21A 4F3BA 3O2AA 4RK2A 4OMBA 4OESA 3G3JA 1B5JA 1LLSA 1WODA 3KZGA 3HSTA 1T0KA 1B51A 3O97A 2W7YA 1EZPA 1SI1A 2QS1A 5EHSA 2O1LA 4G68C 2IA4A 4R6YA 4FEBA 1GV8A 4YU0A 5CBSA 4ONYA 1UTBB 5H8NB 4N6PA 5CI5A 1A8FA 2VP1A 1A40A 3IO6A 3UA8A 4GXAA 5H8NA 4KQPA 4OFLA 4YMBA 4QFLA 3FVOA 4X48A 5H8HB 4QSCA 1NH8A 2GH9A 2RCBA 3EHTA 3U94A 1R9QA 1IXGA 4Q30B 2ZXTA 2F36A 3CFLA 3PMXA 3PUYE 4BDRA 3Q25A 4NF8B 4DLDA 2Z22A 2I0BA 1TFDA 4UA8A 4G8NA 2XXQA 3O29A 4NF8A 4GOTA 3TZAA 4FJPA 2NUVA 2XXYA 2ZNSA 2Z8FA 2PBWA 1QUKA 4GIZA 1GR2A 4GQOA 2OLBA 4NF5B 1NL5A 2RC9A 1DMBA 2HAUA 3KSXA 4IB2A 4OVJA 2IEEA 4GLIA 4XTCQ 5EHMA 4NF5A 1NNTA 1SW4A 4R74A 1P1NA 4YKIA 3OELA 3PMWA 2X7QA 1MPBA 2ZMBA 3C36A 5I57B 1ZBMA 2R71A 4NF6A 3D4CA 3MZBA 3MQ9A 3MVYA 3QSLA 4H0WA 1MY3A 4KD5A 4KHZE 2ONKE 2XX9A 4OWDA 2I48A 1MXUA 4H65A 1MH4A 4OFOA 4C1TA 5J1DA 3W9VA 1IZ1A 1SVXB 5BUUA 3H6WA 3OEMA 4DDDA 2I3VA 4XIGQ 1LAFE 1L5TA 1IIWA 1US5A 3K1MA 4OEVA 1AL3A 1SDXA 2RINA 4Q0CA 2O6AA 1XS5A 3OOAA 5I56B 2B3FA 1P1UA 3KEIA 1A99A 3RTFB 2ZYMA 2F35A 1SD3A 3OMBA 5I56A 3JV9A 4R72A 4HW8A 3TELA 1H3DA 1FTOA 4JSDA 2GFEA 4RXLA 3FXQA 3TTMA 2OZZA 1P1WA 3BFUA 4TLLB 1SYHA 1LCTA 3RT8A 3BBRA 1BKAA 1HSJA 2F6PA 1B3HA 2DXYA 4OENA 4GXSB 2XXVA 2Y7RA 4O3AA 1POY1 4IO6A 4QRZA 3T22A 3LSLA 3M3KA 3IJOB 3IB1A 1DPPA 1B9JA 2ONSA 5CMMA 1D9YA 4OFJA 4FE8A 4Q8RA 1GGGA 2OBGA 1H45A 4YKPA 3C33A 4KI0E 4LP2B 2P2AA 4ZE8A 3P7IA 3UN6A 2VOZA 4H5FA 1AOVA 3FVNA 4WEDA 1S7YA 4U4XA 3EHSA 3G3KA 4NF4B 2V84A 1Q35A 2Z23A 4OYVA 2PT1A 3V8XB 4NF4A 1MXXA 2Z8EA 3KJ7A 1MY0A 4MH5A 4NTLA 2AYSA 1Z7NE 2QS2A 4K3FA 3SEUA 3V5AA 4MBPA 1N7WA 2E1SA 1FW0A 2THIA 3KOSA 5K2YA 1IUDA 1N3XA 1URGA 2I0CA 4P11A 1B05A 2FYIA 3VLWA 3C9HA 3QK6A 2ESNA 4DXCA 3ODBA 3K01A 5I59B 4YZZA 4GD5A 4YAHX 3B6TA 3CG3A 1B5IA 4PE5B 1MG1A 5AE4A 1MXWA 1JW1A 3O28A 2A5TB 5L8DA 4LZ7A 5I2KB 2Y7WA 5DVFA 4DCYA 1XVYA 4TQUQ 2ZNUA 4JDFA 3JYRA 5I2KA 4EQ7A 4JSOA 4HCYA 1YAEA 3TQLA 4YB5A 1A54A 2PYYA 2ANJA 1GTKA 4P0GA 3VXBA 4F2QA 5JTYB 3R26A 1TT1A 3KOTA 1I6AA 3OO7A 4DXUA 1NH7A 1VR5A 3PGFA 2XD3A 1B7ZA 3QUFA 2V3UA 4MLVA 3SEWA 3HO7A 1A8EA 5A5XA 1JW4A 4ZEIA 3MVZA 5H8QA 1RYXA 1QW0A 5DVJA 4FAJA 3LBSA 2Y7IA 3FZVA 3O66A 1MH3A 3TKDA 1LBBA 4H1XA 3T66A 2H5YA 5TPAA 3SEVA 4QFKA 4FIMA 3N6TA 5DEXB 4F1VA 4QFNA 1PB8A 1MXVA 3U93A 4ELQA 3C32A 4N07A 4U1ZA 3DP4A 4PFTA 5DEXA 4U23A 4GF8A 4G2ZA 4EF1A 3R7XA 2NWJA 1B32A 3F11A 1UIUA 3LSWA 3GBBA 1M5EA 4X1BA 4LZ8A 3EPEA 4BDLA 1NNKA 3PPNA 3PUZE 3EHUA 3GLBA 1UTHB 3TFLA 4DXBA 1B3FA 4NWCA 3K6WA 3A09A 3M3FA 4YB6A 1R6ZA 3OD7A 3TAJA 3RY3A 3B7DA 3N5LA 4X9TA 1I6QA 3PMVA 3QIMA 3FATA 1SQYA 2UVIA 3QYTA 3FD3A 4LONB 1Y1MA 2HQ0A 1LAGE 1QUJA 4H8IA 2I4CA 1I69A 1MS7A 4YKKA 3TCFA 3IOTA 1UIVA 1IXCA 5L9MA 3H3GA 1A55A 3HCQA 3PU5A 1DSNA 1Y1ZA 1ZKBA 1UTBA 2DE3A 4F22A 2O84X 3A3CA 2VGQA 4LUBA 3BFTA 4F2OA 2ONRA 1Y20A 3E4RA 4H5GA 3CVGA 4R75A 1CB6A 3CFXA 4NE4A 3VVDA 4YB7A 1B1XA 4G8HA 1P1OA 1LBCA 1OVTA 3MZ1A 3CRBA 3G3HA 3UGWA 5AA1A 3FXUA 1EZOA 5H8HA 2H98A 3S9EA 3CG1A 3VLUA 4POWA 4MF3A 1B52A 3TCHA 3VVFA 2XXWA 3K2DA 4QHQA 2RKMA 2ZYNA 2X7PA 4RPOA 2V3TA 3MP1A 3K00A 5DVIA 3O9PA 4ZEKA 4WXJA 4PFUA 3IAZA 5JK4A 2E0SA 4UACA 1YTVA 3PPPA 4PFWA 1B0HA 4H6DA 1DOTA 2Z8DA 4AQ4A 3ILUB 4LATA 2FNCA 3FV2A 1PBPA 4FEDA 1B3LA 4E0XA 2UVGA 3ZSFA 2LAOA 3Q26A 2HZKA 4P0IA 4EUOA 2D5WA 1IXIA 1ATGA 1LCFA 4YKJA 1JW5A 4F3SA 4U22A 3PV0E 2B65A 5I57A 3K0VA 3BKIB 3MW0A 4JWXA 3CSBA 3H6UA 2DWAA 3IORA 4FATA 1XHYA 1PEBA 1B6HA 3HV1A 3TTLA 3DP8A 4Z7EA 4LQ2A 4KPTA 5FHNA 3VVEA 3U1OA 2DS9A 3E3KA 4O3CA 1VFDA 3KSJA 3FGSA 5KDTB 5HBCA 3FXRA 1ANFA 2F7BA 1QUIA 1M5BA 4F31B 3K6VA 3RN8A 1GVCA 3E9XA 1O7TA 4BDMA 1Q1KA 3R6UA 1ZJLA 4NWDA 3S4UA 1S50A 1QKBA 1LGBC 3B6WA 3Q28A 4OTEA 1FTJA 3CSGA 4JXIA 3GXAA 2Y84A 3CFZA 1LB9A 2P0SA 3EN3A 4IO4A 4YICA 3QAXA 1SW5A 4PP0A 3OO9A 1HSEA 5CBRA 3TQWA 3Q27A 4KYDA 3H03A 1WVJA 2F6GA 3QUJA 3G3FA 2X26A 3LC8A 3C35A 4OERA 1MQGA 2O51A 3TEPA 4ZEBA 4DIGA 4OEUA 4POXA 5CRYA 2XXIA 1R9LA 4FECA 1CE2A 2G29A 3UP9A 2O1MA 4ISUA 4AB5A 4AB6A 1F9BA 1DTGA 4OETA 1R1NA 4MFIA 5I2NB 2OWSA 2F8DA 3TODA 2V3QA 5CMCA 2O69A 1N84A 4E0WA 1FQBA 1MQIA 2ZYOA 4ELPA 5AA4B 4ZEDA 2DWJA 4QFPA 1FCKA 1OLAA 3FVKA 4QF9A 3GBAA 5AA4A 1OLCA 3QXMA 3RLFE 4BDQA 3PPQA 5FTHA 1D4NA 4OZ9A 4X1DA 1OQGA 3TTNA 1SI0A 3TMGA 3K6XA 2Q88A 4THIA 3HHGA 1ZU0A 4RNSA 4XXUA 1B7UA 1MY1A 1USYE 4G68B 4XKQA 4F18A 2QMWA 4XKRA 5ITPA 1P99A 1IEJA 4G68A 1FQEA 2Q89A 3OSQA 1B1HA 3LSFB 3ZS6A 3MP6A 5F7VA 1NNPA 2XXTA 4ZZEA 2REJA 2H99A 2QS4A 2XX7A 3H4ZA 1Y9UA 5IAIA 1QVSA 5L9OA 1URSA 2XD2A 3FVGA 3G3IA 3LUYA 4JWYA 2PMSA 3S9LC 5K2XA 1D3KA 4RK9A 4KFQA 3M8UA 1M5DA 3C34A 2VD2A 1BP5A 5BWJA 3MZ9A 1B46A 3OXNA 4Z0IA 3PD9A 2KLFA 1FQCA 2H9BA 5I59A 1O63A 2O68A 1N04A 4LZ5A 1MPCA 3MVWA 1D9VA 3UIFA 2DXRA 3T9UA 2XHDA 1MY2A 2H25A 2DP8A 4XKPA 2A5TA 1RKMA 3PD8A 2OK2A 4ESWA 3MVXA 1MDQA 5KCJB 1MPDA 1VFEA 1JVYA 4RA1A 2QS3A 5KCJA 3IJXB 3T96B 3IK6B 4U1OA 3MUQA 1JEVA 3MJNA 5JTYA 4EF2A 3U72A 3THIA 5ICTA 4RPNA 3W15C 1B3GA 4ELRA 3SESA 2DE2A 3VLVA 3EQ1A 3VV5A 2PX1A 5B70A 1PC3A 3TDJA 2DVZA 3IL1B 5TU0A 2F78A 4ZECA 1QJMA 2GHAA 5AA2D 2HAVA 4OHNA 5DTBA 2ALUA 1OQHA 1B0LA 2I49A 5B7DA 3RPWA 3W9WA 1OIBA 3K6UA 2Q2AA 3IOVA 2HZLA 4IGRA 3C4MA 3SDFA 1MXYA 3KG2A 3MAMA 3H06B 3A3UA 1VSOA 1MQJA 1NNFA 4IO5A 4ZEFA 1XT8A 3O6HA 3KGCA 4G8MA 1B2HA 4F3GA 1YPNA 5JEIA 2DYXA 4U21A 4MLQA 2YJPA 1TWYA 4ND9A 3WAEA 1N76A 4R9FA 2UXAA 1LFIA 1UTHA 1B4HA 1WDNA 4GVOA 3LSXA 1QKAA 3IB0A 1RYOA 3CI8A 1B4ZA 1J1NA 4R6HA 2HXWA 3PUVE 1JNFA 1II5A 3S2VA 3U8QA 2FA7A 4R2FA 4ZZAA 3OSRA 1US4A 4NEDA 3N94A 3FV1A 1M5FA 4HCWA 3K02A 1ZLQA 1HSLA 4TOZA 1B5HA 3SERA 3IO4A 3H6VA 3RGYA 3HN0A 1USYH 3G7WA 5FTIA 4WKMA 5HM4B 4M1VA 4ZS9A 2DWHA 2DVCA 2HFBA 2NXOA 4EXLA 4JWOA 1AIVA 2A5SA 3HHFA 2F7CA 2V93A 3SEYA 2V25A 4JB7A 3JZJA 3N26A 2HEUA 4GWOA 5IKBA 2PT2A 1POTA 2P1SA 3IOWA 2RCAA 3LR1A 1MM7A 3RQTA 4BDOA 4I1DA 2XXHA 4HTGA 1XVXA 1N3WA 2QSXA 1MQDA 4F1UA 3ONMA 3OENA 1P1QA 2I58A 5AA3A 1MQHA 3DLNA 1DTZA 3ILTB 4RYAA 3FJMA 3KN7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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